BAB 2
TINJAUAN PUSTAKA
2.1. Karakteristik Staphylococcus aureus
Terdapat sekurang-kurangnya 40 spesies dalam genus Staphylococcus. Tiga spesies yang selalu ditemukan dengan kepentingan klinis adalah Staphylococcus
aureus, Staphylococcus epidermidis dan Staphylococcus saprophyticus. Staphylococcus aureus merupakan salah satu patogen utama pada manusia.
Hampir setiap orang akan mengalami infeksi yang disebabkan oleh S. aureus dalam hidup mereka dengan tahap keparahan yang berbeda; dari keracunan makanan atau infeksi kulit minor hingga infeksi yang membahayakan nyawa (Jawetz, 2010). Staphylococcus aureus biasanya mengkolonisasi kulit dan membran mukosa manusia. Daerah depan (anterior) hidung merupakan habitat utama S. aureus, namun bakteri ini dapat dijumpai pada kulit, perineum, pharynx, saluran pencernaan (gastrointestinal), vagina dan ketiak (axilla) manusia (Wertheim, 2005).
Staphylococcus aureus pertama kali digambarkan oleh Anton Rosenbach seorang dokter asal Jerman pada tahun 1884 (Freeman-Cook, 2006).
Staphylococcus aureus bersifat non-motil (tidak bisa bergerak), tidak membentuk
spora dan tumbuh secara berkelompok menyerupai buah anggur. Bakteri Gram-positif ini mempunyai diameter 1µm dan berbentuk kokus (bulat) (Jawetz, 2010). Secara biokimia, semua Staphylococci dapat memproduksi katalase (katalase dapat mendegradasi H2O2 menjadi O2 dan H2O). Katalase merupakan suatu faktor virulensi yang penting karena H2O2 bersifat mikrobisidal dan degradasi katalase membatasi kemampuan neutrofil untuk membunuh. Staphylococcus aureus dapat memproduksi koagulase yaitu suatu enzim yang dapat menyebabkan plasma menggumpal dengan mengaktivasi protrombin. (Levinson et al. 2002)
Batas suhu untuk pertumbuhan S. aureus adalah antara 15°C hingga 45°C dan bakteri ini dapat tumbuh pada lempeng agar yang mengandung NaCl sehingga konsentrasi 15% (Todar, 2012). Staphylococcus aureus dapat
memfermentasi manitol dan menghemolisis sel darah merah (Levinson et al. 2002). Pada lempeng agar, koloni yang terbentuk berwarna kuning keemasan (Todar, 2012).
2.1.1. Struktur Dinding Sel
Dinding sel bakteri terdiri dari jaringan makromolekul yang disebut peptidoglikan (dikenal juga sebagai murein) dan jaringan ini bisa tersusun tunggal atau dengan kombinasi zat lain. Staphylococcus aureus merupakan bakteri Gram positif. Dinding sel bakteri Gram positif mempunyai lapisan peptidoglikan yang banyak sehingga struktur yang terbentuk tebal dan kaku (Tortora, 2013). Peptidoglikan merupakan suatu target yang bagus untuk obat antibakteri karena peptidoglikan hanya dijumpai pada bakteri, bukan pada manusia (Levinson et al. 2002). Dinding sel kebanyakan bakteri gram positif mengandung asam teichoic dan asam teichuronic yang mengatur fungsi elastisitas, porositas, kekuatan tarik dan sifat elektrostatik dinding sel. Dinding sel bakteri memberi proteksi osmotik bagi bakteri, mempertahankan bentuk bakteri, meregulasi proses pembelahan sel dan menentukan karakteristik antigen bakteri (Jawetz, 2010).
2.1.2. Faktor Virulensi
Virulensi suatu organisme adalah derajat patogenisitas organisme tersebut. Virulensi bakteri bergantung pada struktur sel, eksotoksin dan endotoksin yang dimiliki bakteri tersebut, sehingga keseluruhan komponen itu disebut sebagai faktor virulensi (Gladwin, 2001). Staphylococcus aureus dapat memproduksi sejumlah besar faktor virulensi untuk memfasilitasi patogenesisnya. Pada awalnya, penelitian terfokus pada peran faktor virulensi protein permukaan seperti kapsul; namun sejak kebelakangan ini, peneliti mula memperhatikan pentingnya keseluruhan eksoprotein Staphylococcus, seperti sitolisin dan superantigen, dalam inisiasi dan perkembangan infeksi melalui kerusakan jaringan langsung ke membran mukosa dan kulit.
A. Faktor permukaan sel: Kapsul dan protein pengikat-fibronektin (Fibronectin-binding protein).
Faktor virulensi yang terkait dengan dinding sel Staphylococcus aureus mencakup polisakarida kapsuler (capsular polysaccharides, CPs),
staphyloxanthin (pigmen karotenoid) dan sekelompok protein yang dikenal
sebagai microbial surface components recognizing adhesive matrix molecules (MSCRAMMs).
Polisakarida kapsuler diproduksi oleh kira-kira 90% S. aureus isolat klinis, dan 2 serotipe (CP5 dan CP8) menyumbang sekitar 75% isolat yang ditemukan dari manusia. Fungsi utama kapsul pada virulensi Staphylococcus adalah untuk mencegah fagositosis oleh neutrofil, tetapi kapsul Staphylococcus juga telah ditunjukkan dapat meningkatkan kolonisasi bakteri dan ketahanan pada permukaan mukosa. Pigmen keemasan S. aureus yaitu staphyloxanthin, juga berfungsi untuk melawan neutrofil (fagositosis berbasis-oksidan reaktif). MSCRAMMs seperti faktor penggumpalan (Clumping factors, Clf), protein pengikat-fibronektin (fibronectn-binding proteins, FnBP), pengikat kolagen dan Protein A, mempunyai peran penting dalam pelekatan mikroba pada protein sel inang (antara lain: fibronektin, fibrinogen dan kolagen) dan menetapkan langkah pertama terjadinya infeksi. Protein-protein ini juga mencegah pengenalan organisme oleh sistem kekebalan tubuh inang. Sebagai contoh, faktor penggumpalan (Clf) dan protein pengikat-fibronektin (FnBP) dapat menyebabkan aktivasi platelet, yang mengakibatkan pembekuan. Protein A mengikat pada bagian Fc immunoglobulin untuk mencegah opsonisasi.
B. Faktor disekresi : Lipase, Sitolisin, Superantigen dan Protease
Berbeda dengan peran protektif dan pasif faktor virulensi yang terkait dengan dinding sel, faktor virulensi yang disekresi oleh S. aureus memainkan peran aktif dalam mengganggu sistem kekebalan tubuh inang dengan merusak sel inang dan jaringan, menghalangi sistem kekebalan tubuh inang melepaskan nutrisi dan memfasilitasi penyebaran bakteri. Faktor virulensi yang disekresi terdiri dari empat kategori utama: superantigen, toksin pembentuk-pori, berbagai eksoenzim dan bermacam-macam protein (Lin, 2010).
Tabel 2.1. Faktor-faktor virulensi yang disekresi Staphylococcus aureus
FAKTOR VIRULENSI FUNGSI
Toxic shock syndrome toxin 1; staphylococcal enterotoxins; staphylococcal enterotoxin-like toxins
Mengaktivasi sel T dan makrofag
Cytolysins (α-, β-, γ-, δ-toxins); phenolsoluble
modulin-like peptides;
leukocidins (Panton-Valentine leukocidin, PVL ; LukD/E)
Menyebabkan apoptosis (pada konsentrasi rendah) dan lisis berbagai sel termasuk eritrosit, limfosit, monosit, sel epitel; variasi target spesifik
Lipase Inaktivasi asam lemak
Hyaluronidase Degradasi asam hyaluronik
Serine proteases; cysteine proteases (termasuk staphopains); aureolysin
Menginaktifkan aktivitas proteolitik neutrofil; inaktivasi peptida antimikroba
Staphylokinase Aktivasi plasminogen; Inaktivasi peptida
antimikroba
Exfoliative toxins Bertindak sebagai protease serine;
mengaktivasi sel T
Chemotaxis inhibitory protein of S. aureus; Staphylococcal inhibitor of complement
Menghambat komplemen
Staphylococcal superantigen-like proteins; extracellular adherence protein
Menghambat komplemen C5 dan IgA; menghambat migrasi neutrofil
2.2. Antibiotik Betalaktam (ß-laktam) 2.2.1. Mekanisme kerja antibiotik ß-laktam
Penicillin, seperti semua antibiotik ß-laktam, menghambat pertumbuhan bakteri dengan mengganggu reaksi transpeptidasi sintesis dinding sel bakteri. Dinding sel bakteri berfungsi untuk menjaga bentuk sel dan integritas sel, dan mencegah terjadinya lisis sel yang disebabkan oleh tekanan osmotik tinggi. Dinding sel bakteri diperbuat daripada polimer kompleks polisakarida dan polipeptida serta peptidoglikan yang dihubungkan bersilangan (cross-linked). Polisakarida tersebut mengandung gula amino, acetylglucosamine dan asam
N-acetylmuramic. Satu pentapeptida terhubung pada asam N-acetylmuramic; peptida
ini akan terminasi pada D-alanyl-D-alanine. Dalam proses membentuk cross-link dengan peptida yang berdekatan, enzim penicillin binding protein (PBP) akan mengeluarkan alanine terminal tersebut. Antibiotik ß-laktam mempunyai struktur analog substrat alami D-Ala-D-Ala, mengikat secara kovalen pada active site PBP. Ini akan menyebabkan terjadi hambatan sintesis dinding sel bakteri karena proses transpeptidasi antara rantai peptidoglikan terganggu dan membawa kepada kematian sel. Mekanisme kematian sel yang tepat tidak diketahui, namun terdapat penglibatan autolisin dan gangguan pada morfogenesis dinding sel. Antibiotik ß-laktam hanya dapat membunuh sel bakteri pada waktu bakteri masih aktif tumbuh dan mensintesis dinding sel (Katzung, 2009)
2.2.2. Mekanisme Resistansi
Resistansi bakteri terhadap penicillin dan antibiotik ß-laktam lain dapat disebabkan oleh satu dari empat mekanisme umum: (a) inaktivasi antibiotik oleh enzim betalaktamase (ß-laktamase), (b) modifikasi target PBP, (c) gangguan penembusan obat ke target PBP, dan (d) effluks. Produksi enzim ß-laktamase merupakan mekanisme resistansi yang tersering. Terdapat ratusan enzim ß-laktamase yang telah diidentifikasi, bahkan ada enzim ß-ß-laktamase yang diproduksi oleh spesies bakteri tertentu yang mempunyai spesifisitas terhadap suatu substrat. Pengubahan target PBP merupakan dasar resistansi terhadap methicillin dalam Staphylococci. Organisme (bakteri) yang resistan ini akan memproduksi PBP dengan afinitas rendah pada pengikatan antibiotik ß-laktam.
Sebagai konsekuensinya, organisme ini tidak terhambat kecuali pada konsentrasi obat tinggi yang biasanya tidak tercapai secara klinis (Katzung, 2009). Semua bakteri termasuk S. aureus mempunyai membran plasma dan dinding sel. Kebanyakan zat obat memasuki sel melalui pori pada membran sel. Konsentrasi obat di dalam sel adalah sebanding dengan jumlah pori pada sel. Ada bakteri yang menjadi resistan terhadap obat (antibiotik) dengan mekanisme mengurangi jumlah pori pada membran sel. Pada bakteri dimaksud, jumlah obat yang memasuki sel tidak cukup untuk merusak atau membunuh bakteri tersebut. Ada pula bakteri yang memproduksi pompa efluks yang mengeluarkan antibiotik dari sel sebelum antibiotik tersebut dapat merusaknya. Terdapat pompa khusus untuk obat tertentu saja dan pompa yang dapat mengekspor berbagai obat. Pompa yang dapat mengekspor berbagai obat ini dikenal sebagai pompa multi-drug resistance (MDR) dan bakteri yang mempunyai pompa ini resistan terhadap berbagai antibiotik. Pompa MDR ini juga bisa mengeluarkan disinfektan dan antiseptik yang biasanya digunakan untuk membunuh bakteri pada permukaan. Pompa-pompa ini kemungkinan telah berevolusi dari fungsi aslinya yaitu mengekspor substansi kimia toksik yang dijumpai bakteri di alam (Freeman-Cook, 2006).
2.3. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA)
Wabah infeksi didapat di rumah sakit (hospital-acquired infections) yang disebabkan oleh methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) diakui dengan frekuensi meningkat di Amerika Serikat. Dua pertiga dari kasus infeksi ini berjangkit di instalasi perawatan intensif. Pasien rawat inap terinfeksi dan dikolonisasi MRSA menjadi reservoir utama, dimana tangan petugas rumah sakit sebagai pembawa transien MRSA merupakan mekanisme yang paling penting pada seri penularan kuman dari satu pasien ke pasien lain. Pada lebih dari 85% rumah sakit di mana MRSA telah ditemukan, strain MRSA telah menjadi patogen nosokomial endemik (Thompson, 1982).
Strain MRSA ditemukan segera setelah methicillin diperkenalkan dalam praktek klinis. Resistansi tersebut disebut intrinsik karena kerusakan yang terjadi bukan disebabkan oleh antibiotik ß-laktam. Wabah pertama infeksi yang
disebabkan oleh MRSA terjadi di rumah sakit Eropa pada awal tahun 1960. Sejak itu, strain MRSA dan methicillin-resistant coagulase-negative Staphylococci telah menyebar di seluruh dunia dan telah menjadi mapan di luar lingkungan rumah sakit, terutama dalam kalangan pasien di fasilitas perawatan penyakit kronis dan pencandu obat parenteral. Terjadi peningkatan yang stabil dalam prevalensi MRSA yang diisolasi di rumah sakit di Amerika Serikat sehingga sekarang, sekitar 25% dari isolat klinis S. aureus merupakan strain resistan methicillin (MRSA).
Sekitar 30 sampai 50 kb DNA kromosom tambahan, mec, tidak ditemukan pada methicillin-sensitive Staphylococcus aureus (MSSA) namun terdapat pada MRSA. Mec selalu ditemukan dekat kelompok gen pur-nov-his pada kromosom
S. aureus. Mec mengandung MecA, gen struktural untuk protein pengikat
penicillin 2a (Pencillin-binding protein 2a, PBP 2a); mecI dan mecR1, elemen yang mengontrol transkripsi MecA; dan 20 sampai 45 kb DNA terasosiasi mec. MecA mengkode PBP 2a (juga dikenal sebagai PBP 2’), suatu 76-kDa PBP yang dapat diinduksi dan menentukan sifat resistan terhadap methicillin. Strain
S.aureus yang rentan terhadap methicillin (MSSA) tidak memiliki gen MecA.
Kedua MRSA dan MSSA menghasilkan empat PBP utama, PBPs 1, 2, 3, dan 4 dengan perkiraan massa molekul 85, 81, 75, dan 45 kDa. Penicillin-binding
protein (PBP) adalah membran terikat DD-peptidase yang telah berevolusi dari
protease serin (serine), dan mekanisme aktivitas biokimianya mirip dengan yang protease serin. Enzim-enzim ini mengkatalisis reaksi transpeptidasi yang membentuk cross-links pada peptidoglikan dinding sel bakteri. Antibiotik ß-laktam adalah analog substrat yang mengikat PBP secara kovalen di situs-aktif serin dan mengakibatkan inaktivasi enzim pada konsentrasi yang kurang lebih sama dengan minimum inhibitory concentration (MIC). Penicillin-binding
proteins (PBP) 1,2 dan 3 memiliki afinitas tinggi untuk sebagian besar antibiotik
ß-laktam, dan pengikatan antibiotik ß-laktam oleh PBP ini mematikan bagi sel bakteri. Pada sel bakteri yang resistan terhadap methicillin, PBP 2a, dengan afinitas rendah untuk mengikat antibiotik ß-laktam dapat menggantikan fungsi penting dari PBP dengan afinitas tinggi untuk mengikat antibiotik dalam konsentrasi antibiotik yang dinyatakan letal. (Chambers,1997).
2.4. Infeksi nosokomial
Infeksi nosokomial menurut World Health Organization (WHO) adalah adanya infeksi yang tampak pada pasien ketika pasien berada di dalam rumah sakit atau fasilitas kesehatan; dimana infeksi tersebut tidak tampak pada saat pasien diterima di rumah sakit. Pasien yang menunjukkan tanda-tanda infeksi setelah keluar dari rumah sakit dan infeksi pada petugas-petugas kesehatan yang bekerja di fasilitas kesehatan juga disebut sebagai infeksi nosokomial. Infeksi yang tampak setelah 48 jam pasien diterima dirumah sakit biasanya diduga sebagai suatu infeksi nosokomial.
Menurut Darmadi (2008), infeksi nosokomial merupakan suatu infeksi yang diperoleh pasien selama pasien tersebut dirawat di rumah sakit. Infeksi nosokomial dapat terjadi karena ada transmisi mikroba patogen dari lingkungan rumah sakit. Salah satu penyebab meningkatnya angka kesakitan (morbiditas) dan angka kematian (mortalitas) di rumah sakit adalah infeksi nosokomial, sehingga ini dapat menjadi suatu masalah kesehatan di negara berkembang maupun di negara maju. Infeksi nosokomial juga dijadikan landasan mengukur mutu pelayanan rumah sakit, malah jika angka kejadian infeksi nosokomial di sebuah rumah sakit tinggi, maka izin operasional rumah sakit tersebut bisa ditarik kembali. Pihak asuransi juga tidak bersedia menanggung biaya yang ditimbulkan akibat infeksi nosokomial dan ini amat merugikan bagi pihak pasien.
World Health Organization (WHO) telah mengelola suatu survei mengenai prevalensi infeksi nosokomial dalam 55 rumah sakit di 14 negara. Negara-negara ini mewakili 4 wilayah WHO yaitu Eropa, wilayah Mediterania Timur, Asia Tenggara dan wilayah Pasifik Barat. Hasil dari survei ini menyatakan rata-rata 8,7% pasien di rumah sakit mengalami infeksi nosokomial. Lebih dari 1,4 juta orang di seluruh dunia menderita akibat komplikasi infeksi yang didapat di rumah sakit. Frekuensi terjadinya infeksi nosokomial yang paling tinggi dilaporkan pada rumah sakit di wilayah Mediterania Timur sebesar 11,8%. Ini diikuti dengan wilayah Asia Tenggara dengan frekuensi 10.0%, wilayah Pasifik Barat dengan frekuensi 9,0% dan wilayah Eropa dengan frekuensi 7,7%.
Infeksi nosokomial yang paling sering terjadi adalah infeksi luka bedah, infeksi saluran kemih dan infeksi saluran pernafasan bagian bawah. Menurut studi yang dijalankan oleh WHO dan lain-lain, prevalensi terjadinya infeksi nosokomial adalah paling tinggi di instalasi perawatan intensif dan di bangsal bedah akut serta bangsal ortopedi. Tingkat infeksi lebih tinggi pada kalangan pasien dengan peningkatan kerentanan disebabkan oleh usia lanjut, penyakit yang mendasari atau kemoterapi.
