ABSTRACT
Dani Sutanta S. 2017. Survey and Identification of Potato Cyst Nematode (Globodera spp.) from Wonosobo and Banjarnegara, Central Java. Supervised by Lisnawita and Hasanuddin.
Potato cyst nematode (PCN) (Globodera spp.) are the primary pathogens that infect potato and has a wide distribution area in the world. In Indonesia, this pathogens including A2 plant quarantine pest that limited distribution in Java. The proper identification of the PCN be an important basis in order to find effective control techniques. The aim of this research was to determine the geographic distribution and PCN species that infect potato in Wonosobo and Banjarnegara - Central Java through morphological and molecular approaches. The survey method to investigate the distribution of PCN in the area. The morphological characters were observed among cyst (fenestradiameter, anus-fenestra distance, and the granek’s ratio), eggs (egg length and width), and the second-stage juveniles (J2) (body length and width, head length and width, stylet length, knob type, and long tail). While the molecular identification used polymerase chain reaction amplification based on the internal area transcripbed spacers using specific primers G. rostochiensis PITSr3 (5’-AGCGCAGACATGCCGCAA-3’), specific primers PITSp4 G. pallida (5’-ACAACAGCAATCGTCGAG-3’) and universal primers ITS5 nematodes (5’-GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG-3’). Twelve populations PCN, respectively 5 and 7 populations of Wonosobo population of Banjarnegara used in this reseach. The results of the analysis based on morphological and molecular characters for all locations identified a single species G. rostochiensis (434 bp).
Keywords: geographic distribution,Globodera rostochiensis, morphological, polymerase chain reaction, survey
ABSTRAK
Dani Sutanta S. 2017.Survei dan Identifikasi Nematoda Sista Kentang (Globoderaspp.) Asal Wonosobo dan Banjarnegara, Jawa Tengah. Dibimbing oleh Lisnawita dan Hasanuddin.
Nematoda sista kentang (Globodera spp.) merupakan patogen utama yang menginfeksi tanaman kentang dan memiliki daerah sebaran yang luas di dunia. Di Indonesia, patogen ini termasuk OPTK A2 yang penyebarannya masih terbatas di wilayah Jawa. Identifikasi yang tepat terhadap NSK menjadi dasar penting agar menemukan teknik pengendalian yang efektif. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui sebaran geografi dan spesies NSK yang menginfeksi tanaman kentang di Kabupaten Wonosobo dan Banjarnegara-Jawa Tengah melalui pendekatan morfologi dan molekuler.Melalui metode survei dilakukan penelitian untuk mengetahui sebaran NSK di wilayah tersebut. Adapun karakter morfologi yang diamati diantaranya sista (diameter fenestra, jarak anus ke fenestra, danrasiogranek), telur (panjangdanlebartelur), dan juvenilstadia 2 (J2) (panjangdanlebartubuh, panjangdanlebarkepala, panjangstilet, tipe knob, sertapanjangekor). Sedangkan identifikasi molekuler digunakan teknikpolymerase chain reaction yang berdasarkan pada amplifikasi daerah internal transcripbed spacersdengan menggunakan primer spesifikG. rostochiensisPITSr3 AGCGCAGACATGCCGCAA-3’), primer spesifikG. pallida PITSp4 ACAACAGCAATCGTCGAG-3’) dan primer universal nematoda ITS5 (5’-GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG-3’). Dua belas populasi NSK, masing-masing 5 populasi dari Wonosobo dan 7 populasi dari Banjarnegara digunakan dalam penelitian ini. Hasil analisis berdasarkan karakter morfologi dan molekuler untuk semua lokasi berhasil diidentifikasi spesies tunggal G. rostochiensis(434 bp).
Kata kunci : Globodera rostochiensis, karakter morfologi, polymerase chain reaction, sebaran geografi, survei
