Inkscape で線と円を作成する方法。ユーザーが作成したマップを使用して分析を実行できます。ユーザー マップを使用すると、より効果的なデータ プレゼンテーションを作成できます。本書では、KaPPA-View4に読み込む代謝マップの作成方法について説明します。
Inkscape は、Macintosh または Linux で地図を作成しながら、SVG を使用して地図を作成できるツールです。Inkscape の対応する機能をお読みください。 「完了」ボタンをクリックして Inkscape を起動します。
ここにリストされている設定は、Inkscape 画面からオンまたはオフにすることもできます。
ファイルの作成と保存
作成したSVGマップを保存するには、<ファイル>→<名前を付けて保存>を選択し、適当な名前を付けて保存します。このとき、ファイル形式は「Plain SVG」または「Inkscape SVG」を選択します。
オブジェクトの作成と ID の付加
ストロークと塗りつぶしの色を設定するには、Inkscape メニューの <オブジェクト> → <塗りつぶし/ を選択すると、ストロークの先端の形状を設定できます。ただし、以下の画像のように、属性リストから「id」を選択すると、画面右下に現在の設定値が表示されます。
ここで、下図の赤枠部分に値を入力して「設定」ボタンを押すと、その値がidに代入されます。このようにして、オブジェクトの ID を設定できます。グループオブジェクトのIDを設定してください。
3) IDを入力後、「設定」ボタンを押して確定します。 "機関"。
各マップオブジェクトの作成
KaPPA-View4システムで使用する遺伝子オブジェクトID 文字列+(整数)_g部分 遺伝子ID の形式に従って、遺伝子を表す長方形のオブジェクトにIDを付与してください。
KaPPA-View4 システムでは、遺伝子ボックス領域にすべてのシンボルを描画したくない場合、遺伝子ボックス ID とそれに対応する遺伝子 ID がユニバーサルモードで表示されます。 1.
遺伝子に従って描画する 長方形または正方形作成ツールを使用して遺伝子ボックスのオブジェクトを作成します ( 1) ツールで長方形のオブジェクトを作成します。
注:上図の□はKaPPA-View4で表示した場合のイメージです。遺伝子ボックス作成時に描く必要はありません。
ジーンボックスオブジェクトID形式 B+数字 キャンバス上にグリッド線が表示されます。 4) 2 つのオブジェクトをグループ化します。
以下の形式に従って、結合したオブジェクトに酵素反応オブジェクトIDを追加します。
その他のオブジェクト
、B のオブジェクトは A に従って色分けされていません。KaPPA-View4 はマップのデフォルト フォントとして Arial を使用します。 Arial を使用すると、Inkscape で作成した画像が KaPPA-View4 にも表示されるため、キャラクターの描画にはできるだけ Arial を使用してください。ユーザー カードで Arial 以外のフォントが使用されている場合、それらはユーザー カードを作成した PC にインストールされているフォントと同じです。
KaPPA-View4でもほぼ同様の画像が表示されます。ただし、ユーザーカードをKaPPA-View管理者に送付する際は、必ず文字をアウトライン化してください。実際に「ユーザーカードの動作確認」の方法でKaPPA-View4にアップロードしてみます。
デフォルトのKaPPA-View4マップには、線オブジェクトで表現された点線と、線オブジェクトで表現された点線が含まれています。次に、以下に示すように、表示されたボタンの 1 つをドラッグしてオブジェクトを拡大してみます。
すると、キャンバスの左上に黒い丸が表示されます。満足のいくユーザー マップが完成したら、それを使用して効率的に分析を進めます。ユーザーが作成したマップが KaPPA-View4 でどのように表示され、機能するかを確認する最も簡単かつ効率的な方法は、ファイルを KaPPA-View4 にアップロードしてみることです。
KaPPA-View4のWebサイトにアクセスします。パワーユーザーの場合は、作成したユーザーカードをKaPPA-View4サーバーに保存してください。
説明 KPC+ 番号は、KaPPA-View4 システムで使用される複合 ID です。