- 1 -
ESTIMASI JARAK GENETIK DAN FAKTOR PEUBAH
PEMBEDA KUDA DI SUMATERA UTARA MELALUI
ANALISIS MORFOMETRIK
SKRIPSI
Oleh:
HALITOPAN KABAN 110306059
PROGRAM STUDI PETERNAKAN FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
MEDAN 2017
- 2 -
ESTIMASI JARAK GENETIK DAN FAKTOR PEUBAH
PEMBEDA KUDA DI SUMATERA UTARA MELALUI
ANALISIS MORFOMETRIK
SKRIPSI
Oleh:
HALITOPAN KABAN 110306059/PETERNAKAN
Skripsi sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar sarjana di Program Studi Peternakan Fakultas Pertanian
Universitas Sumatera Utara
PROGRAM STUDI PETERNAKAN FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
- 3 -
Judul Skripsi : Estimasi Jarak Genetik dan Faktor Peubah Pembeda Kuda di Sumatera Utara Melalui Analisis Morfometrik
Nama : Halitopan Kaban
NIM : 110306059
Program Studi : Peternakan
Disetujui Oleh : Komisi Pembimbing
Hamdan, S.Pt, M.Si. Ir. Tri Hesti Wahyuni, M.Sc
Ketua
Anggota
Mengetahui,
Prof. Dr. Ir. Hasnudi, MS Ketua Program Studi Peternakan
Tanggal Lulus :
ABSTRAK
HALITOPAN KABAN, 2017 : Estimasi Jarak Genetik Dan Faktor Peubah Pembeda Kuda Di Sumatera Utara Melalui Analisis Morfometrik. Dibimbing oleh
HAMDAN dan TRI HESTI WAHYUNI.
Penelitian ini bertujuan untuk melihat jarak genetik dan faktor peubah pembeda kuda di empat Kabupaten di Sumatera Utara. Penelitian ini dilaksanakan di Kabupaten Karo (60), Kabupaten Humbang Hasundutan (77), Kabupaten Tapanuli Utara (52) dan Kabupaten Samosir (42) dari bulan Juli 2016. Analisis yang digunakan dalam penelitian ini adalah Analisis Deskriptif, Analisis Diskriminan, Analisis Kanonikal, Analisis Komponen Utama, Jarak Genetik dan Pohon Filogenik.
Peubah yang menjadi pembeda kuda adalah tinggi pinggul. Jarak genetik kuda yang terdekat adalah kuda antar Kab. Karo dan Kab. Tapanuli Utara (0.869), dan kuda yang memiliki jarak genetik terjauh adalah kuda di Kab. Karo dengan kuda di Kab. Samosir (14.539). Berdasarkan hasil pengukuran
morfometrik kuda pada penelitian ini, dalam rangka untuk mendapatkan heterosis, diperkirakan perlu dilakukan persilangan antara kuda yang berada di Kab. Karo dan kuda yang berada di Kab. Samosir.
ii
ABSTRACT
HALITOPAN KABAN, 2017 : Estimation of genetic distance and the differentiated change factor of the horses in North Sumatra through morfometric analysis. Guided by HAMDAN dan TRI HESTI WAHYUNI
This research aims to see the distance of genetics and differentiated change factor of the horse in four District in North Sumatra, this research is hold in Karo District (60), Humbahas District (77), Tapanuli Utara District (52) and Samosir District (42) beginning at July 2016. The analysis used in this research is descriptive analysis, discriminant analysis, canonical analysis, principal component analysis, genetic distances and filogenic tree.
The change which is being differentiation of horse is the height of the hip, the weanest distance of horse genetic is the horse between Karo and North Tapanuli District (0.869) and the horse which has the far thest genetic distance is between horse of Karo District and the horse of Samosir District (14.539). Based to the measurement of morfometric of horse in this research in order to get heterosis, it is decided to do assimilation between the horse in Karo District and the horse in Samosir District.
Keywords: morfometric, discriminan analysis, canonical analysis, principal component analysis, genetic distance
RIWAYAT HIDUP
Penulis dilahirkan di Pernantin Kec. Juhar Kab. Karo Sumatera Utara
pada tanggal 08 September 1993 dari Bapak Muhammadta Kaban dan Ibu Bunga
Rim Br Tarigan. Penulis merupakan anak keempat dari empat bersaudara.
Pada tahun 2005 penulis lulus dari SDN 043945 Pernantin, pada tahun
2008 penulis lulus dari SMP Swasta Raksana Medan, dan pada tahun 2011
penulis lulus dari SMA Swasta Raksana Medan, dan pada tahun yang sama
penulis masuk ke jurusan Peternakan, Fakultas Pertanian, Universitas Sumatera
Utara melalui jalur Ujian Masuk Bersama (UMB).
Selama mengikuti perkuliahan penulis aktif menjadi anggota Ikatan
Mahasiswa Peternakan (IMAPET), anggota dalam Ikatan Mahasiswa Kristen
Peternakan (IMAKRIP), dan masuk Ikatan Mahasisa Karo (IMKA) MBUAH
PAGE FP USU.
Penulis melaksanakan Praktek Kerja Lapangan (PKL) di KUD (Koperasi
Unit Desa) Rahmad Tani Desa PIR ADB Dusun CIII Kecamatan Besitang
Kabupaten Langkat provinsi Sumatera Utara dimulai pada tanggal 14 Juli 2014-14
iv
KATA PENGANTAR
Puji dan syukur penulis ucapkan kehadirat Tuhan Yang Maha Esa yang
telah memberikan rahmat serta karuniaNya sehingga penulis dapat menyelesaikan
Skripsi yang berjudul “Estimasi Jarak Genetik Dan Faktor Peubah Pembeda Kuda
Di Sumatera Utara Melalui Analisis Morfometrik”
Penulis mengucapkan terima kasih kepada Hamdan, S.Pt. M.Si selaku
ketua komisi pembimbing, dan Ir. Tri Hesti Wahyuni, M.Sc selaku anggota
komisi pembimbing yang telah memberikan bimbingan dan arahan dalam
menyelesaikan penulisan skripsi ini. Penulis juga mengucapkan terimakasih
kepada kedua orangtua atas doa, semangat dan pengorbanan materil maupun moril
hingga sampai saat ini. Penulis juga mengucapkan terimakasih kepada kakak dan
abang kandung saya, dan kepada civitas akademia di Program Studi Peternakan
Fakultas Pertanian Universitas Sumatera Utara, serta semua rekan mahasiswa
yang telah membantu penulis dalam menyelesaikan skripsi ini.
Penulis mengharapkan kritik dan saran yang membangun demi
kesempurnaan skripsi ini. Akhir kata, penulis mengucapkan terimakasih. Semoga
skripsi ini bermanfaat bagi yang membutuhkan.
DAFTAR ISI
ABSTRAK ... i
ABSTRACT ... ii
DAFTAR RIWAYAT HIDUP ... iii
KATA PENGANTAR ... iv
Tujuan Penelitian ... 2
Hipotesis Penelitian ... 2
Kegunaan Penelitian... 2
TINJAUAN PUSTAKA Kondisi Umum Lokasi Penelitian ……...3
Kabupaten Karo ... 3
Kabupaten Humbang Hasundutan... 4
Kabupaten Tapanuli Utara ... 5
Kabupaten Samosir……….. ...5
Kuda ... 6
Fenotifik ... 7
Karakterisasi ... 8
Morfometrik ... 8
Analisis Diskriminan ... 9
Analisis Kanonikal ... 11
Jarak Genetik ... 11
Pohon Filogenik……… ... 12
Analisis Komponen Utama ... 13
BAHAN DAN METODE PENELITIAN Tempat dan Waktu Penelitian………15 Morfometrik Kuda di Kab. Karo ... ...20
vi
Morfometrik Kuda di Kab. Humbahas... 21
Morfometrik Kuda di Kab. Tapanuli Utara... 21
Morfometrik Kuda di Kab. Samosir………...22
Perbandingan Morfometrik Kuda ... 23
Peubah Pembeda Kuda Jantan ... 25
Peubah Pembeda Kuda Betina ... 26
Peubah Pembeda Kuda Gabungan ... 26
Analisis Gerombol Kuda Jantan ...……...………27
Analisis Gerombol Kuda Betina………...……….28
Analisis Gerombol Kuda Gabungan...30
Penentuan Estimasi Jarak Genetik Dan Dendogram Kuda………...32
KESIMPULAN DAN SARAN Kesimpulan………34 Saran………..………34
DAFTAR PUSTAKA
LAMPIRAN
DAFTAR TABEL
1. Jumlah Sampel Kuda di Kab. Karo………..………..15
2. Jumlah Sampel Kuda di Kab. Humbahas………..……….15 3. Jumlah Sampel Kuda di Kab. Tapanuli Utara…………..………..15 4. Jumlah Sampel Kuda di Kab. Samosir………..……….16 5. Rataan, Simpangan Baku dan KK Kuda di Kab. Karo ………..…...20 6. Rataan, Simpangan Baku dan KK Kuda di Kab. Humbahas………...21 7. Rataan, Simpangan Baku dan KK Kuda di Kab. Taput ………22 8. Rataan, Simpangan Baku dan KK Kuda di Kab. Samosir ...………..…23 9. Rataan, Simpangan Baku dan KK Kuda Gabungan . . …………...24
10. Struktur Peubah Pembeda Kuda Jantan..……….………....25
11. Struktur Peubah Pembeda Kuda Betina………...………....26 12. Struktur Peubah Pembeda Kuda Gabungan………...…... . . . 26
13. Analisis Diskriminan Fisher Kuda Jantan………...28
14. Analisis Diskriminan Fisher Kuda Betina………...29
15. Analisis Diskriminan Fisher Kuda Gabungan ……….. .31
viii
DAFTAR GAMBAR
1. Gambar Peubah Kuda ... 17
2. Analisis Gerombol Kuda Jantan... 27
3. Analisis Gerombol Kuda Betina…………..………..29
4. Analisis Gerombol Kuda Gabungan ... 30
5. Dendogram………..………...32
Hal. No.
DAFTAR LAMPIRAN
1. Peta Geografis Kab. Karo...…..……….……...38
2. Peta Geografis Kab. Humbahas...………... 39
3. Peta Geografis Kab. Tapanuli Utara...………...40
4. Peta Geografis Kab. Samosir...……….41
5. Tabel Populasi Kuda di Kabupaten Karo…..……….……...42
6. Tabel Populasi Kuda di Kabupaten Humbang Hasundutan………... 43
7. Tabel Populasi Kuda di Kabupaten Tapanuli Utara………...44
8. Tabel Populasi Kuda di Kabupaten Samosir……….45
9. Rata-rata, Simpangan Baku, dan Koefisien Keragaman Morfometrik Kuda jantan di Kabupaten Karo………...………..46
10. Rata-rata, Simpangan Baku, dan Koefisien Keragaman Morfometrik Kuda jantan di Kabupaten Humbang Hasundutan………….………46
11. Rata-rata, Simpangan Baku, dan Koefisien Keragaman Morfometrik Kuda jantan di Kabupaten Tapanuli Utara………46
12. Rata-rata, Simpangan Baku, dan Koefisien Keragaman Morfometrik Kuda jantan di Kabupaten Samosir……….………...46
13. Rata-rata, Simpangan Baku, dan Koefisien Keragaman Morfometrik Kuda betina di Kabupaten Karo……….47
14. Rata-rata, Simpangan Baku, dan Koefisien Keragaman Morfometrik Kuda betina di Kabupaten Humbang Hasundutan……….47
15. Rata-rata, Simpangan Baku, dan Koefisien Keragaman Morfometrik Kuda betina di Kabupaten Tapanuli Utara……….………47
16. Rata-rata, Simpangan Baku, dan Koefisien Keragaman Morfometrik Kuda betina di Kabupaten Samosir……….………...47
17. Rata-rata, Simpangan Baku, dan Koefisien Keragaman Morfometrik Kuda di Kabupaten Karo……….……...48
18. Rata-rata, Simpangan Baku, dan Koefisien Keragaman Morfometrik Kuda di Kabupaten Humbang Hasundutan………….……...48
19. Rata-rata, Simpangan Baku, dan Koefisien Keragaman Morfometrik Kuda di Kabupaten Tapanuli Utara………..………...…………...48
20. Rata-rata, Simpangan Baku, dan Koefisien Keragaman Morfometrik Kuda di Kabupaten Samosir………...48
21. Peubah Pembeda Kuda Jantan………49
22. Peubah Pembeda Kuda Betina………...49
23. Peubah Pembeda Kuda Gabungan……….……… . . 49
24. Peta dan Tabel Penyebaran Kuda Jantan……….……...50
25. Peta dan Tabel Penyebaran Kuda Betina ...……… . . . .51
26. Peta dan Tabel Penyebaran Kuda Gabungan……...………...52
27. Jarak Genetik………..53
28. Dendogram………..53
