Asdak C. 1995. Hidrologi dan pengelolaan daerah aliran sungai. Yogyakarta (ID): UGM press.
Azrita, Nugroho E, Syandri H, Dahelmi dan Syaifullah. 2011. Genetik Ikan Bujuk (Channa lucius Cuvier, Channidae) dari Perairan Sumatera Barat, Jambi dan Riau Berdasarkan Marker DNA. Berita Biologi 10(5): 675-680.
Barlow GW. 1961. Causes and significance of morphological variation in fishes. Syst. Zool 10:105-117.
Bengen DG. 2000. Sinopsis teknik pengambilan contoh dan analisis data biofisik sumberdaya pesisir. Bogor (ID): Pusat Kajian Sumberdaya Pesisir dan Lautan. Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan IPB. 88 hlm.
Boyd, C.E. 1988. Water quality in warmwater fish ponds. Fourth Printing Auburn Univ. Agricultural Experiment Station. Alabama, USA. 625 p.
Buckel JA, Steinberg ND, Conover DO. 1995. Effects of temperature, salinity, and fish size on growth and consumption of juvenile bluefish. Journal of Fish Biology,47 (4): 696–706.
Budiharjo A. 2001. Perubahan karakter morfologi ikan Tawes (Barbodes gonionotus) yang hidup di danau Gua Serpeng, Gunung kidul. Biodiversitas 2: 104-109 Carter MW, Shoup DE, Dettmers JM, Wahl DA. 2010. Effects of turbidity and cover on
prey selectivity of adult smallmouth bass. Transactions of the American Fisheries Society 139: 353–361.
Dettinger MD, Diaz HF. 2000. Global Characteristics of Stream Flow Seasonality and Variability. Journal of Hydrometeorology 1(4): 289-310.
Effendi H. 2003. Telaah kualitas air bagi pengelolaan sumberdaya dan lingkungan perairan. Yogyakarta (ID): Penerbit Kanisius.
Gosline WA. 1996. Structures associated with feeding in three broad-mouthed, benthic fish groups. Environ. Biol. Fishes, 47:399-405.
Hadisusanto S, Tussanti I, Trijoko. 2011. Status Komunitas Ikan di Perairan Sungai Klawing dan Serayu, Somagede, Banyumas, Jawa Tengah: Upaya Pemantauan
26
dalam Rangka Menjaga Kelestariannya dalam Endi Setiadi Kartamihardja. (eds).
Prosiding Forum Nasional Pemacuan Sumber Daya Ikan III, PR 04: 1-5.
Hebert PDN, Ratnasingham S, deWaard JR. 2003. Barcoding animal life: cytochrome c oxidase subunit 1 divergences among closely related species. Proceeding of the Royal Society. 270: 96–99.
Ihssen PE, Brooke HE, Casselman JM, McGlade JM, Payne NR, Utter FM. 1981. Stock identification:materials and methods. Canadian Journal Fish Aquat Science.
38:1838-1855.
Indu M, Ambili TR, Manimekalan A. 2012. In sillico analysis of the molecular phylogeny of Siluriformes inferred from mitochondrial CO1 gene. IJALS 5: 71-78.
Kottelat M, Whitten AJ, Kartikasari SN, Wirjoatmodjo S. 1993. Freshwater fishes of Western Indonesia and Sulawesi. Singapore: Periplus Edition. 291pp + 84 plates. Leary RF, Allendorf FW, Knudsen KL. 1983. Developmental stability and enzyme
heterozygosity in rainbow trout. Nature (Lond.) 301: 71–72.
Maniagasi R, S Sipriana. Tumembouw, Mundeng Y. 2013. Analisis kualitas fisika kimia air di areal budidaya ikan Danau Tondano Provinsi Sulawesi Utara. Budidaya Perairan 1(2): 29-37.
Nosil P. 2008. Perspective Speciation with gene flow could be common. Journal compilation 2103-2106.
Pin Y, Hao Z, Li-qiao C, Jin-yun Y, Na Y, Zhi-min G, Da-xiang S. 2007. Genetic structure of the oriental river prawn (Macrobrachium nipponense) from Yangtze and Lancang River, inferred from COI gene sequence. Zoological Research
28(2): 113-118.
Pramono TB, Marnani S. 2006. Pola Penyerapan Kuning Telur dan Perkembangan Organogenesis pada Stadia Larva Ikan Brek (Puntius orphoides). Program Sarjana Perikanan dan Kelautan. Universitas Soedirman: Purwokerto. 1-4.
Quinn GP, Keough MJ. 2002. Experimental Design and Data Analysis for Biologists. United Kingdom (UK): Cambridge University Press. 526 p.
Rahardjo MF, Sjafei DS, Affandi R, Sulistiono, Hutabarat J. 2011. Iktiologi. Bandung: Lubuk Agung. 396 ha l. Smith HM. 1945. The freshwater fishes of Siam or Thailand. Smithsonian Institution. United States National Bulletin 188. 622 p. Ratti JT, Garton EO. 1996. Research and experimental design. Di dalam: Bookhout TA,
editor. Research and Management Techniques for Wildlife and Habitats. New York (US): Allen Pr. 1–23 p.
Rumondang. 2013. Kajian makanan dan pertumbuhan ikan brek (barbonymus balleroides val. 1842) di sungai serayu kabupaten banjarnegara provinsi jawa tengah. [tesis]. Bogor: Pascasarjana. 74 p.
Salmin. 2005. Oksigen terlarut (DO) dan kebutuhan oksigen biologi (BOD) sebagai salah satu indikator untuk menentukan kualitas perairan. Oseana 30(3): 21–26. Sharp JC, Able KW, Legget WC, Carscaden JE. 1978. Utility of meristic and
morphometric characters for identification of capelin (Mallotus vi`lotus) stocks in Canadian Atlantic waters. J. Fish. Res.Bd. Can 35:124-130.
Suryaningsih S. 2012. Karakter Morfometri dan Karakter Reproduksi Ikan Brek, Puntius orphoides (Valenciennes, 1842) dan Tawes, P. javanicus (Bleeker, 1863) di sungai Klawing Purbalingga, Jawa Tengah. [disertasi]. Yogyakarta: Pascasarjana UGM.
27 Tamura K, Dudley J, Nei M, Kumar S. 2007. MEGA 4: Molecular Evolutionary
Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0. Molecular Biology and Evolution 10.1093/molbev/msm092.
Tatangindatu F, Kalesaran O, Rompas R. 2013. Studi Parameter Fisika Kimia Air pada Areal Budidaya Ikan di Danau Tondano Desa Paleloan Kabupaten Minahasa.
Budidaya Perairan 1(2): 8-19
Vannote RL, Minshal GW, Cummins KW, Sedell JR, Coshing CE. 1980. T he River Continuum Concept. Canadian Journal Fish Aquat Science 37: 130-137.
Van Valen L. 1962. A study of fluctuating asymmetry. Evolution 16: 125-142.
Wahyuningsih E, Lestari W, Setyaningrum N, Sugiarto. 2011. Struktur komunitas dan distribusi ikan di zona atas waduk Sungai Serayu sebagai dasar konservasi. Pros Sem Nas : 32-38.
Ward RD, Zemlak TS, Innes BH, Last PR, Hebert PDN. 2005. D NA barcoding Australia’s fish species. Philosophical Transactions the Royal Society Biologycal Sciences 360: 1847–1857.
Wardoyo STH. 1981. Kriteria Kualitas Air untuk Keperluan Pertanian dan Perikanan.
Bogor (ID): PPLH-UNDP-PSL IPB.
Weber M, de Beaufort LF. 1916. The Fishes of the Indo-Australian Archipelago. Ostariophysi: II. Cyprinoidea, Apodes, Synbranchii. Leiden (NL): E.J. Brill. 455p.
Wedemeyer GA. Physiology of Fish in Intensive Culture System. International Thompson Publishing: New York. 232 p.
Wibowo A. 2011. Kajian Bioekologi dalam Rangkan Menentukan Arah Pengelolaan Ikan Belida (Chitala lopis Bleeker 1851) di Sungai Kampar, Provinsi Riau. [Tesis]. Bogor: Pascasarjana IPB. 203 p.
Wulandari DA. 2004. P enanganan Sedimentasi Waduk Mrica. Berkala Ilmiah Teknik keairan 13(4): 264-271.
Zein MSA, Sulandari S. 2008. S truktur populasi genetika ayam hutan hijau menggunakan sekuen hypervariable 1 D-Loop DNA Mitokondria. Biota 13:182-190.
Yulfiperius, Toelihere MR, Affandi R, Subardja DS. 2004. Pengaruh alkalinitas teriiadap kelangsungan hidup dan pertumbuhan ikan lalawak Barbodessp.
28
Lampiran 1 Gambar lokasi pengambilan sampel di Sungai Serayu
ST I ST II
ST III
ST IV
ST V ST VI
HILIR
WADUK
HULU
ST III
29 Lampiran 2 Gambar jenis alat tangkap yang digunakan