122
ĐỀ CƢƠNG MÔN HỌC PCR NÂNG CAO
(Advanced PCR)
1. Thông tin chung về môn học - Tên môn học: PCR nâng cao - Mã môn học: 211505
- Số tín chỉ: 01 - Môn học: Tự chọn
- Các môn học tiên quyết: Thiết bị và kỹ thuật Công nghệ Sinh học - Giờ tín chỉ đối với các hoạt động: 30 tiết
+ Nghe giảng lý thuyết: 5 tiết + Thực hành, thực tập: 25 tiết + Tự học: 15 tiết
2. Mục tiêu của môn học
Môn học cung cấp cho sinh viên ngành Công nghệ Sinh học các kiến thức cơ bản và chuyên sâu của kỹ thuật PCR, nhận biết được các ứng dụng của kỹ thuật PCR trong các lĩnh vực nông nghiệp (chẩn đoán bệnh, chọn giống), công nghiệp thực phẩm, y tế (xét nghiệm bệnh). Sau khi kết thúc môn học, sinh viên thuần thục các thao tác thực hành liên quan đến kỹ thuật PCR, phát triển kỹ năng làm việc theo nhóm, kỹ năng phân tích và giải quyết các vấn đề nảy sinh, thấy được vai trò, tầm quan trọng cũng như tính ứng dụng cao của kỹ thuật PCR đối với các hoạt động xã hội nên người học cảm thấy yêu thích môn học, nắm vững các kiến thức cũng như thao tác thực hành giúp sinh viên cảm thấy tự tin để mạnh dạn vận dụng kỹ thuật PCR vào các hoạt động thực tiễn xã hội và tìm hiểu các kỹ thuật chuyên sâu khác có liên quan.
3. Tóm tắt nội dung môn học
PCR là một kỹ thuật phổ biến trong sinh học phân tử nhằm khuếch đại nhanh một gen mong muốn lên nhiều lần trong điều kiện in vitro. Kỹ thuật này được sử dụng rộng rãi trong các nghiên cứu sinh học và y học phục vụ nhiều mục đích khác nhau như phát hiện chẩn đoán bệnh, chọn lọc giống, tách dòng gen và xác định huyết thống. Môn học sẽ bao gồm phương pháp ly trích DNA, nguyên tắc cơ bản, thành phần, vai trò các hóa chất và các ứng dụng của kỹ thuật PCR, các dạng kỹ thuật PCR, các vấn đề thường gặp trong kỹ thuật PCR và cách giải quyết, thực hành ứng dụng PCR trong chọn lọc giống heo và xác định nguồn gốc thịt trong thức ăn gia súc.
4. Nội dung chi tiết môn học
Bài 1. Kỹ thuật PCR nâng cao Chương 1: Giới thiệu về kỹ thuật PCR 1.1. Nguyên tắc kỹ thuật PCR
1.2. Lịch sử phát triển
1.3. Các thành phần của phản ứng PCR
Chương 2: Các phương pháp PCR (Nguyên lý và ứng dụng) 2.1. Multiplex PCR
2.2. RT-PCR
2.3. Long distance PCR 2.4. Hot-start PCR 2.5. Nested PCR 2.6. Degenerate PCR
Chương 3: Các vấn đề thường gặp trong kỹ thuật PCR và cách giải quyết
Bài 2. Thực hành ứng dụng PCR trong chọn lọc giống heo dựa trên gen halothan và gen estrogen
2.1. Đặt vấn đề
2.2. Thao tác thực hiện
123 2.2.1. Tách chiết DNA từ máu
2.2.2. Phản ứng PCR khuếch đại gen halothan và gen estrogen 2.2.2.1. Nguyên tắc
2.2.2.2. Quy trình PCR khuếch đại gen halothan 2.2.2.3. Quy trình PCR khuếch đại gen estrogen
2.2.3. Xác định kiểu gen halothan và estrogen bằng enzyme cắt giới hạn 2.2.3.1. Nguyên tắc
2.2.3.2. Qui trình xác định kiểu gen halothan bằng enzyme cắt giới hạn 2.2.3.3. Qui trình xác định kiểu gen estrogen bằng enzyme cắt giới hạn
Bài 3. Thực hành ứng dụng kỹ thuật multiplex-PCR xác định nguồn gốc thịt trong thức ăn gia súc
3.1. Đặt vấn đề
3.2. Thao tác thực hiện
3.2.1. Tách chiết DNA từ thức ăn gia súc
3.2.2. Phản ứng multiplex-PCR phát hiện thịt heo, bò, cừu, gà, cá 3.2.2.1. Nguyên tắc
3.2.2.2. Qui trình thực hiện 5. Học liệu
5.1. Học liệu bắt buộc
Hồ Huỳnh Thùy Dương. 2002. Sinh Học Phân Tử (Khái Niệm - Phương Pháp – Ứng Dụng).
Tái bản lần 2, NXB Giáo Dục, Thành Phố Hồ Chí Minh.
5.2. Học liệu tham khảo
Michael A. innis, David H. Gelfand, Jonh J. Sininsky. 1999. PCR Applications Protocols for Functional Genomics.
6. Chính sách đối với môn học và các yêu cầu khác của giảng viên
Yêu cầu sinh viên có mặt đầy đủ và hoàn thành tất cả các bài thực hành trong từng buổi học, làm bài báo cáo, phân tích kết quả thực hành. Sinh viên dịch thuật ít nhất 2 tài liệu khoa học (bài báo, chương mục của sách) do giáo viên cung cấp
7. Phƣơng pháp, hình thức kiểm tra - đánh giá kết quả học tập môn học
Nội dung đánh giá: tham gia học tập trên lớp (20%), bài báo cáo kết quả thực hành (50%), kiểm tra - đánh giá cuối kì (tự luận) (30%).
