BAB V KESIMPULAN DAN SARAN
5.2 Saran
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
BAB V
KESIMPULAN DAN SARAN
5.1 Kesimpulan
Kurva amplifikasi pada Real Time Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) menunjukkan bahwa sosis sapi yang beredar di wilayah Bumi Serpong Damai (BSD) tidak tercemar oleh daging babi.
5.2 Saran
Penelitian terhadap status kehalalan dalam produk makanan olahan perlu ditingkatkan dikarenakan daya konsumsi makanan olahan siap saji dikalangan masyarakat Indonesia semakin meningkat.
35
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
DAFTAR PUSTAKA
Ali, M. E., et al. 2012. Analysis of pork adulteration in commercial meatballs
targeting porcine-specific mitochondrial cytochrome b gene by TaqMan probe real-time polymerase chain reaction. Malaysia: Meat Science 91
(2012) 454–459.
Anugrah, R., P. Adirestuti., R. Puspadewi. 2014. Pengawasan Kehalalan Daging
Sapi dan Produk Olahannya di Sektor Usaha Kecil dan Mikro. Jawa Barat.
Fakultas Farmasi Universitas Jendral Achmad Yani: ISBN: 978-602-18580-2-8.
Artika, I. M. 2003. Struktur, Fungsi dan Biogenesis Mitokondria. Eijkman Lecture Series I: Mitochondrial medicine. Lembaga Biologi Molekul Eijkman Jakarta:17-42
Handoyo, Darmo dan Ari Rudiretna. 2001. Prinsip Umum Dan Pelaksanaan
Polymerase Chain Reaction (Pcr). Surabaya: Universitas Surabaya.
Hewajuli, D. A., Dhamayanti, NLPI. 2014. Perkembangan Teknologi Reverse
Transcriptase-Polymerase Chain Reaction dalam Mengidentifikasi Genom Avian Influenza dan Newcastle Disease. Bogor : Balai Besar Penelitian
Veteriner.
Hidayat, Rian. 2015. Perbandingan Metode Kit Komersial Dan Sds Untuk Isolasi
Dna Babi Dan Dna Sapi Pada Simulasi Cangkang Kapsul Keras Untuk Deteksi Kehalalan Menggunakan Real Time Pcr (Polymerase Chain Reaction). Skripsi. Program Studi Farmasi. Fakultas Kedokteran dan Ilmu
Kesehatan. UIN Syarif Hidayatullah Jakarta.
Izzah, A. N. 2014. Perbandingan antara Metode SYBR Green dan Metode
Hydrolisis Probe dalam Analisis DNA Gelatin Sapid an DNA Babi dengan menggunakan Real-Time PCR. Skripsi. Program Studi Farmasi. Fakultas
Kedokteran dan Ilmu Kesehatan. UIN Syarif Hidayatullah Jakarta.
Kheyrodin, Hamid dan Khosro Ghazvinian. 2012. DNA Purification and Isolation
of Genomic DNA from bacterial species by plasmid purification system.
African Journal of Agricultural Research: ISSN
Ma, Hongbao., Kuan-Jiunn, S., Geroge, C., X. Tracy Qiao., Mei-Ying, C. 2006.
Application of Real Time Polumerase Chain Reaction (RT-PCR). The journal
of American science: 2 (3): 1-15
Mane, B. G., S. K. Mendiratta., A. K. Tiwari. 2013. Pork Specific Polymerase
Chain Reaction Assay for Authentication of Meat and Meat Products. India:
36
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
May, Panloup P., Chretien, M. F., Savagner, F., Vasseur, C., Jean, M., Malthiery, Y., Reynier, P. 2003. Increased Sperm Mitochondrial DNA Content In Male
Infertility. Hum Reprod 18(3):550- 556.
Muladno. 2010. Teknologi Rekayasa Genetika. Edisi Kedua. Bogor: IPB Press.
Murray, R. K., Granner, D. K., Rodwell, V. W. 2012. Biokimia Harper. Jakarta : EGC
Mutalib, Sahilah. ABD., et al. 2012. Comparison Between Pork adn Wild Boar
Meat (Sus scrofa) by Polymerase Chain Reacyion-Restriction Fragment Lenght Polymorphism (PCR-RFLP). Malaysia: Universiti Kebangsaan
Malaysia.
Ngili, Yohanis. 2013. Biokimia Dasar. Bandung: Rekayasa Sains
Nishiguchi, M. K., et al. 2002. DNA Isolation Prosedure. Birkhäuser Verlag Basel:Switzerland
Nooratiny, I., Sahilah, A. M., Alif Alfie, A. R., and Mohd. Farouk, M. Y. 2013. DNA Extraction From Ghee dan Beef Species Identification Using Polymerase Chain Reaction (PCR) Assay. Malaysia: IFRJ 20(5):
2959-2961.
Norrakiah, A. S., Shahrul Azim, M. G., Sahilah, A. M. and Abdul Salam, B.2015.
Halal analysis of raw materials, ingredients and finished bakery product using PCR and gene chip southern-hybridization for detection of porcine DNA. Malaysia: International Food Research Journal 22(5): 1883-1887
(2015). Bintang, Maria. 2010. Biokimia Teknik Penelitian. Jakarta: Erlangga
Nurfadila, Mifa. 2015. Isolasi DNA Stomatopoda Sp dan Drosophila
Melanogaster. Blokspot.co.id
Pratami, Dienar Fitri. 2011. Analisis Cemaran Daging Babi Pada Produk Burger
Sapi Yang Beredar di Wilayah Ciputat Melalui Amplifikasi DNA Menggunakan Real Time PCR. Skripsi. Program Studi Farmasi. Fakultas
Kedokteran dan Ilmu Kesehatan. UIN Syarif Hidayatullah Jakarta.
Qhardawi. 1993. Halal Dan Haram Dalam Islam. Bangil: PT. Bina Ilmu.
Radji, Maksum. 2011. Rekayasa Genetika. Jakarta: ISBN : 978-602-8674-40-9
Suparman., W. S. Rahayu., H. T. Atmojo., A. S. 2014. Identifikasi Daging Babi
Dalam Sosis dan Burger Sapi Yang Beredar di Pasar Wage Purwokerto dan Pasar Wanakriya Kebumen Menggunakan Metode Polymerase Chain Reaction (PCR) dan Analisis Restriksi Menggunakan Enzim BamH1 dan BseD1. Purwokerto. Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto: ISBN: 978-602-18580-2-8.
37
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
Susanto, Edi dan Wardoyo. 2014. Pengaruh Substitusi Daging Babi Terhadap
Karakteristik Asam Lemak Sosis. Lamongan. Program Studi Peternakan.
Fakultas Peternakan Universitas Islam Lamongan.
Susmiarsih, T. (2010). Peran Genetika DNA Mitokondroa (mtDNA) Pada
Motilitas Spermatozoa. Universitas Yarsi, Fakultas Kedokteran :Majalah
Kesehatan Pharma Medika.
St. John, J. C., Jokhi, R. P., Barratt, CLR. 2005. The Impact Of Mitochondrial
Genetics On Male Infertility. Int. J. Androl 28:65-73.
Syukriani, Yoni Fuadah. 2012. DNA Forensik. Bandung: Departemen Ilmu Kedokteran Forensik dan Medikolegal Fakultas Kedokteran Universitas Padjadjaran Rumah Sakit Dr. Hasan Sadikin.
Teare, J.M., R. Islam., R. Flanagan., S. Gallagher., M.G Davies., C. Grabau. (1997). Measurement of Nucleic Acid Concentrations Using the DyNA
QuantTM and the GeneQuantTM. BioTechniques 22 : 1170 – 1174.
Viljoen, G. J., Louis, H. N., John, R. C. 2005. Molecular Diagnostic PCR
Handbook. Netherlands: Springer.
Widowati, E. W. 2013. Desai Primer Sitokrom B (cytb b) Sebagai Salah Satu
Komponen PCR (Polymerase Chain Reaction) Untuk Deteksi DNA Babi.
Yogyakarta: Lembaga Penelitian Universitas Islam Negeri Sunan Kalijaga.
Yuningsih, Rahmi. 2010. Perlindungan Konsumen Dari Dampak Buruk Makanan
Tidak Halal Bagi Kesehatan. Jakarta: Pusat Pengkajian Pengolahan Data dan
Informasi Sekretariat Jendral DPR RI.
Yuwono, Triwibowo. 2009. Biologi Molekular. Jakarta : Erlangga
Xiong, Y., M. Sundaralingam. 2001. Protein-Nucleic Acid Interaction. Ohio State University, Columbus, Ohio, USA: Encyclopedia Of Life Sciences
38
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
Lampiran 1. Konsentrasi dan Kemurnian Isolat DNA
Sampel Gambar Konsentrasi dan Kemurian (A280/260) Daging Sapi Konsentrasi 95.587 ng/µl Kemurnian 1.86 Daging Babi Konsentrasi 29.223 ng/µl Kemurnian 1.99 Sampel 1 Konsentrasi 234.110 ng/µl Kemurnian 1.82 Sampel 2 Konsentrasi 43.749 ng/µl Kemurnian 1.77
39
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
Sampel 3 Konsentrasi 22.700 ng/µl Kemurnian 1.87 Sampel 4 Konsentrasi 1.624 ng/µl Kemurnian 1.86 Sampel 5 Konsentrasi 29.223 ng/µl Kemurnian 1.76 Sampel 6 Konsentrasi 33.796 ng/µl Kemurnian 1.75
40
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
Lampiran 2. Perhitungan Pembuatan Larutan Primer
a. Membuat larutan primer 50 µM dari larutan induk 100 µM V1 x N1 = V2 x N2
V1 x 100 = 100 x 50 V1 = 50 µL
Maka, 50 µl diambil dari larutan induk primer konsentrasi 100 µM, kemudian ditambahkan aquabidest sampai volume 100 µl.
b. Membuat larutan primer 5 µM dari seri konsentrasi primer 50 µM. V1 x N1 = V2 x N2
V1 x 50 = 30 x 5 V1 = 3 µL
Maka, diambil 3 µl dari larutan primer konsentrasi 50 µM, kemudian ditambahkan aquabidest sampai volume 30 µl.
c. Membuat larutan primer 0,1 µM dari konsentrasi 5 µM. V1 x N1 = V2 x N2
V1 x 5 = 20 x 0,1 V1 = 0,4 µL
41
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
Lampiran 3. Perhitungan Tm (Melting Temperature) Primer
PRIMER SAPI PRIMER BABI
Primer Sapi Forward Primer Babi Forward
Tm = 2oC (2 + 6) + 4oC (11 + 0) Tm = 2oC (1 + 9) + 4oC (10 + 0)
= 60oC = 60 oC
Primer Sapi Reverse Primer Babi Reverse
Tm = 2oC (4 + 5) + 4oC (2 + 9) Tm = 2oC (5 + 9) + 4oC (2 + 9)
= 62oC = 72oC
Tm rata-rata primer sapi: Tm rata-rata primer babi:
Tm = (60 + 62) / 2 Tm = (60 + 72) / 2
= 6oC = 66oC
42
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
Lampiran 4. Campuran Reaksi Mastermix Untuk Amplifikasi DNA
Konsentrasi Akhir Konsentrasi Awal Jumlah Yang Digunakan Primer Forward 0,1 µM 5 µM 0,4 µl Primer Reverse 0,1 µM 5 µM 0,4 µl UPL 0,2 µM 10 µM 0,4 µl LightCycler®480 Hydrolysis Probe 1x 2x 10 µl ddH2O - - 3,8 µl DNA Template - - 5 µl
43
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
Lampiran 5. Kurva Amplifikasi DNA Daging Sapi, Daging Babi, Sosis Sapi dan
NTC Menggunakan Primer Sapi
a. Kurva Amplifikasi DNA Daging Sapi, Daging Babi, dan NTC
44
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
c. Kurva Amplifikasi DNA Daging Sapi, Sosis sapi, dan NTC (2) d.
45
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
Lampiran 6. Kurva Amplifikasi DNA Daging Sapi, Daging Babi, Sosis Sapi dan
NTC Menggunakan Primer Babi
a. Kurva Amplifikasi DNA Daging Babi, Daging Sapi, dan NTC
46
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta