UNIVERSITAS INDONESIA
POLA RESISTENSI BAKTERI DALAM DARAH TERHADAP KLORAMFENIKOL,
TRIMETHOPRIM/SULFAMETOKSAZOL, DAN TETRASIKLIN DI LABORATORIUM MIKROBIOLOGI
KLINIK FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS INDONESIA (LMK FKUI) PADA TAHUN 2001-2006
SKRIPSI
TOMMIE PRASETYO U. W.
0105001677
FAKULTAS KEDOKTERAN JAKARTA
JUNI 2009
Pola resistensi ..., Tommie Prasetyo U.W., FK UI., 2009
UNIVERSITAS INDONESIA
POLA RESISTENSI BAKTERI DALAM DARAH TERHADAP KLORAMFENIKOL,
TRIMETHOPRIM/ SULFAMETOKSAZOL, DAN TETRASIKLIN DI LABORATORIUM MIKROBIOLOGI
KLINIK FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS INDONESIA (LMK FKUI) PADA TAHUN 2001-2006
SKRIPSI
Diajukan sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar sarjana kedokteran.
TOMMIE PRASETYO U. W.
0105001677
FAKULTAS KEDOKTERAN JAKARTA
JUNI 2009
Pola resistensi ..., Tommie Prasetyo U.W., FK UI., 2009
ii
PERNYATAAN ORISINALITAS
Penelitian ini adalah hasil karya saya sendiri, dan semua sumber baik yang dikutip maupun dirujuk
telah saya nyatakan dengan benar.
Nama : Tommie Prasetyo U. W.
NPM : 0105001677
Tanda tangan :
Tanggal : 3 Juli 2009
Pola resistensi ..., Tommie Prasetyo U.W., FK UI., 2009
iii
LEMBAR PENGESAHAN
Skripsi ini diajukan oleh :
Nama : Tommie Prasetyo U. W.
NPM : 0105001677
Program Studi : Pendidikan Dokter Umum
Judul Skripsi : Pola Resistensi Bakteri dalam Darah terhadap Kloramfenikol, Trimethoprim/Sulfametoksazol, dan Tetrasiklin di Laboratorium Mikrobiologi Klinik Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia (LMK FKUI) pada tahun 2001-2006
Telah berhasil dipertahankan di hadapan Dewan Penguji dan diterima sebagai bagian persyaratan yang diperlukan untuk memperoleh gelar sarjana pada Program Pendidikan Dokter Umum Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia.
DEWAN PENGUJI
Pembimbing : Dr. Anis Karuniawati, SpMK, PhD ( ) Penguji : Dr. Anis Karuniawati, SpMK, PhD ( )
Penguji : Dr. T. Mirawati Sudiro, SpMK, Ph.D ( )
Jakarta, 3 Juli 2009
Pola resistensi ..., Tommie Prasetyo U.W., FK UI., 2009
iv
KATA PENGANTAR
Alhamdulillah, segala puji bagi Allah SWT, hanya dengan rahmatNya saya dapat menyelesaikan pembuatan skripsi yang berjudul “Pola Resistensi Bakteri dari Darah terhadap Kloramfenikol, Trimethoprim/Sulfametoksazol, dan Tetrasiklin di Laboratorium Mikrobiologi Klinik Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia (LMK FKUI) pada tahun 2001-2006” ini dengan cukup mudah dan lancar.
Ucapan terima kasih kami sampaikan kepada dr. Anis Karuniawati, SpMK, PhD selaku pembimbing penulis dalam pembuatan skripsi ini. Kemudian kepada DR.
dr. Ernie H. Purwaningsih atas bimbingan yang telah diberikan. Juga kepada seluruh staf Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI yang terlibat dalam penyediaan data sekunder dalam penelitian ini. Kemudian kepada orangtua saya, teman-teman dan pihak-pihak yang tidak dapat saya sebutkan satu per satu, yang telah memberikan dukungannya baik dukungan moral maupun material sehingga saya dapat menyelesaikan skripsi ini dengan lancar.
Harapan saya skripsi ini dapat menambah pengetahuan di bidang kedokteran khususnya bidang mikrobiologi mengenai resistensi bakteri terhadap antibiotik.
Terlebih lagi bila tulisan ini bermanfaat bagi penggunaan antibiotik secara klinis dan dapat menolong orang banyak.
Saya menyadari bahwa skripsi ini jauh dari sempurna. Oleh karena itu saya mohon maaf kepada pembaca bila terdapat kesalahan atau kekurangan dalam tulisan ini yang mengganggu atau tidak berkenan di hati pembaca.
Saran dan kritik yang membangun selalu saya harapkan demi kesempurnaan ilmu pengetahuan dan perbaikan tulisan saya berikutnya. Selamat membaca.
Jakarta, 3 Juli 2009 Tommie Prasetyo U. W.
Pola resistensi ..., Tommie Prasetyo U.W., FK UI., 2009
v
HALAMAN PERNYATAAN PERSETUJUAN PUBLIKASI TUGAS AKHIR UNTUK KEPENTINGAN AKADEMIS
Sebagai sivitas akademik Universitas Indonesia, saya yang bertanda tangan di bawah ini:
Nama : Tommie Prasetyo U. W.
NPM : 0105001677
Program Studi : Pendidikan Dokter Umum Fakultas : Kedokteran
Jenis karya : Skripsi
demi pengembangan ilmu pengetahuan, menyetujui untuk memberikan kepada Universitas Indonesia Hak Bebas Royalti Non-Eksklusif (Non-Exclusive Royalty- Free Right) atas karya ilmiah saya yang berjudul: ” Pola Resistensi Bakteri dalam Darah terhadap Kloramfenikol, Trimethoprim/Sulfametoksazol, dan Tetrasiklin di Laboratorium Mikrobiologi Klinik Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia (LMK FKUI) pada tahun 2001-2006” beserta perangkat yang ada (bila diperlukan). Dengan Hak Bebas Royalti Non-Eksklusif ini Universitas Indonesia berhak menyimpan, mengalihmedia/format-kan, mengelola dalam bentuk pangkalan data (database), merawat, dan mempublikasikan tugas akhir saya selama tetap mencantumkan nama saya sebagai penulis/pencipta dan sebagai pemilik Hak Cipta.
Demikian pernyataan ini saya buat dengan sebenarnya.
Jakarta, 3 Juli 2009 Yang menyatakan
Tommie Prasetyo U. W.
Pola resistensi ..., Tommie Prasetyo U.W., FK UI., 2009
Universitas Indonesia
viii DAFTAR ISI
HALAMAN JUDUL ...i
PERNYATAAN ORISINALITAS ... ii
LEMBAR PENGESAHAN ... iii
KATA PENGANTAR ...iv
LEMBAR PERNYATAAN PERSETUJUAN PUBLIKASI KARYA ILMIAH ...v
ABSTRAK ...vi
ABSTRACT ... vii
DAFTAR ISI... viii
DAFTAR TABEL ...x
DAFTAR GAMBAR...xi
DAFTAR SINGKATAN... xii
1. PENDAHULUAN ...1
1.1. Latar Belakang...1
1.2. Rumusan Masalah ...2
1.3. Pertanyaan Penelitian ...2
1.4. Tujuan Penelitian...2
1.4.1. Tujuan Umum ...2
1.4.2. Tujuan Khusus ...2
1.5. Manfaat Penelitian...2
2. TINJAUAN PUSTAKA...4
2.1. Bakteri...4
2.1.1. Definisi...4
2.1.2. Klasifikasi ...4
2.1.3. Struktur.. ...6
2.1.4. Pertumbuhan dan Reproduksi.. ...7
2.2. Antibiotik ...8
2.2.1. Klasifikasi ...9
2.2.2. Resistensi Bakteri terhadap Antibiotik ...11
2.2.3. Pemeriksaan Aktivitas Antimikroba in vitro ...13
2.2.4. Kloramfenikol ...15
2.2.5. Tetrasiklin ...16
2.2.6. Trimethoprim/Sulfametoksazol ...17
2.3. Kultur darah ...19
2.3.1. Kepentingan Klinis.. ...19
2.3.2. Pengumpulan dan Transpor spesimen ...19
2.3.2.1. Waktu Pengumpulan Kultur Darah. ...19
2.3.2.2. Jumlah Spesimen Darah untuk Pembuatan Kultur...20
2.3.2.3. Volume Darah. ...20
2.3.2.4. Distribusi Darah...21
2.3.2.5. Pengcegahan Kontaminasi Kultur Darah. ...21
2.3.2.6. Pengumpulan Kultur Darah...21
2.3.2.7. Kriteria Penolakan. ...23
Pola resistensi ..., Tommie Prasetyo U.W., FK UI., 2009
Universitas Indonesia
ix
2.3.3. Pedoman Khusus Berhubungan dengan Pemeriksaan Kultur Darah 23
2.3.4. Kerangka Konseptual...24
3. METODE PENELITIAN...25
3.1. Desain Penelitian ...25
3.2. Tempat dan Waktu Penelitian...25
3.3. Populasi Penelitian...25
3.3.1. Populasi Target ...25
3.3.2. Populasi Terjangkau...25
3.4. Sampel dan Cara Pemilihan Sampel ...25
3.5. Besar Sampel ...26
3.6. Kriteria Inklusi dan Eksklusi...26
3.6.1. Kriteria Inklusi ...26
3.6.2. Kriteria Eksklusi ...26
3.7. Cara Kerja ...27
3.8. Definisi Operasional ...30
3.9. Persetujuan Setelah Penjelasan (Informed Consent) ...31
4. HASIL ...32
5. PEMBAHASAN ...40
6. KESIMPULAN DAN SARAN ...44
6.1. Kesimpulan ...44
6.2. Saran ...44
DAFTAR REFERENSI ...46
Pola resistensi ..., Tommie Prasetyo U.W., FK UI., 2009
Universitas Indonesia
x
DAFTAR TABEL
Tabel 1. Sebaran isolat bakteri gram positif dan negatif dari darah di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI, Tahun 2001- 2006………32 Tabel 2. Persen resistensi beberapa bakteri yang didapatkan dari spesimen
darah di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006 terhadap antibiotik kloramfenikol, kotrimoksasol, dan tetrasiklin...38
Pola resistensi ..., Tommie Prasetyo U.W., FK UI., 2009
Universitas Indonesia
xi
DAFTAR GAMBAR
Gambar1. Pola resistensi Acinetobacter anitratus terhadap antibiotika kloramfenikol dan kotrimoksasol di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006...33 Gambar2. Pola resistensi Klebsiella pneumoniae terhadap antibiotika
kloramfenikol dan kotrimoksasol di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006...34 Gambar3. Pola resistensi Pseudomonas aeruginosa terhadap antibiotika
kloramfenikol dan kotrimoksasol di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006...35 Gambar4. Pola resistensi Salmonella Typhi terhadap antibiotika kloramfenikol
dan trimethoprim/ sulfamethoxazole di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006...35 Gambar5. Pola resistensi Staphylococcus epidermidis terhadap antibiotika
kloramfenikol dan kotrimoksasol di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006...36 Gambar6. Pola resistensi Staphylococcus aureus terhadap antibiotika
kloramfenikol dan kotrimoksasol di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006...37 Gambar7. Pola kepekaan berbagai bakteri yang didapatkan dari spesimen darah
terhadap tetrasiklin di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI tahun 2001-2003... ...39
Pola resistensi ..., Tommie Prasetyo U.W., FK UI., 2009
Universitas Indonesia
xii
DAFTAR SINGKATAN
CLSI : Clinical and Laboratory Standards Institute
DNA : Deoxyribonucleic Acid
DAP :Diaminpimelat
MDR : Multi Drug Resistant
MIC : Minimum Inhibitory Concentration MLC : Minimum Lethal Concentration mRNA : messenger-Ribonucleic acid NAG :N-acetylglucosamine
LMK FKUI : Laboratorium Mikrobiologi Klinik Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia
LPS : Lipopolisakarida
PABA :p-aminobenzoat
PBP :protein binding penicillin PUFA : Polyunsaturated Fatty Acids
RSCM : Rumah Sakit Cipto Mangunkusumo
tRNA : transfer- Ribonucleic acid
Pola resistensi ..., Tommie Prasetyo U.W., FK UI., 2009