BAB. II
TINJAUAN PUSTAKA
Genetika Jagung Manis (Sweet Corn)
Jagung manis (Zea mays L. var. saccharata) merupakan salah satu sayur- mayur yang populer di negara-negara maju seperti Amerika, Brasil, Prancis dan di negara-negara berkembang. Jagung ini dikonsumsi dalam bentuk jagung muda yang direbus atau dibakar, dibuat sayur, perkedel, cream atau susu, sirup, dan bahan baku pembuatan permen karena rasanya manis dan enak. Di Europa, Cina, Korea, dan Jepan, digunakan untuk topping pizza. Rasa manis disebabkan oleh kandungan gula yang tinggi pada endosperm, mengkilap, dan tembus pandang ketika belum masak, dan bila kering berkerut. Jagung manis selain rasanya manis dan enak juga bermanfaat bagi kesehatan seperti mengurangi resiko terkena penyakit jantung dan kanker terutama jika dikonsumsi dalam bentuk jagung rebus. Kandungan nutrisi jagung manis diperlihatkan pada Tabel 1 (Larson 2003).
Tabel 1 Kandungan nilai nutrisi dalam biji jagung manis Nilai nutrisi dalam biji jagung manis per 100 g
(3,5 oz)
Energy 90 kkal 360 kJ
Karbohidrat 19 g
- Gula 3.2 g
- Dietary fiber 2.7 g
Lemak 1.2 g
Protein 3.2 g
Vitamin A equiv. 10 μg 1%
Asam Folat (Vit. B9) 46 μg 12%
Vitamin C 7 mg 12%
Besi 0.5 mg 4%
Magnesium 37 mg 10%
Kalium 270 mg 6%
Sumber: database nutrisi USDA
Jagung manis diperoleh dari field corn (jagung biasa) yang mengalami mutasi resesif secara alami dalam gen yang mengontrol konversi gula menjadi pati dalam endosperm biji jagung. Saat ini telah ditemukan 13 gen mutan yang dapat memperbaiki tingkatan gula pada jagung manis. Gen yang utama mempengaruhi G
G Gen
m ma ma ma ma ma ma m m ma ma ma ma ma ma ma m ma ma ma ma ma ma ma m maa ma m ma ma ma m ma m ma maa ma m ma maa ma ma maaa ma maa m m m maaa m maa ma m m maaa m m ma m m m m m ma ma m ma m maaayyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyy n ne neeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeegggggggggaggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggg d di diiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiirerererrerererererrrerrrererrrrrerrerrererererrrrrrrrrrerrrrrrrerrrrrrerrerrrrrerrrerrerrrerrrrrrrrrererrrerrerrrrrrrrreeb p p peeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeemmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm J Je Jeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeepapapapappppppappppppppppppppppppappppppppppppppppppppppppppppppppppppppp g gu guuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuullllalalalllllllllalallllalalalalllllllalllllalllllllllallllllllalalalllaaaaaaaaaaaaaa m ma ma maaaaaaaaaaa maa maaa ma maaa ma maaaaaaaaaaa maa ma maaaaaaaaaaa maaaaaaaaaaaa m maaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaasssssssssssssssssssssssssssssss b b beeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeermrmrrmrmrmrmrmrmrmrmrmrmrmrmrmrmrmrmrmrmrmrmrrmrmrrrmrrrrrmrrrmrrrrrrrrrrmrrmrmrrrrrmrrrrrrmrmrrrrmrmrrrrrrrrrrmmmmm k ka kaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaannnnnnnnnnknnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn j j jaaagugugggugggugggggugugugguguggguggugggggggggggguguggggguggugggguggggggggggugggggggggggggggggggugggggggggggg
r re re re reeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeesesessesesesesesssesesesesesssessessesesessessesessssesesessssesessesessesesssesssessesssesesssesssssssssee e e en ennnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnndododddododddddddddddddddddododddodoo m me me me me me me me me me m me m me m m me me me mee me me me me m m me mee m me mee meeeeeeeeeeemmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm
kemanisan jagung ada tiga yaitu : (1) gen sugary (su); (2) gen sugary enhancer (se); dan (3) gen shrunken (sh2). Ketiga gen tersebut merupakan gen resesif sehingga harus ditanam terpisah dari varietas jagung biasa.
Penyakit Bulai (Downy Mildew)
Penyebab penyakit bulai pada tanaman jagung Peronosclerospora dilaporkan ada lima spesies (Renfro 1980 dikutip Wakman 2001). Namun di Indonesia hanya ada dua spesies yang dilaporkan yaitu P. maydis dan P. philippinensis, tetapi umumnya P. maydis terdapat dimana-mana, sedangkan P. philippinensis khusus terdapat di daerah Sulawesi Utara.
Penyakit bulai atau embun berbulu (downy mildew) memiliki banyak nama setempat, antara lain di Jawa Tengah dikenal dengan nama omo putih, omo londo, dan omo bule, di Jawa Timur, omo putih, dan potehan, sedangkan di Jawa Barat dikenal sebagai omo bodas dan hama lieur (Semangun 1996).
Serangan penyakit bulai dapat dilihat pada permukaan daun terdapat garis-garis sejajar tulang daun berwarna putih sampai kuning diikuti dengan garis-garis klorotik sampai coklat. Bila infeksi makin lanjut, tanaman terlihat kerdil dan tidak berproduksi, tetapi jika infeksinya terlambat tanaman masih ada kemungkinan untuk berproduksi, hanya saja biji yang dihasilkan sudah terinfeksi patogen. Jamur berkembang secara sistemik, sehingga bila patogen mencapai titik tumbuh maka seluruh daun muda yang muncul mengalami klorotik, sedangkan daun pertama sampai ke empat masih terlihat sebagian hijau. Ini merupakan ciri-ciri dari infeksi patogen melalui udara. Bila biji jagung sudah terinfeksi, maka bibit muda yang tumbuh memperlihatkan gejala klorotik pada seluruh daun dan tanaman cepat mati.
Di permukaan bawah daun yang terinfeksi dapat dilihat banyak terbentuk tepung putih yang merupakan spora patogen tersebut (Agrios 1988).
Menurut Semangun (1996), tanaman yang terinfeksi terdapat benang-benang jamur dalam ruang antar selnya, daun-daun tampak kaku, agak menutup, dan daun lebih tegak dari biasa. Akar kurang terbentuk dan tanaman mudah rebah. Tanaman yang terinfeksi pada waktu masih sangat muda biasanya tidak membentuk buah.
Bila terinfeksi pada tanaman yang lebih tua, tanaman dapat tumbuh terus dan membentuk tongkol buah. Tongkol buah sering mempunyai tangkai yang panjang, k
k kem ( ( (se);
s s sehin
P P Peny
a ad ad addddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddda a a aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa a ad addddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddda aaaaaaaa aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa u u ummmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmuuuuuu t t teeerrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrdadddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddd
s s seeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeetetetetetetetetetetetetetetetetetetttetetetettetttettettettetettttetetettttetttettettttttttttttetettttttttttttttttemeeeeee d da daaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaannn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn d di diiiiikekekkkkkkkkkekkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkk
s s seeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeejajajajajajajjajajajjajjjajajajjajajajajajjajajajajajajajajjajjajajjjajajjjajajajajajajajajajjjjajjjajajajjajjajajjajjajajajjajajajajjjjjajajjajajjjjjjjjjjjjjjaaaaaaaaaaaaaaaaaaaj s s saaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaammmmpmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm b b berp b b berp b b berk s s selur s s samp p p pa p to t tu tuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuummmmmmmbmbmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm D Di Di D Di Di Di Di Di Di Di Di Di Di Di D D D D Di Di D D Di Di D Di Diii D Di Di Diii Di Di D Di Di Di D Di D D D Dii Dii D D D D D D D D D D D D D D D D D D D D p p p pu puuuu puu puuuuu puuuuuuuuuuuuuuuu puuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuutitititittitititttititititittitttitititititittttittttititittittittittitititittitttittitttitiiiiiiiiiiiiihhh
j ja jaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaammmummmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm l le leeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeebbibibibibibibibibbibibibibibibibibibibibbbibibibbbibibibibbbbbbbbbbbbbihiiiiiiiiiiiiihhh y ya ya ya ya ya yaaaa yaaa yaaaaaaa ya ya yaaa yaaaa ya yaaaaaaaa yaa yaaaa ya ya yaa ya ya yaaa ya yaaa yaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa yaaaa ya y nngnngnnnnnnnnnngnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn B Bi Bi Bi Bi Bi Bi Biiiiii Biiii Bii Bi Bii Bi Bi Bi Bi Bi Bii Biii Bi B Bi B Bi Bi Bi B Bi Bi Bii Biiiiiiiii B B B B B B B B B B B B B B Bllalalalalllllllllllalaaaa m me me me me me me me me mee m me m me m m me me me meee me me me me me me me meee me me mee meeeeeeeeeeeeeemmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm
dengan kelobot yang tidak menutup pada ujungnya, dan hanya membentuk sedikit biji.
Kajiwara (1974) dari hasil penelitiannya dengan menggunakan daun jagung kultivar Harapan menggambarkan proses perkembangan gejala penyakit bulai yang tercantum dalam Tabel 3.
Tabel 2 Perkembangan gejala penyakit bulai (downy mildew) Hari setelah
inokulasi Gejala
2 5 6 7 9 14-25
Muncul bintik-bintik hijau pucat (1-2 mm).
Muncul garis-garis berwarna hijau kekuningan.
Garis-garis tadi semakin jelas. Beberapa daun berubah warna menjadi kuning.
Seluruh daun berwarna kuning dan beberapa diantaranya mulai layu.
Daun pertama sampai daun ke tiga mati. Garis-garis kuning yang jelas muncul pada daun ke empat.
Gejala serangan sistemik mulai terlihat pada daun-daun yang baru terbentuk.
Jamur dapat bertahan hidup sebagai mycelium dalam embrio biji yang terinfeksi jika kondisi biji lembab. Bila biji ditanam, jamurnya ikut berkembang dan menginfeksi bibit, selanjutnya dapat menjadi sumber inokulum. Infeksi terjadi melalui stomata daun jagung muda umur di bawah satu bulan jika pada permukaan daun terdapat air gutasi atau tetesan air serta jamur berkembang secara sistemik.
Sporangia (konidia) dan sporangiofora dihasilkan pada permukaan daun yang basah dalam gelap. Sporangia berperan sebagai inokulum sekunder. Pembentukan spora patogen membutuhkan udara yang lembab (lebih dari 90%) dan hangat pada suhu sekitar 220 C serta gelap. Produksi sporangia (sporulasi) sangat banyak terjadi pada dini hari antara pukul 03.00 sampai 05.00 (Semangun 1996). selanjutnya oleh tiupan angin di pagi hari, spora tersebut tersebar sampai jarak jauh dan bila spora menempel pada daun jagung muda yang basah, maka dalam waktu satu jam spora tersebut sudah mulai berkecambah dan menginfeksi daun melalui stomata jika ada air gutasi atau embun (Subandi 1996).
Penyakit bulai pada jagung terutama terdapat di dataran rendah dan jarang terdapat di tempat-tempat yang lebih tinggi dari 900-1.200 m (Rutgers 1916 dikutip Semangun 1996). Ini sesuai dengan penelitian Bustamam dan Kimigafukuro (1981) d
d deng b b biji.
k k kulti t t terca
T Ta Ta Ta Ta Ta Ta Ta Ta Ta Ta Ta Ta Ta Ta T Ta Ta Ta Ta Ta T Ta T Ta Ta Ta Ta Ta Ta Ta Ta Taa Ta Taa T T Ta Ta Taaa Ta Ta T Ta T Ta Taaaaa Ta Taaaa T Ta T Ta Ta Taa T Tabebbbbbbebebebbbebbbbebbbebbebbebebbebebbbebbebbbbbbbebebbebebebbebebbbbbebbbbebebbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbb
H
t te teeeriririririririririririririririririririrrrriririririririririririririrrirrrririrririririririrrirrrirrirririririrrirrrirrririrrirrririiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiinnn m m men m m mela d d daun S S Spor d d dala p p pa pa pa p p too s s se seeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekikikkkkikkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkt d di di di diii di di diii di dii diiiiii dii diiiiiiiiiiii dii dii diii diii diiii dii di di di di di diiiiiiiiinininnnninnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn a an an an annnnnnnnnn annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngigigigiggigigigiggigggiggigigggigigggggggggigigggggggggggggggggiggggggggggggggggggggigggggigggggiggggggggigiggggggggggggggggiii p p pa pa paa paaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaadddaddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddd s s su suuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuudaddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddd a at atttttt at attttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttauauauauaaauauauauauaauauauaauaaaauuuuuuuuuu
t te teeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeerdrdrdrdrdrdrdrdrdrdrrrdrdrdrdrdrrdrrrrrrrddddddddddddddddaa S S Se Se See Seee See Se Se Se Se S S See Se Seeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeemmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm
yang dilakukan di Bogor menunjukkan bahwa konidium berkecambah paling baik pada suhu 20qC. Varietas-varietas jagung berbeda ketahanannya terhadap penyakit bulai, ada yang tahan dan rentan. Hal ini ditentukan oleh gen-gen penyusun yang terdapat dalam tanaman jagung. Gambar 1 menunjukkan penampilan daun tanaman jagung yang terinfeksi penyakit bulai.
Gambar 2 Daun tanaman jagung yang terserang bulai Pengendalian Penyakit Bulai (Downy Mildew)
Pemberantasan penyakit bulai harus dilakukan secara terpadu diantaranya penggunaan varietas resisten, penanaman serentak, tanaman yang sakit dicabut dan dikubur dalam tanah atau dibakar agar tidak menjadi sumber penyakit, pengaturan pola tanam, dan penggunaan fungisida (Fagi et al. 1997). Pergiliran tanaman merupakan salah satu cara menekan tingkat serangan penyakit bulai. Karena tidak terbentuknya oospora memungkinkan patogen dapat bertahan di dalam daun, batang, kelobot, bunga jantan, bunga betina ataupun tongkol yang masih muda sehingga dapat bertahan dalam waktu yang cukup lama. Dengan demikian pertanaman jagung terus menerus sepanjang tahun akan menyebabkan patogen dapat bertahan terus.
Perlakuan biji dengan metalaksil, kerugian dapat dikurangi. Tetapi pemberantasan penyakit bulai dengan memakai fungisida biasanya terdapat masalah karena beberapa alasan yaitu (a) serangan patogen terhadap tanaman bersifat sistemik ; (b) Infeksi serangan terjadi pada malam hari; dan (c) Serangan terjadi pada saat tanaman berusia muda, pada waktu stadia pertumbuhan. Oleh karena itu y
y yang p p pada b b bula t t terda j j jagu
P Pe Peeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeennngnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
p p peng d d diku p p pola m m meru t te teeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeerbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrrbrbrbrbrrbrbrrbrbrbrrbrbrrbrbrbrbrbrbrbrbrbrrbrrbrbrbrbrrrbrrrrrbrrbrrbrbrrrbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeee k k ke ke ke ke ke ke ke ke k ke ke ke ke ke ke k ke k ke k ke ke ke ke ke ke ke ke ke ke k ke ke ke k ke ke ke ke ke k ke ke ke k ke k k ke k ke ke ke ke kee keee ke ke k k kee k ke ke ke ke ke ke ke kee keee k ke ke k ke ke k k ke kee kee k k k k llllolololollllllllllllllllolllllllllllllllllollllllllllllllllllllllllllllllllll d da da da d da da d d d daaapppppppppppappppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppp t te te te te tee te te te te tee te tee teee te te tee te te te teeeeeeeeeeeeee te te tee teee t teeeee tee te te teeee teee tee te tee teee teee te t terurururrrrrrrururrrurururrrururrrrurururrurururururururururrururrrrururrurrrrururrruruuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuus
p p pe pe pe peeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeemmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm k ka ka ka ka kaaaaa ka ka ka ka kaaa kaaa ka k ka kaaaaaaarrrrrererrrrrrrrrrrerrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrr s s si siiiiiiiiiiiiiiiiiiii sistssssseeeeeee s sa sa saaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatataaataaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaat
fungisida yang dapat digunakan untuk menekan serangan bulai adalah fungisida sistemik. Namun cara yang paling baik untuk memberantas serangan penyakit dan hama adalah dengan merakit kultivar resisten (Singh 1986; Mochizuki 1974).
Penanganan pemberantasan penyakit bulai selain penggunaan fungisida sistemik juga diusahakan mendapatkan varietas baru yang resisten. Hal ini telah dilakukan karena dengan penggunaan fungisida akan membutuhkan biaya tambahan kepada petani.
Pemuliaan untuk Ketahanan terhadap Penyakit
Program pemulian untuk menghasilkan varietas resisten terhadap penyakit harus melalui beberapa tahapan yakni mendapatkan sumber ketahanan dan menentukan pola pewarisan karakter ketahanan tanaman inang serta karakter genetik dari interaksi antara inang dengan patogen (Allard 1960). Hal tersebut dapat terlaksana dengan baik apabila pengkajian dilakukan pada lingkungan epidemik bagi patogen, baik di laboratorium, rumah kaca, maupun di lapangan. Beberapa kendala yang sering ditemukan adalah penentuan dan penilaian ketahanan, identifikasi genetik dari karakter ketahanan yang melibatkan interaksi gen yang tidak sealel, dan kaitan gen.
Untuk mengantisipasi hal tersebut di atas maka pada setiap pelaksanaan pengujian dan seleksi ketahanan tanaman perlu diusahakan terciptanya lingkungan epidemik yang mampu memberikan kondisi epifitotik patogen. Langkah yang harus dilaksanakan untuk menciptakan kondisi seluruh tanaman yang diuji terinfeksi patogen penyakit adalah dengan melakukan inokulasi buatan. Beberapa hal penting untuk keberhasilan inokulasi buatan tersebut adalah inokulum harus tetap bermutu tinggi, penerapan inokulasi diusahakan homogen untuk setiap tanaman, dan kondisi lingkungan pada saat inokulasi sesuai bagi pertumbuhan patogen, serta tanaman inang yang akan diuji harus bebas dari penyakit lain dan harus dalam keadaan fisiologik yang cocok untuk terjadinya serangan patogen.
Tanaman resisten dan tanaman rentan dapat dibedakan dengan mudah apabila dikendalikan oleh satu atau dua gen mayor. Pada keadaan tersebut varians ketahanan akan menunjukkan sebaran terputus atau diskontinyu. Sering pada ketahanan yang dikendalikan oleh banyak gen tidak ada perbedaan jelas antara individu tanaman f
f fung s s siste h h ham
s s siste d di di di di di di di di di di di di diii di di di di diii di diii di dii diii di dii diiiii dii d diiii di diii d di di diiii dii d di dii dlalalalalalalalallalallallallalalalalalalalalalalalalalalalalalallalllallallalalalalalalalalalalallallalalllaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaakkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkk k ke keeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeepapppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppp
P Pe Peeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeemmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm
h ha haaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaarururrururrururururururururrrurururururrurururrrrrrrrrurrrrrururrururrrrururururrururrrrurrrrrrrrrrrrrrurrrrrrruuu m me me me me meeeeeeeee meeeee meeeee meeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeee meeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeennnnnn d da daaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaarrrrrrrriririrrirrrrririrrrririrririrrirrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrr t t teeerlrlrlrlrlrlrlrlrlrlrlrrrlrlrlrlrlrlrlrlrlrlrlrrlrlrlrlrlrlrlrlrlrlrlrlrlrlrlrlrrrlrrlrrrlrlrlrrlrrrrrlrrrrlrrlrrrlrrlrrlrlrlrrrlrrrrrlrlrrrlrrrrrrlrrllllllllllllllllaaa p p paaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatotototototttttototttottttotottottttottottttttttttototttottttttttttttotototototototttotttottttttttttttttttoooo y ya yaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaannnnnnnnnngnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn g ge geeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeennnennnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn k k kaita
p p peng e e epid d d dilak p p pa p to u u un un unnn unn un unn un un un un unnnnn unnnn un unnnnnnnnnn unnnnnnnn un unn un unnn un unnnnn unn un unn un u unn u unnntututtutttuttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttt t ti tiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiingngngngngngngnngngngngngnngngngnngngngngngngngngngnnngnngngngngngnngnngngnngnngngngngnnngngngnnngnnnnnngngngnngngngngggggggggggggggg l li liiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiingngngngngngngngngngngngngngngnngngngngngngngngngngngngngngngnnngnngngngngngnnnngngngnngnnngnngngngngnngngnngngnngnngnngngnngngggggggggggggggggggggggggggggggggggkkk i i i in in i in in inn i in inn inn in in innnn in in in in in in i in in in innnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaaananananananaaanaaanananaaanaaaanaaananaanananaaaaaaaaaanaaaaaaaaaaaaaaannnn f f fiiiiii fiiii fiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiisisisisisisisisisisisisisisisisisisisisisisisisisissssissisisississsisssisssisioiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiioo
d di di di di di dii dii di dii dii di diiii di diii dii di diii diiiiiiiiiii diiiii diii d diiiii d dii diiiiiiiiiiiiiiiiii dikekkkekkkkkkkkekkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkk a ak ak ak akkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkanananannnnnn d di di di di d diii diiiii di d diiiii dii diiii diiiiiikekekekekekkekekekekekekkekekkkekkekekkkekkkkkkkkkkekkkekekekekekkekekkekekkekekkekkekkkekkkkkkkkkkeeeee
resisten dan tanaman rentan dalam populasi yang bersegregasi. Varians ketahanan tersebut bersifat kontinyu dengan perubahan perbedaan ketahanan yang kecil (Herison 2002).
Pegetahuan tentang adanya gen-gen pengendalian karakter ketahanan terhadap penyakit bulai akan memudahkan pemulia tanaman untuk merakit varietas resisten.
Pamin (1980) menyimpulkan bahwa terdapat keragaman genetik yang cukup luas terbukti dari pembentukan varietas sintetik yang tahan penyakit bulai, dengan pembentukan intercross S1 dan S2 telah berhasil diturunkan tingkat serangan penyakit bulai dari 60.8 persen pada bahan asal menjadi 22.4 persen pada intercross S1dan 16.8 persen pada intercross S2.
Aday (1974) meringkas bahwa program pemuliaan yang dilakukan di Philipina guna menekan serangan bulai berlangsung dalam empat tahap yaitu:
a. isolasi dan seleksi galur-galur murni yang resisten terhadap bulai (DMR) (1953 – 1963).
b. skrening varietas lokal untuk ketahanan penyakit bulai pada areal yang luas dan introduksi plasmanutfah yang memiliki hasil tinggi (1964 – 1968).
c. pembentukan varietas hibrida persilangan antara varietas lokal tahan bulai dengan varietas introduksi plasmanutfah produksi tinggi (1967 – 1973).
d. perbaikan dalam populasi untuk ketahanan terhadap bulai dan seleksi karakter argonomi yang baik.
Dengan melaksanakan program di atas dewasa ini telah berhasil dirilis varietas- varietas seri Phil DMR dengan tingkat serangan rata-rata sebesar 34.63 persen dibandingkan dengan bahan asal sebesar 44.40 persen. Dekade sepuluh tahun terakhir sekarang ini juga telah dilaksanakan program Asian Maize Biotechnology Network (AMBIONET) berhasil melaksanakan pemetaan gen ketahanan penyakit bulai di Philipina, Cina, dan India, sedangkan di Indonesia sampai sekarang ini masih belum menghasilkan. Melihat kemajuan yang telah dicapai dengan pemberantasan melalui pemuliaan maka pencarian varietas baru yang resisten penyakit bulai masih dilanjutkan.
r r resis t t terse ( ( (Her
p p peny P Pa Pa Pa Pa Pa Pa Paa Pa Pa Pa Pa Paa Pa Pa Pa Pa Pa Pa Pa Paa Pa Pa Pa Pa Pa Pa Paaaaaaaa Paaa Paa Paaaaaaa Paa P Paaa Pa Paaa Pa Pa Pa Pa Paa Paaa P Pa Paammmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm t t teeerbrbrbrbrbrbrrbrbrbrbrbrbrrbrrbrbrbrrbrbrbrbrbrbrbrbrrrbrbrrbrbrrrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrrbrrrrbrrbrbrbrrrrbrbrbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbu p p peeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeemmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm p p peeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeennnnnnnnnnnnnnynnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn S S S111111111111111111111111111dddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddd
g gu guuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuunnnnnnnannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn a a a... i
b b b... s
i c c.
c... p d d d d. p
a D D Den v v varie d d di di d d di di d di dii d di di di d di di di d dbabababababababababababaaaaaaaaaaa t t te teeeeeee teeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeee teeeeeeeeeeeeeeeeeeee tee t rarararararararararararararararararararararararararrararrarrarararrrrrrrrrrrarararararrrrrrraaak N Ne Ne Ne Ne Ne Ne Ne Ne Ne Ne N Ne Nee Ne Ne N Ne Ne N Ne Ne Ne N Ne Ne Ne Ne Ne Ne Ne Ne Nee Ne Ne N N Ne N Ne Ne Ne Ne N N Ne Ne Ne N Ne Nee Ne N Nee Neee Neee Nee Ne N Nee Ne Ne N N N N Neee N Nee N N N Ne Neeettttttwttttttttttttttttttttttttt b b bu bu bu buuuuu buu buuuu buuu buuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuulalallalallalalalallllalallllllalalallllalllalalalalllalalallalalalllalallalalallalllallllallallllllalalallalllllllaaaaaaaaa m m ma ma ma ma ma ma maaa ma m ma ma ma ma maaa ma ma ma ma ma maa ma ma maaa maaa maa maaaaaaa maaa maaaaaaaaaaaaaaaa maaaaaaaaaaaaaaaaaaaasssss p p pe pe pee p pe pe pe pee pe peee peee pe p p peeeeeeee p p peee pe pee pe pee pe pe pe pee p pe pe p pe peeeeeeeeeeeee pe p pe p mmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm p p pe pe p pe peee pe peee pe peee pe pe pee peeeee peeee peee pe pe pee pe pe pee pe pee pe pee pe p pe pe pee pe pe peeeeeeeeeeeee p p p p nnnnnnnynnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
Marka Genetik
Marka genetik merupakan bagian kecil dari materi genetik yang mudah diidentifikasi. Menurut Liu (1998) penanda genetik ada tiga tipe (a) marka morfologi, protein (biokimia) dan DNA (molekuler). Marka morfologi mudah dilakukan tetapi sulit mengidentifikasi gen dalam jumlah besar jika populasi spesiesnya sedikit. Marka protein yang biasa digunakan adalah isozim, marka DNA dengan mengisolasi sebagian kecil daerah DNA. Menurut Tanksley dan McCouch (1997), marka morfologi merupakan secara visual dikarakterisasi secara fenotipik seperti warna bunga, bentuk biji, tipe tumbuh atau pigmentasi. Marka isozim adalah marka yang dapat membedakan enzim yang dideteksi melalui elektroforesis dan merupakan penanda spesifik. Keterbatasan dari marka-marka biokimia dan morfologi terbatas dalam jumlah dan dipengaruhi oleh faktor-faktor lingkungan atau fase perkembangan dari tanaman.
Marka molekuler pada awal perkembangannya diperkenalkan untuk mengatasi kesulitan seleksi secara konvensional. Apabila marka molekuler yang terpaut dengan gen-gen yang dimaksud sudah diidentifikasi, maka marka tersebut dapat membantu mengurangi ukuran populasi dan waktu yang dibutuhkan dalam program pemuliaan per siklus seleksi. Beberapa kelebihan marka molekuler, khususnya memiliki kemampuan menyeleksi tanaman pada tahap pembibitan untuk sifat yang baru bisa diamati setelah tanaman tumbuh menjadi besar dan kemampuan menyeleksi sifat yang sangat sulit bila menggunakan seleksi fenotipe saja yang membutuhkan waktu relatif panjang (Couch et al. 1991).
Marka SSRs (Simple Sequence Repeats) atau biasa disebut mikrosatelit, telah menjadi sistem marka yang sering digunakan pada tanaman jagung (Smith et al.
1997). Simple Sequence Repeats (SSRs) terdiri dari susunan DNA dengan motif 1 - 6 pasang basa, berulang sebanyak lima kali atau lebih secara tandem (Vigouroux et al. 2002). SSR polimorfis telah digunakan secara ekstensif sebagai marka genetik pada studi genetik jagung seperti pada konstruksi pemetaan keterpautan gen dan pemetaan QTL (Romero-Severson 1998; Frova et al. 1999) atau analisis keragaman genetik dan evolusi (Senior et al. 1998; Pejic et al. 1998; Lu dan Bernardo 2001;
Matsuoka 2002).
M M Mar
d d diide m m mor d d dilak s s sp spppppp sp sp sppp sp sp sp spp sppp spp sp sppp sp sppp s spp sppppp sp spppppp spp spp sp s spppppp sppppppppppppppppppppppppeseseseseeseseseseseseseseseseseseseseeseseseeseseseseseseseseseseeseseseseseeseseseeeeseseeseesesssssssssssssss d de deeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeennnnnnnnnnnngnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn ( ( (19191919191919119191911919191919191919191911919191999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 s s seeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeepepepppeppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppp m ma maa ma ma maaaaa maaaaaaa ma maaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa maaaaaaaaaaaaaaaarkrrrrrrrr m me me me me me me me meeeeee meee me meeee me mee meeeeeeeeeeeeee meeeeeeee meeeeeeee mee meeeeeeeeeeeee m m meerrrurrrrrrrrrrrrrrrr t t teeeerbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrrbrbrbrbrrrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrrbrrbrbrbrbrrrrbrrbrrrbrbrbrbrbrrrrrbrbrrbrrrbrrrrbrrrbrrbrrbrbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbba p p peeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeerkrkrkrkrkrrkrkrkrkrrrkrkrkrkrrkrkrkrkrkrkrrkrrrkrrkrkrrrrrrrrrrrkkkkkkkkkk
k ke keeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeessssssususssssssssssssssssssssussssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssss g ge geeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeennnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn- m me me me me me me me me me me me me me me me me m mee me m me me me mee meeeeee me m me meeeeeeeee me m me me m meeeeeeeeeeeeeeeeeee me m nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn p p per k k kem d d diam y y yang r r relat
m m m me me me me me me me m me me me me me me me me me me me me me mee me me m meeeeeeee m m me m m me me me me me me me m me me me m me me mee me m me m me me me me me m m m m me m m m me m m mee me mee me me m m me m me me m me me m me me me m m nnnnnnnnnnn 1 19 19 19 199999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999799999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 ppppppppppppapppppppppppppppppappppppppppapppppppppppppppppppppppppppppppppppppppp a al al al al alll all al allll al al al all a allllllllllllllllllllll.... . . .... 22222222222222222222222222222222 p p pa pa paaaa paaaaaaa paaaaaaaaaaaa paaaaaaaaaaaaaaaadadaddaddadadadadddadaddddaddddddaddadadadaddaddadadaaa p p peeeeeeeeee pe peeeeee peeeeeeeee peeeeeeeeeeemmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm g ge ge ge ge geeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeenenenenenenenenenennenenenennenenenneneneneeeeeeee M Ma Ma Ma Ma Ma Ma Ma Ma Ma Ma M Ma Ma Ma Ma Ma Ma M Ma Ma M M M M Ma M M Maa M Ma Ma M Ma Ma M M Ma M M Ma Ma M M M M Ma M M M M M M M M Maaa Ma Ma Ma Ma Maaaaaa Maa Maaaa Maaaaaa Maaaaaaaaaaaaaatttttttttttttttttttttttttttt
Primer SSR dibentuk berdasarkan pada daerah pengapit konservatif (conserved flanking region). Variasi dalam jumlah pengulangan untuk suatu batasan lokus diantara genotip-genotip yang berbeda dengan mudah dapat dideteksi dengan teknik PCR (Polymerase Chain Reaction) (Hamada et al. 1982; Powell et al. 1996).
Kemudahan SSR dalam mengamplifikasi dan mendeteksi fragmen-fragmen DNA (Deoxyribo Nucleic Acid), serta tingginya tingkat polimorfisme yang dihasilkannya menyebabkan metode ini ideal untuk dipakai dalam studi genetik, terutama pada studi dengan jumlah sampel yang banyak. Selain itu, teknik PCR pada SSR hanya menggunakan DNA dalam jumlah kecil dengan daerah amplifikasi yang kecil, sekitar 100 - 300 bp (base-pair) dari genom. Selain itu, SSR dapat diaplikasikan tanpa merusak bahan tanaman karena hanya sedikit saja yang digunakan dalam ekstraksi DNA atau dapat menggunakan bagian lain, seperti biji atau polen (Senior et al. 1996).
Marka SSRs juga bersifat multialelik dan mudah diulangi sehingga penggunaan marka SSRs lebih menarik dalam mempelajari keragaman genetik di antara genotip-genotip yang berbeda (Senior et al. 1998). Keunggulan lain adalah selain produk PCR dari SSR dapat dielektroforesis dengan gel agarose, juga dapat dielektroforesis dengan menggunakan gel akrilamid terutama pada alel suatu karakter memiliki tingkat polimorfis yang rendah, dimana gel agarose tidak mampu digunakan (Macaulay et al. 2001).
Beberapa pertimbangan lain sehingga marka mikrosatelit banyak digunakan dalam studi genetik diantaranya: terdistribusi secara melimpah dan merata dalam genom, variabilitasnya sangat tinggi (banyak alel dalam lokus), dan sifatnya yang kodominan dengan lokasi genom yang telah diketahui. Dengan demikian, marka mikrosatelit merupakan alat uji yang memiliki reproduksibilitas dan ketepatan yang sangat tinggi sehingga banyak digunakan dalam membedakan genotipe, evaluasi kemurnian benih, pemetaan gen, sebagai alat bantu seleksi, studi genetik populasi, dan analisis diversitas genetik. Akhir-akhir ini, mikrosatelit lebih banyak digunakan untuk karakterisasi dan pemetaan genetik pada tanaman, diantaranya pada tanaman jagung, padi, anggur, kedelai, jewawut, gandum, dan tomat (Gupta et al. 1996; Powel et al. 1996).
f f flank d d dian P P PCR K K Kem ( ( (DeDeDeDeDeDeDeDeDDeDeDDeDDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDDeDeDeDeDDeDDDeDDeDDeDDDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDeDDDDeDDeDDeDDeDDDDDDeDeoeeeeeeeoooooooooooooooooooooooooooo ((
m me me me me meeeeeee meeeeeee meeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeennnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn s s stttudududududuuuuudududuuuuuuuuuuuuuduuuuuuduuuuududuududuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuduuduuuuuuuuduuuuuuuuuuuuuuuuuuuuduuuuuuuuuuu m me me me meeeeeee meeeeeeeeeeeeeeee meeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeee meeeeeeeeeeeeeeeeennnnnn s s seeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkkkikkkikikkkkkkkkkkikkkkkkkikikkkkikkkikkkkkkkikkikikikkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkt t t taaaaanpnpnpnpnpnpnpnpnpnnnpnnpnpnpnpnnnpnnpnpnpnpnpnnpnpnpnpnpnnpnpnnnpnpnnpnnnnnnnnnpnpnnnnnpnpnnpnnnpnnnpnnnpnnnpnpnpnnpnnnpnpnpnnnnnnnnnnnnpnpnnpnnnnnnnnnnpnnnnnnpppppppp e ek ekkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkstsssssssststssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssr a al alllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllll. . .... .. ..111
p p peeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeennnnnngnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn a an annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatattatattatttattttatatatttttatatttatattttatatttattttttattttatttatatttatttatatattttttatatttttttttttttttttttttttttttttt s s seeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeelalallalalalalallalalalllalalalallalalllalalalalllalallalalallalalallallallalallllallllllllllllalllalalalalllalallllllllaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaai d d diele m m mem d d digu
d d dala g ge ge ge geeeeeeeeeeee geeeeeeeenononononononononnononnonoooooo k ko ko ko koo koooooooooo ko ko ko koo koo kooo ko kooo ko k ko ko kooo koo k k ko ko koooooooooooooooooooooo k kooooooooooodddddddddddoddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddd m mi mi mi mi mi mi mi mi mi mi mi mi mi m m mi mi mi mi m mi mi mi m mi miii mi mi miiii mi mi mi m mi mi mi m mi m mi mi mi mi mi m mi m m mi mi mi m m m m mi miii m mi m m m miikkkkkkrkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkk s s sa saaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaanngngngngngngnnnnngngngngngnnngngngngngngngnngngnngngnnnngngngnngnngngnnngnngngnnnngnnnnngnnnngnnnnnngngnngnnnnngnnnnnnnnnnnnnngggggggg k ke ke ke keeeee k ke ke k keee kee ke keeeeeemmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm d da da da da daaa da daaaaaa daa daaaaaaaaaaa daaaaaaaaa da da daaa daa da daa da daa da da d d daa daaaa d daaa daaaaaa daaa d nnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnn u u un un un un unnn un unnn un unnn un un unn unnnnn unnnn unnn un un unn un un unn un unn un unn un unn un un unnn unnnnnnnnnnnnnnnnnn u untutttutttttttttttttttttttttttttttt j ja jaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagugugugugugugugugguguguggguguguguggugugugugugugguggguguggggugugggggguggggggugguggggggggguguguuuuuuuuuuu e et et etttttt ettttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttt a a a a a aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaallllllllll
Keragaman Genetik pada Jagung
Dengan munculnya metode molekuler untuk menduga variasi genetik, berbagai studi mengenai keragaman genetik dan hubungannya dengan galur-galur inbrida jagung, hibrida dan bersari bebas. Keragaman molekuler pada jagung telah diteliti untuk berbagai kepentingan. Mum dan Dudley (1994) telah berhasil mengidentifikasi kelompok heterotik utama dan subgrup dalam set yang terdiri atas 148 galur inbrida Amerika Serikat (A.S.), menggunakan 46 marka RFLP.
Berdasarkan analisis molekuler dengan menggunakan 83 marka SSR, Lu dan Bernardo (2001) menyimpulkan bahwa keragaman genetik sejumlah galur inbrida A.S. terbaru telah menurun pada level genetik tetapi tidak pada level populasi jika dibandingkan dengan galur-galur penting yang telah lama digunakan. George et al.
(2004) menduga keragaman genetik untuk penyakit bulai terhadap 102 galur inbrida Asia menggunakan 76 marka SSR dan menyimpulkan bahwa aktivitas pemuliaan jagung di Asia tidak menyebabkan penurunan keragaman genetik dalam skala besar pada daerah tertentu dimana aktivitas dilakukan.
Korelasi Marka DNA dengan Marka Fenotipik
Penelitian mengenai hubungan antara marka-marka dan karakter-karakter yang bernilai ekonomi, penting dalam kaitannya dengan pemanfaatan marka molekuler sebagai alat bantu dalam pemuliaan. Perhatian utama dalam pogram pemuliaan jagung hibrida adalah mengidentifikasi galur-galur murni dimana dari hasil persilangannya akan diperoleh tingkat heterosis yang optimal (Lee et al. 1989).
Estimasi kedekatan genetik antara tanaman bermanfaat di dalam studi evolusi populasi atau spesies dan dalam perencanaan persilangan untuk hibrida atau dalam pengembangan kultivar homozigous (Cox et al. 1985).
Hubungan genetik dapat bermanfaat sebagai alat peramal dalam penampilan kombinasi genotipe untuk program pemuliaan sehingga dapat mengurangi biaya dan waktu yang dibutuhkan dalam pengujian hibrida. Eksploitasi secara komersial dari fenomena heterosis adalah salah satu kontribusi yang sangat penting dari pemanfaatan hubungan genetik dalam pemuliaan tanaman di abad ini (Barbosa-Neto et al. 1996).
K K Ker
b b berb i i inbr d d diitet l m me me me me me me me me me me me me me me m me me me me m me me me me m m me m me m me m me m me me me m m me me m me m m me m meeee mee me me meeeeeeeeeeennnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn 1 14 14444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444888 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888
B Be Be Beeeeeeeeeeeeeeeeeee Beeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeerrrrrrrrnrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrr A A.
A.
A...S.SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS d di diiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiibababababababbabbbbbabababbbbbbbbbbabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbabbbababababbbbbbbabababbbbbbbbbbbbbbbbbbaaaa ( ( (222222222222222222222222222222222222200000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 A As As As Asssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssiiiiiiiiiiiaiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii j j jaaaaguguggggguggguguguggguggggugggugugguggggggggggggggggggggguggugggggggggggggggggggggggggggggggggggguggggggggggggggggggggggggg p p paaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaddadddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddddd
K Ko Ko Ko Ko Ko Ko Kooo Ko Ko Ko Ko Ko Ko Koo Koo Ko Koo Ko Ko Ko K Koo Koo Koooo Kooooooo Koo Ko K Ko K Koo K Ko Ko Ko Ko Koo K Ko Ko K Ko Ko Ko Ko Koooo Ko Ko K Koo K Kooooooooooooooo K rrrrrrrrrrrrrrrrrrrr
b b bern s s seba j j jagu p p pers E Es Es Es Es Es Es Es Es Es Es Es E Es Es Ess Essss Es Es Es Es Es Ess Es E Es Ess Es E Es Es E E Esssssss Essssssssss E Esss Es E Esssstitititititititititititititititititittittititititititititititititititittititititititititttttttititittittittititttitttiiiiiiiiiiiiiiiiimmm p p p p po po po po po po po po poo po po po po po po p po po poo po po poo po p p po po po po poo p poo po p p p p p po po po poo po po po p po po p p poooo poo po p po p po p p po pooo p p p p p p p p ppuppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppp p p pe pe peeeee peeeeeeeee p nnnngnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
k ko ko ko ko ko ko ko k ko ko kooooo ko ko ko ko ko k k koooooooooooooo kooooo koooo kooo kooooo ko koo kooooommmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm w wa wa wa wa wa w w wa w w w w w wa w wa wa wa wa wa wa w wa wa w w wa w w wa waaaaaa w w w w w kkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkk f f fe feeeeeeeeeeeee feeeeeeeeeeeeeenonononnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn p p pe pe pe p mmmmm e et et et etttttttttttttttttttttttttttt a a a aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaall
Estimasi jarak genetik sejumlah galur murni jagung yang dilakukan oleh Lee et al. (1989) berdasarkan MRD (Modified Rogers’ Distance) menunjukkan bahwa hasil (ton/ha) dan kemampuan daya gabung khusus (DGK) mempunyai korelasi yang nyata dengan MRD pada enam dari 10 peta kromosom jagung. Oleh sebab itu, gerombolisasi galur-galur jagung ke dalam kelompok heterosis sebelum pengujian di lapangan akan memungkinkan bagi peneliti pemulia untuk mengurangi biaya karena dapat menghindari terjadinya persilangan di dalam kelompok heterosis.
Riday et al. (2003) membandingkan antara nilai jarak genetik dengan morfologi dan heterosis pada Medicago sativa sub sp. sativa dan subsp. Falcata, menemukan bahwa jarak genetik berdasarkan AFLP tidak berkorelasi dengan hasil daya gabung khusus (DGK) namun sebaliknya matriks jarak berdasarkan morfologi terhadap 17 karakter agronomik dan karakter kualitatif mempunyai korelasi yang nyata dengan heterosis.
Metode Dialel
Metode dialel merupakan cara analisis keturunan untuk daya gabung, baik daya gabung umum maupun daya gabung khusus (Hallauer and Miranda 1981). Analisis dialel membantu para pemulia menentukan pola heterosis antar populasinya serta memilih bahan dan metode yang akan digunakan dalam program pemuliaannya.
Persilangan dialel yakni persilangan yang melibatkan sejumlah genotip (varietas, galur atau klon) dalam semua kombinasi. Masing-masing genotip mempunyai kesempatan untuk disilangkan dengan genotip lain, bahkan dapat ditambah dengan persilangan sendiri genotip itu. Melalui persilangan dialel dapat diketahui kombinasi mana yang cocok dipasangkan sehingga dapat menghasilkan suatu varietas yang lebih baik.
Menurut Griffing (1956), terdapat empat macam metode percobaan yang digunakan untuk analisis dialel yakni:
1. Metode 1: kombinasi lengkap p2 , terdiri dari tetuanya, F1, dan persilangan resiprokalnya
2. Metode 2 : 1/2p (p + 1) kombinasi, terdiri dari tetuanya dan F1 3. Metode 3 : p (p-1) kombinasi, terdiri dari F1dan resiprokalnya a
a al. ( ( ( (ton/
n n nyat g g gero l la laaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaapapapapapapapapapapapapapapapapapapapapapapapapapapapppppppapapappapapapapapapapappapapapappapapapapappapapappapapapapapapppapapapappapappaaaaaaaaaaa d da daaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaapapppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppp
m mo mo mo mooooooo moooooooooooooooo moooooooooooooooooooooooooo mooooooooooooooooorr m me me me me me me me meeeeeeeeeeeeee meeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeennnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn d da daaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaayayyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyy t t teeerhrrhrrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrhrrhrhrhrhrhrrhrhrhrhrrrhrrrhrhrrrhrrrhrrrhrrrhrrrhrrrrrhrhrrrrrrrrrhrrhrhrhrrhrrrrrrhrhrrhrrrhahhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh n ny nyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyataaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa
M Me Me Me Me Me Me M Me Me Me M Mee Me Me Me Me Me Me Me Me Me Me Me M Mee Mee Me Me Me Me Me M Mee Me M M Meee M M Mee M Mee M M M Me M Me Me Me M M Mee M M M M Mee Mee M M M M Meeeeeeeeeeeeeee Mee Meee Meeeeeeet
g ga gaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaabbbubbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbb d d diale m m mem
( ( (vari m m mem d d ditam d di diiiiiiii diiii diiii di di diii diiiiiiiiii dii diii diii dii di diiiii diiii diii di d di d di dii diiii di d diiikkkkkkkekekekekkkkkkkkekkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkk s s su suu suuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuataataaaataaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaau
d d d di di d di di di di di di di d di di dii d d di di di di di di d d di di d di di d d dii d d diii di di diii di d d di d dii di d di d d d d d d di d diiiiii dii dii dgggggggguguguguggggggggugugggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggg
1 1.
1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
2 2 2 2.
2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3.
3.
3 3.
3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3
4. Metode 4: ½ p (p-1) kombinasi, terdiri dari F1 saja tanpa tetua dan resiprokalnya.
Penggunaan salah satu metode dialel tergantung dari tujuan analisisnya atau dihubungkan dengan penyederhanaan analisisnya. Berdasarkan cara penentuan tetua-tetua yang dipakai dalam persilangan, interpretasi hasil analisis dialel dibedakan ke dalam dua model, yaitu :
1. Model I atau model tetap (fixed model), dengan menggunakan tetua-tetua tertentu yang merupakan genotip yang dimaksud (reference genotype).
Estimasi yang diperoleh hanya berlaku untuk genotip yang dimasukkan dalam pengujian dan tidak berlaku untuk populasi lain.
2. Model II atau model acak, dengan menggunakan tetua-tetua yang merupakan contoh acak dari populasi tetua yang dimaksud (reference population). Estimasi yang diperoleh diinterpretasikan berkaitan dengan populasi tetua, dari mana genotip yang dievaluasi diambil secara acak (Griffing 1956).
Dalam model I, tetua-tetua yang dipelajari atau diteliti adalah populasi, maka cukup tepat untuk menganalisis galur-galur elit yang terpilih. Analisis model I digunakan untuk mengestimasi efek DGU dan DGK yang hasilnya berlaku hanya untuk tetua-tetua yang dievaluasi saja. Hasil akan berubah bila tetua-tetua tersebut dievaluasi bersama-sama dengan tetua lain yang berbeda. Sedangkan tujuan utama analisis model II adalah estimasi komponen varians populasi yang dimaksud (reference population) dan berkaitan dengan tipe aksi gen dalam populasi (Moentono 1985).
Daya Gabung (Combining Ability)
Daya gabung merupakan ukuran kemampuan suatu galur atau tetua, yang bila disilangkan dengan galur lain akan menghasilkan hibrida dengan penampilan superior. Konsep daya gabung sangat penting dalam pemuliaan, berkaitan dengan prosedur pengujian galur-galur berdasarkan penampilan kombinasi keturunannya.
Nilai masing-masing galur terletak pada kemampuannya untuk menghasilkan keturunan unggul bila dikombinasikan dengan galur-galur lain (Allard 1960).
4.
d d dihu t te teeeeeetutututututututututtttutuuuuuuuuuuuuuuuuua d di di di di di di dii di di di dii di d diii di d dii di diiii dii dii diiiiiiiiiiiiiiibebbbebebbebebebebbebebebebebebebebbbebebebebebebebebebebebebbebbbebbbbebbbebebbbbebbbbbbbbbbee
c c cuku d d digu u u untu d d diev a a anal ( ( (refe 1 19 19 19999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999988888588858888888858888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 D Da Da Da Da Da D Da Da Da Da Da Da Da Da Da Da Da Da Da Da Da Da Daa Da Da Da D Daaa Da Da Da Daa Da Da D Daa D D Da D D Da Daaaaaa Da Da Da Da Daaaa Daaaaaaaaaaaaaayyyyyyyyyyyyyyyyy
d di di di d diii dii di di d dii di d di di di d di d di diii diiii diiiiiiiiii diiii diiiiiiiiiiiiiiiii diiiiiiii di dii disisisisisisisisisissisisisisisissisisisisisisisssissssisiiiiiiiiiil s s su suuuuuu suuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuupepppppppeppeppppppppppppppppppppppppp p p pr pr prrrrrrrrr pr prrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrooooosoosoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo N N Ni Ni Ni Ni Ni Ni Ni N Ni Niiii Ni Nii N N Nii Ni Ni Ni Ni Ni N Ni Ni Ni Ni Ni Ni N N Ni N N Ni N Ni N N Nii Niii Ni Ni Niiii Ni N N N N Ni N N N N N N N N N N N N N N N N N N N N N Nlalalallllllllalaaaaa k ke ke ke ke k keeee keeeee ke k keee kee keeee keeeeettututttttttututututtttututtututututututututtututututututututututututututtutututtttttttttutuuuuuuuuuuuuuuuu
Daya gabung ada dua macam yakni daya gabung umum (general combining ability) dan daya gabung khusus (specific combining ability). Daya gabung umum (DGU) adalah nilai rata-rata dari galur-galur dalam seluruh kombinasi persilangan bila disilangkan dengan galur-galur lain. Daya gabung umum yang baik adalah nilai rata-rata kombinasi persilangan mendekati nilai rata-rata keseluruhan persilangan.
Daya gabung khusus (DGK) adalah penampilan kombinasi pasangan persilangan tertentu. Bila nilai pasangan persilangan tertentu lebih baik daripada nilai rata-rata keseluruhan persilangan yang terlibat, dikatakan daya gabung khususnya baik (Poehlman dan Sleeper 1990).
Daya gabung umum merupakan simpangan dari nilai rata-rata seluruh persilangan, sehingga nilai daya gabung umum dapat positif atau negatif. Dengan demikian jumlahnya sama dengan nol. Jadi nilai daya gabung umum merupakan angka yang relatif terhadap nilai daya gabung umum yang lain. DGU yang besar menunjukkan tetua/galur yang bersangkutan mempunyai kemampuan bergabung dengan baik, sedangkan nilai DGU yang rendah menunjukkan bahwa tetua tersebut mempunyai kemampuan bergabung yang lebih jelek daripada tetua yang lain. Nilai positif atau negatif dari DGU tergantung pada karakter yang diamati dan bagaimana cara menilainya.
Daya gabung yang diperoleh dari suatu persilangan antar kedua tetua, dapat memberikan informasi tentang kombinasi-kombinasi yang dapat memberikan turunan yang berpotensi hasil tinggi. Hasil tinggi dapat diperoleh apabila kombinasi tersebut memiliki nilai heterosis dan daya gabung khusus yang besar. Galur yang mempunyai efek daya gabung umum yang tinggi tidak selalu memberikan efek daya gabung khusus yang tinggi pula (Silitonga et al. 1993).
Daya gabung umum dan daya gabung khusus yang bermakna untuk karakter yang dievaluasi berindikasi bahwa keragaman karakter disebabkan oleh efek gen aditif dan non aditif. Semua karakter dari suatu galur dapat diketahui efek DGU dan DGK-nya, diantaranya karakter hasil, tinggi tanaman, berat biji, ketahanan terhadap hama penyakit dan lain-lain.
a a abili ( ( (DG b b bila r r rata- D Da Da Da Da Da Da Daa Da Da Da Daa Da Da Da Da Da Da Da Da Da Da Da Da Da Da Da Daa Da Da Da Da D D Da Daaaaaa Da Da Da Daaaaa D Daa Daa Daa D D Da D D Da Da Da Da D Daaa Da Daaa D Da Daa Da D yyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyy t t teeertrtrtrtrtrtrtrtrtrrrtrrrrtrtrtrtrtrrtrtrtrtrtrtrtrtrtrrtrrtrrtrrtrtrtrtrtrrtrtrtrrtrtrtrrtrrrrrrtrtttttttttttttttttttttttttteeeeeeee k ke keeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeesesssssssesesesesssssssessssssssssssssssssssssesssssssssssssssssssssssssssse ( ( (PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPooooooooooooooeooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
p p peeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeersrsrsrsrrsrrrsrsrsrrrrrrsrsrrrrrsrrrrrrrrrrrrrrrrrrrsrrsrrrrrrrrrrrsrrsrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrr d de deeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeemmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm a an annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggggggkgggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggg m me me me me me me me me meeeeee meeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeee m meeeeeennnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn d de deeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeennnnnngnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn m me me me me me meeeee me meeee meee meeeeeee meeeeeeeeeeeeeeeeeeeeee meeeeeeeeee meeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeee meeeeee meeeeeeeeeeemmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm p p pooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooosisssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssss c c cara
m m mem t t turun t t terse m m me m m m m m m me me m m me me me me m m me m me me me m mmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm g ga ga ga g ga ga gaa ga gaa gaa ga g gaa ga ga ga gaa ga gaaa gaaaaa ga ga gaa ga g ga ga ga ga gaa gaaa ga ga gaaa ga ga gaaaaaaaaaa gaaa g gaaaaaaaaa g g g g g g g g g g g bbbbbbbbbbbbbubbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbb
y ya ya ya ya yaaaaaaa yaaaaaaaaaaaaa yaaaaaaaaaaaaaaa y y y nngngnnnnngngngnnnngnnnnnngngngngnnnnnnngnnnnnngnnnngnnnngngnnnnngnnnngnnngnngnnnngnnnnnnngngnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggg a ad ad add addddddddddddddddddddddddddddddddddddititiitiititititiitititiiitiiitiititititititititiiiiiiiitititiiitiitititiiitititiiitiitiiiitiiiiiittttii D DG DG DG DG DG D D D DG DG D DG DG D D DG DG DG DGG DG DG DG D DG D D D DG DGG D D D DG DG DG DG DG DG D D DG D D D DGG DG DG D D DG D D D D D D D D D D D D D D D D D D D DGGG D D D D K h ha ha h haa ha ha ha haaa ha ha haaaa ha haaaaa haaaaa haaaaa ha haaaa h haa ha haaa ha ha ha ha haaaaaaaaaaaaaaaaaaaaammmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm
Heterosis
Pada umumnya apabila dua tanaman yang berlainan (unrelated or distantly related individuals) disilangkan, maka turunannya sering memperlihatkan gejala heterosis atau umumnya disebut vigor hibrida (Hybrid Vigour) (North 1979 dikutip Baihaki 1989). Tanaman turunan pertamanya memperlihatkan pertumbuhan yang lebih subur dan terkadang lebih genjah daripada kedua tetuanya. Untuk persilangan yang melebar, misalnya persilangan antar species tanaman atau antar genera, dapat menghasilkan tanaman turunan pertamanya menunjukkan pertumbuhan yang lemah.
Dengan demikian terlihat bahwa terdapat variasi penampilan gejala heterosis dan tergantung pada materi yang digunakan dalam persilangan.
Fenomena heterosis telah banyak dimanfaatkan secara intensif pada pemuliaan jagung dalam membentuk kultivar hibrida. Keberhasilan jagung dalam memanfaatkan heterosis mendorong pemulia menggunakannya pada jenis tanaman lain seperti pada tanaman terung, tomat, mentimum, sorgum, dan lain-lain. (Dahlan et al. 1998).
Terdapat tiga konsep heterosis yang dapat menjelaskan gejala heterosis.
Konsep pertama adalah konsep yang berdasarkan hipotesis bahwa vigor hibrida merupakan hasil terkumpulnya gen-gen dominan yang baik (Favourable dominant genes) dalam satu genotip tanaman dan dikenal sebagai hipotesis dominan.
Menurut Shull dan East (1908) dikutip Sriani et al. 2007, Davenport merupakan orang pertama yang mengajukan hipotesis dominan dalam upaya menjelaskan secara genetik mengenai gejala heterosis. Konsep kedua didasarkan kepada hipotesis bahwa vigor hibrida merupakan hasil penampilan superioritas heterozigositas terhadap homozigositas, artinya bahwa individu yang penampilan superior adalah individu yang memiliki jumlah alil dalam keadaan heterosigos yang terbanyak, konsep ini dikenal sebagai hipotesis overdominan.
Konsep ketiga didasarkan pada teori epistasis. Peranan aksi gen epistasis berperan terhadap wujudnya heterosis. Sumbangan tindakan gen interlokus terhadap pembentukan suatu sifat jelas diketahui, namun sangat rumit. Pengertian terhadap tindakan gen epistasis ini masih kurang jelas dan belum ada bukti yang cukup untuk menunjukkan epistatsis adalah sumber heterosis yang utama (Sriani et al. 2007).
H H Hete
r r rela h h hete B B Baih l le leeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeebibibibibibibibibibibibibibibibibbibibbibibibbbibibibibibibibbbibibbbibibibibibibibibibibibibbibibibibibbibbibibbbbbbbbibbibiiiiiiiiiiiihhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh y ya yaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaannnnnnnnnngnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn m me me me me me me mee mee me me mee me me mee mee m meeeeee me me me meee me me me me me me me me me me me mee me meee me m m meeeeeeeee meeee meeee meeeeeeeeeeeeennnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn D De De De Dee Deeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeennnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn t t teergrgrgrgrgrgrgrrgrgrgrgrgrgrgrrgrgrgrgrgrrrgrrgrrrgrrgrrrrgrrgrgrgrgrrgrgrgrrrrgrrrrgrrrrrrrrrrgrrrgrgrgrrgrrgrgggggggggggggggggga
j ja jaaaaguguguguguguggugugguggggugugugugugggggggugggggguggugguguggguguguggggugggggugguggugugugugggggugguggugggggggggggggggggggguggggggugugguggggggggggggggggggguuuuuuuu m me me me me me meeeee meeeeeee meeeeee meeeee meeeeeeeeeeeeeeeeeeeemmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm l l laaaaainininiinininininininininininiinininininiiniinininiiniiiiininininininiininininininiinininininininininiiiniiininininiiiiniininininiiniiiinininiininiiniiiiiiniiiiiniiinnnnnnnnnnnnnnn e et etttttt a a aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaal
K Ko Ko Ko Ko K K Ko Ko Kooo K K K K K K K Ko K K K K Ko Ko Koo K K Ko K K Kooo K K Kooooo Ko K Ko K Koooooooooooooooooo K nnnnnnn m m meru g g gene
m m meru m m men k ke ke ke ke k k ke keeeee ke keeeee keeee ke ke keeeeeee ke kee keeeee keeepapapappapapapapapapppppappppppappapapppppapappapppappppppapppppapapppappappapppappppappapppppppppppppppppppppa h he he he hee he he he he he he heee he he he he he he he he he he he he he he heee h he hee he he he he he hee heeeeee h h he he h he h heee h h h he h h h hee heee hee he h he he he he he he he he he he h h h hettttttttetettttetetetetttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttt s s su suuu suuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuppeppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppppp t te te tee teee te te tee te teeee tee tee te tee teee tee tee teeeee teeee tee teee teeeeeeeeeeee te teeeeeee teeee teeeee teerbrrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrbrrbrrbrbrbrbrbrbrrrrrrrrrrbrrrrrbrrrbrrrrbrrrrrrrrrrbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbba
b b be be beeee beeeee beeeeeeeeeee beeeeeeeeeerprprprrprprrrprrprrrrrrprrprprprprprprprprprprpppppppppppppppppp p p pe peeeeee peeeeeeeeee pe peeeeeeeeeeeeeemmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm t ti tiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiindndndndndndndndndndnndndndndndndndnddddddddddddddddddddddaa m me me me me me me me me me me meeeee m me me meee mee me m me meee meeee me me meeeeeee m me meeeeeee meeeeeeeeeeeeeeeeennnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
