9
KU3 Mampu mengkaji implikasi pengembangan atau implementasi ilmu pengetahuan teknologi yang memperhatikan dan menerapkan nilai humaniora sesuai dengan keahliannya berdasarkan kaidah, tata cara dan etika ilmiah dalam rangka menghasilkan solusi, gagasan, desain atau kritik seni.
KU4 Mampu menyusun deskripsi saintifik hasil kajiannya dalam bentuk skripsi atau laporan tugas akhir, dan mengunggahnya dalam laman perguruan tinggi.
KU5 Mampu mengambil keputusan secara tepat dalam konteks penyelesaian masalah di bidang keahliannya. KU6 Mampu memelihara dan mengembangkan jaringan kerja sama dan hasil kerja sama di dalam maupun di
luar lembaganya.
KU7 Mampu bertanggung jawab atas pencapaian hasil kerja kelompok dan melakukan supervise dan evaluasi terhadap penyelesaian pekerjaan yang ditugaskan kepada pekerja yang berada di bawah tanggung jawabnya.
KU8 Mampu melakukan evaluasi diri terhadap kelompok kerja yang berada di bawah tanggung jawabnya, dan mampu mengelola pembelajaran secara mandiri.
KU9 Mampu mendokumentasikan, menyimpan, mengamankan, dan menemukan kembali data untuk menjamin kesahihan dan mencegah plagiasi.
CPMK Mahasiswa diharapkan mampu menjelaskan terminologi dasar dan konsep diagnostik molekuler sebagai landasan dalam implementasi dan adopsi teknik-teknik baru dalam diagnosis.
CPMK-1 Mampu menjelaskan prinsip isolasi asam nukleat dari darah dan jaringan padat serta bagaimana menyimpan RNA dan DNA untuk analisis lebih lanjut.
CPMK-2 Mampu menjelaskan tentang polymerase chain reaction (PCR), reverse transcriptase PCR, dan teknik amplifikasi lainnya.
CPMK-3 Mampu menjelaskan metode elektroforesis dan hibridisasi, termasuk Southern dan Northern blot. CPMK-4 Mengetahui dan mampu menjelaskan teknik-teknik diagnostik molekuler untuk diagnosis secara
mikrobiologi, hematologi dan penyakit-penyakit genetik.
DESKRIPSI SINGKAT MK Pada mata kuliah ini mahasiswa belajar tentang konsep-konsep dalam diagnostik molekuler yang merupakan landasan dalam implemetasi dan adopsi teknik-teknik baru dalam diagnosis.
BAHAN KAJIAN/
MATERI PEMBELAJARAN
1. Struktur dan Fungsi Asam Nukleat 2. Metode Ekstraksi Asam Nukleat 3. Teknik Blotting Asam Nukleat 4. PCR
5. Metode deteksi mutasi berbasis PCR
6. Metode alternatif untuk amplifikasi asam nukleat
7. Metode elektroforesis untuk mendeteksi mutasi dan Sequencing DNA
8. Polimorfisme single-Nucleotide: Pengujian variasi DNA yang berhubungan dengan penyakit 9. Konsep Jaminan Mutu dalam diagnostik molekuler
9
11. Standar dan Standarisasi dalam Diagnostik Molekuler
12. ISH Fluorosensi: Landasan utama dalam Luminous Cytogenetics 13. Pendekatan microarray untuk analisis ekspresi gen
PUSTAKA UTAMA
7. Coleman, William B. and Tsongalis, G. J., 1997, Molecular Diagnostic: For The Clinical Laboratorian. 2nd edition, Humana Press Inc, Totowa, New Jersey
PENDUKUNG
1. Buckingham, L. and Flaws, M.L., 2007, Molecular Diagnostics: Fundamentals, Methods, & Clinical Applications, F.A. Davis Company, Philadelphia
2. Grody, W.W., Nakamura, N.M., Kiechle, F.L., Strom, C., 2009, Molecular Diagnostics: Techniques and Applications for the Clinical Laboratory, Academic Press
3. Patrinos, G.P. and Ansorge, W., 2005, Molecular Diagnostics, Academic Press
DOSEN PENGAMPU Dr. Erman Tritama, M.Si; Nur Asni Setiani, M.Si; Dewi Astriany, M.Si., Apt.
MATA KULIAH PRASYARAT Biologi Sel, Biologi Molekuler
MINGGU KE Sub-CPMK
(Kemampuan akhir tiap tahapan belajar)
Indikator Penilaian Kriteria dan bentuk penilaian
Bentuk, metode pembelajaran dan
penugasan (media & sumber
belajar)
Materi Pembelajaran (pustaka)
Bobot Penilaian
(1) (2) (3) (4) (5) (6) (7)
1 Mengetahui aturan main keikutsertaan mata kuliah Diagnostik Molekuler Mampu menjelaskan definisi serta perkembangan dalam diagnostik molekuler Ketepatan dalam menjelaskan ruang lingkup diagnostik molekuler Ketepatan dalam memberikan contoh diagnostik molekuler Metode : Kuliah interaktif Media :
Power point, video
Deskripsi mata kuliah; Metode/teknik pembelajaran; Sistem penilaian; Terminologi dan perkembangan dalam Diagnostik Molekuler. 0 2 Mampu menjelaskan struktur dan fungsi asam nukleat, prinsip isolasi asam nukleat dari darah dan jaringan padat serta bagaimana menyimpan RNA dan DNA untuk analisis lebih lanjut.
Ketepatan dalam menjelaskan struktur dan fungsi asam nukleat
Ketepatan dalam menjelaskan dan memberikan contoh peranan asam nukleat dalam kit diagnostik
Bentuk test:
Kuis
Metode :
Kuliah interaktif
Media :
Power point, video
Struktur asam nukleat, replikasi, transkripsi, translasi;
Ekstraksi asam nukleat
9 3 Mampu menjelaskan
metode elektroforesis dan hibridisasi, termasuk Southern dan Northern blot.
Ketepatan dalam membedaakan dan menjelaskan prinsip kerja Southern dan Northern Blot
Ketepatan dalam interpretasi hasil dan permasalahan yang ada pada teknik Southern dan Northern Blot Kriteria: Rubrik deskriptif Metode : Kuliah interaktif Media :
Power point, video
Southern, northern, dot/blot:
Preparasi dalam pemeriksaan asam nukleat, Sekuensing DNA, serta interpretasi hasil dan permasalahan-permasalahannya
5%
4 Mampu menjelaskan tentang polymerase chain reaction (PCR), reverse transcriptase PCR, dan teknik amplifikasi lainnya.
Ketepatan dalam membedaakan dan menjelaskan prinsip berbagai teknik amplifikasi PCR. Ketepatan dalam menganalisis keberadaan mutasi melalui PCR Kriteria: Rubrik deskriptif Bentuk non-test: Resume Bentuk test: Kuis Metode : Kuliah interaktif Media :
Power point, video
Teknik amplifikasi DNA dan aplikasi-aplikasi termasuk reverse transcriptase (RT)-PCR, in situ PCR, Analisis mutasi: PCR, persiapan sampel, desain eksperimen, primer, kontrol, deteksi produk
5%
5 Ketepatan dalam
memberikan contoh dan mengevaluasi kit diagnostik yang ada Ketepatan menjelaskan prinsip ligase dalam amplifikasi DNA Metode : Kuliah interaktif Media :
Power point, video
Reaksi rantai Ligase, amplifikasi berbasis urutan asam nukleat, deteksi cabang-DNA.
Penilaian kit yang disetujui FDA dan aplikasinya saat ini.
5% 6 Ketepatan dalam membedaakan berbagai jenis RT-PCR. Ketepatan mendesain kit berbasis RT-PCR Metode : Kuliah interaktif Media :
Power point, video
RT-PCR, RT-PCR relatif, RT-PCR kompetitif: desain eksperimen, kontrol, kit, aB27:aplikasi khusus I30nd. 5% 7 Ketepatan dalam menjelaskan konsep Metode : Kuliah interaktif RACE, RNA fingerprinting 5%
9 dasar RACE dan
RNA fingerprinting Ketepatan dalam
menjelaskan
kegunaan RACE dan RNA fingerprinting
Media :
Power point, video
8 UTS 25%
9 Mengetahui dan mampu menjelaskan teknik-teknik diagnostik molekuler untuk diagnosis secara mikrobiologi, hematologi dan penyakit-penyakit genetik. Ketepatan dalam menjelaskan konsep deteksi berbasis PCR Ketepatan dalam menjelaskan teknik diagnosis menggunakan PCR dan analisis polimorfisme Ketepatan mendeteksi mutasi gen pada masalah kelainan genetic Ketepatan
menjelaskan fungsi dari berbagai teknik diagnostik, khususnya hibridisasi dan amplifikasi Kriteria : Rubrik deskriptif Bentuk test: Kuis Bentuk non-test:
Review jurnal dan Presentasi kelompok Metode : Kuliah interaktif Tugas : Presentasi terkait teknik-teknik diagnostik untuk diagnosis mikrobiologi, hematologi dan penyakit genetik
Deteksi mutasi berbasis PCR: analisis polimorfisme konformasi single-stranded. 5% 10,11 Analisis heterodupleks, denaturasi gradien elektroforesis gel, pembelahan kimia, pembelahan ribonuklease 5%
12,13 Deteksi mutasi berbasis
PCR: spesifik alel dan multipleks PCR; primer oligonukleotida kompetitif, pemotongan protein
5%
14,15 In situ hibridisasi dan
amplifikasi asam nukleat: ISH, FISH, ISA.
5%
9
RANCANGAN TUGAS
SEKOLAH TINGGI FARMASI INDONESIA PROGRAM STUDI S1 FARMASI
RENCANA TUGAS MAHASISWA MATA KULIAH Diagnostik Molekuler
KODE FA 1510 SKS (2-0) SEMESTER 5 (LIMA) DOSEN PENGAMPU Dr. Erman Tritama
BENTUK TUGAS
Tugas review jurnal dan presentasi
JUDUL TUGAS
Teknik Diagnostik Molekuler untuk Pengujian Mikrobiologi, Hematologi, dan Penyakit Genetik
SUB CAPAIAN PEMBELAJARAN MATA KULIAH
Mampu menjelaskan konsep dasar, prinsip, tahapan, dan kegunaan teknik diagnostik molekuler sebagai landasan dalam implementasi diagnosis secara mikrobiologi, hematologi, dan penyakit genetik.
DISKRIPSI TUGAS
Tugas yang dikerjakan pada matakuliah ini berupa presentasi dari hasil review jurnal tentang teknik diagnostik molekuler untuk pengujian mikrobiologi, hematologi, dan diagnosis penyakit genetik.
METODE PENGERJAAN TUGAS
1. Studi literature mencari jurnal terkait 2. Diskusi kelompok
3. Menyusun bahan & slide presentasi tugas 4. Presentasi tugas di kelas secara kelompok
BENTUK DAN FORMAT LUARAN
30. Tugas berupa slide presentasi power point terkait tema yang diterima setiap kelompok dengan sistematika lengkap 31. Tampilan berupa text, tabel, gambar, grafik, animasi atau video maksimum 10 slide.
32. Dikumpulkan dalam bentuk softcopy (format ekstensi (*.ppt) atau (*.pptx) dengan nama file : Tugas-Slide-Kelas-Kelompok (nama anggota termasuk dalam slide)
9
INDIKATOR, KRITERIA DAN BOBOT PENILAIAN cc. Penyusunan Slide Presentasi (bobot 30 %)
Jelas dan konsisten, sedehana & mudah dipahami, menampilkan teks, tabel, dan gambar menggunakan font yang mudah dibaca.
dd. Presentasi (bobot 70%)
Bahasa komunikatif, penguasaan materi, penguasaan audiensi, pengendalian waktu (5 menit presentasi), kejelasan & ketajaman paparan,penguasaan media presentasi.
JADWAL PELAKSANAAN
Pemaparan tugas : minggu ke-9
Pengerjaan tugas : minggu ke-10 hingga minggu ke-14 Pengumpulan tugas dan presentasi : minggu ke-15
LAIN-LAIN
-
DAFTAR RUJUKAN
UTAMA
Coleman, William B. and Tsongalis, G. J., 1997, Molecular Diagnostic: For The Clinical Laboratorian. 2nd edition, Humana Press Inc, Totowa, New Jersey PENDUKUNG
Buckingham, L. and Flaws, M.L., 2007, Molecular Diagnostics: Fundamentals, Methods, & Clinical Applications, F.A. Davis Company, Philadelphia
Grody, W.W., Nakamura, N.M., Kiechle, F.L., Strom, C., 2009, Molecular Diagnostics: Techniques and Applications for the Clinical Laboratory, Academic Press Patrinos, G.P. and Ansorge, W., 2005, Molecular Diagnostics, Academic Press
Assesment (Rubric)
Rubrik Deskriptif : Penilaian presentasi (Penyusunan dan Pemaparan)
Dimensi Sangat baik Baik Batas Kurang memuaskan Di Bawah Harapan Poin
Organisasi Presentasi terorganisasi dengan menyajikan fakta yang didukung oleh contoh yang telah dianalisis sesuai konsep (9-10)
Presentasi terorganisasi dengan baik dan menyajikan fakta yang meyakinkan untuk mendukung kesimpulan-kesimpulan.
(6-8)
Presentasi mempunyai fokus dan menyajikan beberapa bukti yang mendukung kesimpulan-kesimpulan.
(4-5)
Cukup fokus, namun bukti kurang mencukupi untuk digunakan dalam menarik kesimpulan (3-2)
Tidak ada organisasi yang jelas. Fakta tidak digunakan untuk mendukung pernyataan. (0-1)
Isi Isi mampu menggugah pendengar untuk mengambangkan pikiran (14-15)
Isi akurat dan lengkap. Para pendengar menambah wawasan baru tentang topik tersebut. (10-13)
Isi secara umum akurat, tetapi tidak lengkap. Para pendengar bisa mempelajari beberapa fakta yang tersirat, tetapi mereka tidak menambah wawasan baru tentang topik tersebut.
Isinya kurang akurat, karena tidak ada data faktual, tidak menambah pemahaman pendengar
(3-5)
Isinya tidak akurat atau terlalu umum. Pendengar tidak belajar apapun atau kadang menyesatkan.
9 (6-9)
Poin Total
*PoinTotal Maksimal = 25 x 4 = 100
