121No Morfometrik (G religiosa
PRIMER R CCG AGC T AC T *** **
PRIMER R ---CTCACGAGAA *********
Ayam ATCAGCAACCCCTGCCTGTAATGTACTTCATGACCAGTCTCAGGCCCATTCTTTCCCCCT 1080
PRIMER R CCGAGCTACT--- *** ** Ayam ACACCCCTCGCCCTACTTGCCTTCCACCGTACCTCTGGTTCCTCGGTCAGGCACATCCCA 1140 --- Ayam TGCATAACTCCTGAACTTTCTCACTTTTCACGAAGTCATCTGTGGATTATCTTCCCCTCT 1200 --- Ayam TTAGTCCGTGATCGCGGCATCTTCTCTCTTCTATTGCTGTTGGTTCCTTCTCTTTTTGGG 1260 --- Ayam GCTTCTTCACAGGTTACCCTTCACAGTGCGGGTGCGAGTGCTATTCAAGTGAAGCCTGGA 1320 --- Ayam CTACACCTGCGTTGCGTCCTATCCTAGTCCTCTCGTGTCCCTCGATGAGACGGTTTGCGT 1380 --- Ayam GTATGGGGAATCATCTTGACACTGATGCACTTTGGATCGCATTTGGTTATGGTTCTTCCA 1440 ---
Lampiran 7. Hasil perunutan sebagian D-loop mtDNA burung beo #UK1 CCCCCCCCCTCCCCCCCCGCACTTATTTTTCTCATGCTTTACAGGGTATGTACTTCCTCA TTTAGTATTTTTGCCCCATCAGACACTACTATAATGTAGGATACTCCACGCCATACGGGT ATGCTATGCCAATTCAACTCAAACATTTTCCTCTAAGAGATAATGTTCACACCATTACAC CTCTAGGCACATCTTTGCTTCAGGTACCATAAGCCCAAGTGATCCTACCTCCAGCCGAGC CGCAAGCGTTACTTGAGATCGTACTCTGTTCCTTCGTACTTTCCCCTATTCAACCAAACG GATGAACGTCACAGTACTCCTTTGCATTCCCCTAGACTATTGAATTCGCCCACCTCCTAG GGTCCCATGTTCTACCAACCACTTTCAGGAACTCCCAAGCCAGAGAGCCTG #UK2 CCCCCCCCCCTTCCCCCCCCGCACTTATTTTTCTCATGCTTTACGGGGTATGTACTTCCT CATTTAGTATTTTTGCCCCATCAGACACTACTATAATGTAGGATACTCCACGCCATACGG GTATGCTATGCCAATTCAACTCAAACATCTTCCTCTAAGAGATAATGTTCGCACCATTAC GCCTCTAGGCACATCTTTGCTTCAGGTACCATAAACCCAAGTGATCCTACCTCCAGCCGA GCCGCAAGCGTTACTTGAGATCGTACTCTACTTCCTCGTACTTTCCCCTATTCAACCAAA CGGATGAACGTCACAGTACTCCTTTGCATTCTCCCAGACTATTGAATTCGCCCACCTCCT AGGGTCCCATGTCTTACCAACCACTTTCAGGAGCTCCCAAGCCAGAGAACCTGGTATC #UK3 CCCCCCCCCCTTCCCCCCCCGCACTTATTTTTCTCATGCTTCACGGGGTATGTACTTCCT CATTTAGTATTTTTGCCCCATCAGACACTACTATAATGTAGGATACTCCACGCCATACGG GTATGCTATGCCAATTCAACTCAAACATCTTCCTCTAAGAGATAATGTTCGCACCATTAC GCCTCTAGGCACATCTTTGCTTCAGGTACCATAAACCCAAGTGATCCTACCTCCAGCCGA GCCGCAAGCGTTACTTGAGATCGTACTCTACTTCCTCGTACTTTCCCCTATTCAACCAAA CGGATGAACGTCACAGTACTCCTTTGCATTCTCCCAGACTATTGAATTCGCCCACCTCCT AGGGTCCCATGTCTTACCAACCACTTTCAGGAGCTCCCAAGCCAGAGAACCTGG #UK4 CCCCCCCCCCCTTCCCCCCCCGCACTTATTTTTCTCATGCTTTACGGGGTATGTACTTCC TCATTTAGTATTTTTGCCCCATCAGACACTACTATAATGTAGGATACTCCACGCCATACG GGTATGCTATGCCAATTCAACTCAAACATCTTCCTCTAAGAGATAATGTTCGCACCATTA CGCCTCTAGGCACATCTTTGCTTCAGGTACCATAAACCCAAGTGATCCTACCTCCAGCCG AGCCGCAAGCGTTACTTGAGATCGTACTCTACTTCCTCGTACTTTCCCCTATTCAACCAA ACGGATGAACGTCACAGTACTCCTTTGCATTCTCCCAGACTATTGAATTCGCCCACCTCC TAGGGTCCCATGTCTTACCAACCACTTTCAGGAGCTCCCAAGCCAGAGAACCTGGTATC #N1 CCCCCCCCCCCTTCCCCCCCCGCACTTATTTTTCTCATGCTTTACGGGGTATGTACTTCC TCATTTAGTATTTTTGCCCCATCAGACACTACTATAATGTAGGATACTCCACGCCATACG GGTATGCTATGCCAATTCAACTCAAACATCTTCCTCTAAGAGATAATGTTCGCACCATTA CGCCTCTAGGCACATCTTTGCTTCAGGTACCATAAACCCAAGTGATCCTACCTCCAGCCG AGCCGCAAGCGTTACTTGAGATCGTACTCTACTTCCTCGTACTTTCCCCTATTCAACCAA ACGGATGAACGTCACAGTACTCCTTTGCATTCTCCCAGACTATTGAATTCGCCCACCTCC TAGGGTCCCGTGTCTTACCAACCACTTTCAGGAGCTCCCAAGCCAGAGAAC
#N2 CCCCCCCCCCTTCCCCCCCCGCACTTATTTTTCTCATGCTTTACGGGGTATGTACTTCCT CATTTAGTATTTTTGCCCCATCAGACACTACTATAATGTAGGATACTCCACGCCATACGG GTATGCTATGCCAATTCAACTCAAACATCTTCCTCTAAGAGATAATGTTCGCACCATTAC GCCTCTAGGCACATCTTTGCTTCAGGTACCATAAACCCAAGTGATCCTACCTCCAGCCGA GCCGCAAGCGTTACTTGAGATCGTACTCTACTTCCTCGTACTTTCCCCTATTCAACCAAA CGGATGAACGTCACAGTACTCCTTTGCATTCTCCCAGACTATTGAATTCGCCCACCTCCT AGGGTCCCATGTCTTACCAACCACTTTCAGGAGCTCCCAAGCCAGAGAACCTGGTA #N3 CCCCCCCCCCCTTCCCCCCCCGCACTTATTTTTCTCATGCTTTACGGGGTATGTACTTCC TCATTTAGTATTTTTGCCCCATCAGACACTACTATAATGTAGGATACTCCACGCCATACG GGTATGCTATGCCAATTCAACTCAAACATCTTCCTCTAAGAGATAATGTTCGCACCATTA CGCCTCTAGGCACATCTTTGCTTCNGGTACCATAAACCCAAGTGATCCTACCTCCAGCCG AGCCGCAAGCGTTACTTGAGATCGTACTCTACTTCCTCGTACTTTCCCCTATTCAACCAA ACGGATGAACGTCACAGTACTCCTTTGCATTCTCCCAGACTATTGAATTCGCCCACCTCC TAGGGTCCCATGTCTTACCAACCACTTTCAGGAGCTCCCAAGCCAGAG #N4 CCCCCCCCCCCTTNCCCCCCCGCACTTATTTTTCTCATGCTTTACGGGGTATGTACTTCC TCATTTAGTATTTTTGCCCCATCAGACACTACTATAATGTAGGATACTCCACGCCATACG GGTATGCTATGCCAATTCAACTCAAACATCTTCCTCTAAGAGATAATGTTCGCACCATTA CGCCTCTAGGCACATCTTTGCTTCAGGTACCATAAACCCAAGTGATCCTACCTCCAGCCG AGCCGCAAGCGTTACTTGAGATCGTACTCTACTTCCTCGTACTTTCCCCTATTCAACCAA ACGGATGAACGTCACAGTACTCCTTTGCATTCTCCCAGACTATTGAATTCGCCCACCTCC TAGGGTCCCATGTCTTACCAACCACTTTCAGGAGCTCCCAAGCCAGAGAACCTG #M1 CCCCCCCCCCCTTCCCCCCCCGCACTTATTTTTCTCATGCTTTACGGGGTATGTACTTCC TCATTTAGTATTTTTGCCCCATCAGACACTACTATAATGTAGGATACTCCACGCCATACG GGTATGCTATGCCATTTCAACTCAAACATCTTCCTCTAAGAGATAATGTTCGCACCATTA CGCCTCTAGGCACATCTTTGCTTCAGGTACCATAAACCCAAGTGATCCTACCTCCAGCCG AGCCGCAAGCGTTACTTGAGATCGTACTCTACTTCCTCGTACTTTCCCCTATTCAACCAA ACGGATGAACGTCACAGTACTCCTTTGCATTCTCCCAGACTATTGAATTCGCCCACCTCC TAGGGTCCCATGTCTTACCAACCACTTTCAGGAGCTCCCAAGCCAGAGAAC #M2 CCCCCCCCCCCTTCCCCCCCCGCACTTATTTTTCTCATGCTTTACGGGGTATGTACTTCC TCATTTAGTATTTTTGCCCCATCAGACACTACTATAATGTAGGATACTCCACGCCATACG GGTATGCTATGCCATTTCAACTCAAACATCTTCCTCTAAGAGATAATGTTCGCACCATTA CGCCTCTAGGCACATCTTTGCTTCAGGTACCATAAACCCAAGTGATCCTACCTCCAGCCG AGCCGCAAGCGTTACTTGAGATCGTACTCTACTTCCTCGTACTTTCCCCTATTCAACCAA ACGGATGAACGTCACAGTACTCCTTTGCATTCTCCCAGACTATTGAATTCGCCCACCTCC TAGGGTCCCATGTCTTACCAACCACTTTCAGGAGCTCCCAAGCCA
#K1 CCCCCCCCCCTTCCCCCCCCGCACTTATTTTTCTCATGCTTTACGGGGTATGTACTTCCT CATTTAGTATTTTTGCCCCATCAGACACTACTATAATGTAGGATACTCCACGCCATACGG GTATGCTATGCCAATTCAACTCAAACATCTTCCTCTAAGAGATAATGTTCGCACCATTAC GCCTCTAGGCACATCTTTGCTTCAGGTACCATAAACCCAAGTGATCCTACCTCCAGCCGA GCCGCAAGCGTTACTTGAGATCGTACTCTACTTCCTCGTACTTTCCCCTATTCAACCAAA CGGATGAACGTCACAGTACTCCTTTGCATTCTCCCAGACTATTGAATTCGCCCACCTCCT AGGGTCCCATGTCTTACCAACCACTTTCAGGAGCTCCCAAGCCAGAGAACCTGGTA T #K2 CCCCCCCCCCTTCCCCCCCCGCACTTATTTTTCTCATGCTTCACGGGGTATGTACTTCCT CATTTAGTATTTTTGCCCCATCAGACACTACTATAATGTAGGATACTCCACGCCATACGG GTATGCTATGCCAATTCAACTCAAACATCTTCCTCTAAGAGATAATGTTCGCACCATTAC GCCTCTAGGCACATCTTTGCTTCAGGTACCATAAACCCAAGTGATCCTACCTCCAGCCGA GCCGCAAGCGTTACTTGAGATCGTACTCTACTTCCTCGTACTTTCCCCTATTCAACCAAA CGGATGAACGTCACAGTACTCCTTTGCATTCTCCCAGACTATTGAATTCGCCCACCTCCT AGGGTCCCATGTCTTACCAACCACTTTCAGGAGCTCCCAAGCCAGAGAACCTGGT #K3 CCCCCCCCCCTTCCCCCCCCGCACTTATTTTTCTCATGCTTTACGGGGTATGTACTTCCT CATTTAGTATTTTTGCCCCATCAGACACTACTATAATGTAGGATACTCCACGCCATACGG GTATGCTATGCCAATTCAACTCAAACATCTTCCTCTAAGAGATAATGTTCGCACCATTAC GCCTCTAGGCACATCTTTGCTTCAGGTACCATAAACCCAAGTGATCCTACCTCCAGCCGA GCCGCAAGCGTTACTTGAGATCGTACTCTACTTCCTCGTACTTTCCCCTATTCAACCAAA CGGATGAACGTCACAGTACTCCTTTGCATTCTCCCAGACTATTGAATTCGCCCACCTCCT AGGGTCCCATGTCTTACCAACCACTTTCAGGAGCTCCCAAGCCAGAGAACCTG #F1 CCCCCCCCCTCCCCCCCCGCACTTATTTTTCTCATGCTTTACAGGGTATGTACTTCCTCA TTTAGTATTTTTGCCCCATCAGACACTACTATAATGTAGGATACTCCACGCCATACGGGT ATGCTATGCCAATTCAACTCAAACATTTTCCTCTAAGAGATAATGTTCACACCATTACAC CTCTAGGCACATCTTTGCTTCAGGTACCATAAGCCCAAGTGATCCTACCTCCAGCCGAGC CGCAAGCGTTACTTGAGATCGTACTCTGTTCCTTCGTGCTTTCCCCTATTCAACCAAACG GATGAACGTCACAGTACTCCTTTGCATTCCCCTAGACTATTGAATTCGCCCACCTCCTAG GGTCCCATGTTCTACCAACCACTTTCAGGAACTCCCAAGCCAGA #F2 CCCCCCCCCTCCCCCCCCGCACTTATTTTTCTCATGCTTTACAGGGTATGTACTTCCTCA TTTAGTATTTTTGCCCCATCAGACACTACTATAATGTAGGATACTCCACGCCATACGGGT ATGCTATGCCAATTCAACTCAAACATTTTCCTCTAAGAGATAATGTTCACACCATTACAC CTCTAGGCACATCTTTGCTTCAGGTACCATAAGCCCAAGTGATCCTACCTCCAGCCGAGC CGCAAGCGTTACTTGAGATCGTACTCTGTTCCTTCGTGCTTTCCCCTATTCAACCAAACG GATGAACGTCACAGTACTCCTTTGCATTCCCCTAGACTATTGAATTCGCCCACCTCCTAG GGTCCCATGTTCTACCAACCACTTTCAGGAACTCCCAAGCCAGAGAGCCTG
137 P.p.jankowskii, P.p.pica, C.c.interposita, dan Ayam white leghorn (Genbank) sebagai pembanding.
#Ayam white leghorn AACTATGAAT GGTTACAGGA CATACATTTA ACTACCATGT TCTAACCCAT TTGGTTATGC TCGCCGTATC AGATGGATTT [ 80] #Cyanopica_cyanus_interposita GGTGTC--.. ....GTTC.G -...AGG.CG T..--..AAC .TG.CA.TG- A..CACT.TT A.C..A.TCA T.G...G.CC [ 80] #Pica_pica_pica GGTGTC--.. ....GTTC.G -...AGG.CG T..--..AAC .TG.CA.TG- A..CACT.TT A.C..A.TCA T.G...G.CC [ 80] #Pica_pica_jankowskii GGTGTC--.. ....GTTC.G -...AGG.CG T..--..AAC .TG.CA.TG- A..CACT.TT A.C..A.TCA T.G...G.CC [ 80] #Beo_thailand utara CC.CCC--T. CCCCC.CC.C -.CTT....T T..--....C .T..CGGGG. A..TACT.-- -.CT.A.T.A GT..TTT.GC [ 80] #Beo_thailand selatan CC.CC.--T. CCCCC.C... -..TT....T TG.--....C .T..CGGGG. A..TACT.-- -.CT.A.T.A GT..TTT.GC [ 80] #Beo_M1 CC.CCC--T. CCCCC.CC.C -.CTT....T T..--....C .T..CGGGG. A..TACT.-- -.CT.A.T.A GT..TTT.GC [ 80] #Beo_M2 CC.CCC--T. CCCCC.CC.C -.CTT....T T..--....C .T..CGGGG. A..TACT.-- -.CT.A.T.A GT..TTT.GC [ 80] #Beo_K1 CC.CCC--T. CCCCC.CC.C -.CTT....T T..--....C .TC.CGGGG. A..TACT.-- -.CT.A.T.A GT..TTT.GC [ 80] #Beo_UK3 CC.CCC--T. CCCCC.CC.C -.CTT....T T..--....C .TC.CGGGG. A..TACT.-- -.CT.A.T.A GT..TTT.GC [ 80] #Beo_N1 CC.CCC--T. CCCCC.CC.C -.CTT....T T..--....C .T..CGGGG. A..TACT.-- -.CT.A.T.A GT..TTT.GC [ 80] #Beo_N2 CC.CCC--T. CCCCC.CC.C -.CTT....T T..--....C .T..CGGGG. A..TACT.-- -.CT.A.T.A GT..TTT.GC [ 80] #Beo_N3 CC.CCC--T. CCCCC.CC.C -.CTT....T T..--....C .T..CGGGG. A..TACT.-- -.CT.A.T.A GT..TTT.GC [ 80] #Beo_N4 CC.CCC--T. CCCCC.CC.C -.CTT....T T..--....C .T..CGGGG. A..TACT.-- -.CT.A.T.A GT..TTT.GC [ 80] #Beo_K1 CC.CCC--T. CCCCC.CC.C -.CTT....T T..--....C .T..CGGGG. A..TACT.-- -.CT.A.T.A GT..TTT.GC [ 80] #Beo_K3 CC.CCC--T. CCCCC.CC.C -.CTT....T T..--....C .T..CGGGG. A..TACT.-- -.CT.A.T.A GT..TTT.GC [ 80] #Beo_UK2 CC.CCC--T. CCCCC.CC.C -.CTT....T T..--....C .T..CGGGG. A..TACT.-- -.CT.A.T.A GT..TTT.GC [ 80] #Beo_UK4 CC.CCC--T. CCCCC.CC.C -.CTT....T T..--....C .T..CGGGG. A..TACT.-- -.CT.A.T.A GT..TTT.GC [ 80] #Beo_UK1 CC.CCC--C. CCCCC.CC.C -.CTT....T T..--....C .T..CAGGG. A..TACT.-- -.CT.A.T.A GT..TTT.GC [ 80] #Beo_F1 CC.CCC--C. CCCCC.CC.C -.CTT....T T..--....C .T..CAGGG. A..TACT.-- -.CT.A.T.A GT..TTT.GC [ 80] #Beo_F2 CC.CCC--C. CCCCC.CC.C -.CTT....T T..--....C .T..CAGGG. A..TACT.-- -.CT.A.T.A GT..TTT.GC [ 80]
#Ayam white leghorn ATTGATCGTC CACCTCACGA GAGATCA-GC AACCCCTGCC TGTAATGTAC TTCATGACCA GTCTCAGGCC CATTCTTTCC [160] #Cyanopica_cyanus_interposita CCCAGCTAC. T.TA.AGTAG CCA.GA.T.T T.TGGT.... G.--.CA..T ..TC.ATTT. T..GTCTA.T AGGAA..GTT [160] #Pica_pica_pica CCCAGCTAC. T.TA.AGTAG CTA..A.T.T T.TG.T.... G.--.CA..T ...T.TTTAT T..CATT..T AGGAA...AT [160] #Pica_pica_jankowskii CCCAGCTAC. T.TA.AGTAG CTA..A.T.T T.TG.T.... G.--.CA..T ..AT.TTTAT T..CATT..T AGGAA...AT [160] #Beo_thailand utara CCCATCA.A. ACTACT.TA. TGT.GG.TA. TC.A.GCCAT AC--GG...T GCT...C.AT T..AACT--. A.ACA.C.T. [160] #Beo_thailand selatan CCCATCA.A. ACTACT.TA. TGT.GG.TA. TC.A.GCCAT AC--GG...T GAT...C.G. T..AGCT--G T.ACA.C.T. [160] #Beo_M1 CCCATCA.A. ACTACT.TA. TGT.GG.TA. TC.A.GCCAT AC--GG...T GCT...C.AT T..AACT--. A.ACA.C.T. [160] #Beo_M2 CCCATCA.A. ACTACT.TA. TGT.GG.TA. TC.A.GCCAT AC--GG...T GCT...C.AT T..AACT--. A.ACA.C.T. [160] #Beo_K2 CCCATCA.A. ACTACT.TA. TGT.GG.TA. TC.A.GCCAT AC--GG...T GCT...C.A. T..AACT--. A.ACA.C.T. [160] #Beo_UK3 CCCATCA.A. ACTACT.TA. TGT.GG.TA. TC.A.GCCAT AC--GG...T GCT...C.A. T..AACT--. A.ACA.C.T. [160] #Beo_N1 CCCATCA.A. ACTACT.TA. TGT.GG.TA. TC.A.GCCAT AC--GG...T GCT...C.AT T..AACT--. A.ACA.C.T. [160] #Beo_N2 CCCATCA.A. ACTACT.TA. TGT.GG.TA. TC.A.GCCAT AC--GG...T GCT...C.A. T..AACT--. A.ACA.C.T. [160] #Beo_N3 CCCATCA.A. ACTACT.TA. TGT.GG.TA. TC.A.GCCAT AC--GG...T GCT...C.A. T..AACT--. A.ACA.C.T. [160]
138 #Beo_K3 CCCATCA.A. ACTACT.TA. TGT.GG.TA. TC.A.GCCAT AC--GG...T GCT...C.A. T..AACT--. A.ACA.C.T. [160] #Beo_UK2 CCCATCA.A. ACTACT.TA. TGT.GG.TA. TC.A.GCCAT AC--GG...T GCT...C.A. T..AACT--. A.ACA.C.T. [160] #Beo_UK4 CCCATCA.A. ACTACT.TA. TGT.GG.TA. TC.A.GCCAT AC--GG...T GCT...C.A. T..AACT--. A.ACA.C.T. [160] #Beo_UK1 CCCATCA.A. ACTACT.TA. TGT.GG.TA. TC.A.GCCAT AC--GG...T GCT...C.A. T..AACT--. A.ACA...T. [160] #Beo_F1 CCCATCA.A. ACTACT.TA. TGT.GG.TA. TC.A.GCCAT AC--GG...T GCT...C.A. T..AACT--. A.ACA...T. [160] #Beo_F2 CCCATCA.A. ACTACT.TA. TGT.GG.TA. TC.A.GCCAT AC--GG...T GCT...C.A. T..AACT--. A.ACA...T. [160]
#Ayam white leghorn CCCTACACCC CTCGCCCTAC TTGCCTTCCA CCGTACCTCT GGTTCCTCGG TCAGGCACAT C---CCATGC ATAACTCCTG [240] #Cyanopica_cyanus_interposita A....A.... T.ATTTT.CA ..CTT..TTT TATCGTT.A. TT..AT.TT. .A.TTTTA.C AAAATA.ACA .CC.T.TT.A [240] #Pica_pica_pica A....A.... TCATTTT... CCTTT..TTT TATCGTT... TT..AT.TT. ...TTTTA.C AAAA.A.ACA .C..A.TT.A [240] #Pica_pica_jankowskii A....A.... TCATTTT... CCTTT..TTT TATCGTT... TT..AT.TT. ...TTTTA.C AAAATA.ACA .C..A.TT.A [240] #Beo_thailand utara .T...AGAGA TAATGTTCG. ACCAT.A--- ---CG... A.GCA.ATCT .TGCTTCAG- ---GTAC. ....AC..AA [240] #Beo_thailand selatan T..A.AGAGA TAATGTTC.. ACCAT.A--- ---C..T.G. A.GCA.ATCT .TGCTTCAG- ---GTAC. ....AC..AA [240] #Beo_M1 .T...AGAGA TAATGTTCG. ACCAT.A--- ---CG... A.GCA.ATCT .TGCTTCAG- ---GTAC. ....AC..AA [240] #Beo_M2 .T...AGAGA TAATGTTCG. ACCAT.A--- ---CG... A.GCA.ATCT .TGCTTCAG- ---GTAC. ....AC..AA [240] #Beo_K2 .T...AGAGA TAATGTTCG. ACCAT.A--- ---CG... A.GCA.ATCT .TGCTTCAG- ---GTAC. ....AC..AA [240] #Beo_UK3 .T...AGAGA TAATGTTCG. ACCAT.A--- ---CG... A.GCA.ATCT .TGCTTCAG- ---GTAC. ....AC..AA [240] #Beo_N1 .T...AGAGA TAATGTTCG. ACCAT.A--- ---CG... A.GCA.ATCT .TGCTTCAG- ---GTAC. ....AC..AA [240] #Beo_N2 .T...AGAGA TAATGTTCG. ACCAT.A--- ---CG... A.GCA.ATCT .TGCTTCAG- ---GTAC. ....AC..AA [240] #Beo_N3 .T...AGAGA TAATGTTCG. ACCAT.A--- ---CG... A.GCA.ATCT .TGCTTCAG- ---GTAC. ....AC..AA [240] #Beo_N4 .T...AGAGA TAATGTTCG. ACCAT.A--- ---CG... A.GCA.ATCT .TGCTTCAG- ---GTAC. ....AC..AA [240] #Beo_K1 .T...AGAGA TAATGTTCG. ACCAT.A--- ---CG... A.GCA.ATCT .TGCTTCAG- ---GTAC. ....AC..AA [240] #Beo_K3 .T...AGAGA TAATGTTCG. ACCAT.A--- ---CG... A.GCA.ATCT .TGCTTCAG- ---GTAC. ....AC..AA [240] #Beo_UK2 .T...AGAGA TAATGTTCG. ACCAT.A--- ---CG... A.GCA.ATCT .TGCTTCAG- ---GTAC. ....AC..AA [240] #Beo_UK4 .T...AGAGA TAATGTTCG. ACCAT.A--- ---CG... A.GCA.ATCT .TGCTTCAG- ---GTAC. ....AC..AA [240] #Beo_UK1 .T...AGAGA TAATGTTC.. ACCAT.A--- ---C... A.GCA.ATCT .TGCTTCAG- ---GTAC. ....GC..AA [240] #Beo_F1 .T...AGAGA TAATGTTC.. ACCAT.A--- ---C... A.GCA.ATCT .TGCTTCAG- ---GTAC. ....GC..AA [240] #Beo_F2 .T...AGAGA TAATGTTC.. ACCAT.A--- ---C... A.GCA.ATCT .TGCTTCAG- ---GTAC. ....GC..AA [240]
#Ayam white leghorn AACTTTCTCA CTTT----TC ACGAAGTCAT CTGTGGATTA TCTTCCCCTC TTTAGTCCGT GATCGCGGCA TCTTCTCTCT [320] #Cyanopica_cyanus_interposita T.TAA.T.T. ACC.AGAT.G T.C..A.... .AAACAT.C. .TCGTTTACA .CA.ACTTTC CTCTATATT. ..-C.CA-T. [320] #Pica_pica_pica TCTGA.T.T. ACC.AGAT.G T.C..AC... T.A.CAT.C. .TCATTTACA C...ACTTTC CTCTA.TTTT CA-...AATC [320] #Pica_pica_jankowskii TCTGA.T... ACC.AGAA.A T.C..AC... TCA.CAT.C. .TCATTTACA C...ACTTTC CTCTA.TTTC CA-C..AATC [320] #Beo_thailand utara -GTGA..CT. .C.C----CA G.CG..C.GC AA.C.TTACT .GAGAT.G.A C.CTACTTCC TCGTA.TTTC C--C..A--- [320] #Beo_thailand selatan -GTGA..CT. .C.C----CA G.CG..C.GC AA.C.TTACT .GAGAT.G.A C.ATACTTCC TCGTA.TTTC C--C..A--- [320] #Beo_M1 -GTGA..CT. .C.C----CA G.CG..C.GC AA.C.TTACT .GAGAT.G.A C.CTACTTCC TCGTA.TTTC C--C..A--- [320] #Beo_M2 -GTGA..CT. .C.C----CA G.CG..C.GC AA.C.TTACT .GAGAT.G.A C.CTACTTCC TCGTA.TTTC C--C..A--- [320] #Beo_K2 -GTGA..CT. .C.C----CA G.CG..C.GC AA.C.TTACT .GAGAT.G.A C.CTACTTCC TCGTA.TTTC C--C..A--- [320]
139 #Beo_N2 -GTGA..CT. .C.C----CA G.CG..C.GC AA.C.TTACT .GAGAT.G.A C.CTACTTCC TCGTA.TTTC C--C..A--- [320] #Beo_N3 -GTGA..CT. .C.C----CA G.CG..C.GC AA.C.TTACT .GAGAT.G.A C.CTACTTCC TCGTA.TTTC C--C..A--- [320] #Beo_N4 -GTGA..CT. .C.C----CA G.CG..C.GC AA.C.TTACT .GAGAT.G.A C.CTACTTCC TCGTA.TTTC C--C..A--- [320] #Beo_K1 -GTGA..CT. .C.C----CA G.CG..C.GC AA.C.TTACT .GAGAT.G.A C.CTACTTCC TCGTA.TTTC C--C..A--- [320] #Beo_K3 -GTGA..CT. .C.C----CA G.CG..C.GC AA.C.TTACT .GAGAT.G.A C.CTACTTCC TCGTA.TTTC C--C..A--- [320] #Beo_UK2 -GTGA..CT. .C.C----CA G.CG..C.GC AA.C.TTACT .GAGAT.G.A C.CTACTTCC TCGTA.TTTC C--C..A--- [320] #Beo_UK4 -GTGA..CT. .C.C----CA G.CG..C.GC AA.C.TTACT .GAGAT.G.A C.CTACTTCC TCGTA.TTTC C--C..A--- [320] #Beo_UK1 -GTGA..CT. .C.C----CA G.CG..C.GC AA.C.TTACT .GAGAT.G.A C.CT..T.C. TCGTA.TTTC C--C..A--- [320] #Beo_F1 -GTGA..CT. .C.C----CA G.CG..C.GC AA.C.TTACT .GAGAT.G.A C.CT..T.C. TCGT..TTTC C--C..A--- [320] #Beo_F2 -GTGA..CT. .C.C----CA G.CG..C.GC AA.C.TTACT .GAGAT.G.A C.CT..T.C. TCGT..TTTC C--C..A--- [320]
#Ayam white leghorn TCTATTGCTG TTGGTTCCTT CTCTTTTTGG GGCTTCTTCA CAGGTTACCC TTCACAGTGC GG--- GTGCGAGTGC [400] #Cyanopica_cyanus_interposita .A..AATTAA CAAA.CAACA ACT...A.CT T.A..T..A. TC.--.TAAT ..A...AATT T--ACACGA- ----T.AAAA [400] #Pica_pica_pica .T..AAC.AA CGAAC.AACA ACT...A.CA T.AC.T.AAC T---.A.. ..A...AACT T.CATACAAT ACAAC.AAAA [400] #Pica_pica_jankowskii .T..AAC.AA CAAAC.AACA ACT...A.CA TAA.CT.AAC TTAAC..A.. ..A...AACT TATATACAA- ----C.AAAA [400] #Beo_thailand utara .TC.ACCAAA CG.A.GAACG ---.CA CAG.A..--- ---.. ..TG..T.CT C--- ----CCAGA. [400] #Beo_thailand selatan .TC.ACCAAA CG.A.GAACG ---.CA CAG.A..--- ---.. ..TG..T.CT C--- ----CCAGA. [400] #Beo_M1 .TC.ACCAAA CG.A.GAACG ---.CA CAG.A..--- ---.. ..TG..T.CT C--- ----CCAGA. [400] #Beo_M2 .TC.ACCAAA CG.A.GAACG ---.CA CAG.A..--- ---.. ..TG..T.CT C--- ----CCAGA. [400] #Beo_K2 .TC.ACCAAA CG.A.GAACG ---.CA CAG.A..--- ---.. ..TG..T.CT C--- ----CCAGA. [400] #Beo_UK3 .TC.ACCAAA CG.A.GAACG ---.CA CAG.A..--- ---.. ..TG..T.CT C--- ----CCAGA. [400] #Beo_N1 .TC.ACCAAA CG.A.GAACG ---.CA CAG.A..--- ---.. ..TG..T.CT C--- ----CCAGA. [400] #Beo_N2 .TC.ACCAAA CG.A.GAACG ---.CA CAG.A..--- ---.. ..TG..T.CT C--- ----CCAGA. [400] #Beo_N3 .TC.ACCAAA CG.A.GAACG ---.CA CAG.A..--- ---.. ..TG..T.CT C--- ----CCAGA. [400] #Beo_N4 .TC.ACCAAA CG.A.GAACG ---.CA CAG.A..--- ---.. ..TG..T.CT C--- ----CCAGA. [400] #Beo_K1 .TC.ACCAAA CG.A.GAACG ---.CA CAG.A..--- ---.. ..TG..T.CT C--- ----CCAGA. [400] #Beo_K3 .TC.ACCAAA CG.A.GAACG ---.CA CAG.A..--- ---.. ..TG..T.CT CT--- ---.CCAGA. [400] #Beo_UK2 .TC.ACCAAA CG.A.GAACG ---.CA CAG.A..--- ---.. ..TG..T.CT C--- ----CCAGA. [400] #Beo_UK4 .TC.ACCAAA CG.A.GAACG ---.CA CAG.A..--- ---.. ..TG..T.CT C--- ----CCAGA. [400] #Beo_UK1 .TC.ACCAAA CG.A.GAACG ---.CA CAG.A..--- ---.. ..TG..T.C. C--- ----CTAGA. [400] #Beo_F1 .TC.ACCAAA CG.A.GAACG ---.CA CAG.A..--- ---.. ..TG..T.C. C--- ----CTAGA. [400] #Beo_F2 .TC.ACCAAA CG.A.GAACG ---.CA CAG.A..--- ---.. ..TG..T.C. C--- ----CTAGA. [400]
#Ayam white leghorn TATTCAAGTG AAGCCTGGAC TACACCTGCG TTGCGTCCTA TCCTAGTCCT CTCGTGTCCC TCGATG [466] #Cyanopica_cyanus_interposita ....G.-T.A .T..AATATA A.A.GA.A.A .CTT-.TA.. .GTC.T.AT. ----AT.TA. A.AT.A [466] #Pica_pica_pica A...G.-T.A .CA.AATATA A.AGAA.A.A C.TT-..A.C CAT..AAT.. T--AAAC.T. AAACCA [466] #Pica_pica_jankowskii G...A.-T.A .CA.AATATA A.AGAA.A.A C.TT-.TA.C CAT..AAT.. ---.AAC.T. AAACCA [466] #Beo_thailand utara ....G..T.C GCC.ACCTC. ..GGGTCC.A .GT.-.TACC AA.C.C.TTC AGGAGC.... AA.CCA [466]
140 #Beo_M2 ....G..T.C GCC.ACCTC. ..GGGTCC.A .GT.-.TACC AA.C.C.TTC AGGAGC.... AA.CCA [466]
#Beo_K2 ....G..T.C GCC.ACCTC. ..GGGTCC.A .GT.-.TACC AA.C.C.TTC AGGAGC.... AA.CCA [466] #Beo_UK3 ....G..T.C GCC.ACCTC. ..GGGTCC.A .GT.-.TACC AA.C.C.TTC AGGAGC.... AA.CCA [466] #Beo_N1 ....G..T.C GCC.ACCTC. ..GGGTCC.A .GT.-.TACC AA.C.C.TTC AGGAGC.... AA.CCA [466] #Beo_N2 ....G..T.C GCC.ACCTC. ..GGGTCC.A .GT.-.TACC AA.C.C.TTC AGGAGC.... AA.CCA [466] #Beo_N3 ....G..T.C GCC.ACCTC. ..GGGTCC.A .GT.-.TACC AA.C.C.TTC AGGAGC.... AA.CCA [466] #Beo_N4 ....G..T.C GCC.ACCTC. ..GGGTCC.A .GT.-.TACC AA.C.C.TTC AGGAGC.... AA.CCA [466] #Beo_K1 ....G..T.C GCC.ACCTC. ..GGGTCC.A .GT.-.TACC AA.C.C.TTC AGGAGC.... AA.CCA [466] #Beo_K3 ....G..T.C GCC.ACCTC. ..GGGTCC.A .GT.-.TACC AA.C.C.TTC AG-AGC.... AA.CCA [466] #Beo_UK2 ....G..T.C GCC.ACCTC. ..GGGTCC.A .GT.-.TACC AA.C.C.TTC AGGAGC.... AA.CCA [466] #Beo_UK4 ....G..T.C GCC.ACCTC. ..GGGTCC.A .GT.-.TACC AA.C.C.TTC AGGAGC.... AA.CCA [466] #Beo_UK1 ....G..T.C GCC.ACCTC. ..GGGTCC.A .GTT-CTACC AA.C.C.TTC AGGAAC.... AA.CCA [466] #Beo_F1 ....G..T.C GCC.ACCTC. ..GGGTCC.A .GTT-CTACC AA.C.C.TTC AGGAAC.... AA.CCA [466] #Beo_F2 ....G..T.C GCC.ACCTC. ..GGGTCC.A .GTT-CTACC AA.C.C.TTC AGGAAC.... AA.CCA [466]
Keterangan :
M1, M2 : Beo asal populasi Medan K1,K2,K3 : Beo asal populasi Kalimantan N1,N2,N3,N4 : Beo asal populasi Nias F1,F2 : Beo asal populasi Flores
P.p.jankowskii, P.p.pica, dan C.c. interposita (Genbank)sebagai pembanding
#Cyanopica_cyanus_interposita GGTGTCATGG TTGTTCGGAT AAGGTCGTCT CAAACTTGAC ACTG-ATGCA CTTTTACCCC ATTCATGGTG GGTCCCCCAG [ 80] #Pica_pica_pica ... ... ... ... ....-... ... ... ... [ 80] #Pica_pica_jankowskii ... ... ... ... ....-... ... ... ... [ 80] #Beo_thailand utara CCCCC.T.CC CCCCC..C.C TTAT.TT... ..TG...T.. GGG.T...T. ...---..T. ...T.GTA.T TT.G...T [ 80] #Beo_thailand selatan CCCCCTT.CC CCCCCG.A.. TTAT.TT.G. ..TG...T.. GGG.T...T. ...---..T. ...T.GTA.T TT.G...T [ 80] #Beo_M1 CCCCC.T.CC CCCCC..C.C TTAT.TT... ..TG...T.. GGG.T...T. ...---..T. ...T.GTA.T TT.G...T [ 80] #Beo_M2 CCCCC.T.CC CCCCC..C.C TTAT.TT... ..TG...T.. GGG.T...T. ...---..T. ...T.GTA.T TT.G...T [ 80] #Beo_K2 CCCCC.T.CC CCCCC..C.C TTAT.TT... ..TG...C.. GGG.T...T. ...---..T. ...T.GTA.T TT.G...T [ 80] #Beo_UK3 CCCCC.T.CC CCCCC..C.C TTAT.TT... ..TG...C.. GGG.T...T. ...---..T. ...T.GTA.T TT.G...T [ 80] #Beo_N1 CCCCC.T.CC CCCCC..C.C TTAT.TT... ..TG...T.. GGG.T...T. ...---..T. ...T.GTA.T TT.G...T [ 80] #Beo_N2 CCCCC.T.CC CCCCC..C.C TTAT.TT... ..TG...T.. GGG.T...T. ...---..T. ...T.GTA.T TT.G...T [ 80] #Beo_N3 CCCCC.T.CC CCCCC..C.C TTAT.TT... ..TG...T.. GGG.T...T. ...---..T. ...T.GTA.T TT.G...T [ 80] #Beo_N4 CCCCC.T.CC CCCCC..C.C TTAT.TT... ..TG...T.. GGG.T...T. ...---..T. ...T.GTA.T TT.G...T [ 80] #Beo_K1 CCCCC.T.CC CCCCC..C.C TTAT.TT... ..TG...T.. GGG.T...T. ...---..T. ...T.GTA.T TT.G...T [ 80] #Beo_K3 CCCCC.T.CC CCCCC..C.C TTAT.TT... ..TG...T.. GGG.T...T. ...---..T. ...T.GTA.T TT.G...T [ 80] #Beo_UK2 CCCCC.T.CC CCCCC..C.C TTAT.TT... ..TG...T.. GGG.T...T. ...---..T. ...T.GTA.T TT.G...T [ 80] #Beo_UK4 CCCCC.T.CC CCCCC..C.C TTAT.TT... ..TG...T.. GGG.T...T. ...---..T. ...T.GTA.T TT.G...T [ 80] #Beo_F1 CCCCC.C.CC CCCCC..C.C TTAT.TT... ..TG...T.. .GG.T...T. ...---..T. ...T.GTA.T TT.G...T [ 80] #Beo_F2 CCCCC.C.CC CCCCC..C.C TTAT.TT... ..TG...T.. .GG.T...T. ...---..T. ...T.GTA.T TT.G...T [ 80] #Beo_UK1 CCCCC.C.CC CCCCC..C.C TTAT.TT... ..TG...T.. .GG.T...T. ...---..T. ...T.GTA.T TT.G...T [ 80]
#Cyanopica_cyanus_interposita CTACCTATAT AGTAGCCAAG AATGTTATGG TTGCCGGACA TATTTTCTAT TTATTCGTCT ACTAGGAATT GTTACCTAAA [160] #Pica_pica_pica ... ...T..T ...C ... ...CT.T. .AT...CAT. G... TA... [160] #Pica_pica_jankowskii ... ...T..T ...C ... ...AT.T. .AT...CAT. G... TA... [160] #Beo_thailand utara .AGA.AC..C TA..ATGT.. G..AC.CCAC GCCATACGGG ...GC.A.GC CAT...AA.. --C.AAC..C T.CCT....G [160] #Beo_thailand selatan .AGA.AC..C TA..ATGT.. G..AC.CCAC GCCATACGGG ...GA.A.GC CG....AG.. --GTAAC..C T.CT..A..G [160] #Beo_M1 .AGA.AC..C TA..ATGT.. G..AC.CCAC GCCATACGGG ...GC.A.GC CAT...AA.. --C.AAC..C T.CCT....G [160] #Beo_M2 .AGA.AC..C TA..ATGT.. G..AC.CCAC GCCATACGGG ...GC.A.GC CAT...AA.. --C.AAC..C T.CCT....G [160] #Beo_K2 .AGA.AC..C TA..ATGT.. G..AC.CCAC GCCATACGGG ...GC.A.GC CA....AA.. --C.AAC..C T.CCT....G [160] #Beo_UK3 .AGA.AC..C TA..ATGT.. G..AC.CCAC GCCATACGGG ...GC.A.GC CA....AA.. --C.AAC..C T.CCT....G [160] #Beo_N1 .AGA.AC..C TA..ATGT.. G..AC.CCAC GCCATACGGG ...GC.A.GC CA....AA.. --C.AAC..C T.CCT....G [160] #Beo_N2 .AGA.AC..C TA..ATGT.. G..AC.CCAC GCCATACGGG ...GC.A.GC CA....AA.. --C.AAC..C T.CCT....G [160]
142 #Beo_N3 .AGA.AC..C TA..ATGT.. G..AC.CCAC GCCATACGGG ...GC.A.GC CA....AA.. --C.AAC..C T.CCT....G [160] #Beo_N4 .AGA.AC..C TA..ATGT.. G..AC.CCAC GCCATACGGG ...GC.A.GC CA....AA.. --C.AAC..C T.CCT....G [160] #Beo_K1 .AGA.AC..C TA..ATGT.. G..AC.CCAC GCCATACGGG ...GC.A.GC CA....AA.. --C.AAC..C T.CCT....G [160] #Beo_K3 .AGA.AC..C TA..ATGT.. G..AC.CCAC GCCATACGGG ...GC.A.GC CA....AA.. --C.AAC..C T.CCT....G [160] #Beo_UK2 .AGA.AC..C TA..ATGT.. G..AC.CCAC GCCATACGGG ...GC.A.GC CA....AA.. --C.AAC..C T.CCT....G [160] #Beo_UK4 .AGA.AC..C TA..ATGT.. G..AC.CCAC GCCATACGGG ...GC.A.GC CA....AA.. --C.AAC..C T.CCT....G [160] #Beo_F1 .AGA.AC..C TA..ATGT.. G..AC.CCAC GCCATACGGG ...GC.A.GC CA....AA.. --C.AAC... T.CCT....G [160] #Beo_F2 .AGA.AC..C TA..ATGT.. G..AC.CCAC GCCATACGGG ...GC.A.GC CA....AA.. --C.AAC... T.CCT....G [160] #Beo_UK1 .AGA.AC..C TA..ATGT.. G..AC.CCAC GCCATACGGG ...GC.A.GC CA....AA.. --C.AAC... T.CCT....G [160]
#Cyanopica_cyanus_interposita CCCTTATTTT TCATTCTTTT TTTTATCGTT TATTTTTATT TTGTAATTTT AACAAAATAA ACAACCATTT TTATATAATT [240] #Pica_pica_pica ....C... .ACCCT.... ... .C... ....C... ...C.. ...A.A.. ....C.G... [240] #Pica_pica_jankowskii ....C... .ACCCT.... ... .C... ....C... ... ...A.A.. ....C.G... [240] #Beo_thailand utara AGA.A..G.. CGCAC.A..A ---..CC .C.AGGC.CA .CT.TGC..C .G---GT ..C.TA.ACC CA.-G.G..C [240] #Beo_thailand selatan AGA.A..G.. CACAC.A..A ---.AC. .G.AGGC.CA .CT.TGC..C .G---GT ..C.TA.ACC CA.-G.G..C [240] #Beo_M1 AGA.A..G.. CGCAC.A..A ---..CC .C.AGGC.CA .CT.TGC..C .G---GT ..C.TA.ACC CA.-G.G..C [240] #Beo_M2 AGA.A..G.. CGCAC.A..A ---..CC .C.AGGC.CA .CT.TGC..C .G---GT ..C.TA.ACC CA.-G.G..C [240] #Beo_K2 AGA.A..G.. CGCAC.A..A ---..CC .C.AGGC.CA .CT.TGC..C .G---GT ..C.TA.ACC CA.-G.G..C [240] #Beo_UK3 AGA.A..G.. CGCAC.A..A ---..CC .C.AGGC.CA .CT.TGC..C .G---GT ..C.TA.ACC CA.-G.G..C [240] #Beo_N1 AGA.A..G.. CGCAC.A..A ---..CC .C.AGGC.CA .CT.TGC..C .G---GT ..C.TA.ACC CA.-G.G..C [240] #Beo_N2 AGA.A..G.. CGCAC.A..A ---..CC .C.AGGC.CA .CT.TGC..C .G---GT ..C.TA.ACC CA.-G.G..C [240] #Beo_N3 AGA.A..G.. CGCAC.A..A ---..CC .C.AGGC.CA .CT.TGC..C .G---GT ..C.TA.ACC CA.-G.G..C [240] #Beo_N4 AGA.A..G.. CGCAC.A..A ---..CC .C.AGGC.CA .CT.TGC..C .G---GT ..C.TA.ACC CA.-G.G..C [240] #Beo_K1 AGA.A..G.. CGCAC.A..A ---..CC .C.AGGC.CA .CT.TGC..C .G---GT ..C.TA.ACC CA.-G.G..C [240] #Beo_K3 AGA.A..G.. CGCAC.A..A ---..CC .C.AGGC.CA .CT.TGC..C .G---GT ..C.TA.ACC CA.-G.G..C [240] #Beo_UK2 AGA.A..G.. CGCAC.A..A ---..CC .C.AGGC.CA .CT.TGC..C .G---GT ..C.TA.ACC CA.-G.G..C [240] #Beo_UK4 AGA.A..G.. CGCAC.A..A ---..CC .C.AGGC.CA .CT.TGC..C .G---GT ..C.TA.ACC CA.-G.G..C [240] #Beo_F1 AGA.A..G.. CACAC.A..A ---.ACC .C.AGGC.CA .CT.TGC..C .G---GT ..C.TA.GCC CA.-G.G..C [240] #Beo_F2 AGA.A..G.. CACAC.A..A ---.ACC .C.AGGC.CA .CT.TGC..C .G---GT ..C.TA.GCC CA.-G.G..C [240] #Beo_UK1 AGA.A..G.. CACAC.A..A ---.ACC .C.AGGC.CA .CT.TGC..C .G---GT ..C.TA.GCC CA.-G.G..C [240]
#Cyanopica_cyanus_interposita TTAACCTAGA TTGTCCAAAT CATCAAACAT TCATTCGTTT ACATCAAACT TTCCTCTATA TTATCCCCA- TTTATAAATT [320] #Pica_pica_pica ... ...C ...TT.T... ...A... ...CTT.... ...CT ..TCAT.T.A .C.T....CC [320] #Pica_pica_jankowskii .C... A.A...C ...TC.T... ...A... ...CTT.... ...CT ..CCA..T.A .C.T....CC [320] #Beo_thailand utara C..C.TC--- -CAG..G.GC .GCA.GCGT. A.T.GA.A.C GT.CTCT... .C.TCG..CT ..CC-..T.- --.TC..CCA [320] #Beo_thailand selatan C..C.TC--- -CAG..G.GC .GCA.GCGT. A.T.GA.A.C GT.CT.T... .C.TCG..CT ..CC-..T.- --.TC..CCA [320] #Beo_M1 C..C.TC--- -CAG..G.GC .GCA.GCGT. A.T.GA.A.C GT.CTCT... .C.TCG..CT ..CC-..T.- --.TC..CCA [320] #Beo_M2 C..C.TC--- -CAG..G.GC .GCA.GCGT. A.T.GA.A.C GT.CTCT... .C.TCG..CT ..CC-..T.- --.TC..CCA [320] #Beo_K2 C..C.TC--- -CAG..G.GC .GCA.GCGT. A.T.GA.A.C GT.CTCT... .C.TCG..CT ..CC-..T.- --.TC..CCA [320] #Beo_UK3 C..C.TC--- -CAG..G.GC .GCA.GCGT. A.T.GA.A.C GT.CTCT... .C.TCG..CT ..CC-..T.- --.TC..CCA [320]
143 #Beo_N1 C..C.TC--- -CAG..G.GC .GCA.GCGT. A.T.GA.A.C GT.CTCT... .C.TCG..CT ..CC-..T.- --.TC..CCA [320] #Beo_N2 C..C.TC--- -CAG..G.GC .GCA.GCGT. A.T.GA.A.C GT.CTCT... .C.TCG..CT ..CC-..T.- --.TC..CCA [320] #Beo_N3 C..C.TC--- -CAG..G.GC .GCA.GCGT. A.T.GA.A.C GT.CTCT... .C.TCG..CT ..CC-..T.- --.TC..CCA [320] #Beo_N4 C..C.TC--- -CAG..G.GC .GCA.GCGT. A.T.GA.A.C GT.CTCT... .C.TCG..CT ..CC-..T.- --.TC..CCA [320] #Beo_K1 C..C.TC--- -CAG..G.GC .GCA.GCGT. A.T.GA.A.C GT.CTCT... .C.TCG..CT ..CC-..T.- --.TC..CCA [320] #Beo_K3 C..C.TC--- -CAG..G.GC .GCA.GCGT. A.T.GA.A.C GT.CTCT... .C.TCG..CT ..CC-..T.- --.TC..CCA [320] #Beo_UK2 C..C.TC--- -CAG..G.GC .GCA.GCGT. A.T.GA.A.C GT.CTCT... .C.TCG..CT ..CC-..T.- --.TC..CCA [320] #Beo_UK4 C..C.TC--- -CAG..G.GC .GCA.GCGT. A.T.GA.A.C GT.CTCT... .C.TCG..CT ..CC-..T.- --.TC..CCA [320] #Beo_F1 C..C.TC--- -CAG..G.GC .GCA.GCGT. A.T.GA.A.C GT.CTCTGT. CCTTCG.GCT ..CC-..T.- --.TC..CCA [320] #Beo_F2 C..C.TC--- -CAG..G.GC .GCA.GCGT. A.T.GA.A.C GT.CTCTGT. CCTTCG.GCT ..CC-..T.- --.TC..CCA [320] #Beo_UK1 C..C.TC--- -CAG..G.GC .GCA.GCGT. A.T.GA.A.C GT.CTCTGT. CCTTCG..CT ..CC-..T.- --.TC..CCA [320]
#Cyanopica_cyanus_interposita AACAAATCAA CAACTTTTAT CTTGATTTTT AATCG--TTA ATTTAACAAA TTT--ACACG A---TAAA AATATTGA-T [400] #Pica_pica_pica ...G..CT.. ... .A...C...A .C.---A. CC... C..GC.T..A .TACAAC... ..A...-. [400] #Pica_pica_jankowskii ...CT.. ... .A.A..C..A .C.TAAC.A. CC... C..AT.T..A .---C... ..G...A.-. [400] #Beo_thailand utara ...GG..G.. .G---. .ACAG.AC.- --- CC..TG..TT C.C--- ---CC.G .C...A. [400] #Beo_thailand selatan ...GG..G.. .G---. .ACAG.AC.- --- CC..TG..TT C.C--- ---CC.G .C...A. [400] #Beo_M1 ...GG..G.. .G---. .ACAG.AC.- --- CC..TG..TT C.C--- ---CC.G .C...A. [400] #Beo_M2 ...GG..G.. .G---. .ACAG.AC.- --- CC..TG..TT C.C--- ---CC.G .C...A. [400] #Beo_K2 ...GG..G.. .G---. .ACAG.AC.- --- CC..TG..TT C.C--- ---CC.G .C...A. [400] #Beo_UK3 ...GG..G.. .G---. .ACAG.AC.- --- CC..TG..TT C.C--- ---CC.G .C...A. [400] #Beo_N1 ...GG..G.. .G---. .ACAG.AC.- --- CC..TG..TT C.C--- ---CC.G .C...A. [400] #Beo_N2 ...GG..G.. .G---. .ACAG.AC.- --- CC..TG..TT C.C--- ---CC.G .C...A. [400] #Beo_N3 ...GG..G.. .G---. .ACAG.AC.- --- CC..TG..TT C.C--- ---CC.G .C...A. [400] #Beo_N4 ...GG..G.. .G---. .ACAG.AC.- --- CC..TG..TT C.C--- ---CC.G .C...A. [400] #Beo_K1 ...GG..G.. .G---. .ACAG.AC.- --- CC..TG..TT C.C--- ---CC.G .C...A. [400] #Beo_K3 ...GG..G.. .G---. .ACAG.AC.- --- CC..TG..TT C.CT--- ---CCC.G .C...A. [400] #Beo_UK2 ...GG..G.. .G---. .ACAG.AC.- --- CC..TG..TT C.C--- ---CC.G .C...A. [400] #Beo_UK4 ...GG..G.. .G---. .ACAG.AC.- --- CC..TG..TT C.C--- ---CC.G .C...A. [400] #Beo_F1 ...GG..G.. .G---. .ACAG.AC.- --- CC..TG..TT CCC--- ---CT.G .C...A. [400] #Beo_F2 ...GG..G.. .G---. .ACAG.AC.- --- CC..TG..TT CCC--- ---CT.G .C...A. [400] #Beo_UK1 ...GG..G.. .G---. .ACAG.AC.- --- CC..TG..TT CCC--- ---CT.G .C...A. [400]
#Cyanopica_cyanus_interposita TAATGCAATA TAAAAAGATA CATCTTTTAT ATGTCATTAT T----ATTTA CACATTA [457] #Pica_pica_pica ...CA... ...GA... ..CT...C.. CCA.T.AATC .T--A.ACCT ..A.CC. [457] #Pica_pica_jankowskii ...CA... ...GA... ..CT... CCA.T.AATC .---G.ACCT ..A.CC. [457] #Beo_thailand utara .CGCC..CCT CCT.GG.TCC ...G.C...C CAAC..C.T. CAGGAGC.CC ..AGCC. [457] #Beo_thailand selatan .CGCC..CCT CCT.GG.TCC ...G.C...C CAAC..C.T. CAAGAGC.CC ..AGCC. [457] #Beo_M1 .CGCC..CCT CCT.GG.TCC ...G.C...C CAAC..C.T. CAGGAGC.CC ..AGCC. [457] #Beo_M2 .CGCC..CCT CCT.GG.TCC ...G.C...C CAAC..C.T. CAGGAGC.CC ..AGCC. [457]
144 #Beo_K2 .CGCC..CCT CCT.GG.TCC ...G.C...C CAAC..C.T. CAGGAGC.CC ..AGCC. [457]
#Beo_UK3 .CGCC..CCT CCT.GG.TCC ...G.C...C CAAC..C.T. CAGGAGC.CC ..AGCC. [457] #Beo_N1 .CGCC..CCT CCT.GG.TCC .G.G.C...C CAAC..C.T. CAGGAGC.CC ..AGCC. [457] #Beo_N2 .CGCC..CCT CCT.GG.TCC ...G.C...C CAAC..C.T. CAGGAGC.CC ..AGCC. [457] #Beo_N3 .CGCC..CCT CCT.GG.TCC ...G.C...C CAAC..C.T. CAGGAGC.CC ..AGCC. [457] #Beo_N4 .CGCC..CCT CCT.GG.TCC ...G.C...C CAAC..C.T. CAGGAGC.CC ..AGCC. [457] #Beo_K1 .CGCC..CCT CCT.GG.TCC ...G.C...C CAAC..C.T. CAGGAGC.CC ..AGCC. [457] #Beo_K3 .CGCC..CCT CCT.GG.TCC ...G.C...C CAAC..C.T. CAG-AGC.CC ..AGCC. [457] #Beo_UK2 .CGCC..CCT CCT.GG.TCC ...G.C...C CAAC..C.T. CAGGAGC.CC ..AGCC. [457] #Beo_UK4 .CGCC..CCT CCT.GG.TCC ...G.C...C CAAC..C.T. CAGGAGC.CC ..AGCC. [457] #Beo_F1 .CGCC..CCT CCT.GG.TCC ...G..C..C CAAC..C.T. CAGGA.C.CC ..AGCC. [457] #Beo_F2 .CGCC..CCT CCT.GG.TCC ...G..C..C CAAC..C.T. CAGGA.C.CC ..AGCC. [457] #Beo_UK1 .CGCC..CCT CCT.GG.TCC ...G..C..C CAAC..C.T. CAGGA.C.CC ..AGCC. [457]