viii
IDENTIFIKASI MUTASI GEN rpoB, katG dan embB PENYEBAB MULTIDRUG RESISTANCE TUBERKULOSIS DI RUMAH SAKIT
UMUM PUSAT (RSUP) HAJI ADAM MALIK
ABSTRAK
Kasus resistensi merupakan kasus yang sejak lama menjadi tantangan dalam program penanggulangan Tuberkulosis (TB) dan pencegahan peningkatan kasus TB resisten obat menjadi prioritas utama. Resistensi mikroba terhadap antibiotik merupakan karakteristik bawaan (innate) Mycobacterium tuberculosis. Hal ini berhubungan dengan mutasi genetik yang terjadi secara alamiah pada sebagian besar populasi M. tuberculosis wild type yaitu antibiotik belum pernah digunakan dan tidak menimbulkan gejala klinis. Adapun tujuan penelitian adalah untuk mengetahui mutasi pada gen M. tuberculosis penyebab resistensi terhadap rifampicin, isoniazid, dan etambutol pada pasien Multidrug Resistance Tuberkulosis (MDR-TB) di Rumah Sakit Umum Pusat (RSUP) Haji Adam Malik Medan, menentukan kodon mana yang bermutasi pada gen rpoB, gen katG, dan gen embB, menentukan kesesuaian pola mutasi umum yang terjadi pada pasien MDR-TB di RSUP Haji Adam Malik Medan dengan pola mutasi global.
Penelitian ini merupakan penelitian observasional dan dilakukan secara prospektif pada pasien MDR-TB yang mempunyai data catatan medik hasil dari
GeneXpert MTB/RIF positif resisten terhadap rifampisin periode Agustus sampai November 2016 di RSUP Haji Adam Malik Medan dengan pengambilan sputum dari pasien, kemudian dideteksi menggunakan metode molekuler Polymerase Chain Reaction (PCR)di Laboratorium Terpadu Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara. Produk PCR dianalisis menggunakan elektroforesis gel dan divisualisasi menggunakan Gel Documentation. Pita DNA terbentuk dan ukurannya dapat diketahui berdasarkan penanda ukuran molekul yang dinyatakan dengan base pair.
Persentase tertinggi mutasi gen 81 bp rpoB M. tuberculosis atau pada daerah rifampicin resistance-determining region (RRDR) yaitu terdapat pada kodon 516 (100%) kemudian pada kodon 531 (96,77%), dan kodon 526 (90,32%); sedangkan persentase terkecil yaitu mutasi gen 81 bp rpoB M. tuberculosis pada kodon 533 (12,90%). Sebanyak 83,87% sampel mengalami mutasi gen katG M. tuberculosis pada kodon 315 yang mengakibatkan resistensi terhadap INH dan sampel tersebut juga resistensi terhadap rifampisin. Sebanyak 29,03% sampel mengalami mutasi gen embB M. tuberculosis di kodon 306A yang menimbulkan resistensi terhadap etambutol.
Kata kunci : Multidrug resistance tuberculosis, mutasi gen rpoB, mutasi gen katG, mutasi gen embB,PCR.
ix
IDENTIFICATION GEN MUTATIONS rpoB, katG, and embB CAUSE OF MULTIDRUG RESISTANCE TUBERCULOSIS
IN HAJI ADAM MALIK HOSPITAL
ABSTRACT
Case of resistance has long been a challenge in the preventive program Tuberculosis (TB) and Multidrug Resistance Tuberculosis (MDR-TB). Microbial resistance to antibiotics is an innate characteristic of Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis). It is associated with a genetic mutation that occurs naturally in a large population of wild-type M. tuberculosis that antibiotics have never been used and does not cause clinical symptoms. The purpose of the study were to assess gene mutations in M. tuberculosis causes resistance to rifampicin, isoniazid and ethambutol in MDR-TB patients in the Haji Adam Malik Hospital, to determine how the mutated of codon in the rpoB, katG, and embB genes, determine the suitability of the general pattern of mutations that occur in patients with MDR-TB in the hospital with global mutation pattern.
This observational study was performed prospectively in patients with MDR-TB who had data medical records results of GeneXpert MTB / RIF positive for resistant to rifampicin period August to November 2016 in the hospital by taking sputum from patients, then detected using Polymerase Chain Reaction (PCR) in the Integrated Laboratory of Faculty of Medicine, University of Sumatera Utara. The PCR products were analyzed using gel electrophoresis and visualized using Gel Documentation. DNA bands formed, and their size were determined by molecular size marker expressed by base pair.
The highest percentage of 81 bp rpoB gene mutation M. tuberculosis
called as rifampicin-resistance determining region (RRDR) which was located at codon 516 (100%) then at codon 531 (96.77%), and codon 526 (90.32%); while the smallest percentage was 81 bp rpoB gene mutation at codon 533 M. tuberculosis (12.90%). A total of 83.87% of the sample experienced M. tuberculosis katG gene mutation at codon 315 resulting in resistance to INH and these samples as well as resistance to rifampicin. A total of 29.03% of the samples had mutations in the gene embB M. tuberculosis codon 306A that caused resistance to ethambutol.
Keywords: Multidrug resistance tuberculosis, mutations in the gene rpoB, katG gene mutations, gene mutations embB, PCR.
