• Tidak ada hasil yang ditemukan

AppendixA.doc 51KB Jun 05 2011 09:30:47 PM

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2017

Membagikan "AppendixA.doc 51KB Jun 05 2011 09:30:47 PM"

Copied!
17
0
0

Teks penuh

(1)

Supplementary Material for:

MMFF VII.  Characterization of MMFF94, MMFF94s, and Other 

Widely Available Force Fields for Conformational Energies and 

for Intermolecular­Interaction Energies and Geometries. 

THOMAS A. HALGREN

Molecular Systems, Merck Research Laboratories, P.O. Box 2000, Rahway, NJ 07065

Appendix A: Experimental Conformational Energies for Set 1

     Table A.I lists some, but by no means all, of the experimental conformational energies that  are available for the comparisons in Set 1.  It also lists experimental uncertainties (a few of  which we estimated from data in the original report), indicates the type of quantity measured,  and specifies the method used.  When two or more experimental values are listed, the first is  used in the comparisons of conformational energies made in this paper.  As will be noted, in a  few instances we have chosen a different experimental value than the one we employed in our  earlier work.1  We also wish to point out that our earlier paper cited previous theoretical papers 

as the basis for the listed values, whereas we now give citations to the original literature.  For 

conformational Set 2, we adopted the experimental values cited by Gundertofte2 without further 

examination.

(2)

many incorrect experimental results.  This fact is established simply by noting the many 

instances in which alternative experimental values for the same conformational difference differ by many multiples of the stated uncertainty in either.  In such cases, both experimental results  cannot be correct (except possibly where strong medium effects are involved).

     Given that some of the listed experimental values are wrong, it is fair to ask how a choice  can be made.  One approach is to consider the reliability of the experimental technique.  Our  own, somewhat untutored, prejudice is for determinations based on spectroscopic intensities  measured as a function of temperature, either directly (indicated by "/T" in the table) or on  samples cryogenically deposited from different initial temperatures (indicated by "/cdT").  In  such cases, a plot of the logarithm of relative intensity vs. 1/T gives  directly.  Even this  technique, however, can give poor results, as the differences of more than 1 kcal/mol between  alternative experimental values determined in this way for 1,2­difluoroethane and for 2­

butanone attest.  We also favor determinations in which vibrational band progressions are used  to construct a complete torsional potential along a one­dimensional torsional coordinate.  In  these cases, differences between local minima then give E for that coordinate (though we call  this quantity 0 in recognition of the fact that the subsumed coordinates include zero­point and

thermal vibrational energy contributions), in close analogy to energy differences taken between  local minima on a force field or quantum mechanical energy surface.  Conversely, 

determinations based on conformationally averaged nmr chemical shifts or coupling constants  for which the isolated­conformer end­point values could not be measured directly seem to us  particularly prone to error.  

     The date of the measurement is also a factor, as we presume that more recent values are  more likely to be accurate, in part because of improved experimental technique but also because any substantial variation from previously published values is likely to have been closely 

(3)

Table III of the paper.  Given their general success in predicting the observed conformational  energies, we presume that these very high level quantum calculations are unlikely to be  seriously in error in any individual case.  To be sure, this choice minimizes the rms "error"  reported for GVB­LMP2  (cf. Table IV), and its use might seem to compromise our claim that  this method is the most accurate.  In point of fact, however, even selection of the 

conformational energies from Table A.I in worst agreement with the GVB­LMP2 results still  finds that it best reproduces the experimental data.  Moreover, we can think of no better  approach for dealing with cases in which discordant experimental values appear to have equal  claims to validity.  We had used much the same approach previously,1 but with 

"MP4SDQ(T)/TZP" calculations serving as the best reference values then available to us.

     The reasons underlying most choices reflected in the table should be apparent from the  foregoing.  Thus, we shall comment here only on a few cases.  One of these is 2­butanone,  where all the higher­level calculations in Table III, as well as several others we had previously  reported,1 clearly favor the lower, liquid­phase result.  A second case is 1,3­butadiene, where 

we had cited a gauche ­ trans conformational energy difference of 2.5 kcal/mol, this being the  average of values referenced by Wiberg et al.4  This value, as it happens, also corresponds to an 

often cited2,3b,5 but suspect early determination in which Carreira constructed a one­dimensional

torsional potential but used an erroneous torsional coordinate that incorrectly identified the  second, higher­energy conformer as being cis rather than gauche.22 The higher, more recent 

values20,21 shown in Table A.I seem to us preferable.  They are also consistent with the pattern 

(4)

     In the case of 1­butene, we had previously cited a conformational energy difference of 0.53  kcal/mol.1  We now realize, however, that this value is derived from the free­energy difference 

of 0.94 kcal/mol measured by Van Hemelrijk et al.65 by simply applying an entropic correction 

of R ln2 = 1.18 e.u. to allow for the two­fold statistical factor favoring skew.  However, the  looser skew conformation is also expected to have a higher vibrational entropy.  With this mind, we have applied the full entropic correction of 2.3 e.u. favoring skew found by Durig and  Compton64 to arrived at the value of 0.24 ± 0.42 kcal/mol listed in Table A.I.  This correction to

the measured G brings the derived value for  into line with Durig and Compton's value of  0.22 ± 0.02 kcal/mol and with the GVB­LMP2 result for E.

    The conformational energy difference for methyl vinyl ether is of particular interest.  We  ourselves had previously referenced the Sullivan, Dickson, and Durig value of 1.70 kcal/mol  favoring cis over skew.49  Friesner and co­workers,3b however, cited the earlier Durig and 

Compton difference of 1.15 kcal/mol,51 and worked intently to improve their theoretical 

methodology to reduce the large discrepancy with their higher LMP2/cc­pVTZ(­f) theoretical  estimate of 2.62 kcal/mol.6  They subsequently published a GVB­LMP2 result of 1.45 kcal/mol 

favoring skew.3b  However, calculations using the current version of Jaguar now find the 

conformational energy difference to be 2.14 kcal/mol (Table III, manuscript) when a rigorously  consistent protocol for lone­pair delocalization is employed in the localized MP2 calculation in  connection with improved grid and dealiasing functions.  Furthermore, we find that this value  falls to 1.61 kcal/mol when zero­point energy differences3a are taken into account.  This last 

estimate is fully consistent with the Sullivan, Dickson, and Durig result and with the enthalpy  difference of 1.59 kcal/mol obtained Beech et al.,50 the experimental result that caused Durig to 

reinvestigate this system and led him to raise his lower early estimate.  

     For the "simple" but conformationally critical gauche ­ anti conformational difference in n­ butane, we list what now appears to be a definitive value of 0.67 ± 0.10 kcal/mol.55  Also shown

(5)

0.75 kcal/mol value we had previously cited1 on the basis of Allinger, Yuh, and Li's 

recommendation.7  Much as in the case of methyl vinyl ether, both the new value and one of the 

earlier values it has superseded are by Durig and co­workers.  Unfortunately, Durig et al. do not  discuss the reasons for rejecting their higher earlier value.  However, they do cite a number of  other experimental determinations, made using a variety of methods, that agree with their lower  value of 0.67 kcal/mol.55  Other recent high­level quantum calculations8 also support this value, 

as does the GVB­LMP2/cc­pVTZ(­f) value of 0.72 kcal/mol cited in Table III of the  manuscript.  

     As an indication of the limitations of experimental data, we point out that the cis ­ trans  difference for methyl acetate is particularly tenuous: the listed G of 8.5 ± 1 kcal/mol represents the relative intensity of a single weak band in the infra­red carbonyl region that was observed in a sample cryogenically deposited from a temperature of 879 K and was thought to probably  arise from the cis conformer.14  Indeed, the original authors cite this conformational energy 

difference as being a , though this interpretation apparently assumes no entropy difference  between cis and trans conformers.  We think it remarkable that the theoretical values in Table  III of the manuscript agree with the experimental value

 

as well as they do, but caution that a  even a disagreement of 1 – 2 kcal/mol should not be viewed as indicative of a problem with the  theoretical calculation.

     Finally, we discuss two entries for which we had previously based our comparisons on free­ energy differences measured in solution.  First, we now list a single value of G = 1.15 

kcal/mol for the axial ­ equatorial difference in cyclohexyl amine rather than the previously  cited range of 1.1 ­ 1.8 kcal/mol.1  The reason for this change is that the larger values in the 

(6)

enthalpy difference of 0.58 kcal/mol found by Eliel and Gilbert in dilute nonpolar medium for  the model 4­t­butylcyclohexanol system;46 these authors criticized the consensus value of 0.52 

kcal/mol that Hirsch recommended for nonpolar solvents47 as being too low because it 

incorporates low values for early determinations that they believed to be unreliable. 

     Most other minor differences between the present data and that cited previously1 either reflect

(7)

TABLE A.I. ___________________________________________________

References for Experimental Conformational Energies (Set 1), in kcal/mol.

Conf. Comparisona    Expt.b Deltac Typed Methode Ref.

N­methylformamide, c ­ t 1.4 ? sol ir/cdT,

nmr/T

9

N­methylacetamide, c ­ t 2.3 2.8

? ?

sol sol

ir/cdT nmr/T

10

11

formic acid, trans ­ cis 3.90 ± 0.09 Ggp mw 12

glyoxylic acid, 

   (O=C­C=O t, O=C­O­H c)  ­ (O=C­C=O t, O=C­O­H t)

1.2 ± 0.5 Ggp mw 13

methyl formate, t ­ c 4.75 3.85

± 0.19  ± 0.20

gp

gp

ir/cdT ir/td

14

15

methyl acetate, t ­ c 8.5 ± 1  Ggp ir 14

ethyl formate, 

   (O=C­O­C c, C­O­C­C g)  ­ (O=C­O­C c, C­O­C­C a)

0.19 ± 0.06 Ggp  mw 16

propionaldehyde, sk ­ cis 0.67 1.03

± 0.03 ± 0.13

0

gp sol

ir,r/tp ir/T

17

18

2­butanone, skew ­ cis 1.07 2.02

± 0.10 ± 0.10

sol gp 

ir/T ir/T

19

19 1,3­butadiene, g ­ s­trans 2.89

2.75 2.5

? ± 0.07

?

ir,r/tp

ir/tp

20

21

22

2­methyl­1,3­butadiene, 

   gauche ­ s­trans 2.65 ?

0

gp ir,r/tp 23

acrolein, cis ­ trans 1.70 1.89

± 0.04 ± 0.11

gp

gp

ir/cdT uv/T

24

25

1,2­difluoroethane, a ­ g 0.56 0.80 1.98

± 0.1 ? ± 0.08

gp

Ggp  sol

ir/cdT nmr/cc

r/T

26

27

(8)

1,2­dichloroethane, g ­ a 1.08 1.09

± 0.10 ± 0.10

gp

gp ed/Tir

29

30

1­fluoropropane, a ­ g 0.35 0.47

± 0.03 ± 0.31

0

gp 

gp mw/Tir,r/tp

31

32

1­chloropropane, g ­ a 0.09 0.37 0.04

± 0.02 ± 0.03 ± 0.07

gp

0

gp

gp

ir/T ir,r/tp

mw

33

31

34

2­methoxytetrahydropyran,    (OCOMe g, OMe eq)   ­ (OCOMe g, OMe ax)

1.05 ? sol nmr/T 35

2,5­dimethyl­1,3­dioxane,

   (2 eq, 5 ax) ­ (2 eq, 5 eq) 0.92 ± 0.01

sol mCal 36

isopropylamine, 

   lp­N­C­H gauche ­ anti

0.45 0.12

? ± 0.02

gp

sol

ir,r/tp ir/T

37

38

cyclohexylamine, ax ­ eq 1.15 ? Gsol nmr 39

piperidine, ax ­ eq 0.53 ± 0.13 gp ir/T 40

N­methylpiperidine, ax ­ eq 3.15 ± 0.1 Ggp nmr 41

ethanol, gauche ­ anti 0.12 0.3, 0.5

0.7

± 0.01 ? ir/T

42

43

44

isopropanol, H­C­O­H a ­ g 0.28 ? Ggp mw 45

cyclohexanol, ax C1 ­ eq C1 0.58

0.52

± 0.02 ?

sol Gsol

nmr/T nmr

46

47

methyl ethyl ether, g ­ a 1.5 ± 0.2 gp ir/T 48

methyl vinyl ether, 

   C=C­O­C skew ­ cis 1.701.59

1.15

± 0.09 ± 0.08 ± 0.05

gp

gp

0 gp

r/T ir/cdT

ir,r/tp

49

50

51

diethyl ether, 

   (C­C­O­C a, C­O­C­C g)  ­ (C­C­O­C a, C­O­C­C a)

1.14 ± 0.05  sol ir/T 52

(9)

   ax C1 ­ eq C1 0.4 ± 0.05 Gsol nmr/cs 54

butane, gauche ­ anti 0.67 0.97 1.09 0.75

± 0.10 ± 0.05 ± 0.05 ± 0.25

gp  gp  0

gp  Ggp 

ir/T r/T ir,r/tp

ed

55

56

57

58

cyclohexane, 

   twist boat ­ chair 5.5 ?

sol,lT nmr/T 59

methylcyclohexane, ax ­ eq 1.75 ± 0.05 sol nmr/T 60

2,3­dimethylbutane,     H­C2­C3­H g ­ a

0.05 0.17

± 0.03 ?

cyclooctane, 

   D4d ­ Cs boat chair

1.9 ± 0.2 sol,lT nmr/T 62

cyclononane, 

   [255] C2 ­ [333] D3

1.0 ? sol,lT nmr 63

1­butene, cis ­ skew 0.22 0.07 0.24

± 0.02 ? ± 0.42

sol

gp

gp

r/T ir,r/tp ed/mw

64

64

65

2­butene, cis ­ trans 1.2 1.0

± 0.1 ?

gp

gp

mCal comb.

66

67

a In the conformational notation, idealized dihedral angles are: cis or c, 0°; trans, t, anti, or a, 

180°; gauche or g, 60°; and skew or sk, 120°.

b When more than one value for the conformational energy is cited, the first listed value is used 

in the comparisons in the body of this paper

c Error in measurement as cited by the authors or as explained in a note accompanying the 

literature citation.

d gp = gas phase; sol = solution or liquid­phase; superscript "0" in 0 denotes a difference 

(10)

e "r", "ir", "mw", "uv", nmr, and "ed" denote raman, infrared, microwave, ultraviolet, nuclear 

(11)
(12)

1.  T. A. Halgren and R. B. Nachbar, J. Comput. Chem., 17, 587­615 (1996).

2.  K. Gundertofte, T. Liljefors, P.­O. Norrby, and I. Petterssen, J. Comput Chem., 17, 429­449 

(1996).

3.  (a) R. A. Friesner, R. B. Murphy, M. D. Beachy, M. N. Ringnalda, W. T. Pollard, B. D. Duneitz, 

and Y. Cao, J. Chem. Phys., submitted (1998); (b) R. B. Murphy, W. T. Pollard, and R. A. Friesner, J. Chem. Phys., 106, 5073­5084 (1997).

4.  K. B. Wiberg, P. R. Rablen, and M. Marquez, J. Am. Chem. Soc., 114, 8654­8668 (1992).  

5.  (a) N. L. Allinger, F. Li, L. Yan, and J. C. Tai, J. Comput. Chem., 11, 868­895 (1990); (b) C. J. 

Casewit, K. S. Colwell, and A. K. Rappé, J. Am. Chem. Soc., 114, 10035­100046 (1992).  

6.  R. B. Murphy, M. D. Beachy, R. A. Friesner, and M. N. Ringnalda, J. Chem. Phys., 103, 1481­

1490 (1995). 

7.  N. L. Allinger, Y. H. Yuh, and J.­H. Lii, J. Am Chem. Soc., 111, 8551­8566 (1989).  See also N. 

L. Allinger and L. Yan, J. Am. Chem. Soc., 115, 11918­11925 (1993), and references therein.

8.  G. D. Smith and R. L. Jaffe. J. Phys. Chem., 100, 18718­18724 (1996). 

9.  Average of values in: S. Ataka, H. Takeuchi, and M. Tasumi, J. Mol. Struct., 113, 147­160 

(1984), and  F. A. L. Anet and M. Squillacote, J. Am. Chem. Soc., 97, 3243­3244 (1974). 

10.  S. Ataka, H. Takeuchi, and M. Tasumi, J. Mol. Struct., 113, 147­160 (1984).

11.  T. Drakenberg and S. Forsén, Chem. Commun., 1404­1405 (1971).  This result is from a 

difference in enthalpies of activation for isomerization in C2H4Cl2 as determined by nmr line­shape

analysis.

12.  W. H. Hocking, Naturforsch., 31a, 1113­1121 (1976).

13.  B. P. van Eijck and F. B. van Duijneveldt, J. Mol. Struct., 39, 157­163 (1977).

14.  C. E. Blom and Hs. H. Günthard, Chem. Phys. Lett., 84, 267­271 (1981).

15.  S. Ruschin and S. H. Bauer, J. Phys. Chem., 84, 3061­3064 (1980).

16.  J. M. Riveros and E. B. Wilson Jr., J. Chem. Phys., 46, 4605­4612 (1967). This quantity is 

(13)

difference, presumably corrected for the two­fold statistical factor favoring the C­O­C­C gauche  conformer; no later report on this measurement appears to have been made. 

17.  J. R. Durig, D. A. C. Compton, and A. Q. McArver,  J. Chem. Phys., 73, 719­724 (1980). 

18.  G. Sbrana and V. Schettino, J. Molec. Spectrosc., 33, 100­108 (1970). This value contributes to 

the composite value of 0.95 kcal/mol cited in ref. 1.  For other references, see: P. van Nuffel, L. van den Enden, C. van Alsenoy, and H. J. Geise, J. Mol. Struct., 116, 99­118 (1984).

19.  T. Shimanouchi, Y. Abe, and M. Makami, Spectrochim. Acta A, 24A, 1037­1053 (1968). 

20.  Y. N. Panchenko, A. V. Abramenkov and C. W. Bock, J. Mol. Struct., 140, 87­92 (1985). 

21.  J. R. Durig, W. E. Bucy, and A. R. H. Cole, Can. J. Phys., 53, 1832­1837 (1975).

22.  L. Carreira, J. Chem. Phys., 62, 3851­3854 (1975).    

23.  Y. N. Panchenko, V. I. Pupyshev, A. V. Abramenkov, M. Traetteberg, and S. J.  Cyvin, J. Mol. 

Struct., 130, 355­359 (1985). 

24.  C. E. Blom and A. Bauder, Chem. Phys. Lett., 88, 55­58 (1982).  Note that this value supersedes 

the earlier result of 1.6 kcal/mol obtained by C. E. Blom, R. P. Müller and Hs. H. Günthard, Chem.  Phys. Lett., 73, 483­486 (1980). 

25.  E. J. Bair, W. Goetz, and D. A. Ramsay, Can. J. Phys., 49, 2710­2717 (1971).  A note added in 

proof to this paper reports a correction, agreed to by the original authors, to the value of 2.00 ± 0.11 kcal/mol published by: A. C. P. Alves, J. Christoffersen, and J. M. Hollas, Mol. Phys., 20, 625­644  (1971); 21, 384 (1971).  

26.  P. Huber­Wälchi and Hs. H. Günthard, Chem. Phys. Lett., 30, 347­351.  This result and the cited 

uncertainty were obtained from the relative intensity vs. 1/T plots in Fig. 3.  The authors appear to  incorrectly label their determinations as G.  

27.  K. T. Hirano, S. Nonoyama, T. Miyajima, Y. Kurita, T. Kawamura, and H. Sato, J. Chem. Soc., 

Chem. Commun., 1986, 606­607. 

28.  W. C. Harris, J. R. Holtzclaw, and V. F. Kalasinsky, J. Chem. Phys., 67, 3330­3338 (1977).

(14)

30.  K. Tanabe, Spectrochim. Acta, 28A, 407­424 (1972).  An entropy difference calculated from 

symmetry numbers, moments of inertia, and vibrational frequencies was used to correct the  measured free­energy difference.

31.  J. R. Durig, S. E. Godbey, and J. F. Sullivan, J. Chem. Phys., 80, 5983­5993 (1984). 

32.  E. Hirota, J. Chem. Phys., 37, 283­291 (1962).

33.  W. A. Herrebout and B. J. van der Veken, J. Phys. Chem., 100, 9671­9677 (1996).  I thank Dr. 

Michael Beachy (Schrodinger) for supplying this reference. 

34.  K. Yamanouchi, M. Sugie, H. Takeo, C. Matsumura, and K. Kuchitsu, J. Phys. Chem., 88, 2315­

2323 (1984).  An entropy difference calculated from moments of inertia and vibrational frequencies was used to correct the measured free­energy difference of ­0.12 kcal/mol. 

35.  A. J. de Hoog, H. R. Buys, C. Altona, and E. Havinga, Tetrahedron, 25, 3365­3375 (1969).  

Position of the equilibrium as a function of temperature was determined from conformationally  averaged nmr coupling constants.

36.  R. M. Clay, G. M. Kelle, and F. G. Riddell, J. Am. Chem. Soc., 95, 4632 (1973).

37.  J. R. Durig, G. A. Guirgis, and D. A. C. Compton, J. Phys. Chem., 83, 1313­1323 (1979).

38.  P. J. Krueger and J. Jan, Can. J. Chem., 48, 3229­3235 (1970). 

39.  Average of values for nonpolar solvents cited in H. Booth and M. L. Jozefowicz, J. Chem. Soc., 

Perkins Trans. II, 895­901 (1976).

40.  R. W. Baldock and A. R. Katritzky, J. Chem. Soc. B, 1470­1477 (1968); see also R. A. Y. Jones, 

A. R. Katritzky, A. C. Richards, R. J. Wyatt, R. J. Bishop, and L. E. Sutton, J. Chem. Soc. B, 127­ 131 (1970).

41.  P. J. Crowley, M. J. T. Robinson, and M. G. Ward, Tetrahedron, 33, 915­925 (1977).  

Kinetically­controlled protonation was used to trap conformers in quaternary salt form for nmr  analysis.

42.  R. K. Kakar, and C. R. Quade, J. Chem. Phys., 72, 4300­4307 (1980). 

43.  J. R. Durig, W. E. Bucy, C. J. Wurrey, and L. A. Carriera, J. Phys. Chem., 79, 988­993 (1975).  

(15)

44.  H. L. Fang and R. L. Swofford, Chem. Phys. Lett., 105, 5­11 (1984).  Signal detection was by 

photoacoustic spectroscopy.

45.  E. Hirota, as cited in W. A. Lathan, L. Radom, W. J. Hehre, and J. A. Pople, J. Am. Chem. Soc., 

95, 699­703 (1973).  The reference to relative microwave intensities with no reference to 

temperature dependence suggests that this measurement is G, presumably corrected for the two­ fold statistical factor favoring the gauche conformer.  For the preliminary study, see: S. Kondo and  E. Hirota, J. Mol. Spectrosc., 34, 97­107 1970).  No follow­up study seems to have appeared.  

46.  E. L. Eliel and E. C. Gilbert, J. Am. Chem. Soc., 91, 5487­5495 (1969).  The cited value was 

measured for 4­t­butylcyclohexanol epimers equilibrated via Raney nickel catalysis.  

47.  J. A. Hirsch, in N. L. Allinger and E. L. Eliel, Eds., Topics in Stereochemistry, 1, 199­222 

(1967).  This often­cited value (cf. refs. 1, 2, 3b, and 5) is the free­energy difference Hirsch  recommends for nonpolar solvents, but has been criticized by Eliel and Gilbert46 as being too low 

because it averages in early determinations they believed to be unreliable. 

48.  T. Kitagawa and T. Miyazawa, Bull. Chem. Soc., Jpn., 41, 1976 (1968).

49.  J. F. Sullivan, T. J. Dickson, and J. R. Durig, Spectrochim. Acta, 42A, 113­122 (1986). 

50.  T. Beech, R. Gunde, P. Felder, and Hs. Günthard, Spectrochim. Acta., 41A, 319­339 (1985). 

51.  J. R. Durig and D. A. C. Compton, J. Chem. Phys., 69, 2028­2935 (1978).  Note that this value is

incorrect and has been superseded by the Sullivan, Dickson and Durig result.49  

52.  H. Weiser, W. G. Laidlaw, P. J. Kruger, and H. Fuhrer, Spectrochim. Acta, 24A, 1055­1089 

(1968).  The listed uncertainty of ± 0.05 reflects a purely subjective assessment on our part of the  data in Fig. 13 of this reference, and if anything is likely to be an overestimate.

53.  F. R. Jensen, C. H. Bushweller, and B. H. Beck, J. Am. Chem. Soc., 91, 344­351 (1969).  

54.  E. L. Eliel and E. C. Gilbert, J. Am. Chem. Soc., 91, 5487­5495 (1969).  This value was 

measured for 4­t­butylmethoxycyclohexane using conformationally averaged nmr chemical shifts.

55. W. A. Herrebout, B. J. van der Veken, A. Wang, and J. R. Durig, J. Phys. Chem., 99, 578­585 

(1995).  I thank Prof. Alex MacKerell (Univ. Maryland) for supplying this reference.

56.  A. L. Verma, W. F. Murphy, and H. J. Bernstein, J. Chem. Phys., 60, 1540­1544 (1974).

(16)

58.  R. K. Heenan and L. S. Bartell, J. Chem. Phys., 78, 1270­1274 (1983); W. F. Bradford, S. 

Fitzwater, and L. S. Bartell, J. Molec. Struct., 38, 185­194 (1977).  These papers are cited by 

Allinger et al.7 as the basis for the value and the uncertainty listed in this table.  

59.  M. Squillacote, R. S. Sheridan, O. L. Chapman, and F. A. L. Anet, J. Am. Chem. Soc., 97, 3244­

3246 (1975); this result uses data from: F. A. L. Anet and A. J. Bourn, J. Am. Chem. Soc., 89, 760­

768 (1967).

60. H. Booth and J. R. Everett, J. Chem. Soc., Perkin II, 255­259 (1980).

61.  T. L. Boates, thesis, Iowa State University, 1966, as cited by: E. J. Jacob, H. B. Thompson, and 

L. S. Bartell, J. Chem. Phys., 47, 3736­3753.  This value is reported as a G, but has been corrected

for the two­fold statistical factor in favor of the gauche conformer.   

62.  F. A. L. Anet and V. J. Basus, J. Am. Chem. Soc., 95, 4424­4426 (1973).

63.  F. A. L. Anet and J. Krane, Isr. J. Chem., 20, 72­83 (1980).  This result was measured by nmr 

line­shape analysis at ­145° and converted from G = 0.5 kcal/mol by using a force­field­calculated

S of 3.5 e.u.  Use of the MP2/6­31G* estimate of 4.33 e.u. for S (cf. ref. 1) would raise H by an

additional 0.1 kcal/mol.

64.  J. R. Durig and D. A. C. Compton, J. Phys. Chem., 84, 773­781 (1980).  We estimated the listed 

uncertainty of ± 0.02 kcal/mol from hand­drawn slopes for the five highest vs. four lowest  temperature points in Fig. 3 of this reference.

65.  D. Van Hemelrijk, L. Van den Enden, H. J. Greise, H. L. Sellers, and L. Schäfer, J. Am. Chem. 

Soc., 102, 2189­2195 (1980).  The listed H differs from the reported H of 0.53 kcal/mol because 

it uses Durig and Compton's measured S of 2.3 e.u. favoring skew (cf. ref. 64) to make the full  entropic correction (not just the symmetry­number correction of R ln2 = 1.18 e.u.) to the measured  free­energy difference of 0.94 kcal/mol.

66.  D. M. Golden, K. W. Egger, and S. W. Benson, J. Am. Chem. Soc., 86, 5416­5420 (1964). 

67. Heat of combustion value cited in, but not correctly referenced by: N. L. Allinger, F. Li, and L. 

Yan, J. Comput. Chem., 11, 848­867 (1990).  The value listed here is from heats of formation given 

(17)

Ibrahim, Z. A. Fataftah, P. von R. Schleyer, and P. D. Stout, J. Comput. Chem., 8, 1131­1138 

Gambar

TABLE A.I. ___________________________________________________References for Experimental Conformational Energies (Set 1), in kcal/mol.

Referensi

Dokumen terkait

Kesimpulan penelitian ini memperlihatkan bahwa strategi yang dilakukan oleh The Original Viking Fanshop melalui promosi Bus The Original Viking Fans Mobile Store

Keluhan yang sering muncul adalah adanya gangguan penglihatan karena katarak, rasa kesemutan pada tungkai serta kelemahan otot (neuropati perifer) dan luka

Hal ini menyebabkan timbulnya beberapa permasalahan dalam pengolahan data , sebagai contohnya sering terjadi kekeliruan dalam hal pemasukan data material proyek, lambatnya

Sehubungan telah dilaksanakan Seleksi Sederhana dengan Pascakualifikasi Belanja Modal Perencanaan Dan Pengawasan Jaringan : Pengawasan Pembangunan Instalasi Air Bersih di BBPK

Masa perikatan audit pada Kantor Akuntan Publik di Bandung yang terdaftar di BAPEPAM-LK dalam kondisi cukup baik, bisa dilihat dari hasil penelitian dari

Jabar menjadi Bank Pembangunan Daerah Pertama di Indonesia yang.. menjalankan dual banking system, yaitu memberikan layanan perbankan

ASYARAKAT pada jaman sekarang ini kurangnya kecintaan akan kebudayaan Indonesia dan juga banyak pengaruh dari negara luar sehingga kecintaan akan produk dalam

Mengingat dalam kegiatan Praktek Kerja Lapangan di PT Pos Indonesia wilayah Bandung ini sebagian besar kegiatan penulis adalah melayani konsumen, dimana semua