LAMPIRAN
Lampiran 1. Profil elektroforegram perbandingan primer SSR-3574
Keterangan: M = DNA ladder 1kb (Marker), A = isolasi DNA berasal dari bagian akar, D = isolasi DNA berasal dari bagian daun, B = isolasi DNA berasal dari bagian
buah
Lampiran 2. Profil elektroforesis perbandingan primer SSR-3574
Keterangan: M = DNA ladder 1kb (Marker), D = DNA stok berasal dari bagian daun,
B = DNA stok berasal dari bagian buah P = DNA stok berasal dari bagian pollen,
O = DNA stok berasal dari bagian bunga betina
33D 33A 34D 34A 35D 35A 36D 36A 15D 15B 100bp 16D 16B 17D 17B 18D 18B 6D 6B 7D
Lampiran 3. Profil elektroforegram pengulangan proses PCR dengan Primer Beta pada sampel bagian akar
Keterangan: M = DNA ladder 1kb (Marker), A = isolasi DNA berasal dari bagian akar, B = isolasi DNA berasal dari bagian buah
Lampiran 4. Profil elektroforegram yang dianalisis menggunakan UVITEC
FIREREADER
Lampiran 5. Profil elektroforegram yang dianalisis menggunakan UVITEC
FIREREADER
Lampiran 6. Pembuatan larutan stok dan buffer A. Pembuatan Larutan Stok
• CTAB 5 % (100 ml): Timbang NaCl sebanyak 2.0 gram dan CTAB
sebanyak 5.0 gram. Masukkan bahan kimia ke dalam erlenmeyer dan
ditambahkan 100 ml aquades. Aduk campuran larutan dengan menggunakan
stirrer kemudian diletakkan diatas hotplate.
• Tris HCl 1 M pH 8.0 (100 ml): Timbang Tris sebanyak 12.114 gram.
Masukkan Tris ke dalam erlenmeyer dan ditambahkan 80 ml aquades. Aduk
campuran larutan dengan menggunakan stirrer kemudian diletakkan diatas
hotplate. Selanjutnya, ditambahkan 4.2 ml HCl pekat sedikit demi sedikit
sampai pH mencapai 8. Masukkan ke dalam gelas ukur, kemudian volume
ditepatkan dengan aquades hingga volume larutan menjadi 100 ml.
• Tris HCl 1 M pH 7.4 (50 m): Timbang Tris sebanyak 6.057 gram.
campuran larutan dengan menggunakan stirrer kemudian diletakkan diatas
hotplate. Selanjutnya, ditambahkan NaOH 2.5 M sedikit demi sedikit sampai
pH mencapai 7.4. Masukkan ke dalam gelas ukur, kemudian volume
ditepatkan dengan aquades hingga volume larutan menjadi 50 ml.
• EDTA 0.5 M pH 8.0 (100 ml) : Timbang EDTA sebanyak 18.612 gram dan
NaOH 2.0 gram. Masukkan bahan kimia ke dalam erlenmeyer dan
ditambahkan 80 ml aquades. Aduk campuran larutan dengan menggunakan
stirer kemudian diletakkan diatas hotplate. Selanjutnya, ditambahkan HCl
pekat sedikit demi sedikit sampai pH mencapai 8. Masukkan ke dalam gelas
ukur, kemudian volume ditepatkan dengan aquades hingga volume larutan
menjadi 100 ml.
• NaCl 5 M(l00 ml): Timbang NaCl sebanyak 29.22 gram. Masukkan ke
dalam erlenmeyer dan ditambahkan 80 ml aquades. Aduk campuran larutan
dengan menggunakan stirrer kemudian diletakkan diatas hotplate. Masukkan
ke dalam gelas ukur, kemudian volume ditepatkan dengan aquades hingga
volume larutan menjadi 100 ml.
**Semua bahan di atas disterilkan dengan menggunakan autoklaf kecuali CTAB
5%.
B. Pembuatan Larutan Buffer
• Buffer Ekstraksi/CTAB (100 ml): Campurkan 40 ml CTAB 5%, 25.1 ml
NaCl 5 M, 4 ml EDTA 0.5 M pH 8.0, 10 ml Tris HCl 1 M pH 8.0 dan 20.8 ml
• Buffer TAE 50 X (100 ml): Campurkan 24.2 ml Tris HCl 1 M pH 7.4, 5.7
ml Asam Asetat Glasial, 10 ml EDTA 0.5 M PH 8.0, dan aquades hingga
volume larutan menjadi 100 ml.
• Buffer TAE 1X (500 ml): Campurkan 10 ml Buffer TAE 50 X dan 490 ml
aquades.
• Buffer TE (50 ml): Campurkan 0.5 ml Tris HCl 1 M pH 8.0, 0.1 m lEDTA
0.5 M pH 8.0 dan 49.4 ml aquades.
• Kloroform Isoamilalkohol 24 : 1 (50 ml): Campurkan 48 ml Kloroform dan
2 ml Isoamilalkohol.
Lampiran 7. Hasil uji kuantitas dengan nanospektrometer
Sampel A260/A280 Konsentrasi (ng/µl)
25D 0.1327 233 0.0327 14 0.2021 541 0 0 0 0
Keterangan : Axis Eigenvalue Inertia%
1 0.06456 33.67
2 0.04319 22.52
3 0.0147 7.67
4 0.01316 6.86
Lampiran 11. Data ukuran pasangan basa amplikon DNA
Sampel Produk PCR
6B 6D 7B 7D 9B 9D 15B 15D 16B 16D 17B 17D 18B 18D
843 1934 2248 1934 1934 1934 843 1934 843 843 1934 2248 843 1934
738 1060 1934 1756 843 1060 738 1060 738 738 991 1934 738 1060
843 1756 1060 738 843 843 843 991 843
738 1060 843 738 738 738 843 738
340 843 428 428 738
Lampiran 12. Data ukuran pasangan basa amplikon DNA
Sampel Produk PCR
19B 19D 21B 21D 23B 23D 25B 25D 28B 28D 30B 30D 31D 31P
738 3029 3029 3029 3029 3029 1934 1934 1934 3029 3029 3029 1934 843
2248 1934 1934 1934 1934 1060 843 843 1934 2248 2248 1060 738
1934 1060 1060 1060 1060 843 738 738 1146 1934 1934 991
1060 843 843 843 843 738 568 428 843 1060 1060 843
843 428 738 738 738 568 501 738 843 843 738
738 428 568 568 501 428 568 738 738 428
568 501 501 428 501 568 501
462 428 428 428 428 428
Lampiran 13. Data ukuran pasangan basa amplikon DNA
Sampel Produk PCR
32D 32O 33A 33D 34A 34D 35A 35D 36A 36D
1756 738 738 1934 1934 1934 2248
1146 1060 1060 1060 1934
991 843 843 843 1060
843 738 738 738 843
738 738 428 428 738
568 340
428
340
Lampiran 14. Foto kegiatan penelitian
Isolasi DNA
Uji Kuantitas
Elektroforesis
