x
RINGKASAN
Keanekaragaman genetik merupakan hal penting untuk menjaga kelestarian jangka panjang bagi sebuah spesies bahkan suatu populasi. Penelitian ini ditujukan untuk mengungkap keanekaragaman genetik pada populasi Mystus nigriceps di DAS Serayu. Sejumlah 10 sampel insang dikoleksi sebagai sumber DNA. Genom DNA diisolasi dengan metode Chelex 5%. Lokus RAPD (Random Amplyfied Pholymorphic DNA) diamplifikasi dengan teknik PCR (Polymerase Chain Reaction) sebanyak 45 siklus dengan suhu anneling 45oC. Hasil penelitian menunjukkan dari 10 primer yang digunakan, 3 primer dapat mengamplifikasi marka RAPD. Ukuran berkisar 931 bp sampai 1482 bp. Heterozigositas lokus RAPD Mystus nigriceps di DAS Serayu sebesar 38 % (0.38). Dari hasil penelitian dapat disimpulkan bahwa nilai keanekaragaman genetik M. nigricep di DAS Serayu tergolong rendah.
Kata Kunci : Mystus nigriceps, keanekaragaman genetik, Chelex 5%, DAS Serayu, PCR, RAPD
xi
SUMMARY
Genetic diversity is important for long-term preservation of a species even a population. This study aimed to uncover the genetic diversity in the population of Mystus nigriceps in the Serayu watershed. A number of 10 samples were collected as a source of gills DNA. Genome DNA was isolated by 5% Chelex method. RAPD Loci (Random Amplyfied Pholymorphic DNA) were amplified by PCR (Polymerase Chain Reaction). 3 out of 10 primers could amplify RAPD markers. The fraghmens ranged from 931 bp to 1482 bp. RAPD loci heterozygosity of M. nigriceps in Serayu watershed was 38% (0.38). It could be concluded that the value of genetic diversity in Serayu watershed of M. nigricep wos low.
Keywords: Mystus nigriceps, genetic diversity, Chelex 5%, Serayu watershed, PCR, RAPD.
