v
DAFTAR ISI
Prakata ... iii
Daftar Isi ... v
Daftar Tabel ... vi
Daftar Gambar ... vii
Daftar Lampiran ... viii
Daftar Satuan dan Singkatan ... ix
Ringkasan ... 1
Summary ... 2
I. Pendahuluan ... 3
II. Metode Penelitian ... 5
III. Hasil ... 9
IV. Pembahasan dan Kesimpulan ... 13
Daftar Referensi ... 21
vi
DAFTAR TABEL
Tabel 3.2 Hasil Uji Sensitivitas Antibiotik Eritromisin ... 10 Tabel 3.3 Nilai Rerata Kuantifikasi DNA Hasil Ekstraksi ... 11 Tabel 3.4 Jumlah dan Persentase Hasil Deteksi Generm(B) danmef(A)... 12 Tabel 4.1 Proporsi Jumlah IsolatS. pneumoniaeResisten Terhadap Eritromisin yang
Membawa Generm(B) danmef(A) Berdasarkan Sumber Isolat, Diadaptasi Dari Penelitian Farrell et.al (2005) ... 19 Tabel 4.2 Hasil MLST (multilocus sequence typing) pada Beberapa Negara di Asia,
vii
DAFTAR GAMBAR
Gambar 3.1 Morfologi KoloniS. pneumoniaepada Agar Darah Domba 5% +
Gentamisin ... 9 Gambar 3.2 IsolatS. pneumoniaeresisten terhadap eritromisin pada agar
Mueller-Hinton+ Darah domba 5% ... 10 Gambar 3.3 Visualisasi Amplifikasi genmef(A)(348 bp) danerm(B) (639 bp)
a. genmef(A)danerm(B) (1. PU-053; 3.ISID 16; 4. ISID 12), b. generm(B) (5. ISID 104; 6. ISID 110)
c. genmef(A)(2. PI-150; 7. MA-088; 8. MA-089; 9. MA-145; 10. UB-075) ..12 Gambar 3.4. Grafik Persentase Hasil Deteksi Genmef(A) danerm(B) Pada 56 Isolat
viii
DAFTAR LAMPIRAN
Lampiran 1. Diagram Alir Penelitian ... 24
Lampiran 2. Spesifikasi Alat dan Bahan ... 25
Lampiran 3. Komposisi Agar Darah Domba5%+ Gentamisin ... 28
Lampiran 4. Komposisi Media STGG... 29
Lampiran 5. KomposisiMediaAgarMueller- Hinton +darah domba5%... 30
Lampiran 6. KomposisiGo Taq Green2x ... 31
Lampiran 7. PCR Mix dan Kondisi untukDuplexPCR... 32
Lampiran 8. PCR Mix dan Kondisi untukSingleplexPCRmef(A)... 33
Lampiran 9. PCR Mix dan Kondisi untukSingleplexPCRerm(B)... 34
Lampiran 10. HasilDuplex&SingleplexPCRerm(B) danmef(A)... 35
Lampiran 11. Hasil Uji Sensitivitas Antibiotik Eritromisin ... 37
Lampiran 12. Kuantifikasi DNA Hasil Ekstraksi... 39
ix
DAFTAR SATUAN DAN SINGKATAN
Simbol satuan Satuan Keterangan (besaran pokok)
C Celcius Suhu
G Gravitasi Percepatan rata-rata gravitasi bumi
µl Mikroliter Volume (10-6l)
Ml Mililiter Volume (10-3l)
pH Tingkat ion H+terlarut Derajat Keasaman
µM Mikromolar Volume (106mol/l)
Simbol Arti
% Persen (per seratus)
o
Derajat
µ Mikro (seper sejuta)
Singkatan Arti
ATCC American Type Culture Collection
CLSI Clinical and Laboratory Standards Institute ddH2O Double destillation water
DNA Asam deoksiribonukleat (deoxyribonucleic acid)
dNTP Deoxy Nucleotide Phospate
MIC Minimum Inhibitory Concentration
PCR Polymerase Chain Reaction
RNA Asam Ribonukleat (ribonucleic acid)
rRNA Asam Ribonukleat ribosomal (ribosomal ribonucleic acid)
STGG Skim-Milk Tryptone Glucose Glycerol
TBE Tris-base, Boric-acid,EDTA
TE Tris, EDTA
