SPESIES TIKUS, CECURUT DAN PINJAL YANG DITEMUKAN DI PASAR KOTA BANJARNEGARA, KABUPATEN BANJARNEGARA TAHUN 2013
SPECIES RATS, SHREW AND FLEAS FOUND IN THE MARKET TOWN BANJARNEGARA, BANJARNEGARA DISTRICT 2013
Dina Supriyati*, Adil Ustiawan**
*Fakultas Kesehatan Masyarakat, Universitas Diponegoro
Kampus Undip Tembalang Jl. Prof. Soedarto, SH, Tembalang, Semarang Selatan ** Balai Litbang P2B2 Banjarnegara
Jl. Selamanik No. 16A Banjarnegara E_mail: dinasupriyati.undip@yahoo.co.id
Accepted:30/8/2013 Reviewed:6/9/2013 Reviewed:8/10/2013 Revised:15/10/2013
ABSTRAK
Tikus merugikan bagi kehidupan manusia, baik dari sisi ekonomi maupun kesehatan. Tikus membawa kuman penyakit, ektoparasit dan endoparasit. Pasar tradisional merupakan tempat potensial ditemukan tikus dalam jumlah cukup tinggi. Tujuan penelitian untuk mengetahui keberadaan tikus, cecurut dan ektoparasit pinjal di Pasar Kota Banjarnegara, Kabupaten Banjarnegara. Penelitian deskriptif dengan metode survei dan pendekatan cross sectional. Data tikus dari penangkapan tikus menggunakan live trap. Populasi adalah fauna tikus yang hidup di Pasar Kota Banjarnegara. Sampel adalah tikus yang tertangkap menggunakan perangkap yang diberi umpan kelapa bakar dan mentimun. Analisis data secara deskriptif. Hasil penelitian menunjukkan tikus yang tertangkap sebanyak 33 ekor .Tikus yang banyak tertangkap adalah Rattus tanezumi (84,85%) dan paling sedikit tertangkap Rattus norvegicus (3,03%). Tikus berjenis kelamin jantan lebih banyak ditemukan 20 ekor (60,61%) daripada tikus betina 13 ekor (39,39%). Tikus sebagian besar terdapat di dalam los pasar (77,42%) daripada di luar los pasar (22,58%). Trap success tikus sebesar 8,25% dengan keberhasilan penangkapan paling tinggi pada hari ke-2 (4,5%). Trap success berdasarkan lokasi penangkapan di dalam los pasar lebih besar (6,5%) daripada luar los pasar (1,75%). Jumlah pinjal yang menginfestasi spesies tertangkap sebanyak 67 ekor. Spesies pinjal yaitu Xenopsylla cheopis. Indeks umum pinjal sebesar 2,03 melebihi standar. Perlu dilakukan pengendalian tikus dan pinjal (Xenopsylla cheopis).
Kata kunci: keberhasilan penangkapan, tikus, pinjal
ABSTRACT
Rats harm to human life, both in terms of economics and health. Rats transmitted disease, ectoparasites and endoparasites. Many potential sites where rat found in high enough quantities, one of those sites is a traditional market. The purpose of this study was to know the presence of rats and fleas in the market town Banjarnegara, Banjarnegara District. This research is a descriptive study using survey methods. Research design using cross-sectional approach. Rats data obtained by trapping rats using a live trap. Population was rats living in markets Banjarnegara, Banjarnegara. The sample was rats that were caught using bait traps roasted coconut and cucumber. The collected data were analyzed descriptively. Result showed that 33 rats had been caught during the study. The most abundant species was Rattus tanezumi (84.85%), while the least is Rattus norvegicus (3.03%). As much 20 (60.61%) were male higger than female rat as much as 13 rats (39.39%). Rats in the market stalls (77,42%) greater than the outside market stall (22,58%). The trap succes were 8.25% with the successful capture of the highest rats on day 2 (4.5%). While the success of trapping rats (trap success) based on the location of the arrest shows that in the market stalls (6.5%) greater than the outside market stall (1.75%). Number of fleas that infest species caught as many as 67 tails. Species of fleas that infest rats identified as Xenopsylla cheopis. Common flea index as much 2,03 upper than standard. Control of rats and fleas (Xenopsylla cheopis) was needed.
Key words: trap success, rats, fleas
NLM: WC 765 BALABA
Bina Ikawati, Adil Ustiawan, Muhammad Umar Vol. 9 No. 2, December 2013, Pages. 39-46 Yusuf
(Vector and Animal Borne Disease Control Unit, Rats harm to human life, both in terms of economics
Banjarnegara) and health. Rats transmitted disease, ectoparasites
and endoparasites. Many potential sites where rat ENTOMOLOGY SURVEY AS EARLY WARNING found in high enough quantities, one of those sites is OF MALARIA TRANSMISION IN KENDAGA a traditional market. The purpose of this study was to VILLAGE, BANJARMANGU SUB DISTRICT, know the presence of rats and fleas in the market BANJARNEGARA DISTRICT AT 2012 town Banjarnegara, Banjarnegara District. This research is a descriptive study using survey methods.
BALABA Research design using cross-sectional approach.
Vol. 9 No. 2, December 2013, Pages. 33-38 Rats data obtained by trapping rats using a live trap. Population was rats living in markets Banjarnegara, Central Java malaria case's decreases, either from Banjarnegara. The sample was rats that were caught number of cases or wide of region. Data from Central using bait traps roasted coconut and cucumber. The Java Province Health Office showed at 2012 malaria collected data were analyzed descriptively. Result cases in Banjarnegara District residing in rangking showed that 33 rats had been caught during the study. two after Purworejo District with Annual Paracyte The most abundant species was Rattus tanezumi Incidence (API) as much 0,68 ‰ while Purworejo (84.85%), while the least is Rattus norvegicus District as much 0,78 ‰. Until 2012 Banjarmangu (3.03%). As much 20 (60.61%) were male higger Sub district, Kendaga Village is High Case Incidence than female rat as much as 13 rats (39.39%). Rats in area. The aimed of this research was to know actual the market stalls (77,42%) greater than the outside malaria vector situation in Kendaga Village. This market stall (22,58%). The trap succes were 8.25% research was descriptive with all night entomology with the successful capture of the highest rats on day survey methode and seeking Anopheles mosquitoes 2 (4.5%). While the success of trapping rats (trap larval habitat. Survey had been done in Kendaga success) based on the location of the arrest shows Village on June and December 2012. This research that in the market stalls (6.5%) greater than the found all species malaria vector that found in 2001 outside market stall (1.75%). Number of fleas that that were Anopheles balabacencis, An. maculatus infest species caught as many as 67 tails. Species of and An. aconitus. Wall MHD between 0.4 to .75 was fleas that infest rats identified as Xenopsylla cheopis. found in 2001 and zero for 2012. MHD cage Common flea index as much 2,03 upper than between 0.85 to 2.57 in 2001 and between 0.08-0.17 standard. Control of rats and fleas (Xenopsylla in 2012. Indoor MBR between 0.06 to 0.3 in 2001 cheopis) was needed.
and in 2012 was 0.02 . Outdoor MBR 2001 from 0.08
to 0.25 and in 2012 was 0.02 . Trend of relative Key words: trap success, rats, fleas density was decreases than in 2001.
Key words:malaria, Kendaga, relative density NLM: QX 400 Ribia Tutstsintaiyn
(Public Health Faculty, Ahmad Dahlan University) NLM: WA 106
Dina Supriyati, Adil Ustiawan STUDY ENDOPARACITES HELMINTH OF
(Public Health Faculty, Diponegoro University) RATS (Rattus spp.) IN CITEREUP- DAYEUH KOLOT BANDUNG, WEST JAVA 2013
SPECIES RATS, SHREW AND FLEAS FOUND
IN THE MARKET TOWN BANJARNEGARA, BALABA
BANJARNEGARA DISTRICT 2013 Vol. 9 No. 2, December 2013, Pages. 47-52
BALABA
JURNAL LITBANG PENGENDALIAN PENYAKIT BERSUMBER BINATANG BANJARNEGARA
VOLUME 9 NO. 2 Desember 2013
ABSTRACT SHEET
PENDAHULUAN Peterongan dan Pasar Wonodri Semarang, paling
banyak ditemukan adalah jenis tikus Rattus Faktor lingkungan biotik dan abiotik akan
norvegicus, masing-masing sebesar 53,3% di Pasar mempengaruhi dinamika populasi tikus. Suatu
12 Peterongan dan 27,8% di Pasar Wonodri. populasi tikus domestik, peridomestik dan silvatik
akan beragam dalam struktur umur, fase Pasar di Kabupaten Banjarnegara dibagi perkembangan, atau komposisi genetik dari menjadi 3 UPT (Unit Pelaksana Teknis) yang individu-individu penyusunnya diduga mempunyai tersebar di beberapa wilayah. Salah satu pasar yang perbedaan keragaman komposisi ektoparasit yang termasuk UPT 1 yaitu Pasar Kota Banjarnegara.
1
menempatinya. Pasar Kota Banjarnegara terletak di pusat
Kabupaten Banjarnegara dan merupakan pasar Hubungan tikus dan manusia seringkali
2
dengan total luas lahan sebesar 13.000 m . Pasar bersifat parasitisme, yaitu menimbulkan kerugian
tradisional merupakan tempat jual beli yang dalam berbagai bidang kehidupan manusia.
reservoir umumnya mempunyai kondisi sanitasi yang kurang
Dibidang kesehatan, tikus dapat menjadi
memenuhi persyaratan kesehatan. Aktivitas jual beli beberapa patogen penyebab penyakit pada manusia,
2,3
yang padat sangat rentan terhadap penularan baik hewan, ternak maupun peliharaan. Jenis
penyakit. Selain itu, banyak kerusakan bahan penyakit yang dibawa oleh tikus antara lain pes,
murine typhus scrub typhus pangan yang ditimbulkan oleh tikus. Eksistensi
leptospirosis, , ,
pasar sebagai penyedia bahan pangan identik leishmaniasis, salmonellosis, penyakit chagas dan
dengan kesesakan dan kekumuhan di ruang kota. j u g a b e b e r a p a p e n y a k i t c a c i n g s e p e r t i
3,4,5
Kondisi ini merupakan tempat yang nyaman bagi schistosomiasis dan angiostrongyliasis.
Penyakit-tikus karena banyak limbah seperti sisa-sisa jualan penyakit tersebut juga ditularkan melalui ektoparasit
4,5,6
yang tidak laku atau jeroan ikan laut yang sengaja yang ada di tubuh tikus. Ektoparasit yang
1 2
dibuang. Hal tersebut sangat mendukung ditemukan pada tikus berbeda dengan binatang
perkembangbiakan reservoir penyakit, khususnya mamalia lainnya, baik keragaman jenis maupun
7,8
tikus. Pemilihan Kabupaten Banjarnegara sebagai jumlah ektoparasit. Weber dalam Ristiyanto,
lokasi penelitian mempunyai potensi yang sama menemukan dua kelompok artropoda ektoparasit
untuk ditemukan tikus, cecurut dan pinjal sehingga pada rodensia, khususnya tikus yaitu serangga
penelitian ini dapat dilakukan di lokasi manapun. (pinjal, kutu) serta tungau (larva tungau, tungau
Penelitian ini dapat digunakan sebagai kewaspadaan dewasa dan caplak) mamalia lainnya, baik
1
dini penyakit tular rodent dan tular vektor terutama keragaman jenis maupun jumlah ektoparasit.
pinjal. Oleh karena itu, peneliti tertarik untuk Dibandingkan ektoparasit lainnya, ektoparasit pinjal
mengkaji keberadaan tikus dan pinjal di pasar Kota mempunyai peran penting dalam bidang kesehatan.
Siphonaptera Banjarnegara, Kabupaten Banjarnegara dan
Pinjal merupakan serangga kecil , dan 9,10
permasalahannya bagi kesehatan manusia. Hasil mengalami metamorfosis sempurna. Pinjal
penelitian ini diharapkan dapat memberikan dewasa bersifat parasitik, sedangkan pradewasanya
informasi yang bermanfaat untuk pencegahan dan hidup di sarang atau tempat-tempat yang sering
8
pengendalian penyakit tular rodent dan tular vektor dikunjungi tikus. Pinjal berperan sebagai vektor
khususnya pinjal supaya lebih tepat dan terarah. penyakit, diantaranya adalah penyakit pes. Vektor
penyakit pes adalah pinjal Xenopsylla cheopis yang paling banyak ditemukan selama survei ektoparasit
METODE 10,11
pada rodent komensal.
Jenis penelitian ini adalah penelitian Tikus termasuk jenis binatang yang
deskriptif yaitu menggambarkan keberadaan tikus, perkembangannya sangat cepat apabila kondisi
cecurut dan pinjal di Pasar Kota Banjarnegara, lingkungan menguntungkan bagi kehidupannya.
Kabupaten Banjarnegara. Metode yang digunakan Faktor yang sangat menunjang reproduksi tikus
adalah metode survei dengan pendekatan cross meliputi tersedianya makanan, minuman dan tempat
sectional. Populasi penelitian meliputi seluruh tikus, 3
persembunyian atau perlindungan. Banyak
tempat-cecurut serta ektoparasit pinjal yang berada di pasar tempat potensial ditemukan tikus dalam jumlah
Kota Banjarnegara, Kabupaten Banjarnegara. yang cukup tinggi, salah satunya adalah di pasar.
Sampel penelitian adalah semua tikus, cecurut serta Survei yang dilakukan oleh Listriyani dkk di Pasar
Jakarta:Puslitbang Oseanologi-LIPI; 2009. 16. Yepyhardi. 2009. Elektroforesis:pintu gerbang
penelitian biologi molekular. [diakses tanggal 2 J u n i 2 0 1 3 ] . A v a i l a b l e f r o m : http://sciencebiotech.net.
17. Martin R. Gel electrophoresis: nucleid acids. Oxford: Bios scientific Publisher; 1996.
ektoparasit pinjal yang berhasil tertangkap dengan Tabel 1 menunjukkan hasil penangkapan menggunakan perangkap hidup (live trap) di Pasar tikus dan cecurut di Pasar Kota Banjarnegara selama Kota Banjarnegara, Kabupaten Banjarnegara pada penelitian diperoleh spesies yang paling banyak Bulan Agustus 2013. Teknik pengambilan sampel ditemukan adalah tikus R. tanezumi (84,85%). yang digunakan adalah purposive sampling.
Penelitian ini menggunakan perangkap live trap.
Tabel 2. Hasil Penangkapan Tikus Berdasarkan Jenis
Dalam penelitian ini umpan yang digunakan yaitu
Kelamin di Pasar Kota Banjarnegara, Kabupaten
kelapa bakar dan mentimun. Penangkapan Banjarnegara Tahun 2013 dilakukan di Pasar Kota Banjarnegara pada sore hari
pukul 15.00 – 17.00 WIB kemudian diambil pada keesokan harinya pada pukul 06.00 WIB selama 2 hari berturut-turut. Jumlah perangkap yang dipasang adalah 200 perangkap per hari dengan jumlah masing-masing di dalam dan luar los pasar sebanyak 100 perangkap. Perangkap diletakkan di dalam los
Tabel 2 menunjukkan hasil penangkapan pasar dan luar los pasar yang terdapat tanda-tanda
tikus yang berjenis kelamin jantan (60,61%) lebih keberadaan tikus, misalnya dengan melihat bekas
tinggi daripada tikus berjenis kelamin betina. telapak kaki dan kotoran. Peletakkan perangkap
yang tepat sangat penting untuk memperoleh hasil 13
yang maksimal. Setelah tikus terperangkap,
Tabel 3. Hasil Penangkapan Tikus Berdasarkan Jenis
peletakan perangkap berikutnya harus berbeda
Habitat di Pasar Kota Banjarnegara, Kabupaten
14,15
tempat agar tikus tidak jera. Banjarnegara Tahun 2013
HASIL
Spesies tikus dan cecurut yang tertangkap di Pasar Kota Banjarnegara dapat dilihat pada Tabel 1.
Tabel 1. Hasil Penangkapan Tikus dan Cecurut di Pasar
Tabel 3 menunjukkan hasil penangkapan
Kota Banjarnegara, Kabupaten Banjarnegara
tikus di dalam los pasar (60,61%) lebih banyak
Tahun 2013
dibandingkan di luar los pasar.
Tabel 4 menunjukkan secara keseluruhan trap success dalam penelitian ini sebesar 8,25 %. Keberhasilan penangkapan tikus yang paling tinggi pada hari ke-2 (3,75 %).
No Spesies Jumlah Persentase (%) 1 Rattus tanezumi 28 84,85 2 Rattus norvegicus 1 3,03 3 *Suncus murinus 4 12,12
Total 33 100
*S. murinus tidak termasuk rodentia /tikus
No Jenis Kelamin Jumlah Persentase (%) 1 Jantan 20 60,61 2 Betina 13 39,39 Total 33 100
No Jenis Habitat Jumlah Persentase (%) 1 Dalam Los Pasar 20 60,61 2 Luar Los Pasar 13 39,39 Total 33 100 8,25 No Hari Penangkapan Total perangkap Jumlah spesies tertangkap Trap success (%) Persentase (%) 1 Hari 1 100 15 3,75 45,46 2 Hari 2 100 18 4,5 54,54 Total 200 33 100
Tabel 4. Trap Success Berdasarkan Hari Penangkapan Tikus di Pasar Kota Banjarnegara, Kabupaten Banjarnegara Tahun 2013.
Geneva. 1982; 171. dituangkan ke dalam baki gel agarosa, dibiarkan
hingga larutan berubah menjadi gel yang padat. 3. E b r a h i m i A , N a s r Z , K o j o u r i G H A . Seroinvestigation of bovine leptospirosis in Sisir diambil dengan hati-hati, selotip dilepaskan
Shahrekord district, central Iran. Iranian. J. Vet. dari ujung-ujung baki. Baki yang telah berisi gel
Res. 2004; 5(2): 110-113. agarosa dimasukkan ke dalam tangki
4. Rad MA, Zeinali A, Yousofi JV, Tabata AH, elektroforesis yang telah diisi dengan larutan
Brokaie S. Seroprevalence and bacteriological buffer TBE 1x (dipastikan bahwa gel terendam
study of canine leptospirosis in Tchran and its seluruhnya dalam TBE). DNA hasil PCR
suburban areas. Iranian J. Vet. Res. 2004; 5(2): diambil 0,7 l menggunakan mikropipet dan
73-80. dimasukkan ke dalam sumuran. Kabel dari
5. Rocha T. A review of leptospirosis in farm s u m b e r a r u s d i h u b u n g k a n k e t a n g k i
animals in Portugal. Rev. Sci. Tech. Off. In. elektroforesis (dipastikan bahwa kabel yang
Epiz. 1998; 17 (3): 699-712. tersambung ke kutub negatif berada di dekat
6. Hartman EG, Ingh TSGAM, Rothuizen J. sumuran; jika tidak demikian, posisi baki/gel
Clinical, pathological and serological features of diubah ke arah sebaliknya). Sumber arus
spontaneous canine leptospirosis. An evaluation dinyalakan, voltase dan waktu running diatur of the IgM- and IgG- specific ELISA. Vet. hingga diperoleh angka 100 V dan 40 menit Immunol, and Immunopathol. 1986; 13:
261-271. dengan cara menekan tombol yang sesuai pada
sumber arus. Elektroforesis dijalankan (running) 7. Kositanont. Detection and differentiation dengan cara tombol run pada sumber arus between pathogenic and saprophytic Leptospira spp. by multiplex polymerase chain reaction. ditekan. Elektroforesis dihentikan apabila
DNA-Diagnostic Microbiology and Infectious nya sudah mencapai garis ketiga. Sumber arus
Disease. 2007: 117-122. dimatikan dan baki diangkat dari tangki
8. Albert B. Biologi molekular sel Edisi ke-2. elektroforesis. Gel dikeluarkan dan diletakkan di
Jakarta:Gramedia; 1994. atas UV transluminator (selubung kaca hitam
diletakkan di atas UV transluminator). UV 9. Doyle JJ, Doyle JL. 1997. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf transluminator dinyalakan, pita-pita DNA yang
tissue. Phytochem. Bull. tervisualisasi diamati.
10. Arumingtyas EL. Isolasi DNA dan RAPD. Disampaikan pada Pelatihan Analisis DNA
KESIMPULAN Fingerprinting Tanaman dengan Metode RAPD
Tanggal 4-6 Juli 2011. Laboratorium Sentral Komponen-komponen yang dibutuhkan
Ilmu Hayati Universitas Brawijaya. Malang. dalam pemeriksaan bakteri Leptospira pada sampel
11. Jamilah. 2005. Pengaruh berbagai macam darah manusia menggunakan metode PCR adalah
detergen, penambahan enzim, dan ekstrak nanas DNA template, enzim polymerase, Primer PU 1 dan
(Ananas comusus (L) Merr) Terhadap hasil Primer SU 1 (forward), Primer Lep R1 (reverse), air,
isolasi DNA berbagai macam buah sebagai topik 2+
Mg , dan dNTP. Pemeriksaan bakteri Leptospira
p r a k t i k u m m a t a k u l i a h g e n e t i k a . pada sampel darah manusia meliputi beberapa Skripsi.Malang:Universitas Negeri Malang; teknik, yaitu pengambilan sampel, isolasi DNA, 2005.
pemeriksaan dengan metode PCR, dan running
12. Nicholl DST. An introduction to genetic
elektroforesis. e n g i n e e r i n g T h i r d E d i t i o n . N e w
York:Cambridge University; 2008.
13. Sachse K, Nat R, Frey J. PCR detection of microbial pathogens. Humana Press; 2010. 14. Saiki RKS, Faloona F, Mullis F, Horn KB,Erlich
DAFTAR PUSTAKA GT, Arnheim N. Enzymatic amplification of
betaglobin genomic sequences and restriction 1. Hickey PW, Deemeks D. Leptospirosis.
site analysis for diagnosis of sickle cell anemia. Emedicine. 2003: 1-9.
Science. 1989; 230: 1350-54. 2. Faine S. Guidelines for the control of
15. Pratiwi R. Mengenal Metode Elektroforesis. leptospirosis. World Health Organization,
Tabel 5. menunjukkan keberhasilan penangkapan tikus di dalam los pasar (6,5%) lebih banyak daripada di luar los pasar.
No Spesies
Trap success
Persentase (%) Dalam los pasar Luar los pasar
Jumlah tikus Trap success (%) Jumlah tikus Trap success (%)
1 R. tanezumi 26 6, 5 2 0,5 84,85
2 R. norvegicus 0 0 1 0,25 3,03
3 *S. murinus 0 0 4 1 12,12
Total 26 6, 5 7 1,75 100
*S. murinus tidak termasuk ke dalam rodentia/tikus
Tabel 7. Jenis Spesies dan Jenis Kelamin Pinjal yang
Tabel 5 menunjukkan keberhasilan
Menginfestasi Tikus yang Tertangkap di Pasar
penangkapan tikus di dalam los pasar (6,5%) lebih
Kota Banjarnegara, Kabupaten Banjarnegara
banyak daripada di luar los pasar.
Tahun 2013
Tabel 6 menunjukkan dari ketiga spesies tikus yang tertangkap semuanya terinfestasi oleh pinjal. Jumlah pinjal yang menginfestasi tikus paling banyak pada spesies R. tanezumi yaitu sebanyak 61 ekor.
Tabel 6. Jumlah Pinjal pada Tikus yang Tertangkap di Tabel 7 menunjukkan spesies pinjal yang Pasar Kota Banjarnegara, Kabupaten
mengenfestasi tikus X. cheopis. Jumlah pinjal yang
Banjarnegara Tahun 2013
berjenis kelamin jantan (61,29%) lebih banyak daripada pinjal yang berjenis kelamin betina.
Tabel 6 menunjukkan dari ketiga spesies Indeks umum pinjal pada penelitian ini tikus yang tertangkap semuanya terinfestasi oleh sebesar 2,03.
pinjal. Jumlah pinjal yang menginfestasi tikus paling banyak pada spesies R. tanezumi yaitu sebanyak 61
PEMBAHASAN
ekor.
Fauna tikus
Jumlah pinjal yang berhasil diidentifikasi
sebanyak 62 ekor, dikarenakan 5 ekor pinjal lainnya Jenis tikus yang tertangkap di pasar Kota terjadi kerusakan pada saat pengawetan sehingga Banjarnegara, Kabupaten Banjarnegara terdiri dari
tidak teridentifikasi. R. norvegicus (Berkenhout, 1769), R. tanezumi
(Temminck, 1844), dan cecurut S. murinus
No Spesies Jumlah Spesies Tertangkap Total Pinjal 1 R. tanezumi 28 61 2 R. norvegicus 1 3 3 *S. murinus 4 3 Total 33 67
*S. murinus tidak termasuk ke dalam rodentia/tikus
No Spesies Pinjal Jenis Kelamin Jumlah Persentase (%) 1 X. cheopis Jantan 38 61,29 2 X. cheopis Betina 24 38,71 Total 62 100 Jumlah Pinjal IUP =
Jumlah Spesies Tertangkap 67
IUP = = 2,03 33
1. Ukuran molekul DNA farmasi untuk identifikasi DNA dalam
15
pembuatan antibiotik. Molekul DNA kecil akan melintasi gel lebih
cepat karena ruang gerak yang tersedia untuk Marker adalah segmen DNA yang
melintasi gel lebih banyak. spesifik dan telah diketahui ukurannya. Marker
berfungsi untuk mengetahui ukuran DNA hasil 2. Konsentrasi gel
amplifikasi. Marker DNA (fermentas) berfungsi Konsentrasi agarosa yang semakin tinggi sebagai penanda posisi molekul DNA yang menyebabkan molekul-molekul DNA sukar bermigrasi, untuk menentukan perkiraan ukuran melewati gel. Konsentrasi gel tinggi basa-basanya. Fragmen DNA yang letaknya mempermudah DNA berukuran kecil paling dekat dari sumuran adalah fragmen DNA melewati gel, sedangkan konsentrasi gel yang memiliki berat molekul terbesar. Fragmen rendah mempermudah molekul DNA DNA marker yang laju migrasinya paling cepat berukuran besar untuk melintasi gel.
atau paling jauh dari sumuran adalah fragmen
3. Bentuk molekul marker yang memiliki berat molekul atau ukuran
16 Molekul yang berbentuk supercoil atau elips
fragmen terkecil.
akan bergerak lebih cepat melewati gel. Alat-alat yang digunakan dalam tahap
4. Densitas muatan elektroforesis adalah microwave yang digunakan
untuk membuat gel agarosa. Baki gel agarosa Molekul dengan densitas tinggi akan lebih berfungsi untuk mencetak gel agarosa sebagai cepat bergerak dibandingkan molekul tempat DNA sampel akan ditempatkan dalam dengan densitas yang rendah. Densitas sumuran-sumuran, sedangkan sisir elektroforesis merupakan jumlah muatan per unit volume
digunakan untuk membuat sumuran. Sisir molekul.
elektroforesis tersebut dipasang di salah satu 5. Voltase ujung baki gel agarosa dengan posisi hampir
Voltase tinggi akan menyebabkan cepatnya menyentuh dasar baki. Selotip digunakan untuk
pergerakan molekul DNA. Hal tersebut melekatkan tiap ujung baki gel agarosa yang
dikarenakan oleh tingginya muatan positif bertujuan mencegah terjadinya lubang pada
yang ditimbulkan. masing-masing ujung baki. Tangki elektroforesis
berfungsi sebagai tempat running elektroforesis. 6. Larutan buffer
Mikropipet digunakan untuk memindahkan Buffer dengan kadar ion tinggi akan DNA ke dalam sumuran dengan volume 0,7 menaikkan konduktansi listrik sehingga mikroliter. UV transilluminator digunakan untuk migrasi DNA akan lebih cepat.
15 interpretasi hasil pemeriksaan PCR.
Tahapan-tahapan dalam melakukan Bahan dan larutan yang digunakan dalam elektroforesis adalah membuat gel agarosa 1% running elektroforesis memiliki fungsi masing- dibuat dengan cara menimbang agarosa 0,3 g masing. Gel agarosa merupakan matriks untuk dilarutkan ke dalam buffer TBE 1x hingga penyangga yang banyak dipakai untuk separasi volume 30 ml. Larutan agarosa dididihkan protein dan asam nukleat, digunakan sebagai hingga larut sempurna. Selanjutnya, baki gel pemadat, sebagai media elektroforesis. DNA agarosa disiapkan, selotip dilekatkan di tiap marka sebagai DNA penanda. Larutan buffer ujung baki gel agarosa (pastikan bahwa selotip TBE 1 X untuk penyangga. Akuades untuk melekat kuat dan tidak ada lubang pada masing-melarutkan agarosa. Pewarna Gold View bekerja masing ujung baki). Sisir elektroforesis dipasang menyisip di sela-sela basa-basa DNA, berfungsi di salah satu ujung baki gel agarosa dengan sebagai pewarna agar DNA dapat tervisualisasi posisi hampir menyentuh dasar baki. Suhu
7
0
pada UV Transilluminator. larutan agarosa ditunggu hingga sekitar 50-60 C,
Pergerakan DNA pada elektroforesis ditambahkan 1 µl etidium bromid. Sarung tangan dipengaruhi oleh beberapa faktor sebagai digunakan untuk melindungi dari EtBr yang
17
berikut: bersifat karsinogenik. Larutan agarosa
Serba Serbi Parasit
16
(Linnaeus). Cecurut (shrew) jika dilihat sepintas Sanitasi yang dimaksud adalah pembuangan sampah 6
memang mirip dengan tikus kecil atau mencit, pada tempatnya dan kebersihan lingkungan.
namun jika diperhatikan lebih cermat terdapat Tikus mempunyai penyebaran geografis beberapa perbedaan yang menunjukkan bahwa yang menyebar di seluruh dunia sehingga disebut
2,3
cecurut bukan golongan hewan pengerat. hewan kosmopolit. Spesies Rattus sp., Bandicota Lingkungan manusia terutama pasar menjadi habitat sp. dan S. murinus tersebut juga merupakan rodent yang menguntungkan bagi tikus sebagai omnivora komensal, yaitu hewan yang sudah beradaptasi dan cecurut sebagai insektivora. Keberadaan cecurut dengan baik pada aktivitas manusia serta
S. murinus di pasar berkaitan dengan adanya sumber menggantungkan hidupnya (pakan dan tempat
makanan utamanya yaitu berupa serangga dan tinggal) pada kehidupan manusia. Keberadaan tikus mampu beradaptasi baik dengan pakan selain tidak selalu terbatas di daerah huniannya saja, hal ini
17
serangga, yaitu sisa pakan manusia. disebabkan satu jenis tikus dapat menghuni Jenis tikus yang sering tertangkap adalah R. beberapa macam habitat atau satu macam habitat
2
tanezumi. Keberadaan jenis tikus ini di Pasar Kota dapat dihuni beberapa jenis tikus. Keanekaragaman Banjarnegara karena letak pasar yang dekat dengan jenis tikus disebabkan karena penyebaran tikus perumahan penduduk. Hal ini dikarenakan tikus berlangsung bersama-sama dengan migrasi manusia
3
tersebut termasuk kelompok tikus domestik dimana antar pulau dan antar benua. Habitat dari R. aktivitas hidup jenis tikus ini mencari makan, tanezumi, R. norvegicus dan S. murinus biasanya berlindung, bersarang, dan berkembangbiak di dipemukiman manusia, rumah, dan gudang karena
3 dalam rumah sehingga lebih dikenal dengan tikus merupakan jenis tikus domestik.
rumah. Menurut Priyambodo, tikus yang biasa hidup Jenis tikus R. norvegicus ditemukan paling di tanah lapang dapat berpindah ke pemukiman sedikit. Keberadaan R. norvegicus di Pasar Kota
2
penduduk terutama jika kekurangan makanan. Banjarnegara ini dikarenakan di lingkungan sekitar Tidak adanya pembatas antara pasar dan pemukiman pasar terdapat saluran air yang merupakan habitat penduduk memberi peluang terjadinya perpindahan yang sesuai. Tikus ini disebut tikus riul atau tikus got tikus dari habitat asal ke habitat lain di lingkungan karena habitat tikus ini adalah di saluran air (riul) di
3
pasar. Hal ini serupa dengan penelitian Listriyani di pasar atau daerah pemukiman kota. Rattus Pasar Peterongan dan Pasar Wonodri, Semarang dan norvegicus dikenal sebagai reservoir penular penelitian Ania Maharani di Pasar Johar, Semarang Leptospira ke manusia. Beberapa serovar yang
12,18
yang menyatakan terdapat tikus rumah. berbahaya bagi manusia dibawa oleh R. norvegicus Keberadaan tikus di lingkungan manusia adalah ichterohamorragie, ballum, dan autumnali. dapat mencerminkan sanitasi lingkungannya. Infeksi Leptospira yang sifatnya kronis seperti pada Terdapat berbagai jenis los di Pasar Kota tikus riul tidak menimbulkan gejala klinis. Oleh Banjarnegara seperti los sayur, los sembako dan karena itu, R. norvegicus merupakan host sejati
19 warung makanan yang dalam aktivitas sehari-hari Leptospira.
tempat tersebut menghasilkan sisa makanan atau Tikus yang berhasil tertangkap di Pasar Kota sampah. Jika sanitasi lingkungan pasar tidak dijaga Banjarnegara sebagian besar berjenis kelamin dengan baik, maka lingkungan pasar akan menjadi jantan. Penelitian ini berbeda dengan hasil penelitian tempat sarang tikus. Tikus menyukai tempat yang Listriyani tentang studi kepadatan tikus di Pasar kotor, lembab, dan kurang pencahayaan. Kurangnya Peterongan dan Pasar Wonodri dimana sebagian tindakan pengendalian tikus yang dilakukan oleh besar tikus ditemukan berjenis kelamin betina 16
12
petugas kebersihan atau pedagang, dapat ekor (60%). Sedangkan penelitian lain yang serupa menguntungkan bagi perkembangbiakan ditempat di kawasan Pelabuhan Tanjung Emas tentang
tersebut. kepadatan tikus, dari 98 ekor tikus yang tertangkap,
11 Menurut Brooks dan Rowe, dalam 67 ekor (67%) tikus berjenis kelamin betina. Ristiyanto, kondisi lingkungan yang kurang terjaga Priyambodo menyatakan bahwa tikus berjenis kebersihannya merupakan tempat yang sesuai bagi kelamin betina lebih sering berada di luar rumah
3
kehidupan tikus. Selain itu menurut Riyadi, dalam untuk mencari makan bagi anak-anaknya, Ristiyanto, pencegahan keberadaan tikus di sedangkan jantan lebih sering berada di sarang untuk
2 lingkungan sangat dipengaruhi oleh sanitasinya. mempertahankan daerahnya.
Komponen Volume tabung, jika perlu dapat disentrifus sebentar. PCR
mix selanjutnya dimasukkan ke dalam thermal
2x Reaction Mix 10 l
cycler, kemudian alat dijalankan sesuai dengan
Primer PU 1 (Forward) 2 l
program sebagai berikut: (i) Sintesis cDNA 1 0
Primer SU 1 (Forward) 2 l siklus : 60 C selama 45 menit; (ii) Predenaturasi
0
1 siklus : 94 C selama 1 menit; (iii) Amplifikasi
Primer Lep R1 (Reverse) 2 l
0
30-35 siklus ; 94 C selama 1 menit (denaturasi),
DNA 4 l 0 0
60 C selama 30 detik (annealing), 68 C selama 1 PCR tube ini harus bebas dari nuclease menit (ekstensi); (iv) Ekstensi akhir 1 siklus :
0
dengan tujuan agar DNA hasil isolasi tidak rusak 68 C selama 5 menit. Untuk mengetahui hasil oleh enzim nuklease. Tujuan PCR mix disentrifus akhirnya, selanjutnya digunakan metode sebentar adalah untuk memastikan agar tidak ada elektroforesis.
sisa remukan sel, protein, maupun RNA.
Thermal cycler digunakan untuk tahap 3. Elektroforesis
pemeriksaan PCR. Alat thermal cycler ini
Elektroforesis adalah teknik yang disesuaikan dengan program yang telah
digunakan untuk memisahkan DNA berdasarkan 12
dijelaskan pada langkah kerja.
ukuran (berat molekul) dan struktur fisik Bahan-bahan yang digunakan antara lain molekulnya. Gel yang biasa digunakan antara Primer PU 1 (Forward) digunakan untuk lain agarosa. Dengan gel agarosa dapat mendeteksi Leptospira patogen dengan produk dilakukan pemisahan sampel DNA dengan PCR sebesar 615 bp. Primer SU 1 (Forward) ukuran dari beberapa ratus hingga 20.000 pasang digunakan untuk mendeteksi Leptospira saprofit basa (pb). Molekul DNA bermuatan negatif dengan produk PCR sebesar 316 bp. Primer Lep sehingga di dalam medan listrik akan bermigrasi R1 digunakan sebagai reverse yang digunakan melalui matriks gel menuju kutub positif untuk membuat PCR mix. DNA hasil isolasi (anode). Makin besar ukuran molekulnya, berfungsi sebagai komposisi utama dalam makin rendah laju migrasinya. Berat molekul pembuatan PCR mix. Hasil PCR selanjutnya di suatu fragmen DNA dapat diperkirakan dengan
running dengan elektroforesis untuk mengetahui membandingkan laju migrasinya dengan laju
jenis bakteri Leptospira yang berasal dari migrasi fragmen-fragmen molekul DNA
sampel darah manusia. strandar (marker) yang telah diketahui
ukurannya. Visualisasi DNA selanjutnya Langkah-langkah yang dilakukan dalam
dilakukan di bawah paparan sinar ultraviolet metode PCR diawali dengan pembuatan PCR
setelah terlebih dulu gel direndam di dalam mix dalam PCR tube 0,2 ml yang bebas nuclease,
14 larutan etidium bromid. dan dikerjakan di dalam es menggunakan dua
kali reaksi pencampuran dengan komposisi Metode elektroforesis adalah metode sebagai berikut: Primer PU 1 sebagai forward untuk mengidentifikasi suatu zat berdasarkan sebanyak 2 mikroliter, primer SU 1 (forward) pada sifa tkelistrikan zat tersebut, khususnya sebanyak 2 mikroliter, primer Lep R1 sebagai berdasar besarnya berat molekul (BM) dan reverse sebanyak 2 mikroliter, dan DNA 4 s t r u k t u r f i s i k ( u k u r a n ) z a t t e r s e b u t . mikroliter. Komponen-komponen tersebut Elektroforesis dalam dunia medis biasa dicampur perlahan-lahan, dan dipastikan semua digunakan dalam proses pencucian darah, komponen berada di bagian bawah atau dasar diagnosis penyakit, dan digunakan dalam bidang
Tabel 1. Primer untuk Pemeriksaan Bakteri Leptospira dengan Metode PCR
Jenis Primer Leptospira Sekuens Primer Ukuran Pita
Forward:
PU 1 Patogen 5’-TAT CAG AGC CTT TTA ATG G- 3’ PU 1 – Lep R1= 615
SU 1 Saprofit 5’-TTT AGG GTT AGC GTG GTA- 3’ SU 1 – Lep R1= 316
Reverse:
Keberhasilan penangkapan tikus populasi tikus yang cukup tinggi. Menurut Suyanto, tikus memiliki pergerakan yang terbatas yang Keberhasilan penangkapan tikus yang
disebut dengan daerah kembara/ jelajah. Tikus tidak tertangkap selama dua hari berturut-turut
masing-pernah melewati daerah terbuka seperti lapangan masing memiliki jumlah yang berbeda.
atau jalan raya pada saat siang hari kecuali terpaksa, K e b e r h a s i l a n p e n a n g k a p a n i n i d a p a t
sebab secara naluri rodent lebih aktif di malam menggambarkan kepadatan populasi tikus relatif di 20
hari. suatu tempat. Presentase keberhasilan penangkapan
atau trap success dihitung berdasarkan jumlah tikus Angka keberhasilan penangkapan yang tertangkap dibagi dengan jumlah perangkap dipengaruhi oleh beberapa faktor, yaitu kualitas
3
perangkap, ketepatan pemilihan umpan, dan yang dipasang. Secara keseluruhan, trap success
2
kepadatan tikus. Keberhasilan tikus juga dalam penelitian ini sebesar 8,25 %. Jumlah
dipengaruhi oleh cara penempatan perangkap tikus penangkapan tikus yang paling tinggi pada hari
ke-yang kurang tepat di runway tikus. Menurut Hadi, 2.
keberhasilan penangkapan dipengaruhi oleh Hasil penangkapan tikus yang lebih sedikit
penempatan perangkap yang tepat karena tikus pada hari ke-1 kemungkinan disebabkan oleh jenis
mempunyai sifat thigmotaxis yaitu mempunyai umpan yang kurang disukai tikus. Sifat tikus yang
lintasan yang sama saat mencari makan,sarang, dan
mudah curiga terhadap setiap benda yang 21
aktivitas harian lainnya. ditemuinya, termasuk pakannya, disebut dengan
nophobia. Dalam proses mengenali dan mengambil
pakan yang ditemukan, tikus tidaklangsung Pinjal pada tikus memakan seluruhnya, namun mencicipi terlebih
Dari ketiga spesies tikus yang tertangkap dahulu untuk melihat reaksi di dalam tubuhnya.
semuanya terinfestasi oleh pinjal. Jumlah pinjal Sebaliknya, ada tikus yang bersifat nophilia artinya
yang menginfestasi tikus paling banyak pada menyukai benda asing atau baru. Adapun sifat tikus
spesies R. tanezumi. Hal ini berbeda dengan yang enggan memakan umpan beracun karena tidak
penelitian Mutholib di Pasar Peterongan dan melalui umpan pendahuluan disebut dengan jera
Wonodri, Semarang, pinjal hanya menginfestasi
umpan (bait-shyness) atau jera racun (poison- 14
R. tanezumi dan R. norvegicus. Hasil identifikasi 2
shyness).
pinjal menunjukkan bahwa keseluruhan pinjal Keberhasilan penangkapan tikus (trap merupakan spesies yang sama, yaitu Xenopsylla success) di dalam los pasar lebih banyak daripada di cheopis.
luar los pasar. Hal ini dapat dikarenakan kondisi
Pada umumnya, X. cheopis lebih suka pada antara di dalam dan di luar los pasar memiliki cukup
tikus rumah karena berhubungan dengan banyak perbedaan. Kondisi di luar los pasar lebih
perkembangan larva pinjal yang memerlukan tidak tertata, sering ditemukan sampah dan kondisi
kondisi kering seperti pada sarang tikus rumah. permukaan tanah yang becek sehingga tampak
Pinjal tidak dapat bertahan di tempat yang lembab kotor. Namun, disisi lain pada malam hari terdapat
dan suhu udara rendah. Menurut Harwood dan kucing yang berkeliaran sehingga memungkinkan
James, X. cheopis merupakan jenis pinjal yang tikus untuk takut keluar dari sarangnya. Sedangkan
sangat mudah berpindah dari satu host ke host lain
di dalam los pasar terdapat banyak sumber makanan 2 1
baik itu sejenis ataupun berbeda jenis. yang menyebabkan tikus menyukai untuk tinggal di
Ditemukannya X. cheopis pada R. norvegicus dalam los pasar tersebut.
menunjukkan terjadinya perpindahan pinjal dari Menurut Priyambodo, lingkungan yang satu host ke host lain dan kondisi iklim yang kering. kotor merupakan tempat yang disukai tikus. Faktor Hal ini disebabkanoleh habitat R. norvegicus yaitu lain yang memungkinkan tingginya trap success selokan air yang tidak memungkinkan terjadinya adalah adanya tumpukan puing- puing bangunan, perkembangbiakan pinjal.
2 batu bata, dan sampah di sekitar gedung.
Hasil penyisiran pinjal X. cheopis yang Berdasarkan observasi, banyak tikus yang
berasal dari seluruh jenis tikus, sebagian besar menampakkan diri di siang hari meskipun ada
berasal dari penangkapan di dalam los pasar. manusia. Hal ini menunjukkan tingkat kepadatan
Xenopsylla cheopis merupakan pinjal yang khas
basa nukleotida berupa empat macam dNTP tahap selanjutnya, masing-masing untai tunggal (dATP, dGTP, dCTP, dTTP), dan enzim DNA akan ditempeli oleh primer. Jadi, ada dua buah polimerase. Langkah pertama dalam metode ini primer yang masing-masing menempel pada
11
adalah membuat DNA template. untai tunggal DNA template. Biasanya, kedua
primer tersebut dinamakan primer maju (forward DNA template adalah DNA untai ganda
primer) dan primer mundur (reverse primer). yang membawa urutan basa fragmen atau gen
Setelah menempel pada untai DNA template, yang akan digandakan. Urutan basa ini disebut
primer mengalami polimerisasi mulai dari tempat juga urutan target (target sequence).
penempelannya hingga ujung 5' DNA template. Penggandaan urutan target pada dasarnya
Dengan demikian, pada akhir putaran reaksi merupakan akumulasi hasil polimerisasi molekul
pertama akan diperoleh dua pasang untai DNA, primer. Primer adalah molekul oligonukleotida
jika DNA template awalnya berupa sepasang untai tunggal yang terdiri atas sekitar 30 basa. 12
untai DNA. Polimerisasi primer dapat berlangsung karena
adanya penambahan basa demi basa dari dNTP Pasangan-pasangan untai DNA yang
yang dikatalisasi oleh enzim DNA polimerase. diperoleh pada suatu akhir putaran reaksi akan Namun, pada PCR enzim DNA polimerase yang menjadi template pada putaran reaksi berikutnya. digunakan harus termostabil karena salah satu Begitu seterusnya hingga pada putaran yang ke n tahap reaksinya adalah denaturasi untai ganda diharapkan akan diperoleh fragmen DNA pendek DNA yang membutuhkan suhu sangat tinggi sebanyak 2n – 2n. Fragmen DNA pendek yang (sekitar 95ºC). Salah satu enzim DNA polimerase dimaksudkan adalah fragmen yang ukurannya yang umum digunakan adalah taq DNA sama dengan jarak antara kedua tempat polimerase, yang berasal dari bakteri termofilik penempelan primer. Fragmen pendek inilah yang
11
thermus aquaticus. merupakan urutan target yang memang
13 dikehendaki untuk digandakan (diamplifikasi). Tiap putaran reaksi PCR terdiri atas tiga
tahap, yaitu denaturasi template, penempelan Alat-alat yang digunakan dalam primer, dan polimerisasi primer, yang masing- pemeriksaan dengan menggunakan metode PCR masing berlangsung pada suhu lebih kurang antara lain, PCR tube 0,2 ml yang bebas nuclease 95ºC, 50ºC, dan 70ºC. Pada tahap denaturasi, digunakan sebagai tempat pembuatan PCR mix pasangan untai DNA templat dipisahkan satu dengan komposisi sebagai berikut:
sama lain sehingga menjadi untai tunggal. Pada
Merapi, Jawa Tengah. Jurnal Vektor dan ditemukan pada rodent dalam gedung. Indeks umum
Reservoir Penyakit. 2009; 1 (2): 73-83. pinjal dan indeks khusus pada penelitian memiliki
2. Priyambodo S. Sigit SH dan Upik KH, editor. persamaan karena hanya ditemukan satu jenis pinjal
. Hama pemukiman Indonesia: pengenalan,
X. cheopis. Indeks umum pinjal sebesar 2,03
biologi dan pengendalian tikus. Bogor: termasuk melebihi standar.
Fakultas Kedokteran Hewan IPB; 2006. Menurut WHO tahun 1988 dan pedoman
3. Ristiyanto, Sustriayu N, Soenarto N, pemberantasan pes di Indonesia tahun 2000, suatu
Haripurnomo K, Damar TB. Tikus, ektoparasit, wilayah dikatakan waspada terhadap penularan pes dan penyakitnya. Salatiga: Balai Besar jika 30% tikus dihuni oleh pinjal, indeks khusus Penelitian dan Pengembangan Vektor dan
X. cheopis Reservoir Penyakit (B2P2VRP); 2002.
pinjal >1, dan indeks umum pinjal
X. cheopis >2. Jika memenuhi kriteria tersebut maka 4. Omudu, Agbo E, Terlumun T. A survey of rats 13,15
perlu dilakukan pengendalian. trapped in residential apartments and their
ectoparasites in Makurdi, Nigeria. Research Journal of Agriculture and Biological Science
KESIMPULAN [serial on the Internet]. 2010 [cited 2013 Aug
17]; 6 (2): [144-49]. Available from: Tikus yang banyak tertangkap adalah Rattus
www.insipub.com/rjabs/2010/144-149.pdf. tanezumi dan lebih banyak berjenis kelamin jantan.
5. Kia EB, Sani HM, Hassanpoor H, Vatandoost Tikus lebih banyak tertangkap di dalam los pasar.
H, Zahabiun F, Akhavan AA, Bojd AA, Keberhasilan penangkapan tikus lebih tinggi pada
Telmadarraiy Z. Ectoparasites of rodents hari ke-2 dan di dalam los pasar lebih besar. Ketiga
captured in Bandar Abbas, Southern Iran. spesies tikus yang tertangkap semuanya terinfestasi Iranian J Arthropod-Borne Dis [serial on the oleh pinjal. Jumlah pinjal yang menginfestasi Internet]. 2009 [cited 2013 Aug 17]; 3(2):
[44-9 ] . A v a i l a b l e f r o m : spesies yang tertangkap sebanyak 67 ekor. Spesies
www.journals.tums.ac.ir/pdf/14951. pinjal yang menginfestasi tikus yaitu Xenopsylla
cheopis. Indeks umum pinjal melebihi standar. 6. Ristiyanto. Pengamatan fauna tikus dan
ektoparasit di daerah pemukiman penduduk dan persawahan sekitar Danau Rawa Pening
SARAN sehubungan dengan potensinya sebagai
penular penyakit bersumber binatang. Sanitas. Perlu dilakukan pengendalian populasi tikus
1997; 3 (1): 32-5. secara rutin dengan melibatkan peran serta pedagang
7. Ristiyanto dan Farida DH. Rodentologi pasar. Selain itu juga perlu pengendalian vektor
Kesehatan. Salatiga: Balai Besar Penelitian dan pinjal tikus Xenopsylla cheopis dengan
Pengembangan Vektor dan Reservoir Penyakit memperhatikan sanitasi lingkungan.
(B2P2VRP); 2005.
8. Boris R, Krasnov, Irina S, Khoklova, George I,
UCAPAN TERIMA KASIH Shenbrot. Density dependent host selection in
ectoprasites: An application of isodar theory to Peneliti mengucapkan terima kasih kepada
fleas parasitizing rodents. [cited 2013 Aug 17].
seluruh pihak yang turut berkontribusi dalam A v a i l a b l e f r o m :
penelitian ini, khususnya kepada Balai Litbang www.springerlink.com/index/E64H93PKYD B3R4R2.pdf.
P2B2 Banjarnegara dan Dinas Pasar utamanya Unit
Pelaksana Teknik Pasar Kota Banjarnegara yang 9. Sembel DT. Entomologi Kedokteran. telah memberikan kesempatan untuk dapat Yogyakarta: Andi; 2009.
melakukan penelitian ini.
10. Ibrahim IN, Winoto I, Wongsrichanalai C, Blair P, Stoops C. Abundance and distribution of Xenopsylla cheopis during on small mammals DAFTAR PUSTAKA
collected in West Java, Indonesia during rodent – borne disease surveys. Southest Asia J Top 1. Ristiyanto, Mulyono A, Agustini M, Yuliadi B,
Med Public Health [serial on the Internet]. 2006 Muhidin. Indeks keragaman ektoparasit pada
Rattus tanezumi [cited 2013 Aug 17]; 37(5). Available from:
tikus rumah (Temminck,
www.tm.mahidol.ac.th/seameo/2006_37_5/13 1844) dan tikus polinesia Rattus exulans (Peal,
-3815.pdf. 1848) di daerah enzootik pes Lereng Gunung
kontaminan lain pada tangan, serta menjaga mikroliter dan 40 mikroliter Proteinase K tangan dari larutan yang berbahaya. Tabung ditambahkan ke dalam eppendorf, kemudian
eppendorf (tube) digunakan untuk menampung dihomogenkan dengan menggunakan vortex.
larutan hasil ekstraksi, sedangkan vortex Selanjutnya, diinkubasi dalam waterbath selama 0
digunakan untuk menghomogenkan larutan 10 menit pada suhu 70 C. setelah diinkubasi, dengan prinsip menggunakan bantuan energi ditambahkan 100 mikroliter isopropanol dan listrik. Waterbath digunakan untuk inkubasi dihomogenkan menggunakan vortex. Larutan sampel DNA. Ice pack berfungsi untuk yang sudah homogen dipindah ke tabung high menyimpan DNA hasil isolasi. Microsentrifuge pure filter, kemudian disentrifugasi selama satu digunakan untuk sentrifugasi, mikropipet dan tip menit dengan kecepatan 8000 x g. Cairan berupa digunakan untuk memindahkan larutan secara kotoran yang terdapat di tabung koleksi dibuang. akurat, lemari pendingin digunakan untuk proses 500 mikroliter inhibitor removal buffer kondensasi. Tabung high pure filter berfungsi ditambahkan, kemudian disentrifugasi dengan untuk memisahkan natan dan supernatan yang kecepatan 8000 rpm selama 1 menit. diperoleh ketika proses sentrifugasi. DNA Selanjutnya, cairan berupa kotoran yang terdapat sampel tidak luruh bersama kotoran, protein, di tabung koleksi dibuang. Wash buffer sebanyak maupun RNA, karena DNA akan menempel 500 mikroliter ditambahkan, kemudian pada filter yang terdapat dalam tabung tersebut disentrifugasi dengan kecepatan 8000 x g selama (bagian yang berwarna putih). Pasangan dari 1 menit. Cairan berupa kotoran yang terdapat di tabung high pure filter ini dinamakan tabung tabung koleksi dibuang kembali, kemudian 500 koleksi (collection tube), yang berfungsi untuk mikroliter inhibitor removal buffer ditambahkan, menampung cairan berupa kotoran, protein, kemudian disentrifugasi dengan kecepatan 8000 maupun RNA pada saat proses sentrifugasi. x g selama 1 menit. Cairan berupa kotoran yang Tabung vakum digunakan untuk menampung terdapat di tabung koleksi dibuang, dan
7
sampel darah manusia. disentrifugasi dengan kecepatan 13.000 x g
selama 10 menit. Tabung koleksi dibuang, Sementara bahan yang digunakan
tabung mikro di masukkan ke dalam tabung meliputi sampel darah manusia. Binding buffer
eppendorf dan ditambahkan 200 mikroliter
berfungsi untuk melisiskan sel sampel yang 0
elution buffer (70 C). Sentrifugasi selama 1 digunakan, sedangkan Proteinase K berperan
menit dengan kecepatan 8000 x g. Akhirnya, dalam perusakan protein yang terdapat dalam sel
purifikasi DNA template dihasilkan. darah manusia yang digunakan. Isopropanol
digunakan untuk presipitasi DNA setelah
disentrifugasi, yaitu pembuangan remukan sel 2. Pemeriksaan dengan PCR atau protein maupun RNA. Larutan inhibitor
Polymerase Chain Reaction (PCR) removal buffer berfungsi untuk menjaga agar
merupakan suatu metode yang digunakan untuk natan (sampel DNA) tetap menempel pada filter
amplifikasi urutan basa DNA tertentu (selektif). dan digunakan juga sebagai pencuci dan langkah
Metode yang ditemukan oleh Kary Mullis pada awal protokol elusi. Wash buffer digunakan
tahun 1987 ini dapat digunakan untuk sebagai pencuci dan langkah kedua dan ketiga
menggandakan urutan basa nukleotida tertentu pada protokol elusi. Larutan elution buffer
secara in vitro. Penggandaan urutan basa berfungsi untuk menghasilkan purifikasi DNA
nukleotida berlangsung melalui reaksi yang ditambahkan sebelum sentrifugasi terakhir
polimerisasi yang dilakukan berulang-ulang 7
agar didapatkan DNA yang benar-benar murni.
secara berantai selama beberapa putaran (siklus). Pemeriksaan DNA bakteri Leptospira Tiap reaksi polimerisasi membutuhkan untuk pemeriksaan High Pure PCR Template komponen-komponen sintesis DNA seperti untai
Preparation Kit (Roche, Cat. No. 11 858 874 DNA yang akan digunakan sebagai cetakan
001). Langkah-langkah isolasi DNA diawali (template), molekul oligonukleotida untai dengan pengambilan 200 mikroliter sampel tunggal dengan ujung 3'-OH bebas yang darah manusia dan kemudian diletakkan dalam berfungsi sebagai prekursor (primer), sumber tabung eppendorf. Binding buffer sebanyak 200
11. Purwanto S, Praba G, Retno H. Kepadatan 15. WHO. Vector control in international health. Tikus dan Pinjal sebagai Indikator Kerentanan Geneva; 1988.
Wilayah Pelabuhan tanjung Emas terhadap
16. Suyanto A. Rodent di Jawa. Bogor: LIPI; 2006. Transmisi Pes. Jurnal Ilmiah Nasional [serial
17. Priyambodo S. Pengendalian hama tikus Internet]. 2008 [diakses tanggal 17 Agustus
terpadu. Jakarta: Penebar Swadaya; 2003. 2 0 1 3 ] . A v a i l a b l e f r o m :
http://lib.atmajaya.ac.id/default.aspx?tabID=6
18. Maharani, A. Studi kepadatan tikus beserta 1&src=a&id=129313.
infestasi pinjal dan tungau di Pasar Tradisonal Johar, Kota Semarang. Skripsi. Semarang: 12. Listriyani I. Survei kepadatan tikus di Pasar
Fakultas Kesehatan Masyarakat Universitas Peterongan dan Pasar Wonodri. Skripsi.
Diponegoro; 2010. Semarang: Fakultas Kesehatan Masyarakat
Universitas Muhammadiyah Semarang; 2006.
19. Mulyono A, Ristiyanto, Soesanti N. Karakteristik histopatologi hepar tikus got 13. Departemen Kesehatan RI. Pedoman
Rattus norvegicus infektif Leptospira sp. Jurnal penanggulangan pes di Indonesia. Sub
Vektor dan Reservoir Penyakit. 2009; 1 (2): 85-Direktorat Zoonosis Dirjen Pengendalian
93. Penyakit dan Penyehatan Lingkungan. Jakarta:
Depkes; 2000.
20. Delany MJ. The ecology of small mammals. London: Edward Arnold; 1976.
14. Mutholib A. Indeks pinjal pada tikus yang tertangkap di Pasar Peterongan dan Wonodri
21. Hadi. Jenis-jenis tungau trombokulid di Semarang. Skripsi. Semarang: Fakultas
I n d o n e s i a . J a k a r t a : U n i v e r s i t a s K e s e h a t a n M a s y a r a k a t U n i v e r s i t a s
Indonesia;1991. Muhammadiyah Semarang; 2006.
minggu pertama setelah infeksi dan berlangsung monosmotik, sedangkan bahan-bahan yang lebih sampai beberapa bulan. Kasus leptospirosis kasar perlu diperlakukan dengan detergen yang seringkali tidak menunjukkan gejala klinis yang kuat seperti triton X-100 atau dengan sodium spesifik dan sulit didiagnosis tanpa pengujian dodesil sulfat (SDS). Langkah ini harus disertai sampel di laboratorium. Pengujian dengan dengan perusakan membran nukleus. Sel menggunakan metode PCR (Polymerase Chain mengalami lisis, remukan-remukan sel harus
Reaction) dinilai lebih akurat apabila dibandingkan dibuang. Pembuangan remukan sel dilakukan
6
dengan metode yang lain. dengan sentrifugasi. Protein yang tersisa
dipresipitasi menggunakan fenol atau pelarut organik seperti kloroform, selanjutnya
METODE disentrifugasi dan dihancurkan secara enzimatis
Bahan penulisan artikel ini adalah literatur dengan protease. DNA yang telah dibersihkan dan cara yang digunakan dalam penulisan ini adalah dari protein dan remukan sel masih tercampur studi literatur dari berbagai sumber baik berupa buku dengan RNA sehingga perlu ditambahkan
7 maupun artikel ilmiah yang berhubungan dengan RNAse untuk membersihkan DNA dari RNA. pemeriksaan bakteri Leptospira menggunakan
Prinsip utama sentrifugasi adalah metode PCR.
memisahkan substansi berdasarkan berat jenis molekul. DNA kromosom dan plasmid yang kemurniannya cukup tinggi akan diperoleh
PEMBAHASAN
dengan menjalankan prosedur secara benar, Pemeriksaan bakteri Leptospira pada sampel
d a p a t d i l i h a t d a r i p e n a m p a k a n h a s i l darah penderita suspect leptospirosis melalui
elektroforesis yang baik. Tujuan dilakukannya beberapa tahapan berikut:
lima kali sentrifugasi adalah agar dalam proses
1. Isolasi DNA isolasi DNA akan didapatkan DNA murni yang
Isolasi DNA adalah memisahkan DNA bebas dari kotoran-kotoran sel, maupun RNA kromosom atau DNA genom dari komponen - dan protein. Ketelitian dan kecermatan dalam komponen sel lain. Sumber DNA bisa berasal pelaksanaan penelitian, sangat menentukan hasil 8 dari tanaman, kultur mikroorganisme, atau sel kemurnian DNA kromosom dan plasmid. manusia. Membran sel dilisis dengan Presipitasi merupakan tahap terakhir dalam menambahkan detergen untuk membebaskan isolasi DNA. Presipitasi bertujuan untuk isinya, kemudian pada ekstrak sel tersebut mengendapkan protein histon, sehingga untai-ditambahkan protease, yang berfungsi untai DNA tidak lagi menggulung (coiling) dan mendegradasi protein dan RNAse, yang berikatan dengan protein histon, yang
9 berfungsi untuk mendegradasi RNA, sehingga menyebabkan DNA menjadi terlihat.
yang tinggal adalah DNA. Ekstrak tersebut B e r d a s a r k a n h a s i l i s o l a s i D N A 0
selanjutnya dipanaskan sampai suhu 90 C untuk m e n g g u n a k a n s a m p e l d a r a h m a n u s i a , menginaktifasi enzim yang mendegradasi DNA menunjukkan adanya kabut putih, hal ini dapat (DNase). Larutan DNA kemudian di presipitasi dikatakan bahwa isolasi DNA berhasil, sesuai
10
dengan etanol dan bisa dilarutkan kembali pernyataan, pekat atau tidaknya larutan DNA menggunakan air, akhirnya didapatkan DNA tergantung dari preparasinya, ditunjukkan
7
murni. dengan adanya kabut putih. Semakin baik
Isolasi DNA diawali dengan perusakan preparasinya, seringkali menghasilkan DNA dan atau pembuangan dinding sel, yang dapat yang pekat. Hasil DNA yang didapatkan kurang dilakukan baik dengan cara mekanis seperti pekat, maka diperlukan adanya pemekatan untuk sonikasi, tekanan tinggi, beku-leleh, maupun meningkatkan konsentrasi DNA.
dengan cara enzimatis seperti pemberian lisozim. Isolasi DNA bakteri Leptospira Langkah berikutnya adalah lisis sel. Bahan- menggunakan alat-alat, seperti sarung tangan bahan sel yang relatif lunak dapat dengan mudah digunakan untuk menghindari hasil isolasi diresuspensi di dalam medium buffer terkontaminasi DNAse dari keringat atau
