x
RINGKASAN
Pengetahuan mengenai keragaman genetik pada populasi ikan sangat penting sebagai landasan dalam usaha menjaga kelestarian populasi ikan tersebut. Penelitian ini ditujukan untuk mengungkap keanekaragaman Mystus gulio di DAS Serayu. Sepuluh sampel insang ikan Mystus gulio (lundu) dikoleksi sebagai sumber DNA. DNA genomik total diisolasi menggunakan Chelex 5 %. Variabel yang diamati adalah pola pita dan jumlah fragmen DNA hasil amplifikasi. Penentuan primer terpilih dilakukan secara deskriptif berdasarkan ada tidaknya pita DNA spesifik pada gel agarosa. Keanekaragaman genetik akan dianalisis secara statistik menggunakan
molecular diversity indices yang terdapat dalam software Arlequin (versi 3.0). Hasil penelitian menunjukkan bahwa dari sepuluh primer tersebut hanya dua primer yang dapat menghasilkan marka RAPD yang konsisten dan polimorfik pada beberapa strain ikan lundu, yaitu OPA-9 dan OPAC-14. Dengan ukuran pasangan basa 900 pada OPA-9 dan 935, 1250, dan 1380 pada OPAC-14. Heterozigositas lokus RAPD
Mystus gulio di DAS Serayu sebesar 16 % (0.16), dari hasil penelitian dapat disimpulkan bahwa nilai keragaman genetik Mystus gulio di DAS Serayu bernilai rendah.
Kata kunci : Mystus gulio, Chelex 5%, RAPD, PCR, keragaman genetik
xi SUMMARY
Knowledge on genetic diversity is very important for fish population preservation. This study aimed to reveal the genetic diversity within population of
Mystus gulio in Serayu watershed. The ten gill tissue samples were collected as a source of DNA. Total genomic DNA was isolated using Chelex 5%. The variables measured were banding pattern and the member of RAPD bands fragments amplification product. Determination of selected prime descriptively based on the presence or absence of specific DNA bands on an agarose gel. Genetic diversity will be statistically analyzed using molecular diversity indices contained in the Arlequin software (version 3.0). The results showed that from ten primes only two could produce consistent RAPD markers and polymorphic in some strains of the fish, the OPA-9 and OPAC-14. With a size of 900 base pairs in OPA-9 and 935, 1250, and 1380 in OPAC-14. RAPD locus heterozygosity of Mystus gulio Serayu watershed was 16% (0.16), it was concluded that the value of genetic diversity in the watershed Serayu Mystus gulio was low
Keywords: Mystus gulio, Chelex 5%, RAPD, PCR, genetic diversity
