BAB IV. HASIL DAN PEMBAHASAN
B. Saran
Perlu penelitian lebih lanjut untuk mengetahui produksi enzim eksoprotease A. hydrophila menggunakan senyawa furanon murni yang diisolasi dari buah tomat (L. esculentum Mill.) beserta analisis ekspresi gen untuk mengetahui pengaruh senyawa furanon tersebut terhadap gen penyandi enzim eksoprotease A. hydrophila.
DAFTAR PUSTAKA
Afrianto, E.A dan Liviawaty, E. 1992. Pengendalian Hama dan Penyakit Ikan
Yogyakarta : Kanisius.
Alavandi, A., S. A. Anathan., and G. Kang. 1998. Prevelance in Vitro Secretory Activity and Cytotoxicity of Aeromonas species Associated With Chilhood Gastroenterisis in Chennai (Madras) India. Jpn.J.Med.Sci.Biol
(51):1-12
Allan, B.J. and R.M. Stevenson. 1981. Extracelluler Virulence Factors of A. hydrophila in Fish infection. Can J. Microbiol, 27: 1114-1122.
Atherton, J.G. and J. Rudich. 1996. The Tomato Crop. London : Chapman and Hall.
Bassler, B.L., M. Wright., R.C. Showalter., and M.R. Silverman. 1993. Intercelluler Signalling In Vibrio harveyi : Sequence and Function Of Gene Regulating Expression Of Luminescence. Mol microbiol, 2 : 773- 786.
Bauer, W.D. and J.B. Robinson. 2002. Disruption of Bacterial Quorum Sensing by Other Organism. Current Opinion Biotechnology. 13 : 234-237
Bottarelli, E., and M.C. Ossiprandi. 1999. Aeromonas Infections : An Update.
http://www.unipr.it/arpa/facvet/annali/1999/bottarelli2/bottarelli.htm. Buttery, R.G., G.R. Takeda., M. Naim., H. Rabinowitch., and Y. Nam. 2001.
Analysis of Furaneol in Tomato Using Dynamic headspace sampling with Sodium Sulfate. J. agric food chem, 49 : 4349-4351.
Cascon, A., J. Yugueros., A. Temprano., M. Sanchez., C. Hernanz., J.M. Luengo., and G. Maharro. 2000. A Major Secreted Elastase Is Essential for Pathogenicity Of Aeromonas hydrophila. Infect and Immun, 86(6) : 3233- 3241.
Dong, Y.H., A.R. Gusti., Q. Zhang., J.L. Xu., and L.H. Zhang. 2002. Identification of Quorum Quenching N-Acyl Homoserine Lactonases from Bacillus Species. Appl and Environ Microbiol. 64 (4) : 1754-1759 Eberl, L. 1999. N-Acyl Homoserine lactone. Mediated Genes Regulation in Gram
Negative Bacteria. Syst.Appl. Microbiol, 22(4) : 493-506.
Finch, R.G., D.I. Pritchard., B.W.P. Williams., and G.S.A.B. Stewart. 1998. Quorum Sensing : A Novel Target For Anti Infective Therapy. Jurnal of Antimicrob. Chemotherapy, 42 : 569-571.
Fardiaz, S. 1993. Analisis Mikrobiologi Pangan. Jakarta : PT Grafinddo Persada
Fryer, J.L and J.L. Bartholomew. 1996. Established and Emerging Infectious Disease of Fish. ASM News, 62 : 592-594.
Gavriel, A.A., J.P. Landre., and A.J. Lamb. 1998. Incidence of Mesophilic
Aeromonas Within A public Drinking Water Supply in North East Schotland. J. Appl. Microbiol (84) : 383-392.
Gao, M., M. Teplitski., J.B. Robinson., and W.D. Bauer. 2003. Production of Substances by Medicago truncatula That Affect Bacterial Quorum Sensing. MPMI. 16 (9) : 827-834
Givskov, M., R. de Nys., .M. Manefield, L. Gram., R. Maximilein., L. Eberl., S. Molin., P.D. Steinberg., and S. Kjelleberg. 1996. Eukaryotic Interference with Homoserine Lactone Mediated Prokariotic Signalling. J. Bacteriol .
179 : 6618-6622.
Gram, L., A.B. Christensen., L. Ravn., S . Molin., and M. Givskov. 1999. Production of Acylated Homoserine Lactones by Psichrotrophic Members of The Enterobacteriaceae Isolated From Food. Appl. And Environ. Microbiol. 65(8) : 3458-3463
Hanlon, G. and N.A. Hodges. 1981. Bacitracin and Protease Production In Relation to Sporulation During Exponensial Growth Of Bacillus licheniformis On Poorly Utilized Carbon and Nitrogen Sources. J. Bacteriol, 162(2) : 427-431.
Hayes, J. 2000. Aeromonas hydrophila. Oregon State University : Disease of Fish spring Term Project 2000 (on line). http://www.. Hmsc.orst.edu/classes/hydrophila hayes.
Hentzer, M. and M. Givskov. 2003. Pharmacological Inhibition of Quorum Sensing for The treatment of Chronic Bacterial Infection. J. Clint. Invest
(112): 1300-1307.
Ibrahim, A. and I.C. Mac Rae. 1991. Incidence of Aeromonas and Listeria sp. In Red Meat and Milk Sample in Brisbane, Australia. Int.J. Food microbiol
(12): 263.
Janda, J.M and S.L. Abbot. 1998. Evolving Concepts Regarding The Genus
Aeromonas : An Expanding Panorama of Species, Disease Presentation and Unanswered Question. Clin.infect.Dis, 27 : 332-344.
Khalil. 1997. Toxicity of Crude Extracelluler Products of Aeromonas hydrophila
Kievit, T.R and B.H. Igleweski. 2000. Bacterial Quorum Sensing in Phatogenic Relationship. Infect and Immun. September 2000. p.4839-4849
Kordi, M.G.H. 2004. Penanggulangan Hama dan Penyakit Ikan . Jakarta : Rineka Cipta dan Bina Aksara.
Lonn, J. 2005. May We Fight Bacteria by Inhibitting Cell-Cell Signaling UsingFuranon?. Institute of Oral Biology. Dental Faculty, Universitas Of Oslo Norway. www.odont.uio.no/forsking/uldanning
Lynch, M.J. 2002. The Regulation of Biofilm Development by Quorum Sensing in Aeromonas hydrophila. Environ Microbiol, 4: 18-28.
Maalej, S., M. Denis., and S. Dukan. 2004. Temperature and Growth Phase Effect on Aeromonas hydrophila Survival in Natural Sea Water Microcosm : Role of Protein Synthesis and Nucleic Acid Content on Viable But Temporarily non Culturable response. Microbiol, 150 : 181-187.
Manefield, M., R. de Nys., N. Kumar, R. Read., M. Givskov., P. Steinberg., and S. Kjelleberg,. 1999. Evidence That Halogenated Furanones From Delisea Pulchra Inhibit Acylated Homoserine Lactone (AHL) Mediated Gene Expression By Displacing the AHL Signal From Its Receptor Protein.
Microibol. 145 : 283-291.
Martinelli, D., G.U. Sequin., H. Brandl., R. Bachosen. 2004. Effect of Natural and Chemichally Synthesised Furanones on Quorum sensing in
Chromobacterium violaceum. BMC Microbiol. 4:25.
Mary, P., N.E. Chihib., O. Charafeddine., C. Defives., and J.P. Hornez. 2002. Starvation Survival and Viables But Nonculturable States in Aeromonas hydrophila.Microb. Ecology, 43(2) : 250-258.
McMahon, M.A.S. 2004. The Effect of Modified Atmosphere on Growth and Extracelluler Protein Production in Aeromonas hydrophila.
www.science.ulst.ac.uk/food/Aeromonas.htm
Merino, S., S. Camprubi., and J.M. Thomas. 1992. The Effect of Growth Temperature on Outer Membrane Components and Virulence of
Aeromonas hydrophila Strain of Serotype 0 : 34. Infect Immun, 60 (10) : 4343-4349.
Murray, R.K., D.k. Granner., P.A. Mayes., and V.W. Rodwell. 1996. Biokimia Harper.edisi 24. Jakarta : EGC : 68
Nieto, T.P. and A.E. Ellis. 1986. Characterisation Of Extracelluler Metallo and Serine Proteases Of Aeromonas hydrophila Strain B51. J.Gen Microbiol.
Noga, E.J. 1995. Fish Desease : Diagnosis and Treatment. The C.V Mosbi Company Missoury.
Parsek, M.R., and E.P. Greenberg. 1997. Acyl Homoserine Lactone Quorum Sensing In Gram Negative Bacteria : A Signalling Mechanism Involved
Association With Higher Organism:
http://www.pnas.org/cgi/content/full/96/16/8789=fn152.
Pelzar, J.M. and E.C.S. Chan. 1992. Dasar-dasar Mikrobiologi. Jakarta : UI Press Purnomo, A.T. dan Purwanto, D.A. 2001. Karakterisasi Enzim Proteolitik
Bacillus Subtilis FNCC 0059. Surabaya : Fakultas Farmasi Universitas Airlangga
Rasch, M., C. Buch., B. Austin., W.J. Slierendrecht., K.S. Ekmann., J.L.Larsen., C. Johansen., K. Riedel., L. Eberl., M. Givskov., and L. Gram. 2004. An Inhibitor Of Bacterial Quorum Sensing Reduces Mortality Caused By Vibriosis in Rainbow Trout ( Oncorhynchus mykiss, wal baum).
Systematic and Appl microb, 24(3) : 350-359.
Rasmussen, T.B., M. Manefield., J.B. Anderson., L. Eberl., U. Anthoni., C. Christophersen., P. Steinberg., S. Kjelleberg., and M. Givskov. 2000. How Delisea pulchra Furanones Affect Quorum Sensing and Swarming Motility in Serratia liquefaciens MGJ. Microbiol (146) : 3237-3244. Rasmussen, T.B; T. Bjarnsholt; M.E. Skindersoe; M. Hentzer; P. Kristoffersen.;
M. Kote; J. Nielson; L. Eberl; and M. Givskov. 2005. Screening for Quorum Sensing Inhibitors by Use of A Novel Genetic System The Quorum Sensing Selector. J. Bacteriol. 185(5): 1755-1814
Rodrigues, L.A., A.E. Ellis and T.P. Nieto. 1992. Purification and Characterization of an Extracellular Metalloprotease, Serine Protease, and Hemolisin of Aeromonas hydrophila I strain B32: All are lethal for Fish.
Microbpathogen (13) : 17-24.
Sautor, M., P. Mary., N.E. Chihib., and J.P. Hornez. 2003. The Effect Of Temperature, Water Activity and pH on The Growth of Aeromonas hydrophila and on its Subsequent Survival in Microscosm Water.
Appl.microbiol. 95(4) : 807-813.
Sauriasari, R. 2006. Mengenaal dan Menangkal Radikal Bebas. Berita iptek. 22 Januari 2006.www.beritaiptek.com.
Schauder, S.,and B.L.Bassler. 2001. The Language Of Bacteria. J. Microbiol.
Secades, D. and J.A. Guijarro. 1999. Purification and Characterization of an Extracelluler Proteases from Fish Pathogen Yersinia ruckeri and Effect of Cultures Condition and Production. Applied and Environmental Microbiol. 65 (9), : 3969-3975.
Steenis, C.G.G.J.V. 1997. Flora Untuk Sekolah di Indonesia. Jakarta : PT. Pradnya Paramita.
Sunarjono, H. 2004. Bertanam 30 Jenis Sayur. Jakarta : Penerbit Swadaya.
Swift, S., A.V. Karlyshev., L. Fish., El Durant., M.K Winson., S.R. Chhabra., P. Williams., S. Macintyre., and G.S. Stewart. 1997. Quorum Sensing In Aeromonas hydrophila and Aeromonas salmonicida Identification Of The LuxRI Homologs and Asa RI and Their Cognate N-acylhomoserine Lactone Signal Molecules. J.Bacteriol. 179(17) : 5271-5281.
Swift, S., M.J. Lynch., L. Fish., D.F. Leink., J.M. Thomas., C.J. A.B. Stewart., P. Williams. 1999. Quorum Sensing –Dependent Regulation and Blokade of Eksoprotease Production in Aeromonas hydrophila . Infection and imunity.
4 : 18-28.
Taga, M.E. and B.L. Bassler. 2003. Chemical Communication among Bacteria.
Pnas Vol. 100 (2) : 14549-14554
Tjitrosoepomo, G. 2002. Taksonomi Tumbuhan (Spermatophyta). Yogyakarta : Gadjah Mada University Press.
Wardhani, S.Z. 2005. Pemantauan Aktivitas Penangkapan Radikal Bebas Secara Kromatografi Lapis Tipis Pada Lalapan. [Tesis]. Departemen farmasi JBPTPTBFA.
Lampiran 1. Komposisi Medium
1. Nutrient Agar dalam 1 liter aquades (Fardiaz, 1993)
Agar………. 15,0 g
Pepton……… 5,0 g
NaCl………. 5,0 g
Yeast Extract……… 2,0 g
Beef Extract……… 1,0 g
2. Luria Bertani (LB) Agar dalam 1 liter aquades
Tryptone……… 10,0 g
Yeast Extract………. 5,0 g
NaCl……….. 10,0 g
Agar……….. 15,0 g
3. Luria Bertani (LB) Broth dalam 1 liter aquades
Tryptone……… 10,0 g
Yeast Extract………. 5,0 g
NaCl……….. 10,0 g
UCAPAN TERIMA KASIH
Segala puji bagi Allah SWT yang telah memberikan rahmat-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan naskah skripsi yang berjudul “PENURUNAN PRODUKSI ENZIM EKSOPROTEASE Aeromonas hydrophila OLEH EKSTRAK BUAH TOMAT (Lycopersicon esculentum Mill. )”. Penyusunan naskah skripsi ini tidak terlepas dari bantuan berbagai pihak, oleh karena itu penulis mengucapkan terima kasih kepada :
1. Bapak dan Ibu serta keluarga di rumah yang telah memberikan seluruh kasih sayang kepada penulis.
2. Bapak Drs. Marsusi, M. S selaku Dekan Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Sebelas Maret Surakarta.
3. Bapak Drs. Wiryanto, M. Si selaku Ketua Jurusan Biologi Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Sebelas Maret Surakarta.
4. Bapak Prof. Drs. Sutarno, M.Sc., Ph.D selaku pembimbing I yang telah membimbing dan mengarahkan dalam pelaksanaan penelitian dan penyusunan skripsi.
5. Ibu Ari Susilowati, M. Si selaku pembimbing II yang telah membimbing dan mengarahkan dalam pelaksanaan penelitian dan penyusunan skripsi. 6. Ibu Dra. Ratna Setyaningsih M. Si, selaku penguji I yang telah
memberikan masukan pada skripsi ini
7. Ibu Solichatun, M. Si selaku penguji II yang telah memberikan masukan pada skripsi ini.
8. Ibu Artini Pangastuti, M. Si atas segala masukan dan bantuan pada skripsi ini
9. Bapak Tjahjadi Purwoko, M.Si selaku pembimbing akademik yang telah mengarahkan selama menempuh studi.
10. Kepala Sub Laboratorium Biologi, Laboratorium Pusat MIPA Universitas Sebelas Maret Surakarta yang telah memberikan izin penelitian, beserta seluruh staff yang telah membantu penulis dalam pelaksanaan penelitian di laboratorium.
11. Umi Lestari, S.Si atas semua ilmu yang ditularkan padaku, atas semua bantuan dan dorongannya mulai dari awal pembuatan proposal sampai tersusunnya naskah skripsi ini .
12. Dian Ratnasih, Irmawati, Wiwin Undari, Slamet Mardiyanto, Feri Lina, Isnaini N.H, Sevi Sawestri, Ana Fitri, Ana N.C dan teman-teman biologi angkatan 2002 atas bantuan dan dorongan semangat selama penelitian 13. Teman-teman Kost Bu Husein atas persaudaraan dan persahabatan yang
kita jalin dan support yang diberikan.
14. Teman-teman seperjuangan di sub Lab. Biologi terima kasih atas segala kerjasamanya
15. Rekan-rekan Biologi angkatan 2001, 2003, dan 2004. 16. Teman-teman remaja masjid Sabilarrosyad Sekarpace 17. Semua pihak yang tidak dapat disebutkan satu-persatu.
RIWAYAT HIDUP PENULIS
Penulis dilahirkan di Klaten pada tanggal 22 Mei 1984. Tahun 1996 penulis menyelesaikan pendidikan dasar di SD Gondangsari II. Selanjutnya, penulis menyelesaikan pendidikan menengah di SLTPN I Juwiring pada tahun 1999 dan SMUN 1 Wonosari Klaten pada tahun 2002. Penulis diterima sebagai mahasiswa di Jurusan Biologi FMIPA UNS melalui jalur UMPTN pada tahun 2002.
Selama menempuh pendidikan di Jurusan Biologi FMIPA UNS, penulis pernah Magang di Pusat Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Biodiversitas Lembaga Penelitian dan Pengabdian Masyarakat (LPPM) UNS, pernah menjadi asisten praktikum mata kuliah Mikrobiologi, Genetika, Biologi Molekuler, Limnologi, Struktur Perkembangan Tumbuhan I, II, dan III, Taksonomi Tumbuhan I, dan Biologi umum. Tahun 2006 Penulis menjadi juara pertama pada Lomba Karya Tulis mahasiswa tingkat Universitas Sebelas Maret, dan termasuk sepuluh besar dalam Lomba Karya Tulis Mahasiswa tingkat Wilayah B dengan judul karya tulis “ Penghambatan Faktor Virulensi Aeromonas hydrophila Oleh Bawang Putih (Allium sativum Linn.) Sebagai Upaya Pencegahan Penyakit Motile Aeromonads Septicemia Pada Ikan”. Pada tahun yang sama Penulis juga terpilih sebagai Mahasiswa Berprestasi Tingkat Jurusan Biologi Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, serta juara kedua lomba Mahasiswa Berprestasi Tingkat Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam. Penulis pernah menjabat sebagai staff Bidang Kaderisasi dan
Pengembangan Organisasi HIMABIO pada periode 2003/2004, staff Bidang Kaderisasi dan Pengembangan Organisasi HIMABIO pada periode 2004/2005, staf Departemen Kemuslimahan SKI FMIPA pada periode 2003/2004, Koordinator Keilmiahan Kelompok Studi Jamur dan Tanaman Obat (MUTANT), serta Dewan Perwakilan Angkatan HIMABIO pada periode 2005/2006.