EKSPLORASI BAKTERI SELULOLITIK DARI TANAH HUTAN MANGROVE BAROS KRETEK, BANTUL, Eksplorasi Bakteri Selulolitik Dari Tanah Hutan Mangrove Baros, Kretek, Bantul, Yogyakarta.

EKSPLORASI BAKTERI SELULOLITIK DARI TANAH

HUTAN MANGROVE BAROS KRETEK, BANTUL,

YOGYAKARTA

SKRIPSI

Untuk Memenuhi Sebagian Persyaratan Guna Mencapai Derajat Sarjana S-1 Program Studi Pendidikan Biologi

Oleh:

FAJAR NURROCHMAN

A 420 110 060

FAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN

UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH SURAKARTA

ii

HALAMAN PERSETUJUAN

EKSPLORASI BAKTERI SELULOLITIK DARI TANAH HUTAN

MANGROVE BAROS KRETEK, BANTUL, YOGYAKARTA

Yang Dipersiapkan dan Disusun Oleh : FAJAR NURROCHMAN

A 420 110 060

Telah Disetujui dan Disahkan oleh Pembimbing untuk Dipertahankan di Hadapan Dewan Penguji Skripsi

Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan Universitas Muhammadiyah Surakarta

Pembimbing,

Triastuti Rahayu, S.Si., M.Si.

NIK. 920

iii

HALAMAN PENGESAHAN

SKRIPSI

EKSPLORASI BAKTERI SELULOLITIK DARI TANAH HUTAN

MANGROVE BAROS KRETEK, BANTUL, YOGYAKARTA

Yang Dipersiapkan dan Disusun Oleh : FAJAR NURROCHMAN

A 420 110 060

Telah Dipertahankan di Depan Dewan Penguji Pada Hari Selasa, Tanggal 22 Mei 2015

dan Dinyatakan Telah Memenuhi Syarat Susunan Dewan Penguji

1. Triastuti Rahayu, S.Si., M.Si. ( )

2. Dra. Suparti, M.Si ( )

3. Dra. Titik Suryani, M.Sc. ( )

Surakarta, 9 Juni 2015

Universitas Muhammadiyah Surakarta Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan

Dekan,

iv

PERNYATAAN

Dengan ini, saya menyatakan bahwa dalam skripsi ini tidak terdapat karya yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar kesarjanaan di suatu Perguruan Tinggi dan sepanjang pengetahuan saya juga tidak terdapat karya atau pendapat yang pernah ditulis dan diterbitkan oleh orang lain, kecuali yang secara tertulis diacu dalam naskah dan disebutkan dalam daftar pustaka.

Apabila ternyata kelak di kemudian hari terbukti ada ketidak benaran dalam pernyataan saya di atas, maka saya akan bertanggung jawab sepenuhnya.

Surakarta, 15 Mei 2015

Fajar Nurrochman

v

MOTTO

“Sesungguhnya Allah tidak merubah keadaan suatu kaum sehingga mereka

merubah keadaan yang ada pada diri mereka sendiri”

(Qs. ar Ra’d : 11)

Saya percaya selalu ada harapan yang lebih baik di depan sana ASAL

kita tidak pernah berhenti untuk berusaha, bersyukur, dan dilandasi do’a

(Joko Susilo)

Waktu tak pernah menunggu, berjalan seperti tak mau tau, tak ada yang bisa menghentikan maupun menundanya, maka jangan sis-siakan waktu yang ada,

karena hanya penyesalan yang didapat.

(Makrifatun Nur Hidayah)

Mengawali itu terasa sulit daripada membiasakan dan terbiasa itu terasa mudah dilakukan, akan tetapi semua itu terasa ringan dengan adanya

NIAT dan KE-IHKLASAN

vi

PERSEMBAHAN

Alhamduliillah

irobil’alamin

,

Terucap syukur atas nikmat dan kemudahan Allah SWT sehingga

dapat tersellesaikannya goresan tinta ini yang saya persembahkan

untuk:

Ayah dan ibu

(Bp. Ma’ruf dan Ibu Supa

rti)

Yang telah memberi motivasi, dorongan, doa, dan kasih sayang

hingga sampai ke jenjang ini. Terimakasih atas segalanya.

Adik (Febrian Lailia Nurrochim)

yang telah memberi semangat untuk menjadi yang terbaik.

Ibu Triastuti Rahayu, M.Si.

Terimakasih atas bimbingan dan kesabaran yang telah diberikan

selama ini.

Sahabat-sahabatku

Teman-teman seperjuangan FKIP BIOLOGI 2011

Teman-teman asisten Laboratorium Biologi 2013

Teman-teman Kos Belti

vii

KATA PENGANTAR

Assalamu‘alaikum Wr. Wb.

Alhamdulillah, segala puji dan syukur kepada Allah SWT yang telah melimpahkan rahmat, hidayah dan inayah-Nya sehingga dapat menyelesaikan penyusunan skripsi yang berjudul “EKSPLORASI

BAKTERI

SELULOLITIK DARI TANAH HUTAN MANGROVE BAROS,

KRETEK, BANTUL, YOGYAKARTA”

.

Penulis menyadari sepenuhnya tanpa adanya bantuan dari berbagai pihak, penulis tidak akan mampu melaksanakan skripsi ini dengan baik. Untuk itu pada kesempatan ini penulis menyampaikan terima kasih kepada:

1. Ibu Triastuti Rahayu, S.Si., M.Si., selaku dosen pembimping yang telah berkenan meluangkan waktunya dalam membimbing dan memberikan pengarahan, ilmu, serta nasehat, sehingga penulis mampu menyusun dan menyelesaikan skripsi ini.

2. Ibu Dra. Aminah Asngad, M.Si., selaku pembimbing akademik yang telah membimbing, mengarahkan dan memberi nasehat.

3. Semua Bapak dan Ibu dosen FKIP Biologi UMS yang telah mendidik selama ini.

4. Bapak dan Ibu tercinta yang selalu memberi motivasi, doa dan dukungan moril maupun materiil.

5. Adikku tersayang yang selalu memotivasi untuk selalu berusaha yang terbaik. 6. Seluruh teman-teman seperjuangan mahasiswa Program Studi Pendidikan Biologi FKIP UMS angkatan 2011 yang telah memberi dukungan dan bantuan dalam penelitian ini.

7. Teman-teman asisten Laboratorium Biologi FKIP UMS angkatan 2011 dan angkatan 2012 yang turut membantu kelancaran proses penelitian.

viii

Semoga Skripsi ini dapat bermanfaat, baik bagi pembaca maupun penulis dan dapat menjadi sumbangan bagi perkembangan ilmu pengetahuan. Semoga ilmu yang di dapat dari skripsi ini dapat bermanfaat dalam kehidupan dunia dan akhirat.

Wassalamu‘alaikum Wr. Wb.

Surakarta, 15 Mei 2015 Penulis

ix

DAFTAR ISI

HALAMAN JUDUL ... i

HALAMAN PERSETUJUAN... ii

HALAMAN PENGESAHAN ... iii

HALAMAN PERNYATAAN ... iv

HALAMAN MOTTO ... v

HALAMAN PERSEMBAHAN... vi

KATA PENGANTAR ... vii

DAFTAR ISI ... ix

DAFTAR TABEL... xi

DAFTAR GAMBAR ... xii

DAFTAR LAMPIRAN ... xiii

ABSTRAK ... xiv

BAB I PENDAHULUAN A. Latar Belakang ... 1

B. Pembatasan Masalah ... 3

C. Perumusan Masalah ... 4

D. Tujuan Penelitian ... 4

E. Manfaat Penelitian ... 4

BAB II TINJAUAN PUSTAKA A. Landasan Teori ... 5

Bakteri Selulolitik... 5

Teknik Isolasi ... 7

Populasi Bakteri ... 8

Karakterisasi ... 10

Uji Skrining ... 11

Hutan Mangrove ... 12

Hutan Mangrove Baros, Kretek, DIY ... 13

x

C. Kerangka Berpikir ... 15

BAB III METODE PENELITIAN A. Tempat dan Waktu Penelitian ... 16

B. Populasi, Sampel dan Sampling ... 16

C. Alat dan Bahan ... 16

D. ProsedurPenelitian ... 16

E. Rancangan Percobaan ... 23

F. Teknik Pengumpulan Data ... 23

G. Teknik Analisis Data ... 24

BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN A. Hasil Penelitian ... 25

B. Pembahasan ... 27

BAB V KESIMPULAN DAN SARAN A. Kesimpulan ... 34

B. Saran ... 34 DAFTAR PUSTAKA

xi

DAFTAR TABEL

Tabel Halaman

3.1. Waktu Penelitian... 16

3.2. Rancangan Penelitian ... 23

4.1. Jumlah Populasi Bakteri Selulolitik Pada Kedalaman Berbeda ... 25

4.2. Hasil Uji Skrining dan Karakterisasi Bakteri Selulolitik ... 26

xii

DAFTAR GAMBAR

Gambar Halaman

2.1. Bakteri Bacillus ... 6

2.2. Skema Kerangka Berpikir ... 15

3.1 Skema Prosedur Penelitian ... 22

3.2. Bentuk Elevasi Bakteri ... 24

4.1. Hasil Uji Potensi Bakteri Selulolitik ... 31

xiii

DAFTAR LAMPIRAN

Lampiran

1. Tabel Hasil Isolasi Bakteri Selulolitik Pada Tanah Hutan Mangrove Baros, Kretek, DIY

2. Tabel Hasil Pengamatan Ukuran Koloni Bakteri Dan Zona Bening (cm)

3. Dokumentasi Proses Penelitian

4. Agenda Kegiatan Pelaksanaan Penelitian.

5. Surat Riset Penggunaan Laboratorium FKIP UMS. 6. Berita Acara Bimbingan Skripsi

7. Jadwal Bimbingan Mahasiswa Dan Uraian Hasil Pembimbingan 8. Berita Acara Ujian Skripsi

xiv

EKSPLORATION CELLULOLITYC BACTERIA OF SOIL

MANGROVE FORESTS BAROS, KRETEK, BANTUL,

YOGYAKARTA

Fajar Nurrochman (1), A 420 110 060, Triastuti Rahayu (2), (1)

College Student/Graduate, (2) Lecturer, Biology Education Program, Faculty of Education and Teacher Training,

Muhammadiyah University Of Surakarta, 2015.

ABSTRACT

Cellulolytic bacteria are bacteria producing cellulase enzyme that functions to degrade cellulose. One of cellulolytic bacteria habitat is soil. This study aims to determine the population, the potential and characteristics of cellulolytic bacteria in mangrove forest land Baros, Kretek, Bantul, Yogyakarta. Sampling was done by the method of composite soil at a depth of 5, 10, 15 and 20 cm at five different points. Isolation of cellulolytic bacteria using selective media Carboxy Methyl Cellulose 1% (CMC 1%) with a spread plate method, incubated at 28 0C for 5 days. Cellulolytic bacterial isolates were grown colonies of each treatment was calculated and chosen different isolates of the overall treatment for isolated on NA medium. Characterization is done by growing the pure isolates were selected in CMC 1% media further congo red 0.1% drops to test the potential of cellulolitic (potential cellulolytic marked by the emergence of a clear zone around the colony). Results obtained 23 isolates of bacteria isolation of potentially degrade cellulose from 31 isolates. The population most commonly found at a depth of 20 cm (6,44x105 CFU/g), whereas at a depth of 5 cm there are at most a difference of character cellulolytic bacterial isolates (13 isolates) and most major cellulolytic activity index isolates possessed 3 is 6.38. Cellulolytic bacterial isolates obtained dominated by gram-negative cocci.

xv

EKSPLORASI BAKTERI SELULOLITIK DARI TANAH

HUTAN MANGROVE BAROS KRETEK, BANTUL,

YOGYAKARTA

Fajar Nurrochman (1), A 420 110 060, Triastuti Rahayu (2), (1)

Mahasiswa/alumni, (2) Staf Pengajar, Program Studi Pendidikan Biologi, Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan,

Universitas Muhammadiyah Surakarta, 2015.

ABSTRAK

Bakteri selulolitik merupakan bakteri penghasil enzim selulase yang berfungsi untuk mendegradasi selulosa. Salah satu habitat bakteri selulolitik adalah tanah. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui populasi, potensi dan karakteristik bakteri selulolitik pada tanah hutan mangrove Baros, Kretek, Bantul, DIY. Pengambilan sampel tanah dilakukan dengan metode komposit pada kedalaman 5, 10, 15 dan 20 cm di lima titik yang berbeda. Isolasi bakteri selulolitik menggunakan media selektif Carboxy Methyl Cellulose 1% (CMC 1%) dengan metode spread plate, diinkubasi pada suhu 28 0C selama 5 hari. Isolat bakteri selulolitik yang tumbuh dihitung koloninya setiap perlakuan dan dipilih isolat yang berbeda dari keseluruhan perlakuan untuk diisolasi pada media NA. Karakterisasi dilakukan dengan cara menumbuhkan isolat murni terpilih pada media CMC 1% selanjutnya ditetesi Congo red 0,1% untuk menguji potensi selulolitiknya (potensi selulolitik ditandai dengan munculnya zona bening di sekitar koloni). Hasil isolasi bakteri diperoleh 23 isolat yang berpotensi mendegradasi selulosa dari 31 isolat. Populasi paling banyak ditemukan pada kedalaman 20 cm (6,44x105 CFU/g), sedangkan pada kedalaman 5 cm terdapat paling banyak perbedaan karakter isolat bakteri selulolitik (13 isolat) dan indeks aktifitas selulolitik paling besar dimiliki isolat 3 yaitu 6,38. Isolat bakteri selulolitik yang diperoleh didominasi bentuk coccus gram negatif.