BAB V KESIMPULAN DAN SARAN
5.2. Saran
1. Penelitian selanjutnya dapat melakukan uji sensitivitas DNA babi dengan konsentrasi yang lebih kecil dari konsentrasi yang telah kami lakukan. 2. Penelitian selanjutnya melakukan identifikasi kandungan babi dengan
sampel yang berbeda misalnya: kosmetik, kapsul, kecap, dan sediaan lainnya.
41
DAFTAR PUSTAKA
1. Yuwono, D. B., Kepedulian Muslim Perkotaan terhadap Kehalalan Makanan Produk Pengusaha Mikro Kecil (Kasus pada Masyarakat Muslim Minoritas di Kota Kupang, NTT). Center for Research and Publication LP2M UIN
Sunan Kalijaga Yogyakarta. 2017; 1: p 111–37.
2. Irawati, D. 2009. Dendeng Sapi Dicampur Daging Babi di Malang, http://regional.kompas.com/read/2009/04/06/1722499/Dendeng.Sapi.Dica mpur.Daging.Babi.di.Malang, diakses tanggal 16 maret 2017, pukul 17.03. 3. Fibriana, F., Widianti, T., Retnoningsih, A., Susanti. Deteksi daging babi
pada produk bakso di pusat kota Salatiga menggunakan teknik polymerase chain reaction. Biosantifika. 2012; 4(2): p 106-12.
4. Alaraidh, I.A., Improved DNA Extraction Method for Porcine Contaminants, Detection in Imported Meat to The Saudi Market. Saudi J
Biol Sci. 2008;15(152): p 225–9.
5. Marseli, C., Identifikasi kandungan daging babi pada beef burger menggunakan metode Polymerase Chain Reaction-Spesific Primers gen 12s rRNA babi. Skripsi. Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Universitas Islam Indonesia. 2016; p 2.
6. Chen, S.Y., Liu, Y.P., Yao, Y.G. Species authentication of commercial beef jerky based on PCR-RFLP analysis of the mitochondrial 12S rRNA gene. J
Genet Genomics. 2010;37(11): p 763–9.
7. Tanabe, S., Hase M., Yano, T., Sato M., Fujimura, T., Akiyama, H. A Real-Time Quantitative PCR Detection Method for Pork, Chicken, Beef, Mutton, and Horseflesh in Foods. Biosci Biotechnol Biochem. 2007;71(12): p 3131-5.
8. Broeders, S., Huber, I., Grohmann, L., Berben, G., Taverniers, I., Mazzara M., et al. Guidelines for validation of qualitative real-time PCR methods.
Trends Food Sci Technol. 2014;37(2): p 115–126.
9. Burns, M.J., Nixon, G.J., Foy, C.A., Harris, N. Standardisation of data from real-time quantitative PCR methods-Evaluation of outliers and comparison of calibration curves. BMC Biotechnol. 2005;5: p 1–13.
10. Wikipedia. Daging. diambil dari: https://id.wikipedia.org/wiki/Daging. diakses pada tanggal 17 April 2018 pukul 11.30.
11. Kamus Besar Bahasa Indonesia. Hamburger. diambil dari: https://kbbi.kemdikbud.go.id/entri/hamburger. diakses pada tanggal 17 April 2018 pukul 11.40.
12. Zulfahmi Z. Deteksi kontaminan babi pada makanan menggunakan teknologi DNA molekuler. J Penelit Sosial Keagamaan. 2015; 18(1): p 1-6. 13. Faatih, M. Isolasi dan digesti DNA kromosom. J Penelit Sains dan Teknol.
2009;20(1): p 61–7.
14. Rosana, D. Struktur dan Fungsi DNA dan RNA. Modul 3 Biofisika. 2012; p 7.
15. Gandjar, I. G. Kimia Farmasi Analisis. Pustaka pelajar UGM. Yogyakarta. 2007; p 235-6.
42
16. Morihito, R. V. S. A., Chungdinata, S. E., Nazareth, T.A., Pulukadang, M.I., Makalew, R. A. M., Pinontoan, B., et al. Identification of Changes of Dna Structures on Cancer Cell Form Using Graph Decomposition. Jurnal Ilmiah
Sains. 2017; 17(2): p 154.
17. Guyton, A. C., Hall, J. E. Buku Ajar Fisiologi Kedokteran Edisi 11. Penerbit Buku Kedokteran. EGC. Jakarta. 2008: p 36.
18. Sherwood, L. Fisiologi Manusia dari Sel Kesistem Edisi 2. Penerbit Buku Kedokteran. EGC. Jakarta. 2001: p 47.
19. Gaffar, S. Bioteknologi Molekul. Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Padjadjaran. Bandung. 2007; p 65–66. Available from: http://repository.unpad.ac.id/2163/
20. Murtiyaningsih, P. Isolasi DNA genom dan identifikasi kekerabatan genetik nanas menggunakan RAPD (Random Amplified Polimorfic DNA). Jurnal
Unmuh Jember. 2017;15(1): p 82-94.
21. Mulyani, Y., Purwanto, A., Nuruhwati, I. Perbandingan Beberapa Metode Isolasi DNA Untuk Deteksi Dini Koi Herpes Virus (KHV) Pada Ikan Mas (Cyprinus carpio L.). Univ Padjajaran. 2011; 2, No. 1: p 1–16.
22. Farida, Y. Metode sidik jari DNA dengan REP -PCR. Prosiding Seminar
Nasional Penelitian. Fakultas MIPA Universitas Negeri Yogyakarta.
2009;(2): p 273–9.
23. Joko, T., Kosumandari, N., Hartono, S. Optimization of PCR method for the detection of Pectobacterium carotovorum, a causal agent of soft-rot disease on orchid. J Perlindungan Tanam Indones. 2011;17(2): p 54–9.
24. Budiarto, B. R. Polymerase Chain Reaction (PCR) : Perkembangan Dan Perannya Dalam Diagnostik Kesehatan. Polym Chain React Perkemb Dan
Perannya Dalam Diagnostik Kesehat. 2015;6(2): p 29–38.
25. Hewajuli, D.A., Nlpi, D. Perkembangan Teknologi Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction dalam Mengidentifikasi Genom Avian Influenza dan Newcastle Diseases. Wartazoa. 2014;24(1): p 16–29.
26. NCBI. Tahapan PCR. diambil dari: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/probe/docs/techpcr/. diakses pada tanggal 18 April 2018 pukul 10.00.
27. Thau, W., Yong, L., Jole, S.E., Rodrigues, K.F., Gansau, J.A. Quantitative Real-Time PCR for Determination of Transgene in Callus of Jatropha curcas. Annu Res Rev Biol. 2014;4(6): p 874–85.
28. Ramakers, C., Ruijter, J.M., Lekanne, D. R. H., Moorman, A. F. M. Assumption-free analysis of quantitative real-time polymerase chain reaction (PCR) data. Neurosci Lett. 2003;339(1): p 62–6.
29. Kesmen, Z., Gulluce, A., Sahin, F., Yetim, H. Identification of meat species by TaqMan-based real-time PCR assay. Meat Sci. 2009;82(4):444–9.
30. Belgrader, P., Elkin, C. J., Brown, S.B., Nasarabadi, S.N., Langlois, R.G., Milanovich, F.P., et al. A reusable flow-through polymerase chain reaction instrument for the continuous monitoring of infectious biological agents.
Anal Chem. 2003;75(14): p 3446–50.
31. Maryam, S., Sismindari, S., Raharjo, T.J., Sudjadi, Rohman, A. Determination of Porcine Contamination in Laboratory Prepared dendeng
43
Using Mitochondrial D-Loop686 and cyt b Gene Primers by Real Time Polymerase Chain Reaction. Int J Food Prop. 2016;19(1): p 187–95. Available from: http://dx.doi.org/10.1080/10942912.2015.1020434
32. Helmi, T.Z., Widayanti, R., Hariyanto, A. Penentuan subtipe virus avian influenza dengan metode single step multiplex reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) isolat asal provinsi Aceh. J Kedokt
Hewan. 2014;8(1): p 72-5.
33. Husni, P., Putriana, N.A., Wicaksono, I. A. Metode Deteksi Kandungan Babi dan Alkohol dalam Eksipien Farmasi dan Produk Obat untuk Menjamin Kehalalan Sediaan Obat. Maj Farmasetika. 2017;2(1): p 1–7. 34. Nihayati, K., Khoiriyah, R. A. Deteksi fragmen DNA rendah pengkode gen
sitokrom B (cyt b) babi pada sampel mie instan menggunakan metode polymerase chain reaction (PCR). Biotropic. 2017;1(1): p 17-22.
35. Kit GDNA. TIANamp Genomic DNA Kit Handbook. Tiangen Biotech Co., Ltd. Beijing, China. 6hlm.
36. Tim Penyusun Dosen. Buku Petunjuk Praktikum Biologi Molekuler. Universitas Islam Indonesia. Yogyakarta. 2016; p 36-37.
37. Bio-Rad. EvaGreen qPCR Master Mix Universal. Applied Biological Materials Inc. United States; p 1-2.
38. Ilhak, O. I., Arslan, A. Identification of meat species by Polymerase Chain Reaction (PCR) technique. Turkish J Vet Anim Sci. 2007;31(3): p 159–63. 39. Suciati, Y., Prijanti, A.R., Sadikin, M. Pola mRNA Hypoxia Inducible
Factor-1α (HIF-1α) dan Exkspresi Protein HIF-1α Ginjal Tikus pada Hipoksia Sistemik Kronik. J Kedokt Yars. 2012;20(1): p 1–13.
40. Putri, A. A., Identifikasi kandungan daging babi pada bakso menggunakan metode Real-Time Polymerase Chain Reaction. Skripsi. Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Universitas Islam Indonesia. 2018; p 34. 41. Eyigor, A., Carli, K.T. Rapid detection of Salmonella from poultry by real-time polymerase chain reaction with fluorescent hybridization probes. Avian
44
LAMPIRAN
Hasil elektroforesis Isolasi DNA
1. Elektroforesis isolasi DNA daging menggunakan Tiangen kit.
2. Elektroforesis isolasi DNA sampel beef burger secara konvensional.
Ladder Babi Sapi Ayam
Ladder
45
Perhitungan dari hasil kuantifikasi DNA dengan spektrofotometer.
Rasio perbandingan absorbansi λ 260nm : λ 280nm=
Aλ260 Aλ280 - Daging babi = 0,168 0,115=1,68 - Daging sapi = 0,166 0,099=1,46 - Daging ayam = 0,170 0,118=1,44 - Sampel 1 = 0,190 0,129=1,47 - Sampel 2 = 0,184 0,120=1,53 - Sampel 3 = 0,183 0,117=1,56
Pada λ260 nm, optical density (OD260) sama dengan 1, maka konsentrasi molekul DNA setara 50 ug/ml.
Konsentrasi DNA (µg ml ⁄ )=
OD260 × 100(faktor pengenceran) × 50 µg ml⁄ - Daging babi = 0,166 × 100 × 50 = 830µg ml ⁄ - Daging sapi = 0,168 × 100 × 50 = 840µg ml ⁄ - Daging ayam = 0,170 × 100 × 50 = 850µg ml ⁄ - Sampel 1 = 0,190 × 100 × 50 = 950µg ml ⁄ - Sampel 2 = 0,184 × 100 × 50 = 920µg ml ⁄ - Sampel 3 = 0,183 × 100 × 50 = 900µg ml ⁄
46