Daftar Isi Kata Pengantar
Chapter 1 Ebola di Afrika Chapter 2 Ciri-ciri Virus Ebola Chapter 3 Ekologi Virus
Chapter 4 Metode Deteksi dan Pengobatan Chapter 5 Mengembangkan Vaksin
Chapter 6 Lain-lain Tentang Demam Berdarah Glosarium
Daftar Pustaka
Buku-buku literatur terkait Virus Ebola
Kata Pengantar
Selama musim semi dan musim panas 2014, orang di seluruh dunia telah menyaksikan dengan penuh perhatian, penuh daya tarikt, simpati, dan tidak sedikit ketakutan pribadi terhadap wabah Penyakit virus Ebola yang telah membuka dan tersebar diantara tiga negara yaitu Afrika Barat (Guinea), Liberia, Sierra Leone- dan kemudian pindah melalui pesawat udara, Nigeria. Selama berbulan-bulan, wabah ini membunuh korban dengan jumlah puluhan, itu pada bulan Agustus tahun 2014 dan mulai menimbulkan kematian, minggu demi minggu hingga jumlahnya mencapai ratusan. Pada saat itu telah menjadi wabah Ebola terburuk dalam sejarah ini, ini merupakan penyakit membingungkan. Kisah wabah pada tahun 2014 itu begitu mengerikan. Peristiwa kontemporer itu terjadi di Suriah, Ukraina, dan Jalur Gaza. Namun wabah Ebola sangat berbeda dengan realitas perang dan politik yang mengerikan. Virus Ebola tidak terlihat, kecuali melalui mikroskop elektron atau dengan cara efek patogenik. Sekarang mulai impersonal. Hal ini besifat apolitis. Tampaknya ini sangat membunuh seperti wabah yang ditimbulkan oleh malaikat kematian. Kesan terakhir ini menyesatkan. Ebola adalah malaikat maut; itu membingungkan tapi tidak supranatural. Ini hanya Virus, meskipun virus tetap saja bersifat destruktif ketika masuk ke tubuh manusia. Setiap penyakit baru mulai muncul termasuk Ebola, dimulai sebagai cerita misteri. Misteri itu membuat pertanyaan Apa yang menyebabkan tiba-tiba mengakibatkan penderitaan dan kematian?
Jika itu virus, apa jenis virus itu? Apakah ada bidang ilmu yang pernah meneliti hal seperti itu? Dari mana virus datang? Virus harus tinggal di dalam tubuh makhluk hidup, dalam rangka untuk meniru dan bertahan dari waktu ke waktu,. Dan bagaimana bisa pindah dari makhluk lain ke manusia? Dapatkah virus baru ini dikendalikan? Apakah bisa diobati dengan terapi farmasi atau vaksin? Apakah bisa dihentikan? Atau wabah ini akan menjadi Next Big One, bencana pandemi, ditakdirkan untuk menyapu seluruh dunia dan membunuh beberapa fraksi yang cukup besar dari populasi manusia, seperti pada abad keempat belas yakni virus influenza pada tahun 1918? Ilmuwan ahli penyakit dan kesehatan masyarakat, bernama Sam Spades dan Philip Marlowes dan Detektif Kepala Inspektur Jane Tennisons, yang mengumpulkan misteri-misteri tersebut. Dalam kasus Ebola, mereka telah memecahkan beberapa saja tapi tidak semua. Ebola sebagian besar telah menyebabkan penderitaan di Afrika (sejauh ini), dan meskipun unik tapi tidak
anomali. Itu hanya merupakan dramatis versi fenomena global. Segala sesuatu berasal dari suatu tempat, dan penyakit menular yang baru ini aneh, muncul tiba-tiba diantara manusia, datang sebagian besar dari hewan bukan manusia. Penyakit ini mungkin disebabkan oleh virus, atau bakteri, protozoa, atau beberapa bentuk mahluk berbahaya lainnya. Mahluk yang mungkin hidup menarik perhatian semacam tikus, atau kelelawar, atau burung, atau monyet, atau kera. Ada kata indah untuk fenomena ini, yang digunakan oleh ilmuwan yang mempelajari penyakit menular dari perspektif ekologi: zoonosis.
Itu istilah yang agak teknis, asing bagi kebanyakan orang, tetapi membantu mengklarifikasi kompleksitas biologis flu babi, flu burung, SARS, demam West Nile, penyakit yang muncul secara umum, dan ancaman global pandemi. Ini membantu kita memahami mengapa ilmu kedokteran dan kampanye kesehatan masyarakat telah mampu untuk menaklukkan beberapa penyakit menakutkan, seperti cacar dan polio, tetapi tidak mampu menaklukkan orang lain, seperti demam berdarah dan demam kuning. Itu adalah sebuah kata masa depan, ditakdirkan dalam abad ke dua puluh satu. Zoonosis adalah binatang Infeksi yang menular terhadap manusia. Pes adalah zoonosis. Semua virus influenza itu zoonosis. Jadi, apakah monkeypox, tuberkulosis, penyakit Lyme, Marburg, rabies, dan anehnya penderitaan itu disebut Nipah, yang telah menewaskan babi dan peternak babi di Malaysia, serta orang-orang yang minum nira (kadang-kadang terkontaminasi oleh virus dari kotoran kelelawar) yang terdapat di Bangladesh.
Masing-masing dari mereka mencerminkan aksi patogen yang dapat menyeberang terhadap orang-orang dari spesies lain. Bentuk lompatan antarspesies adalah umum, tidak jarang; sekitar 60 persen bahwa semua penyakit menular saat ini dikenal baik atau baru-baru ini menyeberangi diantara hewan lain dan juga manusia. Beberapa dari mereka terutama rabies adalah yang akrab, luas, dan masih bersifat mematikan, membunuh manusia dengan jumlah ribuan meskipun berabad-abad telah dicari upaya mengatasi efeknya, bahkan upaya internasional untuk memberantas atau mengendalikan virus-virus itu, dan cukup jelas pemahaman tilmiah entang bagaimana mereka bekerja. Sekarang disebabkan oleh virus variola, yang berada di bawah kondisi alam dan hanya menginfeksi manusia.
Yang bisa membantu menjelaskan mengapa kampanye global diadakan oleh Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) untuk memberantas cacar pada tahun 1980 itu
berhasil. Cacar bisa diberantas karena virus itu tidak memiliki kemampuan untuk tinggal dan berkembang biak di mana saja tetapi hanya dalam tubuh manusia saja (atau hewan).
Itu lah yang membuat mereka begitu menarik, sehingga rumit, dan bermasalah. Ini patogen yang tinggal di mana mereka melakukan dan mengirimkan seperti bertahan hidup dan reproduksi. Oleh Logika yang disampaikan Darwin berdasarkan seleksi alam, mengkodingkan evolusi ke dalam strategi. Strategi mencolok adalah untuk mengintai apa yang disebut Tuan rumah waduk. Sebuah host waduk adalah spesies yang membawa patogen, sementara penderitaan itu sedikit atau tidak ada penyakit sama sekali. Ketika penyakit tampaknya menghilang diantara wabah, agen penyebabnya harus menjadi tempat, ya? Yah, mungkin itu lenyap seluruhnya dari planet Bumi tapi mungkin tidak.
Mungkin itu meninggal di seluruh wilayah dan hanya akan muncul kembali ketika angin dan nasib membawanya kembali dari tempat lain. Atau mungkin itu masih melekat di dekatnya, di sekitarnya, dalam beberapa waduk tuan rumah. Seekor tikus? Seekor burung?
Seekor kupu-kupu? Kelelawar? berada dan terdeteksi dalam host reservoir yang mungkin paling mudah di mana pun biologis keanekaragaman tinggi dan ekosistem itu relatif tidak terganggu. Kebalikannya adalah juga benar: gangguan ekologis menyebabkan penyakit mulai muncul. Menangkap kelelawar untuk makanan, dan Anda mungkin menangkap sesuatu yang lain juga. Membantai seekor simpanse, untuk memberi makan keluarga Anda atau desa, dan siapa tahu terdapat kejutan mengerikan yang mungkin muncul. Itu cara transmisi, ketika patogen berpindah dari satu jenis host ke host yang lain, disebut spillover. Sekarang Anda dilengkapi dengan konsep dasar. Berikut adalah titik awal nya:
Ebola adalah zoonosis.
Pada tahun 1960, banyak penyakit menular yang telah meneror saat itu. Setelah satu abad kemudian, orang Amerika baik tua maupun muda sedang dicegah dengan vaksin baru atau disembuhkan dengan obat-obatan baru. Risiko kematian akibat pneumonia, tuberkulosis (TB), meningitis, influenza, rejan batuk, dan difteri menurun secara dramatis.
Vaksin baru pada musim panas seperti penyakit polio, dan terjadi kampanye global dalam pemberantasan cacar di seluruh dunia. Pestisida baru seperti DDT berfungsi untuk memberantas nyamuk untuk di rumah dan ladang, sehingga mengurangi wabah malaria, yang muncul di Amerika Selatan dan wabah ini menimbulkan penyakit yang bisa membunuh terutama bagi anak-anak di seluruh dunia.
Namun euforia tahun 1960-an telah menguap. Mikroba pun mulai melawan. Mikroba yang menyebabkan penyakit seperti TB dan malaria berkembang secara resistensi terhadap obat murah dan efektif. Penyakit baru pun mulai muncul, termasuk AIDS, legiuner, dan penyakit Lyme. Dan penyakit yang tidak pernah terlihat dalam beberapa dekade kembali muncul, seperti hantavirus yang terdapat di Navajo pada tahun 1993.
Teknologi itu sendiri benar-benar menciptakan risiko kesehatan yang baru. Misalnya penyakit seperti virus West Nile bisa menyebar di luar daerah terisolasi dan menjadi ancaman global. Bahkan perlindungan kesehatan masyarakat modern yang terkadang gagal, seperti yang mereka lakukan pada tahun 1993 di Milwaukee, Wisconsin, mengakibatkan 400.000 kasus penyakit cryptosporidiosis pada sistem pencernaan. Dan baru-baru ini, ancaman penyakit cacar, penyakit yang diyakini harus benar-benar diberantas, telah kembali muncul bersamaan juga adanya potensi senjata bioteror seperti anthrax.
Pelajaran yang bisa diambil adalah bahwa memerangi penyakit menular itu tidak akan pernah berakhir. Dalam perjuangannya terus-menerus melawan penyakit, kita sebagai individu memiliki senjata yang tidak memerlukan vaksin atau obat-obatan, dan memiliki segudang ilmu pengetahuan. Kita belajar dari sejarah ilmu yang "modern".
Dalam serangkaian buku ilmu pengetahuan misalnya, Anda akan belajar bahwa penyakit seperti sifilis pernah dianggap penyebabnya adalah karena makan kentang. Penemuan mikroskop mengatur ilmu di bidang sains dan teknologi. Ada pelajaran yang lebih positif dari sejarah.
Pada saat yang sama, terus ada saja penemuan obat baru, vaksin, dan informasi baru.
Baru-baru ini seluruh genom manusia sedang diterjemahkan. Begitu juga genom parasit yang menyebabkan malaria. Mungkin dengan melihat mikroba melalui lensa genetika kita akan dapat menemukan cara-cara baru untuk memerangi malaria, yang merupakan pembunuh utama bagi anak-anak di seluruh negara.
Karena kemajuan dalam pemahaman kita tentang penyakit seperti AIDS, seluruh obat anti retroviral telah mulai dikembangkan. Tapi resistensi terhadap semua obat ini sudah terdeteksi, sehingga kita tahu bahwa pengembangan obat AIDS harus terus diteliti lebih lanjut. Pendidikan, eksperimen, dan penemuan-penemuan yang tumbuh dari situ merupakan alat terbaik untuk menjaga kesehatan. Pembukaan buku ini dapat
menempatkan Anda pada jalan inovasi baru. Saya berharap seperti itu, karena vaksin baru, antibiotik baru, teknologi baru, dan yang paling penting para ilmuwan baru diperlukan sekarang ini jika kita ingin tetap memberantas mikroba yang mengancam kesehatan tubuh kita.
Depok, 5 Desember 2014
Tirta Angen Pangestu
Chapter 1 Ebola di Afrika
EPANJANG ALIRAN Sungai Ivindo arah timur laut Gabon, dekat perbatasan dengan Republik Kongo, terletak desa kecil bernama Mayibout 2, semacam penyelesaian satelit. Pada awal Februari 1996, Komunitas masyarakat sekunder di desa ini dilanda rantai peristiwa yang mengerikan dan membingungkan. Delapan belas orang di Mayibout 2 tiba-tiba sakit setelah mereka melakukan pembantaian dan makan daging simpanse. Gejala yang mereka timbulkan termasuk demam, sakit kepala, muntah, mata merah, pendarahan dari gusi, cegukan, nyeri otot, sakit tenggorokan, dan diare berdarah. Semua delapan belas orang itu dievakuasi ke rumah sakit di kabupaten ibukota, sebuah kota bernama Makokou. Itu berjarak kurang dari lima puluh mil dari Mayibout 2 sampai Makokou. Empat dari pengungsi yang hampir mati ketika mereka tiba dan mati dalam waktu dua hari. Empat mayat, kembali ke Mayibout 2, dikuburkan menurut praktek upacara tradisional mereka, dengan tidak ada tindakan pencegahan khusus terhadap transmisi apapun yang bisa membunuh mereka. Korban kelima melarikan diri dari rumah sakit, kembali ke desa, dan meninggal di sana. Kasus sekunder segera pecah di antara orang yang terinfeksi. Akhirnya tiga puluh satu orang jatuh sakit, di antaranya dua puluh satu meninggal: angka kematian hampir 68 persen. Fakta-fakta dan angka-angka yang dikumpulkan oleh tim medis peneliti, sebagian wilayah Gabon.
Diantara mereka adalah negarawan asal Prancis bernama Eric M.
Leroy, seorang ahli virus asal Paris yang terlatih dan seorang dokter hewan yang berbasis di Pusat International de Recherches Médicales de Franceville (CIRMF), di Franceville, sebuah kota sederhana di bagian tenggara Gabon. Leroy dan rekan-rekannya mengidentifikasi Penyakit demam berdarah Ebola (sebuah nama jenis sekarang ini digantikan oleh Penyakit virus Ebola) dan dideduksi bahwa simpanse yang disembelih itu sudah terinfeksi Ebola. "Simpanse tampaknya telah menjadi Indeks kasus karena telah menginfeksi 18 kasus manusia, "mereka menulisnya. Penyelidikan juga membuat fakta bahwa simpanse tidak terbunuh oleh seorang pemburu dari desa; itu telah ditemukan tewas di hutan.
Ini adalah salah satu bukti, bahwa simpanse dan gorila, seperti manusia, sangat rentan terhadap Ebola. Dan jika mereka mengalami penderitaan dan kematian yang cepat maka itu adalah akibat dari virus ini. Setelah tahun 1979 wabah yang terjadi di Sudan,
S
Ebola bersembunyi di Afrika. Seorang ahli di bidang Epidemiologi mencoba untuk menemukan tempat persembunyiannya, tetapi mereka tidak berhasil. Meskipun virus ini muncul di Amerika Serikat dia bersifat kurang mematikan, Ebola menghilang di Afrika selama 15 tahun, sebelum kembali seperti dulunya. Tanda pertama bahwa virus mematikan telah kembali terjadi di Pantai Gading di Afrika. Ini adalah pertama kalinya virus itu muncul di Afrika Barat. Pada November 1994, seorang peneliti sedang menyelidiki epidemi di kalangan simpanse di Hutan nasional tai. Epidemi telah membunuh setengah dari populasi simpanse dalam waktu dua tahun. Ilmuwan, yang baru saja melakukan nekropsi pada simpanse liar, mengalami jatuh sakit dengan demam tinggi, sakit kepala, menggigil, sakit perut, diare, dan muntah. Berpikir ia telah tertular malaria, ilmuwan itu diobati dengan halofantrine, obat anti-malaria. Gejala terus memburuk, dan ia diterbangkan kembali ke asalnya yakni negara Swiss pada hari ketujuh dari penyakit yang dideritanya. Dia diperlakukan di ruang isolasi rumah sakit. Dia tidak diuji untuk segala bentuk demam berdarah, karena dia tidak memiliki perdarahan yang jelas, dan Ebola belum ditemukan di Swiss.
Pada bulan Desember tahun itu, para ilmuwan mulai melakukan investigasi epidemiologi untuk menemukan penyebab kematian simpanse. Penyelidikan membantu untuk mengisolasi subtipe baru Ebola. Para ilmuwan kemudian meneliti si peneliti tersebut kehadiran antibodi terhadap virus Ebola, dan dia ditemukan positif. Ini menunjukkan bahwa ia telah sebelumnya terinfeksi dengan virus Ebola, meskipun itu tidak didiagnosis pada saat itu. Dia sembuh dari penyakitnya, dan tidak ada kasus sekunder. Ebola kembali, bagaimanapun, dan itu tidak hanya di Pantai Gading. Pada tahun yang sama, lebih dari 1.000 mil ke arah tenggara di Gabon, wabah lain terjadi, dan tampaknya dihubungkan ke kamp-kamp pertambangan emas. Sebenarnya ada dua gelombang dari epidemi. Wabah pertama dimulai pada bulan Desember 1994, dengan Gelombang kedua pasien pada bulan Januari dan Februari 1995. Total A dari 44 orang terinfeksi, dan 57% dari mereka meninggal. Situasi politik di Gabon pada saat itu tidak stabil karena kontroversial Pemilu penuh dengan penyimpangan; ini menyulitkan peneliti untuk mengumpulkan data dengan benar, tetapi mereka menerima laporan epidemi yang sama terjadi pada kera besar (simpanse dan gorila) di wilayah tersebut. Satu pasien melaporkan bahwa dia telah Baru-baru ini membunuh simpanse menunjukkan perilaku
abnormal. Meskipun epidemi tampaknya telah dimulai di pertambangan kamp, itu juga menyebar melalui dukun. Penyembuh ini menganjurkan sering menyentuh dan memegang korban, dan beberapa kasus, bahkan memotong kulit pasien dengan pisau yang tidak steril.
Selain itu, mereka menganjurkan praktik penguburan tradisional, yang termasuk lebih banyak kontak dengan mayat dan sering mencuci barang ritual mereka. Praktek ini berfungsi untuk meningkatkan risiko tertular virus Ebola karena virus baik pada kulit atau darah atau sekresi tubuh lainnya. Epidemi dinyatakan alih oleh Otoritas kesehatan Gabon pada pertengahan Februari 1995, setelah ada kasus baru telah dilaporkan selama beberapa minggu. Pada musim semi tahun 1996, wabah lain terjadi di Desa terpisah di Gabon, sekitar 25 km sebelah selatan dari aslinya Situs wabah tersebut. Delapan belas pasien menjadi sakit setelah menyembelih dan makan simpanse mati yang mereka telah temukan.
Hal ini tidak diketahui jika mereka memperoleh virus dengan memakan daging yang terkontaminasi, disengaja memotong selama proses pemotongan, atau paparan langsung dengan kulit. Enam kasus sekunder tambahan dan kasus tersier (infeksi akibat kontak dengan kasus sekunder) diidentifikasi. Ada Total enam kematian.
Sebuah wabah ketiga terjadi pada musim gugur tahun yang sama, lagi-lagi setelah simpanse epidemi dilaporkan di daerah. Kali ini, para korban semuanya terkait dengan penebangan. Epidemi ini berlangsung sampai Maret tahun 1997, sehingga dalam total 60 kasus dan 45 kematian. Urutan glikoprotein pada gen virus ini mengungkapkan bahwa setiap wabah ini adalah karena pengenalan independen virus ke dalam populasi manusia.
Dengan kata lain, setiap epidemi dianggap memisahkan, meskipun mereka semua terjadi dalam waktu yang relatif singkat. Seorang ilmuwan dan dokter memproses informasi dari infeksi yang terajdi Pantai Gading dan mencoba untuk membendung wabah di Gabon, Kikwit, di Republik Demokratik Kongo. Oleh penyidik saat diberitahu wabah yang terajdi di bulan Mei 1995, epidemi sudah setidaknya selama dua bulan. Wabah dijiplak kembali ke pekerja arang yang meninggal karena demam berdarah pada bulan Januari 1995 di Rumah Sakit Umum Kikwit. Ada tiga anggota keluarganya meninggal juga. Dari bulan Januari sampai Maret, terdapat tambahan sepuluh kasus fatal terjadi pada anggota keluarga besarnya. Dari sana, epidemi menyebar ke individu lain dalam desa yang berdekatan dan dalam pengaturan rumah sakit. Seperti telah menjadi kasus dengan 1.976
wabah Ebola di Republik Demokratik Kongo, transmisi nosokomial memainkan peran dalam epidemi. Beberapa pasien diyakini telah terjangkit Penyakit melalui kontak langsung dengan pasien yang terinfeksi selama operasi atau prosedur medis lainnya.
Kematian termasuk anggota Staf rumah sakit. Sebanyak 315 kasus demam berdarah Ebola yang diidentifikasi berdasarkan bukti serologis, isolasi virus, dan analisis kasus retrospektif. Ada 244 kematian, sehingga tingkat kematian menjadi 78%. Pasien diidentifikasi terakhir meninggal pada tanggal 16 Juli 1995, dan epidemi dinyatakan lebih lama setelah itu. Berikut penelitian telah menunjukkan bahwa kedua wabah Gabon dan wabah Kikwit di Republik Demokratik Kongo adalah karena virus Zaire yang mematikan dari Ebola.
Ebola menyerang lagi, pada Agustus 2000, kali ini di Uganda, di Afrika Tengah timur (Uganda berbatasan dengan Sudan dan DRC; Gambar 1.1). Pasien pertama meninggal di Gulu pada 17 September 2000. Meskipun penyelidikan yang dilakukan oleh dokter tidak dapat menentukan mana atau bagaimana ia bisa kontak dengan penyakit. Kematiannya diikuti oleh kematian suaminya, dua anak, dan beberapa anggota keluarga lainnya. Pihak berwenang melaporkan informasi ini kepada Kementerian Kesehatan pada bulan Oktober tahun itu, dekat puncak epidemi. Sebuah penyelidikan dan intervensi untuk mengendalikan penyakit ini diikuti, dan pejabat menyatakan epidemi akan berakhir pada bulan Januari 2001 (Gambar 1.2). Sebanyak 425 pasien dari tiga desa (Gulu, Masindi, dan Mbarara) di Uganda yang diidentifikasi berdasarkan gejala dan/atau data laboratorium. Pada tahun 1976 wabah Ebola di Sudan, tercatat ada 224 pasien meninggal, dengan kematian yang dihasilkan mencapai tingkat sebanyak 53%. Ini adalah pertama kalinya jenis wabah ini telah muncul sejak tahun 1979 di Sudan. Seorang ilmuwan berhipotesis bahwa pemberontak Sudan yang dilakukan cara Serangan teratur di sekitar Gulu mungkin tidak sengaja menimbulkan virus dalam beberapa cara, meskipun ini belum pernah dikonfirmasi.
Gambar 1.1: Seorang pekerja perawatan kesehatan memeriksa pasien yang diduga mengalmi infeksi Ebola di sebuah rumah sakit di dekat Gulu, Uganda, selama bulan Oktober 2000.
Sumber: WHO Statement on the Meeting of the International Health Regulations Emer-gency Committee Regarding the 2014 Ebola Outbreak in West Africa.
Pada bagian awal pada abad kedua puluh satu, pengakuan wabah Ebola dipercepat.
Wabah melewati perbatasan antara Republik Kongo dan Gabon terjadi pada tahun 2001-2002. Republik Kongo berbatasan dengan Republik Demokratik Kongo; maka sementara ini merupakan laporan pertama Ebola di Republik Kongo, filoviruses telah ditemukan sebelumnya di negara-negara terdekat (Ebola sebelumnya di DRC dan Gabon, serta Marburg di Angola). Wabah ini disebabkan oleh virus Zaire dari Ebola, dan menyebabkan 57 orang terserang penyakit serta kematian sebanyak 43 orang (sekitar 75% dari nilai kematian). Wabah tampaknya telah dimulai dalam satu keluarga, yang mengalami kematian akibat Ebola sebnayk 5 orang lebih dalam 3 minggu pada periode bulan Oktober 2001. Otoritas Internasional mulai menyelidiki pada bulan November, dan mengkonfirmasi terdapat infeksi Ebola. Wabah itu sulit untuk dikontrol karena terletak di desa terpencil, dan karena konflik yang sedang berlangsung di daerah bencana.
Menariknya, kedua desa dan satwa liar ahli biologi satwa liar melihat Kematian (kebanyakan primata non-manusia, termasuk simpanse dan gorila) pada saat yang sama dengan wabah manusia. Republik Kongo menderita wabah tambahan Ebola Zaire pada akhir tahun 2002, dimulai lagi pada bulan Desember dan berlangsung sampai Maret 2003.
Kasus-kasus indeks untuk wabah ini, yang menewaskan 128 orang (mortalitas sebesar 89%), ditemukan menjadi pemburu yang baru saja membunuh berbagai hewan, termasuk kijang dan gorila. Ebola kembali ke negara lagi pada November 2003, namun wabah ini lebih kecil dan lebih pendek hidupnya dibandingkan dengan dua sebelumnya. Tiga puluh lima orang yang terinfeksi, dari jumlah yang meninggal sebanyak 29 (sekitar 83% dari nilai kematian). Wabah kecil lainnya terjadi pada bulan April dan Mei 2005, menginfeksi 12 orang dan membunuh sebanyak 9 orang (mortalitas sebesar 75%), menurut data dari World Health Organization Surveillance pada tahun itu.
Ebola muncul kembali di Sudan pada Mei 2004 ketika 7 pasien didiagnosis dengan penyakit selama 3 minggu. Sekali lagi, kasus indeks dalam wabah ini dilaporkan memiliki ciri pada babon yang disembelih dan dimakan pada hari-hari sebelum onset penyakit; diduga bahwa ini adalah bagaimana ia terkena Ebola. Dalam wabah ini, menyebabkan 17 orang terkena penyakit dan kematian sebanyak 7 orang (mortalitas
sebesar 41%). Wabah cepat menyebar dan secara resmi dinyatakan selesai dalam bulan Juni 2004. Ternyata Ebola kembali pada tahun 2007, ketika Republik Demokratik Kongo lagi-lagi dipukul dengan wabah Ebola Zaire antara bulan September dan November.
Meskipun wabah singkat, tetap saja itu mematikan: sebanyak 264 orang terinfeksi dan 187 orang tewas (angka kematian mencapai 71%). Indeks kasus ditelusuri kembali ke pemakaman kepala suku desa, yang bisa saja terinfeksi dan menyebarkan infeksi melalui penguburan ritual. Ebola kembali ke daerah ini lagi pada tahun 2008, menginfeksi 21 orang dan menewaskan sedikitnya 9 orang (mortalitas sebesar 43%). Hal ini disebabkan sementara menutup perbatasan Angola dengan Republik Demokratik Kongo dalam rangka untuk mencegah penyakit tersebut.
Ebola kembali ke Uganda pada bulan Agustus 2007, menyebabkan 149 orang terkena penyakit dan kematian sebanyak 37 orang sampai wabah dinyatakan lebih bahaya pada bulan Februari 2008. Kematian ini (sebanyak 36%) secara signifikan lebih rendah daripada kebanyakan wabah Ebola. Oleh karena itu, para ilmuwan menentukan urutan molekul seluruh virus, dan menemukan bahwa itu adalah strain baru dari Ebola, yang mereka beri nama Ebola Bundibugyo. Akhirnya, Ebola Reston muncul untuk pertama kalinya dalam waktu 12 tahun di Filipina. Bagaimanapun, tidak seperti sebelumnya Ebola Reston, yang diakui dalam spesies primata non-manusia, virus ini pertama kali ditemukan dalam tes babi dari beberapa peternakan yang berbeda. Babi-babi telah sakit, dan sampel dari babi yang mati dikirim ke Amerika Serikat untuk menentukan apa penyebab penyakitnya. Diperkirakan bahwa babi mungkin tertular dari kelelawar yang terinfeksi.
Enam manusia terkena juga ditemukan positif antibodi terhadap Ebola Reston, termasuk petani babi dan daging, menunjukkan bahwa virus bisa ditransfer dari babi ke manusia (meskipun tidak ada diantara mereka yang melaporkan sakit itu, mirip dengan sebelumnya wabah Ebola Reston ini menular ke manusia dari hewan).
Gambar 1.2: Wabah Ebola di Uganda tahun 2000-2001. Epidemi memuncak pada pertengahan Oktober dan dinyatakan lebih meningkat pada akhir Januari 2001, dengan total 224 kasus.
Sumber: Gostin LD, Lucey D, Phelan A. The Ebola Epidemic – a global health emergency. JAMA 2014;
Published online August 11, 2014
1.1 Ebola mendekati rumah Anda
Pada musim gugur tahun 1989, pengiriman dari 100 monyet liar dari Filipina tiba di tempat Penelitian Produk Hazelton di Reston, Virginia. Spesies tertentu adalah jenis monyet, umumnya dikenal sebagai "kepiting pemakan monyet" (Gambar 1.3). Para ilmuwan membagi monyet di antara 12 kamar yang berbeda (yang ditunjuk A sampai L).
Pekerja di fasilitas memperhatikan bahwa dua monyet mengalmi kematian pada saat kedatangan. Pada saat itu, ini tidak dianggap sebagai suatu peristiwa yang tidak biasa, sebagian hewan kadang-kadang mati selama dalam perjalanan atau transportasi. Pada
tanggal 1 November 1989, terdapat dengan total 29 monyet telah meninggal. Sebagian besar kematian tersebut terjadi di ruang F. Nekropsi A dari dua monyet menunjukkan adanya pembesaran limpa, dan darah dalam usus mereka. Para ilmuwan awalnya menduga virus ini disebut demam berdarah simian. Virus menyebabkan perdarahan yang menyebabkan penyakit pada monyet (mirip dengan Ebola), tetapi tidak berbahaya bagi manusia. Para ahli mikrobiologi di Hazelton memutuskan untuk memanggil ilmuwan penting untuk menguji virus ini. Mereka meminta bantuan ahli virus di USAMRIID (U.S.
Army Medical Research Institute of Infectious Diseases) yang terletak di Fort Detrick, Maryland. Ilmuwan yang memiliki akses ke fasilitas yang bisa mengandung patogen berpotensi mematikan. Pada akhir November, para ilmuwan telah menggunakan sejumlah tes yang berbeda dan telah sampai pada suatu kesimpulan tentang diagnosis penyakit dari mana monyet itu menimbulkan penyakit. Itu Ebola. Strain baru bernama Ebola Reston, tempat di mana ia pertama kali diisolasi.
Pada awal Desember 1989, semua monyet di tempat Penelitian Produk Hazelton yang eutanasia (dibunuh), dan untuk sementara dievakuasi, dibersihkan dan didekontaminasi. Hebatnya, tidak ada manusia menjadi sakit. Gelombang kedua Ebola menyapu fasilitas pada bulan Januari dan Februari 1990 setelah importasi dari kelompok baru dari monyet yang berasal dari Filipina. Sekali lagi, tidak ada manusia yang terinfeksi, meskipun salah satu teknisi telah memotong dirinya dengan pisau bedah berdarah.
Kemudian tes dikonfirmasi, bagaimanapun, bahwa setidaknya empat orang akhirnya dinyatakan positif terpapar virus Ebola Reston. Mereka menghasilkan antibodi terhadap virus, yang berarti bahwa virus telah memasuki tubuh mereka, tetapi mereka tidak pernah menimbulkan gejala penyakit.
Gambar 1.3: Kera, jenis monyet yang ditemukan di Asia dan Afrika utara, biasanya digunakan dalam penelitian biomedis di Amerika Serikat.
Sumber: WHO - Ebola Response Roadmap Update. October 17, 2014
Semua patogen bahwa peneliti dapat bekerja di laboratorium itu dibagi menjadi empat kelompok, berdasarkan bahaya potensi mereka untuk manusia. Kelompok ini disebut "tingkat keamanan hayati," atau BSL. Karena tingkat keamanan meningkat, begitu juga tindakan pencegahan dibutuhkan di laboratorium.
• Sebuah BSL-1 laboratorium dapat bekerja pada patogen yang telah ditunjukkan bahwa tidak berbahaya bagi manusia. Tidak ada tindakan pencegahan khusus yang diperlukan, meskipun sarung tangan dan jas lab itu direkomendasikan.
• BSL-2 laboratorium yang digunakan untuk patogen itu yang mungkin menimbulkan risiko bagi manusia. Banyak prosedur di laboratorium ini perlu dilakukan dalam penahanan biologis, untuk meminimalkan aerosol (campuran cairan dan gas) yang mungkin dihasilkan ketika menggunakan prosedur tertentu (misalnya, pencampuran sampel). Sarung tangan, jas lab, dan alat pelindung lainnya (seperti kacamata atau masker) harus dikenakan. Setiap limbah infeksius yang dihasilkan harus disterilkan sebelum dibuang.
• BSL-3 laboratorium yang digunakan untuk patogen itu adalah yang dapat menyebabkan penyakit serius atau bahkan kematian ketika seorang peneliti terkena melalui inhalasi. Ini menunjukkan bahwa aliran udara harus mengambil rute tertentu dalam laboratorium. Laboratorium ini direkayasa sehingga udara harus selalu mengalir dari daerah kontaminasi rendah ke daerah-daerah kontaminasi lebih tinggi. Oleh karena itu, setiap agen infeksi akan tidak mencemari daerah yang belum mengandung mikroba. Respirator dapat dipakai selama beberapa prosedur.
• BSL-4 laboratorium untuk patogen ini seperti agen pada BSL-3, dapat ditularkan oleh aerosol. Selain itu, agen BSL-4 menimbulkan risiko penyakit yang mengancam jiwa, dan untuk penyakit yang tidak ada vaksin atau obatnya.
Peneliti bekerja dalam "ruang pakaian" dengan respirator dan laboratorium berada di bawah tekanan udara negatif: Ini berarti bahwa udara benar-benar mengalir ke laboratorium, yang tersedot seperti sebuah vakum bertenaga kecil, yang berfungsi mencegah kecelakaan dari patogen.
Lab BSL
Salah satu dari orang-orang itu adalah teknisi yang memotong dirinya. Persis bagaimana orang lain terinfeksi secara tidak jelas. Mereka tidak punya sejarah ditusuk oleh jarum atau paparan lain yang sejenis. Para ilmuwan menduga virus menyebar melalui udara, memasuki paru-paru manusia, dan juga menyebar melalui kamar yang berisi monyet. Mikroskop elektron mengkonfirmasikan adanya Ebola Reston di ruang udara di dalam paru-paru monyet yang terinfeksi. Ini disediakan lebih banyak bukti bahwa virus itu tersebar melalui udara.
Gambar 1.4: Pekerja laboratorium biosafety di tingkat (BSL-4) harus melaksanakan pekerjaan mereka mengenakan "pakaian ruang angkasa," dan menjalani dekontaminasi sebelum kembali ke daerah bebas patogen. Itu yang bekerja di laboratorium tersebut melakukan penelitian terhadap agen yang paling mematikan yang dikenal manusia.
Sumber: Briand S, Bertherat E, Cox P, Formenty P, Kieny MP, Myhre JK, et al. The International Ebola Emergency. NEJM 2014
Wabah ini (dan wabah berikutnya yakni Ebola Reston dari monyet yang diimpor dari Filipina ke Italia pada tahun 1992) ada di Amerika Serikat untuk memodifikasi prosedur yang digunakan untuk transportasi dan karantina satwa primata (monyet dan kera besar, manusia juga merupakan anggota dari Primata, dan dengan demikian, juga diklasifikasikan sebagai primata). Pada tahun 1994, Filipina melarang ekspor liar monyet untuk mengurangi kemungkinan adanya hewan yang positif terinfeksi Ebola Reston.
Pada tahun 1996, pengiriman lain monyet memasuki Negara Inggris (kali ini di sebuah fasilitas di Texas; lihat gambar 1.5) dari Filipina. Salah satu monyet meninggal
USAMRIID merupakan singkatan dari U.S. Army Medical Research Institute of Infectious Diseases. Terletak di Fort Detrick, Maryland, USAMRIID melakukan penelitian tentang ancaman biologis, terutama yang ditujukan untuk militer.
USAMRIID memiliki banyak fasilitas yang tidak tersedia di sebagian besar lembaga penelitian lainnya, termasuk laboratorium besar BSL-3 dan BSL-4. USAMRIID berperan dalam mendiagnosis dan melokalisasi wabah Ebola Reston tahun 1990, dan mengembangkan alat tes diagnostik untuk virus itu, yang sekarang digunakan untuk menyaring infeksi pada primata. Ilmuwan USAMRIID telah bekerja dengan Organisasi Kesehatan Dunia dan Pusat Pengendalian serta Pencegahan Penyakit di berbagai bidang penelitian, termasuk yang dilakukan selama dan setelah tahun 1995 wabah Ebola di Republik Demokratik Kongo. Ilmuwan USAMRIID menghabiskan banyak waktu bekerja untuk memahami bagaimana patogen menyebabkan penyakit, dan mencari jenis vaksin untuk mencegah penyakit itu, serta obat-obatan yang mungkin dapat mengobati penyakit tersebut.
USAMRIID
saat dikarantina setelah tiba di Texas. Binatang itu kemudian dites positif untuk antibodi terhadap virus Ebola. Virus juga terisolasi dari monyet lain pada pengiriman yang sama.
Lima puluh dari 100 monyet dalam kelompok yang eutanasia. Tidak ada karyawan yang ditemukan terkena virus, dan prosedur karantina bekerja dengan baik dalam membatasi wabah. Para peneliti di Filipina menegaskan bahwa persentase besar kematian monyet di Filipina adalah karena infeksi dengan virus Ebola.
Gambar 1.5: Pusat Primata Texas adalah situs tahun 1996 dari wabah Ebola Reston pada monyet.
Sumber: Chan M. Ebola virus disease in West Africa – no early end of the outbreak. NEJM 2014.
1.2 Sebuah Wabah modern
Kata Ebola itu membuat bayangan mengerikan seperi penyakit dan kematian.
Bioskop dan acara televisi telah mendramatisasikan hasil infeksi virus yang mematikan tersebut (Gambar 1.6). Bahkan, virus Ebola telah menjadi identik dengan kematian yang mengerikan. Organ tubuh "mencairkan," pasien mengalami demam dan nyeri, perdarahan internal dan eksternal yang menyebabkan pasien mengalami kematian. Bahkan orang-orang yang tidak terbiasa dengan Penyakit menular yaitu tentang virus Ebola ini.
Banyak seperti wabah AIDS, Ebola adalah penyakit yang telah melampaui obat untuk menjadi bagian dari budaya populer. Dan juga seperti AIDS, virus Ebola telah menanamkan rasa takut kepada masyarakat dalam waktu sangat singkat: Kedua penyakit itu ditemukan hampir 30 tahun yang lalu, dan telah membuat virus itu ditulis dalam buku-buku sejarah.
Gambar 1.6 Wabah virus Ebola di Amerika Serikat adalah plot utama dalam film tahun 1995, Wabah yang dibintangi oleh Dustin Hoffman dan Rene Russo. Di sini, kita melihat aktris Russo mengenakan pakaian pelindung untuk melindungi dirinya dari kontaminasi virus yang mematikan tersebut.
Sumber: Xu, L., Sanchez, A., Yang, Z., Zaki, S.R., Nabel, E.G., Nichol, S.T., Nabel, G.J., 1998. Immunization
for Ebola virus infection. Nat. Med. 4, 37–42.
Sebenarnya ada empat subtipe yang berbeda dari virus Ebola, yang merupakan bagian dari keluarga yang dikenal sebagai Filoviridae (nama muncul karena virus tampaknya menyerupai filamen dalam bentuk; lihat Gambar 1.7. sifat khusus dari filoviruses akan dibahas lebih lanjut dalam Bab selanjutnya). Meskipun lebih dari 35 tahun penelitian, para ilmuwan masih mengetahui sedikit tentang famili virus luar biasa ini. Memang, hanya dua spesies virus yang dikenal familinya: Ebola dan virus Marburg.
Dari jumlah tersebut, Marburg adalah virus pertama yang menjadi perhatian para ilmuwan medis.
Gambar 1.7 Scanning elektron mikrograf dari Virus Ebola. Penampilannya berbentuk seperti benang "filovirus."
1.3 SEBUAH VIRUS ANEH BARU DI JERMAN
Pada tahun 1967, beberapa pekerja laboratorium, semua dari laboratorium yang sama di Marburg, Jerman, dirawat di rumah sakit karena penyakit aneh yang belum pernah diketahui sebelumnya. Para dokter menyadari, bahwa para pekerja laboratorium semuanya itu menunjukkan gejala klinis yang sama, termasuk demam, diare, muntah, pendarahan besar-besaran dari berbagai organ yang berbeda, shock, dan akhirnya merusak sistem peredaran darah. Hal ini menunjukkan bahwa semua pasien menderita penyakit yang sama. Para ilmuwan mulai menyelidiki upaya untuk mengungkap sumber wabah. Sumber virus, spesies monyet hijau Afrika diimpor dari Uganda, ditemukan di Jerman. Para ilmuwan di sana telah telah menggunakan monyet untuk melakukan riset vaksin polio. Virus itu terisolasi, dan ditemukan menunjukkan morfologi (bentuk) tidak seperti virus yang dikenal sebelumnya. Karena memiliki bentuk yang asing, virus ditempatkan dalam kelompok baru, yang disebut Filoviridae. Wabah yang termasuk menyebar terhadap manusia dengan jumlah kasus sebanyak 31 kasus, dan penyakit itu menimbulkan angka kematian sebesar 23% (7 kematian terjadi dari 31 jumlah yang mengalmi infeksi). Dari tahun 1967 sampai tahun 1998, hanya ada empat tambahan infeksi alami yang diperoleh dari virus Marburg ini, semua manusia di pedesaan Afrika.
Infeksi alami diperoleh di alam bukan di laboratorium. Baru-baru ini, wabah dahsyat di Afrika karena virus Marburg ini telah diakui. Dimulai pada tahun 1998 di Republik Demokratik Kongo (dulu Zaire), dan berlangsung sampai tahun 2000. Yang kedua adalah diakui di Angola pada awal tahun 2005, dan telah membunuh manusia berjumlah 117 orang (Angka kematian mencapai 94%) per April pada tahun itu.
1.4 Filovirus Kedua
Pada tahun 1976, hampir satu dekade setelah awal wabah, baik Republik Demokratik Kongo maupun Sudan mengalami wabah yang menghancurkan dari demam hemorrhagic (perdarahan) yang bersifat mematikan. Karena perjalanan sulit di dalam dan sekitar daerah Sudan serta Republik Demokratik Kongo, maka belum disadari bahwa wabah ini mulai menyebar. Untungnya, para ilmuwan mampu melihat ke belakang dan memeriksa wabah dengan mengumpulkan data dari para korban yang sudah terinfeksi virus tersebut.
Para ilmuwan menentukan bahwa agen penyebab untuk wabah ini adalah virus yang mirip dengan Marburg, yang lain yaitu filovirus. Virus ini bernama Ebola, diambil dari
nama Sungai Ebola yang melintasi desa Yambuku di Republik Demokratik Kongo.
Sebuah wabah kecil dilaporkan terjadi di Sudan pada tahun 1979, dan satu Kasus dilaporkan di Republik Demokratik Kongo pada tahun 1977. Virus ini benar-benar tidak menarik perhatian ilmuwan di Amerika Serikat, sampai Ebola muncul di negara Amerika Serikat pada tahun 1989, di sebuah fasilitas penelitian primata di dalam wilayah Reston, Virginia (berada di luar Washington, DC). Subtipe wabah virus Ebola ini berbeda dengan yang telah diisolasi di negara Afrika, yang bernama Ebola Reston. Tidak ada manusia meninggal dalam wabah Reston ini, namun virus itu fatal bagi monyet. Wabah ini akan dibahas secara lebih rinci dalam Bab selanjutnya
Ebola muncul kembali di Afrika beberapa kali antara tahun 1994 dan 1996, dan sekali lagi pada tahun 2000. Wabah ini akan dibahas dalam bab-bab selanjutnya. Sebuah wabah, dan spesies filovirus serta subtipe memiliki karakter berbeda-beda, dan akan ditunjukkan pada Gambar 1.8.
Gambar 1.8 Timeline wabah filoviral yang telah diketahui, dimulai pada tahun 1967 dengan jumlah
sebanyak 31 kasus terkait virus Marburg.
Sumber: Wilson, J.A., Bray, M., Bakken, R., Hart, M.K., 2001. Vaccine potential of Ebola virus VP24, VP30, VP35, and VP40 proteins. Virology 286, 384–390.
1.5 KASUS VIRUS MARBURG LAINNYA
Meskipun Ebola sendiri adalah penyakit langka, virus sepupunya itu adalah Marburg.
Sejak wabah aslinya yang terjadi pada tahun 1967, Marburg telah muncul kembali pada populasi manusia namun hanya beberapa kali saja. Dalam wabah asli yang terajdi di Marburg, Jerman (disebabkan oleh impor monyet Afrika), dilaporkan terjadi kasus sebanyak 31 kasus (7 meninggal). Setelah ini, virus kembali tidak muncul hampir dalam satu dekade, tidak muncul lagi sampai tahun 1975, di Afrika Selatan. Virus Marburg lagi-lagi menghilang sampai terjadi lagi kasus yang dilaporkan bertempat di wilayah Kenya pada tahun 1980, dan satu lagi di tahun 1987, di wilayah yang sama. Dalam wabah pertama, sekali lagi terjadi kasus indeks meninggal, sementara kedua pasien yang selain selamat. Hanya satu yang mengalami infeksi dan tercatat pada tahun 1987, serta mengakibatkan kematian pada pasien. Kedua, Wabah terjadi di sekitar Gunung Elgon, dan tercatat kedua kasus indeks telah terajdi di sebuah gua dalam gunung. Hal ini menimbulkan spekulasi yang belum dikonfirmasi bahwa kelelawar mungkin merupakan reservoir untuk filoviruses ini, hipotesis yang akan dibahas secara lebih rinci dalam Bab selanjutnya. Antara tahun 1987 dan 1998, satu-satunya kasus virus Marburg ini terjadi pada saat kecelakaan laboratorium, berada di Uni Soviet. Satu dari kasus ini adalah fatal.
Namun, pada tahun 1998, wabah ini mulai terbesar yakni wabah virus Marburg mulai dari daerah timur laut Republik Demokratik Kongo. Kali ini, fokus wabah itu adalah sebuah kota bernama Durba (populasi penduduknya berjumlah sekitar 16.000). Beberapa orang di wilayah ini bekerja untuk Kilo Moto yakni sebuah Perusahaan Pertambangan, yang berisi sejumlah tambang emas ilegal di daerah itu. Kondisi kerja di daerah ini sangat genting. Perang saudara pun terajdi pada tahun 1996, dan situasi sosial ekonomi mulai memburuk. Penyakit infeksi dari semua jenis wabah ini sangat berbahaya maka dibutuhkan lah pengobatan, seperti vaksinasi, namun pengobatan waktu itu terbatas.
Wabah virus marburg diperkirakan telah muncul dimulai pada bulan November 1998, meskipun hal itu belum dilaporkan kepada badan-badan internasional sampai akhir April 1999, yang menimpa kepala petugas medis di daerah tersebut dan menyebabkan kematian.
1.6 MENGAPA EBOLA BEGITU MENARIK UNTUK DIBAHAS?
Semua media baik elektronik maupun non elektronik menaruh perhatian besar terhadap Ebola ini telah diterima di negara Amerika Serikat, seseorang mungkin berpikir itu telah menjadi penyebab utama kematian pada manusia. Ini adalah konsep yang salah.
Selama hampir 30 tahun, Ebola telah menyebabkan kurang dari 2.000 jumlah manusia terinfeksi oleh virus ini di seluruh dunia, sehingga menyebabkan sekitar 1.100 jumlah kematian yang dialami manusia saat itu. Jika dibandingkan dengan virus seperti influenza, yang menyebabkan sekitar 36.000 kematian hanya dalam satu tahun khusus di Amerika Serikat saja, salah satu tidak bisa tidak bertanya-tanya mengapa Ebola telah menerima reputasi sebagai pembunuh yang mengerikan. Namun, jumlah kematian tidak seluruh nya tergambarkan: Pengecualian untuk AIDS, tidak ada virus yang dikenal membunuh dengan efektivitas seperti virus Ebola. Di bab-bab berikutnya, kita akan memeriksa banyak faktor yang membuat Ebola layak dijadikan studi oleh peneliti-peneliti profesional di seluruh negara. Kita juga akan membahas mengapa virus yang menyebabkan kematian ini yang berasal dari negara Afrika, dan telah menjadi penyakit yang ditakuti di seluruh dunia.
Chapter 2 Ciri-ciri Virus Ebola
Ebola adalah virus RNA. Bahan genetik material yang membentuk gennya itu terdiri dari asam ribonukleat. Itu adalah genom (seluruh jumlah RNA) yang berukuran cukup kecil. Hanya berisi sekitar 19.000 pasangan basa (dalam perbandingan, genom manusia mengandung sekitar 3 miliar pasang basa), yang mengkodekan hanya 7 protein. Virus ini milik keluarga Filovirus, dan struktural menyerupai benang panjang (Gambar 2.1). Virus umumnya muncul dalam bentuk benang panjang, berserabut, tetapi juga dapat "berbentuk U," dalam bentuk "6", atau bahkan melingkar. Urutan analisis menunjukkan virus itu mendekati dan berhubungan dengan paramyxoviruses, itu adalah virus yang menyebabkan penyakit umum seperti campak dan gondok. Seperti disebutkan sebelumnya, keluarga virus Ebola terdiri dari empat subtipe yang berbeda. Dalam subtipe tertentu, virus berhubungan erat, tapi di antara subtipe yang berbeda, mereka jauh lebih bervariasi. Sebagai contoh, virus jenis Ebola Zaire diisolasi dari tahun 1976 epidemi di Yambuku dan tahun 1995 epidemi di Kikwit, berbeda dalam urutan nukleotida mereka hanya sekitar 1,6% .Virus itu terdiri dari berbagai jenis, sebanyak 40%. Oleh karena itu, Para ilmuwan menganggap bahwa subtipe ini adalah yang paling berbeda.
2.1 GEJALA KLINIS TERINFEKSI VIRUS EBOLA
Masa inkubasi (waktu antara paparan virus dan perkembangan penyakit) virus Ebola biasanya berkisar antara 5 sampai 14 hari. Periode ini dapat bervariasi, tergantung pada rute paparan dan jumlah virus yang kontak dengan pasien. Misalnya, pasien disuntik dengan jumlah besar Ebola karena penggunaan kembali jarum yang kotor dapat mengembangkan gejala lebih cepat daripada seseorang terkena melalui kontak eksternal dengan sejumlah kecil cairan tubuh lainnya dari pasien yang terinfeksi. Gejala, termasuk demam, sakit kepala, sakit perut, mual, kelelahan, dan perasaan sakit umum, biasanya muncul tiba-tiba. Karena gejala-gejala ini umum untuk banyak penyakit, itu adalah sangat sulit untuk membuat diagnosis definitif infeksi Ebola pada tahap ini. Penyakit yang timbul seperti diare berdarah, sakit tenggorokan yang parah, dan sakit kuning (menguningnya kulit dan mata, karena penumpukan protein hati) adalah gejala umum.
Muntah dan anoreksia (kehilangan nafsu makan).
Gambar 2.1: perlakuan scan elektron mikrograf dari virus Ebola. Penampilan seperti benang yang menghasilkan bentuk sebagai sebuah "filovirus."
Sumber: Briand S, Bertherat E, Cox P, Formenty P, Kieny MP, Myhre JK, et al. The International Ebola Emergency. NEJM 2014.
2.1 PATOGENESIS PADA INFEKSI VIRUS EBOLA
Komponen yang paling menonjol dari infeksi virus Ebola adalah perdarahan dan koagulasi intravaskular, yang berarti bahwa darah sebenarnya mengalami pembekuan pada seluruh tubuh dalam kapiler. Proses ini bisa cepat menguras pasokan tubuh dari jumlah protein yang terlibat dalam pembekuan, membuat darah tidak dapat merespon dengan benar ketika kerusakan jaringan yang sebenarnya telah terjadi. Hal itu menyebabkan perdarahan yang tidak terkendali. Ketika Ebola menginfeksi berbagai jenis sel, menyebabkan pelepasan sejumlah bahan kimia, termasuk molekul yang disebut sitokin, kemokin, dan antihistamin. Melepaskan protein ini ke dalam aliran darah menyebabkan sejumlah gejala Infeksi Ebola, termasuk demam, pembengkakan, dan shock (penurunan tekanan darah). Syok adalah hasil dari protein ini meningkatkan permeabilitas sel endotel yang melapisi pembuluh darah. Hal ini memungkinkan air bocor dari darah ke dalam jaringan sekitarnya. Dengan sedikitnya cairan di dalam darah, maka hanya sedikit volume jantung yang bertugas memompa ke seluruh tubuh, menyebabkan jantung berdetak lebih cepat dalam upaya untuk mendapatkan cukup darah menuju organ.
Bahan kimia ini juga merupakan bagian dari kaskade (reaksi rantai protein dalam darah) yang dapat mengakibatkan pembekuan darah, seperti yang disebutkan sebelumnya.
Pembekuan darah kaskade biasanya terjadi cedera pada jaringan epitel. Kejadian dalam kapiler tersebut tidak normal. Para ilmuwan berhipotesis bahwa DIC sebagian besar bertanggung jawab untuk manifestasi perdarahan dari virus Ebola.
2.2 PERANAN VIRAL PROTEIN
Seperti disebutkan sebelumnya, genom Ebola memiliki enkode berjumlah tujuh protein. Salah satu protein yang telah banyak dipelajari menjadi subyek adalah virus Ebola glikoprotein. Hal ini diduga memainkan peran penting dalam patogenesis (asal dan perkembangan) dari penyakit. Sebenarnya ada dua glikoprotein yang sedikit berbeda, dikodekan oleh gen yang sama. Tiga ratus asam amino (blok bangunan protein) yang sama, namun karena suatu Proses editing selama mengalami transkripsi virus, maka dua protein yang unik dibuat. Salah satu protein, yang disebut selubung glikoprotein, menjadi protein struktural dalam virus. Masih dalam selubung viral (bagian terluar dari virus, lihat Gambar 2.2). Di sini, salah satu fungsi protein ini adalah mengikat sel inang, sehingga virus dapat masuk dan mereplikasi di dalamnya. Bentuk lain dari protein adalah versi
yang disekresikan, yang berarti dilepaskan dari sel yang telah terinfeksi. Kedua protein ini telah terbukti secara eksperimental untuk bermain peran dalam patogenesis yang terinfeksi. Ketika glikoprotein Ebola dinyatakan bahwa sel terinfeksi, maka pembulatan sel diamati. Ini berarti bahwa sel-sel yang "sakit" itu karena kehadiran glikoprotein. Para ilmuwan juga mengamati perbedaan sitotoksisitas (kemampuan untuk menyebabkan kerusakan racun bagi sel-sel yang terinfeksi) dalam percobaan menggunakan berbagai jenis virus Ebola. Ekspresi glikoprotein Ebola Zaire dalam sel yang terinfeksi mengakibatkan Efek beracun pada sel primata manusia dan bukan manusia. Ekspresi dari glikoprotein Ebola Reston hanya disebabkan oleh efek ini dalam sel yang berasal dari primata non-manusia. Ini mungkin salah satu alasan mengapa strain Ebola Reston belum ditemukan penyebab gejala klinis pada manusia, tetapi sangat mematikan terhadap primata lainnya. Protein Ebola lain, VP40, juga sitotoksik, meskipun sedikit yang diketahui tentang mekanisme (s) dimana protein ini berkontribusi untuk patogenisitas virus.
Bentuk yang disekresikan dari glikoprotein juga mungkin memainkan peran dalam menekan respon imun terhadap infeksi virus Ebola. Virus Ebola menghancurkan sistem kekebalan tubuh. Akibatnya, pasien yang terinfeksi Ebola sering tidak dapat mengembangkan respon imun yang memadai untuk melawan infeksi. Ini adalah sebagian karena fakta bahwa virus menginfeksi beberapa sel yang memainkan peran penting dalam pengembangan respon imun. Dengan cara menginfeksi dan menghancurkan sel-sel ini, maka virus tidak akan mampu melawan infeksi. Selain itu, adanya antibodi yang diarahkan terhadap glikoprotein Ebola dapat benar-benar meningkatkan infeksi virus Ebola. Bentuk hewan telah menunjukkan bahwa imunisasi dengan glikoprotein Ebola Zaire sebenarnya akan meningkatkan infektivitas dari virus itu. Ketika ilmuwan meneliti model ini dengan glikoprotein Ebola Reston, ternyata efeknya jauh lebih kecil. Sekali lagi, ini adalah penjelasan lain yang mungkin untuk perbedaan dalam hal kematian manusia antara dua jenis virus ini. Informasi ini juga memiliki implikasi untuk pengembangan vaksin berdasarkan glikoprotein dan untuk transfer antibodi pasif pada pasien yang terinfeksi.
Sumber: Bray, M., Paragas, J., 2002. Experimental therapy of filovirus infections. Antiviral Res. 54, 1–17.
Gambar 2.2: Gambar Skema virus Ebola, yang menunjukkan lokasi dari berbagai protein yang disandikan oleh virus.
Protein Ebola lainnya juga telah terlibat secara langsung mempengaruhi patogenesis virus. Sebuah protein yang disebut VP35 telah ditunjukkan bertindak sebagai antagonis interferon. Interferon adalah protein dari sistem kekebalan tubuh yang bertindak secara khusus dalam pertahanan terhadap virus. Para ilmuwan berhipotesis bahwa protein VP35 mungkin berbeda diantara jenis Ebola. Memang, sebuah penelitian baru-baru ini menunjukkan bahwa Protein VP35 dari virus Ebola Zaire, ketika digabungkan dengan protein yang berbeda (protein L) dari Ebola Reston, ternyata mampu mereplikasi.
Meskipun ini tidak membahas perbedaan virulensi antara dua subtipe, hal itu menunjukkan bahwa protein VP35 cukup untuk mempengaruhi sel manusia.
2.3 PENULARAN
Virus Ebola ditularkan melalui kontak dengan darah atau cairan tubuh pasien yang terinfeksi. Pada tahun dalam situasi merebaknya virus ebola, Ilmuwan telah menyarankan mungkin juga bisa ditularkan melalui kontak yang sama dengan primata yang terinfeksi.
Risiko penularan lebih tinggi bila pasien yang terinfeksi dalam tahap penyakit, karena viremia (keberadaan virus di dalam darah) lebih tinggi pada tahap ini. Di rumah sakit, penggunaan kembali dari jarum yang tidak steril dan jarum suntik serta kurangnya prosedur keperawatan adalah faktor penting dalam penyebaran penyakit. Anggota keluarga terinfeksi karena kontak langsung melalui kulit, baik di rumah sakit atau rumah.
Ebola juga telah ditemukan mereplikasi dalam jumlah yang besar di dalam kulit.
Kontak dengan cairan tubuh yang cenderung tidak dibutuhkan untuk berkontraksi virus ini. Hal ini belum sepenuhnya jelas, namun, bagaimana virus ini masuk ke tubuh manusia.
Para ilmuwan berhipotesis bahwa masuknya dengan rute yang paling mungkin adalah melalui kontak jari yang terkontaminasi dengan salah satu matanya atau mulutnya. Dalam beberapa kasus, penularan melalui udara mungkin terjadi. Hal ini secara khusus diduga pada jenis Reston, meskipun dalam beberapa kasus Ebola Zaire, tidak ada kontak langsung dengan pasien yang terinfeksi. Selain itu, virus Ebola ini terisolasi dari jaringan paru-paru pada 1995 Kikwit merebaknya di Republik Demokratik Kongo. Hal ini tidak diketahui, namun, apakah ini merupakan rute utama penularan. penularan seksual mungkin, juga, karena virus telah diisolasi dari kedua cairan vagina dan air mani.
Penyembuhan (proses pemulihan dari infeksi) adalah proses yang cukup panjang, dan virus yang telah diisolasi dari penderita selama 82 hari sejak timbulnya penyakit tersebut.
Hal ini tidak diketahui berapa penderita sejauh mana penyembuhan memberikan kontribusi untuk penularan virus ini.
Chapter 3 Ekologi Virus
Ekologi organisme mengacu pada studi tentang lingkungan alam dan interaksinya dengan kedua lingkungan hidup dan organisme lain dalam lingkungan tersebut. Sebuah studi pada ekologi patogen bertujuan untuk menjawab pertanyaan-pertanyaan berikut:
• Di mana patogen tersebut terletak secara alami?
• Apa yang dimaksud dengan spesies inang?
• Bagaimana cara patogen tersebut menular ke orang lain?
• Interaksi Apa miliki dengan organisme yang lain, seperti informasi lainnya tentang mikroba?
• Apa yang dimaksud dengan keanekaragaman genetik (jumlah variasi pada DNA level) dari spesies?
• Apakah jenis tertentu atau subtipe patogen tersebut yang beredar bahwa terjadi lebih sering (atau, mungkin, lebih ganas) daripada yang lain?
• Apakah beberapa jenis patogen terbatas pada wilayah geografis tertentu? Apa interaksi patogen dengan host reservoirnya, bila salah satu yang ada?
• Apakah ada organisme lain (hewan atau bahkan serangga) berperan dalam pemeliharaan patogen?
Para ilmuwan masih mencari jawaban atas semua pertanyaan tentang Ebola ini.
3.1 PETUNJUK DARI VIRUS ITU SENDIRI
Urutan genetik sebenarnya dari virus Ebola bisa memberikan petunjuk untuk lembar ekologi dan epidemologi. Pada Ebola, dalam subtipe berikut ini (variasi yang agak berbeda untuk virus ini) telah diidentifikasi (Ebola Zaire (EBO-Z), Ebola Sudan (EBO-S), Ebola Reston (EBO-R), dan Ebola Côte d'Ivorie (EBO-CI). Para ilmuwan telah menemukan EBO-R pada monyet di Filipina, dan telah kembali dari monyet yang diimpor dari negara itu ke Amerika Serikat dan Eropa. Studi telah menunjukkan serologi bahwa virus Ebola yang beredar di beberapa bagian Asia dan Madagaskar, serta di Afrika Tengah dan Afrika Barat. Sebagian besar kasus Ebola dan paling prevalensi (petunjuk antibodi terhadap infeksi sebelumnya) terjadi di daerah hutan hujan, meskipun kasus juga terjadi di daerah-daerah lebih sabana seperti ekologi, seperti di Sudan dan Uganda.
Melihat pohon filogeni Ebola (Gambar 3.1), Ebola Reston dan Ebola Zaire adalah virus yang paling berbeda; sehingga ini, yang paling jauh dengan satu sama lain. Salah satu
bisa juga melihat bahwa regangan Ebola yang menyebabkan penyebaran pada tahun 1976 di Republik Demokratik Kongo (kemudian dikenal sebagai Zaire) sangat erat kaitannya dengan jenis yang ditemukan di Kongo pada tahun 1995 dan di Gabon pada tahun 1994 dan 1996. Hal ini sangat terbilang mengejutkan, karena Ebola adalah virus RNA, dan Virus RNA sering rentan terhadap kesalahan dalam transkripsi ("Menyalin" kesalahan yang terjadi ketika virus berkembang biak). Ketika virus RNA adalah stabil sifatnya, umumnya artinya adanya beberapa jenis kendala eksternal yang evolusinya, mungkin karena patogen-inang evolusi bersama. Jika mengalami mutasi patogen terlalu banyak, mungkin tidak dapat hidup dalam Surat inang alami lagi. Mutasi dalam genom dapat menyebabkan ini menyebabkan penyakit pada inang, atau mungkin mengalami mutasi protein yang yang diperlukan untuk mengikat sel inang, misalnya. Stabilitas virus Ebola menunjukkan bahwa tetap ada sesuatu yang menjaga Ebola subtipe yang berbeda.
Gambar 3.1: Pohon filogenetik dari filoviruses. Sebagai contoh, virus Ebola dari Gabon pada tahun 1994 dan 1996, dan dari Zaire pada tahun 1976 dan 1995 sangat terkait erat, dan bersama-sama membentuk subtipe Ebola Zaire. Kelompok serupa untuk Ebola-Sudan dan Ebola Reston bisa terlihat di pohon. Subtipe Ebola keempat adalah Pantai Gading. Marburg disediakan sebagai outgroup virus yang jauh dengan yang lain.
Sumber: Simmons, G., Lee, A., Rennekamp, A.J., Fan, X., Bates, P., Shen, H., 2004. Identification of murine T-cell epitopes in Ebola virus nucleoprotein. Virology 318, 224–230.
Diluar penelitian, pada ekologi Ebola masih tetap belum jelas. Sifat sporadis wabah serta terjadinya virus-virus di daerah terpencil Afrika didirikan penelitian medis, dan sering di negara-negara yang mengalami perselisihan dan ketidakstabilan pemerintah, senyawa kesulitan menentukan ekologi virus tertentu. Seringkali, kasus utama, orang pertama dalam wabah diketahui terinfeksi, serta mungkin virus ini diperoleh dari reservoir liar. Sulit untuk menentukan dimana pasien bisa terjangkit penyakit ini. Musim juga mungkin memainkan peran dalam ekologi wabah penyakit ini. Banyak yang telah terjadi selama musim ini. Bagaimanapun, para ilmuwan telah berusaha untuk membuat sebagian besar wabah. Mereka telah melakukan Studi wabah untuk menentukan dimana virus "bersembunyi" jika tidak menginfeksi manusia. Para ilmuwan juga mencoba untuk mencari tahu bagaimana virus bergerak dari tempat itu dipertahankan sifatnya dalam populasi manusia. Mungkin, itu hanya udara. Mungkin ditularkan dari menyembelih hewan yang terinfeksi. Hal ini juga dapat ditularkan oleh perantara seperti vektor serangga. Jawaban untuk pertanyaan-pertanyaan ini, meskipun tahun investigasi ini masih belum diketahui.
3.2 APA ARTI RESERVOIR PADA Virus Ebola?
Satu bagian hilang data kunci Mengenai infeksi Ebola adalah sumber reservoir Ebola.
Sebuah reservoir merupakan sumber pada penyebab infeksi, tempat dimana agen tersebut dipelihara dan bereplikasi. Primata bukan manusia telah disarankan sebagai reservoir virus ini, didasarkan pada beberapa bukti, Termasuk factthat sejumlah wabah Ebola telah ditelusuri untuk kontak dengan primata bukan manusia, dan Penemuan ini apakah cukup banyak primata bukan manusia bisa bertahan infeksi, seperti yang ditunjukkan oleh studi serologi (lihat di bawah). Fakta infeksi Ebola sangat mematikan di sebagian besar primata bukan manusia spesies yang tidak menunjukkan itu adalah hipotesis yang mungkin apakah primata adalah reservoir yang sebenarnya. Dalam semua kemungkinan, Mereka Banyak sekali terinfeksi, seperti halnya manusia. Meskipun beberapa penelitian yang besar, para ilmuwan masih belum menemukan reservoir yang benar dari virus Ebola di alam. Pada tahun 1976 wabah simultan Demam berdarah Ebola terjadi di Sudan dan Republik Demokrat Kongo. Analisis virus Menyebabkan perpaduan wabah menunjukkan
apakah dua subtipe dari Ebola virus, Ebola Zaire dan Ebola Sudan yang ditunjuk.
Ilmuwan melakukan investigasi di kedua lokasi, dalam upaya untuk tambang penentuan ekologi virus yang menyebabkan hipotesis wabah. Di Republik Demokratik Kongo, ada lebih dari 800 bedbugs dan 147 spesies mamalia (hewan pengerat liar) dikumpulkan untuk investigasi. Para ilmuwan menguji semua sampel untuk penentuan tambang jika mereka berjumlah banyak.
Werewolf positif untuk virus Ebola, tetapi tidak ada virus yang ditemukan dimana setiap serangga atau binatang. Sekelompok peneliti kemudian mempersempit daftar mamalia tambahan untuk menguji berdasarkan ukuran, kerentanan terhadap infeksi Ebola di laboratorium, habitat diketahui, dan frekuensi kontak dengan manusia. Mamalia ini berfungsi sebagai sasaran survei ekologi di masa depan dalam mencari reservoir. Wabah Sudan ditelusuri kembali apa yang layak individu bekerja di sebuah gudang di mana kapas itu disimpan. Gudang dipenuhi dengan kelelawar, koneksi yang menarik bagi para ilmuwan. Kitum Gua di Kenya jadi tempat yang penuh dengan kelelawar, dan pengunjung di sana telah tertular virus Marburg. Kelelawar adalah wabah filoviruses?
Untuk menguji hipotesis ini, para ilmuwan menguji 100 spesimen vertebrata (termasuk kelelawar) untuk virus Ebola Setelah beberapa tahun lamanya. Tak satu pun dari mereka yang ditemukan positif. Meskipun upaya yang besar sudah dilakukan oleh peneliti, reservoir Ebola tetap tidak ditemukan.
Namun, kelelawar telah dikaitkan dengan infeksi filovirus karena infeksi awalnya ditemukan (Gambar 3.2). Pada tahun 1976, spesies kelelawar, ditemukan di atap pabrik kapas N'zara di Sudan. Selama wabah itu, kasus indeks dan dua kasus awal lainnya telah ada di pabrik ini. Ebola muncul kembali di lokasi yang sama ini pada tahun 1979. Sekali lagi dalam hal ini, kasus indeks itu terjadi pada seorang pekerja di pabrik kapas N'zara.
Selain itu, kelelawar telah dikaitkan dengan kasus virus Marburg, sebuah filovirus yang terkait erat dengan Ebola. Dua kasus Marburg telah dikaitkan dengan sebuah gua di Gunung Elgon di Kenya. Gua itu adalah rumah bagi ribuan kelelawar. Selain itu, eksperimen menunjukkan bahwa kelelawar dari genus Tadarida dapat terinfeksi oleh Ebola di laboratorium, dan mengirimkan virus itu melalui guano mereka (tinja). Namun, tak satu pun dari kelelawar yang telah ditangkap selama survei ekologi telah diuji positif untuk virus Ebola ini. Selanjutnya, strain Ebola yang telah dilakukan eksperimen pada
anggota lain dari genus Tadarida yang ditemukan terdapat patogen. Karakteristik reservoir spesies adalah bahwa patogen biasanya menyebabkan sedikit atau tidak ada reservoir; dengan demikian, diharapkan bahwa infeksi Ebola pada spesies ini akan menjadi asimtomatik (tidak menyebabkan gejala infeksi). Dengan demikian, bukti bahwa kelelawar dapat memainkan peran baik dalam pemeliharaan virus Ebola atau penularan terhadap manusia itu belum terbukti.
Gambar 3.2: Kelelawar telah lama dikaitkan dengan infeksi filovirus. Namun, peran mereka dalam pemeliharaan atau penularan virus di alam tetap belum ditentukan.
Sumber: Bray, M., Paragas, J., 2002. Experimental therapy of filovirus infections. Antiviral Res. 54, 1–17.
Para ilmuwan menggunakan 1.664 hewan, terutama tikus kecil, ketika mereka melakukan penelitian serologis dalam skala besar pada tahun 1979-1980 di Kamerun dan Republik Demokratik Kongo. Sekali lagi, tidak ada virus yang terdeteksi. Terdapat beberapa kekurangan, dan dicatat dalam penelitian ini. Hewan-hewan yang ditangkap
termasuk sseekor hewan yang umum untuk pemukiman (hewan peridomestik). Karena infeksi virus Ebola adalah seperti peristiwa langka, reservoir tidak mungkin terjadi pada hewan perumahan umum. Selain itu, tes yang lebih baik dan lebih sensitif telah dikembangkan sejak studi ini dilakukan.
Setelah tahun 1995, wabah yang terjadi di Kikwit, di Republik Demokrat Kongo, ilmuwan melakukan survei ekologis lain lagi. Sekali lagi, bagaimanapun, iklim adalah faktor. Tim peneliti tiba pada bulan Juni 1995, tetapi kasus primer telah terinfeksi pada bulan Desember 1994. Namun demikian, tim mengumpulkan sampel untuk tes terhadap virus Ebola. Dalam penelitian ini, para ilmuwan mengumpulkan total dari 3.066 spesimen dari total 6 situs (mereka juga membeli hewan besar dari pemburu). Sebagian besar sampel mamalia kecil, seperti burung, reptil, dan amfibi. Para ilmuwan mengumpulkan lebih dari 34.000 jenis arthropoda. Sebagian besar itu terdiri dari nyamuk, kutu busuk, dan kutu. Sekali lagi, meskipun pengujian hampir 40.000 spesimen, para ilmuwan tidak mampu untuk mengisolasi virus, dan mereka tidak menemukan bukti serologis infeksi sebelumnya. Reservoir tetap, dan masih tetap, tidak diketahui, meskipun peneliti sudah menghabiskan beberapa tahun dan ribuan dolar sudah dihabiskan untuk meneliti virus itu.
Sebuah hipotesis yang menarik melibatkan kemungkinan tanaman sebagai reservoir virus Ebola. Beberapa baris penalaran mendukung ide ini. Dengan demikian, virus tidak muncul untuk beradaptasi dengan baik terhadap infeksi di sebagian besar spesies vertebrata, dan mungkin karena itu induk virus adalah spesies non-vertebrata. Munculnya wabah Ebola dapat terjadi pada waktu yang sama. Selain itu, virus yang tampaknya mirip dengan filoviruses diisolasi dari kutu loncat (spesies Psammotettix ) dari Perancis. Sekali lagi, ini adalah ide menarik, tetapi tidak ada bukti belum ditemukan yang melibatkan tanaman memiliki peran dalam infeksi Ebola.
3.3 BUKTI INFEKSI PADA PRIMATA BUKAN MANUSIA
Sama seperti beberapa studi penelitian intensif telah ditargetkan untuk serangga dan hewan-hewan kecil, para ilmuwan telah juga melakukan sejumlah studi untuk melihat bukti infeksi Ebola sebelumnya yang lebih besar dari primata dan manusia di Afrika.
Sebuah survei ke 15 dilakukan di Kamerun, Gabon, dan Republik Demokratik Kongo antara tahun 1985 dan 2000. Para peneliti menguji sebanyak 790 satwa primata dari 20 spesies yang berbeda. Beberapa penelitian sebelumnya telah menunjukkan bahwa wabah
Ebola sering terjadi bersamaan dengan wabah pada simpanse. Dalam kasus lain, infeksi Ebola telah ditelusuri melalui pembantaian simpanse liar, atau dalam kasus-kasus Pantai Gading, dengan nekropsi dari simpanse yang telah meninggal di alam liar, mungkin infeksi Ebola. Dalam studi ini, Sebalikny banyak isolat yang ditemukan positif untuk antibodi virus Ebola. Ini berarti bahwa hewan-hewan ini telah terkena virus Ebola, dan positif terinfeksi. Seroprevalensi tertinggi ditemukan pada simpanse di Kamerun, di mana hampir 18% (21 dari 119 yang diuji) yang positif untuk antibodi terhadap virus Ebola.
Spesies lain ditemukan termasuk positif yakni gorila dan babon. Dari catatan ditemukan bahwa tidak ada hewan kelahiran dinyatakan positif untuk virus Ebola antibodi, menunjukkan bahwa binatang ini adalah terkena virus yang beredar secara alami di alam liar di daerah Afrika.
Sementara para ilmuwan terus berspekulasi tentang reservoir Ebola, virus ini berhasil menebangi kera besar di Afrika Tengah. Ahli primata (ilmuwan yang mempelajari primata) dan warga desa setempat mencatat peningkatan besar dalam jumlah bangkai hewan yang ditemukan di kawasan hutan sebelum dan selama 2001 terhadap wabah Ebola di Gabon. Kebanyakan primata langka ini dibunuh oleh predator, dan terdekomposisi cepat karena lingkungan yang hangat dan lembab. Dalam periode 8 bulan , tim peneliti mempelajari minimal sebanyak 64 hewan bangkai di Gabon, sebagian besar dari mereka adalah gorila. Para peneliti berhipotesis bahwa ribuan gorila mungkin telah meninggal karena infeksi Ebolai. Setelah wabah ini, penampakan kedua gorila dan simpanse di daerah menurun secara signifikan. Bahkan, penampakan gorila (atau bukti lain kehadiran mereka, termasuk kotoran dan jejak) mengalami penurunan sebesar 50%.
Penampakan simpanse mengalami penurunan sebesar 88%, menunjukkan keparahan penurunan populasi di kedua spesies tersebut. Mendukung bukti lain dalam pengamatan ini. Delapan kelompok gorila (total 143 ekor) yang telah dipantau oleh ahli primata selama 10 tahun menghilang dalam beberapa waktu antara Oktober 2002 dan Januari 2003. Sebuah kejadian serupa di Hutan Pantai Gading pada tahun 1994 bertepatan dengan penemuan Ebola di daerah Afrika. Sequencing dari virus Ebola diisolasi dari beberapa bangkai menyarankan bahwa kematian disebabkan beberapa virus, bukan dari satu epidemi yang terus menerus. Itu Oleh karena mungkin bahwa kera tersebut menghadapi reservoir alam Ebola di suatu tempat pada habitatnya.
Simpanse telah terpengaruh di Pantai Gading juga. Sebuah studi pada tahun 1994 tentang simpanse di daerah ini (yang menyebabkan identifikasi subtipe Ebola di Pantai Gading) mengidentifikasi wabah yang sedang terjadi, yang telah dikaitkan dengan makan daging dari colobus monyet merah (spesies Colobus badius badius). Itu diperkirakan bahwa sekitar 25% dari komunitas 43 simpanse yang mari karena wabah. Ahli primata harus menghentikan penyebaran penyakit itu. Mereka tidak yakin apakah beberapa kera harus dipindahkan ke daerah lain, yang mungkin bebas dari Ebola, atau apakah mereka sebaiknya ditinggalkan saja. Satu hal yang peneliti setuju adalah bahwa perburuan (berburu secara ilegal) dari gorila di daerah-daerah harus dihentikan. Ilmuwan William Karesh dari Wildlife Conservation Society di kota New York menyatakan, "Bahwa orang bisa menderita penyakit ini karena memakan primata yang sudah terinfeksi dan kita tahu bahwa yang harus kita lakukan adalah melindungi kera besar. "Untuk saat ini, itu lah yang kita mampu semua lakukan(Gambar 3.3).
Gambar 3.3: Kera besar di Afrika, termasuk gorila dan simpanse, berada dalam bahaya karena virus Ebola, yang telah berkurang populasi mereka di beberapa benua.
Sumber: Gupta, M., Mahanty, S., Greer, P., Towner, J.S., Shieh,W.J., Zaki, S.R., Ahmed, R., Rollin, P.E., 2004. Persistent infection with Ebola virus under conditions of partial immunity. J. Virol. 78, 958–967.
3.4 BUKTI INFEKSI PADA MANUSIA
Para ilmuwan telah melakukan penelitian untuk menguji prevalensi paparan Ebola di Afrika. Sebuah survei di Kamerun 1983 digunakan uji imunofluoresensi secara tidak langsung. Di antara 1.517 orang yang tampak sehat tanpa riwayat penyakit demam berdarah, sebesar 9,7% ditemukan memiliki antibodi terhadap virus Ebola. Dalam studi
ini, tingkat tertinggi seropositif yang ditemukan di antara Pigmi (kelompok penghuni hutan Afrika), orang-orang dewasa berumur masih muda, dan petani hutan hujan.
Penelitian lain mengamati semua filoviruses di Afrika Tengah (virus Marburg dan Ebola).
Sekali lagi, nilai positif yang lebih tinggi untuk virus Ebola ditemukan antara Pigmi daripada kalangan non-Pigmi, tapi tidak ada perbedaan statistik yang signifikan yang ditemukan antara kedua kelompok. Para ilmuwan melakukan penelitian lebih lanjut selama tahun 1995 terhadap wabah di Republik Demokratik Kongo. Jadi, mirip dengan situasi pada virus Ebola Reston, tampak bahwa harus ada jenis Ebola yang beredar di Afrika menyebabkan subklinis (penyakit tanpa gejala). Selain itu, persentase penduduk pedesaan yang lebih tinggi daripada penduduk kota ditemukan memiliki antibodi terhadap Ebola. Dalam sebuah studi terpisah, para ilmuwan menemukan tingkat prevalensi lebih tinggi diantara pemburu dibandingkan petani, ini menunjukkan bahwa ada ketidakbenaran informasi reservoir Ebola di suatu tempat di hutan Afrika.
Chapter 4 Metode Deteksi dan Pengobatan
Secara historis, para ilmuwan telah mengukur infeksi dengan virus Ebola menggunakan tes yang mendeteksi antibodi terhadap virus. Bahkan, para ilmuwan menggunakan beberapa tes yang berbeda, dengan berbagai tingkat sensitivitas (kemampuan untuk mengidentifikasi sampel positif) dan spesifisitas (kemampuan untuk mengidentifikasi dengan benar sampel negatif). Salah satu tes umum disebut indirect fluorescence assay (IFA). Skema dari tes ini ditunjukkan pada Gambar 4.1. Singkatnya, ilmuwan menerapkan sel yang terinfeksi dengan virus Ebola. Mereka kemudian menambahkan serum (bagian cair dari darah, yang mengandung antibodi) dari pasien dan dibiarkan hingga kering. Ini adalah antibodi primer. Selanjutnya, mereka menambahkan antibodi sekunder, yang secara khusus akan mengenali antibodi manusia. Antibodi sekunder ini (yang sering berasal dari kambing) yang terkonjugasi (terkait) dengan protein yang disebut antibodi fluorescein. Ketika Ebola ini muncul, maka mereka akan mengikat virus atau partikel virus pada slide. Antibodi sekunder fluorescein maka akan mengikat antibodi primer. Para ilmuwan kemudian melihat slide di bawah neon melalui mikroskop. Sampel yang positif akan menyala hijau terang atau berwarna kuning (lihat Gambar 4.2). Satu masalah dengan IFA, bagaimanapun, adalah kenyataan bahwa kedua sensitivitas dan spesifisitas itu cukup rendah. Oleh karena itu, tes bisa kehilangan sampel yang positif, dan salah mengidentifikasi sampel yang negatif (ini masing-masing disebut
"negatif palsu" dan "positif palsu,"). Tes-tes lain didasarkan pada prinsip yang sama pada antigen, antibodi primer, sekunder dan antibodi nya. Namun, jenis protein yang terkonjugasi dengan antibodi sekunder, metode pengembangan, dan visualisasi memiliki hasil berbeda.
