MIKROBIOLOGI
Ketua Program Studi/Koordinator Mayor: Dr. Ir. Gayuh Rahayu
Staf Pengajar:
Dr. Anja Meryandini, MSi Dr. Nisa Rachmania Mubarik, MSi Prof. Dr. Antonius Suwanto, MSc Dr. Ir. Nampiah Sukarno
Dr. Aris Tri Wahyudi, MSi Prof. Dr. Okky Setyawati Dharmaputra Dr.Ir. Gayuh Rahayu Dr. dr. Sri Budiarti
Dr. Iman Rusmana, MSi, SSi Dr. Ir. Yulin Lestari Dr. Ir. Lisdar I. Sudirman
Tujuan Pendidikan:
1. Menghasilkan lulusan Magister dan Doktor yang profesional dan berakhlak tinggi,
2. Mengembangkan ilmu pengetahuan dan teknologi dalam bidang Mikrobiologi Tropika guna memanfaatkan sumber daya alam secara berkelanjutan bagi kesejahteraan manusia,
3. Membina kehidupan akademik yang berkualitas.
Kompetensi Lulusan S2:
Mampu mengeksplorasi mikrob indigenos sebagai bagian pengembangan ilmu dan pengembangan teknik mikrobiologi yang mendasari bioteknologi pertanian, lingkungan, industri, dan kesehatan.
Kompetensi Lulusan S3:
Mampu mengevaluasi prospek dari mikrob indigenos sebagai bagian pengembangan pengetahuan dan pengembangan teknik mikrobiologi yang mendasari pemanfaatannya dalam bioteknologi pertanian, lingkungan, industri dan kesehatan.
Kompetensi Minor:
Bioteknologi Mikrob
KURIKULUM
Program Magister Sains
39 SKS, ditawarkan 3 semester (MK SPs + MK Wajib Mayor + MK Pilihan Mayor)
Kode Mata Kuliah SKS Semester
Mata Kuliah Wajib SPs 6 SKS (15%)
PPS 500 Bahasa Inggris 3 Ganjil
STK 511 Analisis Statistika 3 Ganjil
Mata Kuliah Wajib Mayor 25 SKS (62,5%)
BIO 511 Mikrobiologi Lanjut 2(2-0) Ganjil
BIO 513 Fisiologi Mikrob 2(2-0) Ganjil
BIO 515 Genetika Mikrob 2(2-0) Ganjil
BIO 517 Praktik Mikrobiologi 2(0-4) Ganjil
BIO 512 Bioteknologi Mikrob 3(3-0) Genap
BIO 522 Bioteknologi Cendawan 3(2-3) Genap
BIO 590 Metode Ilmiah 3(2-1) Ganjil
PPS 601 Kolokium 1 Ganjil
PPS 690 Seminar 1 Ganjil
PPS 699 Penelitian dan Tesis 6 Ganjil
Mata Kuliah Pilihan Mayor 9 SKS (22,5%), 2 Paket a. Bioprospeksi
BIO 514 Mikrob dan Potensinya 3(2-3) Genap
BIO 516 Bioteknologi Molekular 3(2-3) Genap
BIO 621 Bioteknologi Senyawa Antimikrob 3(2-3) Ganjil
b. Mikrobiologi Lingkungan
BIO 524 Interaksi Mikrob-Inang 3(2-3) Genap
BIO 526 Cendawan Perusak Bahan Pangan dan
Mikotoksinnya 3(2-3) Genap
BIO 611 Mikrobiologi Lingkungan 3(2-3) Ganjil
Mata Kuliah Minor (10 SKS) Bioteknologi Mikrob
Kode Mata Kuliah SKS Semester
BIO 511 Mikrobiologi Lanjut 2(2-0) Ganjil
BIO 515 Genetika Mikrob 2(2-0) Ganjil
BIO 512 Bioteknologi Mikrob 3(3-0) Genap
BIO 522 Bioteknogi Cendawan 3(2-3) Genap
Program Doktor
42 SKS (MK SPs + MK Wajib Mayor + MK Pilihan Mayor)
Kode Mata Kuliah SKS Semester
Mata Kuliah Wajib SPs 2 SKS (4.7%)
PPS 702 Falsafah Sains 2(2-0) Ganjil
Mata Kuliah Wajib Mayor 26 SKS (62%)
BIO 711 Fisiologi Mikrob Lanjut 3(2-3) Ganjil
BIO 721 Biologi Cendawan Lanjut 3(2-3) Ganjil
BIO 713 Biologi Molekuler Keragaman Prokariot 3(2-3) Ganjil
BIO 712 Rekayasa Genetika Mikrob 3(2-3) Genap
PPS 701 Kolokium 1 Ganjil
PPS 790 Seminar 1 Ganjil
PPS 799 Penelitian & Disertasi 12 Ganjil
Mata Kuliah Pilihan Mayor 14 SKS (33.3%)
BIO 715 Biologi Bakteri Patogen 2(2-0) Ganjil
BIO 714 Ekspresi Gen dan Pengendaliannya 3(2-3) Genap
BIO 716 Biologi Aktinomiset dan Produktivitasnya 3(2-3) Genap
BIO 722 Biologi Mikoriza 3(2-3) Genap
BIO 724 Biologi Makrofungi dan Produktivitasnya 3(2-3) Genap
Total SKS 42
*) Mahasiswa yang belum mendapatkan mata kuliah Metodologi Penelitian/Metode Ilmiah atau yang setara pada jenjang S2 harus mengambil mata kuliah-mata kuliah tersebut. **) Pilihan mata kuliah harus disesuaikan dengan minat, topik penelitian dan seizin komisi
SILABUS MATA KULIAH
BIO 511 Mikrobiologi Lanjut 2(2-0) 1
Mata kuliah ini mencakup perkembangan terkini bidang mikrobiologi seperti kehidupan dan prinsip biologi molecular; memberikan penekanan pada evolusi, sistematika, biologi sel mikrob prokariot dan eukariot mikrob eukariot, dan spesiasinya. Diskusi kelas secara aktif akan menekankan pada ekosistem, pengaruh faktor lingkungan pada pertumbuhan mikrob dan pengendaliannya. Mata kuliah ini juga membahas pentingnya imunologi dan peran mikrob dalam industri. Penelitian-penelitian terkini dalam bidang dasar dan aplikasi mikrobiologi juga akan didiskusikan.
Yulin Lestari & Tim
BIO 512 Bioteknologi Mikrob 3(3-0) 2
Mata kuliah ini menjelaskan tentang teknologi DNA rekombinan pada mikroorganisme yang dapat digunakan untuk memproduksi berbagai produk yang bermanfaat. Topik pada kuliah ini mencakup revolusi bioteknologi mikroba, teknologi DNA rekombinan, manipulasi ekpresi gen, produksi senyawa terapeutik dan diagnostik, vaksin dan antibiotik, biopolimer, pemanfaatan untuk bioremediasi, bioinsektisida, fiksasi nitrogen, dan regulasi dari patent produk bioteknologi mikroba.
Iman Rusmana dan Tim
BIO 513 Fisiologi Mikrob 2(2-0) 1
Mempelajari struktur subseluler, pertumbuhan, dan diferensiasi sel mikrob khususnya bakteri, serta mempelajari struktur dan proses metabolisme dan sintesis makromolekul yang terdapat di dalam sel, serta respon mikrob terhadap cekaman dan interaksi inang-parasit.
Nisa Rachmania Mubarik dan Tim
BIO 514 Mikrob dan Potensinya 3(2-3) 2
Mata kuliah ini membahas ciri-ciri dan kemampuan mikrob yang memungkinkannya mempunyai potensi luar biasa yang dapat dimanfaatkan, seperti untuk fermentasi, biokonversi (biotransformasi), dan menghasilkan enzim hidrolitik, protein sel tunggal, biopolimer, asam amino, nukleotida, serta vitamin.
Nisa Rachmania Mubarik dan Tim
BIO 515 Genetika Mikrob 2(2-0) 1
Mata kuliah ini menjelaskan dasar-dasar genetika mikrob khususnya bakteri yang akan digunakan sebagai sistem model. Topik-topik yang akan didiskusikan mencakup karakteristik DNA, biologi plasmid, elemen loncat (transposon), bakteriofage, serta ekspresi gen dan pengendaliannya. Transfer gen pada bakteri seperti konjugasi, transformasi, dan transduksi; pustaka genom dan metagenom, mutan dan analisisnya, kloning DNA, pemetaan fisik dan genetik genom, rekayasa genetika dan perkembangannya juga akan didiskusikan.
BIO 516 Bioteknologi Molekuler 3(2-3) 2 Pengkajian aspek molekular dari gen dan ekspresi gen dengan model mikrob tertentu. Penjelasan mencakup struktur genom, transaksi gen, ekspresi genom, regulasi ekspresi gen, dan teknik biologi molekuler.
Antonius Suwanto dan Tim
BIO 517 Praktik Mikrobiologi 2(0-4) 1
Mata ajaran ini memberikan ketrampilan dalam Mikrobiologi. Topik yang akan dibahas meliputi : berbagai teknik isolasi dan kultivasi mikrob, identifikasi karakter mikrob dan gen bakteri seperti isolasi gen, transfer gen, pemetaan gen dan mutagenesis.
Anja Meryandini dan Tim
BIO 522 Bioteknologi Cendawan 3(2-3) 2
Membahas produk cendawan serta teknologinya seperti kapang untuk pangan tradisional terfermentasi, jamur pangan dan jamur obat, cendawan lignolitik, cendawan entomopatogen, cendawan nematoda, cendawan mikoriza, cendawan agen pengendali hayati, cendawan liken dan cendawan dalam bioremediasi dan biotransformasi dan regulasi dari paten produk bioteknologi cendawan.
Lisdar I. Sudirman dan Tim
BIO 524 Interaksi Mikrob-Inang 3(2-3) 2
Mata kuliah ini menjelaskan tentang biologi interaksi antara mikrob dan inang baik tumbuhan maupun hewan dan manusia yang meliputi Interaksi mutualistik, netral dan parasitik. Materi yang diberikan meliputi biodiversitas, ekologi, fisiologi, mekanisme interaksi dan peranannya dalam bidang pertanian, kesehatan dan lingkungan.
Nampiah Sukarno dan Tim.
BIO 526 Cendawan Perusak Bahan Pangan dan Mikotoksinnya
3(2-3) 2
biji-bijian secara terpadu, penggunan komputer sebagai alat bantu untuk meningkatkan pengelolaan hama pascapanen juga akan dibahas.
Okky Setyawati Darmaputra dan Tim
BIO 611 Mikrobiologi Lingkungan 3(2-3) 3
Pengkajian tentang karakteristik dan aktivitas mikroorganisme di udara, aquatik, terrestrial dan lingkungan ekstrim, prinsip siklus biogeokimia, dampak dari siklus biogeokimia tidak terkendali, prinsip degradasi senyawa polutan organik, toksisitas logam dan detoksifikasi oleh mikrob, interaksi mikrob menguntungan dan mikrob patogen di pertanian, limbah domestik dan pengolahan limbah, konsep dan proses disinfeksi dan faktor yang mempengaruhi disinfeksi.
Yulin lestari dan Tim
BIO 621 Bioteknologi Senyawa Antimikrob 3(2-3) 3
Kajian tentang bioteknologi senyawa antimikrob yang mencakup baik senyawa antibiotik asal organisme maupun semisintetik dan senyawa bakteriosin. Dijelaskan juga organisme penghasil senyawa tersebut, strategi seleksi dan skrining untuk mendapatkan senyawa antimikrob tersebut yang didukung dengan penjelasan fisiologi produksi, genetik dan perbaikan galur, mekanisme kerja, biosintesis, metode uji aktivitas, ektraksi, purifikasi dan sifat fisikokimia yang membantu dalam penentuan struktur molekul senyawa antimikrob tersebut.
Lisdar I. Sudirman dan Tim
BIO 711 Fisiologi Mikrob Lanjut 3(2-3) 1
Mempelajari struktur subseluler sel prokariot (bakteri dan arkaea), proses transpor, metabolisme dan regulasi senyawa aromatik, metabolisme nitrogen, serta respon prokariot terhadap cekaman.
Anja Meryandini dan Tim
BIO 712 Rekayasa Genetika Mikrob 3(2-3) 2
Mata kuliah ini membahas prinsip dasar kloning molekuler, berbagai teknik/strategi dalam kloning DNA, konstruksi pustaka cDNA, pustaka genom dan metagenom, berbagai strategi dalam identifikasi/deteksi gen, fusi transkripsi dan translasi, ekspresi dan ekspresi berlebih dari gen di E. coli, deteksi hasil ekspresi gen, directed mutagenesis dan rekayasa protein, molecular farming, dan produksi berbagai produk komersial hasil rekayasa genetika. Rekayasa genetika pada bakteri gram positif dan khamir juga akan dibahas dalam kuliah ini.
Aris Tri Wahyudi dan Tim
perkembangan/penemuan yang terbaru dengan pendekatan biologi molekuler, biokimia dan ekofisiologi.
Iman Rusmana dan Tim
BIO 714 Ekspresi Gen dan Pengendaliannya 3(2-3) 2
Memberikan wawasan untuk mempelajari analisis ekspresi gen dan
pengendaliannya. Meliputi aplikasi berbagai disiplin “omics” dalam mengungkap
ekspresi pada prokariot dan eukariot. Perkembangan terkini dalam bidang ini akan diberikan dalam bentuk pembahasan kasus khusus dari jurnal.
Antonius Suwanto dan Tim
BIO 715 Biologi Bakteri Patogen 2(2-0) 1
Mengkaji biologi berbagai bakteri patogen dalam hubungannya terhadap inang, penggunaan pendekatan model penelitian untuk menyelidiki regulasi dan ekspresi faktor penyerang yang dimiliki oleh berbagai patogen.
Sri Budiarti dan Tim
BIO 716 Biologi Aktinomiset dan Produktivitasnya 3(2-3) 2 Pengkajian perkembangan terkini biologi dan produktivitas aktinomiset dengan penekanan pada biologi Streptomyces, genetik, produksi antibiotik dan senyawa metabolit lain, pertumbuhan dan preservasi, dan teknik identifikasi. Diskusi juga akan mencakup perkembangan penelitian aktinomiset dan bioprospeksinya.
Yulin Lestari dan Tim
BIO 721 Biologi Cendawan Lanjut 3(2-3) 1
Pengkajian pengetahuan ragam morfologi struktur somatik dan reproduksi, sistem reproduksi dan genetika, ekologi, fisiologi, spesiasi, dan prinsip-prinsip sistematika cendawan.
Gayuh Rahayu dan Tim
BIO 722 Biologi Mikoriza 3(2-3) 2
Mata kuliah ini menjelaskan perkembangan mutakhir dari mikoriza dan mencakup materi dasar dan aplikasinya. Topik bahasan meliputi sejarah perkembangan, ragam mikoriza, ragam fungi mikoriza, fisiologi, ekologi, genetika, interaksi dengan organisme lain, peran mikoriza dalam berbagai aspek seperti siklus nutrisi, pupuk hayati, pengendali hayati hama dan penyakit tanaman, bioremediasi serta aspek teknologi produksi inokulum, ektomikoriza pangan dan obat-obatan, dan rekayasa genetikanya.
BIO 724 Biologi Makrofungi dan Produktivitasnya 3(2-3) 2 Mata kuliah ini menjelaskan pengetahuan dasar tentang makrofungi dan peranannya bagi manusia dan lingkungan dengan mempelajari ilmu jamur/makrofungi (mushroom science) mencakup identifikasi, ekologi, fisiologi, genetika, syarat-syarat pertumbuhan dan perkembangan pada berbagai macam substrat, faktor lingkungan dan nutrisi (proses dekomposisi dan enzim) dan mempelajari bioteknologi makrofungi (mushroom biotechnology) yang berhubungan dengan metabolisme dan produk makrofungi seperti senyawa antimikrob, kandungan obat dan metabolit sekunder lainnya yang bermanfaat bagi industri pangan, farmasi dan lingkungan.
