i SKRIPSI
ANALISIS KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan
Dendrobium crumenatum)
Oleh : INDAH DEWI M.J
H 0709056
PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI
FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS SEBELAS MARET SURAKARTA
ii
ANALISIS KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan
Dendrobium crumenatum)
SKRIPSI
untuk memenuhi sebagian persyaratan guna memperoleh (derajat) Sarjana Pertanian di Fakultas Pertanian Universitas Sebelas Maret
Surakarta
Oleh : Indah Dewi M.J
H0709056
PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI
FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS SEBELAS MARET SURAKARTA
iii SKRIPSI
ANALISIS KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan
Dendrobium crumenatum)
Indah Dewi M.J H0709056
Surakarta, 2016
Universitas Sebelas Maret Surakarta Fakultas Pertanian
Dekan
Prof. Dr. Ir. Bambang Pudjiasmanto, M.S NIP. 195602251986011001
Pembimbing Utama Pembimbing Pendamping
Dr. Ir. Sri Hartati, M.P Dra. Linayanti Darsana, M.Si
iv SKRIPSI
ANALISIS KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR
(Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum)
yang dipersiapkan dan disusun oleh Indah Dewi M.J
H0709056
telah dipertahankan di depan Tim Penguji
pada tanggal: 2016 dan dinyatakan telah memenuhi syarat untuk
memperoleh gelar (derajat) Sarjana Pertanian Program Studi Agroteknologi
Susunan Tim Penguji :
Ketua Anggota I Anggota II
Dr. Ir. Sri Hartati, M.P Dra. Linayanti Darsana, M.Si Dr. Ir. Parjanto M.P NIP. 195705201980032002 NIP. 195207111980032001 NIP.196203231988031001
v
PERNYATAAN
Dengan ini saya Nama: Indah Dewi M.J, NIM: H0709056, Program Studi Agroteknologi, menyatakan bahwa dalam skripsi saya yang berjudul “ANALISIS KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum)” ini tidak terdapat karya yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar akademik dan sepanjang pengetahuan penulis juga tidak ada unsur plagiarisme, fabrikasi karya, data atau pendapat yang pernah ditulis dan dipublikasikan oleh penulis lain kecuali yang secara tertulis diacu dalam naskah ini dan disebutkan dalam daftar pustaka.
Surakarta, 2016 Yang menyatakan
Indah Dewi M.J H0709056
vi
KATA PENGANTAR
Segala Puji bagi Allah SWT atas segala limpahan rahmat-Nya kepada penulis sehingga penyusunan skripsi ini dapat terselasaikan dengan baik tanpa halangan yang berarti. Penulis sadari bahwa dalam penyusunan skripsi ini tidak terlepas dari bantuan berbagai pihak. Oleh karena itu penulis sampaikan terimakasih kepada:
1. Prof. Dr. Ir. Bambang Pudjiasmanto, MS selaku Dekan Fakultas Pertanian Universitas Sebelas Maret Surakarta
2. Prof. Dr. Ir. Hadiwiyono, M.Si selaku Ketua Program Studi Agroteknologi Fakultas Pertanian Universitas Sebelas Maret Surakarta.
3. Dr. Ir. Sri Hartati, MP selaku Pembimbing Utama yang dengan sabar memberikan saran, pengarahan, bimbingan dan bantuan biaya penelitian kepada penulis sehingga skripsi ini dapat diselesaikan.
4. Dra. Linayanti Darsana, M.Si selaku Pembimbing Pendamping yang telah memberikan pengarahan, bimbingan dan motivasi sehingga skripsi ini dapat diselesaikan
5. Dr. Ir. Parjanto MP selaku Dosen Pembahas yang telah memberikan masukan dan saran pada skripsi ini.
6. Prof. Dr. Ir Sulandjari, MS selaku Pembimbing Akademik yang telah memberikan bimbingan dan pengarahan akademik.
7. Keluarga tercinta, Bapak Subiyanto S.Pd, Ibu Nurul Hidayah, Kakak Novi Farida Nurjannah S.Pd M.Pd, Adik Rizky Setyo Nurahmadi atas doa dan dukungannya baik yang bersifat moril maupun materil.
8. Teman-teman Agroteknologi 2009 yang telah membantu dan mendukung penulis selama penelitian dan penyusunan skripsi.
9. Semua pihak yang telah membantu dan mendukung penulis selama penelitian dan penyusunan skripsi
Penulis menyadari bahwa dalam penulisan skripsi ini masih jauh dari sempurna, oleh karena itu kritik dan saran yang bersifat membangun sangat diharapkan
vii
Akhir kata, semoga skripsi ini dapat bermanfaat bagi yang berkepentingan dan pembaca pada umumnya.
Surakarta, 2016
viii DAFTAR ISI
Halaman
KATA PENGANTAR ... vi
DAFTAR ISI ... viii
DAFTAR TABEL ... x
DAFTAR GAMBAR ... xi
DAFTAR LAMPIRAN ... xii
RINGKASAN ... xiii SUMMARY ... xiv I. PENDAHULUAN ... 1 A. Latar Belakang ... 1 B. Rumusan Penelitian ... 2 C. Tujuan Penelitian ... 3 D. Hipotesis Penelitian ... 3
II. TINJAUAN PUSTAKA ... 4
A. Klasifikasi Anggrek ... 4
B. Kromosom ... 7
C. Kariotipe ... 12
III. METODE PENELITIAN ... 14
A. Waktu dan Tempat Penelitian ... 14
B. Bahan dan Alat ... 14
C. Cara Kerja Penelitian ... 14
D. Variable pengamatan ... 15
E. Analisis Data ... 16
IV. HASIL DAN PEMBAHASAN ... 18
A. Jumlah Kromosom ... 18
B. Ukuran Kromosom ... 21
C. Bentuk Kromosom ... 22
ix DAFTAR ISI
(Lanjutan)
V. KESIMPULAN DAN SARAN ... 27
A. Kesimpulan ... 27
B. Saran ... 27
DAFTAR PUSTAKA ... 28
x
DAFTAR TABEL
Nomor Dalam Teks Halaman
1 Bentuk Kromosom Berdasarkan Rasio Lengan Kromosom ... . 15 2 Jumlah Kromosom Anggrek Alam Jawa Timur ... . 18 3 Ringkasan Kisaran Panjang Total Kromosom Anggrek Alam Jawa Timur (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium
crumenatum)………. ……… 21 4 Bentuk Kromosom dan Pola kariotipe Anggrek Alam Jawa Timur
(Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum). ... 23 5 Nilai Indeks Asimetri Intrakromosomal (A1) dan Indeks Asimetri Interkromosomal (A2) Anggrek Alam Jawa Timur (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum)………. 26
Dalam Lampiran
1 Ukuran dan Bentuk Kromosom Anggrek Paphiopedilum glaucophyllum ... ... 32 2 Ukuran dan Bentuk Kromosom Anggrek Coelogyne speciosa ... 33 3 Ukuran dan Bentuk Anggrek Dendrobium crumenatum ... 34
xi
DAFTAR GAMBAR
Nomor Dalam Teks Halaman
1 Anggrek Paphiodilum glaucophyllum ... 5
2 Anggrek Coelogyne speciosa ... 6
3 Anggrek Dendrobium crumenatum ... 7
4 Kromosom Anggrek Paphiodilum glaucophyllum ... 19
5 Kromosom Anggrek Coelogyne speciosa ... 19
6 Kromosom Anggrek Dendrobium crumenatum ... 20
7 Kariogram Paphiodilum glaucophyllum ... 24
8 Kariogram Coelogyne speciosa ... 24
9 Kariogram Dendrobium crumenatum ... 25
10 Idiogram Paphiodilum glaucophyllum ... 25
11 Idiogram Coelogyne speciosa ... 25
12 Idiogram Dendrobium crumenatum ... 26
Dalam Lampiran 1 Pemotongan akar ... 35
2 Ujung Akar Paphiopedilum glaucophyllum ... 35
3 Ujung Akar Coelogyne speciosa ... 36
xii
DAFTAR LAMPIRAN
Nomor Judul Halaman
1 Tabel1. Ukuran dan Bentuk Kromosom Anggrek Paphiopedilum
glaucophyllum ... 32
2 Tabel 2. Ukuran dan Bentuk Kromosom Anggrek Coelogyne speciosa ... 33
3 Tabel 3. Ukuran dan Bentuk Anggrek Dendrobium crumenatum ... 34
4 Gambar 1. Pemotongan akar ... 35
5 Gambar 2. Ujung Akar Paphiopedilum glaucophyllum ... 35
6 Gambar 3. Ujung Akar Coelogyne speciosa ... 36
xiii RINGKASAN
ANALISIS KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum).Skripsi : Indah Dewi M.J (H0709056). Pembimbing Sri Hartati, Linayanti Darsana, Parjanto. Program Studi: Agroteknologi, Fakultas Pertanian Universitas Sebelas Maret (UNS) Surakarta.
Anggrek Alam yang ada di Jawa Timur populasinya sangat beragam, namun jumlahnya di habitat asli sangat terbatas. Pemuliaan tanaman dapat digunakan untuk melestarikan dan membudidayakan tanaman anggrek. Salah satu faktor yang mendukung keberhasilan pemuliaan tanaman dengan mengetahui informasi genetik. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui informasi genetik berupa jumlah, bentuk, ukuran, dan kariotipe kromosom. Diharapkan dengan adanya informasi genetik tersebut dapat digunakan sebagai dasar dalam pemuliaan tanaman untuk mendapatkan varietas unggul dan perbaikan sifat tanaman.
Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Oktober 2015 - Februari 2016 di Laboratorium Fisiologi dan Bioteknologi Fakultas Pertanian Universitas Sebelas Maret Surakarta. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah metode squash (pencet) pada ujung akar tanaman anggrek. Metode squash dilakukan
dengan beberapa tahap meliputi: Pra-perlakuan selama 24 jam dengan 8-Hydroxyquinoline 0,002 M pada suhu 6ºC, Fiksasi dengan asam acetat glacial
45% selama 2 jam, hidrolisis dengan larutan HCL 1N di dalam oven suhu 65ºC selama 3 menit, Pewarnaan larutan aceto orcein 2% selama 24 jam, dilanjutkan squashing dan penyegelan. Pengamatan dilakukan dengan mikroskop cahaya. Variabel yang diamati adalah jumlah kromosom, ukuran kromosom, bentuk kromosom dan kariotipe kromosom. Data hasil pengamatan dianalisis secara deskriptif berdasarkan pengamatan dari gambar kromosom hasil pemotretan dan data pengamatan ukuran dan bentuk kromosom.
Hasil penelitian menunjukkan Anggrek Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum memiliki kesamaan jumlah kromosom yaitu n = 19 dengan 2n=38. Anggrek P. glaucophyllum memiliki ukuran kromosom 4.26 ± 014 sampai 9.73 ± 019 µm. Anggrek C. speciosa memiliki ukuran kromosom 0.35 ± 0.03 sampai 6.30 ± 0.84 µm. Anggrek D. crumenatum 2.46 ± 0.20 sampai 5.33 ± 0.02 µm. Bentuk kromosom Anggrek P.glaucophyllum, C.speciosa dan D.crumenatum dominan metasentrik. Susunan pola kariotipe Anggrek P.glaucophyllum adalah 2n = 38 m, C.speciosa adalah 2n = 36 m + 2 ak dan D. crumenatum adalah 2n = 38 m.
xiv SUMMARY
ANALYSIS CHROMOSOMES ON EAST JAVA-NATURAL ORCHIDS (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa and Dendrobium crumenatum). Thesis: Indah Dewi M.J (H0709056). Consultant: Sri Hartati, Linayanti Darsana, Parjanto. Agrotechnology Study Program, Agricultural Faculty of Surakarta SebelasMaret University (UNS).
Natural Orchid existing in East Java has very diverse population, but its number in original habitat is very limited. Plant breeding can be used to conserve and to breed orchid plant. One factor supporting a successful plant breeding by find out genetic information. This research aimed to find out genetic information constituting number, form, size, and chromosome karyotype. The presence of genetic information is expected to be used as the foundation in plant breeding in order to get superior variety and to improve the properties of plant.
This research was conducted on October 2015 to February 2016 in Physiological and Biotechnological Laboratories of Agricultural Faculty of Surakarta Sebelas Maret University. The method employed in this research was squash method in the root tip of orchid plant. Squash method was conducted in some stages included: Pre-treated for 24 hours with 8-Hydroxiquinoline 0,002 M at temperature of 6° C, fixed with glacial acetic acid of 45% for 2 hours, hydrolysis with HCL 1 N in oven at 65oC for 3 minutes, coloring with acetoorcein solution 2% for 24 hours, followed with squashing and sealing. Observation was conducted using light microscope. The variables observed included: chromosome number, chromosome size, chromosome size, and chromosome karyotype. The data obtained from the result of observation was analyzed descriptively based on observation on chromosome picture resulting from portraying, and chromosome size and form.
The result of research showed that Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa and Dendrobium crumenatum orchids had chromosome number similarity, n = 19, with 2n = 38. P. glaucophyllum orchid had chromosome size ranging between 4.26 ± 014 and 9.73 ± 019 µm. C. speciosa
orchid had chromosome size ranging between 0.35 ± 0.03 and 6.30 ± 0.84 µm. D. crumenatum orchid had chromosome size ranging between 2.46 ± 0.20 and
5.33 ± 0.02 µm. The chromosome form of P. glaucophyllum, C. speciosa and D.crumenatum orchid was dominantly metacentric. Karyotype pattern structure of P. glaucophylum orchid was 2n = 38 m, C. speciosa was 2n = 36 m + 2 ak and D. crumenatum was 2n = 38 m.