Ecosim, Info grup Parameter lainnya
37. Analisis pengurangan stok
Gambar 1. Bagian atas salah satu file deret waktu Anchovy Bay yang digunakan untuk analisis Multi-sim dalam tutorial ini.
Setiap berkas CSV tampak seperti ini, satu-satunya perbedaan adalah nilai pada kolom Fitting bervariasi antara berkas, tetapi rangkaian waktu mana pun dalam berkas dapat divariasikan, jika diinginkan.
Unduh folder csv multisim yang di-zip, ekstrak dan taruh di suatu tempat (di mana Anda dapat menemukannya lagi).
Tutorial Multi-sim dirancang untuk mengatasi ketidakpastian dalam data deret waktu, baik itu fungsi pemaksaan lingkungan, upaya penangkapan ikan, deret biomassa atau lainnya, lihat panduan Pengguna EwE untuk Multi-sim. Gunakan basis data Anchovy Bay true.ewemdb (unduh). Buka basis data, dan buka Ecosim > Alat > Multi-sim. Multi-sim EwE dapat membaca berkas deret waktu dengan berbagai fungsi pemaksaan. Anda bisa mendapatkan format berkas CSV yang akan digunakan jika Anda mengeklik Contoh pada antarmuka Multi-sim. Untuk penggunaan Anda sendiri, gunakan berkas yang berasal dari model Anda sendiri. Di sini, kita akan mengunduh berkas zip yang berisi folder berisi 20 berkas CSV. Masing-masing dari 20 berkas ini memiliki deret waktu produktivitas lingkungan yang berasal dari nilai berkorelasi otomatis berdasarkan nilai deret waktu asli yang sebenarnya.
Sekarang periksa apakah rangkaian waktu Fitting diterapkan pada produksi primer. Buka Ecosim > Input > Fungsi pemaksaan > Terapkan pemaksaan (produsen) dan periksa apakah F2 diterapkan pada produsen primer (atau terapkan, jika belum).
Berikut adalah contoh yang menunjukkan bagaimana tampilan rangkaian waktu “Fitting” untuk empat file CSV,
Tutorial: Ketidakpastian dalam data deret waktu
Pada Output, pilih tempat Multi-sim akan menulis output. Pilih indikator yang ingin Anda dapatkan outputnya, misalnya, Biomassa.
Selanjutnya klik Jalankan. Multi-sim sekarang akan menjalankan Ecosim 20 kali, setiap kali dengan rangkaian waktu yang berbeda untuk fungsi pemaksaan lingkungan yang dibaca. Jika menyimpan biomassa seperti dalam contoh ini, ia akan membuat folder untuk setiap 20 kali proses, dan menyimpan dua file di setiap proses, biomass_annual.csv dan biomass_monthly.csv. Struktur ini cocok untuk analisis di R.
Pada antarmuka Multi-sim, folder Input > Source , pilih Choose, dan telusuri untuk menemukan folder berisi file CSV yang baru saja Anda unduh. Pilih 20 file CSV dengan mengeklik All di kolom kanan.
Gambar 2. Empat rangkaian deret waktu berkorelasi otomatis untuk produktivitas lingkungan. Deret waktu asli ditunjukkan dengan warna merah pada setiap plot.
Bandingkan deret waktu di beberapa file keluaran, putar!
Ada berkas log tersimpan yang menunjukkan apa yang telah dilakukan Multi-sim, Gambar 3 adalah contohnya.
Gambar 3. Log-file dari Anchovy Bay Multi-sim run
Setel ulang pengali kerentanan ke nilai default: Ecosim > Input > Kerentanan. Klik sel kiri atas dalam spreadsheet (di atas 1 dan di sebelah kiri Prey\predator), untuk memilih seluruh lembar, lalu masukkan nilai 2 di Set: di kanan atas, dan klik Apply di sebelah kanan.
Jalankan model, Ecosim > Output > Jalankan Ecosim > tombol Jalankan. Periksa output, terutama pada plot Grup Ecosim. Sebagai contoh tentang apa yang harus dicari, periksa layar cod. Model menunjukkan penurunan biomassa yang lebih besar daripada data.
Apa yang dapat kita simpulkan tentang pengganda kerentanan untuk cod?
Periksa formulir Ecosim > Input > Forcing function di mana Anda akan menemukan dua fungsi pemaksaan, 1: True PP, (yang akan kita gunakan nanti untuk perbandingan), dan 2: Fitting, (yang akan kita gunakan untuk fitting). Periksa formulir Ecosim > Input >
Forcing function > Apply FF (producer). Di sini seharusnya ada F2 di (bidang entri tunggal yang tidak diblokir) untuk Fitoplankton (jika tidak, klik bidang kosong dan pilih FF. Omong-omong, kedua fungsi pemaksaan tersebut disertakan dalam berkas deret waktu, dan ketika/jika Anda membacanya, Anda harus menentukan bahwa Anda tidak ingin membaca masing-masing dari ini sebagai nilai bulanan.
Sekarang masuk ke Ecosim > Alat > Sesuaikan dengan rangkaian waktu. Coba jalankan sejumlah penyesuaian yang berbeda;
pertama dengan pencarian kerentanan saja. Misalnya, cari grup dengan rangkaian waktu, dan cari pengali kerentanan untuk tujuh grup dengan rangkaian waktu. Perhatikan apa SS 'dasar', dan apa yang Anda dapatkan dengan tujuh parameter yang diestimasikan, mungkin pengurangan SS yang substansial. Coba juga untuk memperkirakan pengali kerentanan yang lebih sedikit. Cari juga parameter yang paling sensitif, dan coba dengan jumlah parameter yang berbeda. Grup mana yang paling/paling tidak sensitif?
Apakah ada implikasi yang dapat disimpulkan dari ini? Pertimbangkan secara khusus apakah kita cenderung memiliki atau mendapatkan rangkaian waktu untuk grup yang lebih sensitif.
Dengan demikian, 'data' deret waktu untuk tutorial ini diperoleh dari model yang dijalankan dengan pemaksaan produksi primer yang diketahui dan dengan pengali kerentanan yang diketahui. Dapatkah kita mengambil nilai-nilai tersebut?
Buka model Anchovy Bay true.ewemdb (unduh); lalu muat skenario anch bay , dan kemudian rangkaian waktu sebenarnya anchovybay , (yang juga tersedia dalam berkas rangkaian waktu anchovybay true.csv ).
Tutorial saat ini adalah uji coba untuk melihat seberapa baik Ecosim dapat menyesuaikan model dengan parameter yang diketahui.
Dalam tutorial sebelumnya, kami memasang model Anchovy Bay ke berkas deret waktu sederhana, terutama untuk mengeksplorasi prosedur pemasangan deret waktu Ecosim dengan cara yang sederhana. Di sini, kami akan membahasnya lebih lanjut, terutama dengan mengevaluasi pemasangan saat mempertimbangkan perikanan, jaring makanan, dan kondisi lingkungan, yaitu kami menambahkan fungsi pemaksaan lingkungan.
Tutorial: Menyesuaikan deret waktu dengan nilai
sebenarnya
Evaluasi bukan hanya SS, tetapi juga apakah anomali tersebut masuk akal (mungkin ada kecenderungan untuk memotong atau meningkatkan PP secara drastis di awal atau akhir rangkaian waktu karena hal ini sering kali dapat dilakukan tanpa 'penalti' rangkaian waktu). Berdasarkan hal ini, pilih satu atau beberapa titik spline untuk menguji gabungan pencarian Kerentanan dan Anomali – cobalah menjalankan hal tersebut.
Setelah Anda selesai melakukan uji kecocokan, salin hasil dari tabel pada formulir Sesuaikan dengan deret waktu ke dalam spreadsheet (agar tidak hilang). Evaluasi nilai AICc, dan pertimbangkan implikasi untuk pemilihan model.
Opsional
Ada rangkaian waktu tambahan dalam basis data model, “anchovybay true partial”.
Setel ulang pengganda kerentanan. Sekarang cari anomali produksi primer; centang pencarian Anomali pada formulir Sesuaikan dengan rangkaian waktu, dan hapus centang pencarian Kerentanan, jadi hanya cari sinyal lingkungan. Sebelum setiap proses, masuk ke Ecosim, Input data, Forcing func-tions, dan setel ulang bentuk fungsi Fitting forcing. Coba dengan jumlah titik spline yang berbeda, misalnya, 2, 3, 4, 6, 10, dan terakhir 0 (yaitu PP tahunan). Apakah Anda melihat sinyal lingkungan yang jelas?
• Pertimbangkan seberapa baik rutinitas pemasangan mampu menemukan anomali dan kerentanan PP. • Bahas temuan dan implikasinya.
Bandingkan juga kecocokan pengganda kerentanan dengan pencarian berdasarkan predator dan kombinasi predator/mangsa.
Sebagai aturan, kami menemukan bahwa pencarian berdasarkan predator adalah yang paling efisien – dan lebih mudah dijelaskan.
Untuk tiap kali menjalankan, selalu merupakan praktik yang baik untuk memeriksa formulir kerentanan guna melihat pengganda yang diestimasikan.
Versi model Anda mungkin sedikit berubah dari yang di bawah, tetapi harus mendekati
Mirip dengan yang sebelumnya, tetapi menghilangkan sejumlah nilai deret waktu awal yang membantu mengidentifikasi pola siklus. Coba deret waktu ini untuk mempertimbangkan efek memiliki deret waktu dengan kontras.
Pengganda kerentanan untuk model Teluk Anchovy
7 Ikan Teri
1. Paus 1.14
2.38
6 Ikan tenggiri 1,60
10. Zooplankton 2,26 5 Ikan tenggiri juv 1.10
6.17
3.22 4 Ikan Whiting
9 Bentos
>1000 1.28 3 ikan kod
1.21 8 Udang
2 Segel
Panduan Ecosampler ada di Panduan Pengguna EwE.
Buka formulir Ecosampler dan centang tombol Rekam (jadikan merah untuk perekaman). Buka Ecosim > Alat > Simulasi Monte Carlo, dan jalankan. Perhatikan di antarmuka Ecosampler bahwa ia menyimpan setiap model Ecopath yang seimbang.
Ecosampler disertakan dalam EwE Vers. 6.6., dan tersedia dari Menu > Alat > Ecosampler di Navigator.
Ecosampler adalah rutinitas yang membuat model Ecopath alternatif, dan kemudian menggunakan masing-masing model ini untuk analisis berdasarkan rutinitas inti EwE (yaitu Ecopath, Ecosim, dan Ecospace).
Matikan rekaman Ecosampler. Ikuti petunjuk dalam Panduan Pengguna Ecosampler.
Ecosampler dapat dijalankan untuk menjalankan Ecopath dasar, menjalankan Ecosim, dan menjalankan Ecospace, serta menjalankan plug-in yang dimuat. Namun, (belum) dapat menjalankan berbagai modul yang dibangun dalam EwE, misalnya, pencarian kebijakan, penyesuaian dengan rangkaian waktu. Untuk saat ini, Anda dapat memuat sampel pada saat itu dalam rutinitas Ecosampler, lalu menjalankan berbagai rutinitas dalam EwE, satu demi satu. Atau, rancang plug-in yang akan melakukannya!
Tutorial: Ekosampler Teluk Ikan Teri
), hal ini memberikan titik referensi untuk manajemen,
4. Berhentilah memancing perahu umpan dan ambillah hasilnya.
5. Anda akan melihat bahwa udang secara tidak langsung terkena dampak dari perikanan ikan teri. Cobalah untuk menetapkan termasuk dari sudut pandang masyarakat
Jalankan. Ekstrak hasil, lalu salin ke lembar kerja Anda.
(20051 ). Meskipun MSY merupakan sebuah konsep yang memiliki beberapa permasalahan yang jelas sebagai tujuan pengelolaan, terutama dari perspektif konservasi
3. Kemudian tingkatkan upaya penangkapan armada kapal umpan (yang menargetkan ikan teri) menjadi 10.
Skenario pengelolaan pertama mencakup perbandingan antara Hasil Maksimum Berkelanjutan (MSY) pada tingkat satu spesies dengan tingkat ekosistem. Metodologi ini dijelaskan oleh Walters dkk.
2. Jalankan model, ekstrak hasil untuk tahun terakhir, dan simpan nilai dari hasil tersebut dalam spreadsheet. Anda dapat mengekstrak nilai dari formulir Ecosim > Output > Hasil Ecosim , simpan Fleet, nilai akhir, dan Group, biomassa akhir.
satu, Anda dapat mengunduhnya dari tautan ini. Setelah dimuat, muat skenario Ecosim (tetapi bukan rangkaian waktu), periksa apakah Anda telah menyimpan kerentanan (Ecosim > Input > Kerentanan). Jalankan untuk memeriksa model. Kemudian atur ulang upaya untuk semua armada (Ecosim > Input > Upaya Penangkapan Ikan > Atur Ulang Semua).
1. Gunakan model Anchovy Bay dalam versi yang disesuaikan dengan deret waktu. Jika Anda tidak memiliki
• Memperoleh pengalaman dalam evaluasi MSY tingkat spesies tunggal vs. tingkat ekosistem
. Latihan ini dirancang untuk,
6. Cobalah mengubah upaya untuk armada lain (lakukan beberapa manipulasi ekosistem) untuk melihat apakah Anda dapat meningkatkan nilai perikanan tanpa merusak ekosistem.
peningkatan upaya penangkapan ikan teri dan juga meningkatkan upaya penangkapan udang.