• Tidak ada hasil yang ditemukan

بررسی سطح بیان ژن ها ی fds ، hdr و idi در اندام ها ی هوایی گیاه

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2024

Membagikan "بررسی سطح بیان ژن ها ی fds ، hdr و idi در اندام ها ی هوایی گیاه"

Copied!
10
0
0

Teks penuh

(1)

رود ة 47 رامش ، ة 1 ، راهب 1395 ص(

27 - 19 )

DOI: 10.22059/ijfcs.2016.57847

:نفلت * 09123130360

E-mail: [email protected] Farnesyl diphosphate synthase

یسررب نایب حطس نژ

اه ی ،fds وhdr idi رد مادنا اه ی هایگ ییاوه

Artemisia diffusa طابترا و

نآ اه یدیلوت یاهدیئونپرت زا یخرب نازیم اب

یئلاع دازرف

1مدقم یوقن اضردمحم ،

2

نیسح یداهلادبع و* 3هداز

1 ، 2 و 3 شناد .

،تاتابن حلاصا و تعارز هورگ رایشناد و یژولونکتویب هورگ داتسا ،یژولونکتویب دشرا یسانشراک ةتخومآ جرک ،نارهت هاگشناد یعیبط عبانم و یزرواشک سیدرپ

:تفایرد خیرات(

4 / 9 / 1393 - :بیوصت خیرات 9

/ 6 / 1394 )

هدیکچ

ا یگدنز رد ینپرت تابیکرت تیمها لیلد هب نآ نیب ةطبار یسررب ،ناسن

نژ و اه یرورض لیخد یاه

ژ فشک رظن زا ترورض نیا .تسا یواح ناهایگ نایم رد .تسا داوم نیا دیلوت رد مهم یاهن

نژ ،یسررب نیا رد .دراد یدایز تیمها ایزیمترآ سنج ،نپرت یاه

و fds

و hdr idi

تفاب هس رد

هایگ زا هچنغ و لگ ،گرب

Artemisia diffusa

یسررب نیا .دندش یبایزرا ةسیاقم زا هدافتسا اب

هداد زا لصاح یاه نژ یعقاو نامز ردPCR

هداد اب اه زا لصاح یاه

GC-MS

نپرت هتفرگ ماجنا اه

هب هک داد ناشن یسررب نیا جیاتن .تسا نپرت زا یضعب دیلوت رد لامتحا

تفاب رد اه ،صاخ یاه

نژ مان یاه .دنراد هدننکدودحم ریثأت هدرب نانچ

نژ هک یارب idi

1,8- cineole

و

germacrene-D

رد

نژ نیا هکنیا زا یادج ،رگید یوس زا .داد ناشن ار هدننکدودحم ریثأت هچنغ رد یمهم شقن اه

نپرت )زتنس( بیکرت هب ،ینپرت تابیکرت رگید دروم رد ،دنراد اه

نژ لامتحا نییاپ یاه

تسد دننام رت

نپرت دودحم ةفیظو نیا اهزاتنس هب .دنراد هدهع هب دیلوت رد یگدننک

یروط هدام دیلوت رد هک

beta-

farnescene

چیه رد نژ ةچنغ و گرب ،لگ زا کی یرگید لماع .دادن ناشن ار هدننکدودحم شقنfds

نژ شقن رب هک مان یاه

نپرت دیلوت رد هدرب یم رثا رظندروم یاه

زا سپ حطس رد میظنت دوجو دراذگ

یا رد هک تسا یسیونور .تسا هدشن هتخادرپ نآ هب یسررب ن

هژاو یدیلک یاه :

،ایزیمترآ نپرت

اه

، ،یعقاو نامز ردPCR GC-MS

.

همدقم

سنج

Artemisia

داوناخ زا ة

Asteraceae

تسا رد .

و یفلع ناهایگ سنج نیا هتوب

یا اب ناوت لمحت رد لااب

و کشخ قطانم همین

کشخ رکمین ود لدتعم قطانم ة

دوجو هب سنج نیا .دنتسه هدنکارپ یبونج و یلامش بیکرت ییاه نپرت دننام سناسا رد اه

.تسا فورعم ناش

زا شیب سنج نیا رد دصناپ

تسا هدش ییاسانش هنوگ

رد هک هراق یاه یلامش یاکیرمآ و اپورا ،ایسآ یم

دنیور

(

Abad et al., 2012

نایم رد .) هنوگ

یاه نیا فلتخم نوگ ،سنج

ة

Artemisia diffusa

.دراد رارق نیا

هنوگ

دننامه رگید هنوگ یاه تفای فلتخم طاقن رد ایزیمترآ

یم دوش ،ناریا رد . نیا

هنوگ رد ناتسا یاه ،نانمس

هایگ نیا .تسا هدش شرازگ ناتسلگ و ناسارخ لگ یاه داب طسوت هک دراد یزیر هدرگ

یناشفا یم دوش .

نپرت لیکشت ار هایگ نیا سناسا زا یمهم شخب اه

یم دنهد یلاعف رظن زا هایگ نیا همادا رد . رد نژ هس ت

نپرت تخاس ریسم اه

یسررب یم دوش .

1fds

: داوناخ زا ینژ ة

prenyl transferase

( )PTs

(2)

رد هک تسا نییاپ

تسد اب و دراد رارق تانولاوم ریسم

ددع ود لاصتا

1IDP

ددع کی هب

DMADP

هدام 2

Farnesyl diphosphate

( ار )FDP

یم دیلوت هک دنک

شیپ یئوکسس ةدام نپرت

( تسا اه

Wen & Yu, 2011

.)

Zeng et al.

( ناحیر مقر هس یور یشیامزآ رد )2013

هب لک نپرتونوم تبسن هک دندیسر هجیتن نیا هب یئوکسس طبار دش دیلوت مقر ره طسوت هک لک نپرت ة

هب اهزاتنس نپرتونوم تیلاعف تبسن اب ار یفیعض یئوکسس تبسن نینچمه و تشاد اهزاتنس نپرت

تیلاعف

3gds

میزنآ(

دنزاس ة نپرتونوم زاس شیپ زا اه

و IDI DMADP

هب ) نپرت تبسن اب زین fds

یاه

یدیلوت یناوخمه

.دادن ناشن نانآ

دندرک راهظا

،

یماگنه نپرت ریسم رد شنکاو نایرج

شیازفا اه

یم دبای ، وgds

تسا نکممfds

هجرد یا رد ار لرتنک زا

هک هدام شیپ حطس هب

روط تمس هب میقتسم

میزنآ یاه م یئوکسس و ونو اهزاتنس نپرت

یم دور لامعا

هب اما ،دننک نازیم

نپرت دیلوت رد دایز یدیلوت یاه

نیا هتبلا .دنتسین راذگرثا شیپ

ضرف یتروص رد تسرد

یئوکسس و ونوم یاهریسم هک تسا نپرت

اه هب روط

دنشابن لقتسم لماک (

Zeng et al., 2013

.)

4hdr

: لحرم نژ نیا طسوت یدیلوت میزنآ ة

ینایاپ

دیلوت شیپ هدام یاه ینعی هیاپ وIDP

DMADP

رد ار

ریسم

5MEP

یم زیلاتاک دیلوت رد ار یلصا شقن و دنک

شیپ یاهزاس ریسم هب هتسباو

تخاس یارب MEP

( زتنس ) یم یزاب یدیتسلاپ یاهدیئونورپوزیا دنک

(

Wang et al., 2007; Huang et al., 2009

.)

Munoz-

Bertomea et al.

( ندوزفا اب یشیامزآ رد )2006

هب تانومساج لیتم روتیسیلا هتخای

یاه جاک یعون

( Picea abies

نژ نایب حطس هک دندرک هدهاشم) hdr

هک دوب دهاش تلاح ربارب ود هب کیدزن ةجیتنرد

نآ

نپرتونوم رد هک دندش دیلوت ییاه هنومن

یاه دهاش

زا دندوب ترابع هک دنتشادن روضح :

a-pinene ،

b-pinene ،

camphene ،

limonene

و

myrcene

1. Isopentenyl diphosphate

2. Dimethylallyl pyrophosphate/diphosphate 3. Geranyl diphosphate synthase

4. Hydroxy-2-methyl-2-(E)-butenyl 4- diphosphatereductase

5. 2-c-methyl-erythritol 4- phosphate

(

Munoz-Bertomea et al., 2006 Botella Pavi’a .)

et al.

( ینایب شیب اب )2004

ایزیمترآ هایگ رد hdr

میظنت رد ار یمهم شقن نژ نیا هک داد ناشن یاهدیئونپرت هتخاس

هدش افیا دیتسلاپ رد یم

دنک .

نایب حطس هک دنداد ناشن هورگ نیا نینچمه ردhdr

رف نایرج آ

دنی

deetiolation

چهایگ ندش زبس(

ة دیفس

هچهایگ )هدیدن رون یاه

Arabidopsis

هب تدش شیازفا

دیلوت شیازفا ،شیازفا نیا اب هارمه هک تشاد هنیزبس

( لیفورلک ) دش هدهاشم دیئونتراک و

Botella Pavi’a (

et al., 2004; Botella et al., 2004 )

نازیم .

یدایز

(EST Expressed sequence tag

هب طوبرم ) رد ارhdr

( کرک

trichome

) عانعن هایگ یاه (

نپرت زا ولمم هک اه

دندرک هدهاشم )تسا (

Botella et al., 2004

).

6idi

: فیظو ة تشگرب لیدبت دام ریذپ

ة

IDP

هب ار

DMADP

دام ود نیا(

ای اپمه ة رگیدکی رموزیا

ریسم ود ره رد )دنتسه تانولاوم و MEP

(MVA)

رب

دراد هدهع (

Olofsson et al., 2011; Ma et al., 2012

.)

Page et al.

( رد )2004

یشهوژپ نژ یشوماخ اب

idi

هایگ رد

Nicotiana benthamiana

، گرب یاه دیفس

هکل راد دیتسلاپ تفاب ، بیسآ

هدید نازیم هب نینچمه و

80 حطس شهاک دصرد گنر

هناد اه اب هسیاقم رد ار

رد نژ نیا یشوماخ اب نینچمه .دندرک هدهاشم دهاش هایگ هدشدای نازیم هک دش هدهاشم هنیزبس

و

یشوماخ اب هک دوب یحطس زا رتلااب دیئونتراک نژ

یاه

وhdr 7hds

دوب هدش داجیا (

Page et al., 2004

.)

نامه روط دش ناونع هک نژ

یاه یسرربدروم رد هک

شیپ دیلوت هدام

یاه نپرت ،دنراد شقن اه یم

دنناوت رب

دنراذگب رثا داوم نیا دیلوت نازیم

، هب روظنم یسررب

نازیم ریثأت نآ اه نپرت دیلوت رد هایگ رد اه

A. diffusa

و تسا داوم نیا زا یبوخ عبنم هک یم

دناوت تاعلاطا

یدنمدوس دننام یدربراک مولع رایتخا رد ار

تسیز ( یروانف یژولونکتویب

) شهوژپ نیا ،دهد رارق

.تسا هدش ماجنا

6. Isopentenyl diphosphate isomerase

7. Hydroxy-2-methyl-2-butenyl 4-diphosphate synthase

(3)

شور و داوم اه

هایگ تشاک رذب

A. diffusa

یتسیز و یکیتنژ ریاخذ یلم زکرم زا

و هیهت ناریا یارب

لرتنک طیارش رد تشاک دش

ة هناخلگ

رذب .دش هتفرگ راک هب یاه

تشک روظنم هب هایگ زاغآ رد

میدس تیرلکوپیه اب 20

و رامیت دصرد هاگنآ

بترم هس ه

رذب سپس .دش هداد وشتسش رطقم بآ اب یاه

ینوفعدض تدم هب هدش

هدراهچ زور تدشرد رون 3000

رود و سکول ة

یرون تشه و یکیرات تعاس هدزناش

شید یرتپ رد ییانشور تعاس یفاص ذغاک یواح یاه

رذب .دش هداد رارق بوطرم هناوج زا سپ اه

هب ندز

نادلگ یور و لقتنم کچوک یکیتسلاپ یاه نآ

اه

تبوطر ظفح روظنم هب فافش یکیتسلاپ شوپرد رارق

هداد نادلگ همادا رد دش تدم هب اه

تسیب کیو رد زور

ییامد طیارش 25

جرد ة سویسلس تبوطر ،

55 ،دصرد

یرون تدش 5000

رود و سکول ة

تعاس تشه یرون

و یکیرات هدزناش

دشر کقاتا رد ییانشور تعاس

هچهایگ سپس .دش یرادهگن دلگ هب اه

نا گرزب یاه

لحرم ات و لقتنم ة

ییامد طیارش رد یهدلگ 25

جرد ة

سویسلس تبوطر ،

55 یرون تدش ،دصرد 7000

و

رود ة یرون تشه و یکیرات تعاس هدزناش

تعاس

.دش یرادهگن ییانشور و جارختسا ةیزجت

سناسا

هنومن لگ و هچنغ ،گرب تفاب هس زا اه نیا

هنوگ رد

من ندرک کشخ زا سپ یهدلگ نامز هنو

.دش هتفرگ اه

هنومن هارمه هب و درخ ،سناسا جارختسا روظنم هب اه

رهم راهچ ة

د هب یزلف ةلول نور

هشیش سپ و هتخیر یا

ندرک هفاضا زا نازیم

نازگه ی ( طولخم مه اب

سکترو ) هنومن .دندش

زا سپ اه ندش طولخم

راهچ تدم هب

و هتفرگ رارق قاتا یامد رد تعاس شیلااپ هاگنآ

( رتلیف )

دش هنومن تلاح نیا رد هک دن هاگتسد هب قیرزت یارب اه

GC-MS

( دندوب هدامآ

Munoz-Bertomea et al.,

روظنم هب .)2006

ةیزجت هاگتسد زا سناسا

Agilent

Technologies 7890A

کی اب (MSD

5975 نوتس و )

HP-5MS

لوط هب 30

د رطق و رتم نور

ی 25 / 0

یلیم رتم یلا تماخض و ة

25 / 0 .دش هدافتسا رتمورکیم

( هتفاکش تلاح رد هاگتسد هب قیرزت

split

یامد اب )

یدورو 250 ییامد ةمانرب .دش ماجنا سویسلس ةجرد

هب نوآ نیا نیزاغآ یامد ؛دوب بیترت 60

،سویسلس ةجرد

ات امد شیازفا سپس هقیقد هس تدم هب امد نیا رد فقوت 150 ییامد نایدارگ اب سویسلس ةجرد 3

رد ةج

تدم هب امد نیا رد فقوت ،هقیقد رد سویسلس 1

،هقیقد

ات امد شیازفا سپس 260

بیش اب سویسلس ةجرد

تدم هب امد نیا رد فقوت و شیپ ةلحرم ناسمه نایدارگ نایرج تعرس اب مویله زاگ زا .هقیقد هد 1

یلیم رد رتیل

تعرس طسوتم و هقیقد 1

یتناس هب هیناث رد رتم زاگ ناونع

فتسا لماح ندرک هزینوی عبنم یامد .دش هدا

)نویسازینوی(

230 .دوب سویسلس ةجرد

اهرگزاغآ یحارط 18s rRNA

هب ناونع نآ هب طوبرم رگزاغآ و عجرم نژ

راک ساسا رب

Zeng et al.

( )2008

.دش باختنا یارب

نژ یاه

fds (Accessiom number: U36376.1)

،

idi

(DQ666334.1)

،

hdr (GQ119345.1)

اب رگزاغآ

زا هدافتسا مرن

رازفا

Primer3

و یحارط هاگنآ

هدافتسا اب

زا مرن رازفا

Primer BLAST

نومزآ دش اهرگزاغآ یلاوت .

عطق لوط هارمه هب ة

لودج رد یداجیا 1

.تسا هدمآ

لودج 1 یاهرگزاغآ یلاوت .

forward

و

reverse

نژ یاه هعطق لوط هارمه هب یسرربدروم هتفای شیازفا یاه

Table 1. sequences of forward and reverse primers of evaluated genes and their corresponding amplified length

gene Access no. Forward primer Reverse primer Amplified length

fds U36376.1 5’-CTGCCCTTGGTTGGTGTATT-3’ 5’-ATTCTCGGGACATGGTTACG-3’ 169 hdr GQ119345.1 5’-AATTCTCCATGGCGTCTTTG-3’ 5’-ATTATGCCTGGACACCTTCG-3’ 170 idi DQ666334.1 5’-GGGCGAACATGAACTTGATT-3’ 5’-CAGCTTGAGACCCTCCTCAC-3’ 154

تخاس زا هدافتسا اب نژ نایب یسررب وcDNA

PCR

یعقاو نامز رد هنومن رارکت هس اب ناهایگ لگ و هچنغ ،گرب زا یریگ

جارختسا و یتسیز تیک زا هدافتسا اب RNA

RNasyPlantMiniKit

و نژایک تکرش ربارب

روتسد راک تخاس .تفرگ ماجنا هدنزاس تکرش

زا هدافتسا اب cDNA

روتسد راک

تیک

FirstStrandcDNASynthesisK1622RevertAidTM

(4)

زاتنمرف تکرش ربارب

روتسد راک .تفرگ ماجنا تکرش

ماجنا یارب هاگتسد زا یعقاو نامز PCR

iCycler

تکرش

BioRad

گنر زا و

I Quantitect SYBER

Green

تکرش

Qiagene

هب ناونع گنر هدنشخرد

( سناسرولف )

دش هدافتسا یمک یبایزرا یارب جیاتن .

نیگنایم نژct

اه لودج رد 2

.تسا هدش هداد شیامن

لودج 2 نیگنایم لودج . نژct

اه ی سرربدروم رد ی ردPCR

یعقاو نامز

Table 2. average ct of evaluated genes at Real Time PCR Flower bloom

Leaf Gene/tissue

24.98 24.51

27.51 fds

25.84 25.96

24.59 idi

28.26 28.02

28.91 hdr

15.29 15.41

16.92 rRNA 18S

جیاتن جارختسا هداد ،نایاپ رد هاگتسد هب طوبرم یاه

نامز رد PCR

مرن زا هدافتسا اب یعقاو رازفا

Rest© (version 2)

(

Pfaffl et al., 2002

) یبایزرا دش و هاگنآ تاعلاطا نیا

هداد اب هب طوبرم یاه

GC-MS

نپرت ریسفت و هسیاقم اه

نایاش .دش نژ نایب یسررب رد هک تسا یروآدای

رد اه

نژ نیا نایب ،یسرربدروم ةنوگ رد اه

A. annua

هب ناونع

مرن رد عجرم ةنوگ رازفا

.تسا هدش هدافتساRest

ثحب و جیاتن

نپرت نیب زا هک ددع هد دادعت هایگ نیا رد دوجوم یاه

یئوکسس هس و نپرتونوم تفه لماش یم نپرت

،دوش

ماجنا یسررب .تسا هدش یسررب تسا تروص نیا هب هتفرگ

کت یاوتحم هک نپرتونوم کت

اه نژ نایب نازیم اب یاه

وhdr

کت یاوتحم رگید فرط رد و هدش هسیاقمidi

کت

یئوکسس نپرت د اه نژ نایب نازیم اب هسیاقم ر یاه

وfds

لکش( تسا هدش یسررب زینidi

1 .)

لکش 1 نژ . یاهریسم رد یسرربدروم یاه وMEP

( MVA Nagegowda, 2010

)

Figure 1. Evaluated genes in MVA and MEP pathways (Nagegowda, 2010)

a-pinene

نایب گرب رد .تسا نپرتونوم کی ؛

hdr

نایب یلو هچنغ زا رتمک و تسا هچنغ زا رتشیب idi

دام ة تسا رتشیب زین یدیلوت

، یم هک شقن هب دناوت

گنررپ رت ربارب ردidi

دام دیلوت رد hdr

ة هدشدای هراشا

چنغ رد .دنک ة

نایب و لگ زا یرتلااب نایبhdr

رتمکidi

و دوب لگ زا ةدام

یدیلوت دننام هک دوب لگ زا رتمک

دروم نیشیپ شقن زا یم تیامح هدام دیلوت رد idi

لگ رد .دنک نیا

هنوگ نژ ود ره نایب گرب اب هسیاقم رد دام یلو رتشیب

ة زا رتشیب یکدنا فلاتخا اب یدیلوت

یم هک تسا گرب خت هلئسم دناوت

شیپ عبانم صیص

هدام دام دیلوت فرص هک دنک حرطم ار اه ة

هدش یرگید

تسا لکش(

2 .) رد یشهوژپ نژ یشوماخ اب

رد idi

هایگ

N. benthamiana

گرب ، دیفس یاه هکل

راد ،

بیسآ دیتسلاپ راتخاس نازیم هب و هدید

80 دصرد

حطس شهاک گنر

هناد اه هدهاشم دهاش اب هسیاقم رد

دش (

Page et al., 2004

هک دش هدهاشم نینچمه .)

(5)

نازیم هنیزبس ینپرت تاقتشم ود ره( دیئونتراک و

یحطس زا رتلااب )دنتسه تسا

نژ یشوماخ اب هک یاه

وhdr

دوب هدش داجیاhds

(

Page et al., 2004

.)

1,8-cineole

؛)نپرتونوم(

نژ نایب زا هچنغ ردhdr

نژ و رتشیب لگ و گرب ینعی رگید تفاب ود

idi

و تسا رتمک رگید تفاب ود زا ،سکعرب ةدام

یدیلوت

دراد هراشا هک .تسا رتمک گرب و لگ زا هچنغ رد زین چنغ رد هدام دیلوت یگدننکدودحم لماع هک ة

نژ

hdr

نژ و تسین هدشدای

یم دناوت لگ رد .دشاب idi

دوجواب

لااب ندوب نژ ود نایب هدشدای

، ةدام یدیلوت زا رتمک گرب

دشاب یم هک وت نژ شقن هب دنا نییاپ یاه

یتسد

دشاب هتشاد هراشا لکش(

2 رد .) یشهوژپ حطس

نیئتورپ رد HDR

فلع هایگ ( لات

Arabidopsis

thaliana

اب ) تفاب رد شروضح دوجو ،فلتخم یاه

تفاب رد ار نازیم نیرتشیب .تشاد ناوج یاه

Wang et

al.

(2007)

دندرک راهظا حطس نیب فلاتخا هک

نیئتورپ و mRNA

مادنا رد HDR

فلتخم یاه

هب لامتحا میظنت لیلد هب یاه

و تسا یسیونور زا سپ

نایب هکنیا تسا نکمم hdr

لحرم هب هتسباو ة

یومن

دشاب (

Wang et al., 2007

.)

لکش 2 نپرتونوم یخرب یاوتحم هسیاقم . نژ نایب حطس و اه

یاه وhdr

ردidi

تفاب اه هچنغ و لگ ،گرب ی

A.diffusa

Figure 2. the comparison among some monoterpenes and expression level of genes idi and hdr in leaf, blossom and flower tissues of A.diffusa

-6 -4 -2 0 2

leaf bloom flower

Fold change

Tissue

a-pinene α-pinene

HDR IDI

-10 0 10 20 30

leaf bloom flower

Fold change

Tissue 1,8-cineole

1,8-cineole HDR IDI

-10 -5 0 5 10

leaf bloom flower

Fold change

Tissue

camphene camphene

HDR IDI

-6 -4 -2 0 2

leaf bloom flower

Fold change

Tissue

borneol borneol

HDR IDI

-10 -5 0 5

bloom flower

Fold change

Tissue beta-myrcene

beta-myrcene HDR -20 IDI

0 20 40

leaf bloom flower

Fold change

Tissue camphor

camphor HDR IDI

-6 -4 -2 0 2

leaf bloom flower

Fold change

Tissue p-cymene

p-cymene HDR IDI

(6)

Borneol

،)نپرتونوم(

نایب گرب رد زا رتمک hdr

و هچنغ زا رتشیب زین یدیلوت ةدام و تسا نآ زا رتشیبidi

هب هجیتن رد هک تسا هچنغ نژ شقن لامتحا

دیلوت ردidi

شقن رب هدام لگ اب هسیاقم رد هچنغ رد .دراد یرتربhdr

یلو رتمکidi

تسا رتشیب زین یدیلوت ةدام و رتشیبhdr

یم رظن هب دروم نیا رد هک نژ شقن دسر

هتسجربhdr

رت

زا نایب نژ ود ره ،گرب اب هسیاقم رد لگ رد .تسا idi

هک تسا رتشیب گرب رد یدیلوت ةدام یلو هتشاد یرتشیب یم هراشا دناوت نژ شقن رب دشاب یا

نییاپ یاه و یتسد

هدام شیپ صیصخت هلئسم ه

نژ نیا طسوت هک ا یاه

نییاپ یم لامعا یتسد نینچ زورب هب رجنم هک ،دوش

لکش( تسا هدش یجیاتن 2

.)

Camphene

،)نپرتونوم(

نایب گرب رد و رتمکhdr

نایب دام و هچنغ زا رتشیب idi

ة نآ زا رتمک یدیلوت

یم هک تسا هتسجرب لیلد هب دناوت

شقن ندوب رت

hdr

نایب هچنغ رد .دشاب شیبhdr

نایب و لگ زا رت رتمکidi

دام و تسا نآ زا ة

نیا هک تسا لگ زا رتشیب یدیلوت

جیتن زا زین هجیتن ة

نیشیپ تیامح گرب دروم رد

یم هک دنک هتسجرب ینژ hdr

هدام نیا دیلوت رد رت

رتشیب گرب اب هسیاقم رد نژ ود ره نایب لگ رد .تسا دام و تسا ة

هب هک تسا گرب زا رتشیب لگ رد یدیلوت

یم یقطنم رظن شقن زا ناشن جیاتن نیا .دیآ

لرتنک یگدننک هتسجرب تبسن هب دننام ینژ رت

ردhdr

نژ ربارب یاه نییاپ یتسد دراد لکش(

2 .)

Camphor

،)نپرتونوم(

هچنغ هب تبسن گرب رد

نایب نایب و رتمکhdr

دام و رتشیبidi

ة رتمک یدیلوت

تسا یوق شقن هب هک رت

.دراد هراشا هدام دیلوت ردhdr

زا رگید یوس نژ ،لگ اب هسیاقم رد هچنغ رد

نایبhdr

نژ و رتلااب دام و دراد یرتمک نایب idi

ة رد یدیلوت

هک تسا لگ زا رتشیب هچنغ رگید راب

گنررپ شقن رب رت

ربارب رد hdr

نایب لگ رد .دراد هراشا idi

و hdr idi

رب زا رتشیب دام و تسا گ

ة زا رتشیب لگ رد یدیلوت

هجیتن هک تسا گرب تسا یقطنم یا

لکش(

2 .)

p-cymene

،)نپرتونوم(

زا رتمک گرب رد hdr

و هچنغ دام و تسا نآ زا رتشیب idi

ة رتمک یدیلوت

هک تسا رگید راب

شقن رظن زا ارhdr

یگدننکدودحم

یم هتسجرب هدام دیلوت اب هسیاقم رد هچنغ رد ،دنک

لگ

، و رتشیب hdr

دام نینچمه و رتمک idi

ة یدیلوت شقن ،سکعرب اجنیا رد هک تسا رتمک

رظن هب idi

هتسجرب گرب زا رتشیب نژ ود ره نایب لگ رد .تسا رت

دام و تسا ة

رظن هب یقطنم هک تسا رتشیب زین یدیلوت

یم یم و دسر نژ فیعض شقن هب دناوت

یاه نییاپ یتسد

ترابع هب هک دنک هراشا قیقد

رت یم هک تفگ ناوت

نژ یاه نییاپ یتسد دنرادن ار هدننکدودحم شقن

لکش(

2 .)

beta-caryophyllene

یئوکسس(

رد لگ رد ،)نپرت

نازیم ،نژ ود نایب شیازفا اب هارمه ،هچنغ اب هسیاقم دام ة دروم یم اجنیا رد هک .تسا هتفای شیازفا زین رظن

گنررپ شقن هب ناوت نژ رت

یاه و idi

ب رد fds

ربار

نژ یاه نییاپ یتسد رت زاتنس نپرت دننام درک هراشا اه

لکش(

3 .) رد یسررب یرگید ،

Zare Mehrjerdi et al.

( و تانومساج لیتم یاهروتیسیلا یاقلا اب )2013

2-isopentenyladenine

هایگ رب

A. annua

یطابترا

یئوکسس یعون( نینیزیمیترآ حطس نیب حطس و )نپرت

نایب نیا رد .دشن هدهاشم fds

یسررب یاوتحم

طابترا یلو داد ناشن ار دیلوت شیازفا نینیزیمیترآ ینعم نایب حطس اب ار یراد تشادن fds

(

Zare Mehrjerdi et al., 2013

.)

beta-farnescene

یئوکسس(

تبسن لگ رد ،)نپرت

نژ نایب نازیم هچنغ هب ةدام نازیم یلو رتشیب اه

نیا دننام یجیاتن تسا لگ زا رتشیب هچنغ رد یدیلوت یم هب دناوت هتسجرب شقن هب نشور روط نژ رت

یاه

نییاپ نژ ربارب رد یتسد هک دنک هراشا یسرربدروم یاه

نژ نایب ندوب لااب دوجواب یاه

و idi

دیلوت نازیمfds

نییاپ گید تفاب اب هسیاقم رد ار هدام رت میتسه دهاش ر

لکش(

3 .)

germacrene-D

یئوکسس(

هب ،)نپرت اب یداع روط

رتشیب ،هچنغ هب تبسن لگ رد نژ ود نیا نایب ندوب رد هک .تسا هچنغ زا رتشیب لگ رد زین یدیلوت ةدام

لباق یدروم نیا یلک تلاح شیازفا اب هک تسا راظتنا

جیاتن نیا .دبای شیازفا زین رظندروم ةدام ،نژ ود یم نژ رتشیب یگدننکدودحم رثا هب دناوت یاه

نژ ربارب رد یسرربدروم نییاپ یاه

د یتس دیلوت رد رت

لکش( دنک هراشا رظندروم ةدام 3

.)

Iijima et al.

( )2004

دنداد ماجنا ناحیر مقر هس یور رب یشهوژپ یمیزنآ تیلاعف و یسیونور حطس نیب یفیعض ةطبار هک

(7)

نژ یاه ،gds

و fds 1TPSs

دندرک هدهاشم ار نیا هک

یم دروم حرطم ار یسیونور زا سپ میظنت شقن دناوت

دنک (

Iijima et al., 2004

،لک یدیلوت نپرت نازیم .)

تیلاعف یلک حطس اب یبوخ ةطبار

TPSs

هن یلو تشاد

نژ اب یاه و gds

(fds Iijima et al., 2004

نایم رد .)

مقر گرب رد لاثم یارب مقر هس نآ رد SD

دودح

مقر ربارب هس لک نپرت نازیم تیلاعف حطس و دوبSW

تبسن هب کیدزن مقر ود نیا نیب TPSs

1:3 .دوب

نیمه گرب روط یاه دودحSD

4 / 7 یرتشیب نپرت ربارب

مقر زا تیلاعف نازیم تبسن و دنتشادEMX

زینTPSs

رگید یوس زا .دوب تروص نیمه هب مقر ود نیا رد گرب یاه و SW

تیلاعف زا یناسمه حوطس SD

میزنآ لینرپ یاه ( زارفسنرت

و fds

د ار )gds

دنتشا

یلاحرد هک تشاد یرتشیب نپرت ربارب هسSD

(

Iijima

et al., 2004

.) هب هجوت اب یسررب

نایب نازیم نیب هسیاقم و ریخا

نژ رظانتم یدیلوت داوم و اه نآ

اه تفاب رد و اه

مادنا یم فلتخم یاه رد هک تروص نیا هب ار جیاتن ناوت

تفاب ،فلتخم یاه مادک

کی نژ زا وم مادک یارب اه دا

و هتشاد ار هدننکدودحم شقن هب

لامتحا اب تسد یراک

دام نازیم ناوتب نژ نآ ة

لودج ،داد شیازفا ار یدیلوت

3 تکن اما ؛تسا هدش هئارا ة

لباق هجوت اب هک تسا نیا

نیا رد هکنیا هب هجوت یسررب

نژ یرتشیب یاه هب

هژیو

نژ یاه یسررب TPSs

دشن ه یعطق جیاتن ،دنا هدوبن

و

لامتحا ی تسا لودج(

3 .) نییاپ لودج رد ةژاو

yes

ناشن ةدنهد تفاب رد نژ نآ ندوب هدننکدودحم

رظندروم نپرت یارب و رظندروم

و تسا ةژاو زا ناشنno

.تسا نژ نآ ندوبن هدننکدودحم هب مزلا یروآدای هسیاقم نیا رد هک تسا روظنم اه

نآ رد ،نآ ندوب راذگرثا ای و نژ ندوب هدننکدودحم زا یحطس دام دیلوت زا ة

هدشدای هسیاقم هک تسا هدش

،

یم هدام کی دیلوت زا یدح ات نژ کی لاثم یارب دناوت

زا سپ و دشاب هتشادن هدننکدودحم ای و یفنم یشقن هناتسآ زا رذگ یم نژ نآ ،دیلوت زا یا

شقن دناوت

هدننکدودحم )کبدیف( یدروخزاب ریثأت ای و

دیلوت رد ار

دنک یزاب هدام نآ .

لکش 3 یئوکسس یخرب یاوتحم ةسیاقم . نپرت

اه نژ نایب حطس و یاه

وfds

ردidi

تفاب اه لگ و هچنغ ،گرب ی

A. diffusa

Figure 3. the comparison among some sesquiterpenes and expression level of genes idi and fds in leaf, blossom and flower tissues of A.diffusa

1. Terpene synthases

-6 -4 -2 0 2

bloom flower

Fold change

Tissue beta-farnescene

beta farnescene -6

-5 -4 -3 -2 -1 0

bloom flower

Fold change

Tissue

beta-caryophyllene

beta-caryophyllene FDS

IDI

-10 -5 0 5 10

bloom flower

Fold change

Tissue germacrene-D

germacrene-D FDS IDI

(8)

لودج 3 یلامتحا ریثأت . گدننکدودحم

ی نژ اه نپرت دیلوت رد رد اه

A. diffusa

Table 3. the probable restricting effect of genes in terpene synthesis in A.diffusa

A.diffusa Leaf Bloom Flower

Compounds fds hdr idi fds hdr idi fds hdr idi

beta-caryophyllene - - - yes - yes yes - yes

beta-farnescene - - - no - no no - no

germacrene-D - - - yes - yes yes - yes

1,8-cineole - no no - no yes - yes (reverse)1 no

a-pinene - no yes - yes (reverse) yes - no yes

beta-myrcene - - - - yes no - yes no

borneol - yes (reverse) no - no no - no yes (reverse)

camphene - yes no - yes yes (reverse) - yes no

camphor - yes no - yes yes (reverse) - yes no

p-cymene - yes no - no no - no yes

1 .

Reverse

هک تسا نیا ینعم هب دروم هدام و نژ نیب سکعرب هطبار

.دراد دوجو رظن

1. Rreverse means that there is an inverse relationship between the gen and the corresponding compound.

هجیتن یریگ یلک

نامه روط نژ ،داد ناشن جیاتن هک رد یبایزرا دروم یاه

بیکرت یضعب دروم اه

ریثأت هدننکدودحم یلو ،دنتشاد

بیکرت نیا یقاب دروم رد اه

هب لامتحا نژ نیا یاه

بلغ هک دندوب TPSs

ة هجیتن رد و رتشیب ریثأت

یگدننکدودحم نژ .دنتشاد ار

شقن یسرربدروم یاه

رد ار یتایح نیمأت

هدام شیپ تبسن نییعت و اه

نآ اه

دننام(

نپرت زا یضعب دروم رد اما ،دنراد )idi

اه

هب لامتحا ریثأت یگدننکدودحم نژ

یاه

،TPSs

ریثأت

نژ یگدننکدودحم یاه

هدشدای ار

هب ناونع لماع

هدننکدودحم مک

گنر تکن .تسا هدرک ة

هک یرگید

یم ار جیاتن دناوت هب

روط لماک تسرد ،دهدن ناشن

نژ هک تسا تیعقاو نیا هب طوبرم یاه

یسرربدروم رد

یم میظنت یسیونور زا سپ حطس

نیاربانب و دنوش نژ نیا شهاک ای و شیازفا

یمن ار اه ناوت

هب عطقروط هب

رییغت یریذپ یاه نپرت حطس رظندروم

زا .داد طبر یوس

رگید نپرت لاقتنا ،ناهایگ یخرب دروم رد هب هشیر زا اه

هک تسا هدش هدهاشم ییاوه شخب یم

دناوت تبسن

نایب نژ یاه نپرت هب طوبرم نیا دوجوم نازیم اب ار اه

نیا رد داوم شخب

یاه ییاوه هارمگ هدننک ؛دهد ناشن

هکنیا نمض یسم دروم رد

یاهر و MEP

نیا MVA

هلئسم لباق هجوت شیپ لدابت هک تسا هدام

اه نیا نیب

هک ،تسا هدش هدهاشم فلتخم ناهایگ رد ریسم ود نیب تبسن دشاب هداد خر هایگ نیا رد لدابت نیا رگا نژ اه نپرت و مه زاب ار یدیلوت یاه هدیچیپ

رت یم دنک .

هک یدراوم هب هجوت اب ،لک رد نیاربانب هراشا

جیاتن ،دش

شرازگ یعطق هلاقم نیا رد هدش هدوبن

اب جیاتن و

لامتحا نایب .تسا هدش

REFERENCES

1. Abad, M.J., Miguel Bedoya, L., Apaza, L. & Bermejo, P. (2012). The Artemisia L. genus: A review of bioactive essential oils. Molecules, 17, 2542-2566.

2. Botella-Pavı´a, P., Besumbes, O., Phillips, M.A., Carretero-Paulet, L., Boronat, A. & Rodrı´guez- Concepcio´n, M. (2004). Regulation of carotenoid biosynthesis in plants: evidence for a key role of hydroxylmethylbutenyl diphosphate reductase in controlling the supply of plastidial isoprenoid precursors, The Plant Journal, 40, 188-199.

3. Cheng, A.X., Lou, Y.G., Mao, Y.B., Lu, S., Wang, L.J. & Chen, X.Y. (2007). Plant terpenoids:

Biosynthesis and ecological functions. Journal of Integrative Plant Biology, 49(2), 179-186.

4. Huang, J. Z., Cheng, T.C., Wen, P.J., Hsieh, M.H., & Chen, F.C. (2009). Molecular characterization of the Oncidium orchid hdr gene encoding 1 hydroxy-2-methyl-2-(E)-butenyl 4-diphosphate reductase, the last step of the methylerythritol phosphate pathway. Plant Cell Reports., 28, 1475- 1486

5. Iijima, Y., Davidovich-Rikanati, R., Fridman, E., Gang, D.R., Bar, E., Lewinsohn, E. & Pichersky, E. (2004). The biochemical and molecular basis for the divergent patterns in the biosynthesis of terpenes and phenylpropenes in the peltate glands of three cultivars of basil, Plant Physiology, 136, 3724-3736.

6. Ma, Y., Yuan, L., Wu, B., Li, X., Chen, S. & Lu, S. (2012). Genome-wide identification and characterization of novel genes involved in terpenoid biosynthesis in Salvia miltiorrhiza, Journal of Experimental Botany. 63, 2809-2823.

(9)

7. Munoz-Bertomeu, J., Arrillaga, I., Ros, R. & Segura, J. (2006). Up-regulation of 1-deoxy-dxylulose- 5-phosphatesynthase enhances production of essential oils in transgenic Spike lavender. Plant Physiology 142, 890-900.

8. Nagegowda, D.A. (2010). Plant volatile terpenoid metabolism: Biosynthetic genes, transcriptional regulation and sub-cellular compartmentalization, FEBS Letters, 584, 2965-2973.

9. Olofsson, L., Engström, A., Lundgren, A. & Brodelius, P. E. (2011). Relative expression of genes of terpene metabolism in different tissues of Artemisia annua L, BMC Plant Biology, 11, 45.

10. Pfaffl, M.W., Horgan, G.W. & Dempfle, L. (2002). Relative expression software tool (REST©) for group-wise comparison and statistical analysis of relative expression results in real-time PCR.

Nucleic Acids Research, 30(9), e36-e36.

11. Page, J.E., Hause, G., Raschke, M., Gao, W., Schmidt, J., Zenk, M.H. & Kutchan, T.M. (2004).

Functional analysis of the final steps of the 1-deoxy-d-xylulose 5-phosphate (DXP) Pathway to isoprenoids in plants using virus-induced gene silencing. Plant Physiology 134, 1401-1413.

12. Phillips, M.A., Walter, M.H., Ralph, S.G., Dabrowska, P., Luck, K., Uro, E.M., Boland, W., Strack, D., Rodri´guez-Concepcio, M., Bohlmann, J. & Gershenzon, J. )2007(. Functional identification and differential expression of 1-deoxy D-xylulose 5-phosphate synthase in induced terpenoid resin formation of Norway spruce (Picea abies), Plant Molecular Biology, 65, 243-257.

13. Wang, Q., Pi Y., Hou, R., Jiang, K., Huang, Z., Hsieh, M. & Sun, X. (2007). Molecular cloning and characterization of 1-hydroxy-2-methyl-2-(E)-butenyl 4-diphosphate reductase (CaHDR) from Camptotheca acuminata and its functional identification in Escherichia coli; BMB Reports, 29, 112-118.

14. Wen, W. & Yu, R. (2011). Artemisinin biosynthesis and its regulatory enzymes: Progress and perspective, Pharmacogn Review, 5(10), 189.

15. Zare Mehrjerdi, M., Bihamta, M.R., Omidi, M., Naghavi, M.R., Soltanloo, H. & Ranjbar, M. (2013).

Effects of exogenous methyl jasmonate and 2-isopentenyladenine on artemisinin production and gene expression in Artemisia annua, Turkish Journal of Botany 37, 499-505.

16. Zeng, Q., Zhao, C., Yin, L., Yang, R., Zeng, X., Huang, Y., Feng, L. & Yang, X. (2008). Cloning of artemisinin biosynthetic cDNAs and novel ESTs and quantification of low temperature-induced gene over-expression. Science China C Life Science, 51(3), 232-4.

(10)

Expression levels of hdr, fds and idi genes in aerial organs of Artemisia diffusa and their relationships with some terpene contents

Farzad Alaeimoghadam1, Mohamad Reza Naghavi2* and Abdolhadi Hosseinzadeh3 1, 2, 3. Former M.Sc. Student of Agriculture Biotechnology, Professor of Agriculture Biotechnology

and Associate Professor, Department of Agronomy, University College of Agriculture & Natural Resources of University of Tehran, Karaj, Iran

(Received: Nov. 25, 2015 - Accepted: Aug. 31, 2015)

ABSTRACT

In view of the importance of terpene in human’s life, analyzing the relationship between them and the involved genes are of crucial necessity. The necessity is for exploring influential genes. Among different plants containing terpene, Artemisia is included. In this study, several genes Farnesyl diphosphate synthase (fds), Hydroxy-2-methyl-2-(E)-butenyl 4-diphosphate reductase (hdr) and Isopentenyl diphosphate isomerase (idi) in pathways 2-c-methyl-erythritol 4- phosphate (MEP) and Mevalonate (MVA) were analyzed in comparison to some monoterpene and sesquiterpene content in three tissues namely leaf, bud and flower of Artemisia diffusa. This study was conducted to compare RT-PCR data of genes with data from terpene GC-MS results. Results showed that it seemed for certain terpenes production in certain tissues, the above genes had limiting function (as idi in bud for 1,8- cineole and germacrene-D). These genes play important roles in terpene production and for some other terpenes, probably, other downstream genes such as terpene synthase had this limiting role (about beta-farnescene, for example, genes idi and fds had no limiting role in none of tissues mentioned above). Another point which casts doubt on fds, hdr and idi functions in terpene production is post-transcriptional regulation of these genes, the factor which was not evaluated in this study.

Keywords: Artemisia, GC-MS, Real-Time PCR, terpenes.

* Corresponding author E-mail: [email protected] Tel: +98 912 3130360

Referensi

Dokumen terkait