Produksi Antiserum Virus Bantut Kedelai Melalui Teknik
Ekspresi Gen Protein Selubung Pada Bakteri Untuk Tujuan
Deteksi Serologi
Hibah Bersaing
Dr. Ir. Suryo Wiyono, MSc.Agr
Dr. Ir. Tri Asmira Damayanti, M.Agr
¾
Kedelai : tanaman pangan penting
¾
Produksi belum mencukupi kebutuhan
¾
Masalah hama & penyakit
¾
Virus bantut –
Soybean Stunt Virus
(SSV) =
Cucumber mosaic
virus
strain SS: seed-borne, menurunkan produksi 41-71%
¾
Pentingnya antiserum dalam deteksi patogen terbawa benih
¾
Mosaik
¾
Malformasi daun
1. Deteksi dan Kajian keragaman genetik CMV-SS isolat I ndonesia
Survei
Deteksi Sampel
Perbanyakan Virus
Ekstraksi Asam Nukleat
RT-PCR
Visualisasi
Perunutan DNA
I nsersi site enzim restriksi
(
in vitro mutagenesis
)
Survei di KP Balitbiogen, Bogor
Survei di Magelang,
Jaw a Tengah
Survei di Jember, Jaw a Timur
Survei di kebun Balitkabi Malang, Jaw a Timur
+
BD
-Jawa Barat
- Bogor
- Plumbon
Jawa Tengah*
- Tegal
- Brebes
- Magelang
- Kebumen
Jawa Timur*
- Malang
- Ponorogo
- Jember
Deteksi Serologi
Lokasi
BD : belum dilakukan
3a
CP
3’
5’
F
R
Skematik RNA 3 CMV ( 2.1 kb)
500 bp
L100 CMV-SS
~ 383 bp
Primer: universal untuk CMV
subgroup I B
CMV SS
terdeteksi
dari sampel
3a
CP
3’
5’
F
R
Full- length Gen Protein Selubung CMV SS ( ~ 657 bp)
L 1kb CMV SS
( - )
ATGGACAAATCTGAATCAACCAGTGCCGGTCGTAgCCGTCGACGTCGTCCGCGTCGCGGTTCCCGCTCCGCTCCCTCC TCCGCGGATGCTAACATTAGAGGTCTGTCGCAGCAACTTTCGCGGCTTAACAAGACGTTAGCAGCTGGTCGTCCTACTC TTAACCACCCAACCTTTGTGGGGAGTGAACGTTGTAAACCTGGGTACACGTTCACATCTATTACCCTGAAGCCGCCGAA AATAGACCGTGGGTCTTATTATGGCAAAAGGTTGTTGCTACCTGATTCAGTCACGGATTTCGATAAGAAACTTGTTTCGC GCATTCAAATTCGCGTTAATCCGCTGCCGAAATTTGATTCTACCGTGTGGTTGACAGTCCGTAAAGTTCCTGCCTCTGCG GACTTATCCGTTGCCGCCATTTCCACTATGTTTTCGGACGGAGAATCGCCGGTACTGGTTTATCAGTATGCTGCGTCCGG GATCCAAGCTAACAATAAATTATTGTATGATCTTTCGCCGATGCGCGCTGATATAGGCGACATGAAGAAGTATGCCGTCC TCGTATATTCAAAGGACGATGTGCTCGAGATGGACGAGCTGGTGATTCATGTCGACATTGAGCACCAACGTATTCCCACA TCTGGAGTGCTCCCAGTTTGA
650 bp
¾
Survei & pengambilan sampel di Plumbon, Cirebon serta
Jawa Tengah & Jawa Timur (tergantung sisa budget)
¾
Deteksi, perunutan DNA gen CP isolat asal lokasi lainnya
¾
Analisis keragaman genetik gen CP CMV SS isolat I ndonesia
