• Tidak ada hasil yang ditemukan

KAJIAN MODEL HIDDEN MARKOV DISKRET DAN APLIKASINYA PADA DNA N U R M A I L Y

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2022

Membagikan "KAJIAN MODEL HIDDEN MARKOV DISKRET DAN APLIKASINYA PADA DNA N U R M A I L Y"

Copied!
91
0
0

Teks penuh

(1)

APLIKASINYA PADA DNA

N U R M A I L Y

SEKOLAH PASCA SARJANA INSTITUT PERTANIAN BOGOR

BOGOR 2009

(2)

Dengan ini saya menyatakan bahwa tesis dengan judul “Kajian Model Hidden Markov Diskret dan Aplikasinya pada DNA” adalah karya saya dengan arahan dari komisi pembimbing dan belum diajukan dalam bentuk apa pun kepada perguruan tinggi mana pun. Sumber informasi yang berasal atau dikutip dari karya yang diterbitkan maupun tidak diterbitkan dari penulis lain telah disebutkan dalam teks dan dicantumkan dalam Daftar Pustaka di bagian akhir tesis ini.

Bogor, Agustus 2009 Nurmaily NRP G551070281

(3)

NURMAILY. The Study of Discrete Hidden Markov Model and Its Application on DNA Sequence. Under supervision of BERLIAN SETIAWATY and N. K.

KUTHA ARDANA.

A discrete hidden Markov model is a model which consists of the cause of event and observation process. This model assumes that the cause of event is a Markov chain, which is not observed directly. The observation process has discrete range.

Parameters of this model are transition probability matrices. They are estimated using the maximum likelihood method and expectation maximization algorithm. The estimation procedure involves the change of measure. The estimation of parameters uses Mathematica 7.0, a functional programming based on algebraic computer systems. The model is applied to the DNA sequence. The estimated parameters are used to calculate the expectation of DNA sequence. The result depends on the decision of the initial value. There should be another study for determining the initial value which gives the optimal result.

Keywords: Markov chain, discrete hidden Markov model, expectation maximization

algorithm.

(4)

NURMAILY. Kajian Model Hidden Markov Diskret dan Aplikasinya pada DNA. Di bawah bimbingan BERLIAN SETIAWATY dan N.K. KUTHA ARDANA.

Setiap kejadian berkaitan erat dengan penyebab kejadian. Jika penyebab kejadian tersebut tidak diamati secara langsung dan membentuk rantai Markov, maka pasangan kejadian dan penyebabnya dapat dimodelkan dengan model Hidden Markov (Hidden Markov Model, HMM).

Semua proses didefinisikan pada ruang peluang Ω, , . Misalkan ;

adalah rantai Markov dengan state berhingga yang bersifat homogen dan diasumsikan tidak diamati secara langsung, sedangkan ; adalah proses observasinya. Pasangan proses stokastik , merupakan model Hidden Markov.

Model Hidden Markov (Elliot et al. 1995) yang digunakan pada karya ilmiah ini adalah

 + 

      Y  CX W ,   untuk    

    

 di mana , , … , , , , , , A dan C merupakan matriks peluang transisi dengan

   

      

 dan , yang

memenuhi

∑ 1, 0, dan ∑ 1, 0.  

dan  memenuhi 

  | 0, | 0 

  | diag diag  

  diag diag . 

 

Jika , maka vektor , , … , merupakan nilai harapan dari , yaitu dan untuk ergodic memenuhi dan ∑ 1.

Parameter yang digunakan pada model di atas adalah

, 1 , , , 1 , 1 .

Akan ditentukan parameter baru dengan menggunakan algoritme EM

, 1 , , ̂ , 1 , 1 ,

yang memaksimumkan fungsi log-likelihood bersyaratnya. Hasilnya berupa

parameter dalam bentuk pendugaan rekursif, diantaranya penduga untuk state,

penduga untuk banyaknya loncatan, penduga lamanya rantai Markov berada pada

suatu state tertentu dan penduga proses observasi.

(5)

,

,

, . 2. Pendugaan Banyaknya Lompatan

= , , ,

Penduga banyaknya lompatan adalah

, 1

,

, , .

Penduga smoother banyaknya lompatan adalah

,

,

, .

3. Pendugaan Lamanya Waktu Kejadian

  ,  

Penduga lamanya waktu kejadian adalah

,, , , .

Penduga smoother lamanya waktu kejadian adalah

,, , .

4. Pendugaan untuk Proses Observasi

∑ , , , , .

Penduga untuk proses observasi adala

,

,

, , , .

Penduga smoother untuk proses observasi adalah

,

,

, .

Dari pendugaan rekursif dapat ditentukan parameter model sebagai berikut

, 1 , .

̂ , 1 , 1 . Nilai Harapan adalah

| ∑

1

1

 

Model Hidden Markov diskret di atas diaplikasikan pada perubahan urutan basa DNA pada spesies Aspergillus niger, dengan

 

N = 2. Dalam perkembangan lebih lanjut, dibuat suatu program komputasi yang berbasis pemprograman fungsional untuk menyelesaikan masalah tersebut. Software yang digunakan adalah Mathematica 7.0.

Hasil yang di peroleh pada penelitian ini sangat bergantung pada penentuan nilai

awal. Sampai saat ini hasil yang diperoleh belum cukup baik, karena belum

ditemukan cara untuk menentukan nilai awal yang paling baik sehingga hasil yang

diperoleh optimal.

(6)

© Hak Cipta milik IPB, tahun 2009 Hak Cipta dilindungi Undang-Undang

1. Dilarang mengutip sebagian atau seluruh karya tulis ini tanpa mencantumkan atau menyebutkan sumber.

a. Pengutipan hanya untuk kepentingan pendidikan, penelitian, penulisan karya ilmiah, penyusunan laporan, penulisan kritik, atau tinjauan suatu masalah

b. Pengutipan tidak merugikan kepentingan yang wajar IPB

2. Dilarang mengumumkan dan memperbanyak sebagian atau seluruh Karya Tulis dalam bentuk apapun tanpa izin IPB.

(7)

N U R M A I L Y

Tesis

sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Magister Sains pada

Program Studi Matematika Terapan

SEKOLAH PASCA SARJANA INSTITUT PERTANIAN BOGOR

BOGOR 2009  

(8)

Penguji Luar Komisi pada Ujian Tesis: Dr. Ir. Wayan Mangku, M.Sc.

(9)

Disetujui Komisi Pembimbing

Dr. Berlian Setiawaty, M.S. Ir. N. K. Kutha Ardana, M.Sc.

Ketua Anggota

Diketahui

Ketua Program Studi Dekan Sekolah Pascasarjana Matematika Terapan

Dr. Ir. Endar H. Nugrahani, M.S. Prof, Dr. Ir. Khairil A. Notodiputro, M.S.

Tanggal Ujian: 19 Agustus 2009 Tanggal Lulus:

(10)

Puji dan syukur penulis panjatkan ke hadirat Allah SWT atas segala rahmat dan karunia-Nya sehingga tugas akhir yang berjudul “Kajian Model Hidden Markov Diskret dan Aplikasinya pada DNA” ini bisa terselesaikan sebagai salah satu syarat untuk menyelesaikan pendidikan pada Program Studi Matematika, Sekolah Pascasarjana Institut Pertanian Bogor.

Terimakasih yang mendalam penulis sampaikan kepada:

1. Dr. Berlian Setiawaty, M.S. dan Ir. N. K. Kutha Ardana, M.Sc. selaku pembimbing yang telah memberikan bimbingan dan motivasinya.

2. Dr. Ir. Wayan Mangku, M.Sc. selaku penguji yang telah memberikan saran dan kritiknya.

3. Departemen Agama Republik Indonesia yang telah memberikan beasiswa kepada penulis selama menempuh pendidikan di IPB.

4. Seluruh keluarga atas segala dukungan, doa dan kasih sayangnya.

5. Mahasiswa S2 Matematika Terapan IPB angkatan 2007, serta semua pihak yang telah membantu penulis.

Penulis menyadari bahwa tugas akhir ini masih begitu banyak kekurangan.

Dengan segala keterbatasan yang ada, semoga tugas akhir ini bermanfaat.

Bogor, Agustus 2009 Nurmaily

(11)

Penulis dilahirkan di Banda Aceh pada tanggal 21 Mei 1971 dari pasangan Bapak Rusli Tgk. Ali (Alm) dan Ibu Nurjannah. Penulis merupakan anak ketiga dari lima bersaudara.

Pendidikan sarjana ditempuh di Program Studi Matematika Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan Universitas Syiah Kuala Banda Aceh, lulus pada tahun 1996 dan pada tahun 2007 penulis diberi kesempatan melanjutkan studi di Program Studi Matematika Terapan, Sekolah Pascasarjana Institut Pertanian Bogor dengan beasiswa dari Departemen Agama Republik Indonesia.

Penulis bekerja sebagai guru matematika pada Madrasah Aliyah Negeri Model Banda Aceh sampai sekarang.

(12)

DAFTAR ISI ……… xii

DAFTAR GAMBAR ……….. xiv

DAFTAR LAMPIRAN ………... xv

BAB 1 PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang ………... 1

1.2 Tujuan Penelitian ……….... 3

BAB 2 LANDASAN TEORI 2.1 Pengantar Teori Peluang ………... 4

2.2 Rantai Markov ……….... 10

2.3 Ruang Hasil Kali Dalam ……….. 13

BAB 3 MODEL HIDDEN MARKOV 3.1 State dan Proses Observasi dalam waktu diskret ……… 15

3.2 Perubahan Ukuran ………... 21

3.3 Pendugaan Rekursif ………. 29

3.4 Pendugaan Parameter ……….. 38

3.5 Nilai Harapan

ܻ௞ାଵ ……….. 47

3.6 Algoritme Pendugaan Parameter ………... 47

BAB 4 APLIKASI MODEL HIDDEN MARKOV DISKRET PADA DNA 4.1 DNA Sebagai Materi Genetik ………. 50

4.2 Data Input DNA ……….. 52

4.3 Aplikasi Model Hidden Markov Diskret pada DNA ……….. 53

4.4

Hasil Komputasi ……… 54

BAB 5 KESIMPULAN DAN SARAN 5.1 Kesimpulan ………... 58

5.2 Saran ………. 58

DAFTAR PUSTAKA ………. 59

LAMPIRAN ……… 61

(13)

Halaman

1 Tabel nilai harapan model dengan 2 penyebab kejadian……….. 68

(14)

Halaman

1 Pembentukan secara skematik struktur dsDNA dari gula fosfat sebagai backbone dan basa nukleotida (A). Bentuk skematik

double-helix DNA (B)……… 52

2 Grafik distribusi nilai dugaan urutan DNA menggunakan penduga smoother untuk 2 penyebab kejadian (N = 2). Banyaknya data, T = 1000. Nilai awal 0.31 0.66

0.69 0.34 ,

0.16 0.26 0.09 0.02 0.40

0.35 0.43 0.29

dan 0.49

0.51 ..………... 55

3 Grafik distribusi nilai dugaan urutan DNA menggunakan penduga smoother untuk 2 penyebab kejadian (N = 2). Banyaknya data, T = 1000. Nilai awal 0.37 0.35

0.63 0.65 ,

0.37 0.20 0.27 0.02 0.26

0.10 0.33 0.45

dan 0.50

0.50 ... 56

(15)

DAFTAR LAMPIRAN

Halaman

1 Bukti Teorema 3.3.5 ………... 61

2 Program 1... 66

3 Program 2... 72

4 Tabel nilai harapan model dari Program 1... 78

5 Tabel nilai harapan model dari Program 2... 83

(16)

BAB I

PENDAHULUAN

1.1 Latar Belakang

Dalam kehidupan sehari-hari banyak fenomena yang dapat dimodelkan dengan proses stokastik. Setiap kejadian berkaitan erat dengan penyebab kejadian tersebut. Jika penyebab kejadian tersebut tidak diamati secara langsung dan membentuk rantai Markov, maka pasangan kejadian dan penyebabnya dapat dimodelkan dengan model Hidden Markov (Hidden Markov Model, HMM).

Misalkan

; adalah penyebab kejadian yang tidak diamati secara langsung dan membentuk rantai Markov yang bersifat homogen, sedangkan ;

merupakan proses observasi, maka pasangan , merupakan Hidden Markov Model. Untuk

dan peubah acak diskret maka pasangan , merupakan Hidden Markov Model diskret.

Karakteristik dari Model Hidden Markov dicirikan oleh parameter-parameternya, antara lain berupa matriks peluang transisi. Parameter tersebut diduga melalui pendugaan ulang parameter dengan menggunakan algoritme Expectation Maximization (EM), sehingga diperoleh parameter model dalam bentuk pendugaan rekursif. Pendugaan rekursif ini nantinya dapat dievaluasi kembali dengan menggunakan parameter atau mungkin dengan data yang baru.

Aplikasi Model Hidden Markov diskret sudah banyak dikembangkan pada berbagai bidang antara lain, di bidang biologi yaitu “Penerapan Hidden Markov Model dalam Prediksi Gen Organisme Prokariotik” (Hermanto, 2007), di bidang kebahasaan yaitu

“Penggunaan Hidden Markov Model untuk Kompresi Kalimat” (Wibisono,2008),

”Sistem Pengenalan Bicara dengan Menggunakan Sistem Hidden Markov Model”

(Hasymi,1996), di bidang teknologi komunikasi yaitu “Algoritma Viterbi dalam

Metode HMM pada teknologi Speech Recognition” (Irfani, 2007),”Selecting Hidden

Markov Model state number with Cross-Validated Likehood” (Celeux dan Durand,

(17)

2008), di bidang teknik yaitu “Aplikasi Pengenalan Wicara HMM untuk Kendali Robot PDA” (Bachtiar, 2007), “Computational Issues in Parameter Estimation for Stationary Hidden Markov Models” (Bulla dan Berzel, 2008), “Kajian Hidden Markov Diskret dan Aplikasinya pada Harga Gabah Kering Panen” (Jamal, 2008), di bidang budaya yaitu “Pengenalan Karakter Mandarin Secara On-Line dengan Menggunakan Hidden Markov Models” (Hadi, 2005).

Dalam tesis ini akan dibahas aplikasi Model Hidden Markov diskret Elliott et al.

1995 yang telah dikaji oleh Jamal (2008). Model ini diaplikasikan untuk menggambarkan struktur urutan DNA pada spesies Aspergillus niger

Dengan menggunakan data urutan DNA pada spesies Aspergillus niger

maka dapat diduga parameter modelnya. Sebelum melakukan pendugaan parameter, terlebih dahulu dilakukan perubahan ukuran peluang yang kemudian diinterpretasikan kembali dengan menggunakan peluang asal. Perubahan ukuran peluang ini dibatasi oleh turunan Radon-Nykodim.

Dalam ukuran peluang yang baru, dilakukan pendugaan parameter melalui pendugaan ulang parameter. Hasilnya berupa pendugaan rekursif di antaranya penduga untuk state, penduga untuk banyaknya loncatan, penduga lamanya rantai Markov berada pada suatu state tertentu dan penduga proses observasi. Pendugaan rekursif ini kemudian digunakan untuk menentukan parameter dengan menggunakan algoritme Expectation Maximization (EM ).

Dalam perkembangan lebih lanjut, dibuat suatu program komputasi yang berbasis

pemprograman fungsional untuk menyelesaikan masalah Model Hidden Markov

diskret. Software yang digunakan adalah Mathematica 7.0. Keuntungan

menggunakan program tersebut adalah waktu kerja yang efisien serta memudahkan

dalam menganalisis data yang cukup banyak. Dalam tesis ini, program tersebut

digunakan untuk membantu penyelesaian masalah perubahan urutan DNA.

(18)

1.2 Tujuan Penelitian

Tujuan dari penelitian ini adalah

1. Mengkaji Model Hidden Markov diskret (Elliot et al. 1995).

2. Melakukan pendugaan parameter melalui pendugaan ulang parameter, a. Pendugaan untuk state,

b. Pendugaan untuk banyaknya loncatan,

c. Pendugaan lamanya rantai Markov berada pada suatu state, d. Pendugaan proses observasi.

3. Mengimplementasikan Model Hidden Markov untuk masalah urutan DNA.

(19)

2.1 Pengantar Teori Peluang

Definisi 2.1.1 Percobaan Acak (Ross 1996)

Dalam suatu percobaan seringkali dilakukan pengulangan yang biasanya dilakukan dalam kondisi yang sama. Semua kemungkinan hasil yang akan muncul dapat diketahui, namun hasil pada percobaan berikutnya tidak dapat diketahui dengan tepat.

Percobaan seperti ini, yang dapat diulang dalam kondisi yang sama, disebut percobaan acak.

Definisi 2.1.2 Ruang Contoh dan Kejadian (Ghahramani 2005)

Himpunan dari semua kemungkinan hasil dari suatu percobaan acak disebut Ruang contoh dan dinotasikan dengan Ω. Suatu kejadian A adalah himpunan bagian dari Ω.

Definisi 2.1.3 Medan- σ (Ghahramani 2005)

Medan- σ adalah himpunan yang anggotanya merupakan himpunan bagian dari Ω yang memenuhi:

1 ;

2 Jika , , maka

; 3 Jika maka .

Definisi 2.1.4 Ukuran Peluang (Ghahramani 2005)

Misalkan adalah medan- σ dari ruang contoh Ω. Ukuran Peluang adalah suatu fungsi : 0,1 pada Ω, yang memenuhi:

1 0, ;

2 Jika

P(

φ

)= P0, (Ω)=1;

(20)

3 Jika , , adalah himpunan yang saling lepas yaitu A

i

A

j

= φ

untuk setiap pasangan

ij

, maka ∑

=

=

⎟⎟ =

⎜⎜ ⎞

1 1

) (

i i i

i

P A

A

P U . Pasangan Ω, , ) disebut ruang peluang.

Definisi 2.1.5 Kejadian Saling Bebas (Grimmet dan Stirzaker 2001)

Kejadian A dan B dikatakan saling bebas jika

P(AB)=P(A)P(B).

Secara umum, himpunan kejadian { A

i

: iI } dikatakan saling bebas jika ∏

⎟⎟ =

⎜⎜ ⎞

J

i i

J i

i

P A

A

P I ( )

untuk setiap himpunan bagian berhingga dari J dari I.

Definisi 2.1.6 Peluang Bersyarat (Ghahramani 2005)

Misalkan Ω, , ) adalah ruang peluang dan , maka peluang A dengan syarat B didefinisikan sebagai

| .

Definisi 2.1.7 Peubah Acak (Grimmet dan Stirzaker 2001)

Misalkan Ω adalah ruang contoh dan adalah medan- σ dari Ω. Suatu peubah acak X adalah fungsi : Ω dengan { ω ∈ Ω : X ( ω ) ∈ A } ∈ untuk setiap .

Definisi 2.1.8 Peubah Acak Diskret (Grimmet dan Stirzaker 2001)

Peubah acak X dikatakan diskret jika nilainya hanya pada himpunan bagian tercacah

dari .

(21)

Definisi 2.1.9 Fungsi Sebaran (Grimmet dan Stirzaker 2001)

Fungsi sebaran dari suatu peubah acak X adalah : 0,1 , yang didefinisikan

oleh .

Definisi 2.1.10 Fungsi Kerapatan Peluang (Grimmet dan Stirzaker 2001)

Misalkan Ω, , adalah ruang peluang. Fungsi kerapatan peluang dari peubah acak diskret X adalah suatu fungsi p : S → [ ] 0 , 1 yang didefinisikan oleh

) ( )

( x P X x

p

X

= = untuk setiap xS .

Definisi 2.1.11 Fungsi Kerapatan Peluang Bersama Dua Peubah Acak diskret dan Marginal (Grimmet dan Stirzaker 2001)

Misalkan Ω, , adalah ruang peluang. Fungsi kerapatan peluang bersama dari peubah acak diskret X dan Y adalah suatu fungsi p : S × S → [ ] 0 , 1 yang didefinisikan oleh p

XY

( x , y ) = P ( X = x , Y = y ) untuk setiap

x,yS.

Fungsi kerapatan peluang marginal dari peubah acak X dan Y adalah berturut-turut

∑ ,

∑ , .

Definisi 2.1.12 Fungsi Kerapatan Peluang Bersyarat (Ross 1996)

Jika X dan Y merupakan peubah acak diskret, maka fungsi kerapatan peluang bersyarat dari X jika diberikan Y=y, terdefinisi untuk setiap y sedemikian sehingga P(Y=y)>0 adalah

|

|

,

.

(22)

Definisi 2.1.13 Bebas Stokastik Identik (Hogg et al.2005)

Misalkan X

1

, X

2

,..., X

n

adalah n peubah acak yang memiliki fungsi kerapatan yang sama yaitu sehingga

M

dan fungsi kerapatan bersamanya adalah ,

. Peubah acak X

1

, X

2

, K , X

n

disebut bebas stokastik identik.

Definisi 2.1.14 Nilai Harapan Peubah Acak Diskret (Ghahramani 2005)

Jika X adalah peubah acak diskret dengan fungsi kerapatan peluang )

( )

( x P X x

p

X

= = maka nilai harapan dari X adalah

=

x

X

x

xp X

E [ ] ( ) .

Definisi 2.1.15 Nilai Harapan Bersyarat (Ghahramani 2005)

Misalkan X dan Y adalah peubah acak diskret dengan fungsi kerapatan peluang bersyarat dari X dengan syarat Y=y adalah

|

| , maka nilai harapan bersyarat dari X dengan syarat Y=y adalah

| ∑

|

| .

Definisi 2.1.16 Fungsi Indikator (Cassela dan Berger 1990)

Misalkan A adalah suatu kejadian pada ruang peluang Ω, , . Fungsi indikator dari

A adalah suatu fungsi I

A

: Ω → [ 0 , 1 ] , yang didefinisikan

(23)

1, jika

0, jika .

Definisi 2.1.17 Himpunan P-Null (Grimmet dan Stirzaker 2001)

Misalkan Ω, , adalah ruang peluang. Himpunan P-Null didefinisikan sebagai

Ω: A, , 0 .

Definisi 2.1.18 Ruang Peluang Lengkap (Billingsley 1986)

Ruang peluang Ω, , disebut lengkap, jika

AB,B

, dan

P(B)=0

maka .

Definisi 2.1.19 Filtrasi (Grimmet dan Stirzaker 2001)

Misalkan adalah medan- σ dan , , merupakan barisan submedan- dari , disebut filtrasi jika untuk semua k ∈ .

Definisi 2.1.20 Filtrasi Lengkap (Protter 1995)

Misalkan Ω, , adalah ruang peluang lengkap. Misalkan = ; adalah sebuah filtrasi. Jika memuat semua himpunan P-Null di maka disebut filtrasi lengkap.

Definisi 2.1.21 Terukur(Measurable) (Grimmet dan Stirzaker 2001)

Misalkan X adalah peubah acak diskret yang terdefinisi pada ruang peluang Ω, ,

dan S adalah ruang state X. Jika { ω ∈ Ω ; X ( ω ) ∈ A } ∈ untuk setiap

AS,

maka X

dikatakan terukur- .

(24)

Definisi 2.1.22 Adapted (Grimmet dan Stirzaker 2001)

Misalkan Ω, , adalah ruang peluang. Barisan peubah acak ; dikatakan adapted terhadap filtrasi { jika terukur- untuk setiap .

Definisi 2.1.23 Predictable (Grimmet dan Stirzaker 2001)

Misalkan adalah filtrasi. Barisan peubah acak ; dikatakan predictable (terduga), jika terukur- untuk setiap k.

Definisi 2.1.24 Nilai Harapan Bersyarat (Shreve 2004)

Misalkan Ω, , adalah ruang peluang dan adalah submedan- σ dari .

Misalkan X adalah peubah acak yang terintegralkan pada Ω, , . Maka | disebut nilai harapan bersyarat dari X jika diketahui , didefinisikan sebagai sebarang peubah acak Y yang memenuhi:

1 Y terukur- ; 2 ∫ YdP = ∫ XdPA

A A

, ;

Persamaan | dapat ditulis | .

Teorema 2.1.25 Nilai Harapan Bersyarat (Billingsley 1986)

Misalkan X terintegralkan, dan adalah dua medan- σ yang memenuhi , maka berlaku:

| | | | | .

Teorema 2.1.26. Sifat-sifat Nilai Harapan Bersyarat (Shreve 2004) Misalkan X,Y, dan XY terintegralkan, maka berlaku:

1 | ;

2 Jika X terukur- , maka | ;

(25)

3 | | | , , skalar;

4 Jika X ≥ 0 , maka | 0;

5 Jika Y terukur- maka | | .

Definisi 2.1.27. Kontinu Absolut (Billingsley 1986)

Jika P dan P

_

adalah dua ukuran peluang pada Ω, . Ukuran peluang P dikatakan kontinu absolut ke ukuran peluang P

_

jika untuk setiap

AF,P(A)=0

mengakibatkan P

_ (A)=0,

dinotasikan P << . Jika P

_

P << dan P

_

P

_

<< P maka kedua ukuran dikatakan ekuivalen dan dinotasikan

PP_.

Definisi 2.1.28 Radon-Nikodym (Billingsley 1986)

Jika P dan P adalah dua ukuran peluang pada Ω,

_

sedemikian sehingga P << P

_

, maka terdapat peubah acak tak negatif Λ sehingga P

_

( A) =

A

Λ dP untuk semua

dinotasikan = Λ.

2.2 Rantai Markov

Definisi 2.2.1 Ruang State (Grimmet dan Stirzaker 2001)

Misalkan S adalah himpunan nilai dari barisan peubah acak, maka S disebut ruang state.

Definisi 2.2.2 Proses Stokastik (Ross 1996)

Proses stokastik X = ; terdefinisi pada ruang peluang Ω, , adalah

suatu himpunan dari peubah acak yang memetakan ruang contoh Ω ke ruang state S.

(26)

Definisi 2.2.3 Rantai Markov dengan Waktu diskret (Grimmet dan Stirzaker 2001)

Misalkan Ω, , adalah ruang peluang dan S adalah ruang state. Proses stokastik

; dengan ruang state S, disebut rantai Markov dengan waktu diskret jika untuk setiap k = {0,1,2,…}, berlaku:

| , , |

untuk semua kemungkinan nilai dari i

0

, i

1

,..., i

k

, i

k+1

S .

Definisi 2.2.4 Matriks Peluang Transisi (Grimmet dan Stirzaker 2001)

Misalkan X = ; adalah rantai Markov dengan state S berukuran N.

matriks transisi , dengan | untuk

S i

j, ∈

adalah matriks peluang transisi dari X.

Definisi 2.2.5 Rantai Markov Homogen (Grimmet dan Stirzaker 2001)

Misalkan X = ; adalah rantai Markov dengan ruang State S, dikatakan

homogen jika | | untuk

j,iS.

Definisi 2.2.6 Peluang Transisi n-step (

(a(nji))

(Ross 1996)

Misalkan X = adalah rantai Markov dengan ruang state S. Peluang transisi n-step dari X adalah peluang proses berpindah dari state i ke state j dengan n langkah yang didefinisikan oleh:

| , 0, , S.

Definisi 2.2.7 Accessible (Ross 1996)

Suatu state j disebut terakses (accessible) dari suatu state i, ditulis

ij,

jika ada

sebuah bilangan k ≥ 0 sehingga

a(jik) ≥0.

(27)

Definisi 2.2.8 Communicate (Ross 1996)

Dua state i dan j disebut berkomunikasi (communicate), ditulis

ij,

jika state i dapat diakses dari state j dan state j dapat diakses dari state i.

Definisi 2.2.9 Kelas State (Ross 1996)

Himpunan tak kosong S disebut kelas state apabila semua pasangan state yang merupakan anggota dari S berkomunikasi satu dengan yang lainnya, serta tidak ada state yang merupakan anggota S yang berkomunikasi dengan suatu state yang bukan anggota dari S.

Definisi 2.2.10 Irreducible (Ross 1996)

Rantai Markov disebut tak tereduksi (irreducible) jika hanya terdapat satu kelas state, yaitu jika semua state-nya berkomunikasi satu dengan yang lainnya.

Definisi 2.2.11 Recurrent (Ross 1996)

Peluang bahwa suatu proses yang dimulai dari state i akan bertransisi ke state j didefinisikan sebagai

. State i berulang (recurrent) jika 1.

Teorema 2.2.12 Recurrent (Ross 1996)

State i berulang (recurrent) jika

=

= ∞

0 ) ( n

n

a

ii

.

Definisi 2.2.13 (Ross 1996)

1 Suatu state i disebut memiliki periode d jika d adalah persekutuan pembagi

terbesar bagi n sehingga a

ii(n)

> 0 ;

(28)

2 Suatu state dengan periode = 1 disebut aperiodic, sedangkan state dengan periode ≥2 disebut periodic;

3 Suatu state disebut berulang positif jika state tersebut berulang serta berlaku: jika proses dimulai dari state i, maka nilai harapan dari waktu sampai proses tersebut kembali ke state i adalah bilangan berhingga;

4 Rantai Markov dengan state berulang positif dan aperiodic disebut ergodic.

Teorema 2.2.14 Nilai Harapan Rantai Markov Homogen (Ross 1996)

Misalkan ; adalah rantai Markov yang ergodic dengan ruang state S berukuran N dan misalkan A merupakan matriks peluang transisi berukuran N × N dengan A = ( a

ji

) dan | maka nilai harapan dari X dinotasikan dengan

E[ X]=

π yang memenuhi:

π

π =

A dan 1 .

1

= N

=

j

π

j

2.3 Ruang Hasil Kali Dalam

Definisi 2.3.1 Ruang Vektor (Anton dan Rorres 2004)

V disebut ruang vektor, jika untuk setiap vektor u,v,w

V dan sebarang skalar k dan l dipenuhi aksioma berikut:

1 Jika u,v

V, maka u+v

V;

2 u+v=v+u;

3 u+(v+w)=(u+v)+w;

4 Ada 0

V sehingga 0+u=u+0=u,

u

V;

5 Untuk

u

V, ada -u

V sehingga u+(-u)=(-u)+u=0;

6 Jika k adalah sebarang skalar dan u

V, maka k u

V;

7 k(u+v)=ku+kv;

(29)

8 (k+l)u=ku+lu;

9 k(lu)=(kl)u;

10 lu=u.

Definisi 2.3.2 Perkalian Dalam (Anton dan Rorres 2004)

Jika u = ( u

1

, u

2

, K , u

n

) dan v = ( v

1

, v

2

, K , v

n

) adalah sebarang vektor pada , maka hasil kali dalam euclied u.v didefinisikan oleh:

u.v= u

1

v

1

+ u

2

v

2

+ K + u

n

v

n

.

Definisi 2.3.3 Ruang Hasil Kali Dalam (Anton dan Rorres 2004)

Sebuah hasil kali dalam pada ruang vektor real V adalah fungsi yang mengasosiasikan bilangan real

u,v

dengan masing-masing pasangan vektor u dan v pada V sedemikian sehingga aksioma-aksioma berikut terpenuhi untuk semua u, v, w

V dan skalar k.

1.

u,v = v,u

;

2.

u+v,w = u,w + v,w

; 3.

ku,v =k u,v

;

4.

v,v ≥0;

dan

v,v =0

jika dan hanya jika v = 0.

Sebuah ruang vektor real dengan sebuah hasil kali dalam dinamakan ruang hasil kali

dalam real.

(30)

BAB III

MODEL HIDDEN MARKOV

3.1 State dan Proses Observasi dalam waktu diskret

Semua proses didefinisikan pada ruang peluang Ω, , . Misalkan

; adalah rantai Markov dengan state berhingga yang bersifat

homogen dan diasumsikan tidak diamati secara langsung, sedangkan

; adalah proses observasinya. Pasangan proses stokastik , merupakan model Hidden Markov.

Ruang state dari X adalah , , … , dengan 0, … ,0,1,0, … ,0 , yaitu himpunan vektor satuan di , di mana hanya elemen ke-i yang bernilai 1 dan lainnya 0.

Misalkan , , , merupakan medan-σ yang dibangkitkan oleh , , , dan merupakan filtrasi lengkap yang dibangkitkan oleh . Karena merupakan rantai Markov homogen, maka berdasarkan sifat rantai Markov diperoleh

, , ,

.

Lema 3.1.1 [Elliot et al.1995]

Misalkan merupakan peluang transisi dan merupakan matriks peluang transisi yang memenuhi ∑ 1,

maka

| | .

Bukti:

Misalkan maka | ∑

(31)

, , … , .

Sehingga dapat ditulis

. Jadi

, , … ,

. ■ Didefinisikan

(3.1) dengan

| |

|

| | | |

0.

Sehingga diperoleh persamaan state

. (3.2)

Lema 3.1.2 [Elliot et al.1995]

, . Bukti:

Karena , 1, untuk

0, untuk , maka

, ∑ ,

. ■

(32)

Jika , maka vektor , , … , merupakan nilai harapan dari , yaitu dan untuk ergodic memenuhi dan

∑ 1.

Proses state tidak diamati secara langsung namun terdapat proses observasi yaitu

, , ,

di mana bersifat bebas stokastik identik, dan saling bebas. Ruang state dari adalah , , , dengan merupakan vektor satuan di .

Misalkan , , , , , , , merupakan medan-σ dari Ω yang dibangkitkan oleh , , , dan , , , dan merupakan filtrasi lengkap yang dibangkitkan oleh . Misalkan , , , merupakan medan-σ dari Ω yang dibangkitkan oleh , , , dan merupakan filtrasi lengkap yang dibangkitkan oleh , maka diperoleh

, , , , , , , .

Lema 3.1.3 [Elliot et al.1995]

Misalkan

C = ( c

ji

)

M×N adalah matriks peluang transisi, di mana

| dan memenuhi ∑ 1, 1 , 1 ,

maka

| .

Bukti:

Misalkan

X

k

= e

i, maka

| ∑ |

, , , .

(33)

Sehingga dapat ditulis | .

Jadi | | . ■

Didefinisikan

(3.3)

dengan

| |

| | | | | |

0.

Sehingga dapat diperoleh suatu persamaan observasi

. (3.4)

Notasi 3.1.4

Misalkan , 1,

0, dan , , , ,

dengan ∑ 1.

Misalkan | . Untuk

X

k

= e

l, maka |

, |

∑ , |

|

,

, , ,

∑ , .

(34)

Sehingga dapat ditulis , | ∑ , .

Jadi , | ∑ , dan

, , , maka

| .

Lema 3.1.5 [Elliot et al.1995]

diag diag diag

dan

| |

diag diag ,

di mana diag(z) merupakan matriks diagonal yang unsur diagonalnya adalah vektor z.

Bukti:

dan .

Karena .

,

maka

diag

diag diag(

diag diag diag(

.

(35)

Lema 3.1.6 [Elliot et al.1995]

diag diag diag

dan

|

]

diag diag ,

di mana diag(z) merupakan matriks diagonal yang unsur diagonalnya adalah vektor z.

Bukti:

dan .

Karena

,

maka

diag

diag diag(

diag diag diag(

.

Sehingga didapat model hidden Markov Elliot et al. (1995) dalam waktu diskret dengan ukuran peluang P pada ruang state S sebagai berikut:

, untuk (3.5)

di mana , , A dan C merupakan matriks peluang transisi dengan

dan ,

(36)

yang memenuhi

∑ 1, 0

∑ 1, 0, dan memenuhi:

| 0, | 0

| diag diag

| diag diag .

3.2 Perubahan Ukuran

3.2.1 Teorema Bersyarat Bayes

Teorema 3.2.1 Teorema Bersyarat Bayes [Elliott et al.1995]

Misalkan Ω, , merupakan ruang peluang, merupakan submedan- dari dan merupakan ukuran peluang lain yang kontinu absolut terhadap P dengan turunan Radon-Nikodym Λ. Jika adalah sebarang peubah acak terintegralkan dan terukur- , maka berlaku

[ | | |

.

Bukti:

Menurut definisi 2.1.22 harus ditunjukkan:

(i) |

| terukur-

Karena Λ| merupakan nilai harapan dari Λ dengan syarat maka Λ| terukur- , dan Λ| yang merupakan nilai harapan dari Λ dengan syarat maka Λ| terukur- . Karena |

| merupakan pembagian fungsi terukur- , maka |

| terukur

-

.

(37)

(ii) | Λ| Λ| ,

Definisikan

|

| , untuk Λ| 0 0 , untuk Λ| 0 , maka | . Jadi terukur- .

Akan ditunjukkan

| , .

Ambil sebarang.

Misal : Λ| 0 , sehingga . Maka dari definisi 2.1.22,

Λ| 0 Λ dan Λ 0, sehingga 0 atau Λ 0

hampir pasti di G.

Selanjutnya : Λ| 0 , maka dapat dituliskan di

mana dan , sehingga

|

Λ

Λ Λ . (3.6)

Karena Λ 0 hampir pasti pada , maka

Λ 0 .

Selanjutnya

| |

|

|

Λ

| |

(38)

Λ

| |

| Λ|

| |

Λ|

Λ

Λ , maka

Λ 0 .

Sehingga persamaan (3.6) menjadi

Λ Λ

Λ

|

.

Jadi

|

| , . ■

Lema 3.2.2 [Elliott et al.1995]

Jika { merupakan barisan peubah acak yang bisa diintegralkan, maka

| |

|

.

Bukti: Serupa dengan bukti Teorema 3.2.1

(39)

3.2.2 Perubahan Ukuran

Perubahan ukuran peluang diperoleh dengan mengubah ukuran peluang asal menjadi peluang baru yang kemudian diinterpretasikan kembali ke dalam peluang asal. Perubahan ukuran ini dibatasi oleh turunan Radon-Nikodym.

Di bawah ukuran P pada Ω, dan adalah medan- yang dibangkitkan , berlaku:

• X merupakan rantai Markov yang homogen dan memenuhi , dan | 0.

• , di mana | 0 dan

merupakan peubah acak yang bergantung pada .

Akan dikontruksikan suatu peluang baru pada Ω, yang kontinu absolut terhadap P. Misalkan ukuran peluang baru pada Ω, yang dibatasi oleh turunan Radon-Nikodym

Λk.

(

3.7)

Definisikan

, (3.8)

dan

Λ ∏ , (3.9)

di mana 1,

0, . Jadi adalah fungsi tak linear dari sehingga dapat ditulis

. (3.10)

Lema 3.2.3 [Elliott et al.1995]

| 1. (3.11)

(40)

Bukti:

Berdasarkan definisi (3.8) dan (3.10), diperoleh

| ∏ 1

1 1 1

1

1 1

1

|

1

1 1

|

1

11 1 1 1 11

1

1.

Lema 3.2.4 [Elliott et al.1995]

Di bawah , , , merupakan peubah acak yang bebas stokastik identik yang menyebar seragam dengan peluang 1 pada masing-masing , 1 .

Akan dibuktikan : .

Bukti:

Dengan sifat

, | , |

| 1 ,

dan menggunakan nilai harapan di bawah ukuran peluang , Lema 3.2.2 dan Lema 3.2.3, maka

1 [ , | ,

Λ 1 1, | Λ 1 |

Λ 1 1, |

(41)

Λ 1 1, |

Λ 1|

| , | , (3.12)

berdasarkan (3.11) dan (3.12), diperoleh

1 | , |

∏ , |

∑ , |

, |

|

1

1

1 .

Karena 1 , 1, maka . Sehingga

1 1. ■

Sehingga di bawah ukuran pada Ω, akan berlaku:

• merupakan rantai Markov yang homogen dan memenuhi

, dan | 0.

• Y merupakan barisan peubah acak diskret dengan , , ,

yang bersifat bebas stokastik identik dan menyebar seragam dengan untuk 1,2, , .

• dan saling bebas.

(42)

Lema 3.2.5 [Elliot et al. 1995]

| 0.

Bukti:

Berdasarkan Persamaan (3.1), diperoleh

| | ,

|

0. ■

Lema 3.2.6 [Elliot et al. 1995]

| 0.

Bukti:

Berdasarkan Lema 3.2.5 diperoleh,

| | , |

| | 0|

0. ■

Akan dikontruksi kembali ukuran peluang P pada Ω, yang kontinu absolut pada dengan turunan Radon-Nikodym Λ sehingga di bawah P, model (3.5) dipenuhi yaitu:

• merupakan rantai Markov homogen yang memenuhi

dan | 0.

• , di mana | 0 dan

merupakan peubah acak yang bergantung pada . Misalkan

dan

, ,

,

jadi ∑ 1. (3.13)

(43)

Untuk menentukan P dari didefinisikan dan Λ yang merupakan invers dari dan Λ , yaitu

∏ , (3.14)

Λ ∏ , (3.15)

dan Λ

.

, (3.16)

dimana 1

Lema 3.2.7 [Elliott et al.1995]

1. (3.17)

Bukti:

1

|

1 1

|

1 1

| ∑

1

1|

1 1

1. ■

Lema 3.2.8 [Elliott et al.1995]

Di bawah ukuran P,

|

. Bukti:

Dengan menggunakan Lema 3.2.2

1

|

, |

(44)

Λ 1 1, | Λ 1|

Λ 1 1, | Λ 1 |

1 1, |

1 |

,

(3.18)

berdasarkan (3.17) dan (3.18) diperoleh

1| , |

∏ , |

, |

, , |

, |

( 1|

1

.

Sehingga berdasarkan notasi 3.1.4 dapat ditulis,

|

. ■

Dengan , maka

|

0.

Sehingga persamaan observasinya dapat ditulis .

3.3 Pendugaan Rekursif

Untuk melakukan pendugaan parameter, maka dibentuk suatu pendugaan rekursif dari state, banyaknya lompatan, lamanya waktu kejadian dan proses observasi.

Pada pembahasan sebelumnya merupakan filtrasi yang dibangkitkan oleh

(45)

, , , dan merupakan filtrasi yang dibangkitkan oleh , , , dan , , , .

Dari subbab 3.2, di bawah ukuran pada Ω, berlaku , di mana pada ( , memenuhi | 0, dan

{ bebas stokastik identik dengan 1 1 , serta dan saling bebas.

Definisikan

Λ , | untuk 1 , ,

sehingga

∑ ∑ Λ , |

Λ ∑ , |

Λ | . (3.19)

Lema 3.3.1 [Elliot et al. 1995]

Untuk , , , maka Λ | , ,

Bukti:

Λ | , ∑ Λ | ,

∑ Λ | , ∑ Λ | , Λ , |

, . ■

Notasi 3.3.2

Jika , merupakan barisan peubah acak bernilai skalar yang terintegralkan, dinotasikan

[Λ | .

(46)

Dengan menggunakan Lema 3.2.2 dan persamaan (3.20) maka

| Λ

Λ

.

(3.21)

Sebagai nilai awal

, di mana 1.

Misalkan 1 1,1, … ,1 . Maka

, 1 ∑ , 1.

Akibatnya

, 1 Λ | , 1

Λ , 1 |

Λ , 1 |

, 1 ) , 1 )

. (3.22)

Jika 1 maka dari (3.19), (3.20) dan (3.22) diperoleh 1 , 1

Λ | , 1 Λ , 1 | [Λ

∑ .

Misalkan proses ; bernilai skalar dan adapted terhadap serta memenuhi

, ,

∑ , , , ,

, , , 0,

(47)

di mana , { , , adalah proses predictable terhadap , bernilai skalar, merupakan vektor berdimensi N, dan merupakan vektor berdimensi M.

Notasi 3.3.3 Jika proses , adapted terhadap , dinotasikan , Λ | .

Notasi 3.3.4 Untuk penyederhanaan dinotasikan

∏ .

Teorema 3.3.5 [Elliot et al. 1995]

Untuk 1 dengan , , , adalah kolom ke-j dari

matriks dan , , , adalah kolom ke-j dari

matriks , maka

,

, , , ,

diag Λ , | .

Bukti: (Lampiran 1)

3.3.1 Penduga untuk State

Dengan menggunakan Teorema 3.3.5 dan Lema 3.2.6, ambil

1, 0, maka penduga untuk state didefinisikan

, 1 , 1 , 0 0, ,

diag Λ , 0|

(48)

∑ ,

∑ , .

Jadi

, 1

∑ , . (3.23)

Bentuk pendugaan rekursif untuk nilai harapan tak ternormalkan dari , disebut unnormalized smoother, jika diketahui , 1. Bentuk ini

dapat diperoleh dengan mengambil , , 1, 1

, 0, maka dengan menggunakan Teorema 3.3.5 diperoleh

,, , 0 0, ,

diag Λ , 0| .

, , .

Jadi

,, , . (3.24)

3.3.2 Pendugaan Banyaknya Lompatan

Banyaknya rantai Markov berpindah dari state ke state sampai waktu ke-k didefinisikan sebagai berikut:

=∑ , , .

Dengan menggunakan , maka

=∑ , ,

∑ , , , ,

, ,

, ,

, , , )

(49)

, , ,

, , , .

Dan dengan menggunakan Teorema 3.3.5 dan Lema3.2.6 dapat didefinisikan

,

, , , ,

diag Λ , |

, , , , ,

diag Λ , |

, Λ | , , ,

diag Λ , | .

Ambil , 0, , , , , 0,

sehingga diperoleh

,

, Λ , | , 0, ,

diag Λ , , |

, , , ,

diag Λ , , |

, , ∑ , , ,

diag Λ , , |

, , , , ,

diag Λ , , |

, , , ,

diag Λ , , |

, , , ,

diag Λ , | }

, , , ,

diag , , }

(50)

, , , , diag

, , ,

diag

, , , .

Jadi

,

, , , . (3.25)

Jika 1 diketahui, maka bentuk unnormalized smoother untuk adalah

Λ | , .

Ambil , 0, maka dengan menggunakan Teorema 3.3.5 diperoleh

,, , . (3.26)

3.3.3 Pendugaan Lamanya Waktu Kejadian

Misalkan banyaknya kejadian rantai Markov X berada pada state , 1 , sampai waktu ke-k didefinisikan

∑ ,

∑ , ,

, .

Dengan menggunakan Teorema 3.3.5, penduga untuk waktu kejadian dapat didefinisikan

,

, , , ,

diag Λ , |

(51)

, , , , ,

diag Λ , |

, Λ | , , ,

diag Λ , | .

Untuk , 0, , , 0, diperoleh

,

, Λ , | , 0, ,

diag Λ , 0|

, , , ,

, , , , ,

, , ∑ , , ,

, , , , ,

, , , .

Jadi

,, , , . (3.27)

Bentuk unnormalized smoother untuk jika diketahui adalah . Ambil , , 0, maka dengan menggunakan Teorema 3.3.5 diperoleh

,, , . (3.28)

3.3.4 Pendugaan untuk Proses Observasi

Banyak kejadian berada pada state , 1 , dan berada pada state , 1 , sampai waktu ke-k, didefinisikan

∑ , , , 1 , 1 ,

maka

∑ , ,

∑ , , , ,

(52)

, ,

, , .

Dengan menggunakan Teorema 3.3.7 dan Lema 3.3.2, dapat didefinisikan

,

, , , ,

diag Λ , |

, , , , ,

diag Λ , |

, , Λ , | ,

diag Λ , | .

Untuk , 0, 0, , diperoleh

,

, , 0 Λ , , | ,

diag Λ , 0|

, Λ , , | ,

, Λ , , | ,

, ,

∑ Λ , , | ,

, ,

Λ , , | ,

, , , , , ,

, , ∏ , , , ,

, , , , .

Jadi

,

, , , , . (3.29)

(53)

Bentuk unnormalized smoother untuk dan memilih ,

1 , 0, maka dengan menggunakan Teorema 3.3.7

diperoleh

,, , . (3.30)

3.4 Pendugaan Parameter

Pendugaan parameter model Hidden Markov dilakukan dengan pendugaan ulang parameter. Metode yang digunakan adalah algoritme EM dan hasilnya berupa parameter dalam bentuk pendugaan rekursif.

3.4.1 Maksimum Likelihood

Misalkan , Θ adalah himpunan ukuran peluang yang terdefinisi pada Ω, dan kontinu absolut terhadap . Misalkan , fungsi Likelihood yang digunakan untuk menghitung penduga parameter berdasarkan informasi adalah

| ,

dan Maximum Likelihood Estimation (MLE) didefinisikan oleh

arg max .

3.4.2 Expectation Maximization

Langkah-langkah Excpectation Maximization (EM) adalah:

1. Set nilai awal parameter , dengan 0.

2. Set = dan hitung . , dengan

, = log | .

3. Cari arg max , .

4. Ganti k dengan k+1 dan ulangi langkah ke 2 sampai langkah ke 4 hingga kriteria pemberhentian tercapai.

(54)

Parameter yang digunakan pada model (3.5) adalah

, 1 , , , 1 , 1 .

Akan ditentukan parameter baru dengan menggunakan algoritme EM

, 1 , , ̂ , 1 , 1 .

3.4.3 Pendugaan Parameter Notasi 3.4.3.1

Untuk proses , , ditulis | . Dalam waktu diskret, kondisi ini mendefinisikan -optional projection.

Untuk menggantikan parameter dengan pada rantai Markov , didefinisikan oleh

, , , , Λ ∏ dan Λ .

Lema 3.4.3.2 [Elliot et al. 1995]

Di bawah ukuran peluang dan misalkan , maka , | .

Bukti:

, | 1, Λ 1

Λ 1

1, Λ 1

Λ 1

Λ 1, 1

Λ 1

1, 1

1

1, 1, ,

, 1

1, ,

, 1

(55)

1, 1, 1

1,

1

1, 1 1,

1 1,

1,

1 1,

1,

1 1,

1,

1 1,

1 1 ,

1 1 1 ,

1

1 1

1

1 ,

karena ∑ 1, maka

, | . ■

Teorema 3.4.3.3 [Elliot et al. 1995]

Penduga baru untuk parameter pada waktu pengamatan diberikan oleh

.

(3.31)

(56)

Bukti:

log Λ log ∏ ∏ , , ,

, ∑ , , log log

, log log

, log ∑ , log

, log ,

di mana bebas terhadap dengan ∑ , log , sehingga

logΛ | ∑ , log

, log |

, log | |

, log . (3.32)

Untuk memenuhi ∑ 1 dengan

, ∑ , ∑ ∑ ∑ ,

∑ ∑

∑ 1

(3.33) dan

, . (3.34)

Akan ditentukan yang memaksimumkan persamaan (3.32) sebagai fungsi objektif dengan persamaan (3.34) sebagai fungsi kendala. Dengan menggunakan pengali lagrange diperoleh

, ∑ , log ∑ , .

Turunan pertama terhadap dan , serta 0 dan 0 sehingga diperoleh

(57)

0

0 (3.35)

, 0

, . (3.36)

Dari persamaan (3.35) diperoleh 0

.

(3.37)

Substitusikan persamaan (3.37) ke persamaan (3.36)

,

,

,

,

1

, ∑ , , 1

∑ ∑ ∑ , , 1

∑ ∑ ,

1

∑ 1 1

1,

sehingga , 1 , optimum bila

1 0

(58)

.

Jadi

.

.

3.4.4 Penduga Parameter ̂

Untuk mengganti parameter dengan ̂ pada matriks , didefinisikan

∏ ∏

̂ , , , Λ ∏ dan Λ .

Lema 3.4.4.1 [Elliott et al.1995]

Di bawah ukuran dan misalkan = , maka

, | ̂ .

Bukti:

, | ,

, |

|

, , 1,

, 1,

, 1,

1,

, 1,

1,

(59)

1,

1,

1,

1,

1 ,

1 ,

1

1

,

karena ∑ ̂ 1, maka

, | ̂ .

Teorema 3.4.4.2 Penduga maksimum likelihood untuk parameter ̂ pada waktu pengamatan diberikan oleh

̂ .

Bukti:

log Λ log ∏ ∏ ∏ , ,

∑ ∑ ∑ , , log ̂ log

∑ ∑ log ̂ log

∑ ∑ log ̂ ∑ ∑ log

∑ ∑ log ̂ ,

(60)

di mana bebas terhadap ̂ dengan ∑ ∑ log , sehingga

log Λ ∑ 11 log ̂

11 log ̂ |

11log ̂ |

∑ ∑ log ̂ , (3.38)

Untuk ̂ memenuhi ∑ ̂ 1,

maka

∑ ∑ ∑ , ̂ ∑ ∑ ∑ , ̂

∑ ∑ ̂

∑ 1

sehingga

∑ ∑ ̂ . (3.39)

Dengan menggunakan pengali lagrange, dapat ditentukan ̂ yang memaksimumkan persamaan (3.38) sebagai fungsi objektif dengan persamaan (3.39) sebagai fungsi kendala, sehingga diperoleh

. ̂, ∑ ∑ log ̂ ∑ ∑ ̂ .

Dengan menggunakan turunan pertama terhadap ̂ dan , serta ̂ 0 dan 0 sehingga diperoleh

̂ ̂ 0

̂ 0. (3.40)

∑ ∑ ̂ 0

∑ ∑ ̂ . (3.41)

(61)

Dari persamaan (3.40) diperoleh

̂ 0

̂

.

(3.42)

Substitusikan persamaan (3.42) ke persamaan (3.41)

∑ ∑ ̂

∑ ∑

∑ ∑

∑ ∑

1

1

1 1, ,

∑ ∑

1 1

1 1, ,

∑ ∑

1 1 ,

1

∑ 1 1

1,

sehingga ̂ , 1 , 1 optimum bila

̂ 1 0

̂ . Jadi

̂

.

(62)

3.5 Nilai Harapan

Nilai Penduga terhadap adalah

|

∑ |

∑ ∑ , |

∑ ∑ | |

∑ ∑ |

∑ ∑ .

3.5 Algoritme Pendugaan Parameter Diketahui parameter model berbentuk

, 1 , , , 1 , 1 .

Akan ditentukan parameter baru

, 1 , , ̂ , 1 , 1 ,

yang memaksimumkan pseudo-loglikelihood bersyaratnya. Algoritme untuk menduga parameter tersebut diperoleh dari Setiawaty dan Kristina (2005) dengan beberapa penambahan langkah sebagai berikut:.

Langkah 1:

Tetapkan N (banyaknya state penyebab kejadian), T (banyaknya data) dan input data .

Langkah 2:

Untuk N = 1 sampai dengan kriteria terpenuhi, maka tentukan nilai awal untuk:

dengan dan memenuhi dan ∑ 1.

Gambar

Gambar 1 Pembentukan secara skematik struktur dsDNA dari gula fosfat   sebagai  backbone  dan basa nukleotida (A)
Gambar 2 Grafik distribusi nilai dugaan urutan DNA menggunakan penduga   smoother  untuk 2 penyebab kejadian (N = 2)
Gambar 3 Grafik distribusi nilai dugaan urutan DNA menggunakan penduga  smoother  untuk 2 penyebab kejadian (N = 2)
Lampiran 4  Tabel nilai harapan model dari Program 1

Referensi

Dokumen terkait

Harmonesta sendiri berawal dari ide-ide para anggota Unit Kegiatan Mahasiswa Musik Kampus UIN Imam Bonjol Padang yang saat ini telah menjadi alumni dan senior yang telah

kelas VII SMP Negeri 1 Kabila masih mengeluh untuk mengerjakan tugas yang diberikan oleh guru, selalu berusaha untuk berkata jujur, sering memberikan

Segala puji bagi Allah SWT yang telah memberikan rahmat dan hidayah- Nya, sehingga penulis dapat menyusun dan menyelesaikan skripsi ini yang berjudul Pengaruh

Faktor konversi ini dapat diartikan sebagai dari pengolahan 100 kg ubi kayu diperoleh 20 kg tapioka kasar (20%) dan 6 kg ampas kering (6%). Koefisien tenaga kerja adalah jumlah

44 20 Sinopsis Kursus Universiti/ Program Synopsis of University 45 21 Sinopsis Kursus Teras Diploma Reka Bentuk dan Pembangunan Permainan/ Synopsis of Core Courses- Diploma

Ang sarbey ay naglalaman ng sampung katanungan na idinisenyo upang malaman kung ang mga mag- aaral ba ay may ideya sa konsepto ng mga kakulangan sa kagamitan at pasilidad ng

Untuk alasan inilah Anda tidak dapat mengatur kata sandi admin jika kata sandi sistem atau kata sandi hard drive telah diatur. Oleh karena itu, kata sandi admin harus

diberdayakan dan mampu menyalurkan segenap kemapuan untuk bersaing dalam olahraga prestasi serta memajukan keolahragaan nasional. Kabupaten Jepara adalah suatu daerah yang sudah