• Tidak ada hasil yang ditemukan

Gejala sekresi mukus yang berlebihan merupakan respons perlindungan tubuh ikan terhadap invasi agen patogen termasuk KHV, serta perubahan yang

terjadi pada lingkungan hidupnya. Mukus pada kulit terdapat pada lapisan

epidermis yang berfungsi sebagai pertahanan tubuh ikan. Selain mukus, pada

lapisan epidermis juga terdapat sel-sel yang dapat bermigrasi secara bebas seperti

limfosit dan makrofag. Sel-sel ini mempunyai peranan penting dalam imunitas

kulit. Limfosit pada lapisan epidermis menyekresikan imunoglobulin ke dalam

mukus kulit (Takashima

CF><

., 1995; Roberts, 2001). Lapisan mukus yang terdiri

dari

7 89:;:<

y

=> 99?>@ABC=G

memiliki fungsi yaitu: 1) membentuk lapisan licin di

kulit sehingga mengurangi gesekan gerakan dalam air, 2) melindungi tubuh

JKLMNLO NPNQ KQR KL STUV KLMWN XNL MRN MYNM KLVN SZMKL [\ ]Q KX YL JTLMYVKPQTUNNL

ST RT W JN PY N RPN^ Y JNL H] RKPV KPNL JN XNQ V PZ^ K^ Z^ Q ZPKMT X N^ Y _`NUN^ WYQ N

et a

ab

l

cddefg ZZXKhijkablmmc]n

o KXN YL ^KU PK^Y QTUT^ pNLM RKPX KRY WNL [ MKqN XN pNL M JY SKQTUNL VN JN

V KPQ TUNL ST RT W YUNL N JN XN W V KLJNPN WNL JNL XTU N VNJN UT X YS n rKqNX N V KLJN PNWNL

pNLMSKPqN JYJY^KRN RUNLZXKWV KO NWLpNV KQ RT XT WJN PNWnsKON WLpNN PSKPYN S NTtKLN

JNVN S JY^KRN RU NL ZXKW R KRKPNV N WN X ^KV KPS Y SPNT QN [ V KPN JNL MNL [ N SNT K P Z^Y VNJN

JYL JYLM V KQ RT XT W JN PNWn uTUN NS NT U KPT^NU N L UT X YS JNVN S JY^ KRN RUNL ZX KW

V KLNL MNL NL pN L M UN^ N P JNL N SNT YLvK^SN^Y

KU S ZVN PN^YS ^ KWYLMMN QKLMNUY RN SUNL U KV KUNNL SKPW NJNV YLv KU^Y ^KUTL JKP QKL qN JY Q KL YLMUN Sn w KRKPNVN KU S ZVNPN^ Y S

JNVN S Q KL qNJY V KLpKRN R T SNQN N RPN^Y UT XY S Q K^ U YVTL SY JNU VN PN W[ LNQ TL XTUN

SKP^KRT SQ KPTVNU NLVYL STRNMYQ N^TULpNN MKLxN M KLYLv KU^ Y_y ZRKPS^ [lmmc] n

rKqNXN XNYL pNL M JY SKQTUNL NJN XNW JY^ U ZXZPN^Y UT XY S n s KPT RNWNL S KP^ KRT S

JNVN S JY^ KRN RU NL ZXKW R KRKPNV N WN X NL SN PN XN YL NJNL pN YL tN^ Y N M KL VN SZM KL N SNT

SKPqN JYL pN V K PT RN WNL X YL MUTL MNL pN L M UTPNL M QKLMTL STL MUNL RN MY U K WYJTVNL

YUNL n oY^ SKQKL JZU PYLpN LMSKPJYPYJN PYU KX KL qNPxUKX KL qN PpNL MQKL^ KU P K^ YWZPQ ZL

Q KQRNL ST Q KQKX YWN PN JNL QKLMNST P vTL M^ YxvTLM^Y tY SN X NL SNPN XN YL PK^ V ZL

SKPWN JNV zi{hz z JNL OK JKPN n |YUN S KPqNJY zi{hz z N SNT O KJK PN [ ^ Y^ SKQ KL JZU PYL

Q KQ NOT ^ KPNL MUN YNL PKN U^Y pNL M JY ST qTUNLTL STU Q KQ V KPSN WNLU NL WY JTV n

oN XN W ^ NSTPKNU^YYUNLSKPWNJNV^KPNL MNLN MKL VN S ZM KLQ NTVTLX YLMUTLMNLpN L MUT PNL M

Q KLMTL STL MUNL N JN XN W V KPT RN WNL }N PL N VNJN ST RT WL pN n s K PT RNWNL }NPLN

Q KL qN JY XKRY W VTON S NL SNPN XN YL JY^KRNRUNL ZX KW MNL MMT NL SKPWN JNV ^ KXx^ KX

…† …‡ˆ‰Š‹‰ Œ …Œ …ŽŠŠ‹… ‰‘’ …“ ŽŠ‹…”‰‘ ‡•…” …Š…† … ‡”‰– …† Ž …Š ’ …‘ŽŠ —…Š …†…‡ …“ …Š‹… ‰•Žˆ …“ …” ‡Ž†Ž” …Š˜’‡—…“ …ˆ …†–‰Š‹‰ Œ …Œ” …Šˆ‰ ‘‡ Œ…™ …Šš …‘Š …– ‰Š ’ …“ Žˆ ‡ ›…†  ‰‘” …ކ “‰Š —…Š ŽŠœ …•Ž ž Ÿ ˆ …“ … ˆ‰ ‘–‡”……Š †‡Œ‡™ Ž” …Š˜ ™ …• Ž ˆ‰Š‰ ކ Ž …Š  ¡• †‰•

et al

¢ £¤¥¥„¦– ‰Š ‰– ‡” …Š ’…‡‘ ŽŠ§‰”•Ž…š… ž Ÿ…“ ……™–‰ …‡Ž”‡ ކ“ …Š ”‰– ‡“ Ž …Š Œ‰‘…Š ’‡† –‰ Š ’ …“ Ž ŽŠ§‰”•Ž •Ž• †‰–Ž”  ¨…“ … ™ …‘ Ž ”‰ ¤ …†…‡ © •‰† ‰…™ ˆ‰Š‰†‘ …•Ž˜ žŸ …”…Š Œ‰‘‰ˆŽ” …•Žˆ …“ … † ކ Ž” – …•‡” †‰‘•‰ Œ‡† ª‰ˆŽ” …• Ž žŸˆ …“ … † ކ Ž”– …•‡” –‰‘ ‡ˆ …” …Š ‘ ‰ˆŽ” …•Ž…š… ˜“ …Š™… †‰‘ •‰ Œ‡†“ Ž Œ‡”† Ž” …Š“‰Š— …Š …“ …Š‹… ˆ …‘†Ž”‰«ˆ …‘† Ž”‰ œ Ž‘… ‹… Š— † ‰‘“ ‰†‰”•Ž –‰ …‡Ž –Ž”‘ ¡• ” ¡ˆ ‰‰”† ‘¡Š  žŸ Œ…‘‡ ™ …• Ž ‘‰ˆ Ž” …•Ž … š… † ‰ ‘•‰ Œ‡†˜ ”‰– ‡“ Ž …Š –‰ …Š ’ ‡†” …Š ŽŠ§ Ž †‘ …• Ž ”‰  …ˆ Ž• …Š ‹…Š — ‰ ŒŽ™“ … …–“ …‘Ž” ‡Ž† ¬ ‰– ‰Š† …‘ …ކ‡˜• ‰Œ…—Ž …ŠžŸ…ŽŠŠ ‹…’…† ‡™”‰ˆ‰‘ … Ž‘…Š“ …Š –‰Š ‹‰Œ…‘ ” ‰ ˆ ¡ˆ ‡ …•Ž Ž” …Š “ Ž •‰” ކ …‘Š ‹…  ¨…“ … ¤ …†…‡ © ™ …‘ Ž ˆ …• ›… ŽŠ§‰”•Ž˜ Ž” …Š« Ž” …Š ‹…Š — †‰‘ŽŠ §‰”•Ž …” …Š –‰‘ …•… †Ž“ …” Š ‹…–…Š “‰Š— …Š …“ …Š‹… ‡”… ˆ …“… ” ‡ ކ …” ŽŒ…† …”†Žœ ކ …• ‘‰ˆ Ž” …• Ž ž Ÿ  ž … † ‰‘•‰ Œ ‡† –‰Š ‹‰ Œ …Œ” …Š Ž” …Š • … ŽŠ— –‰Š——¡•¡” «—¡• ¡””…Š †‡ Œ‡™Š ‹… •…† ‡ •…–…  …ŽŠ   ŽŠ—” …™  …” ‡ †‰‘• ‰ Œ‡† –‰–Œ‡…† ˆ‰Š ‹‰ Œ…‘…Š  ž Ÿ • ‰– …”ŽŠ – ‰ ‡…• “ …Š –‰ ‘ ‡ˆ …”…Š ˆ ¡… ˆ‰Š‹‰ Œ …‘ …Š ­ ®¯° ±² ­ ®¯° ³² ´µ² ¶±·¸°­³¯­ ­¯²° £ ¡• †‰• µ± ¸ ¹˜¤¥¥„¦

4.2. UjiPolymerase Chain Reaction(PCR)

º’ ލ ª“ Ž…” ‡” …ЇР† ‡”–‰–…• †Ž” …ŠŽ” …Š – …•“…Š” ¡Ž£»

y

¼· ¯°½­¾¸ · ¼¯² ¦ Œ‰Š …‘«Œ‰Š …‘ †‰‘ ŽŠ§ ‰”•Ž  ž Ÿ ¿…‘Ž •…– ˆ‰ ‹…Š — – ‰Š ‡Š ’ ‡”” …Š —‰ ’ …… ”ŽŠ Ž• žŸ “ Ž ¤¥ ˆ‘¡œ ŽŠ•Ž˜ • ‰ Œ…Š‹…” ÀÁ •…–ˆ‰ –‰Š ‡Š ’‡”” …Š ˆ ¡•ކ ާ ž Ÿ “‰Š —…Š ‡ ’ Ž ¨  ª ž …•Ž‡’ލ ª“Ž• …’ Ž” …Šˆ …“ ……Œ ‰©“ …ŠÂ…– Œ …‘À¥ Ɇ¡“ … ¨ ª ‹…Š— “ Ž—‡Š…” …Š ˆ …“… ˆ‰ ЉŽ†Ž…Š ŽŠ Ž † ‰…™ – ‰–Œ‡”†Ž” …Š …“ …Š‹… ˆ‰Š‹‰Œ …‘ …Š žŸ ˆ …“ … Ž” …Š –…• “ …Š ” ¡ Ž˜Œ…™” …Š …–…• ‰†‰ …™ †‰ ‘ ’…“ ŽŠ ‹… ²½ ±Ä· µ¸ ®¢ ¿‰Š —…Š – ‰Š ——‡Š …”…Š ¼·¯ ³ µ· ­µ± ¬ ˆ™Å«Æ˜ • ‰ Œ…Š‹…” ÀÁ • …–ˆ‰

ÉÊËÌËÍ ÌÎÎÏ Ë ÐÏÑ Ò Ó Ô ÕÑ Ò ÖÒ × ØÙ ÚÛ ÜÝ Þ

mer set

ßÔÐ àáÇ âÒâÒ ÑÏÒË ÌËÖ ÌÎ ÉÊËãÏ É ÔÓÒ×Ò ÎÏÑ ÒÑ ÌÏ Ö Ì ÔäÕâ ÌÎâÊ ËãÏ ËÌÎ ÌäÏËåæÈç ÔèâÏ Ë ÖÒâÏÎÉÊ ËãÏ É ÔÓÒ×Ò ÎÏÑÒ Ôä Õâ ÌÎ éê ëâÏ äÒìÊ ÖÏÎ ÏË ÐÊä ÔÊÑíÒ äÌÑ ÓÏÒ ËËîÏÎ ÊìÌÏ ÓÒ ØÙ ÚÛ ïÊ Ë ããÌËÏ Ï Ë ðÝ Þ ñòÝ óòô ÐÏÑ ÒÓ ÖÊ ÉÌÏ Ë õäÏî òô ö÷ø ùåÈÈåú ÖÊäÑ Êç ÌÖ çÊäÑÒ ×Ï Ö ÑÔÊÑ Ò ×ÒÎ ÌËÖ ÌÎ ÔÊ ÉÊäÒ ÎÑÏÏ Ë ØÙÚÛ ÜÝ Þ ñòÝ óòô Ò ËÒ ÖÊ ÓÏÐ âÒ ãÌËÏÎÏ Ë â Ï ÓÏ É Þ û óðò üô Þýû ðÝ ý üòþÿÝò ýÝ Ø Ù Ú âÒ çÊçÊäÏ ÔÏËÊãÏäÏëÑ Ò ÏÛÙÏÑÒÓÔÊ ËÊ ÓÒ ÖÒÏ ËÔÊ ËâÏ ÐÌÓÌÏ ËÌËÖ ÌÎÉÊË ãÊ ÖÏÐÌÒÑ Ê ËÑ Ò ÖÒ íÒÖÏÑ ðÝ Þ ñòÝ óòô âÏÓÏ É ÉÊËâÊ ÖÊÎÑ Ò íÏäÒÏ Ëá íÏäÒ Ï Ë ØÙÚ âÒ àËâ ÕËÊÑ ÒÏè ÉÊ ËÌË ÍÌÎÎÏ Ë ðÝ Þ ñòÝ óòô ßÔÐ àáÇ îÏ Ëã âÒâÒ ÑÏÒË ÕÓÊ Ð õäÏî òô ö÷ ø ù åÈÈåú ÓÊçÒ Ð Ñ Ê ËÑÒÖÒ× âÏäÒ ÔÏâÏ ðÝ Þ ñòÝóòôÖÐîÉÒ âÒ ËÊÎÒËÏÑ ÊîÏ Ë ãâÒ âÒÑ ÏÒ ËÕÓÊ ÐÊ äìÕíÒ Êäòôö÷øù åÈÈÇúÛ ÏçÊ Ó ÕÎÏÑ ÒÑÏ É ÔÊÓÒÎÏ ËîÏË ãÔÕÑ Ò ÖÒ × ØÙÚÉ Ê ËããÌËÏÎÏ ËÉÊ ÖÕâ Ïï âÏ Ë àÉ ÌËÕÐÒÑÖ ÕÎÒ ÉÒÏÛ

! " # $ % & ' ( )* +, - $ . +-$ . +/- $ # +- $ 0 +-$ 1 +- $ & ' 2 +3- $ 2 +4- $ & ' 5% +,- $ 0 + - $ 6 77 +8- $ 67 7 +3- $ +3- $ 3 +34-$ +3-$ 3 +39- $ +3/ -$ ! 0 +3-: ; +<- $ +!)- $ +6)-$ = $3$ 4:

4.3. Uji Imunohistokimia

0 * * % 3 > $ ! " # * $ , % * ! " #$ * * + -: *? , ! "#: #) * * * 7 4:

B CD EFG HI CD EFG JFKLD MCKJN OP CQR FST CIOGP OCD E GOUO QCI OCP CGCTJF K LDCI CG VCW CXOD YSZB YD CN FSCBF GCNCKZ[LS LKNCG LZP CKB Y GCW FIO\NCS C]^FR FS CECT CGMCKJ P CE CNDF KMFRCR QCKQFJCJCGCKCDE G OU OQCIONFSI FR YNCKNCS CGCOKCP CGCTEF K JJYKC CK ES OD FS MCK J NOP CQ IE FIOUO Q YKN YQ ICDEF GHICDEF G JF KLD PCSO _ ESL`O KI O N FSI FR YN] aP CKMC `CS O CIO JF KFNOQ bc d MCKJ SF GCNOU NOKJJO CN CY e CS CQ JF KFN O Q MCK J SF GCN OU e CYT E CP C ICDEF G HICD EF G JFKLD PCS O _ G LQ CI O N FSI FR YN P ORCKP O KJQ CK PF KJCK ICDEF G HICDEF G JF KLD MCKJ R FS TCI O G P O CDE G OU OQCIO Z P CE CN DFSYE CQCK E FK MFRCR QF JC JCG CK ES LI FI CDE G OU OQCIO] fF KYSYN g CGQFS h AiiijZ `CS OCI O JFKFNOQ QCSF KC

klmn lopp qlrs t

uvs

s muwxys rzx {smslz |oy l} l~n|n|o l~l r lm~| tn |o |vltl {ts wsr €q} los‚ƒ l„…u m lz|o l… |t lzlw †ƒn „‡lˆ l‰smuo †ƒŠ„kx oxwzltx †ƒ} „ …u t lˆ| rs ‹zlo l† m|wuwv u {{lw y lrst ~x rsz s Œ ƒˆ low l Šx {| tlz ~ l} l vlos w lw „…|n l ls{xwz oxt~x rsz s Œ} lww| lz s Œm lrsw Žm lrs w l} ltlyƒ| „ } lwƒ Œ„

 

‘

—˜™š› œ › ž ˜ŸŸ˜ž  ¡™ œ¢ š ¢š£š ™ — Ÿ¤  ¥š¦ — Ÿ¥œžš ™ Ÿ§š £¨œ —¨©£¨œ —¨ª «¬ £š¢š › ž ˜ Ÿ™š¨¥ ™­ ®š  š— £ Ÿ¥˜¯ œšŸ °±² ¢ œ   š³ ¡¨š ™ ¡¨œ˜—´ ¢ œ   šž ˜žš Ÿ ¯ ˜¥š £  Ÿ¥˜¯œšŸ — Ÿ¥¥˜Ÿšžš Ÿ— ™ ¡¢š ›  š œŸ ª« ¬ ˜Ÿ™˜ž ž ¡Ÿµœ¨ —š›œ ¦š›œ  §š Ÿ¥ ¢ œ£¨ ¡  ¦´ ›³š ¥šœ ¤ ¡Ÿ™¡¦ £ Ÿ¨š£š Ÿ — ™ ¡¢š œ— ˜Ÿ¡¦œ›™¡ž œ —œš­ ± š  ™¨› ³ ˜™ ¢ œ£¨  ˜ž šŸ ˜Ÿ™˜ž — Ÿ¥¦œ Ÿ¢š¨ œžž œ¨ ˜š Ÿ¢š  š ——Ÿš¨ œžž›œ—£ ˜  š Ÿ ¦š›œ ˜¯ œ§š Ÿ¥¢ œ šž ˜ž š Ÿ­ ¬¡›  Ÿž¨š Ÿ¶

et al

· ¸¹ºº »¼ — š£ ¡¨ž šŸ ³š ¦½ š — ™ ¡¢š œ— ˜Ÿ¡¦œ› ™¡ž œ —œš — — œ œž œ › Ÿ›œ ™œµœ ™š›¢š Ÿ › £›œ µœ› œ ™š› §š Ÿ¥ ™œ Ÿ¥¥œ ¢š  š — — Ÿ¢ œš¥Ÿ¡› š °±² ›  š œŸ ¢ Ÿ¥š Ÿ ª«¬­ ¾™ ¡¢š œ— ˜Ÿ¡¦œ›™¡ž œ —œš — — œ œž œ ž  ³ œ ¦š Ÿ ¢š š — ¢ ™ ž› œ °±² žš¨ Ÿšž—š —£ ˜š ŸŸ §š³ ¨ œžš ™š Ÿ¢ Ÿ¥š Ÿ› š  š ¦›š ™˜— —³¨šŸ£¨¡™ œŸ§šŸ¥¢ œž ¡¢ ¡  ¦¥ Ÿ¿ ¬ À» Á¸ÂÃÄÅ

R

ÄÆÇÈ ÅÉÊËÆ ÌÄ» Á¼­Í Ÿ¿ ¬À» Á—¨ ˜£šžš Ÿ£¨ ¡¢˜ž°± ² §š Ÿ ¥ —— œ œž œ ³¨š™ — ¡ ž ˜  ¹Î ž ®š´ ³¨›œ µš ™ Ÿ¡Ÿ ©¥ §¤¡›§  š™ ¢ ´ ³¨ ¡žš› œ ¢ œ ¢š š —› œ ™¡£  š› —š› §šŸ ¥™¨œ Ÿµž›œ¢šŸš™š ˜¢ œ¢š  š—š —£ ¡£Ï œ¨ œ¡Ÿ­Ð  šŸ¯˜™Ÿ§š —Ÿ˜¨ ˜™ ¬¡›  Ÿž¨š Ÿ¶ ÄÑ ÆÒ· ¸¹ºº»¼ ´ — ™¡¢š §šŸ¥ £š œŸ¥ ³ šœž ˜Ÿ™˜ž — Ÿ¢ ™ž› œ ž³¨š¢ šš Ÿ — —³¨š Ÿ £¨¡™œ Ÿ §š Ÿ¥ ¢ œž ¡¢ ¡  ¦ ¿ ¬À» Á š¢š š ¦ œ —˜Ÿ¡¦œ› ™ ¡ž œ— œš ´ È Ì ÌÓÅÔÕÒ ÓÔËÄÖ ×Ä ÅÖÄ¢ š ŸÈÌÌÓÅÔÄÒÄ×ÑËÔÅÌÈ×ËÔÖ× ÔÃØ·

4.4. Variasi Genetik dan Sebaran Biogeografis KHV

Нž ˜ Ÿ› œ Ÿ¥ ®Ù Ú ¢ œ šž ˜žš Ÿ ™¨ ¦š¢ 𣠣¨ ¡¢ ˜ž ª«¬ ¢š¨ œ Á» ›š —£  œžš Ÿ £ ¡›œ™ œµ °± ² ´ ¢š Ÿ ¦š›œ Ÿ§š ¢ œ›š¯œžš Ÿ £š¢ š ۚ³  Ü­ Н  š Ÿ¯ ˜™ Ÿ§š ¢ Ÿ¥š Ÿ — Ÿ¥¥˜Ÿšžš Ÿ — ™ ¡¢ š ÝÄÈ ÉÞßÔË àÔÈÅÈ ÅÉ ¢Ÿ¥šŸ Áººá ¨£  œžš› œ — Ÿ¥¥˜Ÿšž šŸ ÖÔÕÑâÆ ËÄ « ˜›™š 

X, hasil sekuensing DNA digunakan sebagai dasar pembuatan

pohon filogenetik KHV. Sebagai pembanding, digunakan sekuen fragmen DNA

KHV dan

ã

y

à ËÈÅÈÇäÄ Ëà ÄÖ åÈ ËÓÖ

3 (CyHV-3) yang berasal dari Jepang.

èéêë ìíì êî ìï ðì íñòí éîó éïíñ ïô õö÷ øù ú ûüìý éò çþ ëì ïî ÿïí êóî í ñ ÿð ÿï ñòÿôéï éñî ìï ô ë ñýóì ûì ýìê þ ìëì ì êñì ï ëì êñ íì éò ÿíññ øù ú ì ï ô ë ñéóîì ï í éëì ïôîì ï ì êñì ï øùú ëì ï ùú ì ïô ý éêì íìò ëì êñ éìïô éêóìîìï ì êñ ìï ìêñìï ìïô ýéêý éë ì éòì ïóï ì ìêñ ìï ìêñì ï øùú ì ïô ë ñéóîì ï éêíéýó ëìì ë ñî éò ÿ ÿîîì ï ëìò ì

clusters

ìýì ïô óì ì ìïô éêë ñêñëì êñîéò ÿ ÿî éò ñóñìêñì ïì êñ ì ïøù ú ìïôýéêì í ìòëì êñøì òñì ïì ï éòììï ìó ïô ì óì èìêì øìò ñ ì ïì ï èì êì ìì èì êì èìòñ ö ó íì ü éïôôì êì ü ñ ó ê õ ÿôìîì êì ó ìéêì èìêì èéïôîóòó õ ÷ éð ëì ï øìòñìïì ïü ñ ó ê ø éò ÿ ÿî éêë ñêñëì êñì êñìïì êñì ïøùúìïôý éêìíìòëì êñ ó ìéêìì êì øìòñì ïì ï èìêìö ó íìüéïôì êì èìêì ñìó øìòñì ïìï ü ñ ó ê ëì ïõø ìîì êì ì éòíì éò õ ö ÷ øùú ì ïô é êì íó î ëìò ì î éòÿ ÿî é ñòñîñ ñ ïôîì í ñ ñòì êñì íììóî é ñêñì ïì ïôê éò ìñ ñïôôñììóé ñò ñî ñì êìîíìóíì ì òì ñ ï ì ïô êéòìñ ë éî ìýìðîì ïí éîó éïõö ÷ øùúìïôý éêì íìò ëì êñ õ ÷éð ëì ï øìòñìïì ï ü ñ ó êûþ é ñòñî ñ ñ ïôîì ð ÿ ÿò ÿôñ èéý éêì ì í éîó é ï õö ÷ øùúò ì ñïïì ìïô éñòñî ñî é ñêñì ï ì ïô

êéòìñ ñ ïôôñû

>95 %) adalah Bali

dengan Nusa Tenggara Timur, DI Aceh, Kalimantan Timur (1), Bengkulu,

Sumatera Barat, DI Yogyakarta, Jawa Barat, dan Kalimantan Barat (1); Nusa

Tenggara Timur dengan DI Aceh, Kalimantan Timur (1), Bengkulu, Sumatera

Barat, DI Yogyakarta, Jawa Barat, dan Kalimantan Barat (1); DI Aceh dengan

Kalimantan Timur (1), Bengkulu, Sumatera Barat, DI Yogyakarta, dan Jawa

Barat; Kalimantan Timur (1) dengan Bengkulu, Sumatera Barat, DI Yogyakarta,

dan Jawa Barat; Bengkulu dengan Sumatera Barat, DI Yogyakarta, dan Jawa

Barat; Sumatera Barat dengan DI Yogyakarta, dan Jawa Barat; DI Yogyakarta

!" # "$" %"&"' () &'" # "$" %" &"' !" *"+ ,-" ' " %"&"' ./01 2 + " 3 4' 5" ( ) "-6 + 7) " -6 + 89 : *; < 5" ! ' &-")4= "+"- = + > -6>= ?? 5" ! - -,+,= , ' , !="'),- ,+ " &,'") 5" !& +"',@ ' , !!,.

> 90 %) adalah Kalimantan Timur (2) dan

DKI Jakarta. Similaritas dan jarak genetik varian-varian KHV yang ditemukan

dapat dilihat pada Gambar 13 dan Tabel 5, sedangkan sebaran biogeografis

molekuler KHV di Indonesia dapat dilihat pada Gambar 14. Berkaitan dengan

variasi genetik KHV yang ditemukan dalam penelitian ini, tingkat similaritas atau

jarak genetik yang diperoleh dari hasil sekuensing DNA dan pohon filogenetik

KHV dapat menggambarkan hubungan antara DNA KHV dari berbagai provinsi

dan dapat memprediksi kemungkinan penyebarannya. Sebagai contoh, varian

yang memiliki tingkat kemiripan yang relatif tinggi atau sangat tinggi,

kemungkinan berasal dari sumber atau lokasi yang sama. Meningkatnya lalulintas

perdagangan ikan koi dan mas antar daerah di wilayah Indonesia maupun antar

negara, membawa kemungkinan menyebarnya varian-varian KHV yang

sebelumnya tidak ditemukan di wilayah atau negara-negara tertentu.

Variasi genetik pada virus merupakan salah satu cara alamiah untuk

Dokumen terkait