UJI DIAGNOSTIK
GENEXPERT
MTB/RIF
DI RUMAH SAKIT UMUM PUSAT HAJI ADAM MALIK
MEDAN
TESIS
Oleh
ELVA SUSANTY
NIM 117027008
MAGISTER ILMU KEDOKTERAN TROPIS
FAKULTAS KEDOKTERAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
MEDAN
UJI DIAGNOSTIK
GENEXPERT
MTB/RIF
DI RUMAH SAKIT UMUM PUSAT HAJI ADAM MALIK
MEDAN
TESIS
Diajukan sebagai salah satu syarat untuk memperoleh Gelar Magister dalam Program Studi Magister Ilmu Kedokteran Tropis pada Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara
Oleh
ELVA SUSANTY
NIM 117027008
MAGISTER ILMU KEDOKTERAN TROPIS
FAKULTAS KEDOKTERAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
MEDAN
HALAMAN PERNYATAAN ORISINALITAS
Tesis ini adalah hasil karya penulis sendiri,
dan semua sumber baik yang dikutip maupun dirujuk penulis
nyatakan dengan benar.
Nama
NIM
Tanda Tangan
:
:
:
ELVA SUSANTY
HALAMAN PERNYATAAN PERSETUJUAN PUBLIKASI KARYA
ILMIAH UNTUK KEPENTINGAN AKADEMIS
Sebagai sivitas akademik Universitas Sumatera Utara, saya yang bertanda tangan di bawah ini:
Nama
NIM
Program Studi
Jenis Karya :
:
:
:
ELVA SUSANTY
117027008
Magister Ilmu Kedokteran Tropis Fakultas Kedokteran
Tesis
demi pengembangan ilmu pengetahuan, menyetujui untuk memberikan kepada Universitas Sumatera Utara Hak Bebas Royalti Non-eksklusif (Non-exclusive Royalty Free Right) atas tesis saya yang berjudul:
UJI DIAGNOSTIK GENEXPERT MTB/RIF
DI RUMAH SAKIT UMUM PUSAT HAJI ADAM MALIK MEDAN
beserta perangkat yang ada (jika diperlukan). Dengan Hak Bebas Royalti Non-eksklusif ini, Universitas Sumatera Utara berhak menyimpan, mengalihmedia/formatkan, mengelola dalam bentuk database, merawat, dan mempublikasikan tesis saya tanpa meminta izin dari saya selama tetap mencantumkan nama saya sebagai penulis dan sebagai pemilik hak cipta.
Demikian pernyataan ini saya buat dengan sebenarnya.
Dibuat di : Medan
Pada tanggal :
Yang menyatakan
DAFTAR RIWAYAT HIDUP
Nama
Tempat/Tanggal Lahir Pekerjaan
Elva Susanty
Lima puluh, 7 Oktober 1978
Dokter PNS Depkes Kabupaten Bungo, Muara Bungo-Jambi Islam
Jl. Linggar Jati/Nanggar Jati No. 16, Medan Perjuangan 085262991961
ke-2 dari 2 bersaudara Miran K
Salbiah Menikah
dr.Harizon Hendrik, Sp.OG 1. Kinanti Kayla Mayvahraz 2. Zhahira Brianna Devahraz
Riwayat Pendidikan :
1984 – 1990: SDN I 010185 Lima Puluh, Batu Bara 1990 – 1993: SMPN I Lima Puluh, Batu Bara 1993 – 1996: SMAN 2 Tebing Tinggi
1996 – 2003: Fakultas Kedokteran Universitas Islam Sumatera Utara, Medan 2011 – sampai sekarang: Magister Ilmu Kedokteran Tropis Fakultas Kedokteran
Universitas Sumatera Utara
Kegiatan Organisasi:
Abstrak
Kasus multidrug resistant tuberculosis (MDR TB/TB MDR) semakin meningkat jumlahnya di dunia dan memerlukan deteksi dini untuk mencegah penyebaran yang lebih lanjut. GeneXpert MTB/RIF adalah alat yang dapat digunakan untuk mendeteksi resistensi rifampisin, sebagai tanda pengganti untuk TB MDR. Penelitian ini merupakan uji diagnostik yang bertujuan untuk menilai sensitivitas dan spesifisitas GeneXpert MTB/RIF dalam mendiagnosa TB MDR. Penelitian dilakukan di poli TB MDR Rumah Sakit Umum Pusat Haji Adam Malik Medan. Subjek penelitian adalah semua suspek penderita TB MDR yang mempunyai hasil GeneXpert MTB/RIF positif baik resisten rifampisin maupun sensitif rifampisin dan mempunyai hasil uji kepekaan obat metode proporsi dengan media Lowenstein Jensen. Data diambil dari rekam medik periode Januari sampai dengan Desember 2013, didapatkan 64 sampel yang mempunyai hasil GeneXpert MTB/RIF positif dan mempunyai hasil uji kepekaan obat, 87,5% sampel yang resisten rifampisin juga resisten terhadap isoniazid. Pemeriksaan GeneXpert MTB/RIF menunjukkan sensitivitas 92,86% dan spesifisitas 59,09%. Kesimpulan: GeneXpert MTB/RIF mempunyai sensitivitas tinggi untuk mendiagnosa TB MDR terhadap baku emas uji kepekaan obat metode proporsi pada media Lowenstein Jensen. Penelitian ini menganjurkan GeneXpert MTB/RIF digunakan sebagai alat skrining TB MDR.
Abstract
Cases of multidrug resistant tuberculosis (MDR TB) is increasing in number in the world and requires early detection to prevent further transmission. GeneXpert MTB/RIF is a tool that can be used for detection of rifampicin resistance, as a surrogate marker for multidrug-resistant tuberculosis. This study aims to assess the sensitivity and specificity of the GeneXpert MTB/RIF in the diagnosis of MDR TB. The study was conducted at a poly MDR TB General Hospital Haji Adam Malik Medan. The subjects were all suspected MDR TB who had results positive GeneXpert MTB/RIF with sensitive rifampin or resistant rifampin and had a drug sensitivity test results with the proportion method Lowenstein Jensen medium. Data retrieved from the medical records of the period of January to December 2013, founded 64 samples that had results of GeneXpert MTB/RIF test positive and had the results of drug sensitivity, 87.5% of rifampin-resistant samples were also resistant to isoniazid. The GeneXpert MTB/RIF examination showed sensitivity of 92.86% and specificity of 59.09%. The Conclusion: GeneXpert MTB/RIF has a high sensitivity for diagnosing MDR TB against the gold standard drug sensitivity testing proportion method on Lowenstein Jensen medium. This study recommends the GeneXpert MTB/RIF be used for MDR TB screening tool.
KATA PENGANTAR
Bismillahirrahmanirrahim
Alhamdulillah, segala puji bagi Allah SWT yang telah memberikan ilmu dan kesehatan yang tidak terhingga sehingga penulis dapat menyelesaikan penulisan dan penyusunan tesis ini sebagai salah satu syarat dalam menyelesaikan jenjang pendidikan strata-2 pada Program Magister Ilmu Kedokteran Tropis Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara. Salawat dan salam kepada Rasulullah Muhammad SAW yang telah menyampaikan kebenaran dan sebagai rahmatan lil’alamin.
Penulis mengucapkan terima kasih kepada Pemerintahan Daerah dan Dinas Kesehatan Kabupaten Bungo yang telah memberikan kesempatan tugas belajar sehingga penulis dapat melaksanakan Program Magister Ilmu Kedokteran Tropis di Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara.
Dengan selesainya penulisan tesis ini, perkenankanlah penulis menyampaikan ucapan terima kasih yang sebesar-besarnya kepada:
Rektor Universitas Sumatera Utara, Prof. Dr. dr. Syahril Pasaribu, DTM&H, M.Sc (CTM), Sp.A(K) atas kesempatan dan fasilitas yang diberikan kepada kami untuk mengikuti dan menyelesaikan pendidikan Magister Ilmu Kedokteran Tropis
Dekan Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara, Prof. dr. Gontar A. Siregar, SpPD-KGEH, atas kesempatan menjadi mahasiswa Magister Ilmu Kedokteran Tropis pada Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara.
Sekretaris Program Studi Magister Ilmu Kedokteran Tropis, dr. Tetty Aman Nasution, M.Med.Sc atas kesempatan menjadi mahasiswa Magister Ilmu Kedokteran Tropis pada Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara.
dengan penuh perhatian telah memberikan dorongan, bimbingan, dan saran kepada penulis dalam penyelesaian tesis ini.
Seluruh komisi penguji, dr. Rina Yunita Sp.MK dan dr. Putri Chairani Eyanoer , MD, Ms. Epi, PhD, yang telah meluangkan waktu dan dengan penuh kesabaran memberikan pengarahan, bimbingan, dan pengajaran.
Jajaran Direksi dan staf Rumah Sakit Umum Pusat Haji Adam Malik Medan yang telah memberikan izin penelitian dan memberikan dukungan data serta membantu penulis dalam penulisan tesis ini
Staf administrasi dan seluruh rekan mahasiswa Program Magister Ilmu Kedokteran Tropis angkatan 2011 yang telah memberikan masukan dan dukungan kepada penulis.
Kepada kedua anakku Kinanti Kayla Mayvahraz dan Zhahira Brianna Devahraz, suami tersayang, kedua orang tua serta keluarga yang telah banyak memberikan dukungan do’a dan keikhlasan kepada penulis untuk menyelesaikan penelitian ini.
Penulis menyampaikan terima kasih kepada semua pihak yang tidak dapat disebutkan satu persatu yang telah mendukung dan membantu penulis dalam menyelesaikan penelitian ini.
Semoga tesis ini dapat bermanfaat bagi sesama untuk kebaikan. Penulis menyadari bahwa tesis ini masih jauh dari kesempurnaan oleh karena itu penulis sangat mengharapkan kritik dan saran guna perbaikan tesis ini. Segala kebenaran datangnya dari Allah dan segala kesalahan yang ada merupakan kesalahan penulis yang dikarenakan keterbatasan kemempuan dan pengetahuan penulis.
Medan, Februari 2015 Penulis
DAFTAR ISI
Halaman
Abstrak ………. Abstract ……… Kata Pengantar ………. Daftar Isi ………... Daftar Tabel ……….. Daftar Gambar ……….. Daftar Singkatan ………... Daftar Lampiran ………...
BAB I PENDAHULUAN ………
1.1Latar Belakang ……… 1.2Perumusan Masalah ………. 1.3Tujuan Penelitian ………. 1.4Manfaat Penelitian ………...
BAB II TINJAUAN PUSTAKA ………..
2.1 Definisi ……… 2.2 Epidemiologi ………... 2.3 Faktor yang Mempengaruhi Terjadinya TB MDR ….. 2.4 Klasifikasi Resistensi OAT ………. 2.5 Suspek TB Resisten Obat ……… 2.6Mekanisme Resistensi M. tuberculosis Terhadap OAT 2.7 Diagnosis dan Pemeriksaan Laboratorium ………….. 2.8 Pengobatan dan Pencegahan ………...
BAB III METODOLOGI PENELITIAN ………
3.5 Populasi dan Sampel Penelitian ……….. 3.6 Variabel Penelitian ………. 3.7 Definisi Operasional ……….. 3.8 Cara Pengumpulan Data ………. 3.9 Alur Penelitian ……… 3.10Rencana Analisa Data ……… 3.11Etika Penelitian ………..
BAB IV Hasil dan Pembahasan ………
4.1 Analisa Sampel ………... 4.2 Karakteristik Subjek Penelitian ……….. 4.3 Nilai Diagnostik ………. 4.4 Pembahasan Penelitian ………... 4.5 Keterbatasan Penelitian ………..
BAB V KESIMPULAN DAN SARAN ………
5.1 Kesimpulan ………. 5.2 Saran ………...
Daftar Pustaka ………
34 35 35 37 38 38 39
40 40 41 46 48 56 57 57 57
DAFTAR TABEL
Pengelompokan OAT ………. Perhitungan Dosis OAT MDR ………... Defini Operasional ………... Tabel 2x2 ……… Distribusi Frekuensi Usia Penderita TB MDR RSUP Haji Adam Malik Medan ……… Distribusi Frekuensi Jenis Kelamin Penderita TB MDR RSUP Haji Adam Malik Medan ………. Distribusi Frekuensi Status Pernikahan Penderita TB MDR RSUP Haji Adam Malik Medan ……….. Distribusi Frekuensi Pekerjaan Penderita TB MDR RSUP Haji Adam Malik Medan ……… Distribusi Frekuensi Tempat Berobat TB Sebelumnya Penderita TB MDR RSUP Haji Adam Malik Medan …… Distribusi Frekuensi Penyakit Komorbid Penderita TB MDR RSUP Haji Adam Malik Medan ………... Distribusi Frekuensi Kriteria Suspek Penderita TB MDR RSUP Haji Adam Malik Medan ……… Uji Kepekaan Rifampisin dan Isoniazid ………. Perbandingan Hasil GeneXpert MTB/RIF dengan Hasil Uji Kepekaan Obat Metode Proporsi Media LJ …………. Sensitivitas GeneXpert MTB/RIF Mendeteksi Resistensi Rifampisin Dibandingkan dengan Baku Emas Kultur …... Sensitivitas GeneXpert MTB/RIF Mendiagnosa TB MDR Dibandingkan dengan Baku Emas Kultur ………..
DAFTAR GAMBAR
Nomor Judul Halaman
2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 4.1
Konsep Perkembangan Resistensi OAT …….... Prosedur Pemakaian GeneXpert/MTB RIF …... Kerangka Teori ……….. Kerangka Konsep ……….. Alur Penelitian ………... Bagan Hasil Penelitian ………...
DAFTAR SINGKATAN
Singkatan Nama Pemakaian pertama
kali pada halaman Am
Amoksilin/ Asam Klavulanat Base Phare
Body Mass Index
Balai Pengembangan Laboratorium Kesehatan
Basil Tahan Asam
Conformite Europeene In Vitro Diagnostic
Clofazimin Klaritromisin Kapreomisin Sikloserin
Direktorat Jenderal Pengendalian Penyakit dan
Penyehatan Lingkungan deoxyribonucleic acid
Directly Observed Treatment, Short-Course
Etambutol Etionamid
Foundation for Inovative New Diagnostic
Isoniazid
Singkatan
M. tuberculosis NADH Lowenstein Jensen Line Probe Assay Linezolid
Multidrug Resistant Tuberculosis
Moksifloksasin
Mycobacterial Growth Indicator Tube
Mycobacterium tuberculosis
Nicotinamide Adenine Dinucleotide Hydrogen
Nucleic Acid Amplification Test
National Institutes of Health Obat Anti Tuberkulosis Ofloksasin
Polymerase Chain Reaction Para Amino Salisilat Pengawas Minum Obat Protionamid
Rifampisin Ribonucleid acid
Rifampicin Resistance-Determining Region
Rumah Sakit Umum Pusat Streptomisin
Pemakaian pertama kali pada halaman
Singkatan
TB TB RR Trd WHO WRD
XDR Z
: : : : :
: :
Nama
Tuberkulosis
TB Resistan Rifampisin Terizidon
World Health Organization
WHO Approved Rapid Diagnostic Methods
Extensively Drug Resistance Pirazinamid
Pemakaian pertama kali pada halaman
1 9 28 1 20
DAFTAR LAMPIRAN
Nomor Judul Halaman
1 2 3
4
Jadwal Penelitian ... Perincian Biaya ... Data Suspek TB MDR Di RSUP HAM yang Mempunyai Hasil GeneXpert MTB/RIF dan Uji Kepekaan Obat ... Persetujuan Komisi Etik ...
67 68
