BAB II PENYELENGGARAAN PENDIDIKAN PROGRAM STUDI
B. PROGRAM PASCASARJANA
3) Konsentrasi Ilmu Pemuliaan Tanaman
a) Struktur Mata Kuliah
SEMESTER
1 UNX20.112 UNX20.111 E20A.142 E20A.145
Filsafat Ilmu Statistika Terapan Genetika Kuantitatif dan genetika populasi Plant Genetic Resources 12 2 4 3 3 SEMESTER
2 UNX20.214 UNX20.201 E20A.235 E20A.240 E20A.236 E20A.237 Analisis Regresi Dan Permukaan Respon Metodologi Ilmu-Ilmu Alam Aplikasi Genomik Untuk Pemuliaan Tanaman Strategi Seleksi dan Pengemba ngan Kultivar Metode Pemuliaan Tanaman Khusus Pemuliaan cekaman biotik dan abiotik 15 3 2 3 3 2 2 SEMESTER ALIH TAHUN UNX20.008 Seminar Usulan Penelitian 1 1 SEMESTER 3 mata kuliah pilihan 2-11 SEMESTER 4 UNX20.010 Tesis 6 6
b) Daftar Mata Kuliah
No Kode Nama Matakuliah SKS
1. UNX20.112 Filsafat Ilmu 2
2. UNX20.111 Statistik Terapan 4
3. UNX20.214 Analisis Regresi dan Permukaan Respon 3
4. UNX20.201 Metodologi Penelitian Ilmu-ilmu Alam 2
5. E20A.145 Plant Genetic Resources 3
6. E20A.144 Pemuliaan Tanaman Hortikultura 2
8. E20A.142 Genetika Kuantitatif dan genetika populasi 3
9. E20A.242 Transformasi dan Ekspresi Gen 2
10. E20A.241 Teknologi Marker 2
11. E20A.240 Strategi Seleksi dan Pengembangan Kultivar 3
12. E20A.239 Pemuliaan Tanaman Tahunan 2
13. E20A.238 Pemuliaan Fitofarmaka dan atsiri 2
14. E20A.237 Pemuliaan Cekaman Biotik dan Abiotik 2
15. E20A.236 Metode Pemuliaan Tanaman Khusus 2
16. E20A.235 Aplikasi Genomik Untuk Pemuliaan Tanaman 3
17. E20A.234 Analisis Genom dan Sitogenetika 2
18. UNX20.010 Tesis 6
19. UNX20.008 Seminar Usulan Penelitian 1
c) Deskripsi Mata Kuliah
UNX20.111 FILSAFAT ILMU 2(2-0)
Philosophy of Science
Ilmu (sains) sebagai pengetahuan yang dipandu secara normatif (dari Tuhan Yang Maha Esa, Allah subhanahu wataala). Pencarian atau penguasaan ilmu (the quest for
knowledge). Manusia yang berkemampuan untuk mengetahui, nalar, dan hasil nalar.
Sejarah perkembangan filsafat dan ilmu. Dunia rasio dan rasa; ikhtiar versus takdir. Sains empiris; anatomi sains. Penalaran deduktif dan induktif. Hubungan diantara filsafat, sains, dan metodologi (metode dan teknik). Persamaan dan perbedaan antara ilmu-ilmu alamiah dengan ilmu-ilmu sosial-kemanusiaan. Perintisan ilmu (sains) berdasarkan agama. Pokok-pokok bahasan yang sama yang dikembangkan dari silabus ringkas di atas dibahas oleh tim pengajar bersama mahasiswa dalam beberapa kelompok/ kelas paralel.
Mahfud Arifin, Aos M. Akyas, Husen Djajasukanta
UNX20.201 METODOLOGI PENELITIAN ILMU ALAMIAH 2(2-0)
Research Method in Natural Sciences Prasyarat : UNX20.111
Logika dan penalaran ilmiah, strategi penelitian. Metode penelitiankualitatif, kuantitatif, dan campuran (Mixed); Rancangan penelitian, perumusan masalah, tinjauan pustaka, kerangka pemikiran, hipotesis; pengujian data dan kesimpulan. Teknik penulisan naskah ilmiah; usulan penelitian tesis dan disertasi, artikel ilmiah dalam jurnal ilmiah terakreditasi nasional dan internasional serta Poster
Tati Nurmala, Agung Karuniawan
UNX20.112 STATISTIK TERAPAN 4(4-0)
Statistical Applied Analysis
Perencanaan percobaan. Batasan dan dasar-dasar. Analisis varians Rancangan acak lengkap (RAL). Pembandingan berganda. Efisiensi nisbi. Analisis varians II: Rancangan acak kelompok (RAK), rancangan bujur sangkar (RBS). Analisis varians III: percobaan
faktorial dan fraksi faktorial. Analisis varians IV: Rancangan split plot, rancangan split blok, rancangan split-split plot, analisis split plot dalam ruang dan waktu, analisis seri percobaan. Analisis varians V: Analisis percobaan tersarang. Analisis regresi dan korelasi, sederhana, multipel, parsial dan parsial-multipel. Analisis regresi nonlinear. Analisis polinom ortogonal. Analisis permukaan respons. Analisis jalin. Analisis kovarians. Uji banding regresi dan korelasi sederhana dan multipel. Analisis statistika nonparametrik Teknik penarikan sampel. Pengenalan statistika multivariat: analisis varians multivariat, analisis komponen utama, analisis faktor, analisis gugus, dan analisis diskriminan
Ruminta dan Denny K
UNX20.214 ANALISIS REGRESI DAN KORELASI 3(3-0)
Regression Analysis and Curve Respons Analysis Prasyarat : UNX20.112
Makna dan manfaat regresi; model dan persamaan regresi; analisis regresi linear sederhana : asumsi dasar, pendugaan dan pengujian parameter; model regresi dan analisis regresi linear; analisis residu regresi; pembandingan dua model regresi atau lebih; data bermasalah : multikolinearitas, autokorelasi, dan outliers; analisis jalin; Analisis regresi nonlinear; analisis komponen utama, analisis faktor, analisis gugus, dan analisis diskriminan; teknik permukaan respons : dasar, tujuan, dan kegunaan; penentuan kondisi operasi optimum; rancangan pendugaan model orde pertama; rancangan pendugaan model orde kedua; pemetaan respons; analisis dan ran¬cangan percobaan berblok; kriterium pemilihan rancangan permukaan respons.
Ruminta
E20A.142 GENETIKA KUANTITATIF DAN GENETIKA POPULASI 3(3-0)
Quantitative And Population Genetics
Pendahuluan, konstitusi genetik populasi, pendugaan variasi genetik, faktor penyebab variasi genetik, struktur populasi, evolusi, kekerabatan.
Anas, Meddy Rachmadi, Noladhi Wicaksana
E20A.145 SUMBER DAYA GENETIK 3(3-0)
Plant Genetic Resources
Genetika tanaman dan dasar-dasar perbaikan tanaman, bertitik-tolak dari hukum-hukum mendel dan penyimpangannya. perubahan sifat tanaman oleh alam dan induksi buatan melalui seleksi, hibridisasi, dan mutasi.
Agung Karuniawan, Suseno Amien, Noladhi Wicaksana, Achmad Baihaki
E20A.235 APLIKASI GENOMIK UNTUK PEMULIAAN TANAMAN 3(3-0)
Application of Genomics to Plant Breeding
Pengertian, kegunaan genomik dan konsep dasar genomik, yang meliputi struktural, fungsional genomik dan bioinformatik. Organisasi genom dan gen: karakteristik dan fungsi genom organel dan inti, ukuran genom dan jumlah gen, serta karakteristik genom inti. Struktur genome dan gen: DNA sequencing project, dan protein sequencing dan prediksi struktur protein. Selain itu materi tentang functional genomics: identifikasi gen, prediksi gen, gene annotation dan discovery, transcriptomics dan proteomics akan diberikan. Genome mapping (linkage dan physical mapping), comparative genomics dan keragaman genom. Teknik yang umumnya digunakan dalam genomik, yaitu molecular marker, microarray dan internet resources untuk analisis genom. Genome database dan bioinformatics yang diaplikasikan untuk kegiatan pemuliaan tanaman (analysis sekuens: homology dan alignment). Transformasi genetik: metode, aplikasi dan karakterisasi molekuler tanaman transgenik.
E20A.240 STRATEGI SELEKSI DAN PENGEMBANGAN KULTIVAR 3(3-0)
Selection and Cultivar Development Strategy
Struktur genetik tanaman menyerbuk sendiri dan menyerbuk silang, overview metode-metode seleksi, perbaikan populasi, landasan dan kemajuan seleksi, seleksi tidak langsung, seleksi marka molekular, desain persilangan, kemajuan selekss, kemajuan genetik. Murdaningsih Haeruman Karmana, Warid Ali Qosim, Dedi Ruswandi, Achmad Baihaki E20A.236 METODE PEMULIAAN TANAMAN KHUSUS (2 (2-0)
Specific Methods in Plant Breeding
Pemanfaatan proses teknologi kultur jaringan terkait dengan ekspresi gen dan pemanfaatannya untuk pemuliaan tanaman molekuler. Proses embriogenesis berbasis jaringan somatik dan jaringan non somatik proses memperoleh mutan dengan atau tanpa mutagen. Hibridisasi interspesies dan intra spesies (konsep, penerapan, prospek dan kendalanya).
Neni Rostini, Warid Ali Qosim, Suseno Amien, Nani Hermiati E20A.237 PEMULIAAN CEKAMAN BIOTIK DAN ABIOTIK
Breeding for Biotic and Abiotic Stress
Cekaman lingkungan dan pengaruhnya pada produksi tanaman, Prinsip-prinsip umum pemuliaan cekaman lingkungan, Prinsip umum dalam metode screening untuk pemuliaan cekaman, Pemanfaatan rekayasa genetik dan biologi molekuler untuk pengembangan tanaman toleran cekaman lingkungan, Mapping genom dan implikasinya bagi peningkatan toleransi tanaman untuk cekaman kekeringan, Pemuliaan untuk ketahanan hama dan penyakit, salinity, kekeringan, tahan genangan, logam berat dan kandungan rendah nutrisi, Tinjauan kasus pemuliaan cekaman berdasarkan komoditas tanaman
Anas, Dedi Ruswandi, Ridwan Setiamihardja
E20A.143 BIOETIKA DAN KEAMANAN HAYATI 2 (2-0)
Biosafety and Bioethics
Definisi bioetika dan biosafety. Isu-isu bioetika dalam aplikasi bioteknologi pertanian atau tanaman. Aspek legal materi genetik. Manajemen resiko tanaman transgenik. Tingkatan biosafety untuk lab. Pengujian biosafety tanaman transgenik: kesepadanan, lingkungan, pangan, pakan dan kesehatan manusia. Future direction tanaman transgenik Nono
Carsono, Noladhi Wicaksana
E20A.144 PEMULIAAN TANAMAN HORTIKULTURA 2 (2-0)
Breeding for Horticulture
Pemuliaan pada tanaman hortikultura buah, sayuran, tanaman hias yang terutama disesuaikan dengan komoditas untuk bahan penelitian. Pemuliaan diarahkan bagaimana merakit varietas unggul.
Murdaningsih Haeruman Karmana, Neni Rostini, Ridwan Setiamihardja
E20A.241 TEKNOLOGI MARKER 2 (2-0)
Marker Technology
Pendahuluan: perkembangan marka molekuler; tipe dan fungsi marka molekuler: PCR based marker, hybridization based marker, dan sequencing based marker; desain dan pengujian marker; aplikasi marka molekuler;
E20A.242 TRANSFORMASI DAN EKSPRESI GEN 2 (2-0)
Gene Transformation and Expressions
Dasar genetika molekuler: dasar molekuler untuk pertumbuhan dan perkembangan tanaman, sistem kendali/cell signaling, dan ketahanan terhadap penyakit. Prinsip dasar isolasi gen dan kloning. Transformasi genetik secara mendalam untuk partikel bombardment dan dengan transformasi dimediasi Agrobacterium tumifaciens. Regulasi dan ekspresi gen: dasar dan aplikasi untuk perakitan tanaman transgenik.
Nono Carsono, Noladhi Wicaksana
E20A.234 ANALISIS GENOM DAN SITOGENETIKA 2 (2-0)
Genome Analysis and Cytogenetics
Pendahuluan (keterkaitan Studi Analisis Genom dan Siogenetika dengan pemuliaan tanaman, Sitogenetika molekuler (penggunaan penanda molekuler), Sel dan Organel (review), Metode Analisis Genom dan Sitogenetika serta Analisis Ekspresi Gen (Euchromatin, heterochromatin dan korelasinya dengan chromosome banding, Chromosome dissection, FISH, GIS) DNA Metilasi dan Imprinting, Studi kasus pada pemuliaan tanaman
Suseno Amien, Noladhi Wicaksana
E20A.239 PEMULIAAN TANAMAN TAHUNAN 2 (2-0)
Breeding for Perennial Crops
Pendahuluan: kondisi pemuliaan tanaman tahunan saat ini, latar belakang gentik tanaman tahunan, kendala dan peluang; Peningkatan keragaman genetik: kendala persilangan, mutasi, poliploidi, apomiksis, persilangan interspesifik; Seleksi: model seleksi klonal, identifikasi marka, re-current selection; Pemuliaan komoditas: tebu, pisang, manggis, teh, kelapa sawit, mangga
Meddy Rachmadi, Warid Ali Qosim, Achmad Baihaki
E20A.238 PEMULIAAN FITOFARMAKA DAN ATSIRI 2 (2-0)
Breeding for Medicinal and Aetheric Oil Plants
Pendahuluan, keanekaragaman hayati tanaman fitofarmaka dan atsiri, konservasi plasma nutfah, metode pemuliaan, metode perbanyakan dan produksi bahan aktif, prospek dan peraturan terkait Fitofarmaka dan Atsiri