II.
Tinjauan Pustaka
A.
Papua
Provinsi Papua dengan luas 421.981 km2, terletak
diantara 130°-141° Bujur Timur dan 2,25° Lintang Utara -
9° Lintang Selatan. Letak pulau ini adalah di ujung Timur
Indonesia dan pulau ini dihuni oleh penduduk asli dari
ras Melanesia, dengan ciri-ciri fisik : berkulit hitam (coklat
kopi) dan berambut keriting (ikal) serta rata-rata
berperawakan besar (Wallace, 2000). Papua dipandang
sebagai suatu kelangsungan dari benua Australia yang
letaknya di zona tropika atas dasar topografi, alam
tumbuh-tumbuhan dan hewannya.
Di dataran tinggi pulau Papua terdapat sekitar 1000
bahasa, atau seperenam jumlah bahasa yang ditemukan
di dunia, sehingga merupakan daerah dengan tingkat
kekayaan bahasa tertinggi di dunia. Penggunaannya
terkadang hanya puluhan atau ratusan orang saja
(Koentjaningrat, 1971). Di daerah ini juga ditemukan
puluhan bahasa lokal yang benar-benar asli dan tidak ada
hubungannya dengan bahasa di bagian lain dunia ini.
Oleh sebab itu oleh Koentjaningrat bahasa-bahasa yang
diucapkan oleh suku-suku bangsa Papua di luar bahasa
Austronesia disebut dengan keluarga bahasa-bahasa
Pawley (1998), menyimpulkan bahwa
bahasa-bahasa yang digunakan di pegunungan tengah Papua
merupakan satu keluarga bahasa yang disebut “the Trans
-New-Guinea family” yang penyebarannya mungkin disetir
oleh budaya pertanian yang berasal dari dataran tinggi
New Guinea. Kesimpulan ini ditopang oleh kenyataan
bahwa di dataran tinggi Papua, masyarakat
mempraktekkan budaya pertanian menetap dengan salah
satunya hipere (ubi jalar) sebagai tanaman utamanya.
Salah satu budaya yang mungkin telah berada di sana
antara 7000 hingga 4000 tahun lampau (Diamond and
Bellwood, 2003).
Pada tahun 1528, gubernur pertama Portugis di
Maluku Jorge de Meneses mengunjungi pulau waigeo dan
mendapati penduduk yang berkulit hitam dan berambut
keriting, maka dia menyebut mereka sebagai orang Papua,
sedangkan wilayahnya disebut Ilhas Dos Papua (pulau
Papua) (Tim Peneliti LIPI, 2001).
Hasil pendataan Badan Pusat Statistik Papua tahun
2000 menyebutkan, ada 250 bahasa yang diujar dan 312
suku di Papua dengan suku terkecil disebut Nalka berada
di Jayawijaya, yang anggotanya 13 orang, dan suku
terbesar adalah Biak Numfor dengan jumlah anggota
148.104 jiwa. Dari 312 suku ini terdapat sekitar 40 suku
yang termasuk paling terisolasi. Mereka tidak tahu masuk
dalam distrik atau kabupaten mana karena pemerintah
1. Kondisi Geografis Papua
Papua memiliki luas hampir tiga setengah kali
Pulau Jawa (421.981 km2) dengan topografi yang
bervariasi dimana ada wilayah yang berada dibawah
permukaan laut, beberapa meter diatas permukaan air
laut, bahkan pegunungan yang senantiasa ditutupi air
salju. Dengan luas wilayah tersebut menjadikannya
sebagai salah satu propinsi terluas di Indonesia. Wilayah
ini terbagi dalam tiga bagian, yakni kepala burung atau
semenanjung cenderawasih, leher dan tubuh.
Saat pertama dikenal dunia luar hingga bergabung
kedalam NKRI, Papua hanya memiliki satu provinsi yang
bertempat di Jayapura. Tiga tahun setelah
Undang-Undang Otonomi Khusus diberlakukan di Papua, tepatnya
pada tahun 2004, Papua mengalami pemekaran hingga
menjadi dua wilayah provinsi, yaitu provinsi Papua dan
provinsi Papua Barat. Ibu kota provinsi Papua terletak di
kota Jayapura dan terdiri atas 19 kabupaten, antara lain
(www.Badan Pusat Statistik Papua.com) : Merauke,
Jayawijaya, Jayapura, Paniai, Puncak Jaya, Nabire,
Mimika, Yapen, Biak Numfor, Boven Digoel, Mappi, Asmat,
Yahukimo, Pegunungan Bintang, Tolikara, Sarmi, Keerom,
Waropen, Supiori. Sedangkan propinsi Papua Barat terdiri
atas delapan kabupaten, antara lain : Fak-fak, Kaimana,
Teluk Wondama, Teluk Bintuni, Manokwari, Sorong
Selatan, Sorong, Raja Ampat. (BPS Provinsi Papua Barat,
Keadaan geografis dan iklim di Provinsi Papua,
menyebabkan terjadinya pola-pola adaptasi yang
berbeda-beda antara satu atau beberapa golongan etnik lainnya
berdasarkan perbedaan lingkungan ekologi yang menjadi
tempat tinggal mereka.
2. Kondisi Demografis Papua
Masyarakat bangsa Papua termasuk dalam rumpun
Melanesia yang memliki kulit coklat gelap, berambut
keriting dan memiliki adat istiadat yang beragam mulai
dari tari-tarian, seni ukir hingga seni lukis. Bangsa Papua
terdiri dari dua golongan, yaitu Papua pantai dan papua
gunung. Papua pantai artinya masyarakat Papua yang
bermukim di pesisir pantai dan berprofesi sebagai
nelayan, sedangkan Papua gunung yaitu masyarakat
Papua yang bermukim di lereng-lereng gunung dan
mencari nafkah dengan cara bertani.
Dalam laporan perdana Bank Dunia/UNDP (1987),
Walker dan Mansoben mencatat bahwa keanekaragaman
orang Papua (sebelumnya disebut orang Irian) di Papua
bertalian erat dengan pola-pola adaptasi sosial-ekonomi
penduduk pada zona-zona ekologi utama yang ada.
Propinsi Papua termasuk Irian Jaya Barat secara geografis
terdiri dari tiga jenis daerah, yaitu daerah pegunungan
tengah, daerah dataran pantai di sebelah selatan dan
B.
Evolusi molekuler dan Definisi Genetik
Evolusi molekuler merupakan proses evolusi yang
terjadi pada skala DNA, RNA, dan protein. Perkembangan
ilmu biologi molekuler telah banyak memberikan
kontribusi yang besar pada pengetahuan evolusi biologi
dan mampu menjelaskan hal-hal yang sebelumnya sulit
dijelaskan, misalnya persamaan gen antara manusia dan
simpanse. Evolusi biologi merupakan proses dan
diversifikasi organisme menurut waktu dan morfologi,
fisiologi, perilaku dan ekologinya. Evolusi molekuler
memiliki 3 prinsip dasar, yaitu :
1. Mutasi
Mutasi bersifat permanen dan dapat mengantar
perubahan material genetik (biasanya DNA atau
RNA) sebuah sel. Mutasi dapat disebabkan oleh
kesalahan penggandaan pada material genetik, pada
saat pembelahan sel dan dapat disebabkan juga
oleh efek radiasi, bahan kimia, virus atau dapat juga
terjadi secara bebas selama proses seperti meiosis
dan Hypermutation. Mutasi alami tidak
mempengaruhi perubahan kelangsungan hidup
pada sebuah organisme pada habitatnya dan dapat
2. Penyebab perubahan pada frekuensi alel
Ada 4 proses yang dapat berakibat pada
kelangsungan hidup sebuah karakter, atau lebih
spesifiknya sebuah varian gen, yaitu:
- Mutasi
- Penyimpangan genetik, merupakan akumulasi
perubahan secara acak pada kelompok gen.
- Aliran gen (campuran gen), merupakan sesuatu
yang membuat populasi lebih dekat secara
genetik pada saat membangun kelompok gen
yang besar.
- Seleksi, pada kenyataannya seleksi alami
terbentuk oleh angka kematian dan angka
kelahiran yang berbeda.
3. Mempelajari filogeni pada tingkat molekuler
Sistematika molekuler merupakan bidang penting
dari sistematik dan genetika molekuler, yakni suatu
proses menggunakan data molekuler dari organisme
biologis (DNA, RNA atau keduanya, untuk
menyelesaikan pertanyaan dalam sistematik.
Gen merupakan satuan dasar bahan genetik yang
terkait degan sifat tertentu yang diteruskan kepada
turunannya melalui sebuah mekanisme cetak-copy
(replication), terekspresi ke dalam struktur RNA atau
protein melalui sebuah proses transkripsi dan atau
translasi. Watson dan Crick (1953) menyatakan bahwa
(“doble helix”) dan memperlihatkan berbagai aktifitas dari
molekul DNA.
Thomas Hunt Morgan (1910) menunjukkan bahwa
gen terletak di kromosom. Asam nukleat merupakan
sebuah polimer nukleotida yang berperan dalam
penyimpanan serta pemindahan informasi genetik
(polinukleotida). Asam nukleat terdapat dalam 2 bentuk
yaitu: Asam Deoksiribosa (DNA) dan Asam Ribosa (RNA).
Keduanya merupakan polimer linier, tidak bercabang dan
tersusun dari subunit-subunit yang disebut nukleotida.
Nukloetida merupakan dasar penyusun asam nkleat, RNA
dan DNA dimana strukturnya terdiri dari Basa, Gula dan
Phospat.
C.
DNA (
Deoxyribo Nucleic Acid
) dan
Kromosom Y
DNA atau Asam Deoksiribonukleat adalah zat kimia
polimer yang satuan-satuan dasarnya adalah nukleotida,
sehingga DNA tergolong polinukleotida. Nukleotida terdiri
atas tiga komponen utama, yaitu gugus fosfat, gula
deoksiribosa, dan basa nitrogen. Pada sistem hayati, DNA
adalah pembawa informasi genetik, artinya bahwa DNA
mengandung pada urutan khas basa nukleat, informasi
yang diperlukan bagi organisme pembawanya
merealisasikan sifat-sifat atau potensi dirinya sebagai
diwariskan. Prinsip bahwa DNA sebagai pembawa
informasi genetik berlaku secara umum/universal, kecuali
pada beberapa virus yang menyimpan informasi
genetiknya dalam bentuk RNA.
Kromosom merupakan suatu struktur
makromolekul yang berisi DNA di mana informasi genetik
dalam sel disimpan. Kromosom Y sendiri adalah
merupakan kromosom terkecil pada manusia yang
diperlukan untuk perkembangan seksual dan
spermatogenesis (Jobling and Smith, 2003). Kromosom Y
yang merupakan penentu kelamin pada manusia
khususnya pada penentu kelamin seks jantan pada pria
mengandung 58 juta pasang basa dan merupakan 0,38 %
dari total DNA dalam sel (Bruyere et al.,2006).
Kromosom Y dipahami hanya membawa gen yang
memicu diferensiasi testes, yang diketahui kemudian
sebagai gen SRY (sex-determining region Y) penentu
identitas seks jantan. Ada beberapa perilaku penting
dimiliki oleh kromosom Y, antara lain yang pertama
kromosom Y merupakan kromosom yang hanya terdapat
pada pria, ada bagian dari DNA kromosom Y tidak
melakukan proses perpasangan dengan kromosom X