Ardiana DW. 2009. Teknik isolasi DNA genom tanaman pepaya dan jeruk dengan menggunakan modifikasi buffer CTAB. Bul Tek Pertan. 14 (1):12-16. Ariyanti Y. 2012. Aplikasi DNA barcode pada penentuan spesies ikan danau laut
tawar, Nanggroe Aceh Darussalam [skripsi]. Bogor (ID): Institut Pertanian Bogor.
Becker WM, Kleinsmith LJ, Hardin J. 2000. The World of The Cell. Ed ke-4. New York (US): The Benjamin Publishing Company.
Bellard MG, Outdet P, Chambon P. 1973. Isolation of high molecular weight DNA from mammalian cells. Eur J Biochem. 36:32-38.
Bravi CM, Liron JP, Mirol PM, Ripoli MV, Garcia PP, Giovambattista G. 2004. A simple method for domestic animal identification in Argentina using PCR-RFLP analysis of cytochrome b gene. Leg Med. 6:246-251.
Buwono ID, Rosidah. 2010. Uji Sensitifitas Metode One Step dan Nested PCR terhadap Deteksi Penyakit KHV pada Ikan Mas (Cyprinus carpio). Lembaga Penelitian dan Pengembangan Masyarakat Universitas Padjajaran.
Clark DP, Pazdernik NJ. 2011. Biotechnology: Academic Cell. Massachusetts (US): Academic Press.
Fatchiyah. 2010. DNA qualitative and quantitative analysis [Internet]. [diacu 2014 Agustus 13]. Tersedia dari: http://fatchiyah.lecture.ub.ac.id/teaching-res ponsibility/general/dna-qualitative-quantitative-analysis/.
Fatchiyah, Rahayu S, Aruminingtyas EL. 2011. Isolasi DNA. Di dalam : Fatchiyah, Arumingtyas EL, Widyarti S, Rahayu S. Biologi Molekular-Prinsip Dasar Analisis. Jakarta (ID): Erlangga. hlm 21-32.
Fatchiyah. 2011. Uji Kuantitatif dan Kualitatif. Di dalam: Fatchiyah, Arumingtyas EL, Widyarti S, Rahayu S. Biologi Molekular-Prinsip Dasar Analisis. Jakarta (ID): Erlangga. hlm 34-37.
Fatchiyah, Aruminingtyas EL. 2011. Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP). Di dalam: Fatchiyah, Arumingtyas EL, Widyarti S, Rahayu S.
Biologi Molekular-Prinsip Dasar Analisis. Jakarta (ID): Erlangga. hlm 42-45.
Froese R, Pauly D. 2014. Fish base [Internet]. [diacu 2014 September 9]. Tersedia dari: http://www.fishbase.org.
Garibyan L, Avashia N. 2013. Polymerase chain reaction. J Invest dermatol. 133 (6):1-4.
Grunenwald H. 2003. Optimization of Polymerase Chain Reaction. Di dalam: Barlett JMS, Stirling D, editor. PCR Protocols Ed ke-2. New Jersey (US): Humana Press Inc.hlm 90-95.
14
[KBBI] Kamus Besar Bahasa Indonesia. 2008. Ikan [Internet]. [diacu 2014 September 6]. Tersedia dari: bahasa.kemdiknas.go.id/kbbi/index.php. Kocher TD, White TJ. 1989. Evolutionary analysis via PCR. Di dalam: Erlich H
A, editor. PCR Technology: Principles and Aplication for DNA amplification. New York (US): Stockton Press. hlm 137-147.
Lockley A, Bardsley R. 2000. Novel method for discrimination of tuna (Thunnus thynnus) and bonito (Sarda sarda) DNA. J Agric Food Chem. 48:4463-4468.
Minarovic T, Trakovicka A, Rafayova A, Lieskovska Z. 2010. Animal species identification by PCR-RFLP of cytochrome b. Anim Sci Biotechnol. 43 (1):296-299.
Muladno. 2002. Seputar Teknologi Rekayasa Genetika. Bogor (ID): Pustaka Wirausaha Muda.
Nebola M, Borilova G, Kasalova J. 2010. PCR-RFLP analysis of DNA for the differentiation of fish species in seafood samples. Bull Vet Inst Pulawy. 54: 49-53.
Noegroho A. 2013. Keanekaragaman hayati laut Indonesia terbesar di dunia [Internet]. [diacu 2014 Agustus 27]. Tersedia dari: http://kkp.go.id/ index.php/arsip/c/9822/keanekaragaman-hayati-laut-indonesia-terbesar-di-dunia/?category_id=.
Pascoal A, Prado M, Castro J, Cepeda A, Barrosvelasquez J. 2004. Survey of authenticity of meat species in food products subjected to different technological processes, by means of PCR-RFLP analysis. Eur Food Res Technol. 218: 306-312.
Putri NTAF. 2010. Karakterisasi spesies bahan baku ikan air tawar komersial berbasis PCR-sequencing dan perbandingan metode ekstraksi DNA [skripsi]. Bogor (ID): Institut Pertanian Bogor.
Roger SO, Bendich. 1994. Extraction of Total Cellular DNA from Plant, Algae, and Fungi. Molecular Biology Manual.
Salkind NJ. 2007. Encyclopedia of Measurement and Statistics Volume 1. California (US): Sage Publications Inc.
Sambrook J, Fritsch FF, Maniastis T. 1982. Molecular Cloning. A laboratory manual. Ed ke-1. New York (US): Cold Spring Harbor Laboratory.
Sambrook J, Fritsch FF, Maniastis T. 1989. Molecular Cloning. A laboratory manual. Ed ke-2. New York (US): Cold Spring Harbor Laboratory.
Saputra D. 2009. Gambaran restriction fragment length polymorphism (RFLP)
gen sitokrom b DNA mitokondria dari sembilan spesies ikan air tawar konsumsi [skripsi]. Bogor (ID): Institut Pertanian Bogor.
Syahailatua A. 2010. Identifikasi stok ikan, prinsip dan kegunaannya. Oseana.
18(2):55-63.
Tataurov AV, You Y, Owczarzy R. 2008. Predicting ultraviolet spectrum of single stranded and double stranded deoxyribonucleic acids. Biophys Chem. 133 (1-3):66-70.
Teletchea F. 2009. Molecular dentification methods of fish species: reassesment and possible applications. Rev Fish Biol Fish. 19:265-293.
Turtinen LW, Juran BD. 1998. Protein salting-out method applied to genomic DNA isolation from fish whole blood. Bio Tech. 24:238-239.
15 [UNDIP] Universitas Diponegoro (ID). 2013. Uji DNA untuk identifikasi ikan spesies baru dari Kaimana Papua [Internet]. [diacu 2014 Agustus 25]. Tersedia dari: http://msdp.undip.ac.id/s3/berita-143-uji-dna-untuk-identifi kasi-ikan-spesies-baru-dari-kaimana-papua.html.
Vin ALL, Adam A, Tedder A, Arnold KA, Mable BK. 2011. Validation of swabs as non destructive and relatively non-invasive DNA sampling method in fish. Mol Ecol Resour. 11 (1):107-109.
Wasko AP, Martins C, Oliveira C, Foresti F. 2003. Non-destructive genetic sampling in fish. An improved method for DNA isolation from fish fins and scales. Her. 138:161-165.
Wolf C, Rentsch J, Hubner P. 1999. PCR-RFLP analysis of mitochondrial DNA: a reliable method for species identification. J Agric Food Chem. 47 (4):1350-1355.
16
Lampiran 1 Analisis ragam jumlah rata-rata konsentrasi sampel DNA daging dan sirip ikan laut
17 Lampiran 2 Analisis ragam jumlah rata-rata tingkat kemurnian sampel DNA
18
Lampiran 3 Perhitungan manual fragmen restriksi Hinf I sirip ikan selar
Keterangan : DNA Ladder : 100 bp : 3.1 cm
200 bp : 2.6 cm
300 bp : 2.4 cm
400 bp : 2.1 cm
Fragmen restriksi sirip selar : 2.3 cm (332 bp)
B
era
t m
olekul (
bp)
19 RIWAYAT HIDUP
Penulis dilahirkan di Sukabumi pada 13 Agustus 1993. Penulis merupakan anak pertama dari tiga bersaudara dari pasangan Yudhi Rhahadian dan Leni Nuraeni. Penulis bersekolah dari sekolah dasar (SD) sampai dengan sekolah menengah atas (SMA) di Kota Sukabumi. SD Negeri Brawijaya Kota Sukabumi ditempuh penulis selama enam tahun dan lulus pada tahun 2005. Jenjang pendidikan selanjutnya adalah SMP Negeri 1 Kota Sukabumi yang ditempuh selama dua tahun dan lulus pada tahun 2007. Setelah lulus SMP, penulis melanjutkan bersekolah di SMA Negeri 1 Kota Sukabumi dan lulus pada tahun 2010. Penulis diterima di IPB melalui jalur undangan seleksi masuk IPB (USMI) pada tahun 2010.
Selama menjadi mahasiswa FKH IPB, penulis pernah menjadi anggota pengurus PC IMAKAHI IPB dan anggota Divisi Informasi dan Komunikasi Himpro Ornithologi dan Unggas pada tahun kepengurusan 2011/2012 serta ketua divisi internal Himpro Ornithologi dan Unggas pada tahun kepengurusan 2012/2013.