IDENTIFIKASI FRAGMEN-FRAGMEN RAPD SPESIFIK TERKAIT TOLERANSI PADI (Oryza sativa L.) TERHADAP GULMA Echinochloa cruss-galli.

(1)

ID-ENTIFIKASI I'RACMEN-FRAGMEN RAPI'

SPf,

SIFIK

TERKATT

TOLE RAAS I

PAfi

\o,yz,

saliw

L)

TERBAD,AP

cULNt

t\

E.h,nochtoa

qr6s4alti

OLEg

SI'RYA EKO PI'TRA

05112003

FAI'I'LTAS PERTA]\IAN

I'NIWRSITAS _ANDAINS

(2)

TDI,NTTFII(A.SI

FRAGMEN.FRA(]MEN

RAPD

SItrSIfIK

'ITRXAIT

TOLERANSI PADI

(O'Jza

rztya

l--)

TERHADAP

CUL\IA

r..hino,

hloo

.tuss

to

t

ABSTRAK

P€nelnirn

tcnthg

idcnlinkasi fmshen

lr,gmen

tuld

snesifik rcrkait

fne.msi

lldi{arr}uz.\zh?

L.)

t..hdap

gulm

Frhinochlor

ctr$

g.llil,

1c1.\

dihksdatd di

l-abontoriuD Rioleknolo8i

d

Penulim

ld.ha.

ruruen BuJidala Pcrbriar lalulras

lendn

r

Uiv$sitas

Andala Padlns tenelnian di

nrlai dei

bulm

M&ct

sdrpai

Oktoler 2009

dens rujr

Mlul

m.nf;indenrilikasi liagnen liagben

lrne

didug! be*ailan dcngm rolc.ansr padi

La.rnap _su\n1aFahinochlod

ur$

s,l/i

dalan jral sifal alelopari _F.dilerhadap

Penclnid

l.rd

dri

cmpat lal3p yaknj holrsi DNA padj {iaD

/,.rr,,.r/o,

.r/.r]a,//t

l.

dcnge

henggDalm

prot,kol

Sashai

Md@l

(1984). $lcksj

F'ner

llAPD

lda

p@l DNA untul Dencari primer

ydgncngha\ilkr raslen

lcbih dari 5, seleksi priDer pad,

p,o/

DNA rolerm

dd

peka umuk mencri _nrimcr

]ana

ncnEhasilk

n€snen polnnorfik _Dada

rral

DNA rolcran dan sclcksi

indilidu

urul

nrcncdi fagnen spcsink.

Ddi

44

trincr yeg

disclcksi

ndla

2l

prine!

yoa

mcnghasilkdr lirgmen

dcngM

junlan

lcbih

dari

5.

Ke 2l

pnner discleki kcnbali

d€ngtu

mengsudrD

P,,/

DNA

loleD

da. peka sebagai DN,1 ledplar dln dip€rolen 5

pri,ner

ydln;

oPA

09,

oPEl8,

oPK-15. OpN-16

dm

Oly

20

yaa

rp:,sn6ilkd

polinorisne

pada

p,o/

DN]\

lolch

Kelina pnnrer tesebut hemudio dieuakm pada lahap sel€ki individn @tul nencdi EaEne. sFesink

pada genorip€ padi

tolm.

Kegiar rwbut b{hdil

menenuks

fmgE.n

sp,sifil dcnga

ul!fu

sckilar 800 bp y&g dihAilkm oleh

prin$

OPN- l 6

Kala

krnci

faEnen

R.1PD

tihi,ochtoa

mtad

i

L, po.]

DN/,

atekrpati,

(3)

,.PENI)AHULUA]t

r-r.l,rr,rl'.lrkang

Keh.dnrn

gul.

prda _{dcal tcnmanan}prdi m€nimbullr. man ah

€clm

la4sung yakni. konpcri\ixDttra padidcngm

gllna

unruk mcnpe(neh air, unsur

hara sena ime.siks

can.yr

Secara

tidlk

ldresuns

eulna

_{rr-qr dapat}nenjadi

inlns baei

hma

dan palosen renertu Oleh karena itu. dapar dikalaldr balNa gulma

nc.iadi

$lah

eru

hklr

l)cmhrlls poduksi

b.si

penandnan padi

Salah salu spesi.s _{eulna )ans}_lalinsbanval dlrenrui di

la\d

padi adahl

E.hin.thbo

truss

autti

a'atr lcbih dikcnal

dengd

nrD

jaiasoan. Jajasod

r.maruk gulna

edas

sctundcr aercsif

ydg

sulil

dik.ndjlikD

Pcnljang.n

s.cad drni

slh

dil.lukd

liarcna pada umnDDya

Dorlilogi

brad

t.di du

jal.sos

kdika

n6ih

n r

susah

dibedato s.tu

$nra

lain. Puba (200,1)

menyarala bah*a

ke.dpdh

l0

cgak

Ethituchloa

Ur\lqalj

padn

tcal

|]etudrn

i.di

I)er mr dapat teiadi p.nurunm

plduksi

sebesr

I

%. lada

kdapatan 60 r.ealan dapal LladipcDuruno ri.rgilandnnn padiscblsar 56.5 on. Pada uDUnDya tumbuhan rclah

nenilikj

suaru

nckmishe

perlindunsd lecendiri crtddap

ekmm

bioriL

nupu

!.biolit. BebeEpa b€ntuL mckmisne tc^cbor

mr,m

lain Bcnbcnirk

dui. .ell

dedth proaran- basian epidemns

randar

yes

ne4andunR lilin, hinaEa neDeiasiltd

*nrawr

dlsloliimta

ll6ilp€neljtia

trhdap

_{r00 senolipe}padiyansdiuji.

b$hail

mc.chllb

a,Luya empar _Bcn.tipepadi

yee

nDnlebrbLd penghdbabn penlnbuhan akd

Lthino.hloa

ottrAalli,.

50 %. Keenpal genolipc

l6cblt.dalah

Ccm!. l.uiu!

Badivoadih Kabalai,

K{Ema

B- (l3.

Smson den8an

nilai

pen.ktuh

p€numbuhm b€rturur

t!.ul

scb.s& 60.1502, 58-09%, 52,96%.

dd

50.01%

rrlradap konhol

yds

ditumbun](a

bcBmoe

dmg& gulha rers€bur (Chaiaso

Fcnonri.

dlelopati pala acDorifr pxdi

'e6ebul nenjadi

ispirasi

ndul

mer.lit

vdels

padi

y

eDeniliki

silal alelopati scb.eai

nckdisdd

_r€tuhman

r€rhadap gulm.

dmgd

pcmbne

kcDned lmg

lebih

llna

Untuk mencapai

rulub

reeb!!

l&gkah penarna

'!n3

(4)

pcnscndali silai alelopali sehinega nmrinyr d,iprl disisipkm ke

tal@m

p{li

S.lnh saru up.ya unrul menenrnkan ge.

tc

gcnd,li delopati adalai dcnear menssunakan penanda _nolekuler.Pada s.ar

ini.

p..dda

holekuler didgB.F

lebih

etiktil

dibandinshan dcnsan peraDdn noraologi

tmna

hdsil yana dip€roleh lehih spesifik

d..

\aktu

_{tang diFnukan}relariflcbih siiglar tdend

penodu

d,laluk

pada rjiAkar stJuklur DNr\.

Scinne _{dc.Cm berkcnbd8nya rclnoh)gi )ang}

brlaris

nrdka DNA mala

lilcrukm lisa

tipc

p.narda

molcktrlcr

dcngm

sesala

kel€bihm

dad

k.klm8mla.

l,enuda pemndn leBebur ad,lan :

(l)

Penarda

yss hcrdMkm

ketada bibndisrsi

DNA seFni llFl-P (Rdti.1nn

Ftas

cht

Lenglh

hr)norphtn),

(2)

li.a

nd^

yrs

berdaskan kepadr rcaksi bermrai polymeEsc

d.ngd

de.ggunalon sekuc.s

rrkle.tid!

sebaai p.imer

spcni

RAPD (RLnAo

.,lnptilel

Pob,ntphi.

r ,l) de

AFLP

tA,tpliieA [ragnr.nt

t.lngh

t'otnorph^n).

(l)

Penuda

-\,

₈

ncnCgMrld

pnnr

yans

mensg.bug*6

setucns komplemen spesifik {lalan DNA

sNrd

sepcni S1S (SxquchLe

ligEet

sl7rs), s(rARs

ft?qzcdzr

atu a.tetizcd

Antplilul Rqtl,u).

nu

SNPS _l,9,s/a

ihc tlot

il

P. ! _|norrhi

n,!)

\

irri.

2005 J

Penmda

I-AID

diswk

n

dalan pcn€lnian

ini kmna pe.dda

RAPD

s.cdr

lmum

h.miliki

kcurunsar

:

(l)

!im6

mudan diperol€h

dd

srd.Jr

b&yrk ymg

dibne^ilktui

(2)

Tid,l

nemqlutm

psr.ra

probes

(pr,r.r

r,nrdrt

r).

senyawa hdioaklif,

iradcr'roarrer,

: (3)

Rclail

du.irh dilakuke

'lerba

&n Maiad,

2008).

RAPD adalai

si{eh

penmda berbGis

DN,\

ydA

hcngguakan apliklsi PCR

Siftn

nn

p.i

loli

dikc'ultr

oleh

Willim

.r

,/

pada tanun 1980

(JaNdi.

2007). Prinsip dasd p€mda ini adalJr

drplitikEi

iasmen DNA

yes

b.rsiral

ronin

dmad

nenglabakan sru

d.u

dM

abtl,'r

prtrer yue

_lcrdin

ddi 8-10 nukleolid. Pmmda i-^PD

klrl

diguakm untul menmrulaD fFemen

rag

diduga teDaur denga tehnanm terhad.p ebrknose yang discbabro oleh

Q

tkrrnun

upliti

l.snjxta

w,timena Cuhdja, YusDl. As$dinoor dar

Su.

:002). nenentuke kem8dran Uon-klon

trd

_]ansren&n

dd

rolcrm te.hadap

(5)

V.

KESIMPI]LAN

DAN SARAN

5.t

(.siDpul,n

Dan

l€nelnis

_]anerelah

dilalukd nala

d.par diank kcsimpuln

balsa

sif

alclopali pada _{Fadi senoripe}

lolem

_{(Cempo Luiut}

dd

_BadiL/cadih_Kabrtai)

diduga

bdkaib

dengan

ketudnan fnghen

raA?D spcsitik yaDS

bctutuD

sekil$ 800 bp ymg dihasilkb olch pnner OPN 16 Kehadirar _{firgmen densd}

dod y

a sma

tada

lihjnbrhloa

jtss

Kulli senakjn ncmperkuat asunsi

bahwa

liasnen

tescbul mcnMg bertairs

_{dengM aletopali}_oteb

kena

Fahinochlaa Lr^s

sdlli

jDga

mcniliki

kcnmpun

urmk

nenshasilkm

S.2 Sar.tr

Polu dikaji

de

didalisis lcbih

lmjul

Mmk nemp€rolch

inlnmdi

_adeya

(6)

,\rdr

1939 I riu

(;ulm,I lDikktl

PidaDe

I

rrversiras ,\ndatas tB ha

'\rrai \,1 :045

lrernrntialan

Marl.h

Nloetuicr

Datani parscs PcDutiaan

t _ananan,/tn tnl )!:t o

llhg."

tlt)

16:,1

r1,/ emakerga.

R

l-croux. G D aid Sima.d. R

R

tqe5

Fitects otBenToic and

a nalnnji. ,^cjds

(tj

Memb(nePomeabllir On

Solb.n

t(us./rr,2//ry'

( _hthtLut

1...b!t

1

t)..1-

_1t5

Dr\FTr\R

PITSTAli

\

Anonim 2009

Baha

^jar

Biolo:i Molckuler

$$r\

,n5ocJ L

rlpr's..n Irj

SueaJnan. N,l, RdJli.ur. r\gisimanto. D drn Suyono t00,1 Va.asi G..erik padi

Tahan

Bli\

Berdasarkan Sldlk Jan

DNA

d.nga

Markal a;e.

Analog

t\.sislcn

.lrrral

l|bt.lr.bs

P.

arn t9(2J

t(

6l

(

lianirgo.l

_dan_lanisan_2i107_P.nggaLian_{Por. si.^tekrpar}pada _Tanamarl,adj

t(rtar

tur.

L)

Dtlam tlpal,a Mciiigkarkan

l)a!a

Sarnsoya tcrhadao

cllna

t..h

mhltu

ctu\\.eallt

L

Bexrv

lLapord

Hasit l,enetnjan

Fund,me.tall Padans !alaltasPenanian UDirersn.s Andatas

l)akhsin. K M I,1 _.lo),. (: L and

lftcrjil

1999

llliophtD

(rt(-.rrl.D.nt

rl

,1M

IIIlita

ldAnnMhbl:cr,/,:J'

Boca

Ra.rjn CRCtj.ss

ppI

t.l

Danrssalam.

R

2007

(a.akrerisasi

Morlologl

_{Beberapa Ccnolipe}_Caba

lca?idhr

d M)

Dan

Seleksi Primer

Unrlk

Analhis

Kekerabaun

lsknpsil

Padans FakultasPdanianUnllesiras Andalas

Diday.

RH.

WG

Yan

(AK.

Voldenhauer and Gravois

K A

l99R

',\lleloprthic Aclivily

ln

_{Rice For Conrolting Major Aquarj. Weedf. tn} AlbloValhf ht RtLt

Ma.ila

IntemalioratRice Rescarc| tnsriiute

pp

7 26

F.es. M M J . l-n,, I- _.Trancl. P J _.Wax. L

M aid

St.ller.

tiw

l99B AbroNn.

4n r-

LuJr,

t,,..1t. a ,.t

_-a

Crcsel.

J

2000

Molecular Diologtr

.l

Wecd

C.ntrot

.ti tldl

.l

tia"\ge,t.

nPvrth9

t

lt

1l,

Jansali

2AA1

Bk

.k

ol.gi

Pennl. l,tin:tp

Da.k

Dd,

Aptik.st A"dhns

t/o/.rrlcr

Riau UNRI

?res

J!ta,

/lMS.

Aswidnb,J

H

daD

Sa

o!,.

l)

1r'al

Deleksi

dai,\n!lir: