Modul Page 1
LANGKAH-LANGKAH MENDOWNLOAD, MENGISTAL DAN MENGGUNAKAN APLIKASI CHEMSKETCH
1. Langkah-langkah mendownload aplikasi Chemsketch
Awalnya buka link google.com dan masukkan kata kunci ”situs download chemsketch” kolom pencarian maka akan mencul tampilan sebagai berikut.
Kemudian klik “chemsketch download” seperti pada tanda panah.
Setelah mengklik, maka mencul tampilan sebagai berikut, kemudian klik free download
Modul Page 2
Setelah halaman terbuka, klik “download” maka akan mencul proses download seperti pada gambar dibawah ini.
Setelah mengklik download, maka akan mencul gambar untuk menyimpan file dan klik “star download” maka aplikasi mulai didownload seperti pada gambar di bawah ini dan tunggu sampai proses ini selesai.
Modul Page 3
Kemudian, setelah proses download telah selesai simpan file dan memulai proses penginstalan.
2. Cara Menginstal Aplikasi Chemsketch
Klik 2 kali file Chemsk11 yang telah selesai didownload, setelah mengklik maka akan muncul tampilan seperti pada gambar dibawah ini, dan klik “next” untuk memulai proses download.
Modul Page 4
Setelah klik “next” maka akan muncul jendela dialog instal lalu pilih ”I accept the terms in the license agreement”, kemudian pilih “next”.
Setelah itu, akan mencul jendela seperti pada gambar, maka klik lagi “next” untuk melanjutkan proses pengistalan.
Modul Page 5
Kemudian klik lagi “next” untuk melanjutkan pengistalan.
Proses selanjutnya, setelah muncul jendela baru klik instal pada kotak dialog.
Proses penginstalan telah berjalan, tunggu sampai selesai.
Modul Page 6
Kemudian klik “finish” untuk mengakhiri proses penginstalan.
3. Cara Menggunakan Aplikasi Chemsketch
Modul Page 7
Buka aplikasi chemskecth yang telah terinstal sebelumnya dengan cara buka tampilan dekstop, kemudian klik “star” dan pilih all program.
Setelah mengklik all program maka akan muncul tampilan seperti pada gambar dibawah ini, pilih folder Chemsketch dan klik folder Chemsketch.
Setelah klik folder Chemsketch, maka akan muncul tampilan seperti pada gambar dibawah ini. Berikut beberapa menu file dari Chemsketch yang penting untuk membuat struktur.
Modul Page 8
Hal yang harus diperhatikan sebelum melakukan yaitu:
1. Telah didapatkan struktur yang diinginkan
2. Menyimpan semua file dalam satu direktori kerja agar mudah untuk mencarinya.
Contohnya struktur steroid:
Dengan menggunakan aplikasi Chamsketch kita bisa merangkai secara manual dengan memanfaatkan beberapa menu file dari aplikasi ini, jadi kita bisa menggambarkan struktur steroid persis dengan gambar diatas.
Berikut hasil yang dibuat:
Modul Page 9
Struktur ligan yang dibuat dalam bentuk 2D dan akan diubah ke dalam bentuk 3D dengan cara klik “ACD/LABS”, kemudian mencentang “3D Viewer (Freeware).
Modul Page 10
Setelah itu, akan mencul tampilan seperti pada gambar dibawah ini.
Setelah itu copy struktur yang kita buat ke dalam 3D Viewer. Sebelumnya kembalikan tampilan struktur ke 2D dengan mengklik 1-Chemsketch seperti pada gambar dibawah ini.
Modul Page 11
Maka tampilan akan menjadi 2D. Kemudian klik 2-copy to 3D
Setelah itu, akan muncul gambar seperti dibawah ini.
Setelah selesai proses membuat struktur, simpan truktur yang selesai dibuat dengan mengklik file dan plih menu file klik save as.
Modul Page 12
Setelah mengklik save as, maka muncul tampilan seperti dibawah ini. Kemudian ubah isian pada kolom "Safe As Type” dengan “GIF Images”.
Kemudian langkah selanjutnya klik save pada tampilan.
Modul Page 13
Setelah itu, kita bisa lihat hasilnya pada folder penyimpanan.hasilnya seperti dibawah ini.
LANGKAH-LANGKAH MENDOWNLOAD, MENGINSTAL DAN
MENGGUNAKAN APLIKASI CHEMSKETCH
Modul Page 14 1. Langkah-Langkah Mendownload Aplikasi Chemsketch
Awalnya buka link google.com dan masukkan kata kunci “download marvinsketch” pada kolom pencarian, maka akan muncul tampilan sebagai berikut.
setelah situs terbuka, maka double klik untuk “marvinsketch-advanced chemical drawing software” yang ditunjuk arah panah.
setelah mengklik “marvinsketch-advanced chemical drawing software”, maka akan muncul tampilan seperti dibawah ini.Kemudian klik “DOWNLOAD”
Modul Page 15
Setelah itu, klik “softpedia secare download (US)” dan tunggu perintah selanjutnya.
Kemudian akan muncul tampilan seperti berikut, klik “start download”.
Modul Page 16
Kemudian akan muncul tampilan seperti dibawah ini dan klik “download marvin”.
Setelah muncul tampilan seperti di bawah ini, klik “I accept the lisence agreement”.
Modul Page 17
Setelah itu geser kursor kebawah hingga muncul tampilan “get archive”, namun sebelum itu ganti terlebih dlu angka pada kotak select archive version menjadi 6.0.0. Lalu klik menu “get archive” untuk menuju ke proses selanjutnya.
Kemudian akan muncul tampilan seperti dibawah ini (kotak pengisian).
Awalnya kita harus memiliki akun dan password
Modul Page 18
Kemudian isi kolom user name lalu isi
Jika belum memiliki akun, maka kita bisa membuat akun baru dengan cara klik “register” pada bagian bawah samping kiri, dan isi data yang diminta serta ikuti petunjuk selanjutnya.
Kemudian setelah terbuka halaman seperti dibawah ini, kita bisa klik “I angree”
untuk melanjutkan ke tahap berikutnya.
Modul Page 19
Selanjutnya isi tampilan dibawah ini sesui dengan apa yang diinginkannya.
Kemudian setelah selesai mengisi centang “I agree to the tema of servis” dan klik
“sumit”
Selanjutnya, kita akan menuju ketampilan berikutnya yaitu proses pemilihan tipe, seperti pada gambar, cari “marvinbeans-6.0.0_windows_jre.exe 224.7 mb”, kemudian klik pilihan tersebut maka akan muncul kontak pemberitahuan proses pengunduhan, jadi silahkan tunggu sejenak.
Modul Page 20
Kemudian akan muncul tampilan untuk memulai download aplikasi marvinsketch, klik star download untuk memulai mendownload aplikasi.
Proses download telah berjalan, tunggu sebentar sampai proses ini telah selesai.
Modul Page 21 2. Cara Menginstal Marvinsketch
Setelah proses pengunduhan selesai, buka file yang telah terinstal. Setelah terbuka, lakikan “double klik” pada file tersebut.
Kemudian muncul tampilan seperti dibawah ini bertanda aplikasi sedang memulai untuk menginstal.
Modul Page 22
Setelah muncul tampilan seperti dibawah ini maka klik next. Dan seterusnya klik next untuk melanjutkannya.
Proses dibawah ini mengakhiri proses penginstalan aplikasi Marvinsketch.
Modul Page 23 3. Cara Menggunakan Aplikasi Marvinsketch
Awalnya nyalakan komputer dan cari aplikasi marvinsketch yang telah terinstal.
Klik aplikasi marvinskrtch.
Kemudian, akan muncul lembar kerja seperti dibawah ini.
Modul Page 24
Cari struktur atau senyawa yang ingin di gambar pada tampilan ini. sebagai contoh senyawa flavonoid sebagai berikut:
Dengan menggunakan aplikasi Chamsketch kita bisa merangkai secara manual dengan memanfaatkan beberapa menu file dari aplikasi ini, jadi kita bisa menggambarkan struktur steroid persis dengan gambar diatas.
Berikut hasil yang dibuat:
Modul Page 25
Kemudian untuk mengubah dalam bentuk yang lebih menarik, kita bisa mengklik “view”
kemudian pilih “structure display”, kemudian klik “ball and stick”.
Kemudian struktur akan brubah seperti pada tampilan dibawah ini.
Langkah selanjutnya kita dapat menyimpan file dengan mengklik “file” kemudian klik save as.
Modul Page 26
Setelah muncul tampilan seperti dibawah ini, kita dapat memilih dimana file dapat disimpan ditempat yang aman dan mudah terjangkau.
Modul Page 27
LANGKAH-LANGKAH MENDOWNLOAD LIGAN DAN PROTEIN
Awalnya buka geogle.com kemudian ketik pdb.org pada kolom pencarian. Setelah muncul tampilan seperti berikut, klik “RCSB Protein Data Bank-RCSB PDB”.
Setelah mengklik “RCSB Protein Data Bank-RCSB PDB” maka akan muncul tampilan seperti dibawah ini.
Modul Page 28
Kemudian ketik ligan yang ingin dicari contohnya ligan “Steroid” pada kolom pencarian. Setelah mengketik ligan, klik “Go”dan perhatikan tanda panah dibawah ini.
Setelah itu akan muncul hasil pencarian berupa beberapa struktur senyawa steroid yang bisa digunakan, pilih beberapa ligan dari senyawa steroid yang ingin diambil.
Modul Page 29
Klik ”Download PDB File” seperti pada gambar dibawah ini dan simpan ditempat yang mudah dijangkau.
Setelah itu, muncul tampilan seperti dibawah ini dan klik oke pada gambar tersebut untuk memulai menyimpan file yang telah didownload.
Modul Page 30
Berikut hasil yang diperoleh.
