Robert
K. Murroy,
MD,
PhDPENDAHULUAN
Biokimia
dapat didefinisikan
sebagaiilmu
pengetahuan tentang dasarkimiawi
hehidupan(Yn
bios "kehidupan"). Sel adalahunit
struktural makhluk hidup. Oleh karena itu,biokimia
juga
dapatdiartikan
sebagaiilmu
pengetahuan tentang konstituenkimiawi
sel hidup serta reaksi dan prosesyang dialami
honstituen-honstituen tersebut. Berdasarkan definisiini,
biokimia mencakup bidangbiologi
sel,biologi
molekular,
dan genetika molekular.Tuiuon
Biokimiq odoloh
Menieloskon
don
Menerqngkon
Semuq
Proses
Kimiqwi
Sel
Hidup
dqlqm lsfilqh Molekulor
Tirjuan
utamabiokimia
adalah pemahaman menyeluruhatas semua proses kimiawi yang berkaitan dengan sel hidup pada
tingkat
molekular.lJntuk
mencapaitujuan
ini,
paraahli
biokimia
berupaya
mengisolasiberbagai
molekul yang terdapatdi
dalam sel, menentukan strukturnya, dan menganalisis fungsi molekul-molekul tersebut. Banyak tekniktelah
digunakanuntuk
tujuan
ini;
beberapa diantaranya diringkas pada Tabel l -l.
Pengetohuon
Tentqng
Biokimio
Penting
bogi
Semuo
llmu
Pengetohuon
nentong Kehidupon
Biokimia
asam
nukleat terletak
di
jantung
genetika;sebaliknya,
penggunaanpendekatan
genetik
sangatlah penting untuk menguraikan berbagai aspek dalam biokimia.Fisiologi
(ilmu faal), yaitu suatuilmu
tentang fungsi tubuh,hampir
seluruhnya bertumpangtindih
dengan biokimia.Imunologi
menggunakan berbagaiteknik
biokimia,
dan berbagai pendekatanimunologik telah
digunakan secaraluas
oleh
paraahli
biokimia. Farmakologi dan
farmasibergantung
pada
pengetahuan
yang
kokoh
tentangbiokimia
dan fisiologi; secara khusus, sebagian besar obat dimetabolismeoleh
reaksiyang
dikatalisisoleh
enzim. Racun bekerja pada reaksi atau proses biokimia;ini
adalah pokok bahasan dalamtoksikologi.
Pendekatan biokimiawikini
semakin sering digunakanuntuk
mempelajariaspek-aspek dasar
patologi (ilmu
tentangpenyakit),
misalnya peradangan, cedera sel, dan kanker. Sebagian besar peneliti di bidangmikrobiologi,
zoologi, danbotani
menggunakan pendekatan biokimiawi hampir secara eksklusif, Hubunganini
tidaklah mengejutkan karena seperti yangkita
ketahui, kehidupan bergantung pada reaksidan
proses biokimia. Bahkan, tembok penghalang lamadi
antara berbagaiilmu
pengetahuankehidupan
(life
sciences)kini
telah
runtuh,dan biokimia
semakin sering digunakan sebagai "bahasa' pemefsatu.Hubungon Timbol Bolik
Anrorq
Biokimiq
& llmu
Kedokterqn
Teloh
Merongsong
Kemoiuon
yqng
Soling Menguntungkon
Dua hal utama yang sangat diperhatikan oleh para peneliti
dalam
ilmu
kesehatan-dan terutama
dokter-adalah
pemahaman
dan
pemeliharaannya
kesehatan
sertapemahaman
dan
terapiefektif untuk penyakit.
Biokimia berdampak besar pada kedua hal yang menjadi perhatian utamadunia
kedokteranini.
Bahkan, hubungan timbal-balik biokimia danilmu
kedokteran adalah suatu jalur lebar dalam dua-arah. Studibiokimia
telah memperjelas banyak aspek kesehatandan
penyakit, dan sebaliknya, penelitiantentang
berbagai aspekdalam
kesehatandan
penyakit telah membuka bidang baru dalam biokimia. Contoh jalur dua-arahini
diperlihatkan
di
Gambar
1-1.
Contohnya, pengetahuan tentang struktur dan fungsi protein diperlukanuntuk
menguraikansatu
perbedaanbiokimiawi
antara hemoglobin normal dan hemoglobin sel sabit.Di
pihak lain, analisis terhadap hemoglobin sel sabit berperan besar dalam pemahamankita
tentangstruktur
dan fungsi hemoglobin normal dan proteinlain. Contoh
analog tentang manfaattimbal-balik
antarabiokimia dan
ilmu
kedokteran dapatdikutip untuk
pasangan-pasanganyang diperlihatkan
di Gambar 1- 1 . Contoh iain adalah karya terobosan ArchibaldGarrod, seorang
doktei
di
Inggris pada awaltahun
1900-an.
Ia
meneliti
pasien dengan sejumlahpenyakit
yang/
BAB 1: BIOKIMIA & ILMU KEDOKTERANrSebagian besar metode ini cocok untuk menganalisis l<omponen-komponen yang ada di homogenat sel dan preparat biokimia lainnya. Pcmakaian beberapa teknik secara berurutan biasanya dapat memurnikan sebagian besar biomolekul. Pembaca dipersilakan melihat ke buku-buku tcks mengenai nretode risel biokimiJ unluk r;nr i.lnnyd.
seianjutnya)
dan
memastikanbahwa
penyakit-penyakitini
ditentukan secara genetik. Garrod menyebut penyakit-penyakitini
sebagaiinborn
er"rors of metltbolism (kelainan metabolisme bawaan). Pemahamannya menjadi dasar bagi berkembangnya bidang gelletika biokimia manusia. Upaya-upayaterkini untuk
memahami dasarpenyakit
genetikyang dikenal
sebagaihiperkolesterolemia
familial
yang menyebabkan aterosklerosis berat pada usia dini, mendorongterjadinya kemajuan pesat
dalam
pemahaman tentang reseptor sel dan mekanisme penyerapan kolesterol oleh se1.Berbagai penelitian tentang onkogen pada se1 kanker telah
mengarahkan perhatian pada mekanisme molekular yang berperan
dalam
pengendalianpertlimbuhan sel
normal. Contohini
dan banyak contoh lain menekankan bagaimana penelitian terrtan g penyakit.dapa+merir$ Lika area baru fungsisel bagi riset biokimia dasar.
Hubungan antara
ilmu
kedokteran
dan
biokimiamemiiiki
dampakpenting bagi
ilmu
kedokteran. Selamaterapi
medis
memiliki
dasarbiokimia dan
ilmu
dasarlainnya yang kuat, prakdk kedokteran akan
memiliki
dasarrasional yang dapat diadaptasikan
untuk
mengakomodasi pengetahuan baru.Hal ini
berbedadari praktik
kesehatan nonortodoks dan paling tidak sebagian praktik "kedokteranalternatif"
yang sering didasarkan pada hal-hal yang ddaklebih dari
mitos dan
kepercayaan sertaumumnya
tidakmemiliki
dasar intelektual apapun.PROSES
BIOKIMIA NORMAI
ADALAhI DASAR
KESEHATAN
\florld
Health
Organization
(VT{O)
mendefinisikankesehatan sebagai "keadaan sejahtera fisik, mental, dan sosial
yang sempurna dan bukan sekadar tidak adanya penyakit dan kecacatan". Dari sudut pandang biokimia semata, kesehatan dapat dianggap sebagai situasi ketika semua reaksi intra- dan ekstrasel yang terjadi
di
dalamtubuh
berlangsung dengan kecepatanyang
seimbangdengan
kelangsungan hidupmaksimal
organismedalam
keadaanfisiologis.
Namun,ini
adaiah pandangan yang sangat sempit, dan seyogianya men.jadi jelas bahwa merawat kesehatan pasien memerlukantidak
saia pengetahuan yang iuas tentang prinsip-prinsip biologis, tetapi juga prinsip-prinsip psikolog is dan sosial.Riset
Biokimio
Berdompok Podq Nutrisi
& llmu
Kedokteron
Pencegohon
Salah satu prasyarat penting
untuk
memelihara kesehatan adalah terdapatnya asupanoptimal
sejumlah bahan kimia melalui makanan; yang utamadari
bahan-bahan tersebutadalah
vitamin,
asarn arnino tertentu' asam
lemaktertentu,
berbagaimineral,
dan
air.
Karena banyak dari pokok bahasan dalam biokimia dan nutrisi berkaitan dengan studi tentang berbagai aspek bahan-bahankimia ini,
kedua cabangilmu
pengetahuanini
berkaitan erat. Selainitu,
saatini
banyak ditekankan tentang pendekatan sistematisuntuk
mempertahankan kesehatan dan mencegah penyakit, yi, padailnu
kedokteran pencegahan. Oleh karena itu, kini banyakditekankan pendekatan
nutrisional dalam
pencegahan berbagai penyakit, contohnya pencegahan aterosklerosis dan kanker.Untuk
memahaminutrisi
diperlukan pengetahuan yang luas tenrang biokimia.Sebcgion
Besqr
& Mungkin
Semuo
Penyokir
Memiliki
Dqsor
Biokimiq
Kita
percayabahwa
sebagian besar(jika tidak
semua)BAB 1: BIOKIMIA & ILMU KEDOKTERAN
Gambar
/'1.
contoh jalur dua-arah yang menghubungkan biokimia dan ilmu kedokteran. Pengetahuan tentang molekul-molekul biokimia yang diperlihatkandi
bagian atas diagramtelah memperjelas pemahaman kita tentang penyakit yang diperlihatkan
di
separuh bagian bawah diagram-dan sebaliknya, analisis terhadap penyakit-penyakit yang diperlihatkan dibagian bawah memberikan kejelasan pada banyak bidang dalam biokimia. Perhatikan bahwa anemia sel sabit adalah suatu penyakit genetik dan bahwa baik aterosklerosis mauDun diabetes
melitus memiliki komponen genetik.
berperan menyebabkan penyakit pada hewan dan manusia dicantumkan di Thbel 1-2. Semua faktor tersebut mengenai satu atau lebih real<si kimia atau molekul pendng
di
dalam rubuh. Di dalam buku ini akan dijumpai banyakcontoh dasarbiokimiawi penyakit. Pada sebagian besar penyakit tersebut, studi tentang
biokimia
ikut
berperan dalam diagnosis dan pengobatan. Sebagian penggunaan hasil penelitian biokimiadan
pemeriksaanlaboratorium dalam
kaitannya dengan penyakit diringkaskan di Thbel 1-3.Contoh
lain
dari
beragam penggunaan tersebut akan ditemukan di berbagai bagian bukuini.
Dompok
Human
Genome
Proiect (HGP)
pqdo Biokimio dqn llmu
Kedokterqn
Pada akhir tahun 1990-an tercapai banyak kemajuan besar
dalam penentuan sekuens genom manusia. Kemajuan
ini
Tahel 1-2. Kausa utama
penyakit.
Semua kausa yangtercantum bekerja dengan memengaruhi
berbagai mekanismebiokimia di
sel ataudi
tubuh.
rDiadaptasi, dengan izin, dari Robbins 51, Cotram RS, Kumar V. Ihe Pathok:gic Basis ofDlsease, 3d ed. Saunders, 1 984. Copyright O I 984 Elsevier lnc. Dicetak ulang dengan izin dari Elsevier,
memuncak pada bulan
Juli
2000, saar para pemimpin dari dua kelompok yang terlibat dalam upayaini
(InternationalTabel
'l-3.
Beberapa penggunaanpenelitian
biokimia
dan
uji
laboratorium dalam kaitannya
denganpenyakit
/
BAB 1: BIOKIMIA & ILMU KEDOKTERANHuman Genome Sequencing Consortium dan Celera Genomics,
sebuah perusahaan swasta) mengumumkan bahwa lebih
dari
90o/o genomtelah diketahui
sekuensnya. Yersi drafi dari sekuens tersebut telah dipublikasikan pada awal tahun2001.
Dengan
pengecualianpada
beberapa perbedaan, sekuens genom manusia keseluruhan diketahui secaraleng-kap
padatahun 2003,
50
tahun
setelah penjelasan sifatDNA
yang beruntai-ganda oleh \Tatson dan Crick. Dampak kemajuan ini pada biokimia, seluruh cabang biologi, dan ilmu kedokteran sangatlah besar,dan
hanya beberapahal
yang dikemukakandi
sini. Banyak gen yang semula tidak dikenalkini
terungkap; berbagai produk proteinnya perlu diketahui karakteristiknya. Banyak hal dalam evolusi manusia kini mulai menjadi lebih jelas, dan prosedur-prosedur untuk menelusuri gen penyakit telah semakin sempurna. Hasil-hasilnya berefek besar pada berbagai bidang seperti proteomlka (proteomics),bioinformatika, bioteknologi, dan farmakog enornlka Qt h
arma-cogenomics). Referensi
mengenai
genom
manusia
akanditemukan di berbagai bagian buku ini.
RINGKASAN
.
Biokimia
adalah
ilmu
pengetahuanyang
meneliti berbagaimolekul yang
terdapat
di
sel hidup
danorganisme
serta
realai-reaksi
biokimianya.
Karenakehidupan
bergantungpada
reaksi-reaksi biokimia,biokimia
telah menjadi bahasa dasar bagi semuailmu
pengerahuan hayati..
Biokimia
berkaitan dengan semua bentuk kehidupan,dari
virus
dan bakteri yang relatif
sederhana hingga manusia yang kompleks..
Biokimia dan ilmu kedokteran berkaitan erat. Kesehatan bergantung pada keseimbangan harmonis reaksi-reaksibiokimia
yangterjadi
di
dalamtubuh, dan
penyakit mencerminkan kelainanbiomolekul,
reaksi biokimia, atau proses biokimia..
Kemajuandalam bidang
biokimia telah
menerangi berbagai bidang ilmu kedokteran. Sebaliknya, penelitian tentang penyakit sering mengungkapkan aspek-aspekbiokimia yang sebelumnya
tidak
diketahui. Penentuan sekuensgenom
manusia,yang
hampir
tuntas,
akanmemberi
dampak besar pada semuabidang
biologi, termasuk biokimia, bioinformatika, dan bioteknologi..
Pendekatanbiokimiawi
seringmenjadi
dasaruntuk
memperjelas kausapenyakit
dan
dalam
merancang terapi yang sesuai..
Pemakaian bijalaana berbagai pemeriksaan laboratorium biokimia adalah komponen integral dari diagnosis dan pemantauan terapi..
Pengetahuan yangbaik
tentangbiokimia
dan disiplindasar terkait lainnya merupakan hal esensial bagi praktik rasional
ilmu
kedokterandan
ilmu
kesehatan terkait lainnya..
Hasil Human
Genome Project akan berpengaruh besarpada masa depan
ilmu
kedokteran danilmu
kesehatan lainnya.REFERENSI
Burtis CA, Ashwood ER: Tietz Fundamentals of Clinical Chemistrl,
5thed. Saunders, 2001.
Encychpedia of Life Sciences. John \ili'iley, 2001. (Mengandung
sekitar 3.000 artikel komprehensif tentang berbagai aspek ilmu pengetahuan kehidupan' Dapat diakses online
di
www. els.net melalui perpustakaan dengan berlangganan.)Fruton JS. Proteins, Enzymes, Genet: The Interplay of Chemisry and Biologl. Yale Univ Press, 1999. (Menyajikan latar beiakang
sejarah dari banyak riset biokimia saat ini.)
Garrod AE. Inborn errors
of
metabolism. (Croonian Lectures.)Lancet 1908;2:
l,
73, 142, 21.4.Guttmacher AE, Collins FS: Genomic
medicine-A
Primer. NEngl J Med 2002;347:1512. (Artikel ini adalah yang Pertama
dari rangkaian sebelas artikel bulanan yang diterbitkan di New
England Journal of Medicine yang menjelaskan berbagai aspek
mengenai kedokteran genomik.)
Kornberg
A:
Basic researchr The lifeline of medicine. FASEB J 1992;6:3143.Kornberg
A:
Centenaryof
thebirth
of
modern biochemistry.FASEBJ 1997;11:1209.
McKusick YA: Mendelian Inheritance in Man. Catalogs of Human
Genes and Genetic Disord.ers,
l2th
ed. Johns Hopkins Univ Press, 1998 [DisingkatMIM]
Online Mendelian Inheritance
in
Man (OMIM):
Center for Medical Genetics, Johns Hopkins University and National Center for Biotechnology Information. National Library of Medicine, 1997 . http: I I www.ncbi.nlm.nih.gov/onim/(Angka-angka yang mengacu kepada berbagai data
di
dalamMIM
danOMIM
akan dikutipdi
beberapa bab dari karyaini. Dengan melihat koleksi penyakit yang luas dan data lain
yang relevan-enzim, protein spesifik, dsb-pengetahuan dan
pemahaman pembaca mengenai berbagai topik yang dirujuk
dan dibahas di buku ini akan sangat meningkat.Yersi online'
nya diperbarui hampir setiap hari.)