Kajian genetika ketahanan tanaman kakao (Theobroma cacao L.) terhadap penyakit busuk buah (Phytophthora palmivora Butl) di Indonesia

202  14  Download (0)

Teks penuh

(1)

(Theobroma cacao L.) TERHADAP PENYAKIT BUSUK BUAH

(Phytophthora palmivora Butl) DI INDONESIA

R U B I Y O

SEKOLAH PASCASARJANA

INSTITUT PERTANIAN BOGOR

(2)

ii Dengan ini saya menyatakan dengan sebenarnya bahwa semua pernyataan dalam disertasi saya yang berjudul:

” Kajian Genetika Ketahanan Tanaman Kakao (Theobroma cacao L)

terhadap Penyakit Busuk Buah (Phytophthora palmivora Butler) di

Indonesia”

Merupakan gagasan atau hasil penelitian disertasi saya sendiri, dengan pembimbingan oleh para komisi pembimbing, terkecuali yang dengan jelas ditunjukkan rujukannya. Disertasi ini belum pernah diajukan untuk memperoleh gelar pada program sejenis di perguruan tinggi lain.

Semua data dan informasi yang digunakan telah dinyatakan secara jelas dan dapat diperiksa kebenarannya.

Bogor, Oktober 2009

Rubiyo

(3)

iii

RUBIYO, Genetic Study of Cacao (Theobroma cacao L.) Resistance against

Black Pod Disease (Phytophthora palmivora Butl) in Indonesia. Supervised by

SUDARSONO, AGUS PURWANTARA, TRIKOESOEMANINGTYAS, and SATRIYAS ILYAS.

Cacao (Theobroma cacao L.) is one of the estate crops having important

role in economy Indonesia. Cacao cultivation faces a lot of constraints, such as crop pests and diseases which can reduce the quality and production of cacao. One of the main diseases which attack cacao in Indonesia is black pod disease caused by Phytophthora palmivora (Butl.) Butl. The disease caused yield losses ranging from 40 to 50% in Indonesia and worldwide.

The research on genetic resistance of cacao against the disease caused by

P. palmivora in Indonesia is still very limited. This research can assist the effort of cacao breeding to produce cacao clones or hybrids which are resistant against P. palmivora and to establish heritability model of F1 progeny to produce crop materials having some high qualities, so that the production of cacao can be

improved. The objectives of this research: (1) To identify P. palmivora species

and to study its genetic variation in cacao production centre of some provinces in Indonesia (2) To establish a standard inoculation method for screening in cacao

resistance (3) To measure pathogenicity of P. palmivora upon cacao (4) To test

cacao germplasm collection against P. palmivora and use them as parental clones

to construct F1 hybrids (5) To study the correlation of resistance levels and observed quantitative characters of several cacao clones (6) To study the potency of high general and specific combining abilities and its heterosis effect on diallel

crossing of cacao clones so that F1 hybrid with high yield and resistance to P.

palmivora and its heritability can be obtained.

In the first part of this research, 24 indigenous isolates of P. palmivora had been isolated from 13 districts and eight provinces in Indonesia. The indigenous isolates produce ellipsoid, globoid, or ovoid sporangia with distinct papillae and pedicel, typical of P. palmivora. Among indigenous isolates, there was no distinct difference in the papilla and their pedicel. Even though the isolates showed similar in morphology, they showed variation in pathogenicity on cacao clones GC 7, ICS

60 and TSH 858. Phytophthora palmivora isolate from Lubuk Basung, West

Sumatra was very pathogenic to pods of the three cacao clones. While the isolates JkBwi (12) and KgBwi (8) from Banyuwangi, East Java; PtBdg (7) from Badung, Bali; SsSpg (36) and AgSpg1 (35) from Sopeng, South Sulawesi, and also Pwmnw from Manokwari, West Papua were pathogenic or very pathogenic.

The second part showed that inoculation using mycelia inoculum was

more efficient than using zoospore, and wounding treatment could assist in accurately detecting cacao seedling resistance against the P. palmivora infection. The estimation of resistance using detached pod was in line with the result of evaluation using cacao seedlings so that the seedlings can be used for an alternative for resistance evaluation against P. palmivora. TSH 858 clone is better to be used as female parent and crossed with Sca 12 as male parent to establish the

population of F1 hybrids which are resistant to the P. palmivora infection and

(4)

iv laboratory for resistance screening gave the similar degree of resistance. Cacao clones showing susceptibility in laboratory have the same susceptibility in the field.

The fourth part indicated that among 35 cacao clones, there were 10 clones which were resistant against P. palmivora infection based on pod inoculation test in laboratory. The clones are: ICCRI 1, ICCRI 3 PA 300, UIT 1, NIC 4, DR 38, ICS 13, TSH 858, Sca 6 and ICS 60. Whereas, the cacao clones showing susceptibility based on inoculation were: RCC 72, KKM 22, NIC 7, DRC 15, DRC 16, RCC71,BL 300, BL 301, KEE2, TSH 908. Genotypes used for the parental clones for future selection process were eight clones: ICCRI 1, ICCRI3, ICS 13, TSH 858, UIT 1, PA 300, NIC 4 and DR38.

The fifth part, based on stomata observation of 10 clones, stomata density in pod and leaf did not show high correlation to the resistance. The number of stomata on resistant and susceptible clones is not significantly different, indicating that cacao clones which are resistant do not always have low stomata density compared to that of susceptible, and vice versa cacao clones which are susceptible do not always have high stomata density in pod and leaf. Study on the activities of chitinase and peroxidase enzymes upon tested clones indicated that there was chitinase role to the resistance of cacao against the infection by P. palmivora. The increase of chitinase activity in resistant clones generally intensified consistently, and so did peroxidase enzyme. Susceptible cacao clones whose peroxidase enzyme activity did not increase were DRC 15 and DRC 16 and they belong to very susceptible clones.

The sixth part of the research showed that there was no gene interaction

(5)

v RUBIYO, Kajian Genetika Ketahanan Tanaman Kakao (Theobroma cacao L.)

terhadap Penyakit Busuk Buah (Phytophthora palmivora Butl) di Indonesia.

Dibimbing oleh SUDARSONO, AGUS PURWANTARA,

TRIKOESOEMANINGTYAS, dan SATRIYAS ILYAS.

Kakao (Theobroma cacao L.) merupakan salah satu komoditas perkebunan

yang mempunyai peran penting dalam perekonomian Indonesia. Budidaya kakao menghadapi banyak kendala di lapangan, antara lain penyakit dan hama tanaman yang dapat menurunkan kuantitas dan kualitas produksi kakao. Salah satu penyakit utama yang menyerang tanaman kakao di Indonesia adalah penyakit

busuk buah (black pod) yang disebabkan oleh Phytophthora palmivora (Butl).

Butl. Penyakit busuk buah kakao mengakibatkan kerugian antara 40 sampai 50% di Indonesia, dan di seluruh dunia.

Penelitian genetika ketahanan kakao terhadap penyakit P. palmivora di

Indonesia belum banyak dilakukan. Penelitian ini dapat membantu usaha pemuliaan untuk memperoleh bahan tanam yang tahan terhadap penyakit busuk buah dan model pewarisan terhadap F1 nya untuk menghasilkan bahan tanam yang mempunyai beberapa sifat unggul, sehingga produksi kakao dapat ditingkatkan. Penelitian ini bertujuan untuk: (1) Melakukan identifikasi spesies P. palmivora dan mengetahui keragaman patogenisitasnya pada lokasi sentra kakao di Indonesia (2) Mengetahui metode inokulasi untuk penapisan ketahanan kakao

(3) Mengetahui patogenitas P. palmivora terhadap tanaman kakao (4) Mengetahui

dan mendapatkan tanaman kakao yang tahan dan rentan terhadap penyakit P.

palmivora di koleksi plasma nutfah kakao untuk digunakan sebagai tetua untuk perakitan hibrida F1 (5) Mengetahui korelasi tingkat ketahanan beberapa klon kakao untuk karakter kuantitatif yang diamati (6) Mengetahui potensi daya gabung umum dan khusus yang tinggi serta efek heterosisnya pada persilangan dialel klon kakao sehingga diperoleh potensi pada hibrida F1 serta heritabilitasnya.

Pada bagian pertama dari penelitian ini telah diperoleh 24 isolat indigenus P. palmivora yang diisolasi dari 13 kabupaten dan delapan provinsi di Indonesia. Isolat indigenus yang didapat mempunyai bentuk sprora ellipsoid, globoid, atau ovoid, tipikal P. palmivora. Di antara isolat tidak terdapat perbedaan yang jelas

pada papila dan pediselnya. Meskipun isolat P. palmivora yang didapat secara

morfologis hampir sama, terdapat perbedaan yang besar dalam tingkat

patogenisitasnya terhadap kakao klon GC 7, ICS 60 atau TSH 858. Isolat P.

palmivora LbSbr dari Lubuk Basung, Sumatra Barat diketahui sangat patogenik terhadap ketiga kultivar kakao yang diuji. Isolat JkBwi (12) dan KgBwi (8) dari

Banyuwangi, Jawa Timur; PtBdg (7) dari Badung, Bali; SsSpg (36) dan AgSpg1

(35) dari Sopeng, Sulawesi Selatan, serta PwMnw dari Manokwari, Papua Barat bersifat patogenik atau sangat patogenik.

Bagian kedua dari penelitian ini menunjukkan bahwa inokulasi dengan

menggunakan inokulum miselia lebih efisien dibandingkan dengan zoospora P.

Palmivora, dan perlakuan pelukaan lebih mampu secara akurat menduga respon

ketahanan bibit kakao terhadap infeksi P. palmivora. Hasil pendugaan ketahanan

(6)

vi

terhadap P. palmivora. Klon TSH 858 lebih baik untuk digunakan sebagai induk

betina dan disilangkan dengan Sca 12 sebagai induk jantan untuk menghasilkan

populasi hibrida F1 yang resisten terhadap infeksi P. palmivora dan berpotensi

berdaya hasil tinggi.

Bagian ketiga menunjukkan bahwa inokulasi untuk mengetahui ketahanan klon kakao di laboratorium maupun di lapangan menghasilkan ketahanan yang sama. Terdapat perbedaan dalam perkembangan luas bercak dan masa inkubasinya. Umumnya rata-rata luas bercak dan perkembangan yang dihasilkan pada inokulasi di laboratorium lebih besar dibandingkan dengan luas bercak yang di hasilkan pada uji inokulasi di lapangan. Masa inkubasi umumnya di lapangan lebih lamban rata-rata 2 hari dibandingkan dengan inokulasi di laboratorium.

Bagian keempat hasil penelitian menunjukkan bahwa berdasarkan hasil uji ketahanan terhadap 35 klon kakao, terdapat 10 klon kakao yang resisten terhadap

infeksi P. palmivora berdasarkan uji inokulasi buah di laboratorium. Klon kakao

tersebut adalah: ICCRI 1, ICCRI 3, PA 300, UIT 1, NIC 4, DR 38, ICS 13, TSH 858, Sca 6 dan ICS 60. sedangkan klon kakao yang menunjukkan hasil rentan berdasarkan hasil inokulasi adalah: RCC 72, KKM 22, NIC 7, DRC 15, DRC 16, RCC71, BL 300, BL 301, KEE2, TSH 908. Genotipe yang digunakan untuk tetua dalam rangka proses seleksi lebih lanjut atau untuk bahan tanam klonal ada delapan klon yaitu: ICCRI 1, ICCRI 3, ICS 13, TSH 858, UIT 1, PA 300, NIC 4 dan DR38.

Bagian kelima menunjukkan bahwa berdasarkan hasil pengamatan stomata pada 10 klon, kerapatan stomata pada daun maupun buah tidak memberikan korelasi yang tinggi terhadap ketahanan. Jumlah stomata tidak berbeda nyata antara kelompok klon yang tahan maupun rentan. Klon kakao yang tahan tidak selalu menghasilkan jumlah kerapatan stomata yang lebih sedikit dibandingkan dengan yang rentan. Klon kakao yang rentan tidak selalu memiliki jumlah stomata yang banyak di daun maupun pada buah. Aktivitas kitinase dan peroksidase terhadap klon kakao yang diuji mengindikasikan ada peran kitinase terhadap

ketahanan kakao dari infeksi P. palmivora. Peningkatan aktivitas kitinase klon

yang tahan umumnya lebih meningkat, begitu juga pada enzim peroksidase. Klon kakao yang rentan, dan tidak memiliki peningkatan aktivitas enzim peroksidase adalah klon DRC 15 dan DRC 16, sehingga klon tersebut masuk dalam kelompok sangat rentan.

Bagian ke enam hasil penelitian menunjukkan bahwa tidak ada interaksi

gen yang terjadi dalam menentukan ketahanan terhadap penyakit P. palmivora.

(7)

vii ©Hak cipta milik Institut Pertanian Bogor, tahun 2009

Hak cipta dilindungi Undang-Undang

1. Dilarang mengutip sebagian atau seluruh karya tulis ini tanpa

mencantumkan atau menyebutkan sumber

a. Pengutipan hanya untuk kepentingan pendidikan, penelitian,

penulisan karya ilmiah, penyusunan laporan, penulisan kritik atau tinjauan suatu masalah

b. Pengutipan tidak merugikan kepentingan yang wajar IPB

2. Dilarang mengumumkan dan memperbanyak sebagian atau seluruh karya

(8)

viii

(Theobroma cacao L.) TERHADAP PENYAKIT BUSUK BUAH

( Phytophthora palmivora Butl.) DI INDONESIA

R U B I Y O

Disertasi

sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar

Doktor pada

Program Studi Agronomi

SEKOLAH PASCASARJANA

INSTITUT PERTANIAN BOGOR

(9)

ix Penguji pada Ujian Tertutup : Dr.Ir.Yudiwanti Wahyu E.K, MS.

Dr.Ir.Muchdar Sudarjo, M.Sc.

Penguji pada Ujian Terbuka: Prof.Dr.Ir. Sudirman Yahya

(10)

x (Theobroma cacao L.) terhadap Penyakit Busuk Buah (Phytophthora palmivora Butl) di Indonesia

Nama : Rubiyo

Nomor Pokok : A 161060011

Program Studi : Agronomi

Disetujui Komisi Pembimbing

Prof. Dr. Ir. Sudarsono, M.Sc. Dr. Ir. Agus Purwantara, APU.

Ketua Anggota

Dr. Ir. Trikoesoemaningtyas, M.Sc. Anggota

Prof. Dr.Ir. Satriyas Ilyas, M.S. Anggota

Diketahui

Ketua Program Studi Agronomi Dekan Sekolah Pascasarjana

Dr. Ir. Munif Ghulamahdi, M.S. Prof. Dr. Ir. Khairil A.Notodiputro, M.S.

(11)

(Theobroma cacao L.) TERHADAP PENYAKIT BUSUK BUAH

(Phytophthora palmivora Butl) DI INDONESIA

R U B I Y O

SEKOLAH PASCASARJANA

INSTITUT PERTANIAN BOGOR

(12)

ii Dengan ini saya menyatakan dengan sebenarnya bahwa semua pernyataan dalam disertasi saya yang berjudul:

” Kajian Genetika Ketahanan Tanaman Kakao (Theobroma cacao L)

terhadap Penyakit Busuk Buah (Phytophthora palmivora Butler) di

Indonesia”

Merupakan gagasan atau hasil penelitian disertasi saya sendiri, dengan pembimbingan oleh para komisi pembimbing, terkecuali yang dengan jelas ditunjukkan rujukannya. Disertasi ini belum pernah diajukan untuk memperoleh gelar pada program sejenis di perguruan tinggi lain.

Semua data dan informasi yang digunakan telah dinyatakan secara jelas dan dapat diperiksa kebenarannya.

Bogor, Oktober 2009

Rubiyo

(13)

iii

RUBIYO, Genetic Study of Cacao (Theobroma cacao L.) Resistance against

Black Pod Disease (Phytophthora palmivora Butl) in Indonesia. Supervised by

SUDARSONO, AGUS PURWANTARA, TRIKOESOEMANINGTYAS, and SATRIYAS ILYAS.

Cacao (Theobroma cacao L.) is one of the estate crops having important

role in economy Indonesia. Cacao cultivation faces a lot of constraints, such as crop pests and diseases which can reduce the quality and production of cacao. One of the main diseases which attack cacao in Indonesia is black pod disease caused by Phytophthora palmivora (Butl.) Butl. The disease caused yield losses ranging from 40 to 50% in Indonesia and worldwide.

The research on genetic resistance of cacao against the disease caused by

P. palmivora in Indonesia is still very limited. This research can assist the effort of cacao breeding to produce cacao clones or hybrids which are resistant against P. palmivora and to establish heritability model of F1 progeny to produce crop materials having some high qualities, so that the production of cacao can be

improved. The objectives of this research: (1) To identify P. palmivora species

and to study its genetic variation in cacao production centre of some provinces in Indonesia (2) To establish a standard inoculation method for screening in cacao

resistance (3) To measure pathogenicity of P. palmivora upon cacao (4) To test

cacao germplasm collection against P. palmivora and use them as parental clones

to construct F1 hybrids (5) To study the correlation of resistance levels and observed quantitative characters of several cacao clones (6) To study the potency of high general and specific combining abilities and its heterosis effect on diallel

crossing of cacao clones so that F1 hybrid with high yield and resistance to P.

palmivora and its heritability can be obtained.

In the first part of this research, 24 indigenous isolates of P. palmivora had been isolated from 13 districts and eight provinces in Indonesia. The indigenous isolates produce ellipsoid, globoid, or ovoid sporangia with distinct papillae and pedicel, typical of P. palmivora. Among indigenous isolates, there was no distinct difference in the papilla and their pedicel. Even though the isolates showed similar in morphology, they showed variation in pathogenicity on cacao clones GC 7, ICS

60 and TSH 858. Phytophthora palmivora isolate from Lubuk Basung, West

Sumatra was very pathogenic to pods of the three cacao clones. While the isolates JkBwi (12) and KgBwi (8) from Banyuwangi, East Java; PtBdg (7) from Badung, Bali; SsSpg (36) and AgSpg1 (35) from Sopeng, South Sulawesi, and also Pwmnw from Manokwari, West Papua were pathogenic or very pathogenic.

The second part showed that inoculation using mycelia inoculum was

more efficient than using zoospore, and wounding treatment could assist in accurately detecting cacao seedling resistance against the P. palmivora infection. The estimation of resistance using detached pod was in line with the result of evaluation using cacao seedlings so that the seedlings can be used for an alternative for resistance evaluation against P. palmivora. TSH 858 clone is better to be used as female parent and crossed with Sca 12 as male parent to establish the

population of F1 hybrids which are resistant to the P. palmivora infection and

(14)

iv laboratory for resistance screening gave the similar degree of resistance. Cacao clones showing susceptibility in laboratory have the same susceptibility in the field.

The fourth part indicated that among 35 cacao clones, there were 10 clones which were resistant against P. palmivora infection based on pod inoculation test in laboratory. The clones are: ICCRI 1, ICCRI 3 PA 300, UIT 1, NIC 4, DR 38, ICS 13, TSH 858, Sca 6 and ICS 60. Whereas, the cacao clones showing susceptibility based on inoculation were: RCC 72, KKM 22, NIC 7, DRC 15, DRC 16, RCC71,BL 300, BL 301, KEE2, TSH 908. Genotypes used for the parental clones for future selection process were eight clones: ICCRI 1, ICCRI3, ICS 13, TSH 858, UIT 1, PA 300, NIC 4 and DR38.

The fifth part, based on stomata observation of 10 clones, stomata density in pod and leaf did not show high correlation to the resistance. The number of stomata on resistant and susceptible clones is not significantly different, indicating that cacao clones which are resistant do not always have low stomata density compared to that of susceptible, and vice versa cacao clones which are susceptible do not always have high stomata density in pod and leaf. Study on the activities of chitinase and peroxidase enzymes upon tested clones indicated that there was chitinase role to the resistance of cacao against the infection by P. palmivora. The increase of chitinase activity in resistant clones generally intensified consistently, and so did peroxidase enzyme. Susceptible cacao clones whose peroxidase enzyme activity did not increase were DRC 15 and DRC 16 and they belong to very susceptible clones.

The sixth part of the research showed that there was no gene interaction

(15)

v RUBIYO, Kajian Genetika Ketahanan Tanaman Kakao (Theobroma cacao L.)

terhadap Penyakit Busuk Buah (Phytophthora palmivora Butl) di Indonesia.

Dibimbing oleh SUDARSONO, AGUS PURWANTARA,

TRIKOESOEMANINGTYAS, dan SATRIYAS ILYAS.

Kakao (Theobroma cacao L.) merupakan salah satu komoditas perkebunan

yang mempunyai peran penting dalam perekonomian Indonesia. Budidaya kakao menghadapi banyak kendala di lapangan, antara lain penyakit dan hama tanaman yang dapat menurunkan kuantitas dan kualitas produksi kakao. Salah satu penyakit utama yang menyerang tanaman kakao di Indonesia adalah penyakit

busuk buah (black pod) yang disebabkan oleh Phytophthora palmivora (Butl).

Butl. Penyakit busuk buah kakao mengakibatkan kerugian antara 40 sampai 50% di Indonesia, dan di seluruh dunia.

Penelitian genetika ketahanan kakao terhadap penyakit P. palmivora di

Indonesia belum banyak dilakukan. Penelitian ini dapat membantu usaha pemuliaan untuk memperoleh bahan tanam yang tahan terhadap penyakit busuk buah dan model pewarisan terhadap F1 nya untuk menghasilkan bahan tanam yang mempunyai beberapa sifat unggul, sehingga produksi kakao dapat ditingkatkan. Penelitian ini bertujuan untuk: (1) Melakukan identifikasi spesies P. palmivora dan mengetahui keragaman patogenisitasnya pada lokasi sentra kakao di Indonesia (2) Mengetahui metode inokulasi untuk penapisan ketahanan kakao

(3) Mengetahui patogenitas P. palmivora terhadap tanaman kakao (4) Mengetahui

dan mendapatkan tanaman kakao yang tahan dan rentan terhadap penyakit P.

palmivora di koleksi plasma nutfah kakao untuk digunakan sebagai tetua untuk perakitan hibrida F1 (5) Mengetahui korelasi tingkat ketahanan beberapa klon kakao untuk karakter kuantitatif yang diamati (6) Mengetahui potensi daya gabung umum dan khusus yang tinggi serta efek heterosisnya pada persilangan dialel klon kakao sehingga diperoleh potensi pada hibrida F1 serta heritabilitasnya.

Pada bagian pertama dari penelitian ini telah diperoleh 24 isolat indigenus P. palmivora yang diisolasi dari 13 kabupaten dan delapan provinsi di Indonesia. Isolat indigenus yang didapat mempunyai bentuk sprora ellipsoid, globoid, atau ovoid, tipikal P. palmivora. Di antara isolat tidak terdapat perbedaan yang jelas

pada papila dan pediselnya. Meskipun isolat P. palmivora yang didapat secara

morfologis hampir sama, terdapat perbedaan yang besar dalam tingkat

patogenisitasnya terhadap kakao klon GC 7, ICS 60 atau TSH 858. Isolat P.

palmivora LbSbr dari Lubuk Basung, Sumatra Barat diketahui sangat patogenik terhadap ketiga kultivar kakao yang diuji. Isolat JkBwi (12) dan KgBwi (8) dari

Banyuwangi, Jawa Timur; PtBdg (7) dari Badung, Bali; SsSpg (36) dan AgSpg1

(35) dari Sopeng, Sulawesi Selatan, serta PwMnw dari Manokwari, Papua Barat bersifat patogenik atau sangat patogenik.

Bagian kedua dari penelitian ini menunjukkan bahwa inokulasi dengan

menggunakan inokulum miselia lebih efisien dibandingkan dengan zoospora P.

Palmivora, dan perlakuan pelukaan lebih mampu secara akurat menduga respon

ketahanan bibit kakao terhadap infeksi P. palmivora. Hasil pendugaan ketahanan

(16)

vi

terhadap P. palmivora. Klon TSH 858 lebih baik untuk digunakan sebagai induk

betina dan disilangkan dengan Sca 12 sebagai induk jantan untuk menghasilkan

populasi hibrida F1 yang resisten terhadap infeksi P. palmivora dan berpotensi

berdaya hasil tinggi.

Bagian ketiga menunjukkan bahwa inokulasi untuk mengetahui ketahanan klon kakao di laboratorium maupun di lapangan menghasilkan ketahanan yang sama. Terdapat perbedaan dalam perkembangan luas bercak dan masa inkubasinya. Umumnya rata-rata luas bercak dan perkembangan yang dihasilkan pada inokulasi di laboratorium lebih besar dibandingkan dengan luas bercak yang di hasilkan pada uji inokulasi di lapangan. Masa inkubasi umumnya di lapangan lebih lamban rata-rata 2 hari dibandingkan dengan inokulasi di laboratorium.

Bagian keempat hasil penelitian menunjukkan bahwa berdasarkan hasil uji ketahanan terhadap 35 klon kakao, terdapat 10 klon kakao yang resisten terhadap

infeksi P. palmivora berdasarkan uji inokulasi buah di laboratorium. Klon kakao

tersebut adalah: ICCRI 1, ICCRI 3, PA 300, UIT 1, NIC 4, DR 38, ICS 13, TSH 858, Sca 6 dan ICS 60. sedangkan klon kakao yang menunjukkan hasil rentan berdasarkan hasil inokulasi adalah: RCC 72, KKM 22, NIC 7, DRC 15, DRC 16, RCC71, BL 300, BL 301, KEE2, TSH 908. Genotipe yang digunakan untuk tetua dalam rangka proses seleksi lebih lanjut atau untuk bahan tanam klonal ada delapan klon yaitu: ICCRI 1, ICCRI 3, ICS 13, TSH 858, UIT 1, PA 300, NIC 4 dan DR38.

Bagian kelima menunjukkan bahwa berdasarkan hasil pengamatan stomata pada 10 klon, kerapatan stomata pada daun maupun buah tidak memberikan korelasi yang tinggi terhadap ketahanan. Jumlah stomata tidak berbeda nyata antara kelompok klon yang tahan maupun rentan. Klon kakao yang tahan tidak selalu menghasilkan jumlah kerapatan stomata yang lebih sedikit dibandingkan dengan yang rentan. Klon kakao yang rentan tidak selalu memiliki jumlah stomata yang banyak di daun maupun pada buah. Aktivitas kitinase dan peroksidase terhadap klon kakao yang diuji mengindikasikan ada peran kitinase terhadap

ketahanan kakao dari infeksi P. palmivora. Peningkatan aktivitas kitinase klon

yang tahan umumnya lebih meningkat, begitu juga pada enzim peroksidase. Klon kakao yang rentan, dan tidak memiliki peningkatan aktivitas enzim peroksidase adalah klon DRC 15 dan DRC 16, sehingga klon tersebut masuk dalam kelompok sangat rentan.

Bagian ke enam hasil penelitian menunjukkan bahwa tidak ada interaksi

gen yang terjadi dalam menentukan ketahanan terhadap penyakit P. palmivora.

(17)

vii ©Hak cipta milik Institut Pertanian Bogor, tahun 2009

Hak cipta dilindungi Undang-Undang

1. Dilarang mengutip sebagian atau seluruh karya tulis ini tanpa

mencantumkan atau menyebutkan sumber

a. Pengutipan hanya untuk kepentingan pendidikan, penelitian,

penulisan karya ilmiah, penyusunan laporan, penulisan kritik atau tinjauan suatu masalah

b. Pengutipan tidak merugikan kepentingan yang wajar IPB

2. Dilarang mengumumkan dan memperbanyak sebagian atau seluruh karya

(18)

viii

(Theobroma cacao L.) TERHADAP PENYAKIT BUSUK BUAH

( Phytophthora palmivora Butl.) DI INDONESIA

R U B I Y O

Disertasi

sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar

Doktor pada

Program Studi Agronomi

SEKOLAH PASCASARJANA

INSTITUT PERTANIAN BOGOR

(19)

ix Penguji pada Ujian Tertutup : Dr.Ir.Yudiwanti Wahyu E.K, MS.

Dr.Ir.Muchdar Sudarjo, M.Sc.

Penguji pada Ujian Terbuka: Prof.Dr.Ir. Sudirman Yahya

(20)

x (Theobroma cacao L.) terhadap Penyakit Busuk Buah (Phytophthora palmivora Butl) di Indonesia

Nama : Rubiyo

Nomor Pokok : A 161060011

Program Studi : Agronomi

Disetujui Komisi Pembimbing

Prof. Dr. Ir. Sudarsono, M.Sc. Dr. Ir. Agus Purwantara, APU.

Ketua Anggota

Dr. Ir. Trikoesoemaningtyas, M.Sc. Anggota

Prof. Dr.Ir. Satriyas Ilyas, M.S. Anggota

Diketahui

Ketua Program Studi Agronomi Dekan Sekolah Pascasarjana

Dr. Ir. Munif Ghulamahdi, M.S. Prof. Dr. Ir. Khairil A.Notodiputro, M.S.

(21)

xi Bismillahirrahmanirrahiim. Alhamdulillah, puji dan syukur penulis sampaikan kehadirat Alloh SWT atas segala karunia dan petunjuk-NYA, sehingga penelitian dan penulisan disertasi ini dapat diselesaikan. Solawat dan salam semoga senantiasa tercurah kepada Nabi Muhammad SAW, yang telah membawa cahaya dan petunjuk bagi kehidupan umat manusia hingga akhir zaman.

Disertasi dengan judul “Kajian Genetika Ketahanan Tanaman Kakao

(Theobroma cacao L.) terhadap Penyakit Busuk Buah (Phytophthora

palmivora Butl) di Indonesia “ disusun berdasarkan penelitian–penelitian yang dilakukan di lapangan yang meliputi sembilan propinsi (Sumatra Utara, Sumatra Barat, Jawa Barat, Jawa timur, Bali, Sulawesi Selatan, Sulawesi Barat, Sulawesi Tenggara dan Papua Barat) saat pengambilan isolat di Indonesia. Penelitian di

laboratorium Balai Penelitian Bioteknologi Perkebunan Bogor, laboratorium fitopatologi dan kebun percobaan Kaliwining Pusat Penelitian Kopi dan Kakao Indonesia Jember Jawa Timur Lembaga Riset Perkebunan Indonesia.

(22)

xii penulisan disertasi dapat diselesaikan. Karena itu ungkapan dan penghargaan ucapan terimakasih penulis sampaikan kepada:

1. Ketua komisi pembinaan tenaga Badan Penelitian dan Pengembangan Pertanian Departemen Pertanian atas kepercayaan, biaya dan fasilitas yang diberikan selama tugas belajar sehingga penulis dapat menyelesaikan pendidikan Program S3 di Institut Pertanian Bogor.

2. Kepala Badan Penelitian dan Pengembangan Pertanian yang telah memberikan beasiswa dan biaya penelitian, ijin dan kesempatan tugas belajar S3 kepada penulis di Institut Pertanian Bogor

3. Rektor Institut Pertanian Bogor, Dekan Sekolah Pascasarjana, Ketua PS Agronomi Sekolah Pascasarjana Institut Pertanian Bogor atas kesempatan dan dukungan yang diberikan mulai dari perkuliahan sehingga penulis dapat menjalankan penelitian dan menyelesaikan penulisan disertasi ini dengan baik.

4. Dr. H. Darmono Taniwiryono dan Dr.Hj. Endang Nurhayati yang telah menguji penulis pada ujian lisan Prakualifikasi Program Doktor.

5. Kepala BPTP Bali dan staf atas dukungannya selama penulis mengikuti tugas belajar program Doktor di Institut Pertanian Bogor.

6. Direktur Balai Penelitian Bioteknologi Perkebunan Bogor-Lembaga Riset Perkebunan Indonesia atas ijin dan fasilitas yang diberikan selama penelitian berlangsung di Laboratorium maupun rumah kaca.

8. Direktur Pusat Penelitian Kopi dan Kakao Indonesia atas ijin dan fasilitas yang diberikan selama penelitian berlangsung baik di kebun percobaan Kaliwining maupun Laboratorium dan perpustakaan dalam studi literatur.

(23)

xiii Pertanian Bogor yang telah memberikan ilmu selama penulis mengambil kuliah untuk program S3 di Institut Pertanian Bogor.

11. Dr.Ir. H. Sutanto Abdulah, SU., Ir.Sri-Sukamto,MP., Ir.Dedy Suhendi, MS., Ir. Sudarsianto, Ir. Nurkolis, atas bantuannya selama penelitian berlangsung di laboratorium dan lapangan yang diberikan, juga diskusi-diskusi yang sangat membantu sehingga sangat dimungkinkan penelitian berlangsung dengan lancar.

12. Ucapan yang sama juga disampaikan kepada Dr.M.Syukur, Atekan, SP, M.Si; Alfian Futuhulhadi, S.Si, M.Si atas bantuan dalam analisa data penelitian ini.

13. Ir.Endang Mufrihati yang telah banyak membantu dalam pengambilan isolat di Provinsi Sumatera Utara, Sumatra Barat dan Papua Barat, Ir.Suparti Disbun Sopeng yang telah membantu dalam pengambilan isolat di daerah Sulawesi Selatan, Ucapan yang sama juga disampaikan kepada Ir. Ramlan, MP Peneliti di BPTP Sulbar yang membantu dalam pengambilan isolat di Sulawesi Barat, Imran, SP peneliti BPTP Sulawesi Tenggara juga membantu pengambilan isolat di daerah Sultra dan Mas Rahmat (yang dengan tekun membantu dalam isolasi isolat dan

inokulasi di Laboratorium dan Green house Balai Penelitian Bioteknologi Perkebunan Bogor).

14. Rekan–rekan di laboratorium dan kebun percobaan Kaliwining: Supandi, SP., Ir.Dody Sulistyo, Suliono, Sukarmin, Sarkawi, Adi Hario, mbak Khotijah, Mbak Imsiah, bu Aan, mas Sumarto dan pak Karmidin, dan berbagai pihak yang telah banyak membantu di kebun maupun di laboratorium, mulai dari persiapan persilangan hingga inokulasi dan tabulasi data.

15. Rekan di Lab.Biomol IPB (mbak Minarti, Susiani dan Mas Agus serta Mas Joko) yang telah banyak membantu dalam penelitian ini.

(24)

xiv kedua orang tua penulis: Bapak Yasareja [Alm] dan Ibu Mukinah atas perjuangan, pengorbanan dan doa yang tidak pernah terhenti dalam membesarkan dan mendidik penulis.

18.Terimakasih kepada Bapak dan Ibu mertua (Bapak Ismail Mahardi [alm] dan Ibu Siti Juariah) yang telah mendidik dan memberikan istri yang sangat baik bagi penulis.

19.Rasa terimakasih yang sebesar-besarnya juga penulis sampaikan kepada istri tercinta Ir. Endang Mufrihati serta ananda Nicho Nurdebyandaru, S.Si, Briliandaru Mahardhiyasa Pribadi, Dhimas Upadyandaru SB, Prabandaru Nuriza Daksa B dan F.Adellia Virgiandaru Huzna yang telah melengkapi dan memberikan kebahagiaan bagi kehidupan penulis serta dengan segala pengertian, pengorbanan, kesabarannya dan doa yang tidak pernah terlupakan selama penulis menyelesaikan studi S3 ini. 20.Terimakasih juga penulis sampaikan kepada kakak dan adik (Mas Ir.

Zaenal Arifin, mbak Ir.Susilowati, Mas Samsul Hadi, mbak Rohma, dik Min, dik Mini dik Tugiya, SE, dik Mery beserta keluarga) serta sanak famili yang tidak dapat penulis sebutkan satu persatu.

21.Terimakasih kepada berbagai pihak yang telah membantu pelaksanaan

dan penyelesaian disertasi penulis yang tidak dapat disebutkan satu persatu dalam tulisan ini.

Semoga bimbingan, bantuan, dukungan dan doa dari berbagai pihak akan menjadi amal baik dan mendapatkan balasan yang berlipat ganda dari Alloh SWT. Akhir kata, semoga tulisan ini bermanfaat bagi pengembangan dan kemajuan ilmu pengetahuan khususnya perkakaoan di Indonesia untuk kehidupan dan kemakmuran kita bersama. Amin.

Bogor, Oktober 2009

(25)

xv RIWAYAT HIDUP

Penulis dilahirkan di Gunung Kidul Yogyakarta tanggal, 11 November 1963 sebagai anak sulung pasangan Yasareja dan Mukinah. Pendidikan sarjana ditempuh di Program Studi Budidaya Pertanian, Fakultas Pertanian Universitas Moch. Sroedji Jember, lulus pada tahun 1989. Pada tahun 2004 menyelesaikan pendidikan di Sekolah Pascasarjana Universitas Udayana program studi pertanian lahan kering. Kesempatan untuk melanjutkan ke program Doktor pada Program Studi Agronomi Sekolah Pascasarjana Institut Pertanian Bogor diperoleh pada tahun 2006. Beasiswa pendidikan Pascasarjana S3 diperoleh dari Badan Penelitian dan Pengembangan Pertanian – Departemen Pertanian.

Penulis mulai bekerja di Balai Penelitian Perkebunan Jember sekarang Pusat Penelitian Kopi dan Kakao Indonesia tahun 1984 - 1997 sebagai staf pada bidang pemuliaan tanaman kakao. Mulai tahun 1998 penulis memilih jalur PNS dan ditempatkan di Balai Pengkajian Teknologi Pertanian (BPTP) Kendari lingkup Badan Penelitian dan Pengembangan Pertanian sebagai Staf Peneliti. Tahun 2001 sampai sekarang sebagai peneliti di BPTP Bali. Pada tahun

2002-2004 sebagai Pemimpin Proyek PAATP Bali. Jabatan fungsional Peneliti pertama diperoleh pada tahun 2000 sebagai Asisten Peneliti Madya bidang budidaya pertanian dan tahun 2003 sebagai Ajun Peneliti Madya, kemudian jabatan Peneliti Madya diperoleh pada tahun 2005. Selama menjadi peneliti karya tulis yang dipublikasikan di Jurnal Ilmiah Nasional sebagai penulis utama 12 buah dan sebagai penulis kedua 15 buah.

Dua buah karya ilmiah berjudul (1) “Response of 35 Cacao Collections of

Indonesian Coffee and Cacao Research Institute against Phytophthora palmivora

Butl. Infection Based on Detached Pod Assays “ dan (2) Judul” Heritability and

Genetic control of black pod disease caused by P. palmivora infection in cacao”

diterima sebagai makalah dan akan dipresentasikan pada International Cacao Research Conference (ICRC) di Bali November 2009. Dua artikel telah

(26)

xvi

kedua (2) dengan judul: “Uji ketahanan kakao (Theobroma cacao L.) terhadap

penyakit busuk buah dan efektivitas metode inokulasi” pada Jurnal Pelita

Perkebunan. Karya-karya ilmiah tersebut merupakan bagian dari program S3 penulis. Sebagai seorang peneliti pemuliaan kakao bersama dengan peneliti yang lain pada tahun 2004 dan 2005 telah melepas 4 klon kakao (ICCRI 1, ICCRI 2, ICCRI 3 dan ICCRI 4) sebagai klon unggul nasional.

(27)

xvii TUJUAN PENELITIAN ... 7 MANFAAT PENELITIAN... 7 HIPOTESIS ... 8 TINJAUAN PUSTAKA... 9 A.MorfologiTanaman kakao ... 9 B. Keragaman GenetikTanaman kakao... 11 C. Penyakit Busuk Buah Kakao ... 12 D. Pengendalian Penyakit Busuk Buah... 16 E. Mekanisme Ketahanan... 17 F Mekanisme Ketahanan Struktural ... Mekanisme Ketahanan Biokimia ...

18 20 G. Genetika Ketahan Kakao terhadap Penyakit P.palmivora... 22 H. Analisis Daya Gabung... 24 I. Heterosis ... 25 J.Heritabilitas... 26 JUDUL 1. ISOLATION OF INDIGENOUS Phytophthora palmivora

(28)

xviii TERHADAP PENYAKIT BUSUK BUAH DAN EFEKTIVITAS METODE INOKULASI ... 47 JUDUL 3. UJI KETAHANAN KAKAO DI LAPANGAN DAN

LABORATORIUM TERHADAP PENYAKIT BUSUK BUAH (Phytophthora palmivora Butler)... 68 Abstract ... 69 Pendahuluan ... 70 Bahan dan Metode... 72

Penelitian uji ketahanan tanaman kakao di laboratorium dan lapangan .. 72

Uji Detached Pod di laboratorium... 73 JUDUL 4. PENELITIAN RESISTENSI KLON KAKAO

TERHADAP INFEKSI Phytophthora palmivora Butl RESPON

35 KLON KAKAO BERDASARKAN UJI DETACHED POD ... 82

(29)

xix Simpulan... 98 Daftar Pustaka ... 98 JUDUL 5. AKTIVITAS ENZIM KITINASE , PEROKSIDASE

SERTA KERAPATAN STOMATA PADA KETAHANAN KAKAO (Theobroma cacao L) TERHADAP PENYAKIT BUSUK BUAH ( P. Palmivora) ... 100 Apstrak ... 101 Pendahuluan ... 102 Bahan dan Metode... 104 A. Penelitian Kerapatan stomata terhadap buah dan daun akao ... 104 Pengamatan stomata buah kakao... 104 B. Penelitian Aktivitas Kitinase dan Peroksidase Daun pada Beberapa

Klon kakao ... 105 Ekstraksi Protein ... 106 Analisis Total Protein Terlarut (TPT) ... 106 Analisis Aktivitas kitinase... 106 Analisis Aktivitas Peroksidase ... 107 Hasil dan Pembahasan... 107 Simpulan... 111 Daftar Pustaka ... 112 JUDUL 6. PENDUGAAN PARAMETER GENETIK UNTUK

KARAKTER KETAHANAN TANAMAN KAKAO (Theobroma

(30)
(31)

Halaman

1 Daftar lokasi pengambilan contoh buah kakao terinfeksi penyakit

busuk buah kakao, jumlah isolat cendawan dan jumlah isolat P.

palmivora indigenus yang teridentifikasi dari masing-masing lokasi.... 37

2 Karakteristik morfologis isolat P. palmivora indigenus berdasarkan

bentuk spora dan keberadaan pedisel serta papila... 39

3 Pengelompokkan patogenisitas isolat P. palmivora indigenus yang

diisolasi dari berbagai pusat produksi kakao di Indonesia berdasarkan respons buah kakao klon GC7 (rentan), ICS60 (agak resisten), dan TSH858 (resisten – terhadap infeksi P. palmivora)... 41

4 Pathogenicity grouping of indigenous isolates of Phytophthora

palmivora isolated from various cacao production centers in Indonesia based on the response of pods of cacao clones GC7 (susceptible), ICS60 (moderately resistance), and TSH858 (resistance - against P. palmivora infection)... 42

5 Pengaruh jenis inokulan terhadap persentase bibit kakao klon GC 7

dan Sca 12 yang terinfeksi P. palmivora dan kisaran panjang bercak

pada batang yang dihasilkan. Pengamatan panjang bercak dilakukan 28 hari sesudah inokulasi batang dari bibit kakao yang diuji. ... 60

6 Pengaruh pelukaan terhadap persentase bibit kakao klon GC 7 dan

Sca 12 yang terinfeksi P. palmivora dan kisaran panjang bercak

pada batang yang dihasilkan. Pengamatan dilakukan 28 hari sesudah inokulasi bibit kakao yang diuji. ... 61

7 Jumlah bercak bibit kakao hibrida F1 (ICS 60 x Sca 12) dan hibrida

F1 (TSH 858 x Sca 12) serta zuriat kakao klon Sca 12 yang

terinfeksi P. palmivora dan rataan panjang bercak pada daun yang

dihasilkan. Pengamatan panjang bercak dilakukan 7 (I), 14 (II), and 21 (III) hari sesudah inokulasi daun bibit kakao yang diuji ... 64

8 Persentase bibit kakao hibrida F1 (ICS 60 x Sca 12) dan hibrida F1

(TSH 858 x Sca 12) serta zuriat kakao klon Sca 12 yang terinfeksi P. palmivora dan kisaran panjang bercak pada daun yang dihasilkan. Pengamatan lebar bercak dilakukan 14 (I), 21 (II), and 28 (III) hari sesudah inokulasi daun bibit kakao yang diuji... 64

9 Rata-rata luas bercak (cm2) hasil inokulasi beberapa klon kakao di

Laboratorium 7 hari setelah inokulasi P. palmivora... 74

10 Rata-rata luas bercak (cm2) hasil inokulasi beberapa klon kakao di

Lapangan 9 hari setelah inokulasi P. palmivora... 76

11 Material Genotipe Kakao yang digunakan sebagai uji Evaluasi

(32)

vi

diinokulasi dengan miselia P. palmivora menggunakan uji detached

pod di laboratorium. Pengamatan dilakukan pada tiga sampai

dengan tujuh hari sesudah inokulasi (HSI)………... .. 91

13 Rataan lebar bercak pada permukaan buah kakao yang diinokulasi

dengan miselia P. palmivora menggunakan uji detached pod di

laboratorium. Pengamatan dilakukan pada tiga sampai dengan tujuh hari sesudah inokulasi (HSI) ... 93

14 Rataan luas bercak pada buah yang diuji dan pengelompokan

respons terhadap infeksi P. palmivora berdasarkan uji detached pod di laboratorium. Pengamatan dilakukan pada 3 - 7 hari sesudah inokulasi (HSI) ... 94

15 Persentase buah tanpa gejala, rataan luas bercak dan pengelompokan

respons terhadap infeksi P. palmivora berdasarkan uji detached pod di laboratorium. Pengamatan dilakukan pada 7 hari sesudah inokulasi (HSI) ... 95

16 Tipe kakao, bentuk buah dan pengelompokan respons klon kakao

koleksi Puslit Kopi dan Kakao Indonesia terhadap infeksi P.

palmivora berdasarkan uji detached pod di laboratorium. Penentuan respons didasarkan pada luas bercak yang diamati pada 7 hari sesudah inokulasi (HIS) ... 95

17 Nilai duga ragam genetik luas bercak setelah inokulasi hari ke 6 dan

ke 7 ... 97

18 Rata-rata Kerapatan Stomata Daun dan buah (cm2) Pada Beberapa

Klon Kakao ... 108

19 Kandungan dan aktivitas kitinase ( µM pNP/mg protein/jam) pada

daun kakao sehat dan terinfeksi penyakit busuk buah P. Palmivora... 110

20 Kandungan dan Aktivitas Peroksidase ( µM pNP/mg protein/jam)

pada daun kakao sehat dan terinfeksi penyakit busuk buah P.palmivora... 110

21 Karakteristik klon sebagai tetua untuk pembentukan populasi hibrida

F1... 121 22 Persilangan setengah dialel menggunakan lima tetua ... 122 23 Komponen Analisis ragam analisis silang dialel... 123 24 Pengelompokan ketahanan ... 124 25 Komponen Analisis Ragam untuk populasi dialel ... 125 26 Persilangan dialel ketahanan kakao terhadap P. palmivora... 125

27 Komponen analisis ragam untuk daya gabung menggunakan

(33)

vii

29 palmivora ……… 133

30 Heritabilitas dalam arti luas (h2bs) dan heritabilitas dalam arti sempit

(h2ns ) komponen ketahanan berdasarkan luas bercak dan Intensitas

Penyakit terhadap P. palmivora. ... 136

31 Anova daya gabung karakter luas bercak terhadap penyakit

Phytopthora palmivora pada tanaman kakao... 137

32 Nilai efek daya gabung umum (DGU) dan Daya Gabung Khusus

(DGK) genotipe tanaman kakao berdasarkan luas bercak dan intensitas penyakit hasil inokulasi ketahanan terhadap penyakit Phytopthora palmivora... 138

33 Penampilan tetua, F1, nilai heterosis rata-rata tetua, dan heterosis

rata-rata tetua tertinggi persilangan genotipe tanaman kakao berdasarkan luas bercak... 139

34 Penampilan tetua, F1, nilai heterosis rata-rata tetua, dan heterosis

(34)

Halaman

1 Beberapa Type Kakao trinitario yang berkembang di Indonesia ... 12

2 A dan B Bentuk Sporangium P.palmivora dan pedise... 14

3 (A). Serangan P.palmivora pada buah kakao dan (B).Serangan

P.palmivora pada bibit ... 15

4 (A) Kerapatan stomata pada epidermis buah kakao (B) Tabung

kecambah saat penetrasi pada stomata ... 19

5 (A) buah kakao klon GC7 (rentan), (B). Buah kakao klon DRC 16

(resisten) ... 23

6 Tahapan isolasi P. palmivora indigenus dari contoh buah kakao

terinfeksi busuk buah dari lapangan dan karakter morfologis isolat.

(a) Contoh buah kakao terinfeksi; (b) Baiting step – inokulasi buah kakao sehat dengan miselia potongan contoh buah sakit dari lapangan, (c) Kemunculan bercak gejala pada buah sehat yang diinokulasi dengan potongan buah bergejala dari lapangan dan potongan buah pada perbatasan jaringan yang bergejala dan tidak bergejala hasil baiting yang digunakan sebagai inokulum pada tahapan isolasi; (d) Koloni cendawan yang tumbuh dari inokulum pada medium PDA; (e) Contoh pembentukan spora pada isolat

cendawan yang diduga P. palmivora. Pengamatan mikroskopik

untuk kemampuan membentuk spora spesifik tersebut digunakan untuk mengidentifikasi isolat cendawan yang dievaluasi sebagai isolat P. palmivora; dan (f) Contoh morfologi spora - ovoid (O) dan ellipsoid (E). ... 34 7 Variasi patogenisitas isolat P. Palmivora indigenus yang berasal dari

sentra produksi kakao di Indonesia berdasarkan luas bercak pada buah kakao klon GC7 (a,b,c), ICS60 (d,e,f), dan TSH858 (g,h,i).

Setiap buah kakao diinokulasi dengan satu isolat P. Palmivora

indigenus. Gejala dicatat pada hari ke 3 (a,d,g), 5 (b,e,h), atau 7 (c,f,i) sesudah inokulasi dengan masing-masing isolat ... 35

8 Inokulasi P. palmivora pada buah dan daun kakao. (a) Buah kakao

terinfeksi P. palmivora dari lapangan yang digunakan sebagai

sumber isolat; (b) Kultur P. palmivora dengan miselia yang aktif

tumbuh; (c) Sporangia P. palmivora; (d) Gejala infeksi P. palmivora pada buah dan (e) pada daun kakao hasil inokulasi buatan... 52

9 Persentase buah kakao klon GC 7 dan Sca 12 total yang terinfeksi P.

palmivora dengan kisaran diameter bercak yang ditimbulkan. Pengamatan dilakukan 7 hari sesudah inokulasi buah. ... 54 10 Pengaruh pelukaan buah terhadap persentase buah kakao klon GC 7

dan Sca 12 yang terinfeksi P. palmivora pada berbagai kisaran

(35)

dengan pelukaan buah sebelum diinokulasi. GC 7 – TPl dan Sca 12 – TPl: buah kakao klon GC 7 dan Sca 12 tanpa pelukaan buah sebelum diinokulasi... 55 11 Pengaruh jenis inokulum terhadap persentase buah kakao klon GC 7

dan Sca 12 yang terinfeksi P. palmivora pada berbagai kisaran

diameter bercak yang ditimbulkan ( dengan pelukaan, 7 hari sesudah inokulasi buah). GC 7 – M dan Sca 12– M: buah kakao klon GC 7 dan Sca 12 yang diinokulasi dengan miselia. GC 7 – Z dan Sca 12 – Z: buah kakao klon GC 7 dan Sca 12 yang diinokulasi dengan zoospora. ... 56 12 Representasi perkembangan luas bercak 5 klon kakao inokulasi di

laboratorium ... 75 13 Representasi perkembangan luas bercak 5 klon kakao

inokulasi di Laboratorium ... 76 14 Representasi perkembangan luas bercak tiga klon kakao PA 300,

DR 2 dan GC7 inokulasi di lapangan dan laboratorium beberapa

klon kakao terhadap penyakit busuk buah P.palmivora... 76

15 Luas bercak (cm2) hasil inokulasi di Lapangan dan Laboratorium

beberapa klon kakao terhadap penyakit busuk buah P. palmivora

Stomata daun kakao klon TSH 858, ICCRI , GC 7 dan ICS 13... 77

16 Stomata daun kakao klon TSH 858, ICCRI , GC 7 dan ICS 13... 108 17 Hubungan kerapatan stomata daun dan buah dengan luas bercak

yang disebabkan oleh infeksi P. palmivora... 109

18 Hubungan peragam (Wr) dan Ragam (Vr) 5 klon kakao sifat ketahanannya

(36)

PENDAHULUAN

Latar Belakang

Kakao (Theobromacacao L.) merupakan salah satu komoditas perkebunan

yang mempunyai peran penting dalam perekonomian Indonesia. Pada tahun 2002, dari 776 ribu ha areal kakao Indonesia, sekitar 668 ribu ha atau 86 % adalah kakao rakyat (Anonim, 2004). Hal ini mengindikasikan peran penting kakao baik sebagai sumber lapangan kerja maupun pendapatan bagi petani. Disamping itu, areal dan produksi kakao Indonesia meningkat pesat pada dekade terakhir, dengan laju 7,99% per tahun (Ditjen Perkebunan, 2008).

Volume dan nilai ekspor kakao Indonesia pada periode 1997-2002 meningkat masing-masing dengan laju 12 % dan 10,84 %/tahun, suatu pertumbuhan yang sangat pesat. Hasil penelitian juga mendukung bahwa industri kakao patut dikembangkan sebagai salah satu andalan karena mempunyai koefisien keterkaitan ke depan dan ke belakang yang lebih besar dari satu, efek

penggandaan dan lapangan kerja yang relatif besar, serta efek distribusionalnya

yang cukup baik (tersebar) (Zainudin et al., 2005). Sejalan dengan peran penting

tersebut, peluang pasar kakao Indonesia masih cukup terbuka. Potensi untuk menggunakan industri kakao sebagai salah satu pendorong pertumbuhan dan distribusi pendapatan cukup terbuka dan sangat menjanjikan.

Permintaan biji kakao terus meningkat, terutama dari Amerika Serikat dan negara-negara Eropa Barat. Berbagai Negara tersebut dikenal sebagai produsen makanan yang menggunakan kakao sebagai komponen utamanya. Indonesia sebagai salah satu produsen perlu memanfaatkan peluang tersebut untuk meningkatkan devisa negara dengan meningkatkan ekspor biji kakao. Berorientasi pada pasar ekspor, peluang besar kakao Indonesia relatif masih terbuka. Beberapa hasil studi menunjukkan bahwa daya saing produk kakao Indonesia, khususnya biji kakao masih baik sehingga Indonesia masih mempunyai peluang untuk meningkatkan ekspor dan mengembangkan pasar domestik.

(37)

di atas laju perdagangan kakao dunia. Pada periode 1997-2002, laju ekspor kakao (volume) Indonesia adalah sekitar 12,0% per tahun, sedangkan laju pertumbuhan dunia hanya 3,51% per tahun (Zainudin & Baon, 2004). Walaupun mempunyai kelemahan dan komposisi komoditas dan distribusi pasar, daya saing biji kakao Indonesia cukup baik yang dicerminkan dengan koefisien daya saing lebih besar dari satu (1,62). (b) Memiliki daya saing yang cukup baik, Indonesia diperkirakan akan mampu memanfaatkan peluang pasar yang masih cukup terbuka pada masa mendatang. Beberapa studi menunjukkan bahwa peluang ekspor kakao Indonesia pada periode 2000-2008 masih tumbuh dengan laju sekitar 3,3% per tahun sampai dengan tahun 2008. Laju tersebut tertinggi di antara negara eksportir dan jauh di atas rata-rata laju ekspor dunia yang hanya 1,7%. (c) Liberalisasi perdagangan juga diperkirakan akan memperkuat posisi kakao Indonesia di pasar Internasional. Beberapa negara produsen utama kakao seperti Pantai Gading dan Ghana harus mengurangi berbagai bentuk dukungan dan subsidi pada agribisnis kakaonya. Di sisi lain, agribisnis kakao di Indonesia hampir tidak diproteksi atau mendapat subsidi. Indonesia diperkirakan merupakan salah satu yang akan memperoleh manfaat liberalisasi perdagangan tersebut ( Zainudin & Baon, 2004)

Peningkatan produksi dan perbaikan mutu kakao Indonesia dapat dilakukan melalui intensifikasi dan ekstensifikasi. Penerapan kedua program tersebut di

Indonesia memerlukan tersedianya bibit dan benih kakao unggul, sehingga pengembangan kultivar atau klon kakao unggul secara terprogram perlu segera dilakukan. Umumnya bahan tanam kakao yang digunakan untuk pengembangan di Indonesia menggunakan benih hibrida F1, yang diperoleh dari kebun benih. Kebun benih dirancang khusus untuk menghasilkan benih hibrida F1, dengan menggunakan tetua (sebagai induk betina dan jantan) yang telah diketahui daya dan mutu hasilnya serta sifat-sifat penting seperti ketahanan terhadap penyakit

utama (Phytophthora palmivora dan Vascular-Streak Dieback/VSD).

Budidaya kakao menghadapi banyak kendala di lapangan, antara lain penyakit dan hama tanaman yang dapat menurunkan kuantitas dan kualitas produksi kakao. Salah satu penyakit utama pada tanaman kakao di Indonesia

adalah penyakit busuk buah (black pod) yang disebabkan oleh Phytopthora

(38)

kakao di berbagai negara penghasil kakao. Penyakit busuk buah di lapangan menyebabkan kerugian yang bervariasi besarnya antara satu daerah dengan daerah lainnya di Indonesia bahkan di antar negara. Secara umum, besarnya kerugian antara 20-30% per tahun dapat terjadi akibat infeksi penyakit busuk buah pada pertanaman kakao di lapangan (Wood & Lass, 1985). Berdasarkan data tahun 1997 dilaporkan infeksi penyakit busuk buah menyebabkan menurunnya total kakao dunia hingga sebesar 44 %/tahun (Van der Vossen, 1997).

Pengendalian penyakit busuk buah yang telah dipraktekkan di lapangan seringkali memberikan hasil yang tidak konsisten karena perkembangan penyakit di lapangan dipengaruhi oleh banyak faktor, antara lain: (i) Pertanaman kakao dibudidayakan di daerah yang mempunyai kondisi iklim cocok untuk perkembangan penyakit busuk buah, (ii) Tanaman kakao yang diusahakan pada umumnya mempunyai ketahanan sedang sampai rendah, (iii) Perkembangan sejak

penyerbukan hingga panen kakao memerlukan waktu antara 5,0-5,5 bulan, (iv) P.

palmivora dapat menyerang semua organ kakao dan serangan pada buah terjadi

pada semua tahap pertumbuhannya, (v) Inokulum P. palmivora banyak ditemukan

di lapangan sehingga pada kondisi lingkungan yang optimum untuk perkembangannya, serangan patogen busuk buah dapat terjadi sepanjang tahun,

(vi) P. palmivora diketahui mempunyai banyak tanaman inang. Dengan kondisi

agroekosistem yang sangat sesuai tersebut sangat dimungkinkan patogen P.

palmivora di daerah sentra produksi kakao di Indonesia akan menghasilkan tingkat patogenisitas yang berbeda. Hal ini semakin menambah sulitnya pengendalian secara umum terhadap patogen tersebut. Oleh karena itu diperlukan informasi isolat-isolat dari daerah yang berbeda pada sentra kakao di Indonesia untuk dapat membantu menyelesaikan masalah tersebut. Berbagai hal tersebut menjadi penguat perlunya pengembangan metode pengendalian penyakit busuk buah kakao yang efektif di lapangan.

(39)

ekonomis, sehingga perlu dicarikan alternatif pengendalian lain yang secara bertahap dapat mengurangi ketergantungan pada fungisida.

Pemuliaan untuk mengembangkan varietas kakao unggul yang resisten

terhadap P. palmivora sangat penting untuk dilakukan dan perlu mendapatkan

perhatian khusus jika Indonesia tetap ingin menjadi produsen terbesar komoditas ekspor ini. Tersedianya varietas tahan membantu meringankan ongkos produksi, sehingga berpotensi meningkatkan pendapatan. Jika telah dikembangkan,

penanaman kultivar unggul kakao yang resisten terhadap P. palmivora dapat

menjadi solusi terbaik yang tersedia bagi petani dan produsen kakao di Indonesia untuk mengatasi masalah penyakit busuk buah di lapangan.

Di Indonesia, arah pemuliaan tanaman kakao ditujukan untuk mengembangkan kultivar unggul dengan sifat-sifat sebagai berikut: (i) mempunyai daya hasil yang tinggi, (ii) kualitas biji bermutu tinggi, dan (iii) resisten terhadap hama seperti: penggerek buah kakao (PBK) dan penyakit busuk

buah yang disebabkan oleh P. palmivora dan VSD (Iswanto & Winarno, 1992).

Program pemuliaan untuk memperoleh kultivar resisten terhadap P. palmivora

merupakan tujuan kegiatan yang dilakukan di berbagai negara produsen kakao (van der Vossen, 1997). Namun demikian, kemajuan yang didapat untuk mencapai tujuan tersebut masih terbatas sebagai akibat (i) belum tersedianya

informasi tentang keragaman genetik/tingkat keragaman plasma nutfah kakao, (ii) belum dilakukannya strategi pemuliaan yang efektif, (iii) belum tersedia

informasi dasar tentang genetika dan mekanisme dari sifat resisten terhadap P.

palmivora yang ada pada plasma nutfah kakao. Untuk itu perlu tersedia data tentang ketahanan dari inang, dengan demikian pemahaman mengenai genetika ketahanan tanaman sangat membantu usaha pemuliaan ketahanan.

(40)

hibrida dengan sifat-sifat kualitatif dan kuantitatif yang diinginkan perlu dilakukan studi pendugaan daya waris terhadap klon-klon yang ada dengan melakukan persilangan dialel. Dengan demikian informasi tentang daya gabung umum (DGU), daya gabung khusus (DGK), heterosis serta dayawaris menjadi sangat penting untuk tanaman kakao yang heterosigot.

Perumusan Masalah

Penyakit busuk buah kakao yang disebabkan oleh P. palmivora merupakan

penyakit penting di Indonesia. Pengembangan kakao di daerah – daerah sentra kakao sangat riskan sebagai tempat endemik penyakit ini. Mengingat banyak tanaman inang dari patogen tersebut, sangat dimungkinkan isolat dari daerah akan memberikan tingkat patogenisitas yang berbeda. Isolat yang diambil dari pertanaman kakao di Indonesia akan menjadi informasi yang penting untuk membantu merakit kultivar yang resisten terhadap patogen ini.

Jenis kakao yang ditanam menunjukkan tingkat ketahanan yang berbeda

terhadap P. palmivora. Umumnya seleksi ketahanan kakao terhadap penyakit

busuk buah dilakukan dengan inokulasi alami ataupun buatan, yang didasarkan pada jumlah organ sakit dan keparahan penyakit (Rocha, 1974). Indikator ini menunjukkan reaksi jaringan terhadap serangan patogen, tetapi tidak mengungkapkan secara tepat mekanisme ketahanan yang bekerja pada satu atau

beberapa tahap dari daur penyakit busuk buah. Pengujian ketahanan dilakukan

pada buah yang dipetik (detachedpod) maupun buah di pohon (attachedpod). Uji

pertama banyak diminati, namun hasilnya kurang sesuai dengan kondisi lapangan karena uji ini mengabaikan pengaruh lingkungan. Dengan demikian metode inokulasi yang baku sangat penting dilakukan untuk mendapatkan metode uji ketahanan yang cepat dan akurat. Hal ini sangat membantu dalam proses seleksi tanaman kakao yang berumur panjang. Disamping itu, hal lain yang penting adalah tersedianya plasma nutfah yang cukup.

Mekanisme ketahanan tanaman terhadap penyakit dibedakan atas mekanisme struktural dan biokimia (Agrios, 1998). Kedua mekanisme tersebut

dapat berperan dalam ketahanan sebelum penetrasi (preexisting defense) dan

(41)

kakao melalui mulut kulit (Tarjot, 1974), namun terdapat laporan kontradiktif mengenai peran mulut kulit sebagai mekanisme struktural ketahanan kakao

terhadap patogen ini (Tarjot, 1972; Iwaro et al., 1997; Iwaro et al., 1999;

Phillips-Mora, 1999). Permukaan buah kakao mempunyai alur primer yang diperkirakan dapat mempengaruhi penyebaran, deposisi, dan pertumbuhan pra-penetrasi inokulum. Mekanisme biokimia tergantung pada reaksi biokimia yang terjadi dalam sel tanaman. Seperti protein yang berhubungan dengan respon ketahanan tanaman terhadap patogen adalah kitinase dan peroksidase. Kitinase dapat mendegradasi senyawa kitin yang merupakan komponen utama penyusun dinding sel cendawan. Sebagian besar cendawan filamentus mengandung senyawa kitin pada dinding sel hifanya (Kasprzewska, 2003). Peroksidase merupakan enzim yang terlibat dalam respon tanaman terhadap patogen dan termasuk ke

dalam PR-9 (pathogenesis related protein) (Lagrimini et al., 1997). Aktivitas

peroksidase yang tinggi pada tanaman terkait dengan ketahanan tanaman yang lebih tinggi terhadap patogen seperti yang pernah dilaporkan pada kacang tanah (Pujihartati et al., 2006).

Berdasarkan uraian di atas dirumuskan bahwa mekanisme ketahanan tanaman kakao terhadap penyakit busuk buah dibedakan atas mekanisme ketahanan struktural dan mekanisme biokimia. Mekanisme struktural diarahkan

pada kerapatan mulut kulit buah dan mulut daun kakao. Mekanisme ketahanan biokimia diarahkan pada aktivitas enzim kitinase dan peroksidase.

(42)

melakukan uji ketahanan terhadap beberapa plasma nutfah kakao yang ada, bertujuan untuk mendapatkan genotipe yang tahan dan rentan, juga dapat digunakan sebagai tetua sebagai langkah awal untuk merakit bahan tanam kakao yang baru.

Terkait untuk mengidentifikasi pasangan tetua yang dapat menghasilkan hibrida dengan sifat-sifat kualitatif dan kuantitatif yang diinginkan, perlu dilakukan studi pendugaan daya waris terhadap klon-klon yang ada dengan melakukan persilangan dialel. Untuk merakit hibrida unggul informasi tentang daya gabung umum (DGU) dan daya gabung khusus (DGK), heterosis, heritabilitas atau daya waris menjadi sangat penting untuk tanaman kakao yang heterosigot.

Tujuan Penelitian

1. Memperoleh identitas spesies P. palmivora dan informasi keragaman

patogenisitasnya pada lokasi sentra kakao beberapa propinsi di Indonesia.

2. Memperoleh metode inokulasi untuk penapisan ketahanan kakao

3. Memperoleh informasi patogenisitas P. palmivora terhadap tanaman kakao.

4. Mendapatkan tanaman kakao yang tahan dan rentan terhadap penyakit P.

palmivora di koleksi plasma nutfah kakao untuk digunakan sebagai tetua untuk perakitan hibrida.

5. Memperoleh informasi korelasi tingkat ketahanan beberapa klon kakao untuk

karakter kwantitatif yang diamati.

6. Memperoleh informasi tentang potensi daya gabung umum dan khusus yang

tinggi serta efek heterosisnya pada persilangan dialel klon kakao sehingga diperoleh potensi pada hibrida.

Manfaat Penelitian

Penelitian genetika ketahanan kakao terhadap penyakit P. palmivora ini

dapat membantu usaha pemuliaan untuk memperoleh bahan tanam kakao yang

tahan terhadap penyakit P. palmivora. Dengan mendapatkan klon unggul yang

(43)

diharapkan akan dapat memperbaiki mutu hasil dan peningkatan produktivitas kakao nasional.

Penelitian mengenai kajian genetika ketahanan tanaman kakao terhadap penyakit busuk buah dapat membantu usaha pemuliaan untuk memperoleh bahan tanam yang tahan terhadap penyakit busuk buah dan model pewarisan terhadap F1 nya serta menjadi informasi yang penting untuk menghasilkan bahan tanam yang mempunyai beberapa sifat unggul, sehingga produksi kakao dapat ditingkatkan.

Manfaat lain adalah memberikan alternatif pengendalian yang diharapkan saling melengkapi dengan pengendalian kimiawi sehingga secara bertahap penggunaan fungisida dapat dikurangi dan biaya pemeliharaan menjadi lebih murah.

Hipotesis

Berdasarkan telaah beberapa pustaka tersebut di atas penelitian ini disusun dengan beberapa hipotesis sebagai berikut:

1. Isolat P. palmivora yang menyerang kakao di Indonesia adalah salah satu

spesies P. palmivora.

2. Terdapat satu metode penapisan yang efisien dalam menentukan derajat

ketahanan kakao.

3. Terdapat sedikitnya satu isolat P. palmivora yang mempunyai tingkat

patogenitas tinggi, dan dapat digunakan sebagai sumber inokulum untuk uji ketahanan.

4. Tetua yang membawa gen sumber ketahanan dapat dicari dengan cara

identifikasi tingkat ketahanan beberapa klon kakao pada koleksi plasma nutfah kakao.

5. Terdapat beberapa karakter kuantitatif struktur tanaman kakao yang

memcerminkan ketahanan terhadap P. palmivora.

6. Terdapat tetua yang mempunyai daya gabung umum dan daya gabung khusus

(44)

A. Morfologi Tanaman Kakao

Tanaman kakao yang mempunyai nama ilmiah Theobroma cocoa L.

merupakan anggota dari familia Sterculiaceae (Wood, 1975; Tjitrosoepomo,

1988). Kakao merupakan jenis tanaman asli hutan hujan tropis Amerika Selatan (Wood, 1975) dan telah lama dibudidayakan di Indonesia yaitu sejak jaman “culturstelsel” tahun 1826 (Sunaryo & Situmorang, 1978). Diperkirakan kakao

berasal dari hulu sungai Amazon, tempat Theobroma dan jenis sekerabatnya

terdapat dalam populasi yang paling besar. Tanaman kakao tersebut merupakan

satu-satunya species diantara 22 jenis dalam genus Theobrama yang diusahakan

secara komersial. Sistematika tanaman kakao secara lengkap dapat

diklasifikasikan dalam taksa-taksa sebagai berikut: Divisio: Spermatophyta, Sub

divisio: Angiospermae, Klassis: Dicotyledoneae, Ordo: Malvales, Familia:

Sterculiaceae, Genus: Theobroma, Spesies: Theobroma cocoa, L. (Cheesman,

1944).

Sebagai tanaman yang masuk dalam anggota dari klas Dicotyledonae, benih tanaman kakao mempunyai tipe perkecambahan yang epigeus yang pada waktu kecambah daun kotilnya terangkat ke atas serta membentuk akar tunggang yang tumbuh lurus ke bawah masuk ke dalam tanah (Prawoto, 1991). Sedangkan akar lateralnya banyak tumbuh dan berkembang di dekat permukaan tanah pada kedalaman sekitar 0-30 cm.

Pertumbuhan batang kakao bersifat dimorfisme yang berarti mempunyai dua macam bentuk pertumbuhan batang, yaitu pertumbuhan batang utama yang bersifat ortotrop yang tumbuh tegak dengan rumus daun 3/8, dan pertumbuhan ke samping seperti cabang primer disebut plagiotrop, mempunyai rumus daun ½ (Prawoto, 1991).

(45)

pangkal daun dan ujung tangkai daun. Adanya persendian ini memungkinkan daun membuat gerakan untuk menyesuaikan dengan arah datangnya sinar matahari (Prawoto, 1991). Pertumbuhan daun pada cabang plagiotrop berlangsung serempak dan berkala. Tunas baru disebut dengan flush, dan pada saat flush setiap tunas dapat membentuk 4-6 lembar daun baru sekaligus.

Tanaman kakao bersifat kaolifloris yang berarti bunga dan buahnya tumbuh dan berkembang pada batang atau cabang. Sifat penyerbukan kakao adalah

menyerbuk silang. Bekas ketiak daun, tempat tumbuhnya bunga atau buah

tersebut lama kelamaan menebal dan membesar disebut dengan bantalan bunga atau bantalan buah. Bunga kakao mempunyai rumus K5C5A5+5G(5). K5 berarti

bunga tersusun atas 5 daun kelopak yang bebas satu sama lainnya. C5 bunga

kakao memiliki daun mahkota yang lepas atau tidak berlekatan satu sama lain.

A5+5 berarti bunga kakao memiliki 10 tangkai sari yang tersusun atas dua

lingkaran masing-masing lingkaran tersusun atas 5 tangkai sari steril yang disebut

dengan staminodia dan 5 tangkai sari yang fertil. G5 bunga kakao mempunyai 5

daun buah yang bersatu (Lass & Wood, 1985).

Bentuk buah kakao bervariasi, dari bulat ke lonjong dan meruncing dengan permukaan yang halus sampai kasar. Permukaan buah kakao mempunyai alur primer dan alur sekunder. Sering kali alur sekunder tidak tampak. Permukaan

buah kakao berlilin, kaku (rigid), mempunyai rambut-rambut tegak dan mulut

kulit yang agak terangkat (Cuatrecasas, 1964). Pengelompokan kakao dapat didasarkan pada bentuk buah (Pound, 1932), gabungan karakteristik buah dan sebaran geografi (Cheesman, 1944), bentuk buah dan struktur permukaan buah (Ostendorf, 1956; Engels, 1986). Bentuk buah kakao tersebut antara lain: amilonado, cundeamor, angoleta, calabasilo, criolo dan pentagona.

Buah kakao mempunyai karakteristik termodinamika yang menarik. Waktu siang hari buah menjadi panas dan dingin waktu malam hari, menjelang dini hari suhu buah sama dengan suhu lingkungan. Peningkatan suhu udara pada dini hari memacu kondensasi uap air pada seluruh permukaan buah yang dapat menjadi

suatu inkubator mikro yang baik bagi perkecambahan spora patogen termasuk P.

palmivora (Fulton, 1989).

(46)

(i) Epikarp, terdiri atas: lapisan epidermis dengan mulut kulit dan trikoma. Parenkim dengan sel yang relatif kecil (diameter 10-20 µm), terbagi dalam 2 zona, yaitu: lapisan luar yang tidak mengandung klorofil, terdiri atas 2-4 lapis sel, lapisan dalam yang mengandung klorofil, terdiri atas 6-12 lapis sel. Parenkim dengan sel yang relatif besar. Diameter sel paling luar 30-40 µm dan bertambah kearah dalam. (ii) Mesokarp, terdiri atas sel yang agak berserat dan (iii) Endokarp, terdiri atas sel parenkim yang besar dengan berkas pengangkutan (Tarjot, 1974).

B. Keragaman Genetik Tanaman Kakao

Menurut Las & Wood (1985) berdasarkan type populasinya, tanaman kakao dapat dibagi menjadi tiga kelompok besar yaitu tipe Criolo, Forastero dan Trinitario. Criollo berasal dari penyebaran melintasi pegunungan Andes ke arah dataran rendah Venezuela, Kolumbia, dan Ekuador, dan ke arah utara ke Amerika Tengah dan Meksiko. Sifat-sifat tipe Criolo antara lain pertumbuhan tanaman kurang kuat, daya hasilnya lebih rendah dibanding Forastero, dan relatif lebih rentan terhadap gangguan hama dan penyakit. Kulit buahnya tebal tetapi lunak

sehingga mudah dibelah. Criollo menghasilkan kakao mulia (fineflavourcocoa).

Warna buah hijau atau agak merah karena adanya pigmen antosianin; perikarp agak kasar, tipis dan lunak, mesokarp mengandung lignin, biji bulat dan kotiledon putih. Kelompok ini cenderung rentan terhadap penyakit (Soria, 1974; Opeke,

1982). Kadar lemak di dalam biji lebih rendah dibandingkan dengan Forastero tetapi ukuran bijinya lebih besar, bulat, memberikan citarasa khas yang unggul. Dalam tataniaga kakao Criolo termasuk dalam jenis kakao mulia, sedangkan tipe Forastero termasuk dalam jenis kakao lindak.

Forastero dihasilkan oleh penyebaran ke lembah Amazon, ke arah Brazil bagian barat dan Guyana (Alvim, 1997). Forastero menghasilkan kakao bermutu

sedang, dikenal dengan kakao lindak (bulk cocoa). Warna buah hijau, tidak ada

(47)

Tipe Trinitario merupakan hibrida antara Criolo dan Forastero. Sifat morfologi dan fisiologinya sangat beragam, demikian pula sifat daya hasil dan mutu hasilnya. Dalam tataniaga kakao kelompok Trinitario termasuk dalam kakao mulia atau kakao lindak tergantung dari mutu biji yang dihasilkannya. Seperti klon DR menghasilkan kakao mulia, sedangkan klon ICS banyak menghasilkan kakao lindak (Mawardi, 1982; Opeke, 1982). Trinitario mempunyai buah berwarna merah atau hijau dan bervariasi, tekstur keras; warna biji bervariasi dari ungu muda sampai ungu tua (Wood & Lass, 1985). Pertumbuhan pohon gigas. Contoh kelompok ini adalah klon-klon ICS 60, ICS 84, ICS 95, DR 1, DR 2, DR 38, dan DRC 16.

Gambar 1. Beberapa tipe kakao Trinitario yang berkembang di Indonesia.

Selanjutnya Lanaud (1987; Laurent, 1993; N’Goran, 1994 cit, Sounigo et

al., 2000) memisahkan kelompok Forastero, antara genotip yang berasal dari

lembah hulu sungai Amazon dan lembah hilir sungai Amazon. Trinitario lebih dekat ke genotip Amazone hilir daripada Amazone hulu.

C. Penyakit Busuk Buah Kakao

Busuk buah (black pod atau pod rot) merupakan penyakit yang paling

merugikan di banyak negara produsen kakao. Masalah penyakit ini bisa bersifat ICS 95

ICS 13

Figur

Gambar 1.  Beberapa tipe kakao Trinitario yang berkembang di Indonesia.

Gambar 1.

Beberapa tipe kakao Trinitario yang berkembang di Indonesia. p.47
Gambar 4b: Tabung kecambah saat

Gambar 4b:

Tabung kecambah saat p.54
Gambar 5.  (A) Buah kakao klon GC7 (rentan), (B) Buah kakao klon DRC 16 (resisten).

Gambar 5.

(A) Buah kakao klon GC7 (rentan), (B) Buah kakao klon DRC 16 (resisten). p.57
Figure 7  Variation of pathogenicity of indigenous isolates of  Phytophthora palmivora from various cacao production centers in Indonesia based on the width of necrotic symptoms on inoculated cacao pod clones GC7 (a,b,c), ICS60 (d,e,f), and TSH858 (g,h,i)

Figure 7

Variation of pathogenicity of indigenous isolates of Phytophthora palmivora from various cacao production centers in Indonesia based on the width of necrotic symptoms on inoculated cacao pod clones GC7 (a,b,c), ICS60 (d,e,f), and TSH858 (g,h,i) p.69
Tabel 2. Karakteristik morfologis isolat P. palmivora indigenus berdasarkan

Tabel 2.

Karakteristik morfologis isolat P. palmivora indigenus berdasarkan p.73
Tabel 4. Pengelompokkan patogenisitas isolat P. palmivora indigenus yang diisolasi

Tabel 4.

Pengelompokkan patogenisitas isolat P. palmivora indigenus yang diisolasi p.76
Gambar 8 Inokulasi P. palmivora pada buah dan daun kakao. (a) Buah kakao

Gambar 8

Inokulasi P. palmivora pada buah dan daun kakao. (a) Buah kakao p.86
Gambar 10 Pengaruh pelukaan buah terhadap persentase buah kakao klon GC 7 dan Sca 12  yang terinfeksi P

Gambar 10

Pengaruh pelukaan buah terhadap persentase buah kakao klon GC 7 dan Sca 12 yang terinfeksi P p.89
Gambar 11 Pengaruh jenis inokulum terhadap persentase buah kakao klon GC 7 dan Sca 12  yang terinfeksi P

Gambar 11

Pengaruh jenis inokulum terhadap persentase buah kakao klon GC 7 dan Sca 12 yang terinfeksi P p.90
Tabel 9 Rata-rata luas bercak (cm2) beberapa klon kakao hasil inokulasi P. palmivora di laboratorium, 7 hari setelah inokulasi

Tabel 9

Rata-rata luas bercak (cm2) beberapa klon kakao hasil inokulasi P. palmivora di laboratorium, 7 hari setelah inokulasi p.108
Gambar 12. Representasi perkembangan luas bercak (cm2) 5 klon kakao hasil inokulasi di Laboratorium

Gambar 12.

Representasi perkembangan luas bercak (cm2) 5 klon kakao hasil inokulasi di Laboratorium p.109
Gambar 14.  Representasi perkembangan luas bercak tiga klon kakao  PA 300, DR 2 dan GC7 hasil inokulasi P

Gambar 14.

Representasi perkembangan luas bercak tiga klon kakao PA 300, DR 2 dan GC7 hasil inokulasi P p.110
Tabel 11. Material genotipe kakao yang digunakan dalam evaluasi respon plasma nutfah  kakao terhadap infeksi P

Tabel 11.

Material genotipe kakao yang digunakan dalam evaluasi respon plasma nutfah kakao terhadap infeksi P p.121
Tabel 12.Rataan panjang bercak pada permukaan buah kakao yang diinokulasi dengan miselia P

Tabel 12.Rataan

panjang bercak pada permukaan buah kakao yang diinokulasi dengan miselia P p.125
Tabel 13. Rataan lebar bercak pada permukaan buah kakao yang diinokulasi dengan miselia P

Tabel 13.

Rataan lebar bercak pada permukaan buah kakao yang diinokulasi dengan miselia P p.126
Tabel 14. Rataan luas bercak pada buah yang diinokulasi dengan miselia P. palmivora berdasarkan uji detached pod di laboratorium

Tabel 14.

Rataan luas bercak pada buah yang diinokulasi dengan miselia P. palmivora berdasarkan uji detached pod di laboratorium p.127
Tabel 15. Persentase buah tanpa gejala, rataan luas bercak dan pengelompokan respon terhadap infeksi P

Tabel 15.

Persentase buah tanpa gejala, rataan luas bercak dan pengelompokan respon terhadap infeksi P p.128
Tabel 16. Tipe kakao, bentuk buah dan pengelompokan respon klon kakao terhadap infeksi P

Tabel 16.

Tipe kakao, bentuk buah dan pengelompokan respon klon kakao terhadap infeksi P p.129
Tabel 18.  Rata-rata Kerapatan Stomata Daun dan Buah pada Beberapa  Klon  Kakao

Tabel 18.

Rata-rata Kerapatan Stomata Daun dan Buah pada Beberapa Klon Kakao p.142
Gambar 17.  Hubungan kerapatan stomata daun dan buah dengan luas bercak yang disebabkan oleh infeksi P

Gambar 17.

Hubungan kerapatan stomata daun dan buah dengan luas bercak yang disebabkan oleh infeksi P p.143
Tabel 20  Kandungan dan Aktivitas Peroksidase (µM pNP/mg protein/jam)  pada daun kakao sehat dan terinfeksi penyakit busuk buah P

Tabel 20

Kandungan dan Aktivitas Peroksidase (µM pNP/mg protein/jam) pada daun kakao sehat dan terinfeksi penyakit busuk buah P p.144
Tabel 23 Skor gejala bercak infeksi  P. palmivora

Tabel 23

Skor gejala bercak infeksi P. palmivora p.157
Tabel 24. Pengelompokan ketahanan kakao terhadap P. palmivora

Tabel 24.

Pengelompokan ketahanan kakao terhadap P. palmivora p.158
Tabel 26. Persilangan dialel ketahanan kakao terhadap P. palmivora

Tabel 26.

Persilangan dialel ketahanan kakao terhadap P. palmivora p.159
Tabel 25. Komponen Analisis Ragam untuk populasi dialel

Tabel 25.

Komponen Analisis Ragam untuk populasi dialel p.159
Tabel  28. Anova ketahanan  genotip kakao terhadap P. palmivora

Tabel 28.

Anova ketahanan genotip kakao terhadap P. palmivora p.166
Tabel 29 Pendugaan parameter genetik ketahanan genotip kakao terhadap P. palmivora

Tabel 29

Pendugaan parameter genetik ketahanan genotip kakao terhadap P. palmivora p.167
Gambar 18. Hubungan peragam (Wr) dan Ragam (Vr) 5 klon kakao sifat ketahanannya terhadap penyakit busuk buah P

Gambar 18.

Hubungan peragam (Wr) dan Ragam (Vr) 5 klon kakao sifat ketahanannya terhadap penyakit busuk buah P p.169
Tabel 30. Heritabilitas dalam arti luas (h2bs) dan heritabilitas dalam arti sempit (h2ns ) komponen ketahanan berdasarkan luas bercak dan Intensitas Penyakit terhadap P

Tabel 30.

Heritabilitas dalam arti luas (h2bs) dan heritabilitas dalam arti sempit (h2ns ) komponen ketahanan berdasarkan luas bercak dan Intensitas Penyakit terhadap P p.170
Tabel 32.  Nilai efek Daya Gabung Umum (DGU)  dan Daya Gabung Khusus (DGK) genotipe tanaman kakao berdasarkan luas bercak (cm2) dan intensitas penyakit (%) hasil inokulasi ketahanan terhadap penyakit Phytophthora palmivora

Tabel 32.

Nilai efek Daya Gabung Umum (DGU) dan Daya Gabung Khusus (DGK) genotipe tanaman kakao berdasarkan luas bercak (cm2) dan intensitas penyakit (%) hasil inokulasi ketahanan terhadap penyakit Phytophthora palmivora p.172

Referensi

Memperbarui...