Chen WH, Davey MR, Power JB, Cocking EC Sugarcane protoplasts; factor effecting division and plant regeneration. Plant Cell Rep.

(1)

Abidin Z. 1985. Dasar-dasar Pengetahuan tentang Zat Pengatur Tumbuh. Angkasa Bandung. 85 hlm.

Adams RLP, Khowlen JT, Leader DP. 1966. The Biochemistry of The Nucleic Acids. Chapman and Hall Ltd. London.

Albert B, Bray D, Lewis J, Raff M, Roberts K, Watson JD. 2001. Biologi Molekuler Sel. Penterjemah: Alex Tri Kantjono. Gramedia. 346 hlm. Alexander A. 1972. Sugarcane Physiology: a Comprehensive Study of The

Source to Sink System. Amsterdam, Elsevier Sintific Publ. hlm 752. Altman A. 1989. Polyamines and plant hormones. In: U Bahrach, VM Heimer,

eds, The Physiology of Polyamines. Vol II. CRC Press. Boca Raton, FL. Pp 122-145.

Amin MN, Islam MA, Rahman MM, Ahmad S. Micropropagation and concervation of the threatend medicinal plant of Bangladesh: A case study of Alpinia calcata Rosc. In: In vitro Culture, Transformation and Molecular Marker for Crop Improvement. Ed.: AS Islam. Science Publischer, Inc. USA. 220 hlm.

Ananda RrWU. 2004. Studi Transformasi pada tebu dengan perantara

Agrobacterium tumafaciens GV 2260 (pMA) serta regenerasi kalus

transgenik. [tesis]. Sekolah Pascasarjana. IPB.

Anas I, Santosa DA, Fakuara Y. 1992. Pupuk hayati. Di dalam: Ed.: Harran S, Ansori M. Biotek Pertanian 2. PAU, IPB, Bogor. 419 hlm

Baksha R, Alam R, Karim MZ, Paul SK, Hossain MA, Miah MAS, Rahman ABMM. 2002. In vitro shoot tip culture of sugarcane (Saccharum

officinarum) variety Isd 28. Biotechnology. 1(2): 67-72.

Basuki MN. 2000. Pengaruh morphologi tebu pada aspek kualitas kertas. Makalah pertemuan teknis P3GI, Hotel Tunjungan-Surbaya, 15-16 November 2000.

Brown TA. 1991. Pengantar Kloning Gena. Yayasan Essentia Medica. hlm 86-90. Brown TA. 1996. Gene Cloning an Introduction. Chapman and Hall.

Buchanan BB, Gruissem W, Jones RL. 2006. Biochemistry and Molecular Biology of Plant. Am. Soc. Plant Physiol. Rockville, Maryland. 1367 hlm. Buckman HO, Brady NC. 1982. Ilmu Tanah. Penerjemah: Soegiman. Bharata

Karya Aksara. Jakarta. 788 hlm.

Budhisantosa H, Sugiyarta E, Mirzawan PDN. 2007. PSJT 941 : Varietas unggul untuk lahan regalan dengan pola keprasan. P3GI. Unpublished

Chen M, Glaz B, Gilbert RA, Daroub SH, Bartoon FE, Wan T. 2002. Near infra red reflectant spectroscopy analysis of phosphorous in sugarcane leaves.

(2)

139 Chen WH, Davey MR, Power JB, Cocking EC. 1988. Sugarcane protoplasts;

factor effecting division and plant regeneration. Plant Cell Rep. 39 (199):61-251.

Choi HW, Lemaux PG, Cho MJ. 2000. Increased chromosomal variation in transgenic versus non transgenic barley (Hordeum vulgare L.) plant. Crop

Sci.. 40:524-533.

Chrispeels M J, Grossi de Sa MF, Higgins T J V, 1998. Genetik engineering with α-amylase inhibitor makes seeds resistant to bruchids. Seed Sci. Res. 8: 257-263.

Coello P, Maughan JP, Mendoza A., Philip R, Bollinger DW, Veum TL; Vodkin LO; Polaco JC. 2001. Generation of low phytic acid Arabidopsis seed expressing an E. coli phytase during embrio development. Seed Sci. Res. 2001; 11:. 285-292.

Cosgrove, DJ. 1980. Inositol Phosphate, Their Chemistry, Biochemistry and Physiology. New York. Elsevier Scientific Publishing Company.

CWSF Project Summary - The Wind In The Tamaracks. 2001.www.cdli.ca/sciencefairs/cwsf2001/summary2.html - 9k . [9 Agustus 2007].

Davies, Petter J. 1995. Plant Hormones. Physiology, Biochemistry and Molecular Biology. Kluwer Academic Publisher. Dordrecht, Boston, London. 833 hlm.

Dewi IS. 2003. Peranan fisiologis poliamin dalam regenerasi tanaman pada kultur antera padi (Oryza sativa L.). [disertasi]. Bogor: Program Pascasarjana, Institut Pertanian Bogor.

Ebinuma H, Sugita K, Matsunaga E, Endo S, Yamada K, Ebinuma AK. 2001. System for the removal of a selection marker and their combination with a possitive marker . Plant Cell Rep. 20:383-392.

Flores H.E, Protacio C.M. 1990. Polyamines metabolism in plant cell and organ culture. In: HE Flores, R.N Artega, J.C. Shanon, eds, Polyamines and Ethylene: Biochemistry, Physiology, and Interaction. Proceedings. 5th Anual Penn State Symposium in Plant Physiology, May 17-19, 1990. Pp 126-136..

Gaba P. 2005. Plant Development and Biotechnology. Ed.: Trigiano, R.T. and D.J. Gray. CRC Press. Boca Raton, London, New York, Washington. 358 hlm.

Gallo-Meagher M. 2000. Thidiazuron stimulates shoot regeneration of sugarcane embryogenic callus . J. In Vitro Cell. Develop. Biol. Plant. 36: 37-40 Galston AW,. Kaur-Sawney R. 1987. Polyamines and senescens in plant. Pp181.

In: Setijorini, L.E., B.S. Purwoko, S. Sujiprihatini, dan S. Susanto. 2001.

Aplikasi poliamine prapanen untuk mempertahankan kualitas buah tomat (Lycopersicon esculentum Mill.) setelah panen. Jurnal Matematika, Sains dan teknologi. Vol 12, 1 Maret 2001.

(3)

George EF, Sherrington PD. 1984. Plant Propagation by Tissue Culture. Eastern Press, Reading, Berks. England. 709 hlm.

Gilbert RA, Gallo-Meagher M, .Comstock JC, Miller JD, Jain M, Abouzid. 2005. Agronomic evaluation of sugarcane lines transformation for resistance to sugarcane mozaic virus strain E. Crop sci.45:2060-2067.

Glaz BG. Powell, Perdomo R, Modesto, Ulloa F. 2000 Sugarcane, genotipe response to phosphorus fertilizer in Everglades. Agron. J. 92:887-894. Glick BR, Pasternak JJ. 1994. Molecular Biotechnology. ASM Press. Washington

DC.

Graf E. 1983. Calcium binding and phitic acid. J. Agric. Food. Chem. 31 : 851-855.

Greiner R, Haller E, Konietzny U, Jany KD. 1997. Purification and characterization of a phytase from Klebsiella terrigena. Arch Biochem Biophys. 341: 201-206.

Greiner R. 2005. Current biochemistry research on phytase genes in microorganism and plant. http:/striweb.si.edu/inositol_conference /program/PDFs/monday_afternoon/Greiner.pdfn. [11 Maret 2006]

Gunawan LW. 1987. Teknik Kultur Jaringan. Lab Kultur jaringan tanaman. PAU Bioteknologi IPB. Bogor. 244 hlm.

Hanarida S, Ambarwati AD, Apriana A. 2002. Induksi kalus dan regenerasi tanaman melalui kultur antera pada silangan padi tipe baru. Penelitian Pertanian Tanaman Pangan. Vol 21. No 2, 2002.

Haris N, Mathius NT. 1995. Teknologi in vitro untuk pengadaan bibit tanaman perkebunan. Warta Pusat Penelitian Bioteknologi Perkebunan. 1(1):hal 2-9.

Hayatyzul R. 2007. Regenerasi dan transformasi tebu (Saccharum officinarum L.) kultivar PA 183 dan CB 6979 dengan gen fitase melalui Agrobacterium

tumefaciens GV2260. [tesis]. Sekolah Pascasarjana. IPB.

Hendaryono DPS, Wijayani A. 1994. Teknik kultur jaringan. Pengenalan dan Petunjuk Perbanyakan Tanaman secara Vegetatif-Modern. Kanisius. Yogyakarta. 139 hlm.

Hetharie H. 2003. Makalah individu, Pengantar Falsafah Sains (PPS702), Program Pascasarjana / S3, Institut Pertanian Bogor, November 2003 Hiei Y, Komari T, Kubo T. 1997. Transformation of rice mediated by

Agrobacterium tumefaciens. Plant. Mol. Biol. 35 : 205 – 218.

(4)

141 Idriss EE, Makarewicz O, Farouk A, Rosner K, Greiner R, Bochow E, Richter T,

Borriss R. 2002. Extracellular phytase activity of Bacillus amyloliquefaciens FZB45 contributes to its plant-growth-promoting effect. Microbiol. 148: 2097-2109.

IITA. 1983. In: International Institute of Tropical Agriculture. Juo, A.S.R., F.R. Moorman, R. Lal (eds). Ibadan. Technical Bulettin. 48 hal.

Irawan. 1990. Berita. Pusat Penelitian Perkebunan Gula Indonesia. Pasuruan. No 3. Hlm 3

Jones J. Benton Jr. 1998. Plant Nutrition. Manual. CRC Press. Boca Raton, Boston, London, New York, Washington. 149 hlm.

Kahl G. 2001. The Dictionary of Gene Technology. Second edition. Wiley-VCH. Germany. 942 hlm.

Keruvuo J, Rouvinen J, Hatzack F. 2000. Analysis of myo-inositol hexakisphosphate hydrolysis by Bacillus phytase: indication of a novel mechanism. Biochem J. 352:623-628.

Khatri A, Khan IA, Javed MJ, Siddiqui MA, Khan MKR, Khanzada MH, Dahar NA. Khan R. 2002. Studies on callusing and regeneration potential of indegenous and exotic sugarcane clones. Asian J. Plant Sci. Volume 1(1): 41-43.

Klee H, Horsch R, Roger S. 1987. Agrobacterium mediated plant transformation and further application to plant biology. Plant Physiol. 8: 467-468.

Konietzny U, Greiner R, 2002. Molecular and catalytic properties of phytate degrading enzymes (phyteses). J. Food Sci. 37 : 791-812.

Kyriakidis NB, Galtou M, Payanatou, Stavropoulou A, Achanasopoulous P, 1998. Increase in phytase activity and decrease in phytase during germination of four common in legumes. Biotechnol Lett. 20 : 475-478.

Leiwakabessy FN, Sutandi A. 1999. Diktat Kuliah Pupuk dan Pemupukan. Jurusan Tanah, Fakultas Pertanian IPB. Bogor. Hlm 1-64

Lindung. 2006. Kajian dosis dan waktu pemupukan fosfat terhadap serapan P, hasil, dan kualitas biji pada tanaman jagung (Zea mays L.). [desis]. Surakarta: Program Pascasarjana, Universitas Sebelas Maret Surakarta Maftuchah. 2003. Transformasi genetik pada padi indica dengan gen cryIA(b)

dan cryIB menggunakan Agrobacterium tumafaciens untuk ketahan terhadap hama penggerek batang kuning (Scirpophaga incertulas Walker). [disertasi]. Bogor: Program Pascasarjana, Institut Pertanian Bogor.

Mariska. 1996. Embrio somatik tanaman kehutanan. Prosiding khusus Biotek. 4-5 November 1996. BPPT Serpong. 13 hlm.

Marschner H. 1995. Mineral Nutrition in Higher Plant. Academic Press. New York. 885 hlm.

Mulyaningsih, E.S. 2001. Introduksi gen Chitinase pada tanaman padi (Oryza

sativa) cv. Rajalele menggunakan Agrobacterium tumefaciens. [tesis].

(5)

Naik GR. 2001. Sugarcane Biotechnology. Science Publisher, Inc. Enfield (NH), USA; Plymouth, UK. 165 hlm.

Nasir M. 2002. Bioteknologi, Potensi dan Keberhasilannya dalam Bidang Pertanian. PT Raja Grafindo Persada. Jakarta. 286 hlm.

Nurhasanah A. 2007. Penyisipan gen fitase pada tebu (Saccharum officinarum) varietas PS 851 dan PA 198 dengan perantara Agrobacterium tumefaciens GV 2260. [tesis]. Sekolah Pascasarjana. IPB. Bogor. 43 hlm.

Ochse JJ, Soule Jr MJ, Dijkman MJ, Wehlburg C. 1961. Tropical and Subtropical Agriculture. Volume 2. The Mac Millan Comp. 144 hl.

Pakpahan A, Supriono A. 2002. Ketika tebu mulai bebunga, mencari jalan revitalisasi industri gula Indonesia. Sugar Observer. Bogor. 972 hlm. Pardal SJ. 2002. Perkembangan penelitian regenerasi dan transformasi pada

tanaman kedelai. Bul. Agrobio. 5: 37-44.

Pawirosemadi M. 1980. Metode hara berimbang optimum dalam analsis daun untuk petunjuk saran-saran pemupukan tanamn tebu (Saccarum officinarum L) di Indonesia. P3GI. Pasuruan.

Pesik A. 2005. Transformasi gen fitase melalui Agrobacterium tumefaciens GV2260 dan regenerasinya pada tanaman tebu (Saccarum officinarum L). Seminar Pascasarjana 23 Juni 2005. hlm 1-12.

Pierrik MLR. 1987. In vitro Culture of Higher Plants. Martinus Nijhoff Publishers. Dordrecht. The Netherlands. 344 hlm.

Poerwanto SB. 1993. Transformasi. Dalam: A. Soewanto (ed.). Materi Kuliah Biologi Molekuler. Jurusan Biologi. FMIPA-IPB. Bogor.

Purwoko BS, Hanarida I, Dewi IS, Santosa E. 2000. Penggunaan poliamin untuk meningkatkan regenerasi tanaman hijau pada kultur antera padi dan aplikasinya dalam program pemuliaan padi. Laporan Penelitian Hibah Bersaing VIII/1. Institut Pertanian Bogor.

Rahmawati S. 2006. Status perkembangan perbaikan sifat genetik padi

menggunakan transformasi Agrobacterium. Jurnal AgroBiogen.

http://biogen.litbang.deptan.go.id/terbitan/agrobiogen/abstrak/agrobiogen_v ol2_no1_2006_36-44.php. [26 Oktober 2007]

Richardson AE, Hadoba PA. Hayes JE. 2001. Ekstraselular secretion of Aspergilus niger from Arabidopsis root enables plant to obtain phosphorus from phytate. Plant J. 25: 641-649.

Riva GA de la, Gonzales-Cabrera J, Vasquaes_ Padron R, Ayra-Pardo C. 1999.

Agrobacterium tumefaciens: a natural tool for plant transformation.

Romelio, R. Mariela C, Danilo P, Justo LGO, Yves D. Growth and photosinthetic activity during acclimatization of sugarcane plantlets cultivated in temporary immersion bioreactor. J. In Vitro Cell. Develop. Biol. Plant. 39: 657-662

Rostini, N. 1999. Diktat Kuliah Pengantar Bioteknologi dalam Pemuliaan Tanaman. Unpad. 96 hlm.

(6)

143 Sangwan RS, Sangwan BSN. 1990. The impact of Biotechnology in Agriculture.

Kluwer Academic Publisher. Printed in The Netherland. 5 hlm.

Santos M, Boger N, Torne JM. 1996. Endogenous polyamine content during In vivo maturation and in vitro culture of maize pollen. Plant Growth Reg. 16:19-26.

Santosa DA, Hendroko R, Farouk A, Greiner R. 2004. A rapid and highly efficient method for transformation of sugarcane callus. Mol. Biotechnol. 28:113-118

Santosa DA, Hendroko R, Farouk A, Greiner R. 2005. Agrobacterium mediated transformation of sugarcane (Saccharum officinarum L) with bacterial phytase gene. The XXV Congress of International Society of Sugarcane Technologists, Guatemala, January 30-Februari 5, 2005.

Santosa, S. 2007. Mineral bagi tanaman. http://sugihsantosa.atspace. com/artikel/mineral.html. [26 Agustus 2007].

Santoso TJ, Bustamam M. 2004. Pengkloning fragmen DNA genom sebagai marka non-radioaktif untuk analisis RFLP tanaman tebu. J. Bioteknologi Pertanian, Vol. 6, No. 1, 2001, pp. 1-8. Balai Penelitian Bioteknologi Tanaman Pangan. Bogor

Scheumann V, Schoch S, Ruediger W. 1998. Chloropyll a formation in the chloropyll b reduction requires reduced ferrodoxin. J. Biol. Chem. 273:35102-35108.

Setijorini LE, Purwoko BS, Sujiprihatini Susanto S. 2001. Aplikasi poliamine prapanen untuk mempertahankan kualitas buah tomat (Lycopersicon

esculentum Mill.) setelah panen. Jurnal Matematika, Sains dan teknologi.

Vol 12, 1 Maret 2001.

Sheng J, Citovsky V. 1996. Agrobacterium – Plant cell DNA transport : Have virulence proteins will travel. Plant cell. 8 : 1699 – 1710.

Skinner DZ, Muthukhrisnan S, Liang GH. Transformation: A powerful tool for crop improvement. Ed: Skinner DZ, Liang GH. In: Geneically Modified Crop, Their Development, Uses and Risk. New York.

Smith RH. 2000. Plant Tissue Culture. Technique and experiments. Second edotion. Academic Press. San Diego, San Fransisco, New York, Boston, London, Didney, Tokyo. 231 hlm.

Somers DA, Olhoft PM, Makarevitch IF, Svitashev SK. 2004. Mechanism(s) of transgene locus formation. Ed: Skinner DZ, Liang GH. In: Geneically Modified Crop, Their Development, Uses and Risk. New York.

Streips UN.1991. Transformation : p.191-16. In. Streips, U. N., and R. E. Yasbin (ed.) : Modern Microbial Genetics. Wiley-Liss. Inc. New York.

Subarkat A, Prasongko A, Karim A. 1988. Penampilan varietas Co617 dan Triton di PG Bungamayang. Prosiding. Seminar Budidaya Tebu lahan Kering. Hlm 110-116

(7)

Sugiyarta E. 1993. Plasmanutfah tebu dan koleksinya di Indonesia. Berita. Pusat Penelitian Perkebunan Gula Indonesia. Pasuruan. ISSN 0852-0344. Hlm 4-6

Sulandari S, Zein MSA. 2003. Panduan praktis Laboratorium DNA. Bidang Zoologi, Pusat Penelitian Biologi. LIPI.125 hlm.

Supardi G. 1979. Sifat dan Ciri Tanah. Departemen Ilmu-ilmu tanah, Fakultas Pertanian. IPB. Bogor

Tim Laboratorium Kultur Jaringan Tanaman. 1991. Bioteknologi tanaman. Pusat Antar Universitas Bioteknologi IPB. 507 hlm.

Tjokrodirjo H. 2000. Jumlah varietas tebu tertanam dan peningkatan produksi hablur nasional secara imaginer melalui data statistik. Makalah pertemuan teknis P3GI, Hotel Tunjungan-Surbaya, 15-16 November 2000.

Triatminingsih, Fitrianingsih RI, Sinaga EB, Wahyuni D. 2001. Pengaruh beberapa level konsentrasi IBA dan perl;akuan penyinaran terhadap perakaran plantlet manggis secara in vitro. J Hort. 1(14):232-236.

Viljoen GJ, Nel LH, Crowther JR. 2005. Molecular Diagnostic PCR. Handbook. Springer. International Atomic Energy Agency, Viena, Austria. 307 hlm. Wattimena GA, Gunawan LW, Matjik NA, Syamsudin E, Armini NMA, Ernawati

A. Bioteknologi Tanaman. Laboratorium Kultur Jaringan. PAU. IPB. 309 hlm.

Wattimena GA. 1988. Zat Pengatur Tumbuh. Pusat Antar Universitas. Institut Pertanian Bogor. 145 hlm.

Wilmink A, Dons JJM. 1993. Selective agent and marker genes for use in transformtion of monocotyledoneus plants. Plant Mol. Biol. Rep. 11:165-185.

Wintermans JGFM., De Mots A. 1965. Spectrophotometric characteristics of chlorophylls a and b and their pheophytins in ethanol. Biochim Biophys Acta. 109: 448–453.

Wulandari I. 2005. Studi beberapa metode transformasi genetik tanaman tebu (Saccarum officinarum L.) dengan gen fitase melalui perantara

Agrobacterium tumefaciens GV 2260 [tesis]. Sekolah Pascasarjana IPB,

Bogor. 54 hlm.

Xiao, Kai , Jn-Heng Zhang, Harrison M, Zeng-Yu. 2006. Ectopic Expression of a Phytase Gene from Medicago truncatula Barrel Medic Enhances Phosphorus Absorption in Plants. Wanghttp://scholar.ilib.cn/ Abstract.aspx?A=zwxb200601005. [26 Agustus 2007].

Zambrysky P. 1992. Cronicle from the Agrobacterium-plant cell DNA transfer story. Plant Mol. Biol. 43: 465-490.

Zupan JR, Zambrasky P. 1995. Transfer T-DNA from Agrobacterium to the plant cell. Plant Physiol. 107: 1041-1047.

(8)

(9)

Lampiran 1 Komposisi bahan kimia dan media yang digunakan dalam penelitian

a Komposisi media MS

Bahan Kimia mg l-1 Kode Stok

Makro nutrisi: NH4NO3 KNO3 H3BO3 KI Na2MoO.2H2O CoCl2.6H2O KH2.PO4 CaCl2.2H2O Mikro nutrisi: MgSO4.7H2O MnSO4.4H2O ZnSO4.7H2O CuSO4.5H2O NA2EDTA FeSO4.7H2O Vitamin: Myo-inositol Thiamin-HCl Niacin Pyrridoxine-HCl Glycine Sukrosa PH Gel rite 1650 1900 6,2 0,83 0,25 0,025 170 440 370 22,3 8,6 0,025 37,3 27,8 100 0,1 0,5 0,5 2 30000 5,8 2500 A B C C C C C D E E E E F F H H H H

(10)

146

b Komposisi media yang digunakan dalam transformasi

Nama media Komposisi

Media LB Tripton 10g/l, ekstrak yeast 5 g/l, NaCl 5 g/l

MS-1 MS salts, 1 mg/l asam nicotinat, 0.8 mg/l

vitamin B1; 0.5 mg/l vitamin B6; 100 mg/l myo-inositol dan 20 g/l sukrosa, 0,1 mg/l kinetin, 3 mg/l 2,4 D

MS-2 MS salts, 1 mg/l asam nicotinat, 0.8 mg/l

vitamin B1; 0.5 mg/l vitamin B6; 100 mg/l myo-inositol dan 20 g/l sukrosa, 0,1 mg/l kinetin, 2 mg/l NAA

MS-ao MS-1 ditambah dengan 15 mg/l asam ascorbat,

40 mg/l L-cystein; 2 mg/l silver nitrat

Media MScd MS-1, N.2 amine 0.5 g (casein hidrolisat)

MScd ao MScd dengan tambahan antioksidant 5 ml/l

MScd ac MScd yang ditambahkan asetosiringone 10 ml/l

MSc MS, air kelapa 100 ml, BAP 0,5 mg/l, PVP 50

mg/l, sukrosa 20000 mg/l.

c Stok bahan kimia lainnya

Nama stok Komposisi

Vitamin (Thiamin-hydrochloride 0,1 g, Biotin 0,05 g;

Pyrodoxine-hydrochloride 1 g; Myo inositol 0.25 g) dilarutkan dalam 75 ml H2O. Catatan:

Biotin dilarutkan terpisah dengan penambahan 1 N NaOH sampai larut. Kemudian sterilisasi dengan 0.2 μm filter.

Acetosyringone 3,5-dimethoxy-4hydroxy-acethophenone 0,196

g dilarutkan dalam 10 ml DMSO. Kemudian sterilisasi dengan 0.2 μm filter.

Antioksidant Ascorbic acid 0,03 g; L-cystein 0,08 g; silver

nitrat 0,04 g (kesemuanya dilarutkan dalam 10 ml H2O); pH 3,8; sterilisasi dengan 0.2 μm

filter

Larutan AAM Acetone 5 N : sulfuric acid 10 mM : amonium

(11)

Lampiran 2 Pembuatan media kultur

a Persiapan media kultur

Bahan-bahan nutrisi untuk pembuatan larutan stok media kultur ditimbang, kemudian masing-masing nutrisi itu dikelompokkan seperti terlihat pada Lampiran 4. Masing-masing kelompok nutrisi ditempatkan pada satu tempat yaitu labu ukur dengan volume 1 liter. Setelah larutan stok ini dibuat, kemudian disimpan di dalam lemari pendingin.

b Pembuatan media dasar

Pembuatan media dilakukan dengan mengencerkan larutan stok sesuai dengan ketentuan untuk media MS yang ditambahkan ZPT sesuai dengan tahap-tahap dan jenis media yang digunakan Komposisi media dapat dilihat pada Lampiran 1. Jumlah larutan media yang dibuat sesuai dengan jumlah botol kultur yang diperlukan. Banyaknya botol yang disiapkan dan pembuatan media disesuaikan dengan banyaknya eksplan yang tersedia dan yang akan ditanam. Selain itu dilakukan penetatapan pH media MS ini pada kisaran 5,8 yang ditetapkan dengan menambahkan larutan NaOH 1 N jika pH terlalu rendah atau menambahkan HCl 1 N jika pH terlalu tinggi, sambil terus diaduk sampai larutan menjadi bening. Sesudah pengukuran pH ditambahkan agar 8 g (atau phytagel 2 g atau gel-rite sebanyak 2,5 g) per liter media. Kemudian media dipanaskan hingga mendidih. Setelah larutan menjadi jernih pemanasan dihentikan dan media segera dimasukkan ke dalam botol kultur sebanyak dan ditutup dengan plastik. Selanjutnya disterilkan dalam autoclave pada tekanan 15 psi dengan suhu 121 o C selama 20 menit. Setelah sterilisasi selesai, botol kultur dikeluarkan dan diinkubasi selama 1 minggu di ruang transfer sebelum ditanam eksplan. Media yang terkontaminasi dikeluarkan dari ruang kultur dan tidak digunakan untuk penanaman eksplan.

(12)

148

Lampiran 3 Analisis kandungan klorofil

Analisis kandungan klorofil berdasarkan metode Wintermans dan De Mots, 1965: 1 Ditimbang 1 g daun sampel, dicuci dengan air mengalir, kemudian

dikeringkan dengan menggunakan kertas pengering (tissue). Selanjutnya daun dipotong kecil-kecil (kira-kira lebar 2 mm).

2 Daun ditambah 5 ml borat 10 mM dingin ditumbuk/dihancurkan menggunakan mortar dan pestle yang telah didinginkan sebelumnya.

3 Hasil penumbukan dipindahkan ke dalam tabung sentrifius polyethylene. Ekstrak kemudian dicampur dengan baik kemudian dipindahkan ke dalam tabung tes ukuran 40 ml. Selanjutnya disentrifugasi dengan kecepatan 15.000 RPM selama 10 menit.

Pengukuran klorofil

a 40 µl sampel klorofil ditambah etanol hingga volume mencapai 960 µl, dibuat 4 tabung tes ukuran 4 ml. Digojog dengan alat Vortex.

b Ekstrak klorofil diinkubasi pada suhu 4oC dalam ruang gelap selama 30 menit. c Disentrifugasi dengan kecepatan 10.000 RPM selama 5 menit.

d Supernatan dipindahkan ke dalam cuvette.

e Dengan menggunakan spektrofotometer diukur absorbannya pada panjang gelombang 649 nm dan 665 nm, etanol 96% digunakan sebagai pembanding. Perhitungan:

1 Klorofil a = (13,7 x A665) – (5,76 x A649) = µg Klorofil/ml 2 Klorofil b = (25,8 x A649) – (7,60 x A665) = µg Klorofil ml-1

(13)

Lampiran 4 Deskripsi dan morfologi kultivar tebu

Gambar Lampiran 4.1 .Batang tanaman tebu cv. Triton (A), cv. PSJT 94-41 (B)

dan cv. PA 175 (C) di lapangan.

Gambar Lampiran 4.2 Morfologi tebu cv. Triton (Alveros et al. 2006)

(14)

150

Lanjutan Lampiran 4 Deskripsi dan morfologi kultivar tebu Tabel 1 Deskripsi tebu cv. Triton

Deskripsi morfotaxonomi tebu cv. Triton usia 7-8 bulan :

a Daun

Warna helaian daun : hijau kekuningan Permukaan helaian daun : halus

Ketegakan helaian daun : Tegak dari pucuk Panjang : 174.50 cm Lebar : 62.5 Warna tulang daun : hijau kuning Bintik secara genetik : tidak ada

b Teling daun

Bentuk telinga daun bagian dalam : sloping transitional (kedudukan miring)

Bentuk telinga daun bagian luar : sloping transitional (kedudukan miring)

Deskripsi morfotaxonomi tebu cv. Triton usia 7-8 bulan : c Lapisan daun

Lapisan lilin : sedang Warna utama : hijau kuning Adanya bulu : beberapa Kualitas bulu : lembut

d Dewlap

Lapisan lilin : banyak Warna utama : kuning hijau Rambut : ada

e Ligula

Ukuran lidah daun : dengan lengkungan yang lebar Rambut lidah daun : menonjol

f Mata tunas

Panjang (mm) : 7.45 Lebar (mm) : 7.71 Rambut : menonjol

Posisi dasar : pada bekas perpotongan dengan daun Posisi tunas : diatas lingkaran tumbuh.

g Batang

Lapisan lilin : terang, sepanjang buku Tampilan warna buku : hijau kuning

Strip pada tebu : tidak ada Lingkar tumbuh : sempit

Deskripsi morfotaxonomi tebu cv. Triton usia 10-12 bulan:

Tinggi tanaman : 392.80 cm Panjang batang : 238.00 cm Jumlah buku (rata-rata) : 24.9 Bentuk melintang buku : lingkaran

Warna antara buku : kuning keabu-abuan Panjang buku (cm) : rendah :10.90

sedang :9.98 tertinggi :3.85 Diameter buku (cm) : terendah :2.64 sedang :2.45

tertinggi :1.85

Brix: : tertinggi : 5.83 sedang :15.17 terendah : 16.00

(15)

Lanjutan Lampiran 4 Deskripsi dan morfologi kultivar tebu

Deskripsi tebu cv. PS 851

PS 851

• SK Menhutbun No. 685/KPTS-IX/98

• Cocok unutk lahan tegalan, dapat juga diusahakan dilahan sawah • Sesuai untuk tanah aluvial dan latosol beriklim D3

(16)

152

Lampiran 5 Analisis sidik ragam

a Regenerasi tebu secara in vitro

Tabel Lampiran 5.1 .Analisis sidik ragam diameter kalus beberapa kultivar tebu secara in vitro usia 6 minggu setelah tanam.

Sum of Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 11 0.64061000 0.05823727 14.21* <.0001 V 2 0.05401500 0.02700750 6.59* 0.0020 v1 vs v2, v3 1 0.05310375 0.05310375 12.96* 0.0005 v2 vs v3 1 0.00091125 0.00091125 0.22ns 0.6382 Z 3 0.53265000 0.17755000 43.33* <.0001 linear 1 0.38405400 0.38405400 93.73* <.0001 kuadratik 1 0.14840333 0.14840333 36.22* <.0001 V*Z 6 0.05394500 0.00899083 2.19* 0.0490 v x Zl 2 0.04188900 0.02094450 5.11* 0.0076 v x Zq 2 0.00687167 0.00343583 0.84 ns 0.4351 Error 108 0.44252000 0.00409741 Corrected Total 119 1.08313000 R‐Square Coeff Var Root MSE Dk Mean 0.591443 5.417774 0.064011 1.181500 = 9.855

Keterangan: *= berbeda nyata

ns

= tidak berbeda nyata l = linear

q = kuadratik V = kultivar

(17)

Tabel Lampiran 5.2 .Analisis sidik ragam persentase terbentuk kalus beberapa kultivar tebu secara in vitro usia 6 minggu setelah tanam.

Sum of Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 11 189.443149 17.222104 2.02* 0.0333 V 2 19.0239817 9.5119908 1.11ns 0.3318 Z 3 147.1245558 49.0415186 5.75* 0.0011 linear 1 131.2927482 131.2927482 15.38* 0.0002 kuadratik 1 12.8904075 12.8904075 1.51ns 0.2217 V*Z 6 23.2946117 3.8824353 0.45ns 0.8401 Error 108 921.702010 8.534278 Corrected Total 119 1111.145159 R‐Square Coeff Var Root MSE mk Mean 0.170494 2.951024 2.921349 98.99442

ns

= tidak berbeda nyata V = kultivar

Z = konsentrasi 2,4 D

Tabel Lampiran 5.3 ..Analisis sidik ragam persentase membentuk tunas beberapa kultivar tebu secara in vitro usia 4 minggu setelah tanam.

K Sum of Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 11 57.4226025 5.2202366 1.00ns_0.4525 V 2 9.63704000 4.81852000 0.92ns_0.4009 u 3 42.59740917 14.19913639 2.72* 0.0483 linear 1 39.19370417 39.19370417 7.50ns 0.0072 kuadratik 1 3.33000083 3.33000083 0.64ns 0.4265 V*U 6 5.18815333 0.86469222 0.17ns_0.9854 Error 108 564.5423100 5.2272436 Corrected Total 119 621.9649125 R‐Square Coeff Var Root MSE mt Mean 0.092325 2.300378 2.286317 99.38875 K

ns

U = konsentrasi BAP

(18)

154

Tabel Lampiran 5.4 ..Analisis sidik ragam tinggi tunas beberapa ...kultivar tebu secara in vitro usia 4 minggu setelah tanam.

Sum of Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 11 8.59291667 0.78117424 38.31* <.0001 V 2 0.30816667 0.15408333 7.56* 0.0008 v1 vs v2, v3 1 0.28704167 0.28704167 14.08* 0.0003 v2 vs v3 1 0.02112500 0.02112500 1.04ns_0.3110 u 3 7.95091667 2.65030556 129.97* <.0001 linear 1 6.30375000 6.30375000 309.14* <.0001 kuadratik 1 1.38675000 1.38675000 68.01* <.0001 V*U 6 0.33383333 0.05563889 2.73ns_0.0166 v x Ul 2 0.17670000 0.08835000 4.33ns_0.0155 v x Uq 2 0.12150000 0.06075000 2.98ns 0.0550 Error 108 2.20228000 0.02039148 Corrected Total 119 10.79519667 R‐Square Coeff Var Root MSE tt Mean 0.795994 7.789731 0.142799 1.833167 Contrast DF Contrast SS Mean Square F Value Pr > F linear 1 0.26041667 0.26041667 12.77* 0.0005 kuadratik 1 1.38675000 1.38675000 68.01* 0.0001 v1 x kl 1 0.00140833 0.00140833 0.07ns 0.7932 v2 x kl 1 0.03422500 0.03422500 1.68ns_0.1979 v1 x kq 1 0.03037500 0.03037500 1.49ns_0.2249 v2 x kq 1 0.09112500 0.09112500 4.47* 0.0368

ns

(19)

Tabel Lampiran 5.4

.

Analisis sidik ragam jumlah tunas beberapa

..

kultivar

tebu

secara in vitro usia 4 minggu setelah tanam.

KK = 8.144 Sum of Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 11 171.0916667 15.5537879 6.71* <.0001 V 2 0.8166667 0.4083333 0.18ns 0.8388 U 3 157.0250000 52.3416667 22.57* <.0001 linear 1 115.2816667 115.2816667 49.70* <.0001 kuadratik 1 14.0083333 14.0083333 6.04ns_0.0156 V*U 6 13.2500000 2.2083333 0.95ns 0.4613 Error 108 250.5000000 2.3194444 Corrected Total 119 421.5916667 R‐Square Coeff Var Root MSE jt Mean 0.405823 8.901932 1.522972 17.10833 Contrast DF Contrast SS Mean Square F Value Pr > F linear 1 27.73500000 27.73500000 11.96 0.0008 kuadratik 1 14.00833333 14.00833333 6.04 0.0156 v1 x kl 1 2.16750000 2.16750000 0.93 0.3359 v2 x kl 1 1.32250000 1.32250000 0.57 0.4518 v1 x kq 1 0.10416667 0.10416667 0.04 0.8326 v2 x kq 1 2.81250000 2.81250000 1.21 0.2733

ns_{= tidak berbeda nyata}

V = kultivar

U = konsentrasi BAP

Tabel Lampiran 5.5 ..Analisis sidik ragam panjang akar beberapa ..kultivar tebu secara in vitro usia 4 minggu setelah tanam.

Sum of Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 11 0.67007640 0.06091604 5.34* <.0001 V 2 0.09334781 0.04667390 4.09* 0.0194 v1 vs v2, v3 1 0.02730204 0.02730204 2.39ns 0.1249 v2 vs v3 1 0.06604577 0.06604577 5.79* 0.0178 Q 3 0.51531144 0.17177048 15.05* <.0001 linear 1 0.33122843 0.33122843 29.02* <.0001 kuadratik 1 0.09636639 0.09636639 8.44* 0.0044 V*Q 6 0.06141715 0.01023619 0.90ns 0.5000 Error 108 1.23262911 0.01141323 Corrected Total 119 1.90270551 R‐Square Coeff Var Root MSE Pa Mean 0.352170 7.357323 0.106833 1.452060

ns

(20)

156

Tabel Lampiran 5.6 .Analisis sidik ragam jumlah akar beberapa ..kultivar tebu secara in vitro usia 4 minggu setelah tanam.

Sum of Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 11 6.79146798 0.61740618 3.90* <.0001 V 2 0.23212367 0.11606183 0.73ns 0.4829 Q 3 6.00944046 2.00314682 12.65* <.0001 linear 1 5.89810741 5.89810741 37.25* <.0001 kuadratik 1 0.00037468 0.00037468 0.00ns 0.9613 V*Q 6 0.54990385 0.09165064 0.58ns 0.7465 Error 108 17.10245728 0.15835609 Corrected Total 119 23.89392526 R‐Square Coeff Var Root MSE JA Mean 0.284234 11.31936 0.397940 3.515568

ns

Q = konsentrasi IBA

b Transformasi tanaman tebu dengan gen fitase melalui Agrobacterium tumefaciens

Tabel Lampiran 5.7 ..Analisis sidik ragam % kalus hidup dalam media kanamisin (data hasil transformasi).

Sum of Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 11 1563.992544 142.181140 49.78* <.0001 V 2 416.0323760 208.0161880 72.83* <.0001 v1 vs v2, v3 1 414.9470941 414.9470941 145.27* <.0001 v2 vs v3 1 1.0852819 1.0852819 0.38ns 0.5389 K 3 888.8688334 296.2896111 103.73* <.0001 linear 1 805.3692839 805.3692839 281.96* <.0001 kuadratik 1 63.5709332 63.5709332 22.26* <.0001 V*K 6 259.0913351 43.1818892 15.12* <.0001 v x Kl 2 45.0181220 22.5090610 7.88* 0.0006 v x Kq 2 190.0682031 95.0341016 33.27* <.0001 Error 108 308.485527 2.856347 Corrected Total 119 1872.478072 R‐Square Coeff Var Root MSE h Mean 0.835253 46.46611 1.690073 3.637217

ns

K = konsentrasi kanamisin

Tabel Lampiran 5.8 .Analisis sidik ragam lama kalus bertahan hidup dalam .media seleksi kanamisin Sum of Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 11 59.40000000 5.40000000 62.04* <.0001

(21)

V 2 27.45000000 13.72500000 157.69* <.0001 v1 vs v2, v3 1 27.33750000 27.33750000 314.09* <.0001 v2 vs v3 1 0.11250000 0.11250000 1.29ns 0.2581 K 3 23.00000000 7.66666667 88.09* <.0001 linear 1 22.42666667 22.42666667 257.67* <.0001 kuadratik 1 0.03333333 0.03333333 0.38ns 0.5373 V*K 6 8.95000000 1.49166667 17.14* <.0001 v x Kl 2 6.14333333 3.07166667 35.29* <.0001 v x Kq 2 2.61666667 1.30833333 15.03* <.0001 Error 108 9.40000000 0.08703704 Corrected Total 119 68.80000000 R‐Square Coeff Var Root MSE Lkh Mean 0.863372 11.34694 0.295020 2.600000

ns

K = konsentrasi kanamisin

c Peningkatan klorofil plantlet tebu hasil transformasi dengan pemberian putresina

Tabel Lampiran 5.9...Analisis sidik ragam pengaruh putresina terhadap pembentukan klorofil a plantlet tebu transgenik

Sum of Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 14 0.32747477 0.02339106 4.84* <.0001 V 2 0.18154839 0.09077419 18.76* <.0001 V1T vs v2, v3 1 0.17909177 0.17909177 37.02* <.0001 V2T vs V3T 1 0.01738315 0.01738315 3.59* 0.0614 D 4 0.11912305 0.02978076 6.16* 0.0002 linear 1 0.03175231 0.03175231 6.56* 0.0122 kuadratik 1 0.04236458 0.04236458 8.76* 0.0040 V*D 8 0.02680334 0.00335042 0.69ns 0.6971 Error 85 0.41121756 0.00483785 Corrected Total 99 0.73869234 R‐Square Coeff Var Root MSE Klorofil_A Mean 0.443317 11.02290 0.069555 0.631002

ns

(22)

158

Tabel Lampiran 5.10....Analisis sidik ragam pengaruh putresina terhadap

.pembentukan klorofil b plantlet tebu transgenik

Sum of Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 14 0.22448527 0.01603466 1.73ns 0.0650 V 2 0.04443435 0.02221717 2.39ns 0.0976 D 4 0.08490740 0.02122685 2.29ns 0.0668 linear 1 0.06683280 0.06683280 7.20* 0.0088 kuadratik 1 0.00030676 0.00030676 0.03ns 0.8562 V*D 8 0.09514353 0.01189294 1.28ns 0.2646 Error 85 0.78949370 0.00928816 Corrected Total 99 1.01397898 R‐Square Coeff Var Root MSE Klorofil_B Mean 0.221390 16.96676 0.096375 0.568023

ns

D = konsentrasi putresina

Tabel Lampiran 5.11...Analisis sidik ragam pengaruh putresina terhadap

..pembentukan total klorofil plantlet tebu transgenik

Sum of Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 14 0.32994283 0.02356735 2.97* 0.0010 V 2 0.08139950 0.04069975 5.14* 0.0078 V1T vs v2, v3 1 0.05694905 0.05694905 7.19* 0.0088 V2T vs V3T 1 0.04732210 0.04732210 5.97* 0.0166 D 4 0.17337994 0.04334499 5.47* 0.0006 linear 1 0.08857375 0.08857375 11.18* 0.0012 kuadratik 1 0.02608663 0.02608663 3.29ns 0.0731 V*D 8 0.07516338 0.00939542 1.19ns 0.3172 Error 85 0.67347561 0.00792324 Corrected Total 99 1.00341845 R‐Square Coeff Var Root MSE Total Mean 0.328819 10.43053 0.089013 0.853385

ns

(23)

d Ekspresi gen fitase pada beberapa kultivar tebu hasil transformasi

Tabel Lampiran 5.12...Analisis sidik ragam pengaruh pemberian fitat terhadap klorofil a plantlet tebu yang dikulturkan dalam media fitat. K Sum of Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 29 2.59279902 0.08940686 13.26* <.0001 v 5 0.80027955 0.16005591 23.74* <.0001 v1 vs lain v1 1 0.10917853 0.10917853 16.20* 0.0002 v2 vs lain v2 1 0.29841200 0.29841200 44.27* <.0001 v3 vs lain v3 1 0.00008778 0.00008778 0.01ns 0.9095 V1T vs lain v1T 1 0.23189917 0.23189917 34.40* <.0001 V2T vs lain v2T 1 0.16070208 0.16070208 23.84* <.0001 F 4 1.24821365 0.31205341 46.29* <.0001 linear 1 1.18732396 1.18732396 176.14* <.0001 kuadratik 1 0.01922874 0.01922874 2.85ns 0.0964 v*F 20 0.54430582 0.02721529 4.04* <.0001 v x Fl 5 0.40111499 0.08022300 11.90* <.0001 v x Fq 5 0.04270875 0.00854175 1.27ns 0.2899 Error 60 0.40445237 0.00674087 Corrected Total 89 2.99725139 R‐Square Coeff Var Root MSE Klorofil_A Mean 0.865059 25.65748 0.082103 0.319996

ns

= tidak berbeda nyata l = linear q = kuadratik V = kultivar F = konsentrasi fitat K= 41.04

(24)

160

Tabel Lampiran 5.13...Analisis sidik ragam pengaruh pemberian fitat terhadap klorofil b plantlet tebu yang dikulturkan dalam media fitat v Sum of Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 29 0.74985418 0.02585704 6.00* <.0001 v 5 0.10667479 0.02133496 4.95* 0.0007 v1 vs lain v1 1 0.00061734 0.00061734 0.14ns 0.7065 v2 vs lain v2 1 0.00919902 0.00919902 2.13ns 0.1493 v3 vs lain v3 1 0.00627960 0.00627960 1.46ns 0.2322 V1T vs lain v1T 1 0.02778530 0.02778530 6.45ns 0.0137 V2T vs lain v2T 1 0.06279354 0.06279354 14.57ns 0.0003 F 4 0.31230467 0.07807617 18.11* <.0001 linear 1 0.22359524 0.22359524 51.87* <.0001 kuadratik 1 0.04697702 0.04697702 10.90* 0.0016 v*F 20 0.33087472 0.01654374 3.84* <.0001 v x Fl 5 0.18384405 0.03676881 8.53* <.0001 v x Fq 5 0.05423412 0.01084682 2.52* 0.0392 Error 60 0.25866380 0.00431106 Corrected Total 89 1.00851799 R‐Square Coeff Var Root MSE Klorofil_B Mean 0.743521 13.57095 0.065659 0.483818

KK Keterangan: *= berbeda nyata

ns

F = konsentrasi fitat

(25)

Tabel Lampiran 5.14 ..Analisis sidik ragam pengaruh pemberian fitat terhadap total klorofil plantlet tebu yang dikulturkan dalam media fitat. Sum of Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 29 2.04261896 0.07043514 30.55* <.0001 v 5 0.42665615 0.08533123 37.01* <.0001 v1 vs lain v1 1 0.04635495 0.04635495 20.11* <.0001 v2 vs lain v2 1 0.17377642 0.17377642 75.38* <.0001 v3 vs lain v3 1 0.01104506 0.01104506 4.79* 0.0325 V1T vs lain v1T 1 0.02261935 0.02261935 9.81* 0.0027 V2T vs lain v2T 1 0.17286036 0.17286036 74.98* <.0001 F 4 1.08794194 0.27198549 117.98* <.0001 linear 1 1.06792495 1.06792495 463.22* <.0001 kuadratik 1 0.01056187 0.01056187 4.58* 0.0364 v*F 20 0.52802088 0.02640104 11.45* <.0001 v x Fl 5 0.40725942 0.08145188 35.33* <.0001 v x Fq 5 0.06775445 0.01355089 5.88* 0.0002 Error 60 0.13832568 0.00230543 Corrected Total 89 2.18094464 R‐Square Coeff Var Root MSE Total Mean 0.936575 8.038815 0.048015 0.597288

KK Keterangan: *= berbeda nyata

ns

(26)

162

Tabel Lampiran 5.15...Analisis sidik ragam pengaruh pemberian fitat terhadap aktivitas fitase plantlet tebu yang dikulturkan dalam media fitat K Sum of Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 29 0.39419262 0.01359285 27.94* <.0001 v 5 0.23018835 0.04603767 94.61* <.0001 v1 vs lain v1 1 0.04860357 0.04860357 99.89* <.0001 v2 vs lain v2 1 0.07895060 0.07895060 162.26* <.0001 v3 vs lain v3 1 0.10168405 0.10168405 208.98* <.0001 V1T vs lain v1T 1 0.00016055 0.00016055 0.33ns 0.5678 V2T vs lain v2T 1 0.00078957 0.00078957 1.62ns 0.2076 F 4 0.15100620 0.03775155 77.59* <.0001 linear 1 0.14868782 0.14868782 305.58* <.0001 kuadratik 1 0.00153516 0.00153516 3.16ns 0.0808 v*F 20 0.01299807 0.00064990 1.34ns 0.1931 Error 60 0.02919483 0.00048658 Corrected Total 89 0.42338745 R‐Square Coeff Var Root MSE Fitase Mean 0.931045 8.592283 0.022059 0.256725 K = 17.321

ns

(27)

Tabel Lampiran 5.16...Analisis sidik ragam pengaruh pemberian fitat terhadap P total plantlet tebu yang dikulturkan dalam media fitat

Sum of Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 29 0.71580556 0.02468295 92.56* <.0001 v 5 0.06964556 0.01392911 52.23* <.0001 v1 vs lain v1 1 0.01779756 0.01779756 66.74* <.0001 v2 vs lain v2 1 0.01809633 0.01809633 67.86* <.0001 v3 vs lain v3 1 0.03334722 0.03334722 125.05* <.0001 V1T vs lain v1T 1 0.00013444 0.00013444 0.50ns 0.4804 V2T vs lain v2T 1 0.00027000 0.00027000 1.01ns 0.3183 Fk 4 0.62383333 0.15595833 584.84* <.0001 linear 1 0.55333556 0.55333556 2075.01* <.0001 kuadratik 1 0.06933492 0.06933492 260.01* <.0001 v*F 20 0.02232667 0.00111633 4.19* <.0001 v x Fl 5 0.00653778 0.00130756 4.90* 0.0008 v x Fq 5 0.00882222 0.00176444 6.62* <.0001 Error 60 0.01600000 0.00026667 Corrected Total 89 0.73180556 R‐Square Coeff Var Root MSE Fosfor Mean 0.978136 6.214350 0.016330 0.262778

ns

(28)

164

Lampiran 6. Glossary (istilah umum yang digunakan dalam disertasi)

• Aklimatisasi: proses penyesuaian peralihan lingkungan hidup heterotroph menjadi autotroph pada plantlet yang diperoleh melalui teknik in vitro.

• Allopoliploid: set kromosom dari spesies yang berbeda

• Annealing: pembentukan double strand asam nukleotida dari 2 untaian single stand molekul asam nukleotida .

• CaMV 35 S: promoter yang terdapat pada DNA viral yang sifat ekspresinya bersifat konstitutif (diseluruh bagian), yang merupakan strong promotor. • DNA polimerase: sebuah enzim yang menghubungkan sebuah

deoksiribonukleotida yang komplemen dengan deoksiribonukleotida pada template untaian DNA, dengan sebuah ikatan fosfo diester pada kelompok ‘3 hidroksil , yang pada akhirnya akan menghasilkan untaian nukleotida selama replikasi.

• Elektroforesis: teknik pemisahan molekul (DNA, RNA, protein) berdasarkan pergerakan migrasi akibat pemberian arus listrik.

• Elongation: perpanjangan dari rantai nukleotida dengan menambahkan nukleotida baru atau rantai asam amino denganmenambahkan asam amino baru.

• Embriogenesis: proses pembentukan embrio

• Embriosomatik: proses pembentukan embrio secara aseksual dari sel somatik dalam kultur in vitro.

• Enhancer: Rangkaian cis acting yang meningkatkan kemampuan promoter • Gen: segmen asam nukleat yang mengkode protein fungsional atau RNA.

Unit dari pewarisan. Penentu suatu sifat pada organisme yang terdiri dari molekul-molekul DNA yang teratur secara linear dalam kromosom yang dapat diturunkan pada generasi berikutnya.

• Gene cassette: elemen yang bersifat mobil yang berukuran 262-1549 bp yang mengandung hanya satu gen tunggal 59 bp situs rekombinan yang berada di ujung gen (down stream).

• Genome: Keseluruhan material genetik dari organisme. Set haploid dari kromosom (DNA) pada organisme eukaryotik.

• Hablur: gula dalam bentuk kristal

• Induksi: inisiasi dari suatu proses khusus yang menghasilkan perkembangan dari suatu organ

• Kromosom: berbentuk benang kelam dan berada di inti selyang kelihatan selama mitosis dan miosis. Tersusun dari DNA dan protein serta pembawa gen.

(29)

• Organogenesis: proses pembentukan organ

• Organ: bagian dari tanaman yang mempunyai fungsi yang spesifik seperti akar, batang, daun, dan sebagainya.

• ORI: posisi pada molekul DNA dimana replikasi dimulai, bagian dari plasmid yang penting untuk penggandaan.

• PCR: amplifikasi enzimatik dari fragmen DNA spesifik dengan menggunakan siklus berulang dari denaturasi, penempelan primer, dan elongasi

• Plasmid: elemen genetik ekstrakromosomal yang memiliki kemampuan untuk menggandakan diri sendiri. Untaian DNA berbentuk lingkaran diluar kromosom yang terdapat dalam sel bakteri-bakteri tertentu.

• Poliploid: suatu organisme yang memiliki jumlah kromomosm menyimpang atau lebih dari 2 set kromosom

• Primer: Sebuah oligonukleotida khusus yang komplemen pada region tertentu dari strand template, yang mana sintesis DNA baru terjadi

• Promoter: situs di DNA tempat RNA polimerase terikat untuk memulai transkripsi

• Regenerasi: proses pembentukan organ-organ dari suatu eksplan yang digunakan dalam kultur in vitro.

• Rendemen: hablur per bobot tebu

• Signal peptide: Rangkaian asam amino pada terminus amino dari protein tersekresi yang terlibat dalam pemindahan protein melalui membran, atau ditujukan ke lokasi target spesifik

• Somatik: proses non seksual ataupun bagian vegetatif tanaman

• T-DNA: segmen dari plasmid Ti yang di transfer dan masuk dalam lokasi kromosomal pada inti sel tanaman

• Terminator: situs dimana transkripsi berhenti

• Transforman: sel yang telah mengalami proses transformasi

• Transformasi: proses memasukan DNA asing ke dalam sel. Sebuah pertukaran dalam morfologi sel ke genome sebuah sel oleh aplikasi eksternal dari sel lain, juga DNA rekombinan dari sel lain yang berbeda.

• Transgenik: Organisme yang genome nya telah disisipi dengan DNA asing • Vektor: Molekul DNA yang dapat membawa DNA yang disisipkan dan

(30)