• Tidak ada hasil yang ditemukan

Tugas Makalah 1 Bioinformatika

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2021

Membagikan "Tugas Makalah 1 Bioinformatika"

Copied!
21
0
0

Teks penuh

(1)

Pengenalan Bioinformatika

Pengenalan Bioinformatika

Disusun guna memenuhi tugas mata kuliah Bioinformatika Disusun guna memenuhi tugas mata kuliah Bioinformatika

Oleh :

Oleh :

AHMAD MAULUDIN SOHIH

AHMAD MAULUDIN SOHIH

NIM 121810401024

NIM 121810401024

JURUSAN BIOLOGI

JURUSAN BIOLOGI

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM

UNIVERSITAS JEMBER UNIVERSITAS JEMBER 2013 2013 M K L H M K L H

(2)

KATA PENGANTAR KATA PENGANTAR

Puji syukur kehadirat Tuhan Yang Maha Esa atas rahmat dan hidayah-Nya Puji syukur kehadirat Tuhan Yang Maha Esa atas rahmat dan hidayah-Nya yang telah diberikan kepada penulis, sehingga dapat menyelesaikan makalah yang yang telah diberikan kepada penulis, sehingga dapat menyelesaikan makalah yang  berjudul

 berjudul ““Pengenalan BioinformatikaPengenalan Bioinformatika”” ini sesuai dengan yang direncanakan. ini sesuai dengan yang direncanakan.

Penyusunan makalah ini digunakan untuk melengkapi standart ketuntasan Penyusunan makalah ini digunakan untuk melengkapi standart ketuntasan  penilaian

 penilaian mata mata kuliah kuliah BioinformatikaBioinformatika.. Penulis menyadari bahwa masih banyakPenulis menyadari bahwa masih banyak kekurangan dalam penulisan makalah ini. Oleh karena itu, semua bentuk saran kekurangan dalam penulisan makalah ini. Oleh karena itu, semua bentuk saran dan kritik senantiasa penulis harapkan bagi kesempurnaan makalah ini.

dan kritik senantiasa penulis harapkan bagi kesempurnaan makalah ini.

Penulis mengucapkan banyak terima kasih kepada Dr.Kahar Muzakar, S.Si Penulis mengucapkan banyak terima kasih kepada Dr.Kahar Muzakar, S.Si dan pihak-pihak yang memberikan bantuan baik secara langsung mapun tidak dan pihak-pihak yang memberikan bantuan baik secara langsung mapun tidak langsung selama proses penyusunan makalah ini.

langsung selama proses penyusunan makalah ini.

Akhirnya, penulis berharap semoga penyusunan makalah

Akhirnya, penulis berharap semoga penyusunan makalah ini banyakini banyak membawa manfaat bagi pihak-pihak yang terkait.

membawa manfaat bagi pihak-pihak yang terkait.

Jember, Maret 2014 Jember, Maret 2014

Ahmad Mauludin Sohih Ahmad Mauludin Sohih

 NIM

(3)

DAFTAR ISI DAFTAR ISI Halaman Halaman HALAMAN JUDUL HALAMAN JUDUL ... i... i KATA PENGANTAR  KATA PENGANTAR ... ... iiii DAFTAR ISI

DAFTAR ISI ... ... iiiiii BAB 1. PENDAHULUAN

BAB 1. PENDAHULUAN ... 1... 1 1.1

1.1 Latar Latar Belakang Belakang ... ... 11 1.2

1.2 Rumusan Rumusan Masalah Masalah ... ... 11 1.3

1.3 Tujuan Tujuan ... ... 22 1.4

1.4 Manfaat Manfaat ... .... 22 BAB 2.

BAB 2. SEJARAH BIOINFORMATIKASEJARAH BIOINFORMATIKA ... ... 33 BAB 3.

BAB 3. PENGERTIAN BIOINFORMATPENGERTIAN BIOINFORMATIKAIKA ... ... 44 BAB 4.

BAB 4. BIOINFORMATBIOINFORMATIKA KLASIKIKA KLASIK ... ... 55 BAB 5.

BAB 5. BIOINFORMATBIOINFORMATIKA BARUIKA BARU ... ... 55 BAB 6. CABANG

BAB 6. CABANG

 – 

 – 

 CABANG yang TERKAIT CABANG yang TERKAIT DENGAN

DENGAN BIOINFORMATBIOINFORMATIKAIKA ... ... 66 6.1

6.1 Biophysics Biophysics ... ... 66 6.2

6.2 Computational Computational biology biology ... .... 77 6.3

6.3 Medical Medical informatics informatics ... ... 77 6.4

6.4 Cheminformatics Cheminformatics ... ... 77 6.5

(4)

6.6

6.6 Proteomics Proteomics ... ... 99 6.7.

6.7. Pharmacogenomics Pharmacogenomics ... ... 1010 BAB 7. JENIS DATA

BAB 7. JENIS DATA BIOLOGI DI BIOINFORMATIBIOLOGI DI BIOINFORMATIKAKA 7.1

7.1 Manajemen Manajemen Data Data ... ... 1111 7.2

7.2 Struktur Struktur dan dan Sekuens Sekuens Protein Protein dan dan Gen ...Gen ... ... 1111 7.3

7.3 Struktur Struktur molekuler molekuler 3D 3D ... ... 1111 7.4

7.4 Fungsi Fungsi dan dan Struktur Struktur Genom Genom ... ... 1111 7.5

7.5 Data Data Bibliofrafik Bibliofrafik ... ... 1212 BAB 8.

BAB 8. TEKNOLOGI Di DALAM BIOINFORMATIKATEKNOLOGI Di DALAM BIOINFORMATIKA 8.1 Teknologi dan

8.1 Teknologi dan Inovasi Microsoft di bidang BioinformatikaInovasi Microsoft di bidang Bioinformatika ... ... 11 BAB 9. PENUTUP BAB 9. PENUTUP ... 9.1 9.1 Kesimpulan Kesimpulan ... 9.2 Saran 9.2 Saran ... DAFTAR PUSTAKA DAFTAR PUSTAKA ... LAMPIRAN LAMPIRAN

(5)

BAB 1.

BAB 1. PENDAHULUANPENDAHULUAN

1.1

1.1 Latar BelakangLatar Belakang

Bioinformatika merupakan bidang ilmu dalam biologi yang menggunakan Bioinformatika merupakan bidang ilmu dalam biologi yang menggunakan teknologi computer untuk penerapannya dalam ilmu biologi. Bioinformatika teknologi computer untuk penerapannya dalam ilmu biologi. Bioinformatika ini lebih ditekankan dalam bidang khusus ilmu biologi, yaitu biomolekuler. ini lebih ditekankan dalam bidang khusus ilmu biologi, yaitu biomolekuler.  Namun

 Namun bila bila penerapannya penerapannya teknologi teknologi computer computer dalam dalam ilmu ilmu biologi biologi lebihlebih dikenal dengan komputasi biologi.

dikenal dengan komputasi biologi.

Perkembangan Bioinformatika menyebabkan pesatnya ilmu biologi Perkembangan Bioinformatika menyebabkan pesatnya ilmu biologi khususnya bidang biologi molekuler, dengan menggunakan teknologi khususnya bidang biologi molekuler, dengan menggunakan teknologi memudahkan dalam penelitian, dan menghasilkan keakuratan dalam memudahkan dalam penelitian, dan menghasilkan keakuratan dalam  pengerjaan.

 pengerjaan. Di Di bioinformatika bioinformatika sering sering digunakan digunakan untuk untuk sequen sequen DNA, DNA, RNA,RNA,  protein, dan lain

 protein, dan lain –  –  lain yang berkaitan. lain yang berkaitan.

Diketahui dengan demikian, namun bioinformatika banyak kalangan ynag Diketahui dengan demikian, namun bioinformatika banyak kalangan ynag tiddak mengetahui tentang bioinformatika itu seperti apa. Maka dari itu tiddak mengetahui tentang bioinformatika itu seperti apa. Maka dari itu  penulis

 penulis menulis menulis makalah makalah ini ini dengan dengan tujuan tujuan dapat dapat memberikan memberikan wawasanwawasan kepada para saintis biologi sendiri, pembaca, dan pihak yang bersangkutan kepada para saintis biologi sendiri, pembaca, dan pihak yang bersangkutan  pada umumnya. Yan

 pada umumnya. Yang akan dibahas tentang bioinformatika.g akan dibahas tentang bioinformatika.

1.2

1.2 Rumusan MasalahRumusan Masalah

Dari latar belakang diatas

Dari latar belakang diatas maka dapat dirumuskan masalahnya yaitu,maka dapat dirumuskan masalahnya yaitu, 1.2.1

1.2.1 Bagaimana Bagaimana sejarah sejarah Bioinformatika Bioinformatika ?? 1.2.2

1.2.2 Apa pengertian bioinformatika ?Apa pengertian bioinformatika ? 1.2.3

1.2.3 Apa itu bioinformatika klasik ?Apa itu bioinformatika klasik ? 1.2.4

1.2.4 Apa Apa itu bioinfoitu bioinformatika baru rmatika baru ?? 1.2.5

1.2.5 Apa cabangApa cabang –  –  cabang  cabang yang yang terkait dengan terkait dengan Bioinforamtika ?Bioinforamtika ? 1.2.6

1.2.6 Bagaimana teknologi dan penerapan Bioinformatika ?Bagaimana teknologi dan penerapan Bioinformatika ? 1.2.7

(6)

1.3

1.3 TujuanTujuan

Tujuan dibuatnya makalah ini adalah untuk mengetahui tentang Tujuan dibuatnya makalah ini adalah untuk mengetahui tentang  bioinformatika,

 bioinformatika, manfaat manfaat atau atau peran peran dari dari bioinformatika bioinformatika dan dan penerapannya penerapannya dalamdalam  bidang ilmu biologi.

 bidang ilmu biologi. 1.4

1.4 ManfaatManfaat

Makalah ini diharapkan menambah pengetahuan penulis, maupun pembaca Makalah ini diharapkan menambah pengetahuan penulis, maupun pembaca serta pihak

serta pihak  –  –   pihak yang terkait, tentang apa itu Bioinformatika, bagaimana  pihak yang terkait, tentang apa itu Bioinformatika, bagaimana  peranannya dibidang bio

(7)

BAB 2.

BAB 2. SEJARAH BIOINFORMATISEJARAH BIOINFORMATIKAKA

Istilah bioinformatics awal dikemukakan di era 1980-an untuk mengolah Istilah bioinformatics awal dikemukakan di era 1980-an untuk mengolah data analisis biologi dengan menggunakan computer. Bioinformatika sering data analisis biologi dengan menggunakan computer. Bioinformatika sering diterapkan dalam bidang

diterapkan dalam bidang –  –  bidang sekuen DNA, pembuatan basis data pada tahun bidang sekuen DNA, pembuatan basis data pada tahun 1960-an.

1960-an.

Paulien Hogeweg merupakan tokoh yang menciptakan istilah Paulien Hogeweg merupakan tokoh yang menciptakan istilah  bioinformatika

 bioinformatika pada pada tahun tahun 1970. 1970. Komputer Komputer menjadi menjadi penting penting dalam dalam ilmu ilmu biologibiologi molekuler seiring penemuan urutan insulin di awal tahun 1950an oleh Frederick molekuler seiring penemuan urutan insulin di awal tahun 1950an oleh Frederick Sanger. Pelopor Bioinformatika di lapangan adalah Margaret Oakley Daydoff, Sanger. Pelopor Bioinformatika di lapangan adalah Margaret Oakley Daydoff, yang dipuji oleh David Lipman (National Center for Biotechnology Information). yang dipuji oleh David Lipman (National Center for Biotechnology Information). Daydof

Daydof berhasil menyusun berhasil menyusun salah satu salah satu database urutan database urutan protein pertama. protein pertama. PeloporPelopor lain, Elvin A Kabat, berhasil memelopori analisis urutan biologis pada tahun 1970 lain, Elvin A Kabat, berhasil memelopori analisis urutan biologis pada tahun 1970 ( James, 2001 ). ( James, 2001 ). Paulien Hogeweg Paulien Hogeweg11 1 1  http://www-binf.bio.uu.nl/ph/  http://www-binf.bio.uu.nl/ph/

(8)

BAB 3.

BAB 3. PENGERTIAN BIOINFORMATIPENGERTIAN BIOINFORMATIKAKA Bioinformatika

Bioinformatika  berasal  berasal dari dari bahasa bahasa yaitu yaitu “bioinformatics” “bioinformatics” yang yang artinya artinya (( ilmu yang mempelajari ) penerapan teknik komputasional untuk mengelola dan ilmu yang mempelajari ) penerapan teknik komputasional untuk mengelola dan menganalisis informasi biologis. Bidang ini mencakup penerapan metode-metode menganalisis informasi biologis. Bidang ini mencakup penerapan metode-metode matematika, statistika, dan informatika untuk memecahkan masalah-masalah matematika, statistika, dan informatika untuk memecahkan masalah-masalah  biologis,

 biologis, terutama terutama dengan dengan menggunakan menggunakan sekuens sekuens DNA DNA dan dan asam asam amino amino sertaserta informasi yang berkaitan

informasi yang berkaitan 22..

Bioinformatika merupakan ilmu terapan yang lahir dari perkembangan Bioinformatika merupakan ilmu terapan yang lahir dari perkembangan teknologi informasi dibidang molekular. Pembahasan dibidang bioinformatik ini teknologi informasi dibidang molekular. Pembahasan dibidang bioinformatik ini tidak terlepas dari perkembangan biologi molekular modern, salah satunya tidak terlepas dari perkembangan biologi molekular modern, salah satunya  peningkatan

 peningkatan pemahaman pemahaman manusia manusia dalam dalam bidang bidang genomic genomic yang yang terdapat terdapat dalamdalam molekul DNA ( James, 2001 ).

molekul DNA ( James, 2001 ).

Aprijani dan Elfaizi (2004) menyatakan bioinformatika merupakan kajian Aprijani dan Elfaizi (2004) menyatakan bioinformatika merupakan kajian yang memadukan disiplin biologi molekul, matematika dan teknonologi informasi yang memadukan disiplin biologi molekul, matematika dan teknonologi informasi (TI). Ilmu ini didefinisikan sebagai aplikasi dari alat komputasi dan analisis untuk (TI). Ilmu ini didefinisikan sebagai aplikasi dari alat komputasi dan analisis untuk menangkap dan menginterpretasikan data-data biologi molekul. Biologi molekul menangkap dan menginterpretasikan data-data biologi molekul. Biologi molekul sendiri juga merupakan bidang interdisipliner, mempelajari kehidupan dalam level sendiri juga merupakan bidang interdisipliner, mempelajari kehidupan dalam level molekul. Utama (2003) menyatakan bioinformatika didefenisikan sebagai aplikasi molekul. Utama (2003) menyatakan bioinformatika didefenisikan sebagai aplikasi dari alat komputasi dan analisa untuk menangkap dan menginterpretasikan dari alat komputasi dan analisa untuk menangkap dan menginterpretasikan data-data biologi. Ilmu ini merupakan ilmu baru yang yang merangkul berbagai data biologi. Ilmu ini merupakan ilmu baru yang yang merangkul berbagai disiplin ilmu termasuk ilmu komputer, matematika dan fisika, biologi, dan ilmu disiplin ilmu termasuk ilmu komputer, matematika dan fisika, biologi, dan ilmu kedokteran, yang kesemuanya saling menunjang dan saling bermanfaat satu sama kedokteran, yang kesemuanya saling menunjang dan saling bermanfaat satu sama lainnya ( Homan, 2000 ).

lainnya ( Homan, 2000 ).

Sedangkan menurut Tekaia (2004, dalam Aprijani dan Elfaizi (2004) Sedangkan menurut Tekaia (2004, dalam Aprijani dan Elfaizi (2004)  bioinformatika

 bioinformatika merupakan merupakan metode metode matematika, matematika, statistik statistik dan dan komputasi komputasi yangyang  bertujuan

 bertujuan untuk untuk menyelesaikan menyelesaikan masalah-masalah masalah-masalah biologi biologi dengan dengan menggunakanmenggunakan sekuen DNA dan asam amino dan informasi-informasi yang terkait dengannya sekuen DNA dan asam amino dan informasi-informasi yang terkait dengannya ( Homan, 2000 ). ( Homan, 2000 ). 2 2 https://lecturer.eepis-its.edu/~tita/KTI/Materi/Bioinformatika1 Sejarah.ppt https://lecturer.eepis-its.edu/~tita/KTI/Materi/Bioinformatika1 Sejarah.ppt //

(9)

BAB 4.

BAB 4. BIOINFORMATBIOINFORMATIKA KLASIKIKA KLASIK

Bioinformatika klasik merupakan bioinformatika yang lebih menitik Bioinformatika klasik merupakan bioinformatika yang lebih menitik  beratkan

 beratkan pada pada sekuen sekuen DNA, DNA, yang yang merupakan merupakan materi materi genetic genetic yang yang terdapat terdapat padapada asam nukleat di protein. Protein terdapat di tubuh makluk hidup. Karena protein asam nukleat di protein. Protein terdapat di tubuh makluk hidup. Karena protein merupakan senyawa organic yang penting, termasuk bahan dasar materi genetic merupakan senyawa organic yang penting, termasuk bahan dasar materi genetic DNA dari asam nukleat ( James, 2001 ).

DNA dari asam nukleat ( James, 2001 ).

Bioinformatika klasik belum dilakukan perbandingan genom dari beberapa Bioinformatika klasik belum dilakukan perbandingan genom dari beberapa spesies yang berbeda. Selain itu juga belum dilakukan pengukuran jumlah relative spesies yang berbeda. Selain itu juga belum dilakukan pengukuran jumlah relative dari kopian atau cetakan dari sebuah pesan genetic seperti pada Bioinformatika dari kopian atau cetakan dari sebuah pesan genetic seperti pada Bioinformatika  baru. Selain

 baru. Selain itu juga itu juga belum bisa belum bisa menemukan fungsi menemukan fungsi dan dan dan dan keterkaitan darketerkaitan dari gen,i gen,  juga belum dapat melihat kerja fungsi hormon

 juga belum dapat melihat kerja fungsi hormone( James, 2001 ).e( James, 2001 ).

BAB 5.

BAB 5. BIOINFORMATBIOINFORMATIKA BARUIKA BARU Bioinformatika baru

Bioinformatika baru telah berhasil telah berhasil mencapai mencapai suatu metode suatu metode besar yangbesar yang  belum

 belum dapat dapat dilakukan dilakukan pada pada bioinformatika bioinformatika klasik. klasik. Proyek Proyek pemetaan pemetaan genomgenom manusia disebut dengan (

manusia disebut dengan ( Human  Human Genome Genome Project Project ). Proyek). Proyek  Human  Human GenomeGenome  Project

 Project menyebabkan berubahnya bentuk dan prioritas riset, serta terjadimenyebabkan berubahnya bentuk dan prioritas riset, serta terjadi  perubahan pula pada penerapan

 perubahan pula pada penerapan Bioinformatika.Bioinformatika. Berhasilnya riset

Berhasilnya riset Human  Human Genome Genome ProjectProject membawa perkembangan yangmembawa perkembangan yang  pesat

 pesat bagi bagi biologi biologi terutama terutama bidang bidang biologi biologi molekuler molekuler dengan dengan memanfaatkanmemanfaatkan  bioinforamtika yang bert

 bioinforamtika yang berteknologikan komputer. Para eknologikan komputer. Para ahli mengatakan ahli mengatakan bahwa kitbahwa kitaa  berada pada

 berada pada masa masa pascagenom. Selesainpascagenom. Selesainya proyekya proyek  Human Genome  Human Genome ProjectProject makamaka membawa p

membawa perubahan pada erubahan pada bioinformatika yaitu, bioinformatika yaitu, dapat mencari dapat mencari perbedaan danperbedaan dan  persamaan

 persamaan di di antara antara gengen  –  –   gen yang berbeda pada spesies yang sama maupun  gen yang berbeda pada spesies yang sama maupun spesies yang berbeda. Dari perbedaan

spesies yang berbeda. Dari perbedaan –  –  perbedaan tersebut maka dapat digunakan perbedaan tersebut maka dapat digunakan untuk proses identifikasi secara molekuler, identifikasi dan pengelompokkan untuk proses identifikasi secara molekuler, identifikasi dan pengelompokkan secara filogenik dengan berdasarkan persamaan dan perbedaan genetic, sehingga secara filogenik dengan berdasarkan persamaan dan perbedaan genetic, sehingga dapat diketahui proses evolusi, sehingga melahirkan cabang ilmu yang disebut dapat diketahui proses evolusi, sehingga melahirkan cabang ilmu yang disebut

(10)

dengan ilmu evolusi yang disebut juga

dengan ilmu evolusi yang disebut juga dengan perbandingan genom (dengan perbandingan genom ( comparativecomparative  genomics

 genomics ) ( Homan, 2000 ).) ( Homan, 2000 ).

Di era ini muncul suatu teknologi yang didesain untuk mengukur jumlah Di era ini muncul suatu teknologi yang didesain untuk mengukur jumlah copian sebuah pesan genetic dari beberapa tingkatan yang berbeda pada copian sebuah pesan genetic dari beberapa tingkatan yang berbeda pada  perkembangannya.

 perkembangannya. Contohnya adalahContohnya adalah  DNA Microarrays. DNA Microarrays. Selain itu cara tersebutSelain itu cara tersebut dapat mengidentifikasi fungsi

dapat mengidentifikasi fungsi  –  –   fungsi dan suatu keterkaitan gen akan semakin  fungsi dan suatu keterkaitan gen akan semakin tumbuh. Perubahan besar akan terjadi dalam penekanan dari gen itu sendiri dari tumbuh. Perubahan besar akan terjadi dalam penekanan dari gen itu sendiri dari hasil

hasil  –  –   hasil gen. yang pada akhirnya akan menuntun ke usaha untuk  hasil gen. yang pada akhirnya akan menuntun ke usaha untuk mengkatalogkan semua aktivitas dan karakteristik interaksi antara semua hasil mengkatalogkan semua aktivitas dan karakteristik interaksi antara semua hasil  –  –  hasil dari gen ( pada manusia ) yang disebut proteomics, usaha untuk hasil dari gen ( pada manusia ) yang disebut proteomics, usaha untuk mengkristalisasi dan memprediksika struktur

mengkristalisasi dan memprediksika struktur –  –  struktur dari semua protein ( pada struktur dari semua protein ( pada manusia ) yang disebut structural genomics.

manusia ) yang disebut structural genomics.

Bioinformatika sangat mempengaruhi kehidupan manusia. Bioinformatika Bioinformatika sangat mempengaruhi kehidupan manusia. Bioinformatika menyebabkan kepesatan yang didapat dari ilmu biologi dengan memanfaatkan menyebabkan kepesatan yang didapat dari ilmu biologi dengan memanfaatkan teknologi yang memudahkan dalam pengerjaannya dan mendapatkan hasil teknologi yang memudahkan dalam pengerjaannya dan mendapatkan hasil keakuratan yang tinggi, sehingga menunjang kehidupan manusia.

keakuratan yang tinggi, sehingga menunjang kehidupan manusia.

BAB 6. CABANG

BAB 6. CABANG

 – 

 – 

 CABANG TERKAIT  CABANG TERKAIT DENGAN BIOINFORMATIDENGAN BIOINFORMATIKAKA Bioinformatika merupakan penerapan kecanggihan teknologi computer pada ilmu Bioinformatika merupakan penerapan kecanggihan teknologi computer pada ilmu  biologi.

 biologi. Selain Selain pada pada ilmu ilmu biologi, biologi, bioinformatika bioinformatika juga juga berpengaruh berpengaruh atau atau terkait terkait padapada cabang

cabang  –  –   cabang ilmu lain, terutama ilmu  cabang ilmu lain, terutama ilmu  –  –   ilmu yang terkait dengan dunia SAINS.  ilmu yang terkait dengan dunia SAINS. Beberapa ilmu yang terkait adalah biophysics (biofisika), Computational Biology, Beberapa ilmu yang terkait adalah biophysics (biofisika), Computational Biology, Medical Informatics, Cheminformatics, Mathematical Biology, Proteomics, dan Medical Informatics, Cheminformatics, Mathematical Biology, Proteomics, dan Pharmacogenomics, yang akan dibahas satu persatu dibawah ini, antara lain :

Pharmacogenomics, yang akan dibahas satu persatu dibawah ini, antara lain : 6.1 Biophysics

6.1 Biophysics

Biofisika merupakan cabang ilmu yang menerapkan beberapa ilmu atau Biofisika merupakan cabang ilmu yang menerapkan beberapa ilmu atau teknik fisika untuk menerapakan ilmu biologi. Bioinformatika juga tercipta teknik fisika untuk menerapakan ilmu biologi. Bioinformatika juga tercipta

(11)

 berdasarkan analisis

 berdasarkan analisis dan teknik dan teknik yang ada yang ada di ilmu di ilmu fisika. Maka fisika. Maka dari itu dari itu ilmu fiilmu fisikasika  juga diperlukan dalam biologi, termasuk pad

 juga diperlukan dalam biologi, termasuk pada bioinformatika.a bioinformatika. 6.2 Computational Biology

6.2 Computational Biology

Komputasi biologi ini hubungannya dengan ilmu bioinformatika dekat, Komputasi biologi ini hubungannya dengan ilmu bioinformatika dekat, karena computasi biologi ini lebih dekat dengan biologi umum klasik. karena computasi biologi ini lebih dekat dengan biologi umum klasik. Computational biology diantara memfokuskan pada populasi, biologi teorotis, dan Computational biology diantara memfokuskan pada populasi, biologi teorotis, dan gerak evolusi, dari pada dalam biomedis dalam biologi molekuler dan biologi sel. gerak evolusi, dari pada dalam biomedis dalam biologi molekuler dan biologi sel. Biologi molekuler penting dalam

Biologi molekuler penting dalam computational biology.computational biology. Diartikan bahwa data

Diartikan bahwa data –  –  data yang disajikan lebih pada gaya statistika dari data yang disajikan lebih pada gaya statistika dari  pada

 pada model model yang yang sebenarnya. sebenarnya. Tidak Tidak semua semua nya nya pada pada computasi computasi biologibiologi merupakan biologi, namun computasi lebih condong pada ilmu matema

merupakan biologi, namun computasi lebih condong pada ilmu matema tika.tika. 6.3 Medical Informatics

6.3 Medical Informatics

Bidang medis memerlukan ilmu dan penerapannya bioinformatika. Bidang medis memerlukan ilmu dan penerapannya bioinformatika. Pengguannkan pada

Pengguannkan pada medical inforamatics,medical inforamatics,  diterapakan seperti analisis atau  diterapakan seperti analisis atau deagnosa suatu penyakit. Memprediksi berapa tingkat kecepatan pertumbuhan deagnosa suatu penyakit. Memprediksi berapa tingkat kecepatan pertumbuhan  penyakit.

 penyakit. Informasi Informasi medis medis juga juga dikodekan dikodekan atau atau ditampilkan ditampilkan dalam dalam bentukbentuk algoritma. Dengan demikian maka akan membantu dan memudahkan ilmu medis algoritma. Dengan demikian maka akan membantu dan memudahkan ilmu medis dalam perkembangan dan kemajuan bidang ilmu medis. Biologi memegang dalam perkembangan dan kemajuan bidang ilmu medis. Biologi memegang  peranan yang besar dan keterkaitannya besar dengan

 peranan yang besar dan keterkaitannya besar dengan ilmu medis.ilmu medis. 6.4 Cheminformatics

6.4 Cheminformatics

Cheminformatics adalah bidang dalam kimia, yang juga menggunakan Cheminformatics adalah bidang dalam kimia, yang juga menggunakan cara dalam biologi, sedangkan cara dalam kimia seperti kombinasi dari sintesis cara dalam biologi, sedangkan cara dalam kimia seperti kombinasi dari sintesis kimia. Pada intinya digunakan dalam penemuan dan

kimia. Pada intinya digunakan dalam penemuan dan pembuatan obat.pembuatan obat.  penemuan

 penemuan obatobat  –  –   obat ini dapat membawa manfaat manusia. seperti  obat ini dapat membawa manfaat manusia. seperti  peneman

 peneman obat obat penisilin penisilin yang yang dapat dapat menggambarkan menggambarkan bagaimana bagaimana cara cara untukuntuk menemukan dan mengembangkan obat

(12)

dalam penemuan ini pun didasakan atas usaha dan waktu yang lama. Dibutuhkan dalam penemuan ini pun didasakan atas usaha dan waktu yang lama. Dibutuhkan tahap

tahap –  –  tahap penting dan ketelitian hingga berhasil pembuatan obat. tahap penting dan ketelitian hingga berhasil pembuatan obat.

Keadaan yang lambat salah satu factor penghambat dalam pembuatan Keadaan yang lambat salah satu factor penghambat dalam pembuatan obat, namun ketersediaan obat dibutuhkan, maka diterapkanlah IT untuk obat, namun ketersediaan obat dibutuhkan, maka diterapkanlah IT untuk membantu proses pengerjaan pembuatan obat

membantu proses pengerjaan pembuatan obat  –  –   obatan. Yaitu dengan  obatan. Yaitu dengan mengotomatiskan proses

mengotomatiskan proses  –  –   proses yang terkait dengan sintesis kimiawi yang  proses yang terkait dengan sintesis kimiawi yang dilakukan oleh ahli kimia, maupun para ahli biokimia.

dilakukan oleh ahli kimia, maupun para ahli biokimia.

Kecepatan pengerjaan dalam sintesis obat seperti inilah yang menjadi Kecepatan pengerjaan dalam sintesis obat seperti inilah yang menjadi target dari

target dari Cheminformatics.Cheminformatics. Beberapa bidang yang dikaji dalam CheminformaticsBeberapa bidang yang dikaji dalam Cheminformatics antara lain : Visualisation Tools, Synthesis Planning, Reaction and Structure antara lain : Visualisation Tools, Synthesis Planning, Reaction and Structure Retrieval, 3-D,Structure Retrieval, Modelling, Computational Chemistry, and Retrieval, 3-D,Structure Retrieval, Modelling, Computational Chemistry, and Utilities.

Utilities.

6.5 Mathematical Biology 6.5 Mathematical Biology

 Mathematical

 Mathematical BiologyBiology merupakan penerapan bidang ilmu biologi dimerupakan penerapan bidang ilmu biologi di matematika. Pada matematika biologi sering menggunakan ilmu biologi yang di matematika. Pada matematika biologi sering menggunakan ilmu biologi yang di analisis secara matematika, baik mengggunakan algoritma, menggunakan statistic, analisis secara matematika, baik mengggunakan algoritma, menggunakan statistic, menggunakan grafik, yang tujuannya adalah untuk mempermudah pembacaan menggunakan grafik, yang tujuannya adalah untuk mempermudah pembacaan data.

data.

 Mathematical

 Mathematical BiologyBiology sering digunakan untuk aplikasi software. Dengansering digunakan untuk aplikasi software. Dengan  Mathematical

 Mathematical BiologyBiology, sebagai missal menggunakan software dengan analisis, sebagai missal menggunakan software dengan analisis matematika dan diterapkannya pada biologi. Missal seperti pembuatan software matematika dan diterapkannya pada biologi. Missal seperti pembuatan software klasifikasi tumbuhan ataupun klasifikasi hewan pada taksonomi tumbuhan dan klasifikasi tumbuhan ataupun klasifikasi hewan pada taksonomi tumbuhan dan taksonomi hewan. Dengan menggunakan prinsip matematika yaitu teori taksonomi hewan. Dengan menggunakan prinsip matematika yaitu teori  permutasi.

(13)

6.6 Proteomics 6.6 Proteomics

Merupakan studi biologi yang lebih mendalami pada struktur dan fungsi Merupakan studi biologi yang lebih mendalami pada struktur dan fungsi dari protein. Protein merupakan senyawa organic

dari protein. Protein merupakan senyawa organic yang penting untuk metabolismeyang penting untuk metabolisme sel. Protein memiliki peranan penting, dan dapat dikatakan senyawa terbanyak sel. Protein memiliki peranan penting, dan dapat dikatakan senyawa terbanyak yang dibutuhkan oleh makluk hidup. Misalnya protein yang berupa asam nukleat yang dibutuhkan oleh makluk hidup. Misalnya protein yang berupa asam nukleat sebagai bahan pennyusun DNA, DNA merupakan materi genetic pada suatu sebagai bahan pennyusun DNA, DNA merupakan materi genetic pada suatu makluk hidup.

makluk hidup.

Penerapannya adalah dengan cara mengguankan teknologi untuk Penerapannya adalah dengan cara mengguankan teknologi untuk menganalisisnya. Sehingga didapatkan hasil yang akurat, cepat, dan maksimal menganalisisnya. Sehingga didapatkan hasil yang akurat, cepat, dan maksimal dalam analisisnya. Diamping itu pula dikarenakan pengerjaan secara manual akan dalam analisisnya. Diamping itu pula dikarenakan pengerjaan secara manual akan memakan waktu yang lama. Dan membutuhkan teknologi yang tinggi dalam memakan waktu yang lama. Dan membutuhkan teknologi yang tinggi dalam  pengerjaannya. Namun dengan adany

 pengerjaannya. Namun dengan adanya teknologi maka akan mempermudah dalama teknologi maka akan mempermudah dalam  pengerjaannya.

 pengerjaannya. Berhubungan Berhubungan dengan dengan bioinformatika bioinformatika dikarenakan dikarenakan proteinprotein merupakan bagian dari studi biologi dan teknologi yang digunakan menerapkan merupakan bagian dari studi biologi dan teknologi yang digunakan menerapkan  prinsip teknologi informasi. Dua s

 prinsip teknologi informasi. Dua studi biologi dan teknologi informasi tudi biologi dan teknologi informasi merupakanmerupakan  pengertian dari Bioinformatika.

 pengertian dari Bioinformatika.

Gambar diatas merupakan robot yang bernama

Gambar diatas merupakan robot yang bernama  MALDI  MALDI mass mass spectrometry.spectrometry. Teknologi yang menerapkan bioinformatika.

(14)

6.7 Pharmacogenomics 6.7 Pharmacogenomics

 Pharmacogenomics

 Pharmacogenomics merupakan bidang studi yang menganalisis bagaimanamerupakan bidang studi yang menganalisis bagaimana respon atau efek obat

respon atau efek obat  –  –   obatan terhadap seseorang. Pharmacogenomics  obatan terhadap seseorang. Pharmacogenomics merupakan kombinasi dari bidang ilmu farmakologi dan genomic. Ini semua juga merupakan kombinasi dari bidang ilmu farmakologi dan genomic. Ini semua juga diguakan teknik sekuen DNA dan sejuen DNA sendiri digunakan untuk analisis diguakan teknik sekuen DNA dan sejuen DNA sendiri digunakan untuk analisis DNA.

(15)

BAB 7. JENIS DATA BIOLOGI DI

BAB 7. JENIS DATA BIOLOGI DI BIOINFORMBIOINFORMATIKAATIKA 7.1 Manajemen Data

7.1 Manajemen Data

Manajemen Data Termasuk pemeliharaan database dan pemrosesan data, Manajemen Data Termasuk pemeliharaan database dan pemrosesan data, merupakan tugas paling dasar dan yang paling utama. Sejumlah besar data yang merupakan tugas paling dasar dan yang paling utama. Sejumlah besar data yang  bisa

 bisa digunakan digunakan bersama bersama dibuat dibuat oleh oleh berbagai berbagai lembaga lembaga penelitian penelitian yang yang dibiayaidibiayai  publik,

 publik, dan dan diletakkan diletakkan di di dalam dalam bank bank data data publik. publik. Anotasi Anotasi data data mentah, mentah, yangyang artinya menambahkan berbagai deskripsi dan fungsi, merupakan bagian yang artinya menambahkan berbagai deskripsi dan fungsi, merupakan bagian yang sangat penting dari pekerjaan ini, dan sebagian besar didanai oleh lembaga sangat penting dari pekerjaan ini, dan sebagian besar didanai oleh lembaga  penelitian pemerintah ( James, 2001 ).

 penelitian pemerintah ( James, 2001 ).

7.2 Struktur dan Sekuens Protein dan Gen 7.2 Struktur dan Sekuens Protein dan Gen

Struktur dan sekuens protein dan gen. Sekuens digunakan untuk Struktur dan sekuens protein dan gen. Sekuens digunakan untuk merepresentasikan molekul makro. Struktur gen yang mengkodifikasi sekuens merepresentasikan molekul makro. Struktur gen yang mengkodifikasi sekuens asam amino di dalam protein dibuat

asam amino di dalam protein dibuat menggunakan proyek sekuensial genom. Datamenggunakan proyek sekuensial genom. Data genomik akan diterjemahkan menggunakan komputer menjadi sekuens protein genomik akan diterjemahkan menggunakan komputer menjadi sekuens protein ( James, 2001 ).

( James, 2001 ).

7.3 Struktur Molekuler 3D. 7.3 Struktur Molekuler 3D.

Struktur Molekular 3D. Pemodelan komputer bisa menggambarkan Struktur Molekular 3D. Pemodelan komputer bisa menggambarkan struktur ini menggunakan pengukuran fisik menggunakan sinar X atau resonansi struktur ini menggunakan pengukuran fisik menggunakan sinar X atau resonansi magnetik nuklir ( James, 2001 ).

magnetik nuklir ( James, 2001 ). 7.4 Fungsi dan

7.4 Fungsi dan Struktur GenomStruktur Genom

Fungsi dan Struktur Genom. Genom dari suatu organisme (mahluk hidup) terdiri Fungsi dan Struktur Genom. Genom dari suatu organisme (mahluk hidup) terdiri dari materi genetik keseluruhan. Informasi fungsi dan struktur genom adalah dari materi genetik keseluruhan. Informasi fungsi dan struktur genom adalah informasi detail dasar yang selalu diperbaharui dengan berbagai informasi baru informasi detail dasar yang selalu diperbaharui dengan berbagai informasi baru termasuk tautan ke berbagai database yang lain ( J

(16)

7.5 Data Bibliofrafik 7.5 Data Bibliofrafik

Data Bibliografik, seperti abstrak dari suatu artikel sains. Jumlah data yang Data Bibliografik, seperti abstrak dari suatu artikel sains. Jumlah data yang meningkat secara eksponensial, terutama yang berhubungan dengan proyek meningkat secara eksponensial, terutama yang berhubungan dengan proyek genom, seperti proyek sekuensial genom manusia. Data yang saat ini bisa diakses genom, seperti proyek sekuensial genom manusia. Data yang saat ini bisa diakses  publik melalui internet merupakan susunan

 publik melalui internet merupakan susunan data dalam bentuk kecil data dalam bentuk kecil ( James, 2001( James, 2001 ).

).

BAB 8.

BAB 8. TEKNOLOGI Di DALAM BIOINFORMATIKATEKNOLOGI Di DALAM BIOINFORMATIKA

Bioinformatika menggabungkan berbagai bidang ilmu komputer, matematika, dan Bioinformatika menggabungkan berbagai bidang ilmu komputer, matematika, dan engineering untuk memproses data biologi. Supercomputer digunakan untuk engineering untuk memproses data biologi. Supercomputer digunakan untuk membaca dan memproses data biologi supaya hasilnya semakin cepat didapatkan. membaca dan memproses data biologi supaya hasilnya semakin cepat didapatkan. Berbagai sistem informasi dan database digunakan untuk menyimpan dan Berbagai sistem informasi dan database digunakan untuk menyimpan dan menyusun data biologi. Dalam menganalisa data

menyusun data biologi. Dalam menganalisa data biologi, juga diperlukan berbagaibiologi, juga diperlukan berbagai algoritma Artificial Intelligence, Machine Learning, Soft Computing, Data algoritma Artificial Intelligence, Machine Learning, Soft Computing, Data Mining, Image Processing, dan Simulation ( James, 2001 ).

Mining, Image Processing, dan Simulation ( James, 2001 ). 8.1 Teknologi dan Inovasi Microsoft di

8.1 Teknologi dan Inovasi Microsoft di bidang Bioinformatikabidang Bioinformatika 8.1.1 Microsoft Bioinformatics Initiative

8.1.1 Microsoft Bioinformatics Initiative

Program “Microsoft Bioinformatics Initiative” yang terdiri dari dua komp Program “Microsoft Bioinformatics Initiative” yang terdiri dari dua komponenonen utama :

utama :

8.1.1.1 NET BIO 8.1.1.1 NET BIO  NET

 NET Bio Bio merupakan merupakan suatu suatu tool tool yang yang bisa bisa ditambahkan ditambahkan ke ke frameworkframework  pemrograman

 pemrograman netral netral bahasa bahasa .NET .NET yang yang awalnya awalnya ditujukan ditujukan untuk untuk mendukungmendukung  penelitian di bidang genomik. Sekarang ini .NET Bio mendukung berbagai formal  penelitian di bidang genomik. Sekarang ini .NET Bio mendukung berbagai formal file bioinformatika; berbagai algoritma untuk manipulasi sekuens protein, RNA, file bioinformatika; berbagai algoritma untuk manipulasi sekuens protein, RNA, dan DNA; dan pasangan konektor untuk terhubung ke layanan web biologi seperti dan DNA; dan pasangan konektor untuk terhubung ke layanan web biologi seperti  NCBI

(17)

dokumentasi, aplikasi demo, kode sumber, dan executable file bisa didownload dokumentasi, aplikasi demo, kode sumber, dan executable file bisa didownload dari situs Codeplex

dari situs Codeplex

8.1.1.2 Microsoft Biology Tools (MBT) 8.1.1.2 Microsoft Biology Tools (MBT)

The Microsoft Biology Tools (MBT) merupakan kumpulan tool yang bisa The Microsoft Biology Tools (MBT) merupakan kumpulan tool yang bisa digunakan para peneliti bioinformatika dan biologi supaya lebih produktif dalam digunakan para peneliti bioinformatika dan biologi supaya lebih produktif dalam menemukan berbagai penemuan sains. Tool di dalam katalog MBT bebas menemukan berbagai penemuan sains. Tool di dalam katalog MBT bebas digunakan, dan juga termasuk didalamnya kode sumber terbuka dan berbagai digunakan, dan juga termasuk didalamnya kode sumber terbuka dan berbagai  proyek

 proyek kolaborasi kolaborasi sumber sumber terbuka. terbuka. Contoh Contoh tool-tool tool-tool di di dalam dalam katalog katalog MBT MBT bisabisa dilihat di sini :

dilihat di sini : http://research.microsoft.com/en-us/projects/bio/mbt.aspxhttp://research.microsoft.com/en-us/projects/bio/mbt.aspx

8.1.1.2 BioHPC 8.1.1.2 BioHPC

BioHPC merupakan implementasi HPC untuk para peneliti biologi. HPC BioHPC merupakan implementasi HPC untuk para peneliti biologi. HPC adalah High Performance Computing, yang memanfaatkan sebanyak mungkin adalah High Performance Computing, yang memanfaatkan sebanyak mungkin sumber daya komputer yang ada untuk menyelesaikan satu tugas berat dengan sumber daya komputer yang ada untuk menyelesaikan satu tugas berat dengan lebih singkat.

lebih singkat.

HPC merevolusi ilmu biologi dengan cara memberi para ahli biologi HPC merevolusi ilmu biologi dengan cara memberi para ahli biologi kemampuan proses dan analisa data yang sangat besar yang tidak terbayangkan kemampuan proses dan analisa data yang sangat besar yang tidak terbayangkan  beberapa

 beberapa dekade dekade lalu. lalu. Namun Namun sayangnya sayangnya kebanyakan kebanyakan ahli ahli biologi biologi tidak tidak memilikimemiliki keahlian komputer ataupun sarana komputer

keahlian komputer ataupun sarana komputer yang memadai.yang memadai.

Microsoft bekerjasama dengan Unit Layanan Biologi Komputasi Microsoft bekerjasama dengan Unit Layanan Biologi Komputasi Universitas Cornell untuk menyediakan kekuatan HPC bagi ribuan peneliti di Universitas Cornell untuk menyediakan kekuatan HPC bagi ribuan peneliti di seluruh dunia. BioHPC khusus ditujukan pada peneliti bioinformatika, sehingga seluruh dunia. BioHPC khusus ditujukan pada peneliti bioinformatika, sehingga  bersifat

 bersifat sangat sangat powerful powerful tetapi tetapi mudah mudah sekali sekali digunakan digunakan dan dan tidak tidak perlu perlu ahliahli komputer dengan keahlian khusus untuk mengoperasikannya.

(18)

8.1.2 Windows Azure

8.1.2 Windows Azure BioinformaticsBioinformatics

Windows Azure merupakan satu layanan komputasi awan Microsoft yang Windows Azure merupakan satu layanan komputasi awan Microsoft yang  bisa digunakan untuk meny

 bisa digunakan untuk menyelesaikan berbagai tugas bioinformatika dengan cepat.elesaikan berbagai tugas bioinformatika dengan cepat.

Dengan adanya ledakan data genom beberapa tahun terakhir, maka kita Dengan adanya ledakan data genom beberapa tahun terakhir, maka kita memerlukan kekuatan komputasi yang luar biasa untuk memproses semua data memerlukan kekuatan komputasi yang luar biasa untuk memproses semua data yang ada. Windows Azure dikombinasikan dengan Microsoft Excel untuk analisa, yang ada. Windows Azure dikombinasikan dengan Microsoft Excel untuk analisa, memberikan para peneliti kemampuan yang luar biasa untuk mendapatkan memberikan para peneliti kemampuan yang luar biasa untuk mendapatkan  berbagai wawasan

 berbagai wawasan baru dan baru dan kemampuan eksplorasi kemampuan eksplorasi di areadi area-area -area yang sebelumnyayang sebelumnya tidak terjamah. Salah satu aplikasi killer untuk Windows Azure di bidang tidak terjamah. Salah satu aplikasi killer untuk Windows Azure di bidang  bioinformatika ini adalah

 bioinformatika ini adalah NCBI BLASTNCBI BLAST untuk Windows Azureuntuk Windows Azure 33

3

3

 http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

(19)

 NCBI Blast

 NCBI Blast merupakan implementasi merupakan implementasi Basic Basic Local Alignment Local Alignment Search ToolSearch Tool (BLAST) dari National Center for Biotechnology Information (NCBI). BLAST (BLAST) dari National Center for Biotechnology Information (NCBI). BLAST merupakan sekumpulan program yang dirancang untuk mencari semua kemiripan merupakan sekumpulan program yang dirancang untuk mencari semua kemiripan antara sebuah protein atau DNA dan sekuensnya yang sudah diketahui dari antara sebuah protein atau DNA dan sekuensnya yang sudah diketahui dari seluruh database kemungkinan yang ada. Peneliti memerlukan kemampuan ini seluruh database kemungkinan yang ada. Peneliti memerlukan kemampuan ini untuk mengetahui fungsi dan manfaat dari

untuk mengetahui fungsi dan manfaat dari sebuah produk genetik.sebuah produk genetik.

Windows Azure memungkinkan komputasi yang sangat rumit dilakukan Windows Azure memungkinkan komputasi yang sangat rumit dilakukan dengan sangat cepat dan dengan biaya yang murah. Misalnya dengan Windows dengan sangat cepat dan dengan biaya yang murah. Misalnya dengan Windows Azure mampu menyingkat pengoperasian BLAST dari enam tahun menjadi satu Azure mampu menyingkat pengoperasian BLAST dari enam tahun menjadi satu minggu saja. Microsoft XCG (Extreme Computing Group) merupakan satu tim di minggu saja. Microsoft XCG (Extreme Computing Group) merupakan satu tim di Microsoft yang berhasil melakukan hal ini dengan cara membagi beban BLAST Microsoft yang berhasil melakukan hal ini dengan cara membagi beban BLAST ke beberapa data center Microsoft yang tersebar

ke beberapa data center Microsoft yang tersebar di Amerika dan Eropa.di Amerika dan Eropa.

Gambar di atas menunjukkan gambar bakteri Rhodopseudomonas palustris yang Gambar di atas menunjukkan gambar bakteri Rhodopseudomonas palustris yang digunakan untuk memproduksi hidrogen sebagai bahan bakar.

(20)

BAB 9. PENUTUP BAB 9. PENUTUP

9.1 Kesimpulan 9.1 Kesimpulan

Bioinformatika merupakan suatu bidang ilmu biologi yang memanfaatkan Bioinformatika merupakan suatu bidang ilmu biologi yang memanfaatkan teknologi computer untuk pendukung ilmu biologi. Bioinformatika terdiri atas teknologi computer untuk pendukung ilmu biologi. Bioinformatika terdiri atas  bioinformatika

 bioinformatika baru baru dan dan klasik, klasik, bioinformatika bioinformatika klasik klasik masih masih focus focus pada pada sekuenssekuens DNA, sedangkan bioinformatika baru pemetaan genom manusia sudah selesai. Di DNA, sedangkan bioinformatika baru pemetaan genom manusia sudah selesai. Di sini kita sudah bisa melakukan perbandingan genom dari berbagai spesies yang sini kita sudah bisa melakukan perbandingan genom dari berbagai spesies yang  berbeda,

 berbeda, mengukur mengukur jumlah jumlah relatif relatif dari dari kopi kopi atau atau cetakan cetakan dari dari sebuah sebuah pesanpesan genetik, menemukan fungsi dan keterkaitan dari gen, dan melihat kerja fungsi genetik, menemukan fungsi dan keterkaitan dari gen, dan melihat kerja fungsi genom.

genom.

Bioinformatika memiliki keterkaitan dengan beberapa cabang ilmu IPA Bioinformatika memiliki keterkaitan dengan beberapa cabang ilmu IPA lainnnya, seperti, Biophysics

lainnnya, seperti, Biophysics,, Computational biology, Medical informatics,Computational biology, Medical informatics,

Cheminformatics

Cheminformatics,, Mathematical Biology, Proteomics, danMathematical Biology, Proteomics, dan Pharmacogenomics.Pharmacogenomics. Bioinformatika

Bioinformatika memiliki jenis dmemiliki jenis data, yaitu ata, yaitu 7.1 Manajemen 7.1 Manajemen Data , Struktur Data , Struktur dandan Sekuens Protein dan Gen, Struktur molekuler 3D, Fungsi dan Struktur Genom , Sekuens Protein dan Gen, Struktur molekuler 3D, Fungsi dan Struktur Genom , dan Data Bibliofrafik. Bioinformatika

dan Data Bibliofrafik. Bioinformatika

9.2 Saran 9.2 Saran

Pembuatan makalah ini disarankan untuk mencantumkan cara penggunaan Pembuatan makalah ini disarankan untuk mencantumkan cara penggunaan salah satu software atau aplikasi yang digunakan dalam bioinformatika, jadi dapat salah satu software atau aplikasi yang digunakan dalam bioinformatika, jadi dapat memberikan wawasan dengan dapat mengoperasikan salah satu software ataupun memberikan wawasan dengan dapat mengoperasikan salah satu software ataupun aplikasi yang digunakan dalam bioinformatika sehingga lebih bermanfaatnya aplikasi yang digunakan dalam bioinformatika sehingga lebih bermanfaatnya  pembuatan makalah ini bagi pembaca dan b

(21)

DAFTAR PUSTAKA DAFTAR PUSTAKA

Hooman H. Rashidi&Lukas K. Buehler. 2000.

Hooman H. Rashidi&Lukas K. Buehler. 2000.  Bioinformatics  Bioinformatics BasicsBasics. United. United States of America : CRL Press LLC

States of America : CRL Press LLC James D. Tisdall. 2001.

James D. Tisdall. 2001.  Beginning  Beginning Perl Perl for for Bioinformatics.Bioinformatics.  United States of  United States of America : O'Reolly Media.

America : O'Reolly Media.

https://lecturer.eepis-its.edu/~tita/KTI/Materi/Bioinformatika1 Sejarah.ppt https://lecturer.eepis-its.edu/~tita/KTI/Materi/Bioinformatika1 Sejarah.ppt http://bebas.vlsm.org/v06/Kuliah/SistemOperasi/2003/50/Bioinformatika.pdf http://bebas.vlsm.org/v06/Kuliah/SistemOperasi/2003/50/Bioinformatika.pdf http://ghr.nlm.nih.gov/handbook/genomicresearch/pharmacogenomics http://ghr.nlm.nih.gov/handbook/genomicresearch/pharmacogenomics http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

Gambar

Gambar  diatas  merupakan  robot  yang  bernama
Gambar di atas menunjukkan gambar bakteri Rhodopseudomonas palustris yangGambar di atas menunjukkan gambar bakteri Rhodopseudomonas palustris yang digunakan untuk memproduksi hidrogen sebagai bahan bakar.

Referensi

Dokumen terkait

Bioinformatika berupa sistem manajemen informasi yang meliputi database biologi molekul dan software sebagai tools untuk mengelola dan menganalisis data biologis

Dari buku Introduction to Protein Structure yang ditulis oleh Carl Branden dan John Tooze yang menjadi buku teks wajib untuk mempelajari ilmu biologi struktur, kita bisa

PROGRAM STUDI PENDIDIKAN BIOLOGI FAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH

Forensik molekuler merupakan salah satu cabang ilmu kedokteran forensik yang memanfaatkan perkembangan teknologi biologi molekuler dalam memecahkan berbagai kasus

Ada empat hal pokok agar ilmu pengetahuan dan teknologi dikembangkan secara konkrit, unsur-unsur mana yang tidak boleh dilanggar dalam pengembangan ilmu pengetahuan

Yang dimaksud dengan “asas ilmu pengetahuan dan teknologi” adalah bahwa dalam penanggulangan bencana harus memanfaatkan ilmu pengetahuan dan teknologi secara

Biopsikologi adalah cabang ilmu yang mengkaji interaksi antara proses biologi dan perilaku manusia 2.1 Keterkaitan Biologi Dengan Kajian Biopsikologi Keterkaitan biologi dengan

KEMENTERIAN PENDIDIKAN, KEBUDAYAAN, RISET, DAN TEKNOLOGI UNIVERSITAS PALANGKA RAYA FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM PROGRAM STUDI BIOLOGI Kampus Universitas Palangka Raya