Departamento de Ciências Biológicas, Florida State University, Tallahassee, FL, 32306-4295, EUA
INTRODUÇÃO
Departamento de Ciências Biológicas, Universidade do Kuwait, Safat, 13110, Kuwait
Departamento de Ecologia e Biologia Evolutiva, Tulane University, New Orleans, LA, 70118-5698, EUA
PALAVRAS-CHAVE ADICIONAIS: morfologia dos apêndices – biogeografia – massa corporal – disparidade – diversidade – oportunidade ecológica – elevação – taxa evolutiva – fenótipo – América do Sul.
BADER H. ALHAJERI1,2*, JOHN J. SCHENK1,3 e SCOTT J. STEPPAN1
Diversificação ecomorfológica após colonização continental em roedores muroides (Rodentia: Muroidea)
–. Com 3 figuras.
*Autor correspondente. E-mail: [email protected]
© 2015 The Linnean Society of London, Biological Journal of the Linnean Society, 2015, , Revista Biológica da Sociedade Linneana, 2015,,
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–
1953; Futuyma, 1986; Schluter, 2000a; McCormack & Smith, 2008) e (2) um declínio subsequente mais gradual (frequentemente dependente da densidade, Rabosky & Lovette, 2008) na taxa de diversificação filogenética e fenotípica como resultado do aumento da competição à medida que o número finito de nichos é preenchido ( Walker & Valentine, 1984; Baldwin & Sanderson, 1998;
Sch-luter, 2000a; Lovette, Bermingham & Ricklefs, 2002; Harmon et al., 2003, 2008a, b, 2010; Yoder et al., 2010). O declínio concomitante nas taxas deverá ocorrer, a menos que algum subconjunto de linhagens irrompa em novas zonas adaptativas (criando a sua própria OE, Schluter, 2000a) ou o aumento das taxas de extinção apague a diversidade anterior. Estudos encontraram muitos casos de surtos iniciais de diversificação líquida que geralmente são seguidos por um declínio dependente da densidade na taxa de diversificação (Harmon et al., 2003; Ruber, Zardoya & Ortÿ, 2005; Kozak, Weisrock & Larson, 2006; McKenna
& Farrell, 2006; McPeek, 2008; Phillimore & Price, 2008).
A generalidade da radiação adaptativa na diversificação evolutiva tem sido frequentemente investigada recentemente usando o modelo de oportunidades ecológicas (EO) (Har-mon et al., 2003, 2008a, b, 2010; Rabosky & Lovette, 2008). As causas da OE incluem transições biogeográficas, extinções em massa de concorrentes e/ou a evolução de inovações importantes, que permitem que as linhagens explorem zonas adaptativas novas e subutilizadas e levam a uma rápida divergência adaptativa (Simpson, 1953; Schluter, 2000a; Grant & Grant, 2008; Yoder et al., 2010). Duas previsões principais da OE são: (1) um aumento precoce na taxa de diversificação filogenética e fenotípica (indicando que as linhagens estão aproveitando o espaço de nicho relativamente vazio como consequência de zonas adaptativas subutilizadas) (Simpson,
€
Recebido em 7 de julho de 2015; revisado em 28 de agosto de 2015; aceito para publicação em 28 de agosto de 2015
O surgimento de clados excepcionalmente diversos é frequentemente atribuído a oportunidades ecológicas. Por exemplo, a diversidade excepcional na mais diversa superfamília de mamíferos, os roedores muroides, foi explicada em termos de múltiplas radiações adaptativas independentes. Se múltiplos eventos de oportunidade ecológica são responsáveis pela geração da diversidade muroid, esperamos encontrar evidências de que estas linhagens se diversificam ecologicamente após a dispersão em novas áreas biogeográficas. No presente estudo, testamos as previsões de oportunidades ecológicas baseadas em características usando dados sobre tamanho corporal, apêndices e elevação em combinação com dados publicados anteriormente sobre transições biogeográficas e uma filogenia molecular calibrada no tempo. Identificamos fraco ou nenhum apoio à diversificação ecológica inicial após as colonizações iniciais de todas as regiões continentais, com base em múltiplos testes, incluindo testes de altura de nós, disparidade através de gráficos de tempo, comparação de modelos evolutivos e análise bayesiana de misturas macroevolutivas. Os clados identificados com maiores taxas de diversificação, não associados a transições geográficas, também não apresentaram padrões de divergência fenotípica previstos pela oportunidade ecológica, o que sugere que a diversidade filogenética e a disparidade fenotípica podem estar dissociadas em muroides. Estes resultados indicam que as mudanças nas taxas de diversificação e nas oportunidades ecológicas mediadas biogeograficamente são maus preditores de padrões de diversidade fenotípica em muroides. © 2015 The Linnean Society of London, Biological Journal of the Linnean Society, 2015, 00, 000–000.
Clabaut et al., 2007) e muitos aspectos da vida de um animal para responder à pergunta: o que acontece com a diversidade
diminuir a disparidade esperada (média ou variância), desde que seja aleatória em relação ao fenótipo
poder estatístico para detectar assinaturas de OE. Muitos as previsões fenotípicas do modelo. Schenk
e outros, 2013; Tremoços do Novo Mundo: Drummond et al.,
outros fatores não biogeográficos (por exemplo, inovações importantes ou extinções em massa de concorrentes).
filogenias moleculares encontraram taxas de diversificação amplamente variadas entre subclados (Fabre et al., 2012;
Roedores muroides, em particular, são perfeitamente adequados
quando a diversidade excepcional de espécies não é estimada.
colonização americana) das seis colonizações continentais primárias e nenhuma das colonizações secundárias se enquadra em todas as previsões filogenéticas do
e outros. (2013), que estudaram o efeito das transições biogeográficas entre os domínios continental e biogeográfico no processo de diversificação dos muroides.
e outros. (2013) para testar as previsões fenotípicas do
1985; Jansa & Weksler, 2004; Steppan et al., 2004;
representam a maior parte da biodiversidade. No entanto, estudos recentes outros mecanismos (por exemplo, extinções em massa de concorrentes ou inovações importantes) que não tinham testado.
com nicho. A massa corporal é indiscutivelmente o
região; três deles eram 'virgens', o que significa que nenhum
2000a). Também testamos as duas previsões fenotípicas do modelo EO acima mencionadas em linhagens que
diversidade de muroids foi atribuída a vários
apenas padrões filogenéticos e não investigou Rabosky e Lovette, 2008; Caracóis terrestres de Galápagos: Parent &
Crespi, 2009; Lagartos Anolis do Caribe: Mahler
características que podem fornecer evidências para OE em relação
essas linhagens podem estar experimentando EO impulsionada por em pequenos clados, no entanto, pode não ter suficiente
radiação bicontinental de primatas: Tran, 2014).
secundário (muróides presentes em colonizações anteriores). EO não explicou bem os padrões desiguais de diversidade nos clados muroides; apenas um (Sul
detectado como um padrão de divergência fenotípica e taxa evolutiva excepcionais (Harmon et al., 2003; Slater et al., 2010; Martin &
Wainwright, 2011), mesmo
& Anderson, 2004) e análises recentes que utilizaram
O presente estudo segue diretamente de Schenk
análise e o quadro de diversificação da Schenk
Antártica e Nova Zelândia (Flynn, Jacobs & Lindsay,
do que as radiações continentais ou marinhas que transições, que foram sugeridas para serem conduzidas por
2000b) e, portanto, testamos as previsões de OE baseadas em características em um conjunto de características com forte associação por um declínio gradual (Simpson, 1953; Schluter,
diversidade (Musser & Carleton, 2005). O excepcional
& Reimchen, 2005; Toutinegras norte-americanas:
nessa taxa). Essas análises, no entanto, examinaram atrasado e, entre esses estudos, apenas alguns casos
ausência de muroides ou parentes próximos nos colonizados
pequenos roedores estavam presentes) e 22 como
Schenk et al. (2013) constataram elevadas taxas de diversificação (independentemente da transição biogeográfica);
explosões independentes de diversificação (Steppan, Adkins e outros, 2010; Mahler et al., 2013). Análises realizadas
amostragem (Foote, 1997), em contraste com estimativas de diversidade de espécies. Portanto, a evidência de OE ainda pode ser 1999; Kozak et al., 2006; Rowe e outros, 2011).
No presente estudo, utilizamos a biogeografia Steppan, 2013; Aves do Himalaia: Price et al., 2014;
e se expandiu sequencialmente para a maioria dos habitats terrestres em todos os continentes e grandes massas de terra, exceto
taxas em linhagens não associadas a dados biogeográficos parte porque são menores e mais tratáveis
Marrom, 1995). O comprimento relativo da cauda é fortemente características que estão correlacionadas com nichos (Schluter, explosão na evolução fenotípica e disparidade seguida superfamília diversificada de mamíferos, com mais de 1.600 espécies,
representando mais de 28% das espécies de mamíferos
diversidade relativamente baixa e distribuições geográficas estreitas (por exemplo, esgana-gatas na Colúmbia Britânica: Nosil
taxa de diversificação seguida por um declínio significativo Testes das previsões fenotípicas de OE têm
categorizando seis deles como primários (definidos pelo preditor de dieta (Schluter, 2000b; Kozak et al., 2005;
bem como o poder estatístico proporcionado por eventos evolutivos replicados (tecnicamente pseudo-réplicas; múltiplas colonizações independentes de regiões continentais),
e/ou escalas geográficas (por exemplo, pássaros-de-forno da América do Sul: Derryberry et al., 2011; donzelas: Frederich
Marshall, 2009; Harmon et al., 2010), não
(Foote, 1993, 1997; Slater et al., 2010). Da mesma forma, as estimativas de variância morfológica devem ser imparciais corresponder às expectativas (Lovette & Bermingham,
interações com o meio ambiente (LaBarbera, 1989;
quando as linhagens experimentam vastas novas oportunidades ecológicas ao colonizar novas regiões continentais?
2012; roedores muroides cosmopolitas: Schenk, Rowe &
esses estudos também são realizados em sistemas insulares, em e outros. (2013) também detectaram aumento da diversificação
Espera-se que as previsões de EO se apliquem principalmente a Schenk et al., 2013). Muróides originados na Eurásia
modelo de OE mediado geograficamente: após as colonizações continentais primárias, haverá um
A maioria dos estudos de OE foi conduzida em clados de
Modelo EO (explosão significativa nos primeiros estudos filogenéticos
como um sistema modelo para explorar EO. Eles são os mais
Eles identificaram 28 eventos de colonização continental, característica ecologicamente importante porque é um importante Fabre et al., 2012; Schenk et al., 2013). Assim, a radiação mur-óide
fornece numerosos experimentos de EO, como começaram a explorar esses padrões em clados maiores
Embora a extinção possa apagar os padrões de diversificação através da poda de linhagens e, assim, apagar a assinatura de uma explosão inicial na diversificação (Quental &
padrões de morfologia ecologicamente importantes
DIVERSIFICAÇÃO FILOGENÉTICA E ENQUADRAMENTO BIOGEOGRÁFICO
© 2015 The Linnean Society of London, Biological Journal of the Linnean Society, 2015, ,
métodos para detectar mudanças nas taxas de diversificação: D2 de múltiplas colonizações). Isto significa que, em
Regra de Allen, segundo a qual tendem a aumentar com
colonizações continentais primárias. Um objetivo menor índice ecológico direto como nas características univariadas, eles
O conjunto de análises serve como um teste preliminar da associação entre diversificação filogenética e diversificação fenotípica em muroids.
América do Sul em seguida, aproximadamente 12,3 milhões de anos, e as radiações correspondiam às previsões filogenéticas do EO.
13 calibrações fósseis. Utilizamos os 28 dados biogeográficos
& Dudley, 2006; Cadena, 2007) e é um importante A morfologia do apêndice é baseada em uma multivariada
foram detectados por todos os métodos. Nós analisamos o et al., 2013) e seus descendentes diretos acumularam 31 espécies que permaneceram na Eurásia (das quais
atribuiu-lhes apenas os descendentes diretos e
suporte para gatilhos não mediados geograficamente de com a marcha, particularmente com locomotores bípedes em
acúmulo de 143 espécies (28 amostradas).
Utilizamos o cronograma de Schenk et al. (2013)
Madagascar tem aproximadamente 24,5 milhões de anos e acumulou 27 espécies (10 amostradas). Sudeste da Ásia
Figura S1). Nós nos concentramos em colonizações primárias
variação entre espécies e complementar análises de
de uma região, haveria uma explosão de divergência em relação às taxas de fundo, seguida por um declínio na
elevação). Embora esses eixos de PC não tenham sido usados como
21,4 Mya, o que levou ao acúmulo de 194 espécies (das quais 39 foram amostradas). Muróides colonizados
que Schenk et al. (2013) encontrou correspondência com
GHR, IRBP e RAG1) totalizando 6.720 pb, e usado
saltitar; Alexandre e Vernon, 1975; Éguas, 2009).
Porter et al., 2002; Navas, 2002; Salão, 2005; Altshuler
radiações secundárias, e também porque nenhuma radiação secundária
MEDUSA (Alfaro et al., 2009), e nem todos os nós Os muroides da coroa originaram-se na Eurásia (Schenk
a região biogeográfica antes das análises de diversificação fenotípica.
Para colonizações primárias,
também experimentam os dois padrões principais acima mencionados esperados pelo modelo EO, que podem fornecer
(relação entre o comprimento da cauda e o comprimento da cabeça-corpo), está correlacionado
Sahul, aproximadamente 9,4 Mya, o que levou ao local
espécies (24 amostradas). A América do Norte foi então colonizada por volta de 27,4 milhões de anos, o que levou ao acúmulo de 156 espécies (35 amostradas). Muróides colonizados
regiões (Fig. 1, consulte também informações de apoio,
as duas principais previsões fenotípicas do modelo EO mediado geograficamente: seguindo a colonização
eixos componentes (PC)] que maximizam
caudas curtas em escavadores (onde as caudas têm pouca utilidade), e com caudas longas em espécies arbóreas (úteis para
que inclui 297 espécies muroides amostradas proporcionalmente
parece ter sido colonizado pela primeira vez aproximadamente devido ao possível efeito de incumbência limitando
essas taxas. Testamos nosso objetivo maior em todas as linhagens as espécies irmãs divergem em vários táxons (Endler, 1982;
espécie cursorial (contrabalançar a alta amplitude
espécies que posteriormente se dispersaram para fora da região biogeográfica antes das análises de diversificação fenotípica.
foi estimado usando quatro genes nucleares (BRCA1,
espécies podadas que posteriormente se dispersaram
ao comprimento cabeça-corpo), semelhante ao comprimento relativo da cauda
associado ao aumento das taxas de diversificação filogenética (independentemente das transições biogeográficas)
testes de cladogênese (Purvis, Nee & Harvey, 1995; Har-mon et al., 2008b) e a abordagem de seleção de modelo de critério de informação de Akaike (AIC) passo a passo em
A última região a ser colonizada por muroides foi
acumulou uma riqueza de espécies de aproximadamente 76 determinar se as previsões de OE baseadas em características correspondem à colonização das principais áreas biogeográficas
O objetivo principal do presente estudo é testar que é usado para extrair um conjunto de variáveis [principal correlacionado com locomoção e estilo de vida, com muito
Schenk et al. (2013) detectaram mais de 20 mudanças nas taxas de diversificação para clados não associados a transições geográficas.
Schenk et al. (2013) usaram três
biotas modernas da África e da Eurásia, que são construídas
extinção de concorrentes. Além disso, o segundo conjunto (Bermann, 1985). Espera-se que o comprimento de todas as
extremidades, incluindo o comprimento das orelhas, varie de acordo com
temperaturas crescentes (Allen, 1877). Finalmente, a preferência elevacional é um importante eixo ecológico sobre o qual equilíbrio; Lêmen, 1980; Fooden & Albrecht, 1999) e
parâmetros (Chan & Moore, 2002, 2005), relativos clados descendentes de cada colonização, podamos à diversidade total dos clados. Este cronograma
do presente estudo é testar se os clados que são
pode refletir o uso do habitat e a ecologia geral. Por exemplo, o comprimento relativo do retropé (relação entre o comprimento do retropé
acumulou 335 espécies naquela região (70 amostradas).
Nos clados descendentes de colonizações primárias,
10 foram amostrados). A transição biogeográfica mais antiga foi para a África em 34,1 Mya e esta linhagem
determinante ambiental do habitat.
ordenação dos comprimentos do corpo, cauda, retropé e orelha,
transições identificadas por Schenk et al. (2013) para
Independentemente dos nós associados às transições geográficas (eventos de EO identificados a priori),
suas radiações autóctones, tratando as colonizações posteriores como radiações secundárias (em particular, as
EO nesses clados, como inovações importantes ou
DIVERSIFICAÇÃO ECOMORFOLÓGICA MURÓIDE 3
características individuais (massa corporal, comprimento relativo da cauda e
ambientes desérticos com retropé alargado
– MATERIAL E MÉTODOS
Nesomyidae América do Sul (D9) Sudeste Asiático (Murinae) (D4)
América do Norte (Cricetidae)
A
B
Archboldomys luzonensis Sigmodontomis alfari
Dendromus mesomelas
Heimyscus fumosus
Limnomys sibuanus
Saccostomus campestris Sooretamys ratticeps
Mus cervicolor
Bandicota bengalensis Oligoryzomys microtis
Gerbillus vallinus Niviventer culteratus Apodemus agrário Auliscomys sublimis
Acomys ignitus Zygodontomis brevicauda
Vandeleuria oleracea
Melasmotrix naso
Eliurus tanala Calomys lepidus
Thomasomys notatus
Onychomys leucogaster
Typhlomys cinereus
Melomys rufescens Akodon aerosus baliolus
Osgoodomys banderanus
Pseudomys australis
Neodon irene Scotinomys teguina Brucepattersonius igniventris
Ondatra zibethicus
Hydromys crisogaster Oryzomys couesi
Hyomys golias
Dendromus insignis
Rattus leucopus Mastomys hildebrandti
Neacomys minuto
Petromyscus monticularus
Dominador de paruromia
Desmodillius auricular Oecomys superans
Apodemus speciosus
Niviventer Excelsior
Uranomys ruddi Andalgalomys pearsoni
Reithrodon auritus
Maxomys surifer Abrotrix andinus
Sigmodon arizonae
Gymnuromys roberti
Grammomys dolichurus
Dipodillus dasyurus
Calomyscus baluchi Wiedomys pyrrhorhinos
Oenomys hipoxanthus
Nyctomys sumichrasti
Xenomys nelsoni Reitrodontomis gracilis Akodon mimus
Chionomys nivalis
Leggadina forresti Kunsia tomentosus
Neotoma bryanti
Abeomelomys sevia
Cricetulus migratório Nectomias apicais
Macrorromia maior Myomyscus brockmani
Rattus sordidus
Malacotrix típica
Apomys hylocoetes Praomys jacksoni
Rattus exulans Phyllotis xanthopygus
Transandinomys talamancae
Lophuromys zena Dacnomys millardi Apodemus sylvaticus Graomys griseoflavus
Lemniscomys barbarus
Micromys menos
Brachyuromys betsileoensis Abrotrix longipilis
Grammomys ibeanus
Sigmodon alstoni
Gerbillus nanus Neotomys ebriosus
Peromyscus crinitus
Cannomys badius
Otomys denti Rhipidomys macconnelli
Peromyscus fraterculus
Uromys caudimaculatus
Neotoma cinera Melanomys caliginosus
Mammelomys lanosus
Cricetulus griseus
Rattus novaeguineae Imitador de anisomia Zelotomys hildegardeae
Steatomys parvus
Rattus tiomanicus Praomys tullbergi
Microryzomys minuto
Mus cookii
Bullimus bagobus
Eliuro menor Calomys venustus
Mylomys dybowskii
Crateromys heaneyi Notiomys edwardsii
Tylomys nudicaudus
Hypogeomys antímena
Meriones shawi Hybomys univittatus Andinomys edax
Tachyoryctes splendens Megadontomys thomasi
Parotomys brantsii
Microtus montanus Peromyscus aztecus Akodon boliviensis
Microtus guentheri
Mesembriomys gouldii Thaptomys nigrita
Reitrodontomis megalotis
Mayermys ellermani Mastomys erythroleucus
Rattus giluwensis
Lemmus sibiricus
Rhynchomys isarogensis
Rattus villosissimus Hylomyscus stella
Cricetomys gambiano Pseudorizomis simplex
Mus terricolor
Rattus norvegicus Oligoryzomys longicaudatus
Gerbillurus paeba Niviventer confucianus Mus pahari Loxodontomis micropus
Nephelomys livipes
Deomys ferrugineus Malacomys longipes
Chiromyscus chiropus
Monticolomys koopmani Ototylomys phyllotis
Golunda Elliott
Hodomys alleni
Myospalax aspalax Thomasomys cinereiventer
Neotomodon alstoni
Microtus californicus
Solomys salebrosus Akodon Kofordi
Peromyscus polionotus
Mastacomys fuscus
Lasiopodomys mandarinus Baiomys musculus Oxymycterus nasutus
Leptomys elegans
Fenacomys intermedius Aegialomys xanthaelous
Phodopus sungorus
Pogonomys macrourus Praomys degraaffi
Tarsomys apoensis Cerradomys subflavus
Mystromys albicaudatus
Bunomys crisocomus Oecomys concolor
Tatera robusta Apodemus semotus
Cremoriventer Niviventer
Acomys russatus Tapecomys wolffsohni
Arvicanthis neumani
Maxomys bartelsii Scolomys juruaense
Delomys dorsalis
Voalavo gymnocaudus
Phloeomys sp.
Dasymys incomtus Juliomys pictipes
Paramelomys levipes
Microtus arvalis Reitrodontomia creper Torques Akodon
Notomys fuscus
Arvícola terrestris Lenoxus apicalis
Ocrotomys nutali
Prometheomys schaposchnikowi
Parahidromys asper Oryzomys palustris
Chiruromys vates
Rattus verecundus Stenocephalemys albipes
Dendromus nyasae
Dados do Apomys
Sundamys muelleri
Lophuromys flavopunctatus Phyllotis andium
Apodemus mystacinus
Oecomys bicolor
Margaretamys elegans Graomys centralis
Chinchilula sahamae
Lophiomys imhausi Crunomys melanius Arvicanthis niloticus Abrotrix jelskii
Brachytarsomys albicauda Sigmodon hispidus
Grammomys macmillani
Gerbillus gerbillus
Calomyscus sp.
Euneomys chinchilloides
Peromyscus boylii
Microtus chrotorrino
Otomys anchietae Thomasomys aureus
Peromyscus eremicus
Clethrionomys gapperi
Zyzomys argurus Scapteromys tumidus
Neotoma desvio
Mallomys rothschildi
Cricetus cricetus
Millardia Kathleenae Nectomia escamipes
Lorentzimys nouhuysi Colomys goslingi
Chiropodomys gliroides
Steatomys krebsi
rattus rattus Praomys misonnei
Neacomys espinhoso
Delanymys brooksi
Leopoldamys sabanus Tokudaia osimensis Calomys calosus
Lemniscomys striatus
Batomys granti
Nesomys rufus Geoxus valdivianus
Rheomys thomasi
Taterillus emini Aethomys namaquensis Irenomys tarsalis
Habromys lepturus
Rhizomys pruinosus
Otomys angoniensis
Microtus richardsoni Rhipidomys masticalis
Conilurus penicillatus
Peromyscus californicus Necromys amoenus
Reitrodontomis fulvescens
Mesocricetus auratus
Pogonomys loriae
Rattus pretor Chrotomys gonzalesi Hylomyscus parvus
Holochilus sciurus
Beamys hindi
Mus booduga
Diplotrix legata
Meriones unguiculatus Oligoryzomys fulvescens
Mus musculus
Berylmys bowersi Phyllotis osilae
Nephelomys keaysi
Lophuromys sikapusi Carpomys phaeurus Rhabdomys pumilio Chelemys macronyx
Tylomys watsoni
Macrotarsomys bastardi
Stochomys longicaudatus
Nanospalax ehrenbergi Punomys kofordi
Peromyscus mexicanus
Melomys cervinipes
Microtus pennsylvanicus Akodon lutescens
Peromyscus leucopus
Microtus kikuchii
Condicionador Leporillus Oxymycterus hiska
Istmomys pirrensis
Xeromys myoides
Synaptomys cooperi Neotoma floridana
Mya
Figura 1. Cronograma de roedores muroides modificado de Schenk et al. (2013). Aumentos significativos na diversificação filogenética (D1-D9) e colonizações continentais primárias (ver informações de apoio, Fig. S1) (ambos detectados por Schenk et al., 2013) são indicados (Sahul = supercontinente da Austrália e Nova Guiné), junto com os principais grupos taxonômicos.
Os retângulos indicam os ramos onde houve um aumento máximo da taxa a posteriori (MAP) (análise BAMM) com base na análise de: SE1-2, taxas de especiação-extinção; EL1-3, taxas evolutivas de elevação; MA1-2, taxas evolutivas em massa; PC1.1, componente principal (PC)1 das taxas evolutivas da morfologia do apêndice; PC2.1-3, PC2 das taxas evolutivas da morfologia do apêndice. Nota: O BAMM não detectou nenhuma desaceleração nas taxas e a árvore MAP para o comprimento relativo da cauda não indica mudanças nas taxas. A árvore da Fig. 1B é a continuação da árvore da Fig. 1A.
10
50
0 30
40 10 0 Mya
20
30 20
MA2 SE1
D7
D2
Murídeos
D6
Calomyscidae
MA1
Platacanthomyidae
PC1.1 Spalacidae
EL2
PC2.3
D3
D5
PC2.2
EL1 PC2.1
EL3 SE2
Eumuróide (D8) África (D1)
Sahul
Madagáscar Para a Figura 1B (Muridae)
Para a Figura 1A Gerbilinos
Deomyinae Tylomyinae
Arvicolinae
Lophiomyinae Cricetinae
Neotominae Sigmodontinae
© 2015 The Linnean Society of London, Biological Journal of the Linnean Society, 2015, , COLEÇÃO DE DADOS
R2adj.
análise (incluindo PPCA) em análises comparativas,
Figura S2). Porque a nossa escolha do método de correção de tamanho muroides; no entanto, quando possível, os dados foram calculados em média
contra o primeiro PC dos dados agrupados, sendo este último utilizado como medida de tamanho (McCoy et al., 2006).
e elevações máximas) foram coletados de Musser
exibindo as quantidades máximas de evolução
foi estimado usando análise de componentes principais filogenéticos (PPCA) (Revell, 2009) após correção de tamanho filogenético (Revell, 2009) seguindo o código
massa, comprimento relativo da cauda (comprimento bruto da cauda dividido por
Como a escolha da correção de tamanho tem o potencial de afetar os valores residuais resultantes (Jungers,
com cuidado.
taxa de erro tipo 1 ao levar em conta as relações filogenéticas, tornando- a mais conservadora do que a análise PC tradicional em análises comparativas (Revell,
um valor de 0,1 mm foi adicionado a todas as espécies para contabilizar
como tamanho relativo das extremidades; o segundo eixo foi o mais comprimento cabeça-corpo transformado em logaritmo, transformado em logaritmo
(massa corporal, comprimento relativo da cauda e elevação), um
variável em relação à massa corporal. O segundo método foi
comprimento da orelha (todos mm) e também elevação (m asl) (ver
a partir de análises de regressão de mínimos quadrados de cada característica
comprimento da orelha transformado em log. O primeiro e o segundo eixos filogenéticos do PC descreveram as combinações de características fontes, quando disponíveis, para minimizar os efeitos de valores
discrepantes e dados relatados incorretamente (ver informações de apoio, Tabela S1). O dimorfismo sexual é incomum em
versão 6.0 (Google, 2010). Realizamos análises de evolução fenotípica (veja abaixo) em corpos transformados em log
1–9).
todas as análises subsequentes.
(com base nos comprimentos cabeça-corpo, cauda, patas traseiras e orelhas)
mas interpretamos nossos resultados das análises de PC foi realizado utilizando log de massa corporal. PPCA reduz
comprimento também foram transformados em log, embora somente após
dois métodos não filogenéticos para todas as quatro características (todas
primeiro eixo foi fortemente correlacionado com todas as medidas, exceto o comprimento do corpo e pode ser considerado
O PPCA foi conduzido em um conjunto de dados que incluía
fortes expectativas a priori de associação ecológica
comprimento cabeça-corpo, comprimento da cauda, comprimento da pata traseira e
resíduos obtidos de dois métodos comuns (não filogenéticos) de correção de tamanho. O primeiro método calculou os resíduos de uma regressão linear de cada
que foram identificados por dois ou mais métodos, bem como
comprimento da cauda, comprimento da pata traseira transformada em log e
índice mais exploratório da morfologia do apêndice
Informações de apoio, Tabela S1). Os valores médios de característica e elevação foram calculados usando literatura múltipla
usou apenas as variáveis filogenéticas corrigidas pelo tamanho em Pontuações AIC no MEDUSA (Fig. 1; nós de diversificação
e, portanto, analisamos os componentes individuais espécimes de Arctos (2011) usando GOOGLE EARTH,
(Paradis, Claude & Strimmer, 2004) em R (R Development Core Team, 2012). Correção de tamanho filogenético
foram altamente correlacionados com os resíduos obtidos a partir do
o comprimento da cabeça-corpo e o comprimento da pata traseira foram normalizados com transformações logarítmicas; comprimento da orelha e cauda
as consequências da divergência seletiva que as características individuais, responsáveis por menos variância, não têm. O Como complemento às análises dos três traços individuais acima
mencionados para os quais temos
literatura (fontes primárias e publicações resumidas; Nowak, 1999) para massa corporal (g), bem como
obtido por correção de tamanho filogenético com o radiações descendentes de nove nós: todos os quatro nós
correlacionado, inversamente, com o comprimento da cauda (Tabela 1). Nós
recentemente levantaram preocupação em relação ao uso de PC cauda (=0mm). Dados de elevação (média do mínimo
análises usando resíduos não filogenéticos corrigidos por tamanho e obtivemos resultados altamente semelhantes (fornecemos um exemplo nas informações de apoio,
não pareceu afetar significativamente os resultados, como cinco nós adicionais que receberam o maior
a maioria dos métodos de evolução de características existentes são univariados,
& Carleton (2005) e coordenadas GPS dos comprovantes de números iguais de homens e mulheres. Massa corporal,
Resíduos obtidos da correção de tamanho filogenético
variação na evolução de características correlacionadas e pode detectar
publicado na Revell (2009) usando a biblioteca APE
> 0,90; P < 0,000001; consulte Informações de apoio Compilamos dados para adultos de cada espécie do
Falsetti & Wall, 1995), comparamos os resíduos
comprimento bruto cabeça-corpo), bem como elevação bruta.
fortemente correlacionado com o comprimento da orelha e moderadamente
2009). Embora Uyeda, Caetano & Pennell (2015) para Nannospalax ehrenbergi não ter orelha visível ou
DIVERSIFICAÇÃO ECOMORFOLÓGICA MURÓIDE 5
'cisalhamento', um método que calcula os resíduos
ção, Tabela S2). Além disso, repetimos vários dos nossos
–
0,0026
6
Comprimento da cauda
0,5618
0,0014
PC4
0,9219 0,0674
0,1918 PC2
variação
13 Variável
0,0184 Autovalores
0,0548
0,0003
Os autovalores da análise do componente principal filogenético (PC) indicam a morfologia residual após a remoção da covariância filogenética e não correspondem aos normais
Comprimento do retropé
Tabela 1. Carregamentos da análise de componentes principais
0,0026 0,5499
29
0,1411
0,6354 Comprimento do corpo 0,2735
PC3
0,8271
0,3780 PC1
% Explicado
Autovalores de análise de PC (Polly et al., 2013).
0,3545
0,0006 52
na morfologia do apêndice
Comprimento da orelha
0,8828
0,5071
Testamos a previsão de EO de um aumento significativo na taxa de evolução fenotípica (Schluter, 2000a) usando o teste de taxa censurada (CRT) sob movimento browniano, conforme implementado em Brownie v2.1 (O'Meara et al., 2006). O CRT compara o ajuste de dois modelos de evolução aninhados: um modelo de taxa única para toda a árvore e um modelo de duas taxas, com taxas de primeiro plano e de fundo separadas, onde as taxas de primeiro plano são aplicadas às radiações após
colonizações continentais. Os dois modelos foram otimizados separadamente com ML (O'Meara et al., 2006) e o ajuste dos modelos foi avaliado com o AIC (Akaike, 1974).
Testamos a previsão EO de um declínio na taxa de evolução fenotípica ao longo do tempo (Schluter, 2000a) usando o teste de altura do nó (NHT) (Freckleton &
Harvey, 2006) e testando o ajuste do modelo Early Burst (EB). (Harmon et al., 2010) conforme implementado nas bibliotecas APE e Geiger em R, respectivamente. O NHT testa a relação entre os valores absolutos dos contrastes independentes padronizados (IC) (Felsenstein, 1985) das características com a idade do nó que elas subtendem.
Em nosso NHT, correlacionamos a idade do nó (em vez da altura do nó) com os contrastes independentes padronizados porque o APE usa a idade do nó nos cálculos; assim, nossas previsões sobre o sinal da relação foram opostas às do NHT padrão. Como os ICs são parâmetros de taxa browniana para os ramos sobre os quais são calculados, uma relação positiva significativa entre a idade do nó e o valor de contraste absoluto indica que as taxas de evolução desaceleraram ao longo do tempo (Garland, 1992; McPeek, 1995), como seria de esperar por espécies subdividindo e preenchendo nichos de forma mais precisa ao longo do tempo (Freckleton &
Harvey, 2006).
a disparidade foi menor (e a disparidade entre subclados maior) do que o esperado sob o movimento browniano, o que é um resultado consistente com o modelo EO (Harmon et al., 2003). A significância foi avaliada calculando o MDI entre cada um dos 1.000 conjuntos de dados simulados e o conjunto de dados observado e depois contando a proporção de casos em que a pontuação do MDI é positiva (a = 0,05). Como o código TDT em Geiger permitiu a análise de dados multivariados, conduzimos uma análise multivariada em uma matriz que inclui comprimento da cabeça-corpo transformado em log, comprimento da cauda transformado em log, comprimento da pata traseira transformado em log e comprimento da orelha transformado em log e comparar os resultados com os obtidos no PPCA univariado.
Favorecemos modelos que tivessem uma pontuação AIC de quatro ou superior (Burnham & Anderson, 2002) após aplicar uma correção mais conservadora para tamanhos de amostras finitos (AICc) (Hurvich & Tsai, 1989). A previsão da EO era que a taxa evolutiva seria
significativamente maior na radiação de primeiro plano.
Usamos o termo mais geral “radiação” em vez de clado, porque para os grupos focais definidos geograficamente a priori, a maioria é parafilética como resultado da exclusão de linhagens de emigrantes.
O modelo de evolução EB é um modelo de passeio aleatório onde a taxa de evolução diminui exponencialmente ao longo do tempo. Como o modelo EB se ajusta melhor às características que se diversificam rapidamente no início de uma linhagem e depois desaceleram até o presente, ele é frequentemente usado como evidência do modelo de evolução que preenche nichos (Harmon et al., 2010). Avaliamos o ajuste do modelo de evolução EB comparando seu ajuste com os dados relativos ao
movimento browniano (BM) e modelos Ornstein-Uhlenbeck (OU; que assume que os valores das características são atraídos para um valor ideal) usando modelos AIC (incluindo DAIC e Pesos AIC), preferindo modelos com menor pontuação AIC, DAIC = 0, e com peso AIC (AICw) mais próximo de 1.
Testamos a previsão de EO de uma explosão precoce na divergência de características, levando a uma disparidade proporcionalmente maior do que o esperado em modelos aleatórios no início da história da radiação, e a uma proporção menor de disparidade total repartida em subclados recentes com gráficos de disparidade ao longo do tempo (DTT) em a biblioteca Geiger (Harmon et al., 2008a) em gráficos R. DTT, conforme implementado em Geiger, traça a disparidade relativa de subclados (Harmon et al., 2003). Isso é igual à média quadrada das distâncias euclidianas entre todas as espécies no morfoespaço em cada subclado cujas linhagens ancestrais estavam presentes naquele momento, em relação à disparidade de todo o táxon (Harmon et al., 2003). Os gráficos DTT foram utilizados para estimar o índice de disparidade morfológica (MDI) (Harmon et al., 2003). Executamos 1.000 simulações de evolução de características sob movimento browniano e comparamos sua média com os gráficos observados para calcular os escores do MDI (Harmon et al., 2003, 2008b). Como a OE prevê uma disparidade inicial desproporcionalmente maior, calculamos a pontuação do MDI apenas no primeiro terço do gráfico da TDT como um
ponto de corte conservador. Uma pontuação negativa no MDI indicaria que o subclado inicial também conduziram análises de evolução fenotípica (veja
abaixo) nos escores de PC dos dois primeiros eixos, que juntos representaram 81% da variância total (Tabela 1) e serviram como índices multivariados de morfologia do apêndice.
MUDANÇA NAS TAXAS EVOLUTIVAS
TAXAS EVOLUCIONÁRIAS AO LONGO DO TEMPO
DISPARIDADE AO LONGO DO TEMPO
© 2015 The Linnean Society of London, Biological Journal of the Linnean Society, 2015, ,
RESULTADOS UMA DETECÇÃO POSTERIORI DE MUDANÇAS DE TAXA
evolução ao longo do tempo) foi encontrada entre a idade do nó não usa especificações a priori sobre onde esses ou acelerar as taxas ao longo do tempo em Muroidea.
empregado acima, também testamos a hipótese EO
Usamos Musser & Carleton (2005) com atualização
para comprimento relativo da cauda (Fig. 2). Pontuações negativas e não significativas do MDI também foram associadas à colonização primária de Madagascar e Sahul para o
América do Sul (ambas uma duplicação da taxa) e
para executar análises e visualizações pós-BAMM.
leva em conta a amostragem de táxons não aleatória e incompleta dentro dos clados muroides (Rabosky, 2014). Para estimar as frequências de amostragem, os clados foram divididos em
ao longo dos galhos (Rabosky, 2014). Os resultados do BAMM
2014) em R para estimar um conjunto de parâmetros iniciais
acima usando os mesmos parâmetros descritos para o
taxas extraídas de diversificação e evolução de características
(Fig. 2) e as análises multivariadas (ver informações de apoio, Fig. S3).
Não significativo, negativo
taxa evolutiva ao longo do tempo, conforme esperado por encontrar os locais para mudanças na dinâmica evolutiva
definido com os valores padrão. Convergência do
análises de evolução, extraímos tanto o máximo
a maioria das árvores, exceto árvores com milhares de táxons
nível de subfamília. Calomyscus representava a família monogenérica Calomyscidae e Typhlomys representava a família Platacanthomyidae (contendo dois
Sete das 30 combinações característica/radiação mostram Os resultados do BAMM basearam-se no critério MAP. Nós também
configuração de mudança de taxa única com o maior post- estão listados nas informações de suporte (Tabela S3).
Apenas quatro destas combinações mostraram o aumento previsto:
comprimento relativo da cauda e elevação em
maximiza a probabilidade marginal de mudanças nas taxas
frações (ou seja, probabilidades de amostragem) para analiticamente
(Plummer et al., 2010) em R e Bammtools foi usado Utilizamos a biblioteca Bammtools (Rabosky et al.,
para cada uma das cinco características ecomorfológicas descritas
especifique tribos Gerbillinae). para o escore do MDI (P > 0,05) tanto no estudo univariado Cadeia de Markov Monte Carlo (rjMCMC) para explorar modelos
candidatos de diversificação e evolução de características para
nenhum experimentou a desaceleração prevista no (Tabela 2; ver também informações de apoio, Tabela S4).
A cadeia rjMCMC foi executada por 107 gerações, amostrando a cada 2.000 etapas, para dar um total de 5.000 amostras da parte posterior;
todos os outros parâmetros foram
porque Rabosky (2014) recomenda usar MAP para
bem definido, especificamos frações de amostragem no
Para a especiação-extinção e cada uma das características Além dos testes padrão baseados em características de EO
A cadeia rjMCMC foi verificada usando a biblioteca Coda
árvore de probabilidade a posteriori (MAP) que detecta o gêneros pequenos). Frequências de amostragem para cada clado
diminuições significativas em relação ao fundo.
(MSC) que estima a configuração de turno que
Executamos um cálculo de especiação-extinção BAMM (versão 2.2) especificando amostragem específica do clado
Informações de apoio, Fig. S3).
taxas evolutivas em uma filogenia para modelar dinâmicas complexas de especiação, extinção e evolução de características (Rabosky, 2014).
BAMM usa salto reversível
Nenhuma das análises da TDT teve resultado significativo classificação tribal de Chevret & Dobigny, 2005 a
Também executamos análises de evolução de características BAMM
ICs após qualquer colonização primária e, portanto,
CRT para qualquer uma das cinco características ecomorfológicas
em diferentes escalas da filogenia. O
com base no critério MSC. Por esta razão, e
2008. Em clados onde as designações tribais não eram
podado da árvore antes da análise BAMM.
de morfologia de apêndice, Sahul para PC2 de morfologia e elevação de apêndice e Sudeste Asiático
relacionamento (indicando uma aceleração na taxa de 2014). Ao contrário dos métodos descritos acima, BAMM para determinar se houve uma desaceleração geral
maior probabilidade e a máxima credibilidade da mudança
mudanças na dinâmica podem ter ocorrido.
e os CIs padronizados absolutos após a colonização primária de: África para comprimento relativo da cauda
análises multivariadas da morfologia do apêndice (ver usando análise Bayesiana de misturas macroevolutivas (BAMM), que
quantifica a heterogeneidade em
números de espécies de fontes mais recentes (por exemplo, o
e PC2 da morfologia do apêndice em Sahul (aumentos de três a quatro vezes).
O NHT não indicou relação positiva significativa entre a idade do nó e o padrão absoluto
tribos se forem bem definidas com base na literatura recente (por exemplo, Musser & Carleton, 2005; Lecompte et al.,
A maioria das radiações biogeográficas não mostrou aumento significativo nas taxas de movimento browniano usando o
para os anteriores sobre parâmetros de taxa que são consistentes
usando o critério MAP correspondeu estreitamente aos resultados
cálculos de especiação-extinção. Como em outras análises, as espécies sem dados ecomorfológicos foram
As pontuações do MDI foram associadas à colonização primária de Madagascar e da América do Sul para PC2
a hipótese de preenchimento de nicho. Um negativo significativo DIVERSIFICAÇÃO ECOMORFOLÓGICA MURÓIDE 7
que são suportados ao máximo pelos dados (Rabosky, ao longo do tempo usando o modelo de variável temporal em BAMM (onde o MSC é mais útil), discutimos apenas o
–
PADRÕES DE EVOLUÇÃO FENOTÍPICA NO MURÓIDE LINHAGENS QUE PASSARAM POR UMA BIOGEOGRÁFICA
TRANSIÇÃO
que nenhuma das filiais estava associada a um A comparação de modelos (MC) indicou que o EB
(16) pelo modelo OU. As análises BAMM indicaram (Tabela 3). Das 30 combinações de característica/radiação, massa, comprimento relativo da cauda e elevação; e Sudeste Asiático
para PC2 de morfologia e elevação de apêndices (Fig. 3).
14 foram mais bem ajustados pelo modelo BM, e o restante características fológicas em todas as radiações biogeográficas América do Norte para elevação; América do Sul para o corpo
desaceleração da taxa de especiação-extinção ou desaceleração da evolução das características em qualquer um dos cinco
modelo não se ajustou melhor aos dados para nenhuma das ecomor- e elevação; Madagascar para comprimento relativo da cauda;
0,00372
0,01305 0,00374
Sahul
0,00336 Apêndices 1
0,01270 Fundo
0,00142 0,00888 0,01131
0,00371 0,00375
0,01282
2.05
Aumentar 0,81
0,14 0,00300
E 0,00118
E Elevação
Apêndices 1
1,91
3.21
Massa
Massa
Primeiro plano
E
Elevação
0,06787
0,02374
Comprimento da cauda
A saída completa é fornecida nas informações de suporte (Tabela S4).
Diminuir 0,02345
0,00168
E 0,02350
0,02346
0,00226
0,00170
Diminuir 0,00368
0,00229
27h45 0,00667
Aumentar 5.11
Sudeste da Ásia
11,40 11,64
5,25 1.22
25.43 0,02422
O ajuste significativo do modelo de parâmetro de duas taxas sobre o modelo de parâmetro de taxa única é baseado no critério de informação de Akaike corrigido D (AICc)> 4 unidades.
0,02340 0,01263
0,01262
0,02345
0,04911 0,00081
0,00198 0,00138
E 0,00057
0,02373
26h20 0,00353
7.33 Tabela 2. Parâmetros do modelo do teste de taxa censurada para colonizações continentais primárias
Comprimento da cauda
Massa
0,00374
E
0,00367
E
E E
, taxa evolutiva; anexos 1 e 2, componente principal (PC)1 e PC2; comprimento da cauda, comprimento relativo da cauda; F, primeiro plano; B, plano de fundo. NS, não significativo.
0,01260
Comprimento da cauda
0,01084
DAICc
0,01018 0,00213
0,20649
Aumentar Diminuir 0,00213
0,00213
0,21134 0,26239
0,00153
0,02605
7.09 0,16258
1,97
0,04972 4,52
0,02322
1.09
1,79 1,29 Apêndices 2
0,00076
D (F – B)
América do Sul
0,02339 Apêndices 2
0,00632
0,04397
Apêndices 2
0,15740 0,00224
1.18 0,01102
Diminuir E
0,00213
0,06592
E
0,02023 0,32326
Diminuir
0,01876 0,01755
Apêndices 2 América do Norte África
Madagáscar
0,02317 0,00212
0,00215
0,00233
2,77 0,02510
0,00150 0,02005
0,00385
0,00464
1,42 0,00207
0,00388
0,00374
0,00384
1,75 0,01266
0,20160
E
0,00417 0,00143
0,00922 Elevação
Elevação
Mudança de taxa
0,15732 Apêndices 1
0,00212
0,10761 Apêndices 1
0,00034 0,20182
Apêndices 1
0,20158
E
0,00256 0,20181
Apêndices 2
E
E 0,84
Elevação
0,20156
0,00990 0,15918 Massa
0,00370 Massa
Taxa única
0,20185
Comprimento da cauda
0,00441
0,20655 0,00134
0,00035 0,00086
0,04917
0,60
0,00023
4,48
0,10373
E 0,20712
Elevação
0,19647
Diminuir 1,77
Comprimento da cauda
0,01033 0,16408
0,69 2.03 Duas taxas
0,01257
Comprimento da cauda
Apêndices 2
E
Apêndices 1
Diminuir
0,01253
0,00084
0,00187 0,00267
0,00264 Massa
0,00235
E 0,01274
0,01293
0,00088
0,00399
Aumentar 0,01503
E
r2
r2
As escalas para os eixos x e y diferem para cada radiação e característica. Anexos 1 e 2, componente principal (CP)1
canto superior esquerdo é o contraste entre Akodon lutescens e Akodon boliviensis).
e PC2; comprimento da cauda, comprimento relativo da cauda. Outliers representam contrastes de nós rasos e estão associados a Figura 2. Gráficos de teste de altura de nó (NHT) para colonizações continentais primárias. Linhas de regressão linear são indicadas.
ramos curtos, o que leva a taxas altas (por exemplo, para o comprimento relativo da cauda de Muroidea e da América do Sul, o valor discrepante no P = 0,379
P = 0,102
P=0,235
P = 0,564 P = 0,0219*
P = 0,0073*
P = 0,036*
P = 0,0193*
P = 0,887
P < 0,0001*
P = 0,234 0,03
P = 0,876 P = 0,588
P = 0,291
P = 0,262
P = 0,0319*
P = 0,00495*
P = 0,0517
P = 0,447
P = 0,985 P = 0,232
P = 0,483
P = 0,0404*
P = 0,0535
P = 0,372 P = 0,118
P = 0,094 P = 0,554
P = 0,241
Comprimento da cauda P = 0,039*
Idade do nó
Apêndices1 Apêndices2 Elevação
Massa
características (Fig. 1). A árvore de especiação-extinção MAP
(Fig. 1; EL1–3), um dos quais ocorreu no mesmo nização da África, apenas seguindo a Eumurida. Para
ramo como a primeira colonização da América do Sul
indica duas acelerações na taxa de diversificação, nas análises de evolução das características, as árvores MAP indicaram:
DIVERSIFICAÇÃO ECOMORFOLÓGICA MUROID 9
nenhum dos quais ocorreu nos ramos que conduzem a três acelerações na taxa de evolução da elevação as colonizações continentais (Fig. 1; SE1-2), embora
um (SE1) ocorreu no ramo seguinte ao colo-
Sudeste da Ásia América do Sul África América do Norte Madagáscar Sahul
Valor absoluto de contrastes filogenéticos independentes
– 8
0,05 14
0,01
14 1,5
0
14 0,8
6 0,15
8 20
0,2
5
1
0
0 0,1
2 15
2
1 0,2
0
20
0,8 0,35
0 0,6
0
2 0
1 2
6 2
20 0
6
2
15 5
0 0
14 1
0 2
0
0 0
0,7
5
2 14
14 2
15
2 0
0
5 0,06
0,6
0 1
4 0,08
0
0,15
0 2
0 0
0
0,2
8 8
20
0
15 0,35
14 2
14 0
1 0,1
5 0,06
0 0,8
2
2 0,02
6 0,3
2
0,2 0
2
0,06
0 0,5
20
0
8 0
14 15
0,8 0,6
14 0
0,1
6
0
1
© 2015 The Linnean Society of London, Biological Journal of the Linnean Society, 2015, ,
Figura 3. Gráficos de disparidade ao longo do tempo (DTT) para colonizações continentais primárias. As linhas sólidas são a disparidade observada e as linhas tracejadas são a média de 1000 simulações na filogenia muroide sob movimento browniano. São indicados os escores do índice de disparidade morfológica (MDI) para o primeiro terço da curva, à esquerda da linha cinza, bem como os valores de significância. Anexos 1 e 2, componente principal (PC)1 e PC2; comprimento da cauda, comprimento relativo da cauda.
0,8 0,8
1.2
0 0
0
0,8 0
0 1 1
0
0 0
0
1,5
0
0,8 0
3
0,8 0
0,8 0
0,8 1
2,5 0
1
2,5
0 0
2,5
0,8 0
1 0
0,8
0
0 0
3
0
0 0
0,8 0
1.2
0,8
1,5 1
0
1 1
1,5
0
0
0 0
0
0 0
0
0,8
1,5 0
0,8 0,8
1
0
0
0,8 0
0
1
0 1,5
0,8 0
0,8 0
1
0
0
0,8 0
0
0
5
0,8 0
2
0,8 2
0 1
0 0
0
1 0
0
2,5
0,8 0 1
0
0 1,5 1
0,8 1
0
2
0,8 0
0
0,8
1 0,8
Massa Apêndices1 Comprimento da cauda Elevação
Tempo relativo Apêndices2
(EL2); duas acelerações na taxa de evolução em massa (Fig. 1; MA1–2), uma das quais ocorreu no mesmo ramo da colonização do Sudeste Asiático (MA1); uma
aceleração na taxa de evolução do PC1 da morfologia do apêndice (Fig. 1; PC1.1), não ocorrendo próximo
às ramificações que levam a transições biogeográficas; e três acelerações na taxa de evolução do PC2 da
morfologia do apêndice (Fig. 1; PC2.1-3), nenhuma das quais ocorreu nos ramos que levaram às colonizações continentais. As árvores MAP para cauda relativa
Sudeste da Ásia América do Norte África Madagáscar Sahul
Disparidade relativa
América do Sul
MDI = 0,0561 P = 0,696
MDI = 0,0979 P = 0,986
MDI = 0,232 P = 0,922
MDI = 0,0643 P = 0,839
MDI = 0,193 P = 0,966
MDI = 0,082 P = 0,974 P = 0,572
MDI = –0,0742 P = 0,095 MDI = 0,0267
P = 0,590
MDI = 0,141 P = 0,815 MDI = 0,0577
P = 0,790
MDI = 0,0064 P = 0,481
P = 0,708
MDI = 0,0753 P = 0,758
MDI = 0,109 P = 0,864
MDI = 0,0192 P = 0,690
MDI = 0,0387 P = 0,658
MDI = 0,178 P = 0,935 MDI = 0,178 P = 1
MDI = 0,142 P = 0,791
MDI = –0,0064 P = 0,458
MDI = 0,0879 P = 0,961
MDI = –0,021 P = 0,292
MDI = 0,0859 P = 0,831 MDI = 0,0922
P = 0,965
MDI = 0,297 P = 0,944
MDI = 0,0172
MDI = –0,0432 P = 0,243
MDI = –0,0168 P = 0,405 MDI = 0,0362
P = 0,650
MDI = 0,108 P = 0,865
MDI = 0,0453