OPTIMASI ISOLASI DNA TANAMAN GAMBIR (uncaria gambir Roxb.) DAN SELEKSI PRIMER RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA).

(1)

or-m\6Asrrsqr,rMe$i

tAflAMAN

GAMBIR

{ur6qr$

Fnaf

h\r\}lDAr{

sf,lr.Exsr

pRrMsR

nAlD

Gfa,trtun'

rt*rfd

P&ffiph'c

DNA\

.

olBn

.AOT

T'mFGITA'

,&a{

oe,.

r,dIryLTA$

PERTANTAN UNIYERSIIIA$ ANDAI,A$

adoAl{c

2101

(2)

oPTlnASl

ISOLASI

DNA

TANAMAN GAMBIIT (Un'dria

cd,rril

Rorb.,

nA\

sFl

LRSI

PRIYI:R

R^"PllrRandom

Ar'rnlilirJ Pol!nrorlhic

D\Al

AI]STRAK

0en.l'

n\l '-t 'o 'pi'

'

J

\r'"

"b'

'

" ".,,'";," ,",,

..t oi,

cnD

..

..o

P .o'L u

\r

ii,"-. "'';,,'"

;'1

B'o

r,oo i"

I"

;:,"-"" ;; '..' 'r'p' r' r ". 'ro ''

'eir

; i

";i.;

"i,

,

",

\.

e,

j-.

i

0u

--

;,",; ";;; "n' t.'r"\r'

oDj

'ode poo

j

"".

-"';i;;i,,

""'1,.'o

h

rtr. r'ldrr'd'or

1'r

L."n-"",,",,

",r,. 'r4'

e'!p igbdi

''

od'D\q3R

'l;;i

"-";

:;:;r

,r;

J.

''

'. '

-

q

D

'eD

1!

\

p'

i::-.j,,,,";

I ;'. .doi o', u\'

d

'F'. ' 's/

ob'

d'

i

::,.1"",-,,

" ,";, l.o, .., ,, v..o ' 8

e

d,i

o,n J

i.,::"r, iniAF"l- .. t e'roo ;

"oJ

\'

- J

oL

;.:"-.--"'..

.:0,: "

"'"

;: ,i", -';

".n

;

o

r""

'b-

'

e

J

:,,',i

,;";

,;;;.,

,,,

o

-" -";:,;-;i

* '

."b.,

d" o,o'''r

' DJ'' 'd ' r

,,".,";;i;;;

I

o''iD1

Lrd'

:;;,

;::".;'.

,,,,:.

,i.,".d

d4i. .DrlTdo

Jp,

'1.:,'

:;":

,.

"

i ,,', i* ' ' 's

1'"

ld

,:;.;"...,.',r,,-ia

t,,"'"

D'' "/'ar"

:";.i:;,:;"i,";

i;

,:"-

"'.

'.. "\,e

in,,-

ti.

cb a

f*r,

rsF"r

p,

c

R\l'Ddriop.run

'

.'*-ti.i'

'_- tll"'

o

D

rrrt

o'i

",...,j,i';,;

;.iorr

.', e-' oi 'm'Jdioil

eJ'd

,i"ll

ii,,.,,

.

.?,' ,

ia.

.

...n,.r.,.

u.,

,sb-.(.,.,..,D\d

lil-,.-r1

.i..

...

',a ' .-''''r' '" '-'J

d'

-1,::;"^;,";

-

.

1"

r.,

a

'' 'djr' '

:(r

"

q"

D:

i;";;;","

.:';

,;.

,

(3)

I. PENDAHULUAN

'randd

_{ganbir (arn.d/u}

gz,brl

_Roxb.)_lersolons_kcdatm_s.l!h_saru

fmiti

Rubiaco€

ydg

nerupliu

tumbuhd perdu dcmanjat,

batea

bulat, bunsaya

naicmul, b.rbcntul bongkol. buah b€rbentul tapsul.

biji

berbenruk janrm d

bcsayap. Cambn

bdyat

dinmlM&b.

mba

lain untuk banm pcnymah kuln,

ar

permm!. dan conpuan

mrul

natu

sirih. Di Jeplns bahkan relah dikenbtugkd

pemen peles! rcngBotuta kiusus unluk peokoi dengd

b.nd

balu sambn,

kftna

geh;

hmpu

mene!tulhir nikodr (Denian dar

limi.

199,1).

Di

Smatcn

Bm|

lebih

ddi

90% lanan

tanmu

gmbir

terddpar di KabupaFn Limapuldr

Kot

dm

PesGt Sclaran.

Pda

periode 1998-2002 reriadi

teningkald luas budiday!

lldman

_sambir

Smatcn

Bd,i

sebee. 46%.

diD

a

pldd

uhu.

l998lercaid

Iu

lohan perLn.nm

gmbi

I4.981ha meninsha! nanjadi

21 812 ha _tada

unln

2002

D€ni(ir

juga dengan pmduksinya. pada pcriodc yang

sma mensalami p€ningkah

ddi

6.271 ton pad! bnun 1998

nenjldi

10.729 lon

pada _unun2002 (Bada Pust Stathtik. I998-2002

.,

Fau!, 2005).

Pesoalan mend6ar daiam pengenb

CM

rarieias Enqman

gmrbir

di

I.do.csia adrlan nasih tundahnya produktifiIls

de

kualitas

hasil

Pred*tinlas BRmbt Sunal.Ia

Add

b.ruariasi.

nulai

drri

65,6

ks/ia

sepai

412

kg/ha

(Fau42005) _Olenkarena

itu

diperlukm upaya

penllidn

unhrk mcndapatkM

lmmu

gdbn

rug

meniliki

produkinl&s dan

hail

y

g

rinsgi. Salan sar!

pmydar

icberhailo

tersebut

ot

saal

tcraeiue

prd!

_lenedimya

smbft

senetit yansrcdin dai basis _senelik

yog

lu6. Sejaul ini dikc.al liga ripe rananran

gmbn yailu lipe Udana, Cubadair, dm tuau (Deni&

du Fisi,

199,1). Kctiga

riF

embir t.rsebur tellh dikenal dan dibudidar€kan peroi scjak lma. Akdr tehpi bukri

bnkli

ysg

ditenuhr di laDdsd

nenunjuktd

6alwa ad, emp€t tip€

tsmM

gimbir.

yaitu

tipc

UdmC. cubadal, Risu Oadane.

de

Riau Mancik (Fau2,.

koouitsi

pe6onal).

(4)

ida buhti hukti ilmiJn

kur )!rA digu.*sn

dalam pcneAolong& kLliCaienis gambiL tcrscbut. Dcnge

denikie.

pln

yad aFahan kdisajenis Le6ebut hanya merupakan

.arb1li,Ipe'r&n

iigl

'.ra

.

rl\xl nrla{eLrdrd;p

"rrr'"ds1;.

bc rbcda sehineaa d ap.t d ik lsi fi kasi kan dalm spc sics tcSendiri bcl

h

dapal di.jaub S.lah satu telenanM ptngeol.ngd _{r'a.g digunahd}

tui

ini

addrn narih didasdkann]!

Fda

pcnematai

ltrattcr

morfoloei yme sdeal scDsitif rcrhadap

|ensinn

lingkDCa

Olcb krena itu dibutuhlo suaru sistem

pensolons

ymg

[bih

$rhil

de

aluEt.

Salah salo

can

unluk itu ad.lah penssolongnn densan

pamder

moleluler yang

diJrdke

ldgsbg

kep.da LomFosisi

d6e

nalDrial

eenerik

(DNA)

suatu organisnr. llerbasai kcuCgutm

karaltcri$si

bcrbash molekuler Lela!

bdyal

dilaporkan oleh berbagai penelili

anun

irin:

d€ngd nrengsunakb kanktcr

nblekul(

bisa lebih

akudl

dalanr

nellkukd

li.dakd

perbaikd silar arau karakrer suat! indiridu.

DisdtinC

nu wallu

yde

dibutuhkm juga lcbih cepal, siaatnya ylns lebib sabil dibddingktur den8an kan[ler norfoloai,

dimana karakrer frorfologi dipensmni oleh hrskuqan setitamya

(Jawi2001)

Selain nu aplbih sralu individu membawa perrakii llau kelnimn yang beEsal dari ret@ya arN lcbih mudan dideleksi seoda ooletuler.

Porcosi _{perasunan Fnanda}

nrol.kuld

sL'basai

alal

umuk nehnulan kdakerhasi

ide.liu\

ore&isnctlal

dikcnalsciak lMa. Pcnanda molekuler sepeni i$zyrn. RILP

(rz\rrrlid,.t.rd.ht

l.neth poltr arphkn), RAPD (. a.lott

onplilitd

pauuorphi.

DN,1). dan A!:LP

@nrliJi.l

faEncnt

lenath

polrnq?h^

)

lena sisrcft pcnanda hnnrra tclah digunakrn scbagai

Fncni

_{ecncik dalan}_Fcmuliaan

r.lffan

(KaBinan,l999)

atlikai

prattGnla

butd

hanya

lnluk

identifikasi kmklcristik,

lebrijug!

balkm diaunakan unluk nrensutur li.skat tekcr^batd

drar

naupun inleBpesi€s

tncntu

(Jmsdi,

200?)

Bahlan

ju8l

digunar@ unluk

kepenuan penctaan lokullokus gen l1rset tn€nlu yms berkdltn dcned

LmkcF

*arahcr agrononi benilai _{ekonqni t€nting.}

Pe.inda RAID yaie dikcn$drekdr oleh lvillians. dr

al

(1990) meruFkm

(5)

t.

V. XISIMPULAN DAN

S

IA}I

5,l,K6impulan

Berdddkon

lscobd

yec dilatulb

dat,1

dimbil

bcbcnpa kesinpuld

l. De

b€bcnpa prclokol

i$lsi

yos

rlisunald

Nrut

nengisolasi DN,^

tanmd

_eurbir,pmrokol isolasi

ydg diFrkenalk

olch Doylc md Doyle

(1990) dapat

disullo

mnrk mcneisolsi

DN

dei

jeinse

daun

la.ams

Cambn. sedarslon probkol isolai DN,{

tmg

laimya tidak dapai disunakan

utuk

nmgisolai

DNI

taEnan gmbn.

2

J.nk malerial yana baik digunakm unluk

toendrla&s

DNA

ddi

leamm

gmbir adalah daun

ntda

dalm kondisi

egd,

dm jusa daun yans disimpu

I

Ddi

25

pider

{opson)

RAPD

ymg

dheleksi,

24

pnner

.1mpu nenghdilkm produt PCR denge

kis.fu

ot!r!

$lu smpai lina naemcn.

5.2. Srrcn

tlnruh

fr.ndapa&

hasil

yus

optnnal dalan

isoldi

DNA

llnanu

_Banbn

dismkan

mtuk memald

ptu$lol

isol4i

DNA

ydg

diprkenalkr

olch

Doyle and Doyle. (1990).

Rerdaqk

karalterislik junlah Fasnen dm tenrudaha skorin8 pDdut

PCR

ydg

diperoleh, maka priner-priner OPN-06, OPA'09, OPE 18.

OPw-02. OPY-08

disants

uotuk disunJ(o dalm

o,lisis

k€ked6.h

tdmd

Seldjuhya

untnk meni.skalkan

altenatif

pilihan primer

yans

dapal

disbakm

nal€

disanlm

nnlul

ndalulm

seleksi priner IIAPD ymg

(6)

A.letula.

o.A

2006.

Gseric

dile*itt

ol

Cal,J'.,n

usine

Rsdon

Amplified Pollrrorphic DNAS.

Alii@

Joumal oa Biolecnnoioey 5i I 20- 122

An Michiels,

w.

van den Ende, M. Tucker,

L.

vrn

tuel, md

AVd

laere,2003

Exlrlion

oi

hish quolity _Benomic

DNA frcm

latex-onlai.ina pldls.

nalil|cal Biochenislrr.(ll5) 85-89

Bennet,

J

1991. Maps

dd

Mdk.s

In

Ocnon

Workshop Hmdbook. Cmt

rl

Rcsctrch

lndonesir l4-16 Ju.i 1991.IRRL

Msila

Daswir

dd

I.

Kusuma. 1993. Sisten .i\aha

CMbir

di

S"natera Barat. Media

komudkdi

penelilim

dm

pengenbosan

llnman indutri

no

11. Puel

pcnclitid

dd

pcneembansan

llnme

indusrri

badm

pencliri

de

pengedbdeM p.nanian. Dcpan.ne.

Pcneid:68

74

Denid, ,4

dd

A.Fiani, I 994. Karakrcrisitik

iorlologi

bebedpa

n.nor

idahln

gdnbir

PrcsidinEsenim penelilid

ranlno

renrpdr dan obai. Sub. Balitro Solot no

Doyle. J.J. md J.L.Doylc. 1990. lelaslion of Plmt DN,{ lrom rrcsn rissuc. locus (12)i

ll

l5

El-Mez}l,

A,, Dreyer, F., Jscobs, G., Jung,

C

(2002). Hi8hjesolution mapping ofihe boltinsgeneB ofsusarbeel.

Tre.t

Appl Ceh.l \05:100-tAs

rrauz.

ll..

2005.

Ambjl

(.Uhcaria

aznbir

(Huntct

Roxb).

Dald:

Raih,ki-.,Haguddin, Elfis, P. Hidayat. ,1. Sugiymto,

dd

Z.

Slsil

{Fns.) Kondisi

Beber4a Plam! Ndllah Konodni PenanilD Penlins

Dewe

Ini. PPS Unpad

KNPN Lilbans Deptan.: 167-186

lladi. Nlifi.chul dan lka Nurlaila,046 Solitot don DN,1

hipl/*||e

na

.

lipi

s.

id

Herero. R.

MJ

Asis. J.A. Pim. E.A. Cdboncll Md l.

Navdr,

1996 Cnetic divesity in tnc otuCe subfmily ,^uimlioidero

II

Genedc rel aliotrshi ps a m ons _senera

adspccies Theor /1ppl. Aeret. (91): 1327-1334