BAB IV. HASIL
A. Hasil Filogeni
A.1. Topologi Pohon Filogeni Famili Stichopodidae
Matriks Tabel 3 merupakan kumpulan sejumlah 78 karakter dan status karakter. Asumsi evolusinya adalah 0 (paling primitif) dan 3 (paling maju). Sedangkan kode minus (-) ditujukan untuk karakter yang hilang. Berdasarkan Tabel 3 tersebut, karakter yang memiliki status karakter binominal (0 dan 1) terdapat kurang lebih 70%. Taksa yang memiliki karakter yang hilang (-) pada hasil pengamatan studi ini terdapat kurang lebih 30%.
Tabel 3. Matriks karakter morfologi Stichopodidae. Hilangnya karakter tertentu ditandai dengan ‘-‘ Spesies 1-10 11-20 21-30 31-40 A.lecanora 0200001010 00020111-- --1000--00 11----0--- H.scabra 0200001000 0002001011 000-00--00 0011000--- S.chloronotus 1211111001 1110100020 111100--10 1020113222 S.herrmanni 1111111001 0110100011 111100--20 1011110--- S.horrens 1211111001 0110000010 111100--10 1010111011 S.pseudohorrens 1111111001 1110010010 111110--10 1010111011 S.quadrifasciatus 1211111001 1110000021 111120--20 1021112200 S.vastus 1111111001 1110110021 111120--10 1021110--- T.ananas 1001211001 10111001-- --0-010201 11----0--- T.anax 1001111001 10110101-- --0-010201 11----0--- T.rubralienata 1101111021 10110101-- --0-010202 11----0--- Spesies 41-50 51-60 61-70 71-78 A.lecanora 01000--000 11----0--- 1000--0100 11010000 H.scabra 00-0110000 0011000--- 0-01100101 01010000 S.chloronotus 0110120100 1021113203 1101201110 11310010 S.herrmanni 0110120200 1021113222 1101202110 11010010 S.horrens 0110120100 1021110--- 1101201110 11310110 S.pseudohorrens 0111120110 1010110--- 1111201110 10311110 S.quadrifasciatus 0112120210 1011113202 1121202110 10210010 S.vastus 0112120100 1011113223 1121201110 11010010 T.ananas 10-0102011 11----0--- 0-01020101 11010201 T.anax 10-0102001 11----0--- 0-01020101 11010201 T.rubralienata 10-0102002 11----0--- 0-01020102 11010202
Keterangan: Judul kolom 1 sampai 78 adalah nomor karakter morfologi yang diamati. Angka di dalam tabel (0, 1, 2, 3) merupakan status karakter berdasarkan asumsi perubahan evolusinya dengan peringkat 0 (paling primitif) sampai 3 (paling maju).
22
Matriks Tabel 3 ini digunakan sebagai input data untuk filogeni yang hasilnya ditunjukkan pada Gambar 7. Analis dengan program PAUP terhadap matriks tersebut menghasilkan dua pohon filogeni yang paling parsimony
(Gambar 7A dan 7B). Nilai indeks topologi pohon adalah CI (consistency index) = 0.7480; HI (homoplasy index) = 0.2520; RI (retention index) = 0.7328; RC
(rescaled consistency index) = 0.5481. Jumlah karakter yang informatif adalah 47
karakter, sedangkan karakter lainnya yang berjumlah 31 merupakan karakter yang tidak informatif.
Karakter turunan atau apomorf yang berbagi dalam genus Thelenota
(synapomorf) berjumlah enam karakter. Keenam karakter tersebut adalah bentuk madreporit oval (karakter 141), memiliki spikula tipe batang pada dinding tubuh (karakter 261), spikula batang dikotom pada dinding tubuh, papila dorsal, kaki tabung, tentakel (karakter 472, 662, 762) dan spikula meja semu pada papila dorsal (karakter 411).
Karakter synapomorf yang dimiliki genus Stichopus berjumlah enam, yaitu susunan papila dorsal padat dalam dua baris (karakter 31), tonjolan posterior cincin kapur bagian radial yang meruncing (karakter 121), spikula batang yang memiliki lubang ditengah pada papila dorsal, kaki tabung (karakter 462, 652),
Gambar 7. Perbandingan pohon filogeni 1 (A) dan pohon filogeni 2 (B) hasil dari analisi
maximum-parsimony menggunakan program PAUP pada timun laut Famili Stichopodidae. Angka diatas tiap cabang merupakan nilai bootstrap & angka dibawah percabangan adalah nomor karakter berdasarkan Tabel 2.
23
spikula lempeng memanjang pada kaki tabung (karakter 691) dan spikula batang masif pada tentakel (karakter 771).
Karakter synapomorf yang dimiliki dalam rumpun S. horrens dan S.
pseudohorrens adalah spikula meja ireguler berbentuk tack-like pada papila dorsal
(karakter 371), spikula meja ireguler dengan barisan lubang tepi piringan yang lebih dari satu baris pada papila dorsal (karakter 380), spikula batang yang bercabang tidak dikotom pada tentakel (karakter 761).
Karakter tidak informatif yang dimiliki keenam spesies dalam genus
Stichopus adalah 10 karakter. Karakter tersebut sebagian besar dari karakter
spikula, diantaranya adalah spikula batang C & S yang bervariasi ukurannya pada dinding tubuh, papila dorsal dan kaki tabung (karakter 292, 482, 672), spikula meja ireguler dengan tiang tereduksi pada kaki tabung (karakter 592), spikula meja reguler pada tentakel (karakter 721), spikula tipe lempeng ireguler pada papila dorsal (karakter 491). Karakter yang tidak informatif pada morfologi eksternal dan organ internal antara lain ukuran maksimal tubuh yang berukuran sedang (karakter 21), polian vesikel yang berjumlah satu (karakter 150), ukuran polian vesikel yang pendek (karakter 161), perbandingan panjang area cincin kapur antara radial dan interadial yang sama (karakter 110).
A.2. Karakter Autapomorf pada spesies anggota genus Thelenota dan Stichopus
Karakter turunan yang hanya dimiliki oleh satu spesies (autapomorf) adalah
T. ananas dan T. rubralienata. Karakter autapomorf pada T. ananas adalah
tuberkel yang bercabang (karakter 52). T. rubralienata memiliki lima karakter autapomorf, yaitu terdapat tuberkel disekeliling anus (karakter 92), spikula bentuk butir yang seperti cacing pada dinding tubuh, papila dorsal dan tentakel (karakter 302, 502, 702, 782).
Spesies yang memiliki karakter autapomorf dalam genus Stichopus adalah empat spesies, yaitu S. chloronotus, S. pseudohorrens, S. quadrifasciatus dan S.
vastus. S. chloronotus memiliki lima karakter autapomorf, yaitu spikula meja
reguler yang lubang tepi piringan kurang dari satu pada dinding tubuh dan papila dorsal (karakter 192, 332), spikula meja ireguler yang tereduksi dengan tiang dan
24
juga mahkota pada papila dorsal (karakter 373, 392, 402). S. pseudohorrens
memiliki enam karakter yang autapomorf, yaitu spikula mawar ireguler yang seperti batang pada dinding tubuh, papila dorsal dan kaki tabung (karakter 251, 441, 631), spikula meja reguler yang lubang tepi piringan satu baris pada kaki tabung (karakter 531), spikula meja reguler dengan tiang tinggi pada kaki tabung (karakter 540), spikula batang yang berlubang di ujung dan tengah pada tentakel (karakter 751). S. quadrifasciatus memiliki dua karakter yang autapomorf, yaitu spikula meja ireguler yang bermahkota kecil pada papila dorsal dan tentakel (karakter 372, 732). S. vastus memiliki satu karakter yang autapomorf, yaitu spikula meja ireguler yang tanpa mahkota pada kaki tabung (karakter 603).
A.3. Kunci Identifikasi
Di bawah ini adalah kunci identifikasi yang dapat dibuat berdasarkan karakter synapomorf dan autapomorf yang diperoleh dari pohon filogeni 1 (Gambar 7A).
1a. Bentuk penampang tubuh silindris, tanpa tuberkel, susunan kaki tabung menyebar, memiliki organ cuvier ……….………...… Famili Holothuriidae 1b. Bentuk penampang tubuh persegi, memiliki tuberkel, susunan kaki tabung
dalam tiga baris, tanpa organ cuvier …..……...…. Famili Stichopodidae (2) 2a. Bentuk madreporit oval, tonjolan posterior tumpul pada cincin kapur radial,
spikula batang bercabang dikotom pada seluruh bagian tubuh, spikula meja semu pada papila dorsal, tanpa spikula meja masif, tanpa lempeng ireguler ……….………... genus Thelenota (3) 2b. Bentuk madreporit bulat, tonjolan posterior runcing pada cincin kapur radial,
tanpa spikula batang bercabang dikotom, tanpa spikula meja semu, memiliki spikula meja masif pada tentakel, memiliki spikula lempeng ireguler pada papila dorsal ……….………….…….………..… genus Stichopus (5) 3a. Polian vesikel pendek dan jumlah lebih dari satu, tuberkel tidak
bercabang………..………. (4) 3b. Polian vesikel panjang dan jumlah satu, tuberkel bercabang
………... Thelenota ananas
25
4b. Spikula bentuk butir bulat …….……….………..… T. anax 5a. Lubang tepi piringan spikula meja reguler dalam satu baris pada kaki tabung,
spikula mawar ireguler seperti lempeng pada papila dorsal ……….... (6) 5a. Lubang tepi piringan spikula meja reguler lebih dari satu baris pada kaki
tabung, tanpa spikula mawar ireguler seperti lempeng pada papila dorsal ...……….……….... (7) 6a. Spikula meja ireguler dengan mahkota kecil pada papila dorsal dan tentakel
……….……… Stichopus quadrifasciatus 6b. Spikula meja ireguler tanpa mahkota pada kaki tabung ……....……. S. vastus 7a. Spikula meja reguler dengan tiang tinggi pada dinding tubuh dan papila
dorsal ………...………. (8) 7b. Spikula meja reguler tanpa tiang tinggi ……….……. S. herrmanni 8a. Spikula meja ireguler dengan tack-like dan lubang tepi piringan meja ireguler
yang lebih dari satu baris pada papila dorsal, spikula batang bercabang pada tentakel ……….……… (9) 8b. Spikula meja ireguler yang tereduksi tiang dan mahkotanya pada papila dorsal,
spikula meja reguler yang lubang tepi piringan kurang dari satu pada dinding tubuh dan papila dorsal ………. S. chloronotus 9a. Spikula meja reguler yang lubang tepi piringan lebih dari satu dan tiang tinggi
pada kaki tabung, spikula mawar ireguler yang seperti batang pada dinding tubuh, papila dorsal dan kaki tabung, spikula batang berlubang diujung dan tengah pada tentakel ……….… S. pseudohorrens 9b. Spikula tanpa meja reguler yang lubang tepi piringan lebih dari satu baris dan tiang tinggi, tanpa spikula mawar ireguler, tanpa spikula batang berlubang pada tentakel ……… S. horrens
B. Hasil penentuan karakter spesimen Famili Stichopodidae