DAFTAR PUSTAKA
Anonim. 2012. http://www.ksh.co.id. Diakses pada tanggal 22 Mei 2012 pukul 16.53 WIB
Disharta, B. 2012. www.biofirstore.com. diakses pada tanggal 20 April 2012 pukul 20.00 WIB
Denissa, S. 2010. http://stelladenissa.blogspot.com. Diakses pada tanggal 22 Mei 2012 pukul 16.53 WIB
Collett, D. 2003. Modelling Survival Data In Medical Research. edition, London : Chapman and Hall.
Ekky. 2009. http://ekkyfajarfranasaputra.wordpress.com. diakses pada tanggal 9 Januari 2012 pukul 15.30 WIB
Goldsmith, D., Jayawardene, S., dan Ackland, P. (2007) . ABC of Kidney Disease, USA : Blackwell Publishing.
Kein, J. P., dan Moeschberger, M. L. 2003. Survival Analiysis Techniques for censored Data and Truncated Data, USA : Springer.
Lee, E. T., dan Wang, J. W. 2003. Statistical Methods for Survival Data Analysis.
edition, New york : John Wiley and Sons.
Mustofa, H. 2012. http://home.unpar.ac.id. diakses pada tanggal 20 April 2012 pukul 20.30 WIB
Ponco, B. 2011. http://ekbis.rakyatmerdekaonline.com. diakses pada tanggal 10 Februari 2012 pukul 10.00 WIB
Rosihan, 2011. http://lecture.brawijaya.ac.id/rosihan. diakses pada tanggal 30 Januari 2012 pukul 20.00 WIB
Singarimbun & Effendi. 1989. Metode Penelitian Survai. Jakarta: LP3ES Sembiring, R.K. 1995. Analisis Regresi. ITB : Bandung
Sjaifullah. 2011. http://www.pediatrik.com. diakses pada tanggal 9 Januari 2012 pukul 15.00 WIB
Situmorang, T. 2008. http://cppddokter.com. diakses pada tanggal 14 Februari 2012 pukul 20.00 WIB
Stephen, W. J. 2009. What is A Cox model ?, Hayward group
Surachno. 2011. Buletin Bina Ginjal Edisi 14. diakses pada tanggal 3 Januari 2012 pukul 17.00 WIB
Syamsuri, I. Biologi Untuk SMA. 2004. Erlangga.
Tabachnick, B. G., dan Fidell, L. S. 2007. Using Multivariate Statistics, New York : Pearson.
Usman. 1995. Pengantar Statistika. Jakarta : Bumi Aksara Wahyudi. Power Dari Uji Kenormalan Data. Surabaya
Wahyu, W. 2011. http://wahyupsy.blog.ugm.ac.id. diakses pada tanggal 23 Februari 2012 pukul 11:58
Lampiran 1. Data Pasien Gagal Ginjal yang menjalani Rawat Jalan di RSUP DR M.Djamil Padang
Pasien T
1 2 1 3 2 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 60
2 2 1 3 2 1 1 0 1 3 1 0 1 1 1 1
3 1 1 2 2 0 0 0 1 3 1 1 1 1 0 70
4 2 1 2 4 1 1 0 1 3 1 0 1 0 1 1
5 1 0 3 2 0 1 0 0 1 0 1 0 1 0 24
6 2 0 2 1 0 1 0 1 2 0 0 0 1 0 84
7 2 1 3 2 0 0 0 1 3 0 0 0 0 0 120
8 2 1 3 2 0 0 0 1 3 1 0 0 1 1 120
9 2 1 3 4 1 1 0 1 3 1 0 1 1 1 1
10 1 1 3 3 1 1 0 0 3 1 0 1 1 1 24
11 1 0 2 1 0 0 0 1 3 1 0 0 1 0 120
12 1 0 3 3 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 120
13 2 1 2 2 1 1 0 0 3 1 0 0 0 0 6
14 1 1 2 3 1 1 0 0 3 0 0 1 1 1 3
15 3 1 3 2 0 1 0 1 3 1 0 0 0 0 60
16 1 1 3 2 0 1 0 1 3 0 0 0 0 0 48
17 1 0 3 1 0 1 0 1 3 1 1 1 0 1 3
18 2 1 3 2 1 1 1 0 3 1 0 0 1 1 140
19 2 1 2 3 0 1 0 1 3 1 0 1 1 1 36
20 2 0 3 2 0 0 0 0 3 0 0 0 0 1 60
21 2 1 3 4 0 1 0 1 3 1 0 0 0 1 1
22 2 0 3 2 0 1 0 0 3 0 0 1 0 0 7
23 2 1 3 2 1 0 0 1 3 0 0 1 1 1 17
24 2 1 2 3 1 1 0 1 3 1 0 1 0 1 2
25 2 1 3 3 1 0 0 0 3 1 0 1 1 0 19
26 3 1 3 3 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 51
27 2 1 3 4 1 0 0 0 3 0 0 1 0 1 47
28 3 1 2 2 1 1 0 1 3 1 0 1 0 0 3
29 3 1 3 2 1 1 0 1 3 1 0 1 1 0 3
30 2 1 3 3 1 1 0 1 3 0 0 1 0 0 50
31 1 0 3 1 0 1 0 0 3 1 0 0 0 0 3
32 1 1 2 3 1 1 0 1 3 1 0 1 0 1 9
33 2 1 1 4 1 1 0 1 3 0 0 1 1 1 6
34 2 0 2 2 0 1 0 1 3 0 0 0 0 1 18
35 1 0 1 1 0 1 0 0 3 1 0 0 1 1 16
36 2 1 3 4 1 1 0 1 3 0 0 1 0 1 11
37 2 0 3 4 0 1 1 0 3 1 0 1 1 1 9
Keterangan:
= Usia = Pendidikan
= Jenis kelamin = Pekerjaan
= Status merokok = Stres
= Pola diet = Lingkungan
= Keturunan = Pola makan
= Penyakit lain = Asupan nutrisi
= Kontrol kesehatan = Pola Tidur
T = Waktu survival
Lampiran 2. Output untuk variabel dummy
Categorical Variable Codings(c,d,e,f,g,h,i,j,k,l,m,n,o,p)
Frequency (1)(a) (2) (3)
usia(b) 1.00 11 1 0
2.00 22 0 1
3.00 4 0 0
jenis_kelamin(b) .00 11 1
1.00 26 0
pendidikan(b) 1.00 2 1 0
2.00 11 0 1
3.00 24 0 0
pekerjaan(b) 1.00 5 1 0 0
2.00 16 0 1 0
3.00 9 0 0 1
4.00 7 0 0 0
status_merokok(b) .00 20 1
1.00 17 0
pola_diet(b) .00 11 1
1.00 26 0
keturunan(b) .00 34 1
1.00 3 0
penyakit_lain(b) .00 14 1
1.00 23 0
kontrol_kesehatan(
b)
1.00 3 1 0
2.00 2 0 1
3.00 32 0 0
stres(b) .00 14 1
1.00 23 0
lingkungan(b) .00 34 1
1.00 3 0
pola_makan(b) .00 17 1
1.00 20 0
asupan_nutrisi(b) .00 20 1
1.00 17 0
pola_tidur(b) .00 17 1
1.00 20 0
a The (0,1) variable has been recoded, so its coefficients will not be the same as for indicator (0,1) coding.
b Indicator Parameter Coding
Lampiran 3. Uji Distribusi
y
Percent
150 100
50 0
-50 -100
99
95 90 80 70 60 50 40 30 20 10 5
1
Mean
<0.005 37.11 StDev 41.75
N 37
AD 2.637
P-Value
Probability Plot of y Normal - 95% CI
y
Percent
1000.0 100.0
10.0 1.0
0.1
99
95 90 80 70 60 50 40 30 20 10 5
1
Loc
0.042 2.716 Scale 1.577
N 37
AD 0.766
P-Value
Probability Plot of y
Lognormal - 95% CI
y - Threshold
Percent
100000.00 10000.00
1000.00 100.00
10.00 1.00
0.10 0.01
99
95 90 80 70 60 50 40 30 20 10 5
1
Loc
2.323 P-Value * 2.109 Scale 2.711 Thresh 0.99
N 37
AD
Probability Plot of y 3-Parameter Lognormal - 95% CI
y
Percent
1000.000 100.000
10.000 1.000
0.100 0.010
0.001
99 9590 80 7060 50 40 30 20
10
5 3 2
1
Shape
0.093 0.6766 Scale 54.84
N 37
AD 0.675
P-Value
Probability Plot of y Gamma - 95% CI
y
Percent
100.0 10.0
1.0 0.1
99 90 8070 60 50 40 30 20
10
5 3 2 1
Mean 37.11
N 37
AD 2.531
P-Value <0.003
Probability Plot of y Exponential - 95% CI
y - Threshold
Percent
100.00 10.00
1.00 0.10
0.01
99 90 8070 6050 40 30 20
10
5 3 2 1
Scale
<0.010 36.12 Thresh 0.99
N 37
AD 2.518
P-Value
Probability Plot of y 2-Parameter Exponential - 95% CI
y
Percent
200 100
0 -100
-200
99 90 80 70 60 50 40 30 20
10 5 3 2 1
Loc
<0.010 59.67 Scale 47.50
N 37
AD 3.353
P-Value
Probability Plot of y Smallest Extreme Value - 95% CI
y
Percent
1000.00 100.00
10.00 1.00
0.10 0.01
99 90 80 70 60 50 40 30 20
10
5 3 2 1
Shape
0.077 0.7708 Scale 32.02
N 37
AD 0.670
P-Value
Probability Plot of y Weibull - 95% CI
y - Threshold
Percent
1000.00 100.00
10.00 1.00
0.10 0.01
99 90 8070 60 50 40 30 20
10 5 3 2 1
Shape
0.945 P-Value 0.019 0.5747 Scale 25.61 Thresh 0.99
N 37
AD
Probability Plot of y 3-Parameter Weibull - 95% CI
y
Percent
200 150
100 50
0
98 97 95
90
80 70 60 50 40 30 20 10 1
Loc
<0.010 19.30 Scale 26.81
N 37
AD 2.127
P-Value
Probability Plot of y Largest Extreme Value - 95% CI
y
Percent
200 150
100 50
0 -50
-100
99
95 90 80 70 60 5040 30 20 10 5
1
Loc
<0.005 30.58 Scale 22.72
N 37
AD 2.272
P-Value
Probability Plot of y Logistic - 95% CI
y
Percent
10000.0 1000.0
100.0 10.0
1.0 0.1
99
95 90 80 7060 5040 30 20 10 5
1
Loc
0.023 2.788 Scale 0.9420
N 37
AD 0.786
P-Value
Probability Plot of y Loglogistic - 95% CI
y - Threshold
Percent
100000.00 10000.00
1000.00 100.00
10.00 1.00
0.10 0.01
99
95 90 80 70 60 5040 30 20 10 5
1
Loc
1.522 P-Value * 2.544 Scale 1.390 Thresh 0.99
N 37
AD
Probability Plot of y 3-Parameter Loglogistic - 95% CI
Lampiran 4. Uji Asumsi Pemodelan Proportional Hazard
T
120.00 100.00
80.00 60.00
40.00 20.00
0.00
Log minus log
4
2
0
-2
-4
3.00 2.00 1.00 Usia LML Function for patterns 1 - 3
T
120.00 100.00
80.00 60.00
40.00 20.00
0.00
Log minus log
6
4
2
0
-2
-4
1.00 .00 Jenis_kelamin LML Function for patterns 1 - 2
T
120.00 100.00
80.00 60.00
40.00 20.00
0.00
Log minus log
6
4
2
0
-2
-4
4.00 3.00 2.00 Pendidikan LML Function for patterns 1 - 3
T
120.00 100.00
80.00 60.00
40.00 20.00
0.00
Log minus log
5.0
2.5
0.0
-2.5
-5.0
4.00 3.00 2.00 1.00 Pekerjaan LML Function for patterns 1 - 4
T
120.00 100.00
80.00 60.00
40.00 20.00
0.00
Log minus log
6
4
2
0
-2
-4
1.00 .00 Status_merokok LML Function for patterns 1 - 2
T
120.00 100.00
80.00 60.00
40.00 20.00
0.00
Log minus log
5.0
2.5
0.0
-2.5
-5.0
1.00 .00 Pola_diet LML Function for patterns 1 - 2
T
120.00 100.00
80.00 60.00
40.00 20.00
0.00
Log minus log
4
2
0
-2
-4
-6
1.00 .00 Keturunan LML Function for patterns 1 - 2
T
120.00 100.00
80.00 60.00
40.00 20.00
0.00
Log minus log
4
2
0
-2
-4
1.00 .00 Penyakit_Lain LML Function for patterns 1 - 2
T
120.00 100.00
80.00 60.00
40.00 20.00
0.00
Log minus log
6
4
2
0
-2
-4
3.00 2.00 1.00 Kontrol_kesehatan LML Function for patterns 1 - 3
T
120.00 100.00
80.00 60.00
40.00 20.00
0.00
Log minus log
4
2
0
-2
-4
1.00 .00 Stres LML Function for patterns 1 - 2
T
120.00 100.00
80.00 60.00
40.00 20.00
0.00
Log minus log
4
2
0
-2
-4
1.00 .00 lingkungan LML Function for patterns 1 - 2
T
120.00 100.00
80.00 60.00
40.00 20.00
0.00
Log minus log
5.0
2.5
0.0
-2.5
-5.0
1.00 .00 Pola_makan LML Function for patterns 1 - 2
T
120.00 100.00
80.00 60.00
40.00 20.00
0.00
Log minus log
4
2
0
-2
-4
1.00 .00 Asupan_nutrisi LML Function for patterns 1 - 2
T
120.00 100.00
80.00 60.00
40.00 20.00
0.00
Log minus log
4
2
0
-2
-4
1.00 .00 pola_tidur LML Function for patterns 1 - 2
Lampiran 5. Output Untuk Model Null
The SAS System The LIFEREG Procedure
Model Information
Name of Distribution Weibull Log Likelihood -68.01960681
Number of Observations Read 37 Number of Observations Used 37
Lampiran 6. Output Untuk Model Penuh
The SAS System The LIFEREG Procedure
Model Information
Number of Observations 37 Noncensored Values 37 Name of Distribution Weibull Log Likelihood -55.29608831
Type III Analysis of Effects Wald
Effect DF Chi-Square Pr > ChiSq jenis_kelamin 1 1.6516 0.1987 pola_diet 1 10.6423 0.0011 keturunan 1 1.8017 0.1795 stres 1 2.4886 0.1147 pola_makan 1 10.5149 0.0012
The SAS System The LIFEREG Procedure Analysis of Parameter Estimates
Standard 95% Confidence Chi-
Parameter DF Estimate Error Limits Square Pr > ChiSq Intercept 1 3.0434 0.6015 1.8645 4.2222 25.60 <.0001 jenis_kelamin 0 1 -0.5173 0.4025 -1.3062 0.2716 1.65 0.1987 jenis_kelamin 1 0 0.0000 . . . . . pola_diet 0 1 1.1654 0.3572 0.4652 1.8656 10.64 0.0011 pola_diet 1 0 0.0000 . . . . . keturunan 0 1 -0.8263 0.6156 -2.0330 0.3803 1.80 0.1795 keturunan 1 0 0.0000 . . . . . stres 0 1 0.5494 0.3483 -0.1332 1.2320 2.49 0.1147 stres 1 0 0.0000 . . . . . pola_makan 0 1 1.2047 0.3715 0.4765 1.9328 10.51 0.0012 pola_makan 1 0 0.0000 . . . . . Scale 1 0.9429 0.1209 0.7333 1.2123
Weibull Shape 1 1.0606 0.1360 0.8249 1.3637
Lampiran 7. Output Untuk Model Reduksi
The SAS System The LIFEREG Procedure
Model Information
Number of Observations 37 Noncensored Values 37 Name of Distribution Weibull Log Likelihood -57.58333347
Type III Analysis of Effects Wald
Effect DF Chi-Square Pr > ChiSq pola_diet 1 8.0991 0.0044 pola_makan 1 12.9104 0.0003
Analysis of Parameter Estimates
Standard 95% Confidence Chi-
Parameter DF Estimate Error Limits Square Pr > ChiSq Intercept 1 2.4084 0.2540 1.9105 2.9062 89.91 <.0001 pola_diet 0 1 1.0486 0.3685 0.3264 1.7707 8.10 0.0044 pola_diet 1 0 0.0000 . . . . . pola_makan 0 1 1.2003 0.3340 0.5455 1.8550 12.91 0.0003 pola_makan 1 0 0.0000 . . . . . Scale 1 1.0026 0.1280 0.7806 1.2876
Weibull Shape 1 0.9975 0.1273 0.7767 1.2810
KUESIONER PENELITIAN Yth. Bapak/Ibu/Saudara/Saudari
Dalam rangka Penelitian Tugas Akhir yang berjudul Faktor-Faktor Yang
Mempengaruhi Penyakit Gagal Ginjal Dengan Menggunakan Regresi Cox, maka saya yang melakukan penelitian :
Nama : Nur Safitri
NIM : 01813
Program Studi : Matematika
Fakultas : Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Negeri Padang
memohon Bapak/Ibu/Saudara/Saudari berkenan untuk mengisi kuisioner berikut ini, karena tanpa partisipasi Bapak/Ibu/Saudara/Saudari, penelitian ini tidak dapat dilaksanakan.
A. Identitias responden
1. Berapa usia anda saat pertama kali didiagnosis penyakit ginjal?
2. Jenis kelamin anda?
3. Apa pendidikan terakhir anda?
4. Apa pekerjaan anda?
B. Riwayat penyakit gagal ginjal pada pasien
5. Kapan anda pertama kali didiagnosis menderita penyakit ginjal?
6. Saat pertama kali didiagnosis penyakit ginjal, kapan fungsi ginjal anda dinyatakan normal oleh dokter? (gejala penyakit sudah tidak ada) 7. Kapan fungsi ginjal anda kembali menurun? (gejala penyakit kembali
muncul)
C. Gaya Hidup
8. Saya merupakan seorang perokok a. Iya
b. Tidak
9. Saya mempunyai pola makan yang teratur setiap hari a. Iya
b. Tidak
10. Saya mempunyai pola tidur yang teratur setiap hari a. Iya
b. Tidak
11. Sebelum fungsi ginjal saya kembali menurun (gejala penyakit belum muncul kembali), saya suka mengkonsumsi makanan yang berkalium tinggi (seperti : pisang, tomat, ubi jalar, kelapa muda, nangka, bayam, sawi, durian, petai, jantung, kentang)
a. Selalu b. Sering
c. Kadang – kadang d. Tidak pernah
12. Sebelum fungsi ginjal saya kembali menurun (gejala penyakit belum muncul kembali), saya suka mengkonsumsi makanan dengan kandungan natrium tinggi (seperti : ikan asin, telur asin, makanan kaleng, makanan dengan bumbu penyedap, makanan cepat saji)
a. Selalu b. Sering
c. Kadang – kadang d. Tidak pernah
13. Sebelum fungsi ginjal kembali menurun (gejala penyakit belum muncul kembali), saya suka mengkonsumsi makanan dengan kadar garam tinggi a. Selalu
b. Sering
c. Kadang – kadang d. Tidak pernah
14. Makanan yang saya konsumsi setiap hari seimbang antara asupan karbohidrat, lemak dan protein
a. Selalu b. Sering
c. Kadang- kadang d. Tidak pernah
15. Saya berusaha untuk mencukupi kebutuhan vitamin untuk tubuh saya, baik melalui buah-buahan / sayur-sayuran atau dari suplemen
a. Selalu b. Sering
c. Kadang-kadang d. Tidak pernah D. Medis
16. Di keluarga saya pernah ada riwayat penyakit gagal ginjal a. Iya
b. Tidak
17. Saya menderita penyakit lain selain penyakit ginjal (seperti: hipertensi, diabetes mellitus, hepatitis, TBC, HIV, sifilis, filariasis, lupus, asam urat, jantung)
a. Iya b. Tidak
18. Sebelum fungsi ginjal saya kembali menurun, saya tetap mengontrol kesehatan saya ke dokter
a. Rutin b. Tidak rutin c. Tidak pernah E. Psikologi
19. Penyakit gagal ginjal membebani pikiran saya a. Selalu
b. Sering
c. Kadang-kadang d. Tidak pernah
20. Setelah saya didiagnosis gagal ginjal, saya tidak bersemangat menjalani kegiatan sehari-hari
a. Selalu b. Sering
c. Kadang-kadang d. Tidak pernah
21. Setelah saya didiagnosis gagal ginjal, saya menjadi lebih sensitif dan mudah marah
a. Selalu b. Sering
c. Kadang-kadang d. Tidak pernah
22. Setelah saya didiagnosis gagal ginjal, saya sulit tidur nyenyak a. Selalu
b. Sering
c. Kadang-kadang d. Tidak pernah
F. Sosial
23. Lingkungan mengucilkan saya, setelah mengetahui saya menderita penyakit gagal ginjal
a. Iya b. Tidak