STATUS DELESI GENAPOBEC3BPASIENMULTIDRUG-RESISTANT TUBERCULOSISRUMAH SAKIT UMUM DAERAH
DR. MOEWARDI DI SURAKARTA
SKRIPSI
PERNYATAAN
Dengan ini menyatakan bahwa dalam skripsi ini tidak terdapat karya yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar kesarjanaan di suatu perguruan tinggi, dan sepanjang pengetahuan Penulis tidak terdapat karya atau pendapat yang pernah ditulis atau diterbitkan oleh orang lain, kecuali yang secara tertulis diacu dalam naskah dan disebutkan dalam daftar pustaka.
Surakarta, Desember 2014
ABSTRAK
Fitri Ika Suryani, G.0011096, 2014. Status Delesi Gen APOBEC3B Pasien Multidrug-Resistant Tuberculosis Rumah Sakit Umum Daerah Dr. Moewardi di Surakarta. Skripsi. Fakultas Kedokteran, Universitas Sebelas Maret, Surakarta.
Latar Belakang: Data status delesi gen APOBEC3B di Indonesia masih minim. Selain itu, data delesi gen APOBEC3B pada pasien Multidrug-Resistant Tuberculosis (MDR-TB) Rumah Sakit Umum Daerah Dr. Moewardi di Surakarta juga belum diketahui. Penelitian ini ditujukan untuk mengetahui status delesi gen APOBEC3B pasien MDR-TB Rumah Sakit Umum Daerah Dr. Moewardi di Surakarta.
Metode: Sampel darah dikumpulkan dari 43 pasien MDR-TB Rumah Sakit Umum Daerah Dr. Moewardi di Surakarta. Sampel darah kemudian digunakan untuk isolasi DNA. Selanjutnya, dilakukan single Polymerase Chain Reaction (PCR) untuk mendeteksi adanya delesi genotip genAPOBEC3B.
Hasil:Delesi genotip genAPOBEC3Bditemukan pada 81,4% (35/43) sampel. Simpulan: Frekuensi delesi genotip gen APOBEC3B lebih banyak ditemukan pada pasien MDR-TB Rumah Sakit Umum Daerah Dr. Moewardi di Surakarta.
ABSTRACT
Fitri Ika Suryani, G.0011096, 2014. APOBEC3B Gene Deletion Status in Multidrug-Resistant Tuberculosis Patients in Dr. Moewardi General Hospital in Surakarta. Mini Thesis. Faculty of Medicine, Sebelas Maret University, Surakarta.
Background: Data of APOBEC3B gene deletion status in Indonesia are limited. Moreover, information about APOBEC3B gene deletion status in Multidrug-Resistant Tuberculosis (MDR-TB) patients in Dr. Moewardi General Hospital in Surakarta was unknown. This study was aimed to know the APOBEC3B gene deletion status in MDR-TB patients in Dr. Moewardi General Hospital in Surakarta
Methods: Blood samples from 43 MDR-TB patients in Dr. Moewardi General Hospital in Surakarta were collected, DNA isolation was performed for all samples, followed by a single Polymerase Chain Reaction (PCR) to detect the presentation of APOBEC3B gene deletion genotype.
Results: APOBEC3B gene deletion genotype was detected in 81.4% (35/43) samples.
Conclusion: The APOBEC3B gene deletion genotype was frequently found in MDR-TB patients Dr. Moewardi General Hospital in Surakarta.
PRAKATA
Alhamdulillah hirobbil’alamin, puji syukur Penulis haturkan kehadirat Allah SWT, yang telah memberikan nikmat-Nya, sehingga Penulis dapat menyelesaikan penelitian skripsi dengan judul “Delesi Gen APOBEC3B Pasien Multidrug-Resistant Tuberculosis Rumah Sakit Umum Daerah Dr. Moewardi di Surakarta”. Penelitian ini merupakan salah satu persyaratan dalam menyelesaikan Program Sarjana Pendidikan Dokter di Fakultas Kedokteran Universitas Sebelas Maret Surakarta.
Penulis menyadari bahwa skripsi ini tidak akan berhasil tanpa adanya bantuan dari berbagai pihak, oleh karena itu dengan penuh rasa hormat dan ucapan terima kasih Penulis berikan kepada:
1. Prof. Dr. Zainal Arifin Adnan, dr., Sp.PD-KR-FINASIM selaku Dekan Fakultas Kedokteran Universitas Sebelas Maret.
2. Afiono Agung Prasetyo, dr., Ph.D. selaku Pembimbing Utama yang telah menyediakan waktu untuk membimbing hingga terselesaikannya skripsi ini. 3. Hudiyono, Drs., M.S. selaku Pembimbing Pendamping yang telah
menyediakan waktu untuk membimbing hingga terselesaikannya skripsi ini. 4. Marwoto, dr., M.Sc., Sp.MK. selaku Penguji Utama yang telah memberikan
banyak kritik dan saran dalam penyusunan skripsi ini.
5. Yulia Sari, S.Si., M.Si. selaku Penguji Pendamping yang telah memberikan banyak kritik dan saran dalam penyusunan skripsi ini.
6. Ari Natalia Probandari, dr., MPH., Ph.D. selaku Ketua dan Tim Skripsi Fakultas Kedokteran Universitas Sebelas Maret (Kusmadewi Eka D, dr., Sri Enny Narbrietty, S.H., M.H., dan Bp. Sunardi) yang telah membantu penyusunan skripsi ini.
7. Yang tercinta kedua orang tua, Bapak Harsono dan Ibu Endang Surini yang senantiasa mendoakan tiada henti dan memberikan support dalam segala hal sehingga terselesaikannya skripsi ini.
DAFTAR ISI
PRAKATA... vi
DAFTAR ISI... vii
DAFTAR TABEL... ix
DAFTAR GAMBAR... x
DAFTAR LAMPIRAN... xi
BAB I PENDAHULUAN... 1
A...Latar Belakang... 1
B... Rumus an Masalah... 3
C... Tujuan Penelitian... 3
D...Manfa at Penelitian... 3
BAB II LANDASAN TEORI... 4
A...Tinjau an Pustaka... 4
B... Kerang ka Pemikiran... 12
A...Jenis Penelitian... 13 B... Lokasi Penelitian... 13 C... Subjek Penelitian... 13 D...Ranca ngan Penelitian... 14
E... Instru men Penelitian... 14
F...Cara Kerja... 15
G...Analisi s Data... 17
BAB IV Hasil Penelitian... 18
BAB V PEMBAHASAN... 20
C.
DAFTAR TABEL
Tabel 3.1.Primer Delesi GenAPOBEC3B... 17 Tabel 3.2.Kondisi PCR Delesi GenAPOBEC3B... 17 Tabel 4.1.Data Subjek Penelitian... 18 Tabel 4.2.Status Delesi GenAPOBEC3Bpada pasien MDR-TB Rumah Sakit
DAFTAR GAMBAR
DAFTAR LAMPIRAN