IR-PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

(1)

v

SKRIPSI ISOLASI DAN KARAKTERISASI… EKA

Eka Narendra Nuswantara, 2020, Isolasi dan Karakterisasi Bakteri Lapisan Schmutzdecke pada Slow Sand Filters Air Limbah Domestik dari Rusunawa Penjaringan dan Keputih. Skripsi ini dibawah bimbingan Dr. Ni’matuzahroh dan Dr. Nurina Fitriani S.T. Departemen Biologi, Fakultas Sains dan Teknologi, Universitas Airlangga, Surabaya.

ABSTRAK

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui jumlah total plate count, karakter makroskopis, mikroskopis, dan fisiologis serta nama genus bakteri heterotrofik di lapisan schmutzdecke pada jenis filter pasir dan cangkang kerang Anadara granosa dengan waktu aklimatisasi berbeda di slow sand filters. Penelitian ini dilakukan dengan menggunakan metode total plate count, pengamatan uji makroskopis berdasarkan bentuk koloni, tepi, elevasi, warna, ukuran, dan transparansi, sedangkan untuk mikroskopis berdasarkan bentuk sel, pewarnaan Gram dan endospora, serta uji fisiologis menggunakan uji katalase, uji oksidase, uji motilitas, dan kit Microbact 12A dan 12B. Hasil pengamatan total plate count pada jenis filter pasir dengan waktu aklimatisasi 2 dan 3 minggu secara berturut sebanyak 1,8 x 10⁵ dan 1,8 x 10⁶, sedangkan untuk jenis filter cangkang kerang Anadara granosa dengan waktu aklimatisasi 2 dan 3 minggu memiliki jumlah koloni yang sama yakni 2,8 x 10⁵. Pada uji makroskopis dan mikroskopis ditemukan 18 isolat yang berbeda berdasarkan karakter yang diamati. Identifikasi dengan uji fisiologis dilakukan terhadap 4 isolat yang memiliki kelimpahan paling banyak yakni isolat 1.6, 2.2, 3.4, dan 3.6² yang setelah pengamatan ditemukan sebagai Kurthia gibsonii dengan kesamaan 83%, Bacillus badius dengan kesamaan 81%, Bacillus firmus dengan kesamaan 85%, dan Bacillus lentus dengan kesamaan 77%, secara berturut.

Kata kunci : bakteri heterotrofik, identifikasi, fisiologis, schmutzdecke, slow sand filters, total plate count

(2)

vi

Eka Narendra Nuswantara, 2020, Isolasi dan Karakterisasi Bakteri Lapisan Schmutzdecke pada Slow Sand Filters Air Limbah Domestik dari Rusunawa Penjaringan dan Keputih. Skripsi ini dibawah bimbingan Dr. Ni’matuzahroh dan Dr. Nurina Fitriani S.T. Departemen Biologi, Fakultas Sains dan Teknologi, Universitas Airlangga, Surabaya.

ABSTRACT

This study aims to enumerate the total plate count and determine the macroscopic, microscopic and, physiological characters, as well as the genus of heterotrophic bacteria found in the schmutzdecke layer in slow sand filters, with different acclimatisation times, and sand and Anadara granosa shells as filters. This research was carried out using various methods including total plate count, macroscopic characterization based on bacterial colony’s shape, edge, elevation, color, size, and transparency, microscopic characterization based on cell shape, and Gram and endospore staining, and physiological examination using the catalase test, oxidase test, motility tests, and the Microbact 12A and 12B kits. The total plate count of bacteria existing in the sand filtered system with an acclimation time of 2 and 3 weeks were 1.8 x 10⁵ and 1.8 x 10⁶, respectively, while the Anadara granosa shell filtered system with an acclimation time of 2 and 3 weeks had the same number of colonies, namely 2.8 x 10⁵. Based on the macroscopic and microscopic characterization, 18 different isolates were found. Identification by physiological examinations was carried out on 4 most prolific isolates, namely isolates 1.6, 2.2, 3.4, and 3.6² which, after said characterizations and examinations, were discovered to be Kurthia gibsonii with 83% similarity, Bacillus badius with 81% similarity, Bacillus firmus with 85% similarity , and Bacillus lentus with 77% similarity, consecutively.

Keywords : heterotrophic bacteria, identification, physiological, schmutzdecke, slow sand filters, total plate count

(3)

vii

KATA PENGANTAR

Puji syukur penulis ucapkan kepada Allah Subhanahu Wata’ala yang telah memberikan rahmat dan karunia-Nya, sehingga penulis mampu menyelesaikan penulisan naskah skripsi yang berjudul “Isolasi dan Karakterisasi Bakteri Lapisan Schmutzdecke pada Slow Sand Filters Air Limbah Domestik dari Rusunawa Penjaringan dan Keputih”.

Naskah skripsi ini disusun untuk memberi wawasan dan memperluas ilmu, serta sebagai syarat kelulusan untuk menyelesaikan pendidikan strata satu (S1) jurusan Biologi Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Airlangga. Semoga skripsi ini dapat membantu penelitian berikutnya dalam mengetahui keanekaragaman bakteri dalam lapisan schmutzdecke yang terdapat pada alat filtrasi sederhana slow sand filters.

Penulisan skripsi ini tidak lepas dari hambatan dan kesulitan, namun dengan bimbingan, bantuan, kerjasama, dan saran dari berbagai pihak, segala hambatan dan kesulitan tersebut akhirnya dapat diselesaikan dengan baik. Penulis menyadari bahwa pada penulisan naskah skripsi ini masih terdapat banyak kekurangan dan ketidaksempurnaan, untuk itu penulis menerima apabila terdapat evaluasi, kritik, dan saran untuk naskah skripsi ini. Semoga naskah skripsi ini dapat bermanfaat dan berguna bagi pengembangan ilmu pengetahuan dan semua pihak yang membaca.

Surabaya, Agustus 2020

Penyusun,

Eka Narendra Nuswantara

(4)

viii

UCAPAN TERIMAKASIH

Segala puji bagi Allah Subhanahu Wa’Taala karena atas rahmat-Nya penulis dapat menyelesaikan skripsi yang berjudul “Isolasi dan Karakterisasi Bakteri Lapisan Schmutzdecke pada Slow Sand Filters Air Limbah Domestik dari Rusunawa Penjaringan dan Keputih” dengan baik. Penyusunan skripsi ini tidak lepas dari bantuan berbagai pihak, sehingga penulis mengucapkan terimakasih setinggi-tingginya kepada:

1. Dr. Ni’matuzahroh selaku pembimbing I sekaligus penguji I yang bersedia meluangkan waktu untuk membimbing, mengarahkan, membimbing mengenai analisis data, dan pemahaman konsep-konsep detail materi, serta kata-kata motivasi, kritik, dan saran yang membangun bagi penulis.

2. Dr. Nurina Fitriani, S.T. selaku pembimbing II sekaligus penguji II yang bersedia meluangkan waktu untuk membimbing dengan sabar, memberikan dukungan, masukan, dan pengarahan selama penelitian dan pengerjaaan skripsi ini berlangsung.

3. Prof. Dr. Ir. Tini Surtiningsih, DEA selaku penguji III yang telah menyediakan waktu untuk memberikan koreksi isi dan redaksional naskah, serta memberikan kritik dan saran dalam penyusunan skripsi ini.

4. Prof. H. Hery Purnobasuki, M.Si., Ph.D selaku penguji IV yang telah menyediakan waktu untuk memberikan koreksi isi dan redaksional, serta memberikan kritik dan saran dalam penyusunan skripsi ini.

5. Drs. Saikhu Akhmad Husen, M.Kes selaku dosen wali yang selalu memberikan dukungan dan semangat mulai awal semester hingga penyelesaian penyusunan skripsi.

6. Prof. Win Darmanto, Ph.D selaku Dekan Fakultas Sains dan Teknologi, Universitas Airlangga, Surabaya.

7. Dr. Sucipto Hariyanto, DEA selaku Ketua Departemen Biologi sekaligus Ketua Prodi S-1 Biologi, Fakultas Sains dan Teknologi, Universitas Airlangga, Surabaya.

(5)

ix

8. Kedua orang tua yang selalu mendoakan, mendukung, dan memberikan motivasi selama perkuliahan dan penyusunan skripsi.

9. Rekan dalam satu tim penelitian Nurul Wahyuni dan Brigita N.D.A yang telah saling mendukung dan saling berbagi suka dan duka selama penelitian berjalan.

10. Mas Zain, Mbak Ana, Mbak Nastiti, Mas Syahriar, Mbak Eka dan Pak Ni yang telah membantu penulis dalam penelitian.

11. Nur Laili Hidayah sebagai penyemangat serta pendamping penulis.

12. Teman-teman Biologi 2016 yang tak dapat penulis sebutkan satu per satu atas semangat, motivasi, kebersamaan melewati masa-masa perkuliahan.

(6)

x

DAFTAR ISI

SKRIPSI ... i

LEMBAR PENGESAHAN NASKAH SKRIPSI ... ii

PEDOMAN PENGGUNAAN SKRIPSI ... iii

SURAT PERNYATAAN ORISINALITAS ... iv

ABSTRAK ... v

ABSTRACT ... vi

KATA PENGANTAR ... vii

UCAPAN TERIMAKASIH ... viii

DAFTAR ISI ... x

DAFTAR GAMBAR ... xii

DAFTAR TABEL ... xiv

BAB I PENDAHULUAN ... 1

1.1 Latar Belakang ... 1

1.2 Rumusan Masalah ... 5

1.3 Tujuan Penelitian ... 5

1.4 Asumsi Penelitian ... 6

1.5 Hipotesis Penelitian ... 6

1.6 Manfaat Penelitian ... 7

BAB II TINJAUAN PUSTAKA ... 8

2.1 Tinjauan tentang Rusunawa ... 8

2.2 Air Limbah ... 8

2.2.1 Greywater ... 8

2.3 Slow Sand Filters ... 9

2.4 Anadara granosa ... 10

2.5 Lapisan Schmutzdecke ... 12

2.6 Tinjauan tentang Bakteri ... 13

2.6.1 Struktur Bakteri ... 14

2.7 Tinjauan tentang Identifikasi Bakteri ... 25

2.7.1 Isolasi dan Karakterisasi Makroskopis dan Mikroskopis Bakteri ... 26