Mikrobiologi (AET 1203P)

(1)

Mikrobiologi

(AET 1203P)

(2)

Dosen Pengampu

1. Prof. Dr. Ir. Asmarlaili Sahar Hanafiah, MS, DAA

2. Prof. Ir. T. Sabrina, M.Sc., Ph.D

3. Ir. Hardy Guchi, MS

4. Dr. Lisnawita, S.P., M.Si.

5. Irda Safni, S.P., MCP, Ph.D (Koordinator)

6. Amelia Zulianti Siregar, S.Si., M.Sc., Ph.D

7. Mariani Sembiring, S.P., M.P,

(3)

Kelas _{Jadwal Kuliah} _{Jadwal Praktikum} _Dosen AEI 1 _{Jum’at 14.00-15.40 (Pustaka 2)} _{AET 1A: Senin 13.00-14.40 (lab)}

AET 1B: Kamis 10.00-11.40 (Lab)

LS / HG

AET 2 Jum’at 08.00-09.40 (Pustaka 4) AET 2A: Rabu 15.00-16.40 (Lab) AET 2B: Selasa 15.00-16.40 (Lab)

IS / TS

AET 3 Kamis 10.00-11.40 (Pustaka 4) AET 3A: Senin 10.00-11.40 (Lab) AET 3B: Senin 15.00-16.40 (Lab)

AZ / AS

AET 4 Jum’at 16.00-17.30 (Pustaka 2) AET 4A: Jum’at 08.00-09.40 (Lab) AET 4B: Kamis 08.00-09.40 (Lab)

MS / TS

AET 5 Jum’at 10.00-11.40 (117) AET 5A: Selasa 10.00-11.40 (Lab) AET 5B: Kamis 13.00-14.40 (lab)

(4)

Rencana Pembelajaran Semester (RPS)

I. Pengantar mikrobiologi: a. Pengertian

b. Ruang lingkup

c. Sejarah perkembangan

Bentuk pembelajaraan: ceramah, diskusi

II. Sistematika mikroorganisme: a. Klasifikasi

b. Taksonomi Poliphasic (Identifikasi dan deskripsi bakteri) Bentuk pembelajaran : ceramah, diskusi, tugas

III. Metode mikrobiologis :

a. Pengantar mikroskop dan pengenalan alat di laboratorium b. Isolasi, cara inokulasi, dan identifikasi mikroba

(5)

IV. Struktur dan fungsi sel mikroba: Archaea dan Bakteri: a. Pengecatan bakteri

b. Struktur dan fungsi sel.

Bentuk pembelajaran : ceramah, praktikum (LAB)

V. Struktur dan fungsi sel mikroba: Eukaryotik – Protista dan Jamur a. Mikroskop dan morfologi sel

b. Struktur dan fungsi sel

Bentuk pembelajaran : ceramah, praktikum (LAB)

VI. Virologi:

a. Pengenalan virus

b. Klasifikasi virus (kisaran inang, ukuran, struktur, siklus hidup) Bentuk pembelajaran: ceramah, praktikum (RUANG KELAS)

(6)

VII. Pertumbuhan populasi mikroba:

a. Konsep pertumbuhan populasi, kurva pertumbuhan b. Pengukuran pertumbuhan mikroorganisme:

- Secara langsung: Plate counts, Filtration, MPN, Direct microscopic count

- Secara tidak langsung : Turbidity, Aktifitas mikroorganisme, berat kering Bentuk pembelajaran : ceramah, praktikum (RUANG KELAS)

VIII. Pertumbuhan populasi mikroba (lanjutan): a. Pembelahan sel bakteri

b. Pertumbuhan populasi

Bentuk pembelajaran: ceramah, praktikum (LAB)

IX. Metabolisme mikroorganisme:

a. Sekilas tentang metabolisme, katabolisme, anabolisme, ATP,serta reaksi oksidasi-reduksi

b. Sintesis ATP

(7)

X. Nutrisi dan kultur mikroorganisme: a. Nutrisi dan kimia sel

b. Media kultur dan kultur di laboratorium (NA, PDA) Bentuk pembelajaran: ceramah, praktikum (LAB)

XI. Keragaman mikroorganisme: a. Bakteri Prokaryota

Bentuk pembelajaran: tugas dan presentasi

XII. Keragaman mikroorganisme (lanjutan):

a. Archaea Prokaryota (Extremely halophilic Archaea, Methane-producing Archaea, Hyperthermophilic Archaea)

b. Mikroorganisme Eukaryota (Algae, Jamur, Protozoa, Lumut) Bentuk pembelajaran: tugas dan presentasi

(8)

XIII. Genetika mikroorganisme:

a. Struktur genom dan informatika genetika b. Struktur dan replikasi DNA; PCR

c. Konsep gen

d. Struktur dan ekspresi gen

Bentuk pembelajaran: ceramah, praktikum (RUANG KELAS)

XIV. Genetika mikroorganisme (lanjutan): a. Perpindahan mikroba

Bentuk pembelajaran: ceramah, diskusi, tugas

XV. Peran mikroba di alam: Ekologi mikroba dan Mikrobiologi lingkungan: a. Teknik pada ekologi mikroorganisme

b. Habitat mikroorganisme c. Simbiosis mikroorganisme

(9)

XVI. Peran mikroba di alam: Aplikasi mikrobiologi dalam bidang pertanian dan bioteknologi:

a. Penggunaan mikroba sebagai pengendali hama dan penyakit tumbuhan;

Plant Growth Promoting Rhizobacteria (PGPR)

b. Mikroorganisme pada pengelolaan masalah lingkungan (Bioremediasi) c.Penggunaan pupuk hayati berbasis mikroorganisme

(10)

KULIAH I

(11)

PENGERTIAN

Mikrobiologi Mikro = kecil Bio = hidup Logos = ilmu Arthropoda Cacing Protozoa Jamur Virus Bakteri Mikroba

(12)

• Mikroorganisme adalah organisme hidup yang

pertama kali di planet bumi, hidup di mana pun

selama kehidupan memungkinkan, lebih banyak

dibandingkan organisme lain, dan mungkin

penyusun terbesar komponen biomasa bumi

• Mikrobiologi mempunyai imbas terhadap banyak

bidang di antaranya kedokteran, pertanian, ilmu

pangan, ekologi, genetika, biokimia, dan biologi

molekuler

(13)

Mikroorganisme & Mikrobiologi

• Mikroorganisme

• Mikrobiologi



Makhluk hidup yang secara

individual sangat kecil untuk

dilihat dengan mata telanjang.



Yang termasuk

mikroorganisme:

–

Bakteri (eubacteria,

archaebacteria)

–

Jamur (yeasts, molds)

–

Protozoa

–

Microscopic algae

–

Virus

–

Berbagai cacing parasit

(nematoda)

 Ilmu yang mempelajari tentang miroorganisme

 Dasar dari Bioteknologi modern

 Berbagai cabang ilmu mikrobiologi:

 - Virologi, Mikologi, Bakteriologi, Immunologi,

Ekologi Mikroba, Biotechnologi, Mikrobiologi Lingkungan,

Mikrobiologi Makanan, Mikrobiologi Forensik, Biologi Molekuler

(14)

Cakupan Mikrobiologi

Mikrobiologi Umum : mempelajari sifat mikroba pada umumnya

Mikrobiologi Kedokteran : Mempelajari mikroba yg berhubungan dgn penyakit pd manusia

Mikrobiologi pertanian : Mempelajari mikroba yg berhubungan dgn penyakit tanaman & hewan, serta kesuburan tanah

Mikrobiologi Industri : Mempelajari mikroba yg berhubungan dgn kegiatan industri

Mikrobiologi Makanan & susu : Mempelajari mikroba yg berhubungan dgn pembuatan & pengawetan makanan

(15)

Mikrobiologi

Dua tema utama yang berhubungan dengan mikrobiologi

1-

Dasar

– proses sel

2-

Terapan

- berhubungan dengan pertanian, industri dan

kesehatan

(16)

Mikroba dalam

kehidupan kita

• Ada yang bersifat patogenik (penyebab penyakit)

• Mendekomposisi sampah organik

• Menghasilkan fotosintesis (cth. Bakteri Sulfur Ungu (

Purple

sulphur bacteria

) harus memperbaiki CO

₂

untuk hidup)

• Memegang peranan di bidang industri (cth. fermentasi untuk

menghasilan etanol and acetone)

• Menghasilkan makanan berfermentasi (cuka, keju & roti)

• Menghasilkan produk yang digunakan pabrik (sellulase) dan

(17)



Mikroba dan makanan

1) Mencegah pembusukan (tempe, ikan asin)

2) Membantu dalam menghasilkan makanan

(18)



Mikroba dan energi

1) Gas alam (methane)

2) Ethanol (biofuel)

(19)



Mikroba dan masa depan

1) Bioteknologi (produksi makanan, obat-obatan,

vaksin)

2) Teknik Genetika

(rekombinasi DNA)

(20)

(21)

Dasar sejarah mikrobiologi



_{Penemuan-penemuan terkenal, di antaranya :}



_Mikroskop



Metode ilmiah



Pengembangan mikrobiologi kedokteran

(22)

Periode Perkembangan Mikrobiologi

(3 periode)

1. Periode perintis/zaman pra sejarah, teori

abiogenesis /

generatio spontanea,

mahluk

hidup terjadi dari benda mati (air, daging)

(23)

2. Periode keemasan,

– Robert Koch (1881), metoda isolasi (pemisahan)

– Petri (asisten Koch), penemu cawan petri

– Gram (1844), penemu teknik pewarnaan Gram

– Chamberland (1887), penemu sterilisasi secara fisik,

metode filter

(24)

Anthony van Leeuwenhoek

(1632-1723)



Pedagang kain dari

Belanda



Orang pertama yang

mengobservasi mikroba

hidup



Menemukan lensa

tunggal dengan

magnifikasi sampai

300X

Insert figure 1.8

(25)

Insert figure 1.9 (a)

(26)

Robert Koch

(1843-1910)



Menemukan Teori

Postulat

Koch

-

suatu eksperimen yang

membuktikan Teori Penyebab

penyakit (

Germ Theory of

Disease

).



Mengidentifikasi penyebab

anthrax, TBC, dan kolera.



Mengembangkan Metode

Kultur Murni.

(27)

Louis Pasteur

(1822-1895)



Menunjukkan mikroba

menyebabkan fermentasi dan

pembusukan.



_{Mematahkan pendapat}

generatio spontanea

mikroorganisme (teori

Abiogenesis).



Mengembangkan Pasteurisasi.



Menemukan Teori Penyebab

Penyakit (

Germ Theory of

Disease

).

(28)

Periode Keemasan menjawab

4 masalah pokok

1). Penggolongan mikroba: mikroskop, bentuk

mikroba ditemukan yaitu bakteri, jamur, virus

2). Asal-usul mikroba : Louis Pasteur, merobohkan

teori abiogenesis, dengan penemuan teori

biogenesis bahwa jasad renik berasal dari jasad

renik induknya

(29)

3). Penyebab mikroba penyebab penyakit

dijawab oleh Postulat Koch

4). Mikroba pada fermentasi anggur dijawab

oleh hasil riset L. Pasteur

(30)

3. Periode modern (1910 – sekarang),

– Adanya peralatan modern/mutakhir, mikroskop

elektron, khromatografi, komputer, autoclave dll

– Masalah yang pelik dapat dipecahkan, virus

– Pasteur dan Koch sudah mulai melakukan penelitian

tentang virus

– Iwanowski (1892), mengungkap masalah virus, TMV

(tobacco mosaik virus)

– Peraih nobel,

• Domagk (1939) penemu obat sulfa utk infeksi bakteri, • Fleming, Florey &Chain (1945) penemu penisilin

• Waksman (1952), penemu streptomisin • Stanley (1946), penemu protein murni virus