Ciri koloni Sumber isolat isolat

yang berasal dari berbagai lokasi

No

Kode

isolat

Sumber isolat

Ciri koloni

(bentuk, warna, pinggir, tekstur)

1. PC1 Tanaman padi, Cianjur Bulat, putih kusam, rata, halus 2. PI2 Tanaman padi, Indramayu Bulat, putih kusam, rata, halus 3. PC3 Tanaman padi, Cianjur Bulat, putih kusam, rata, halus 4. PG4 Tanaman padi, Garut Bulat, putih kusam, rata, halus 5. PG5 Tanaman padi, Garut Bulat, putih kusam, rata, halus 6. PK6 Tanaman padi, Karawang Bulat, putih kusam, rata, halus 7. PS7 Tanaman padi, Subang Bulat, putih, tidak rata, kering 8. PS8 Tanaman padi, Subang Bulat, putih, tidak rata, kering 9. PI9 Tanaman padi, Indramayu Bulat, putih, rata, halus 10. SS10 Tanah sawah, Subang Bulat, putih, rata, halus 11. SS11 Tanah sawah, Subang Bulat, kuning, rata, halus 12. SI12 Tanah sawah, Indramayu Berfilamen, putih, rata, halus 13. PG13 Tanaman padi, Garut Berfilamen, putih, rata, halus 14. SG14 Tanah sawah, Garut Bulat, kekuningan, rata, halus 15. PK15 Tanaman padi, Karawang Berfilamen, kekuningan, rata, halus 16. SC16 Tanah sawah, Cianjur Berfilamen, putih, rata, halus

17. SS17 Tanah sawah, Subang Berfilamen, putih bag belakang kuning 18. SS18 Tanah sawah, Subang Berfilamen, putih kusam, rata

19. SS19 Tanah sawah, Subang Berfilamen, putih kusam, tidak rata 20. SI20 Tanah sawah, Indramayu Berfilamen, putih kekuningan, rata, halus 21. SI21 Tanah sawah, Indramayu Berfiamen, putih kusam, rata, halus 22. SI22 Tanah sawah, Indramayu Berfilamen, putih kusam, rata, halus 23. SI23 Tanah sawah, Indramayu Berfilamen, putih kusam, rata, halus 24. SI24 Tanah sawah, Indramayu Berfilamen, putih kusam, tak rata, halus 25. SI25 Tanah sawah, Indramayu Berfilamen, putih kusam, rata, halus 26. SI26 Tanah sawah, Indramayu Berfilamen, putih kusam, tak rata, halus 27. SK27 Tanah sawah, Karawang Berfilamen, putih, rata, halus

28. SK28 Tanah sawah, Karawang Berfilamen, putih, rata, halus 29. SK29 Tanah sawah, Karawang Berfilamen, putih, rata, halus

30. SK30 Tanah sawah, Karawang Berfilamen, putih kekuningan, rata, halus 31. SK31 Tanah sawah, Karawang Berfilamen, putih kekuningan, rata, halus 32. SC32 Tanah sawah, Cianjur Berfilamen, putih kusam, rata, halus 33. SC33 Tanah sawah, Cianjur Berfilamen, putih, rata, halus 34. SC34 Tanah sawah, Cianjur Berfilamen, kekuningan, rata, halus 35. SC35 Tanah sawah, Cianjur Berfiamen, kekuningan, rata, halus 36. SC36 Tanah sawah, Cianjur Berfilamen, putih kekuningan, rata, halus 37. SC37 Tanah sawah, Cianjur Berfilamen, putih kekuningan, rata, halus 38. SG38 Tanah sawah, Garut Berfilamen, putih, filamentous, kering 39. SG39 Tanah sawah, Garut Berfilamen, putih kusam, kering 40. SG40 Tanah sawah, Garut Berfilamen, kuning kemerahan, kering 41. SG41 Tanah sawah, Garut Berfilamen, putih kekuningan, rata 42. SI42 Tanah sawah, Indramayu Berfilamen, putih kusam, kering 43. SC43 Tanah sawah, Cianjur Berfilamen, putih kusam, kering 44. SK44 Tanah sawah, Karawang Berfilamen, putih kekuningan, rata 45. TT45 Tanah tegalan, Tembilahan Berfilamen, putih kapas, rata, kering

46. TT46 Tanah tegalan, Tembilahan Berfilamen, kuning buludru, kering 47. TT47 Tanah tegalan, Tembilahan Berfilamen, putih kapas, rata, kering 48. TB48 Tanah tegalan, Bogor Bulat, kekuningan, rata, halus 49. TB49 Tanah tegalan, Bogor Bulat, kekuningan, rata, halus 50. TB50 Tanah tegalan, Bogor Bulat, kekuningan, rata, halus 51. AB51 Air kolam, Bogor Bulat, putih kuning tua, rata, halus 52. TB52 Tanah tegalan, Bogor Berfilamen, putih kapas, rata, kering 53. TB53 Tanah tegalan, Bogor Berfilamen, kecoklatan, rata, kering 54. TB54 Tanah tegalan, Bogor Bulat, putih kusam, rata, halus 55. TB55 Tanah tegalan, Bogor Bulat, putih kusam, rata, berlendir 56. TB56 Tanah tegalan, Bogor Bulat, putih kusam, rata, halus 57. TB57 Tanah tegalan, Bogor Bulat, putih kekuningan, rata, halus 58. TB58 Tanah tegalan, Bogor Bulat besar, putih, tak rata, halus 59. TB59 Tanah tegalan, Bogor Tidak beraturan, putih, tak rata, halus 60. TB60 Tanah tegalan, Bogor Berfilamen, putih kapas, tdk rata

61. TB61 Tanah tegalan, Bogor Berfilamen, putih kekuningan, tidak rata 62. TB62 Tanah tegalan, Bogor Berfilamen, putih dgn bag tengah hijau 63. TB63 Tanah tegalan, Bogor Berfilamen, putih kapas, tidak rata 64. TB64 Tanah tegalan, Bogor Berfilamen, putih kekuningan, tidak rata 65. TB65 Tanah tegalan, Bogor Berfilamen, putih kusam, tidak rata, kering 66. TB66 Tanah tegalan, Bogor Bulat kecil, putih kekuningan, rata, halus 67. AST67 Tanah aliran sungai, Tembilahan Berfilamen, putih, tidak rata, kering 68. AST68 Tanah aliran sungai, Tembilahan Berfilamen, putih kapas, tidak rata, kering 69. AST69 Tanah aliran sungai, Tembilahan Bulat, putih kusam, rata, berlendir

70. TT70 Tanah tegalan, Tembilahan Bulat, putih kusam, rata, kering 71. TT71 Tanah tegalan, Tembilahan Bulat besar, putih kusam, rata

72. ASR72 Tanah aliran sungai, Rengat Berfilamen, putih kapas, tidak rata, kering 73. ASR73 Tanah aliran sungai, Rengat Berilamen, putih kusam, tidak rata, kering 74. ASR74 Tanah aliran sungai, Rengat Berfilamen, putih kusam, tidak rata, tipis 75. ASR75 Tanah aliran sungai, Rengat Bulat, putih kusam, rata, berlendir

76. ASR76 Tanah aliran sungai, Rengat Berfilamen, putih kusam, tidak rata, kering 77. ASR77 Tanah aliran sungai, Rengat Berfilamen, putih kusam, tidak rata, kering 78. ASR78 Tanah aliran sungai, Rengat Berfilamen, putih , tengah coklat, kering 79. ASR79 Tanah aliran sungai, Rengat Berfilamen, kekuningan, tidak rata, kering 80. ASR80 Tanah aliran sungai, Rengat Berfilamen, putih kusam, tidak rata, kering 81. ASR81 Tanah aliran sungai, Rengat Berfilamen, putih, tidak rata, kering 82. ASR82 Tanah aliran sungai, Rengat Berfilamen, putih kapas, tidak rata, kering 83. ASR83 Tanah aliran sungai, Rengat Berfilamen, putih, bag tengah hijau, kering 84. TT84 Tanah tegalan, Tembilahan Bulat, ungu, rata, kering

85. ASR85 Tanah aliran sungai, Rengat Bulat, putih, kering 86. ASR86 Tanah aliran sungai, Rengat Berfilamen, putih, kering

87. ASR87 Tanah aliran sungai, Rengat Bulat, putih kusam, rata, berlendir 88. TT88 Tanah tegalan, Tembilahan Berfilamen, putih kusam, kering 89. TT89 Tanah tegalan, Tembilahan Bulat, hijau keputihan, kering 90. AST90 Tanah aliran sungai, Tembilahan Berfilamen, putih, kering 91. SR91 Tanah sawah, Rengat Bulat, putih kusam, rata 92. SR92 Tanah sawah, Rengat Bulat, putih kusam, rata 93. AST93 Tanah aliran sungai, Tembilahan Bulat, putih, rata, halus

94. ASS94 Tanah aliran sungai, Rengat Bulat, putih kusam, tidak rata, kering 95. TK95 Tanah tegalan, Kampar Bulat, putih kusam, tidak rata, kering 96. TK96 Tanah tegalan, Kampar Bulat, kekuningan, rata, halus

97. AST97 Tanah aliran sungai, Tembilahan Bulat, putih kusam, rata, kering 98. ASP98 Tanah aliran sungai, Pekanbaru Bulat, putih kusam, rata, kering 99. ASP99 Tanah aliran sungai, Pekanbaru Bulat, putih kusam, rata, kering 100. TP100 Tanah tegalan, Pekanbaru Bulat, putih, rata, halus

101. TP101 Tanah tegalan, Pekanbaru Bulat, putih, rata rata, halus 102. TK102 Tanah tegalan, Kampar Berfilamen, putih kusam, kering 103. TK103 Tanah tegalan, Kampar Berfilamen, kekuningan, kering 104. AST104 Tanah aliran sungai, Tembilahan Berfilamen, putih kusam, tipis, kering 105. AST105 Tanah aliran sungai, Tembilahan Berfilamen, putih kusam, tipis, rata 106. AST106 Tanah aliran sungai, Tembilahan Berfilamen bag tengah tebal, putih kusam 107. AST107 Tanah aliran sungai, Tembilahan Berfilamen, putih kusam, tipis, rata 108. TT108 Tanah tegalan, Tembilahan Berfilamen, putih kapas, tebal

109. TT109 Tanah tegalan, Tembilahan Berfilamen, putih dg hijau ditengah, kering 110. TT110 Tanah tegalan, Tembilahan Berfilamen, putih kapas, rata, kering 111. ASP111 Tanah aliran sungai, Pekanbaru Berfilamen, kekuningan, kering 112. ASP112 Tanah aliran sungai, Pekanbaru Berfilamen, putih kapas, rata, kering 113. ASP113 Tanah aliran sungai, Pekanbaru Berfilamen, kekuningan, kering 114. TP114 Tanah tegalan, Pekanbaru Berfilamen, putih kusam, kering 115. TP115 Tanah tegalan, Pekanbaru Berfilamen, putih kusam, kering 116. SSi116 Tanah sawah, Siak Berfilamen, putih kusam, rata 117. SSi117 Tanah sawah, Siak Berfilamen, putih susu, rata 118. ASSi118 Tanah aliran sungai, Siak Berfilamen, putih kusam, rata 119. SSi119 Tanah sawah, Siak Berfilamen, putih kusam, rata 120. ASSi120 Tanah aliran sungai, Siak Berfilamen, putih kusam, rata 121. SSi121 Tanah sawah, Siak Bulat, putih kusam, rata 122. ASSi122 Tanah aliran sungai, Siak Bulat, putih kusam, berlendir 123. ASSi123 Tanah aliran sungai, Siak Bulat, putih kusam, rata 124. TSu124 Tanah tegalan, Sumenep Bulat, putih kusam, rata 125. TSu125 Tanah tegalan, Sumenep Bulat, putih kusam, rata 126. TSu126 Tanah tegalan, Sumenep Bulat, putih kusam, berlendir

127. TSu127 Tanah tegalan, Sumenep Berfilamen, putih, Berfilamen, tidak rata 128. TSu128 Tanah tegalan, Sumenep Bulat, kekuningan, rata, halus

129. TSu129 Tanah tegalan, Sumenep Bulat, putih kusam, berlendir 130. TSu130 Tanah tegalan, Sumenep Bulat, putih kusam, berlendir 131. TSu131 Tanah tegalan, Sumenep Berfilamen, putih, kering

132. TSu132 Tanah tegalan, Sumenep Berfilamen, putih kekuningan, kering 133. TSu133 Tanah tegalan, Sumenep Berfilamen, putih kusam, kering 134. TSu134 Tanah tegalan, Sumenep Berfilamen, putih kusam, tipis 135. TSu135 Tanah tegalan, Sumenep Berfilamen, putih kusam, kering 136. TTp136 Tanah tegalan, Tanjung Pinang Bulat, ungu, rata

137. TTp137 Tanah tegalan, Tanjung Pinang Berfilamen, putih, kering 138. TTp138 Tanah tegalan, Tanjung Pinang Berfilamen, putih, kering 139. TTp139 Tanah tegalan, Tanjung Pinang Berfilamen, putih, kering 140. TTp140 Tanah tegalan, Tanjung Pinang Berfilamen, putih, kecil2, kering 141. TTp141 Tanah tegalan, Tanjung Pinang Berfilamen, putih kusam, kering 142. TTp142 Tanah tegalan, Tanjung Pinang Berfilamen, putih kusam, kering 143. ASTp143 Tanah aliran sungai, Tj Pinang Berfilamen, putih kusam, kering 144. BR2 Tanah tegalan, Bogor Bulat, putih, tidak rata

Lampiran 2 Hasil identifikasi secara parsial sekuen gen 16s rRNA dari isolat bakteri BR2

TT47, dan SS19 menggunakan program BLAST

a. Isolat BR2

> gb|JN644613.1| Bacillus subtilis strain MP17_1B (MP17) 16S ribosomal RNA gene, partial sequence

Length=1511

Score = 2178 bits (1179), Expect = 0.0

Identities = 1211/1225 (99%), Gaps = 7/1225 (1%) Strand=Plus/Plus BR2 11 GGGAACTTGCT-CCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCTG 69 |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| MP17 70 GGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCTG 129 BR2 70 TAAGACTGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGGATGGTTGTTTGAACCGCATG 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| MP17 130 TAAGACTGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGGATGGTTGTTTGAACCGCATG 189 BR2 130 GTTCAGACATAAAAGGTGGCTTCGGCTACCACTTACAGATGGACCCGCGGCGCATTAGCT 189 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| MP17 190 GTTCAGACATAAAAGGTGGCTTCGGCTACCACTTACAGATGGACCCGCGGCGCATTAGCT 249 BR2 190 AGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCG 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| MP17 250 AGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCG 309 BR2 250 GCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTC 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| MP17 310 GCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTC 369 BR2 310 CGCAATGGACGAAAGTCTGACGGAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGTTTTCGGATCGT 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| MP17 370 CGCAATGGACGAAAGTCTGACGGAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGTTTTCGGATCGT 429 BR2 370 AAAGCTCTGTTGTTAGGGAAGAACAAGTGCCGTTCAAATAGGGCGGCACCTTTGACGGTA 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| MP17 430 AAAGCTCTGTTGTTAGGGAAGAACAAGTGCCGTTCAAATAGGGCGGCACCTT-GACGGTA 488 BR2 430 CCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAA 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| MP17 489 CCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAA 548 BR2 490 GCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGGGCTCGCAGGCGGTTTCTTAAGTCTGATGTGA 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 549 GCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGGGCTCGCAGGCGGTTTCTTAAGTCTGATGTGA 608 BR2 550 AAGCCCCCGGCTCAACCGGGGAGGGTCATTGGAAACTGGGGAACTTGAGTGCAGAAGAGG 609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| MP17 609 AAGCCCCCGGCTCAACCGGGGAGGGTCATTGGAAACTGGGGAACTTGAGTGCAGAAGAGG 668 BR2 610 AGAGTGGAATTCCACGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCAGTGGCG 669 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| MP17 669 AGAGTGGAATTCCACGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCAGTGGCG 728 BR2 670 AAGGCGACTCTCTGGTCTGTAACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGA 729 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| MP17 729 AAGGCGACTCTCTGGTCTGTAACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGA 788

BR2 730 TTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAAGTGTTAGGGGGTTTCCGC 789 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| MP17 789 TTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAAGTGTTAGGGGGTTTCCGC 848 BR2 790 CCCTTAGTGCTGCAGCTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGACTG 849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| MP17 849 CCCTTAGTGCTGCAGCTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGACTG 908 BR2 850 AAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAG 909 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| MP17 909 AAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAG 968 BR2 910 CAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTCTGACAATCCTAGAGATAGGACGTCC 969 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| MP17 969 CAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTCTGACAATCCTAGAGATAGGACGTCC 1028 BR2 970 CCTTCGGGGGCAGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTT 1029 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| MP17 1029 CCTTCGGGGGCAGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTT 1088 BR2 1030 GGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGATCTTAGTTGCCAGCATTCAGTTGGGCAC 1089 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| MP17 1089 GGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGATCTTAGTTGCCAGCATTCAGTTGGGCAC 1148 BR2 1090 TCTAAGGTGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGC 1149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| MP17 1149 TCTAAGGTGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGC 1208 BR2 1150 CCCTTATGACCTGGGCTAC-CACCTTGCTACAATGGGCAAGAACAAAGGGCACCGGAACC 1208 ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| || |||| MP17 1209 CCCTTATGACCTGGGCTACACACGT-GCTACAATGGGCA-GAACAAAGGGCAGCGAAACC 1266 BR2 1209 CCCNAGGTTAACCCAATCCC-CAAA 1232 | ||||||| |||||||| |||| MP17 1267 GCG-AGGTTAAGCCAATCCCACAAA 1290

b. Isolat TT47

>

gb|HQ696445.1| Ralstonia pickettii strain KTO-35(KTO35)

16S ribosomal RNA gene, partial sequence

Length=1410

Score = 2087 bits (1130), Expect = 0.0

Identities = 1192/1221 (98%), Gaps = 8/1221 (1%)

Strand=Plus/Plus

TT47 22 GCTAGATTGATGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATACATCGGAACGTGCCCTGTAATGG 81 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| KTO35 37 GCTAGATTGATGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATACATCGGAACGTGCCCTGTAGTGG 96 TT47 82 GGGATAACTAGTCGAAAGATTACCTAATACCGCATACGACCTGAGGGTGAAAGTGGGGGA 141 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| KTO35 97 GGGATAACTAGTCGAAAGATTAGCTAATACCGCATACGACCTGAGGGTGAAAGTGGGGGA 156 TT47 142 CCGCAAGGCCTCATGCTATAGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAG 201 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| KTO35 157 CCGCAAGGCCTCATGCTATAGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAG 216 TT47 202 GCCCACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGATCAGCCACACTGGGACTGA 261 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| KTO35 217 GCCCACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGATCAGCCACACTGGGACTGA 276 TT47 262 GACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGCGAAAGC 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| KTO35 277 GACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGCGAAAGC 336 TT47 322 CTGATCCAGCAATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCACTTTTGTCCG 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| KTO35 337 CTGATCCAGCAATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCACTTTTGTCCG 396 TT47 382 GAAAGAAATGGCTCTGGTTAATACCTGGGGTCGATGACGGTACCGGAAGAATAAGGACCG 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| KTO35 397 GAAAGAAATGGCTCTGGTTAATACCTGGGGTCGATGACGGTACCGGAAGAATAAGGACCG 456 TT47 442 GCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTCCAAGCGTTAATCGGAATTACT 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| KTO35 457 GCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTCCAAGCGTTAATCGGAATTACT 516 TT47 502 GGGCGTAAAGCGTGCGCAGGCGGTTGTGCAAGACCGATGTGAAATCCCCGAGCTTAACTT 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| KTO35 517 GGGCGTAAAGCGTGCGCAGGCGGTTGTGCAAGACCGATGTGAAATCCCCGAGCTTAACTT 576 TT47 562 GTGAATTGCATTGGTGACTGCACGGCTAGAGTGTGTCAGAGGGGGGTAGAATTCCACGTG 621 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| KTO35 577 GGGAATTGCATTGGTGACTGCACGGCTAGAGTGTGTCAGAGGGGGGTAGAATTCCACGTG 636 TT47 622 TAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAATACCGATGGCGAAGGCAGCCCCCTGGGAT 681 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| KTO35 637 TAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAATACCGATGGCGAAGGCAGCCCCCTGGGAT 696 TT47 682 AACACTGACGCTCATGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTC 741 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| KTO35 697 AACACTGACGCTCATGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTC 756 TT47 742 CACGCCCTAAACGATGTCAACTAGTTGTTGGGGATTCATTTCCTTAGTAACGTAGCTAAC 801 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| KTO35 757 CACGCCCTAAACGATGTCAACTAGTTGTTGGGGATTCATTTCCTTAGTAACGTAGCTAAC 816

TT47 802 GCGTGAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGG 861 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| KTO35 817 GCGTGAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGG 876 TT47 862 GCACCCGCACAAGCGGTGGATGATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGCAAAACCTTACCT 921 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| KTO35 877 GGACCCGCACAAGCGGTGGATGATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAAAACCTTACCT 936 TT47 922 ACCCTTGACATGCCACTAACGAAGCAAAGATGCATTAGGTGCTCGAAAGAGAAAGTGCAC 981 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || KTO35 937 ACCCTTGACATGCCACTAACGAAGCAGAGATGCATTAGGTGCTCGAAAGAGAAAGTGGAC 996 TT47 982 ACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAAC 1041 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| KTO35 997 ACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAAC 1056 TT47 1042 GAGCGCAACCCTTGTCTCTAGTTGCTACGAAAGG-CACTCTAGAAAGACTGCCGGTGACA 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| KTO35 1057 GAGCGCAACCCTTGTCTCTAGTTGCTACGAAAGGGCACTCTAGAGAGACTGCCGGTGACA 1116 TT47 1101 AACCCGAAGAAGGTTGGAATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGGGGAGGGCTTC-CA 1159 |||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || KTO35 1117 AACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGGGTAGGGCTTCACA 1176 TT47 1160 ACCTCA-ACAAATGGTCCAAACA-AGGGTTGCCAAGCCGCAAGGTGGAACTAATCCG-GA 1216 | ||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| || KTO35 1177 -CGTCATACAA-TGGTGCATACAGAGGGTTGCCAAGCCGCGAGGTGGAGCTAATCCCAGA 1234 TT47 1217 AAATGCATC-TAATCCGGATC 1236 ||||||||| || |||||||| KTO35 1235 AAATGCATCGTAGTCCGGATC 1255

c. Isolat SS19

gb|JF317349.1| Serratia marcescens strain W2.3 (W2.3)16S ribosomal RNA gene, partial sequence

Length=1213

Sort alignments for this subject sequence by: E value Score Percent identity

Query start position Subject start position Score = 821 bits (910), Expect = 0.0

Identities = 517/551 (94%), Gaps = 8/551 (1%) Strand=Plus/Plus SS19 11 CAGGGGAACTTGCTCCCTGGGTGACGAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGTCTGGGAAACTG 70 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| W2.3 24 CAGGGGAGCTTGCTCCCTGGGTGACGAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGTCTGGGAAACTG 83 SS19 71 CCTGATGGAGGGGGATAACTACTGGAAACGGTAGCTAATACCGCATAACGTCGCAAGACC 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| W2.3 84 CCTGATGGAGGGGGATAACTACTGGAAACGGTAGCTAATACCGCATAACGTCGCAAGACC 143 SS19 131 AAAGAGGGGGACCTTCGGGCCTCTTGCCATCAGATGTGCCCAGATGGGATTAGCTAGTAG 190 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| W2.3 144 AAAGAGGGGGACCTTCGGGCCTCTTGCCATCAGATGTGCCCAGATGGGATTAGCTAGTAG 203 SS19 191 GTGGGGTAATGGCTCACCTAGGCGACGATCCCTAGCTGGTCTGAGAGGATGACCAGCCAC 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| W2.3 204 GTGGGGTAATGGCTCACCTAGGCGACGATCCCTAGCTGGTCTGAGAGGATGACCAGCCAC 263 SS19 251 ACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAA 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| W2.3 264 ACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAA 323 SS19 311 TGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGC 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| W2.3 324 TGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGC 383 SS19 371 ACTTTCAGCGAGGAGGAAGGTGGTGAACTTAATACGTTCATCAATTGACGTTACTCACaa 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || W2.3 384 ACTTTCAGCGAGGAGGAAGGTGGTGAACTTAATACGTTCATCAATTGACGTTACTCGCAG 443 SS19 431 aaaaaGCACCGGCTAATTCCGGGCCCGCAGCCGCGTAAATAGAGAGGGAGCAAGCGTAAA 490 || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| || W2.3 444 AAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAA 503 SS19 491 --GGAAACTCACGGGGGTTAAATCACCCGCAGG-GGTTT-TGAAGCCAAGATG-AAAAGC 545 |||| | || ||| |||| | | |||||| ||||| | ||| | ||||| ||| | W2.3 504 TCGGAA--TTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTTTGTTAAGTC-AGATGTGAAATC 560 SS19 546 CCCAGCCTCAA 556 ||| | ||||| W2.3 561 CCCGGGCTCAA 571

Van Loon LC, Bakker PAHM, Pieterse MJ. 1998. Systemic resistance induced

by rhizhosphere bacteri. Ann Rev Phytopathol 36: 453-483.

Velusamy P, Immanuel JE, Gnanamanickam SS, Thomashow L. 2006.

Biological control of rice bacterial blight by plant-associated bacteria

producing 2,4-diacetylphloroglucinol. Can J Microbiol 52: 56-65.

Vidhyasekaran P, Muthamilan M. 1999. Evaluasi of a powder formulation of

Pseudomonas fluorescens Pf1 for control of rice sheath blight. Biocontrol

Sci Technol 9: 67-74.

Walsh C, Trauger J, Courvalin P, Davies J. 2001. Mechanisms of antibiotic

action and resistace. Trends Microbiol 9:

Walsh C. 2003. Antibiotic: action, origins, resistance. Washington DC:

American Society for Microbiology.