Struktur populas - TETUA POPULASI DURA A125 DAN A140 (D X D)POPULASI TENERA B01, B02 (TX T) DAN

TETUA POPULASI DURA A125 DAN A140 (D X D)POPULASI TENERA B01, B02 (TX T) DAN POPULAS

5.3.6 Struktur populas

Berdasarkan hasil analisis struktur (Gambar 25), dari 136individu yang berasal dari 5 populasi yaitu 2 populasi Dura (A125, dan A140), 2 populasi Tenera x Tenera/Pisifera (B01 dan B02), dan 1 populasi Dura x Tenera (C72) yang diuji, digrupkan menjadi 2 grup populasi. Populasi B02 (TxT/P) menjadi 1 (satu) grup dibedakan dengan warna merah, sedangkan populasi lainnya (B01, C72, A125, dan A140) berada pada grup yang lain yang dibedakan dengan warna hijau.

61 Bila dilihat dari kemurnian genetik berdasarkan hasil analisis Structure, terlihat beberapa individu menunjukkan adanya kontaminasi genetik. Hal tersebut terlihat pada individu 4 (B01 19-5) dan individu 11 (B01 21-4) yang terlihat ada warna lain (merah) yang mengkontaminasi warna utamanya (hijau). Selanjutnya kedua individu tersebut dapat

Gambar 16. Analisis Structure memperlihatkan terbentuknya dua grup populasi yaitu (1) B01, C72, A140, A125 berwarna hijau dan B02 berwarna merah 5.3.7 Kekerabatan Genetik Berdasarkan Cluster Analisis

Cluster analisis menggunakan pendekatan Neighbour-Joining dan matrik Dissimilarity terhadap 136 individu dari 5 populasi kelapa sawit yang diamati berdasarkan 16 marka SSR dipresentesikan pada gambar 17.Dari populasi yang diuji, hasil analisis membentuk empatgrup (cluster). Grup pertama yaitu populasi B02 yang membentuk grup yang terpisah secara jarak genetik yang jauh dibandingkan dengan populasi lainnya. Grup berikutnya yaitu grup 2 yang terdiri dari populasi B01. Populasi ini berdekatan jarak genetiknya dengan grup 3 yang terdiri dari dua populasi dura (A125 dan A140). Grup 4 yaitu populasi C72 membentuk jarak genetik yang berdekatan dengan grup 2 dan 4. Hasil ini sejalan dengan analisis Structure yang memperlihatkan bahwa populasi B02 memiliki perbedaan genetik yang jauh terhadap populasi yang diuji lainnya (A125, A140, B01 dan C72). Yang menarik dari hasil PCoA adalah, diketahui bila populasi B01 memiliki kedekatan genetik dengan populasi Dura. Hal ini menjadikan populasi B01 dipertimbangkan untuk tidak dilibatkan dalam program pemuliaan kelapa sawit kedepan karena diperkirakan akan menghasilkan efek heterosis yang rendah. Sebagaimana yang diungkap Singh (2015) yang menyatakan bahwa jarak genetik memiliki korelasi yang sangat erat terhadap heterosis. Semakin jauh jarak genetiknya, maka akan semakin tinggi tingkat heterosis yang dihasilkan. Demikian juga sebaliknya.

B01 B02

B02

C72 A140

Gambar 17. Pohon filogenetik empat populasi berdasarkan metoda Tree Construction-Neighnor Joining menunjukkan terbentuknya 4 grup populasi. Grup 1 yaitu populasi B02 (merah);grup 2, populasi B01 (biru) ; grup 3, populasi dura A125 dan A140 ( hitam dan coklat); grup 4, populasi C72 (hijau)

Hasil PCoA juga menunjukkan tingkat kemurnian yang tinggi dari populasi yang diuji. Tidak terlihat adanya pencampuran warna di dalam satu populasi. Hal tersebut mencerminkan bahwa tidak terjadi kontaminasi genetik atau ilegitimasi didalam suatu populasi. Hal ini juga sejalan dengan hasil analisisi Colony dan Structure yang memperlihatkan hasil yang serupa.

Grup 1

Grup 2

Grup 3 Grup 4

Gambar 18.Sebaran sampel berdasarkan Principal Coordinat Analisis (PCoA) menunjukkan bahwa 5populasi yang dianalisis mengelompok menjadi 3 grup. Grup 1 terdiri dari populasi Dura (A140 dan A125) dan populasi B01 (T x T), grup 2 adalah populasi C72 (D x P) dan grup 3 adalah populasi B02 (D x T)

Sebaran sampel berdasarkan Principal Coordinat Analisis (PCoA) menunjukkan bahwa 5populasi yang dianalisis mengelompok menjadi 3 grup. Grup 1 terdiri dari populasi Dura (A140 dan A125) dan populasi B01 (T x T), grup 2 adalah populasi C72 (D x P) dan grup 3 adalah populasi B02 (D x T). Hasil ini sejalan dengan pohon filogenetik yang dihasilkan, yang mengelompokkan populasi dura dengan populasi B01. Sehingga populasi B01 tidak direkomendasikan untuk disilangkan dengan populasi dura. Perlu dilakukan pengamatan dilapang untuk memastikan lebih lanjut penyebab dekatnya kekerabatan dari populasi B01 terhadap populasi dura. Diduga ada kemungkinan terjadi kesalahan didalam memberi label terhadap populasi B01. Ada kemungkinan populasi B01 merupakan adalah populasi dura yang salah dalam pemberian label saat proses persiapan benih.

5.4 Simpulan

Enam belas marka SSR yang dievaluasi menunjukkan 100% bersifat polimorfik terhadap semua populasi (A125, A140, B01, B02 dan C72). Nilai PIC dari ke 16 marka SSR yang digunakan bersifat moderat informatif hingga sangat informatif. Sehingga ke 16 marka SSR ini sangat baik digunakan dalam analisis

Grup 1

Grup 2

DNA. Berdasarkan hasil analisis Structure (Gambar 25), dari 136individu yang berasal dari 5 populasi yaitu 2 populasi Dura (A125, dan A140), 2 populasi Tenera x Tenera/Pisifera (B01 dan B02), dan 1 populasi Dura x Tenera (C72) yang diuji, digrupkan menjadi 2 grup populasi. Populasi B02 membentuk grup tersendiri (berwarna merah), selebihnya 4 populasi lainnya berada pada grup warna hijau. Dari hasil analisis Structureterlihat tingkat kemurnian dari seluruh populasi yang diuji sangat tinggi. Hal ini juga diperkuat oleh hasil analisis PCoA dan filogenetik yang memperlihatkan kemurnian yang tinggi dari seluruh populasi yang diuji. Namun demikian, hasil analisis Colony menunjukkan tingkat akurasi yang tinggi sehingga dapat mengetahui adanya satu individu yang ilegitim. Individu tersebut untuk selanjutnya tidak disarankan digunakan dalam program pemuliaan kelapa sawit lanjutan. Hasil analisis PCoA dan filogenetik memperlihatkan adanya kedekatan genetik dari populasi dura A125, A140 dengan populasi B01 (T x T).

6 PEMBAHASAN UMUM

Peningkatan produktivitas kelapa sawit saat ini lebih diarahkan pada efisiensi dan intensifikasi lahan dengan penggunaan bahan tanaman unggul berkualitas. Bahan tanaman unggul dapat dihasilkan bila ketersediaan plasma nutfah tercukupi. Tersedianya gen-gen bermanfaat pada plasma nutfah yang ada, memungkinkan pemulia tanaman merakit varietas-varietas unggul baru dengan sifat-sifat unggul yang diinginkan(Arias et al. 2012). Upaya untuk memperkaya plasma nutfah kelapa sawit perlu terus dilakukan. Terlebih lagi, sebagian besar tetua kelapa sawit yang saat ini digunakan di dunia khususnya tetua Dura memiliki jarak genetik yang dekat karena berasal dari nenek moyang yang sama yaitu dari 4 tanaman kelapa sawit yang ditanam di Kebun Raya Bogor pada tahun 1848. Untuk itu PT. Astra Agro Lestari Tbk, bekerjasama dengan IRAD (The Institute of Agricultural Research for Development) Kamerun, telah melakukan persilangan terkontrol dan mengintroduksi plasma nutfah advanced genetic material Kamerun ke Indonesia yang dilakukan dalam kurun waktu 3 tahun mulai 2008 sampai 2011.

Analisis DNA menggunakan 16 Marka mikrosatelit (SSR) telah dilakukan terhadap beberapa populasi bahan tanaman yang berasal dari Kamerun. Isolasi DNA dan amplifikasi PCR untuk semua lokus dilaksanakan di Laboratorium Bioteknologi, PT. Astra Agro Lestari Tbk. Di Pangkalan Bun, Kalimantan Tengah. Data genotipe dianalisis menggunakan beberapa software untuk menganalisis genetik populasi dan menganalisis keragaman genetiknya.

Berdasarkan hasil analisis tersebut diketahui bahwa dari 16 marka SSR yang digunakan memiliki tingkat keragaman alel dan polimorfisme yang tinggi. Itu berarti, ke 16 marka SSR tersebut mampu membedakan DNA terhadap individu satu dengan individu lainnya secara baik. Namun pada beberapa pengujian, lokus mEgCIR0173 (LG 3) dan mEgCIR0353 (LG 16) memperlihatkan kecendrungan polimorfisme yang rendah. Untuk itu diperlukan pengkajian kembali lokus-lokus yang memiliki tingkat polimorfisme tinggi pada kedua daerah grup lokus 3 dan 16. Hasil analisis lanjutan menggunakan analisis Structurememperlihatkan bahwa populasi yang diuji dibagi menjadi dua grup yang berbeda. Pengelompokan terutama terjadi pada populasi dura (A125, A127, dan A140) dan juga populasi B01 (T x T). Hasil ini juga serupa pada analisis menggunakan PCoA dan pohon filogenetik yang mengelompokkan populasi dura dengan populasi B01. Hal tersebut menandakan adanya kedekatan genetik yang tinggi dari ke-4 populasi tersebut sehingga tidak disarankan dilakukan persilangan antara populasi dura (A125, A127, dan A140) dengan populasi B01 (T x T). Sebaliknya, populasi dura terpisah secara jarak genetik dengan populasi B02 dan B57 (T x T). Persilangan antara populasi dura (A125, A127, dan A 140) dengan populasi B02 dan B57, diperkirakan akan menghasilkan keturunan dengan nilai heterosis yang tinggi. Kemajuan genetik yang dihasilkan akan jauh lebih tinggi dibandingkan bila populasi dura disilangkan dengan populasi B01. Hal menarik lainnya adalah dari hasil analisis PCoA dan pohon filogenetik dapat diketahui adanya beberapa sub populasi pada populasi dura. Namun dalam sub populasi yang terbentuk terlihat adanya pencampuran individu-individu beberapa dari beberapa populasi dura. Berdasarkan hasil tersebut, pengelompokkan populasi pada populasi dura bukan

lagi didasarkan pada progeni atau pun famili, tapi lebih didasarkan hasil analisis genetiknya.

Hasil analisis Colony mengidentifikasi adanya satu individu yang ilegitim (B01/21-4). Namun secara keseluruhan, seluruh populasi yang diuji memiliki tingkat kemurnian yang tinggi. Hal itu juga dapat terlihat dari hasil analisis PCoA dan pohon filogenetik yang memperlihatkan kemurnian yang tinggi dari masing- masing populasi yang diuji.

7 SIMPULAN DAN SARAN

7.1 Simpulan

Dari 16 marka SSR yang diuji, 14 marka SSR memiliki tingkat polimorfisme yang tinggi (sangat informatif) kecuali pada lokus mEgCIR0173 (LG 3) dan mEgCIR0353 (LG 16) yang memiliki nilai PIC yang rendah. Pengelompokan terjadi pada populasi dura (A125, A127, A140) dan populasi B01 (T x T). Sedangkan populasi B02 dan B57 memiliki jarak genetik yang jauh terhadap populasi dura. Pada populasi hasil persilangan D xP yaitu C22 dan C72, terlihat bila populasi C22 memiliki jarak genetik yang jauh terhadap populasi dura, namun sebaliknya, populasi C72 memiliki jarak genetik yang relatif dekat dengan populasi dura. Tingkat kemurnian dari seluruh populasi yang diuji sangat tinggi. Hanya ditemukan satu individu yang diduga ilegitim yaitu individu B01 (21-4).

7.2 Saran

Pengujian analisis keragaman genetik dan kebenaran tetua pada populasi asal Kamerun lainnya perlu terus dilanjutkan. Hal tersebut diperlukan guna melengkapi informasi genetik yang diperlukan dan mengetahui tingkat kemurnian dari populasi yang dimiliki.

DAFTAR PUSTAKA

Ajambang W, Sudarsono, Asmono D, Toruan-Mathius N. 2012. Microsatellite markers reveal Cameroon's wild oil palm population as a possible solution to broaden the genetic base in the Indonesia-Malaysia oil palm breeding programs. African Journal of Biotechnology 11 (69): 13244–13249. DOI: 10.5897/AJB11.3897

Ajijah N. 2015. Development An Cacao Regeneration System through Somatic Embryogenesis and Identification of Variants Resistant to Phytophthora palmivora Butl. Bogor Agricultural University. Disertation.

Akkaya, M.S., Bhagwat, A.A. and Cregan, P.B. 1992. Length polymorphisms of simple sequence repeat DNA in soybean. Genetics, 132: 1131–1139.

Arias D, Montoya C, Rey L, Romero H. 2012. Genetic similarity among commercial oil palm materials based on microsatellite markers Similaridad genética entre materiales comerciales de palma de aceite basado en marcadores microsatélites. Agronomía Colombiana, 30(2), 188–195.

Arias D, Montoya C, Romero H. 2013. Molecular characterization of oil palm Elaeis guineensis Jacq. materials from Cameroon. Plant Genetic Resources 11(2): 140-148. DOI:10.1017/S1479262112000482.

Bakoume B, Wickneswari R, Rajanaidu N, Kushairi A, Amblard P, Billotte N. 2007. Allelic diversity of natural oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) populations detected by microsatellite markers: implications for conservation. Plant Genetic Resources: Characterization and Utilization 5(2): 104–107. DOI: 10.1017/S1479262107710870.

Barcelos E, Rios SdeA, Cunha RNV, Lopes R, Motoike SY, Babiychuk E, Kushnir S. 2015. Oil palm natural diversity and the potential for yield improvement. Frontiers in Plant Science, 6(March), 190. http://doi.org/10.3389/fpls.2015.00190

Billotte N, Risterucci AM, Barcelos E, Noyer JL, Amblard P, Baurens FC.2001. Development, characterisation, and across-taxa utility of oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) microsatellite markers. Genome, 44(3), 413–425. http://doi.org/10.1139/gen-44-3-413

Brown AH. 1978. Isozymes, plant population genetic structure and genetic conservation. Theor Appl Genet. 52(4):145-57. DOI: 10.1007/BF00282571. Buchert GP, Rajora OP, Hood JV, Dancik BP. 1997.Effects of harvesting on

genetic diversity in old-growth eastern white pine (Pinus strobus L.) in Ontario, Canada. Conservation Biology 11: 747–758.

Cochard B, Adon B, Rekima S, Billotte N, de Chenon RD, Koutou A,Noyer JL. 2009. Geographic and genetic structure of African oil palm diversity suggests new approaches to breeding. Tree Genics & Genomes, 5(3), 493–504. http://doi.org/10.1007/s11295-009-0203-3

Corley RHV and Tinker PB. 2003 The Oil Palm. Oxford: Blackwell Publishers Corley RHV . 2009. How much palm oil do we need? Environ. Sci. Policy 12,

134–139. doi: 10.1016/j.envsci.2008.10.011

Danielsen F, Hendrien B, Neil, Faizal B, Carsten P, Paul AB, Daniel FD, Ben M, Lucas P, Matthew R, Emily BF. 2009. Biofuel Plantations on Forested

Lands: Double Jeopardy for Biodiversity and Climate. Conservation Biology, 23(2): 348–358. DOI: 10.1111/j.1523-1739.2008.01096.x

Delseny, M., Laroche, M. & Penon, P. 1983. Detection of sequences with Z-DNA forming potential in higher plants. Biochemical and Biophysical Research Communications 116: 113 – 120.

[Ditjenbun] Direktorat Jenderal Perkebunan. 2013. Diskusi Industri Sawit Pasca Moratorium, Mau Kemana? Direktorat Jendral Perkebunan, Republik Indonesia - http://ditjenbun.pertanian.go.id/tanhun/berita-182-diskusi- industri-sawit-pasca-moratorium-mau-kemana.html (Accessed on: Friday, 22 July 2016).

[Ditjenbun] Direktorat Jenderal Perkebunan. 2014. Pertumbuhan Areal Kelapa Sawit Meningkat. http://ditjenbun.pertanian.go.id/setditjenbun/berita-238- pertumbuhan-areal-kelapa-sawit-meningkat.html (Accessed on: Friday, 22 July 2016).

Earl DA, vonHoldt BM. 2012. STRUCTURE HARVESTER: a website and program for visualizing STRUCTURE output and implementing the Evanno method. Conservation Genetics Resources. 4 (2): 359-361. DOI: 10.1007/s12686-011-9548-7.

Evanno G, Regnaut, GoudetS. 2005. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study. Mol Ecol, 14(8), 2611–2620.

Excoffier L, Smouse PE, Quattro JM .1992. Analysis of molecular variance inferred from metric distances among DNA haplotypes: application to human mitochondrial DNA restriction data. Genetics, 131, 479–491.

Falush D, Stephen M, Pritchard JK. 2003. Inference of Population Structure Using Multilocus Genotype Data: Linked Loci and Correlated Allele Frequencies.

Genetics. 164(4): 1567–87.

Ferreira ME, Grattapaglia D. 1998. Introdução ao uso de marcadores moleculares em análise genética. 220pp. Embrapa –SPI.

Garcia AAF, Benchimol LL, Barbosa AMM, Geraldi IO, Souza JrCL, de Souza AP. 2004. Comparison of RAPD, RFLP, AFLP and SSR markers for diversity studies in tropical maize inbred lines. Genetics and Molecular Biology, 27, 4, 579-588.

Govindaraj M, Vetriventhan M, SrinivasanM. 2015. Review Article Importance of Genetic Diversity Assessment in Crop Plants and Its Recent Advances : An Overview of Its Analytical Perspectives. Genetics Research International, 2015, 14.

Gregorius HR. 1978. The concept of genetic diversity and its formal relationship to heterozygosity and genetic distance. Math. Biosci 41: 253–432. DOI:10.1016/0025-5564(78)90040-8

Hama-Ali EO, Alwee SSRS, Tan SG, Panandam JM, LingHC, Namasivayam P, PengHB. 2015. Illegitimacy and sibship assignments in oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) half-sib families using single locus DNA microsatellite markers. Molecular Biology Reports, 42(5), 917–925. http://doi.org/10.1007/s11033-014-3829-7

Hayati A, Wickneswari R, Maizura I, Rajanaidu N. 2004. Genetic diversity of oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) germplasm collections from Africa:

69 implications for improvement and conservation of genetic resources. Theor Appl Genet. 108(7):1274-84. DOI: 10.1007/s00122-003-1545-0.

Hayden MJ, Nguyen TM, Waterman A, & Chalmers, K. J. (2008). Multiplex- ready PCR: a new method for multiplexed SSR and SNP genotyping. BMC Genomics, 9, 80. http://doi.org/10.1186/1471-2164-9-80

Hunger FTW. 1924. De Oliepalm (Elaeis guineensis): Historisch onderzoek over den oliepalm in nederlandisch-indie. N.V.Boekhandel end Drukkerij voorheen E.J. Brilll. Leiden.

Jones AG, Small CM, Paczolt KA, Ratterman NL. 2010. A practical guide to methods of parentage analysis. Molecular Ecology Resources, 10(1), 6–30. http://doi.org/10.1111/j.1755-0998.2009.02778.x

Jones AG et al. 2010. A practical guide to methods of parentage analysis. Mol Ecol Res, 10(1):6–30.

Jones ORJ, Wang. 2010. COLONY: a program for parentage and sibship inference from multilocus genotypes data. Mol Ecol Res 10: 551-555. DOI: 10.1111/j.1755-0998.2009.02787.x

Kalinowski ST, Taper ML, Marshall TC. 2007. Revising how the computer program CERVUS accommodates genotyping error increases success in paternity assignment. Molecular Ecology, 16, pp. 1099-1106. http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-294x.2007.03089.x

Kularatne RS, Shah FH, Rajanaidu N. 2001. The evaluation of genetic diversity of Deli Dura and African oil palm germplasm collection by AFLP technique.

Tropical Agric. Res. 13:1-12.

Laurentin H. 2009. Data analysis for molecular characterization of plant genetic resources. Genetic Resources and Crop Evolution 56: 277–292.

Lim CC, Rao V. 2005. DNA Fingerprinting of oil palm –. Journal of Oil Palm Research, 17, 136–144.

Maizura I, Rajanaidu N, Zakri AH, Cheah SC. 2006. Assessment of genetic diversity in oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) using Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP). Genetic Resources and Plant Evolution 53:187-195. DOI 10.1007/s10722-004-0.

Marshall DR, Brown AH. 1975. Optimum sampling strategies in genetic conservation. In: Franked OH and Hawkes JG (eds) Crop Genetic Resources for Today and Tomorrow. Cambridge, London: Cambridge University Press, 53–80.

Marshall TC, Slate J, Kruuk LEB, Pemberton JM. 1998. Statistical Confidence for Likelihood-Based Paternity Inference in Natural Populations. Molecular Ecology. 7(5): 639–55.

Maskromo I, Tenda ET, Tulalo MA, Novarianto H, Sukma D, Sukendah, Sudarsono. 2015. Phenotypic and Genotypic Variabilities among Kopyor Dwarf Coconut Varieties Originated from Pati Central Java. Jural Litri 21(1):1-8.

Maxted N, Ford Lloyd BV, Jury SL, Kell SP and Scholten MA. 2006 Towards a definition of a crop wild relative. Biodiversity and Conservation 15: 2673– 2685.

Maxted N, Scholten MA, Codd R ,Ford Lloyd BV .2007. Creation and use of a national inventory of crop wild relatives. Biological Conservation 140: 142– 159.

Mohammadi SA, Prasanna BM .2003. Analysis of genetic diversity in crop plants- salient statistical tools and considerations. Crop Sci. 43: 1235–1248.

Moose SP, Mumm RH. 2008. Molecular Plant Breeding as the Foundation for 21st Century Crop Improvement 1. Plant Physiology, 147(July), pp.969–977. NCHU, W. A. 2015. Molecular Analysis Of Oil Palm (Elaeis guineensis Jacq.) Flowering Associated Genes and Their Potential Application In Breeding Programmes. Bogor Agricultural University.

Nei, M. 1978. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics 89: 583 590.

Nei M, Chesser RK. 1983. Estimation of fixation indices and gene diversities. Ann Hum Genet. 47(3):253-9. DOI: 10.1111/j.1469-1809.1983.tb00993.x Okoye MN, Uguru, MI, Bakoumé C, Singh R, Okwuagwu CO. 2016a.

Assessment of Genetic Diversity of NIFOR Oil Palm Main Breeding Parent Genotypes Using Microsatellite Markers. American Journal of Plant Sciences, 7(January), 218–237.

Okoye M, Bakoume C, Uguru MI, Singh R, Okwuagwu CO. 2016b. Genetic Relationships between Elite Oil Palms from Nigeria and Selected Breeding and Germplasm Materials from Malaysia via Simple Sequence Repeat (SSR) Markers. Journal of Agricultural Science 8(2): 159-178.

Peakall R,. Smouse PE. 2012. GenALEx 6.5: Genetic Analysis in Excel. Population Genetic Software for Teaching and Research-an Update.

Bioinformatics 28(19): 2537–39.

Perrier X, Flori A, F. Bonnot. 2003. Data analysis methods. In: Hamon, P., Seguin, M., Perrier, X., Glaszmann, J. C. Ed., Genetic diversity of cultivated tropical plants. Enfield, Science Publishers. Montpellier. pp 43 - 76.

Pritchard JK, Stephens M, Donnelly P. 2000. Inference of population structure using multilocus genotype data. Genetics, 155(2), 945–959. http://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2007.01758.x

Putri LAP, Rivallan R, Zulhermana , PuspitaningrumY, Sudarsono , r Perrier X, Asmono D, and N. B. (2010). Allelic Diversity of 22 Sampoerna Agro ’ s Oil Palm Pisifera Based. In I O P C – J o g y a k a r t a (pp. 1–9). Yogyakarta.

Purba AR, Noyer JL, Baudouin L, Perrier X, Hamon S, Lagoda PJL. 2000. A new aspect of genetic diversity if Indonesian oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) revealed by isoenzyme and AFLP markers and its consequences for breeding. Theor Appl Genet. 101:956–961

Rajora OP, Rahman MH, Buchert GP and Dancik BP (2000) Microsatellite DNA analysis of genetic efforts of harvesting in old-growth eastern white pine (Pinus strobus) in Ontario, Canada. Molecular Ecology 9: 339–348.

Rutgers AAL, Blommendal HN, Van Heurn FC, Heusser C, Mass JGJA, Yampolsky, C. 1922. Investigation on Oil Palm. Ruygro & Batavia, Co. Sajib AM, Hossain M, Mosnaz ATMJ, Hossain H, Islam M, Ali S, Prodhan SH.

2012. SSR marker-based molecular characterization and genetic diversity analysis of aromatic landraces of rice ( Oryza sativa L .). Journal BioScience Biotechnology, 1, p.107-116.

Saghai-Maroof, M.A., Biyashev RM, Yang GP, Zhang Q, Allard RW. 1994. Extraordinarily polymorphic microsatellite DNA in barley species diversity,

71 chromosomal location and population dynamics. Proc. Natl. Acd. Sci. 9:5466-547.

Sajib, A.M., M. Hossain, A.T.M.J. Mosnaz, H. Hossain, M. Islam, S. Ali, S.H. Prodhan. 2012. SSR Marker-Based Molecular Characterization and Genetic Diversity Analysis of Aromatic Landraces of Rice (Oryza Sativa L .).

Journal BioScience Biotechnology. 1: 107–116.

Sambrook J, Fritch, EF, Maniatis, T. 1989. Molecular Cloning: A laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press.

Schuelke M. 2000. An economic method for the fluorescent labeling of PCR fragments A poor man ’ s approach to genotyping for research and high- throughput diagnostics ., 18(February), 1–2.

Sethuraman A. 2013. On inferring and interpreting genetic population structure- Applications to conservation, and the estimation of pairwise genetic relatedness. arXiv preprint.

Singh P. (2015). Genetic distance, heterosis and combing ability studies in maize for predicting F1 hybrid performance. Sabrao Journal of Breeding and Genetics, 47(1), 21–28.

Solin NWNM, S. Sobir, N. Toruan-Mathius. 2014. Genetic Diversity of DxP Population Yield Component in Oil Palm's Paternal Half-Sib Family Based on Microsatellite Markers. Energy Procedia 47:196-203. DOI: 10.1016/j.egypro.2014.01.214.

Szpiech, Z.A., N.A. Rosenberg . 2011. On the size distribution of private microsatellite alleles. Theoretical Population Biology 80:100–113. DOI:10.1016/j.tpb.2011.03.006

Tautz D, Renz M. 1984. Simple sequences are ubiquitous repetitive components of eukaryotic genomes. Nucleic Acids Res.12(10):4127-38.

Tautz, D. 1989. Hypervariability of simple sequences as a general source for polymorphic DNA markers. Nucleic Acids Res. 17(16): 6463–6471.

Taeprayoon P., P. Tanya, SH. Lee, P. Srinives. 2015. Genetic background of three commercial oil palm breeding populations in Thailand revealed by SSR markers. AJCS 9(4):281-288.

Thongthawee S, Tittinutchanon P, Volkaert H. 2010. Microsatellites for parentage analysis in an oil palm breeding population. Thai Journal of Genetics, 3(2), 172–181.

Ting N, Zaki NM, Rosli R, Low EL. 2010. Research Article SSR mining in oil palm EST database : application in oil palm germplasm diversity studies,

89(2), 135–145.

Tornincasa P, Furlan M, Pallavicini A, Graziosi G. 2010.Coffee species and varietal identification. In: Morrison DA, editor. Tools for Identifying Biodiversity: Progress and Problems. p. 307-313.

TommasiniL, Batley J, Arnold GM, Cooke RJ, Donini P, Lee D, Edwards KJ. 2003. The development of multiplex simple sequence repeat (SSR) markers to complement distinctness, uniformity and stability testing of rape (Brassica napus L.) varieties. TAG. Theoretical and Applied Genetics. Theoretische Und Angewandte Genetik, 106(6), 1091–101.

[USDA]United State Department of Agriculture. 2011. World Consumption of Vegetal Oils, 2010/11 World Markets and Trade 2001-2011. Washington: USDA, 2011.

http://doi.org/10.1007/s00122-002-1125-8

Wafiqah N, Solin NM, Toruan-mathius N. 2014. Genetic Diversity of DxP Population Yield Component in Oil Palm ’ s Paternal Half-Sib Family Based on Microsatellite Markers. Energy Procedia, 47, 196–203. http://doi.org/10.1016/j.egypro.2014.01.214

Weir BS, Cockerham CC. 1984. Estimating F-statistics for the analysis of population structure. Evolution 38:1358–1370. DOI: 10.2307/2408641 Zulhermana, Sudarsono , D. Asmono, Yulismawati. 2010. Intra- and Inter-

Population Genetic Diversity of Oil Palm (Elaeis guineensis Jacq.) Pisifera Clones Originated from Nigeria Based on SSR Marker analysis. International Oil Palm Conference (IOPC) 2010, Jogyakarta, 1-3 Juni 2010

RIWAYAT HIDUP

LALU FIRMAN BUDIMAN dilahirkan di Jakarta pada tanggal 03 April 1976 sebagai putra ketiga dari ayahanda Alm. Lalu Mucdin dengan ibunda Almh. Sutati Wiyani. Pada tanggal 08 Maret 2002 penulis menikah dengan Rustie Marlina Kartikasari, dan telah dikaruniai tiga orang anak yang bernama Lalu Muhammad Fauzan, Lalu Farhan Hamizan dan Baiq Farah Syafwa Kamiliyya. Pendidikan dasar dan menengah hingga atas diselesaikan di Jakarta ; yaitu Sekolah Dasar Negeri 04 Petang, Jakarta (1989), Sekolah Menengah Tingkat Pertama Negeri 20 Jakarta (1992), Sekolah Menengah Tingkat Atas Negeri 14 Jakarta (1995). Gelar sarjana pertanian (S1) diperoleh dari Fakultas Pertanian (Jurusan Budidaya Pertanian, Program Studi Pemuliaan Tanaman) Institut Pertanian Bogor di Bogor (2000) dengan predikat sangat memuaskan. Pada tanggal 1 November 2000 penulis diterima bekerja di Pusat Penelitian Kelapa Sawit di Medan, salah satu lembaga penelitian kelapa sawit di Indonesia sebagai

Dalam dokumen Analisis Kebenaran Tetua Dan Keragaman Genetik Populasi Kelapa Sawit (Elaeis Guineensis Jacq) Asal Kamerun Menggunakan Marka Ssr (Simple Sequence Repeat) (Halaman 77-90)