UNIVERSITAS INDONESIA
POLA RESISTENSI BAKTERI DARI KULTUR DARAH TERHADAP GOLONGAN PENISILIN DI LABORATORIUM
MIKROBIOLOGI KLINIK FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS INDONESIA (LMK-FKUI) TAHUN 2001-2006
SKRIPSI
M. SHIDDIQ AL HANIF 010500103Y
FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS INDONESIA
JAKARTA 2009
UNIVERSITAS INDONESIA
POLA RESISTENSI BAKTERI DARI KULTUR DARAH TERHADAP GOLONGAN PENISILIN DI LABORATORIUM
MIKROBIOLOGI KLINIK FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS INDONESIA (LMK-FKUI) TAHUN 2001-2006
SKRIPSI
Diajukan sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar sarjana kedokteran.
M. SHIDDIQ AL HANIF 010500103Y
FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS INDONESIA
JAKARTA 2009
Pola Resistensi ..., M.Shidiq Al Hanif, FK UI., 2009
PERNYATAAN ORISINALITAS
Penelitian ini adalah hasil karya saya sendiri, dan semua sumber baik yang dikutip maupun dirujuk
telah saya nyatakan dengan benar.
Nama : M. Shiddiq Al Hanif
NPM : 010500103Y
Tanda tangan :
Tanggal : 03 Juli 2009
iii Universitas Indonesia LEMBAR PENGESAHAN
Skripsi ini diajukan oleh :
Nama : M. Shiddiq Al Hanif
NPM : 010500103Y
Program Studi : Pendidikan Dokter Umum
Judul Skripsi : Pola Resistensi Bakteri dari Kultur Darah terhadap Golongan Penisilin di Laboratorium Mikrobiologi Klinik Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia ( LMK-FKUI ) Tahun 2001-2006
Telah berhasil dipertahankan di hadapan Dewan Penguji dan diterima sebagai bagian persyaratan yang diperlukan untuk memperoleh gelar sarjana pada Program Pendidikan Dokter Umum Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia.
DEWAN PENGUJI
Pembimbing : DR. dr. Anis Karuniawati, PhD, SpMK ( ) Penguji : DR. dr. Anis Karuniawati, PhD, SpMK ( ) Penguji : dr. Tjahjani Mirawati Sudiro, PhD ( )
Jakarta, 03 Juli 2009
Pola Resistensi ..., M.Shidiq Al Hanif, FK UI., 2009
KATA PENGANTAR
Alhamdulillahirobbil’alamain, karena atas rahmat Allah semata penulis dapat menyelesaikan skripsi ini. Penyusunan skripsi ini dilakukan dalam rangka memenuhi salah satu syarat untuk mencapai gelar sarjana kedokteran pada Pogram Pendidikan Dokter Umum Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia.
Saya menyadari bahwa, tanpa bantuan dan bimbingan dari berbagai pihak, dari masa perkuliahan sampai penyusunan skripsi ini, sangat sulit bagi saya untuk menyelesaikan skripsi ini.
Ucapan terima kasih saya sampaikan kepada dr. Anis Karuniawati, PhD, SpMK (K), selaku pembimbing yang telah menyediakan waktu, tenaga, dan pikiran serta dengan sabar membimbing saya dan teman-teman dalam proses pembuatan skripsi ini. Kemudian kepada DR. dr. Ernie H. Purwaningsih atas bimbingan serta ilmu yang telah diberikan. Juga kepada seluruh staf Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI yang terlibat dalam penyediaan data sekunder dalam penelitian ini. Kemudian kepada ibu saya, Atmim, dan keluarga saya yang selalu mendukung dan mendoakan kebaikan belajar saya dan kepada teman- teman satu kelompok riset Darius, Tommie, Tania dan Uti yang telah banyak membantu, serta pihak-pihak yang tidak dapat saya sebutkan satu per satu, yang telah memberikan dukungannya secara material maupun moral sehingga saya dapat menyelesaikan skripsi ini dengan lancar. Semoga Allah SWT membalas semua kebaikan yang telah diberikan.
Saya menyadari masih banyak kekurangan dalam skripsi ini, semoga skripsi ini membawa manfaat bagi pengembangan ilmu, serta dapat digunakan untuk kepentingan kesehatan.
Jakarta, 03 Juli 2009 M. Shiddiq Al Hanif
v Universitas Indonesia LEMBAR PERNYATAAN PERSETUJUAN PUBLIKASI KARYA ILMIAH
UNTUK KEPENTINGAN AKADEMIS
Sebagai sivitas akademik Universitas Indonesia, saya yang bertanda tangan di bawah ini:
Nama : M. Shiddiq Al Hanif
NPM : 010500103Y
Program Studi : Pendidikan Dokter Umum Fakultas : Kedokteran
Jenis karya : Skripsi
demi pengembangan ilmu pengetahuan, menyetujui untuk memberikan kepada Universitas Indonesia Hak Bebas Royalti Non-Eksklusif (Non-Exclusive Royalty- Free Right) atas karya ilmiah saya yang bejudul: ” Pola Resistensi Bakteri dari Kultur Darah terhadap Golongan Penisilin di Laboratorium Mikrobiologi Klinik Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia ( LMK-FKUI ) Tahun 2001-2006”
beserta perangkat yang ada (bila diperlukan). Dengan Hak Bebas Royalti Non- Eksklusif ini Universitas Indonesia berhak menyimpan, mengalihmedia/format- kan, mengelolanya dalam bentuk pangkalan data (database), mendistribusikannya, dan menampilkan/mempublikasikannya di Internet atau media lain untuk kepentingan akademis tanpa perlu meminta izin dari saya selama tetap mencantumkan nama saya sebagai penulis/pencipta dan sebagai pemilik Hak Cipta. Segala bentuk tuntutan hukum yang timbul atas pelanggaran Hak Cipta dalam karya ilmiah ini menjadi tanggung jawab saya pribadi.
Demikian pernyataan ini saya buat dengan sebenarnya.
Jakarta, 03 Juli 2009 Yang menyatakan
M. Shiddiq Al Hanif
Pola Resistensi ..., M.Shidiq Al Hanif, FK UI., 2009
DAFTAR ISI
HALAMAN JUDUL ... i
PERNYATAAN ORISINALITAS ... ii
LEMBAR PENGESAHAN ... iii
KATA PENGANTAR ... iv
LEMBAR PERSETUJUAN PUBLIKASI KARYA ILMIAH ... v
ABSTRAK ... vi
ABSTRACT ... vii
DAFTAR ISI ... viii
DAFTAR TABEL ... x
DAFTAR GAMBAR ... xi
DAFTAR SINGKATAN ... xii
1. PENDAHULUAN ... 1
1.1. Latar Belakang ... 1
1.2. Pertanyaan Penelitian ... 2
1.3. Tujuan Penelitian ... 2
1.3.1. Tujuan Umum ... 2
1.4.2. Tujuan Khusus ... 3
1.5. Manfaat Penelitian ... 3
2. TINJAUAN PUSTAKA ... 4
2.1. Bakteri ... 4
2.1.1. Definisi ... 4
2.1.2. Klasifikasi ... 4
2.1.3. Struktur ... 6
2.1.4. Pertumbuhan dan Reproduksi ... 7
2.2. Antibiotika ... 8
2.2.1. Klasifikasi ... 9
2.2.2. Resistensi Bakteri terhadap Antibiotika ... 12
2.2.3. Aktivitas antimikroba in vitro ... 14
2.2.4. Penisilin ... 15
2.3. Kultur Darah ... 22
2.3.1. Kepentingan Klinis ... 22
2.3.2. Pengambilan Spesimen ... 23
2.3.3. Faktor-faktor yang mempengaruhi didapatkannya patogen .... 26
2.3.4. Kemaknaan Kultur Darah Positif ... 29
2.4. Kerangka Konseptual ... 30
3. METODE PENELITIAN ... 31
3.1. Desain Penelitian ... 31
3.2. Waktu dan Tempat Penelitian ... 31
3.3. Populasi Penelitian ... 31
3.4. Sampel dan Cara Pemilihan Sampel ... 31
3.5. Besar Sampel ... 32
ix Universitas Indonesia
3.7. Definisi Operasional ... 36
3.8. Persetujuan Setelah Penjelasan ... 37
4. HASIL DAN PEMBAHASAN ... 38
4.1. Hasil ... 38
4.1.1. Bakteri pada kultur darah di LMK-FKUI 2001-2006 ... 38
4.1.2. Pola Resistensi Acinetobacter anitratus terhadap amoksilin/- asam klavulanat, dan tikarsilin tahun 2001-2006 ... 41
4.1.3. Pola Resistensi Klebsiella pneumoniae terhadap amoksilin, sulbenisilin amoksilin/asam klavulanat, dan tikarsilin tahun 2001-2006 ... 42
4.1.4. Pola Resistensi Pseudomonas aeruginosa terhadap amoksilin/- asam klavulanat, dan tikarsilin tahun 2001-2006 ... 43
4.1.5. Pola Resistensi Salmonella Typhi terhadap amoksilin, sulbenisilin amoksilin/asam klavulanat, dan tikarsilin tahun 2001-2006 ... 44
4.1.6. Pola Resistensi Staphylococcus epidermidis terhadap amoksilin, sulbenisilin, amoksilin/asam klavulanat, tikarsilin dan oksasilin tahun 2001-2006 ... 45
4.1.7. Pola Resistensi Staphylococcus aureus terhadap amoksilin, sulbenisilin, amoksilin/asam klavulanat, tikarsilin dan oksasilin tahun 2001-2006 ... 46
4.2. Diskusi ... 47
5. KESIMPULAN DAN SARAN ... 55
5.1. Kesimpulan ... 55
5.2. Saran ... 55
DAFTAR PUSTAKA ... 57
Pola Resistensi ..., M.Shidiq Al Hanif, FK UI., 2009
DAFTAR TABEL
Tabel 4.1. Sebaran isolat bakteri gram positif dan negatif dari darah di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI, Tahun 2001-2006... 38
Tabel 4.2. Hasil uji sensitifitas beberapa bakteri yang diisolasi dari darah di LMK FKUI pada 3 periode selama tahun 2001-2006 terhadap sulbenisilin, tikarsilin dan oksasilin... 39 Tabel 4.3. Hasil uji sensitifitas beberapa bakteri yang diisolasi dari darah di
LMK FKUI pada 3 periode selama tahun 2001-2006 terhadap amoksilin dan amoksilin/asam klavulanat... 40
xi Universitas Indonesia DAFTAR GAMBAR
Gambar 2.1. Perbandingan struktur antara dinding sel bakteri gram-negatif dan gram-positif... 6 Gambar 2.2. Struktur Penisilin : inti asam 6-aminopenisilanik ... 16 Gambar 2.3. Reaksi Transpeptidase ... 20 Gambar 4.1. Pola resistensi Acinetobacter anitratus terhadap antibiotika
amoksilin/-asam klavulanat dan tikarsilin di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006 ...42 Gambar 4.2. Pola resistensi Klebsiella pneumoniae terhadap antibiotika
amoksilin, sulbenisilin, amoksilin/-asam klavulanat dan tikarsilin di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006... 43 Gambar 4.3. Pola resistensi Pseudomonas aeruginosa terhadap antibiotika
amoksilin/-asam klavulanat dan tikarsilin di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006 ... 44 Gambar 4.4. Pola resistensi Salmonella Typhi terhadap antibiotika amoksilin,
sulbenisilin, amoksilin/asam klavulanat dan tikarsilin di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2004... 45 Gambar 4.5. Pola resistensi Staphylococcus epidermidis terhadap antibiotika
amoksilin, sulbenisilin, amoksilin/asam klavulanat, tikarsilin dan okasasilin di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006... 46 Gambar 4.5. Pola resistensi Staphylococcus aureus terhadap antibiotika
amoksilin, sulbenisilin, amoksilin/asam klavulanat, tikarsilin dan okasasilin di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006 ... 47
Pola Resistensi ..., M.Shidiq Al Hanif, FK UI., 2009
DAFTAR SINGKATAN
1. LMK FKUI : Laboratorium Mikrobiologi Klinik Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia
2. RSCM : Rumah Sakit Cipto Mangunkusumo 3. DNA : Deoxyribonucleic Acid
4. LPS : Lipopolisakarida
5. MIC : Minimum Inhibitory Concentration 6. MLC : Minimum Lethal Concentration 7. mRNA : messenger-Ribonucleic acid 8. ESBL : extended-spectrum beta-laktamase 9. PBP : Penisilin-Binding Protein
10. PUFA : Polyunsaturated Fatty Acids
11. NCCLS : National Committee on Clinical Laboratory Standards
12. CLSI : Clinical and Laboratory Standards Institute 13. MRSA : Methicillin-resistant Staphylococcus aureus
