PENDUGAAN PARAMETER GENETIK MODEL CAMPURAN
DATA TAK
-
SEIMBANG
Oleh :
JERRY F. SALAMENA
97128 1 STKPROGRAM STUD1 STATISTIKA
PROGRAM PASCASARJANA
INSITUT PERTANIAN BOGOR
RINGKASAN
JERRY F. SALAMENA. Pendugaan Parameter Genetik Model Campuran Data Tak- Seimbang. Dibimbing oleh Dr. Ir. M. SJARKANT MUSA, Dr. Tr. AHMAD A. MATTJIK dan Dr. Ir. AUNUDDIN.
Heritabilitas merupakan dugaan paling berguna dalam menunjukkan laju perubahan yang dicapai dari seleksi suatu sifat dalam populasi. Metode analisis ragam dapat digunakan untuk menduga heritabilitas apabila tersedia data pengamatan zuriat- zuriat hasil gugus perkawinan suatu rancangan perkawinan. Pendugaan komponen- komponen ragam dari suatu rancangan perkawinan sering diperhadapkan pada faktor pengaruh tetap clan faktor pengaruh acak yang te jadi bersamaan dan bila diterapkan di dalam model linear disebut sebagai model carnpuran (mixed models). Disamping itu, persilangan-persilangan yang terjadi selalu bervariasi sehingga menghasilkan jumlah anak yang tidak sama (unbalanced). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pendugaan parameter genetik hasil susu pada model pengaruh campuran data tak- seimbang dengan pengamatan dulang. Data yang digunakan adalah observasi hasil susu harian dm 95 ekor sapi (D) betina zuriat-zuriat dm 12 pejantan (G). Rancangan perkawinan hidentifikasi sebagai Rancangan Kawin I Comstock-Robinson DIG Tak- Seimbang dengan faktor genetik tetua jantan didentifikasikan sebagai faktor acak dan periode laktasi didentifikasikan sebagai faktor tetap.
Pemeriksaan awal terhadap data menunjukkan adanya keragaman hasil susu zuriat-zuriat tetua jantan. Dari hasil analisis Box-Cox, transformasi akar kuadrat belum mampu menstabilkan ragam, sehingga untuk menstabilkan ragam dilakukan analisis ragam model terboboti. Hasil analisis ragam model terboboti mampu menerangkan keragaman hasil susu sebesar 87.67 % dengan faktor-faktor genotipe pejantan, periode laktasi dan interaksi keduanya berpengaruh nyata terhadap hasil susu zuriat-zuriat tersebut. Hasil lainnya adalah trend rataan hasil susu meningkat dari periode laktasi pertama sampai mencapai puncak pada periode laktasi ketiga dan perlahan-lahan menurun sampai dengan periode laktasi keenam. Disamping itu heritabilitas yang dihasilkan sebesar 1.944 berada diluar selang sebenarnya dan diduga karena adanya keragaman lingkungan yang berbeda untuk kelompok kelompok keluarga yang berbeda dan adanya jumlah cuplikan data yang sedikit.
PENDUGAAN PARAMETER GENETIK MODEL CAMPURAN
DATA TAK
-
SEIMBANG
Oleh :
JERRY F. SALANIENA
97128 1 STK
Tesis Sebagai Salah Satu Syarat Untuk Memperoleh Gelar Magister Sains
Pada
Program Pascasqana Institut Pertanian Bogor
PROGRAM STUD1 STATISTIKA
PROGRAM PASCASARJANA
INSITUT PERTANIAN BOGOR
Judul Thesis : PENDUGAAN PARAMETER GENETIK MODEL CAMPURAN DATA TAK
-
SETMBANGNama Mahasiswa : JERRY FRED SALAMENA Nomor Pokok : 97128.
Program Studi : STATISTIKA
Menyetujui, 1. Komisi Pembimbing
Dr. Ir. M. Siarkani Musa, MS Ketua
Dr. Ir. Ahmad A. Mattiik Anggota
Dr. Ir. ~ u n t h d i n Anggota
2. Ketua Program Studi Statistika
e
RIWAYAT HIDUP
Penulis dilahirkan di kota Ambon Propins1 Maluku pada tanggal 30 Januari 1966, adalah anak kedua dan lima bersaudara dari Bapak Gabriel Salamena serta Ibu Elsina de Fretes. Penulis menikah dengan Ziesma S. Suripatty pada tanggal 16 Juni 1995 dan telah dikaruniai dua orang anak, yakni Fuadiska Salamena dan Fredza Glen Salamena.
Pada tahun 1979 penulis menyelesaikan pendidikan di SD Negeri Teladan Ambon, kemudian pada tahun 1982 menyelesaikan pendidikan di SMP Negeri I1 Ambon, dan pada tahun 1985 menyelesaikan pendidikan di SMA Negeri TI Arnbon. Pada tahun 1985 diterima sebagai mahasiswa Universitas Pammura Arnbon clan tahun 1990 memperoleh gelar Sarjana Peternakan dari Fakultas Pertanian Unpatti.
Sejak bulan September 1997 penulis mengikuti pendidikan Magister Sains pada Program Studi Statistika, Program Pascasqana Institut Pertanian Bogor.
UCAPAN TERIMA KASIH
Segala puji dan syukur penulis panjatkan bag Allah Bapa di Sorga, yang oleh karena rahmat dan anugerahNya, penulis dapat menyelesaikan penelitian ini.
Penulis menyadari bahwa betapa besar bimbingan, arahan dan bantuan yang telah diberikan oleh berbagai pihak selama penulis mernulai penelitian, melaksanakan penelitian bahkan sarnpai dengan penyelesaian penulisan tesis.
Pada kesempatan yang berbahagia ini, dengan segala kerendahan hati penulis ingin menyampaikan penghargaan yang tulus dan terima kasih kepada :
1. Bapak Dr. Ir. M. Sjarkani Musa, MS, Bapak Dr. Ir. Ahrnad A. Matoik dan Bapak Dr. Ir. Aunuddin selaku Komisi Pembimbing, yang telah memberikan birnbingan dan arahan selarna berlangsungnya penelitian bahkan sampai selesainya laporan ini.
2. Ketua Program Studi Statistika Program Pascasarjana IPB beserta staf pengajar yang telah memberikan kesempatan dan birnbingan ilmu pengetahuan kepada penulis selama penulis belajar pada Program Studi Statistika PPs-IPB.
3. Pihak Eastern Indonesian Universities Development Project (EIUDP-CIDA), yang telah memberikan bantuan dana pendidikan secara keseluruhan, sejak penulis mernulai pendidikan pada Program Stud Statistika PPs-IPB sampai selesai.
4. Pihak Balai Penelitian Ternak dan Hijauan Makanan Ternak (BPT-HMT) Baturraden Purwokerto, atas data sekunder yang penulis pergunakan sebagai bahan penelitian.
5 . Ibu Ir. Anneke Anggraeni, MSi, atas data sekunder yang penulis pergunakan sebagai bahan penelitian.
6 . Istri tercinta Ziesma S. Suripatty/Salamena, kedua anak tersayang Fuadiska Salamena dan Fredza Glen Salamena dan adikku yang kukasihi Glen Marthy Salamena (Almarhum) beserta keluarga atas segala pengorbanan, dukungan moril
dan materil serta iringan doa sehingga penulis dapat menyelesaikan studi magister pada Program Studi Statistika PPs-IPB.
7. Semua pihak yang telah bersedia mengorbankan tenaga, pikiran dan waktu untuk membantu penulis selama studi, penelitian dan penyelesaian tesis.
Segala jasa baik BapaWIbu tidak dapat penulis balas, hanya doa yang dapat penulis panjatkan, semoga Allah Bapa senantiasa memberkati BapaWIbu sekalian.
Harapan penulis semoga tulisan ini bermanfaat bagi yang membutuhkannya.
Bogor, Januari 2001 Penulis
KATA PENGANTAR
Thesis ini berjudul : PENDUGAAN PARAMETER GENETIK MODEL
CAMPURAN DATA TAK-SEIMBANG. Thesis ini merupakan laporan hasil penelitian yang disusun sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Magister Sains pada Program Pascasarjana Institut Pertanian Bogor.
Pada bidang pemuliaan temak, pendugaan komponen-komponen ragam dari suatu rancangan perkawinan (matting design) sering diperhadapkan pada faktor pengaruh tetap dan faktor pengaruh acak yang terjadi secara bersamaan. Bila diterapkan di dalam model linear disebut sebagai model campuran (mixed models). Di sisi lain persilangan-persilangan yang terjadi selalu bervariasi sehingga menghasilkan jurnlah anak (data) yang tidak sama (unbalanced). Penelitian ini bertujuan mengaplikasikan suatu metode pendugaan parameter genetik pada data tak- seimbang dari suatu persilangan dengan melibatkan faktor pengaruh tetap dan faktor pengaruh acak. Data sekunder yang digunakan berasal dari Balai Pembibitan Ternak dan Hijauan Makanan Ternak Baturraden, Purwokerto, Jawa Tengah.
Pada kesempatan ini, penulis menyampaikan terima kasih yang tulus kepada Bapak Dr. Ir. M. Sjarkani Musa, MS, sebagai Ketua Komisi Pembimbing serta Bapak Dr. Ir. Ahmad Ansori Mattjik, dan Bapak Dr. Ir. Aunuddin sebagai Anggota Komisi Pembimbing yang telah membimbing penulis dalam menyelesaikan laporan penelitian ini.
Penulis menyadari bahwa thesis ini jauh dan sempurna sehingga saran dan masukan demi perbaikan thesis ini sangatlah penulis harapkan.
Bogor, Januari 2001 Penulis
DAFTAR IS1 Halaman KATA PENGANTAR ... i . . DAFTAR IS1 ... 11 ... DAFTAR TABEL ... 111 DAFTAR GAMBAR ... iv DAFTAR LAMPRAN ... v
1 . Latar Belakang Masalah ... 1
2 . Tuj uan Penelitian ... 1
3 . Kegunaan Penelitian ... I1 . TINJAUAN PUSTAKA ... 2
1 . Produksi Susu ... 2
2 . Analisis Ragam ... 4
3 . Analisis Genetika ... 1 1 I11 . BAHAN DAN METODE ... 13
1 . Data ... 13
2 . Model dan Pendugaan Parameter Model ... 14
3 . Pendugaan Jumlah Kuadrat ... 16 ...
4 . Nilai Harapan Kuadrat Tengah dan Statistik F 17
...
IV . HASIL DAN PEMBAHASAN . . . 21
1 . Pemeriksaan Awal Terhadap Data . . . 21
.
2 Analisis Ragam ... 26
.
3 Komponen Ragam dan Nilai Heritabilitas . . . 31
V . KESlMPULAN DAN SARAN ... 33 1 . Kesimpulan . . . 33
.
2 Saran ... 33
DAFTAR PUSTAKA ... 34